Alvaro FAJARDO ROSSI
Dr.

  • Datos Generales

    • Institución principal

      Universidad de la República/ Facultad de Ciencias / Laboratorio de Virología Molecular, Centro de Investigaciones Nucleares / Uruguay

  • Formación

    • Formación académica

      • Concluida

        • Doctorado

          • Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (2012 - 2016)
            Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Epidemiología Molecular de Flavivirus emergentes en Uruguay y las Américas: virus dengue y zika
            Tutor/es: Juan Cristina Gheraldi
            Obtención del título: 2016
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
            Palabras Clave: Dengue Zika
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología /

          Maestría

          • Maestría en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (2008 - 2011)
            Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Variabilidad Genética del virus Dengue en la región sudamericana: Primeros abordajes epidemiológicos frente a una eventual re-emergencia del virus Dengue en el Uruguay
            Tutor/es: Juan Cristina Gheraldi
            Obtención del título: 2011
            Palabras Clave: Dengue variabilidad genética evolución
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolucion viral

        • Grado

          • Licenciatura en Bioquímica (2003 - 2008)
            Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Variabilidad Genética del Virus Dengue en Ecuador
            Tutor/es: Juan Cristina Gheraldi
            Obtención del título: 2008
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología /

    • Formación complementaria

      • Concluida

        • Posdoctorados

          • tenOever lab (2022 - 2025)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / New York University (NYU) / Microbiology Department , Estados Unidos

  • Areas de actuación

    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias Biológicas /Virología

  • Producción científica/tecnológica

    • Producción bibliográfica

      • Artículos publicados

        • Arbitrados

          • Impact of timely vaccination and genomic surveillance on controlling consecutive waves of SARS-CoV-2 variants (Completo, 2026)
            SALAZAR C. , trovao n , FERRÉS I. , COSTÁBILE, A , Paz M. , PERBOLIANACHIS, P , Ana Moller , Bortagaray V , Colina R , REGO N. , FERNÁNDEZ-CALERO T , LUCIA SPANGENBERG , B.RIVERA , Alonso, M. ; ALONSO, M. , Matías Maidana , FAJARDO A. , IRAOLA G. , MORATORIO, G. , MORENO P
            Scientific Reports, 2026
            Medio de divulgación: Otros
            E-ISSN: 20452322
            DOI: 10.1038/s41598-026-48131-z
            https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42014747/

          • Blood matters: the hematological signatures of Coronavirus infection (Completo, 2024)
            Ayelen Toro , Ana P Arevalo , MARIANOEL PEREIRA-GÓMEZ , agustina Sabater , Eric Zizzi , PERBOLIANACHIS, P , Gaston Pascual , Sofia Lage , Pórfido JL , Ines Achinelli , Rocio Reniuk , Juan Bizzotto , Pablo Sanchis , ALVARO OLIVERA , Alejandro Leyva , MORENO P , COSTÁBILE, A , FAJARDO A. , F. CARRIÓN , FLÓ, M. , OLIVERO N , Fernando Rodriguez , NIN N , Nicolas Anselmino , Estefania Labanca , Elba Vazquez , Javier Cotignola , Daniel Alonso , Maria Valacco , Marcelo Marti , Francesco Gentile , Artem Cherkasov , M. CRISPO , MORATORIO, G. , Geraldine Gueron
            Cell Death and Disease, 2024
            E-ISSN: 20414889

          • One-year monitoring SARS-CoV-2 RNA surface contamination in hospitals reveals no correlation with organic material and negative pressure as a limiting factor for contamination (Completo, 2023)
            MARIANOEL PEREIRA-GÓMEZ , Rodrigo Arce , Ferla, D. , Diego Simón , SALAZAR C. , PERBOLIANACHIS, P , COSTÁBILE, A , FAJARDO A. , Fabián Aldunate , NIN N , HURTADO J, HURTADO FJ , IRAOLA G. , MORENO P , MORATORIO, G.
            Heliyon, 2023
            ISSN: 24058440
            DOI: 10.1016/j.heliyon.2023.e13875
            https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36845037/

