Datos Personales

• Identidad

  Nombre en citaciones bibliográficas: A E Silva
  Documento: Cédula de identidad uruguay - 50350158
  Sexo: Masculino
  Fecha de nacimiento: 18/01/1997
  Lugar de nacimiento: Uruguay / Rocha / Lascano
  País de Nacionalidad: Uruguay

• Datos Generales

  • Institución principal

    Universidad de la República/ Facultad de Ingeniería / Instituto de Física / Uruguay

  • Dirección institucional

    Institución: Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Sector Educación Superior/Público
    Dirección: Av. Julio herrera y reissig 565 / 11300
    País: Uruguay / Montevideo / Montevideo
    Teléfono: 27142714
    Correo electrónico/Sitio Web: asilva@fing.edu.uy https://www.fing.edu.uy/
    

• Idiomas

  • Español

    Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien

  • Francés

    Entiende bien / Habla bien / Lee bien / Escribe bien

  • Portugués

    Entiende bien / Habla bien / Lee bien / Escribe bien

  • Inglés

    Entiende muy bien / Habla bien / Lee muy bien / Escribe muy bien

• Formación

  • Formación académica

    • Concluida

      • Grado

        • Ingeniería Eléctrica (2015 - 2020)

          Universidad de la República - Facultad de Ingeniería , Uruguay
          Título de la disertación/tesis/defensa: Ingeniería Eléctrica
          Obtención del título: 2020
          Palabras Clave: Procesamiento de señales Electrónica Tratamiento de imágenes
          Areas de conocimiento:
          Ingeniería y Tecnología / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información / Procesamiento de señales
          Ingeniería y Tecnología / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información /

    • En Marcha

      • Doctorado

        • Doctorado en Ingeniería (Ingeniería Física) (2020)

          Universidad de la República, Facultad de Ingeniería ,Uruguay
          Título de la disertación/tesis/defensa: Doctorado en Ingeniería Física
          Tutor/es: Julia Rosa Alonso Siri
          Financiación:
          Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
          Palabras Clave: Ingeniería Física Física Ingeniería Óptica Biología
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica /
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
          Ingeniería y Tecnología / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información / Sistemas de Automatización y Control /

  • Formación complementaria

    • Concluida

      • Cursos de corta duración

        • Aprendizaje Profundo Por Refuerzo (02/2019 - 03/2019)

          Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Instituto de Ingeniería Eléctrica , Uruguay
          15 horas
          Areas de conocimiento:
          Ingeniería y Tecnología / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información / Aprendizaje Profundo

• Actuación profesional

  • Sector Empresas/Privado - Empresa Privada - Uruguay

    Qualabs

    • Vínculos con la Institución

      • Funcionario/Empleado (04/2026 - a la fecha)Trabajo relevante

        Software Developer 40 horas semanales

  • Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

    Facultad de Ingeniería / Instituto de Física

    • Vínculos con la Institución

      • Funcionario/Empleado (04/2022 - a la fecha)

        Asistente 20 horas semanales
        Escalafón: Docente
        Grado: Grado 2
        Cargo: Interino

      • Funcionario/Empleado (02/2018 - 04/2022)Trabajo relevante

        Ayudante 20 horas semanales
        Escalafón: Docente
        Grado: Grado 1
        Cargo: Interino

    • Actividades

      • Proyectos de investigación y desarrollo

        • Incorporación de métodos ópticos cuantitativos de fase en microscopio de diseño personalizado para el monitoreo de ensayos celulares (04/2024 - a la fecha)

          Proyecto de Iniciación a la Investigación El proyecto propuesto busca expandir mitrabajo realizado durante un doctorado en el desarrollo de un microscopio personalizado. Este microscopio ha permitido trabajar con diversas muestras biológicas, como células epiteliales o de carcinoma oral, utilizando imágenes de campo claro. Sin embargo, no se podía acceder a la información de fase de los cultivos biológicos sin adaptar su diseño. El objetivo principal del proyecto es incorporar el cálculo cuantitativo de fase al microscopio diseñado. Se tienen varios tipos de métodos para recuperar la fase de la luz que pasa a través de la muestra, destacando dos enfoques principales: interferométricos y no interferométricos. Los métodos interferométricos implican la interferencia entre dos haces de luz para medir la fase de un objeto, siendo precisos pero complejos. Por otro lado, los métodos no interferométricos, como la ecuación de transporte de intensidad (TIE), miden las diferencias de fase entre diferentes partes del objeto, siendo más simples pero potencialmente menos precisos. Se discuten varios métodos para resolver la TIE, incluyendo el uso de transformadas de Fourier y el aprendizaje profundo mediante redes neuronales convolucionales. Estos métodos ofrecen soluciones innovadoras y robustas para la recuperación de fase. El proyecto también explora las aplicaciones biológicas del cálculo de fase, como la medición de la viscosidad y elasticidad celular. Se destaca la importancia de la imagen de fase cuantitativa (QPI) para estudiar cambios en la viscoelasticidad celular sin contacto invasivo, lo que es crucial para comprender procesos biológicos como la progresión del cáncer. Además, el análisis de imágenes de fase cuantitativa puede proporcionar información sobre la rigidez celular y la transición entre tejidos benignos y malignos. En resumen, el proyecto busca mejorar un microscopio existente permitiendo el cálculo cuantitativo de fase, utilizando métodos avanzados que van desde técnicas no interferométricas hasta el aprendizaje profundo. Esto tiene importantes implicaciones en la comprensión de procesos biológicos y en aplicaciones como la investigación del cáncer y la caracterización de tejidos.
          10 horas semanales
          Investigación
          Coordinador o Responsable
          En Marcha
          Equipo: A E Silva (Responsable) , MIGUEL AROCENA , A FERNÁNDEZ , J R ALONSO / J ALONSO , J M Llaguno

        • Microscopía Holográfica Digital basada en Aprendizaje Profundo consciente de la Física (03/2023 - 12/2024 )

          La Microscopía Holográfica Digital (Digital Holographic Microscopy - DHM) es una técnica que permite medir la información cuantitativa del corrimiento de fase (debido a la diferencia de caminos ópticos) que experimenta la luz cuando pasa a través de especímenes biológicos transparentes tales como células vivas. Esto la convierte en una técnica particularmente útil para el estudio no invasivo de procesos dinámicos en células tumorales (sin necesidad de teñir o etiquetar). En DHM, el holograma que contiene la información del espécimen se graba digitalmente primero para luego, tradicionalmente, intentar recuperar la información de fase en forma computacional basándose en soluciones analíticas y/o en soluciones iterativas que satisfacen la ecuación de ondas. Sin embargo, estas aproximaciones representan un alto costo en tiempo así como la generación de artefactos que degradan la calidad de las imágenes recuperadas. Por otro lado, el Aprendizaje Profundo (Deep Learning - DL) ha revolucionado el campo de la microscopía óptica computacional debido a su habilidad para solucionar eficientemente problemas inversos no lineales complejos. Sin embargo, se le ha recriminado su naturaleza de ?caja negra? por llevar a veces a resultados inconsistentes con las leyes físicas. En este sentido, la aproximación de Aprendizaje Profundo consciente de la Física (Physics-aware Deep-Learning) es atractiva porque fomenta la predicción de características condicionadas por la física y reduce