          • Mouse genome rewriting and tailoring of three important disease loci (Completo, 2023)Trabajo relevante
            Weimin Zhang , Ilona Golynker , Ran Brosh , FAJARDO A. , Yinan Zhu , Aleksandra M Wudzinska , Raquel Ordoñez , André M Ribeiro-Dos-Santos , CARRAU, L , Payal Damani-Yokota , .... , Benjamin R tenOever , Jef D Boeke
            Nature, 2023
            ISSN: 00280836
            E-ISSN: 14764687
            DOI: 10.1038/s41586-023-06675-4
            https://www.nature.com/articles/s41586-023-06675-4

          • What have we learned from a case of convalescent plasma treatment in a two-time kidney transplant recipient COVID-19 patient? A case report from the perspective of viral load evolution and immune response (Completo, 2023)
            Fabián Aldunate , FAJARDO A. , Natalia Ibanez , RAMMAURO, F. , DAGHERO H. , Rodrigo Arce , Ferla, D. , MARIANOEL PEREIRA-GÓMEZ , SALAZAR C. , IRAOLA G. , Otto Pritsch , J. Hurtado , TENZI J , BOLLATI-FOGOLIN M , BIANCHI, S , NIN N , MORATORIO, G. , MORENO P
            Frontiers in Nephrology, 2023
            E-ISSN: 28130626
            DOI: 10.3389/fneph.2023.1132763
            10.3389/fneph.2023.1132763

          • Arbovirus researchers unite: expanding genomic surveillance for an urgent global need (Completo, 2023)
            Gabriel Luz Wallau , Global Arbovirus Researchers United , FAJARDO A.
            The Lancet Public Health, 2023
            ISSN: 24682667
            DOI: 10.1016/S2214-109X(23)00325-X
            https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37541265/
            Co-Author member of the Global Arbovirus Researchers United

          • Delayed engagement of host defenses enables SARS-CoV-2 viremia and productive infection of distal organs in the hamster model of COVID-19 (Completo, 2023)Trabajo relevante
            CARRAU, L , Justin Frere , Ilona Golynker , FAJARDO A. , Cristobal Rivera , Shu Horiuchi , Tyler Roonprapunt , Judith M Minkoff , Daniel Blanco-Melo , Benjamin tenOever
            Science Signaling, 2023
            ISSN: 19450877
            E-ISSN: 19379145
            DOI: 10.1126/scisignal.adg5470
            https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37311033/

          • Molecular accuracy vs antigenic speed: SARS-CoV-2 testing strategies (Reseña, 2022)
            FAJARDO A. , PERBOLIANACHIS, P , Irene Ferreiro , MORENO P , MORATORIO, G.
            Current Opinion in Pharmacology, 2022
            Palabras clave: SARS-CoV-2 PCR Antigenic test
            ISSN: 14714892
            DOI: 10.1016/j.coph.2021.12.006
            https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8687762/

          • Dual-Reporter System for Real-Time Monitoring of SARS-CoV-2 Main Protease Activity in Live Cells Enables Identification of an Allosteric Inhibition Path (Completo, 2022)
            Yaron Bram , Xiaohuan Duan , Benjamin E Nilsson-Payant , Vasuretha Chandar , Hao Wu , Derek Shore , FAJARDO A. , Saloni Sinha , Nora Hassan , Harel Weinstein , Benjamin R tenOever , Shuibing Chen , Robert E Schwartz
            ACS Bio & Med Chem Au, 2022
            E-ISSN: 26942437
            DOI: 10.1021/acsbiomedchemau.2c00034
            https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36570071/

          • Real-Time Genomic Surveillance for SARS-CoV-2 Variants of Concern, Uruguay (Completo, 2021)
            REGO N. , COSTÁBILE, A , Paz M. , SALAZAR C. , PERBOLIANACHIS, P , LUCIA SPANGENBERG , FERRÉS I. , Rodrigo Arce , FAJARDO A. , ARLEO M. , POSSI-PEZZALI, T. , N.Reyes , MNBENTANCOR , LIZASOAIN, A. , BENITEZ-GALEANO, M J , Bortagaray V
            Emerging Infectious Diseases, 2021
            Medio de divulgación: Otros
            ISSN: 10806040
            E-ISSN: 10806059
            DOI: 10.3201/eid2711.211198
            https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34437831/

          • Altering Compositional Properties of Viral Genomes to Design Live-Attenuated Vaccines (Completo, 2021)
            MARIANOEL PEREIRA-GÓMEZ , CARRAU, L , FAJARDO A. , MORENO P , MORATORIO, G.
            Frontiers in Microbiology, 2021
            Medio de divulgación: Otros
            E-ISSN: 1664302X
            https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34276608/

          • Evaluation of SYBR Green real time PCR for detecting SARS-CoV-2 from clinical samples (Completo, 2021)
            MARIANOEL PEREIRA-GÓMEZ , FAJARDO A. , Natalia Echeverria , Tort, LFL; Tort FL; Lopez F , PERBOLIANACHIS, P , COSTÁBILE, A , Fabián Aldunate , MORENO P , MORATORIO, G.
            Journal of Virological Methods, 2021
            Medio de divulgación: Internet
            ISSN: 01660934
            DOI: 10.1016/j.jviromet.2020.114035
            https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7831559/

          • Emergence and Spread of a B.1.1.28-Derived P.6 Lineage with Q675H and Q677H Spike Mutations in Uruguay (Completo, 2021)
            REGO N. , SALAZAR C. , Paz M. , COSTÁBILE, A , FAJARDO A. , FERRÉS I. , PERBOLIANACHIS, P , FERNÁNDEZ-CALERO T , VNOYA , M. MACHADO , M. Brandes , Rodrigo Arce , .......... , Gonzalo Wilson BELLO ALMEIDA , MORENO P , MORATORIO, G. , IRAOLA G. , LUCIA SPANGENBERG
            Viruses, 2021
            Medio de divulgación: Otros
            E-ISSN: 19994915
            https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34578382/

          • Prevalence and molecular epidemiology of bovine leukemia virus in Colombian cattle (Completo, 2020)
            Adriana Corredor-Figueroa , S Salas , NN Olaya-Galan , JS Quintero , FAJARDO A. , Soñora, M. , MORENO P , CRISTINA, J. , A Sanchez , J Tobon , D Ortiz , Maria Fernanda Gutierrez
            Infection Genetics and Evolution, 2020
            ISSN: 15671348
            DOI: 10.1016/j.meegid.2020.104171
            https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31904555

          • An Evolutionary Insight into Emerging Ebolavirus Strains Isolated in Africa (Completo, 2020)
            MARIANOEL PEREIRA-GÓMEZ , Tort, LFL; Tort FL; Lopez F , FAJARDO A. , CRISTINA, J.
            Journal of Medical Virology, 2020
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolución viral
            Medio de divulgación: Internet
            ISSN: 01466615
            E-ISSN: 10969071
            DOI: 10.1002/jmv.25627
            https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jmv.25627

          • Usutu Virus: An Arbovirus on the Rise (Completo, 2019)
            Roesch, F. , FAJARDO A. , MORATORIO, G. , Vignuzzi, M.
            Viruses, 2019
            Palabras clave: Usutu virus
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Arbovirus
            Medio de divulgación: Internet
            E-ISSN: 19994915
            DOI: 10.3390/v11070640
            https://www.mdpi.com/1999-4915/11/7/640

          • Response to: Comment on "Pretreatment Hepatitis C Virus NS5A/NS5B Resistance-Associated Substitutions in Genotype 1 Uruguayan Infected Patients" (Completo, 2019)
            Fabián Aldunate , ECHEVERRÍA, N. , Chiodi, D. , Lopez, P. , Sanchez A , FAJARDO A. , Soñora, M. , CRISTINA, J. , Hernandez N , MORENO P
            Disease Markers, 2019
            Medio de divulgación: Internet
            ISSN: 02780240
            E-ISSN: 18758630
            DOI: 10.1155/2019/2520302
            https://www.hindawi.com/journals/dm/2019/2520302/

          • An Evolutionary Insight into Zika Virus Strains Isolated in the Latin American Region (Completo, 2018)
            Diego Simón , FAJARDO A. , MORENO P , MORATORIO, G. , CRISTINA, J.
            Viruses, v.: 10 12 , p.:698 2018
            Palabras clave: virus zika
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolución viral
            Medio de divulgación: Internet
            E-ISSN: 19994915
            DOI: 10.3390/v10120698
            https://www.mdpi.com/1999-4915/10/12/698

          • Pretreatment Hepatitis C Virus NS5A/NS5B Resistance-Associated Substitutions in Genotype 1 Uruguayan Infected Patients (Completo, 2018)
            Fabián Aldunate , ECHEVERRÍA, N. , CHIODI, D. , LOPEZ, P. , Sanchez A , FAJARDO A. , Soñora, M. , CRISTINA, J. , Hernandez N , MORENO P
            Disease Markers, 2018
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolución viral
            Medio de divulgación: Internet
            ISSN: 02780240
            E-ISSN: 18758630
            DOI: 10.1155/2018/2514901
            https://www.hindawi.com/journals/dm/2018/2514901/

          • Evidence of increasing diversification of Zika virus strains isolated in the American continent (Completo, 2017)
            ALDUNATE F , GáMBARO F , FAJARDO A. , SOñORA M , CRISTINA, J
            Journal of Medical Virology, v.: 89 12 , p.:2059 - 2063, 2017
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / virus zika
            Medio de divulgación: Papel
            ISSN: 01466615
            E-ISSN: 10969071
            DOI: 10.1002/jmv.24910
            http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.24910/abstract

          • Host influence in the genomic composition of flaviviruses: A multivariate approach (Completo, 2017)
            SIMON D , FAJARDO A. , SOñORA M , DELFRARO A , MUSTO H
            Biochemical and Biophysical Research Communications, v.: 17 p.:31219 - 31226, 2017
            Palabras clave: Flavivirus
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Flavivirus
            Medio de divulgación: Papel
            Escrito por invitación
            ISSN: 0006291X
            E-ISSN: 10902104
            DOI: 10.1016/j.bbrc.2017.06.088
            https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28630001

          • Emergence and Spreading Potential of Zika Virus (Completo, 2016)Trabajo relevante
            FAJARDO A. , CRISTINA, J , MORENO, P.
            Frontiers in Microbiology, v.: 7 p.:1 - 8, 2016
            Palabras clave: zika virus
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolucion viral
            Medio de divulgación: Papel
            E-ISSN: 1664302X
            DOI: 10.3389/fmicb.2016.01667
            http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2016.01667/full

          • A detailed comparative analysis of codon usage bias in Zika virus (Completo, 2016)
            CRISTINA, J , FAJARDO A. , SOñORA M , MORATORIO, M , MUSTO H
            Virus Research, v.: 223 p.:147 - 152, 2016
            Palabras clave: zika virus
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolucion viral
            Medio de divulgación: Papel
            ISSN: 01681702
            DOI: 10.1016/j.virusres.2016.06.022
            https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27449601

          • Bayesian Coalescent Inference Reveals High Evolutionary Rates and Diversification of Zika Virus Populations (Completo, 2016)Trabajo relevante
            FAJARDO A. , SOñORA M , MORATORIO, M , MORENO, P. , CRISTINA, J
            Journal of Medical Virology, v.: 88 10 , p.:1672 - 1676, 2016
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolucion viral
            Medio de divulgación: Papel
            ISSN: 01466615
            E-ISSN: 10969071
            DOI: 10.1002/jmv.24596
            10.1002/jmv.24596

          • Naturally occurring NS3 resistance-associated variants in hepatitis C virus genotype 1: Their relevance for developing countries (Completo, 2016)
            ECHEVERRIA N , BETANCOUR G , GáMBARO F , HERNANDEZ N , LóPEZ P , CHIODI D , SáNCHEZ A , BOSCHI, S. , FAJARDO A. , SOñORA M , MORATORIO, M , CRISTINA, J , MORENO, P.
            Virus Research, v.: 223 p.:140 - 146, 2016
            Palabras clave: Hepatitis C virus
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolucion viral
            Medio de divulgación: Papel
            ISSN: 01681702
            DOI: 10.1016/j.virusres.2016.07.008
            http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168170216304385

          • An evolutionary insight into Newcastle disease viruses isolated in Antarctica. (Completo, 2015)
            SOñORA M , MORENO, P. , ECHEVERRIA N , FISCHER S , COMAS V , FAJARDO A. , CRISTINA, J
            Archives of Virology, 2015
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolucion viral
            Medio de divulgación: Papel
            ISSN: 03048608
            E-ISSN: 14328798
            DOI: 10.1007/s00705-015-2434-y
            http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26014920

          • Phylogenetic analyses of Norovirus strains detected in Uruguay reveal the circulation of the novel GII.P7/GII.6 recombinant variant. (Completo, 2014)Trabajo relevante
            FAJARDO A. , LOPEZ-TORT, F. , VICTORIA M. , FUMIAN TM. , MIAGOSTOVICH MP. , LEITE JP. , CRISTINA, J , COLINA, R
            Infection Genetics and Evolution, v.: 28 p.:328 - 332, 2014
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolucion viral
            Medio de divulgación: Internet
            ISSN: 15671348
            http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567134814003979

          • Evolution of dengue virus type 3 genotype III in Venezuela: diversification, rates and population dynamics (Completo, 2010)
            RAMIREZ, A , FAJARDO A. , MOROS, Z , GENDER, M , CARABALLO, G , CAMACHO, D , COMACH, G , ALARCON, V , ZAMBRANO, J , HERNANDEZ, R , MORATORIO, M , CRISTINA, J , LIPRANDI, F
            Virology Journal, 2010
            Palabras clave: Dengue virus Bayesian inference Phylogenetic Analysis Venezuela
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolucion viral
            Medio de divulgación: Papel
            E-ISSN: 1743422X
            DOI: 10.1186/1743-422X-7-329
            http://www.virologyj.com/content/7/1/329

          • Evidence of diversification of dengue virus type 3 genotype III in the South American region (Completo, 2009)
            DE MORA, D , D ANDREA, L , ALVAREZ, M , REGATO, M , FAJARDO A. , RECAREY, R , COLINA, R , KHAN, B , CRISTINA, J
            Archives of Virology, 2009
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Virus Dengue
            Medio de divulgación: Papel
            ISSN: 03048608
            E-ISSN: 14328798

          • Modeling gene sequences over time in 2009 H1N1 Influenza A Virus populations (Completo, 2009)
            GOÑI, N. , FAJARDO A. , MORATORIO, M , COLINA, R , CRISTINA, J
            Virology Journal, 2009
            Palabras clave: Bayesian inference Evolution H1N1 influenza A
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolucion viral
            Medio de divulgación: Papel
            E-ISSN: 1743422X
            DOI: 10.1186/1743-422X-6-215
            http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2794274/?tool=pubmed

          • Modeling gene sequence changes over time in type 3 dengue viruses from Ecuador (Completo, 2009)
            FAJARDO A. , RECAREY, R , DE MORA, D , D ANDREA, L , ALVAREZ, M , REGATO, M , COLINA, R , KHAN, B , CRISTINA, J
            Virus Research, v.: 141 1 , p.:105 - 109, 2009
            Palabras clave: Dengue virus Bayesian inference Evolution Ecuador
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Virus Dengue
            Medio de divulgación: Papel
            ISSN: 01681702
            http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19185597?ordinalpos=1&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_R

          • Phylogenetic analysis of the NS5 gene of dengue viruses isolated in Ecuador (Completo, 2008)
            REGATO, M , RECAREY, R , MORATORIO, M , DE MORA, D , GARCÍA-AGUIRRE, L , GONZÁLEZ, M , MOSQUERA, C , ALAVA, A , FAJARDO A. , ALVAREZ, M , D ANDREA, L , DUBRA, A , MARTÍNEZ, M , KHAN, B , CRISTINA, J
            Virus Research, v.: 132 p.:197 - 200, 2008
            Palabras clave: Dengue virus Evolution Ecuador NS5 gene
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Virus Dengue
            Medio de divulgación: Papel
            ISSN: 01681702
            http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6T32-4RB5BCV-1&_user=10&_rdoc=1&_fmt=&_ori

        • No Arbitrados

          • Extended tissue tropism and vertical transmission in a murine model of Mayaro virus infection (Completo, 2026)
            AREVALO AP. , Ana Paula Arévalo, Ana P. Arévalo, AP.Arevalo , PERBOLIANACHIS, P , Pórfido JL , MARIANOEL PEREIRA-GÓMEZ , GREIF, G. , J. Hurtado , FAJARDO A. , Varela, Maria Belén , VERDES JM , MORATORIO, G. , M. CRISPO

            bioRxiv, 2026
            Medio de divulgación: Otros
            E-ISSN: 26928205
            https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.01.04.693264v1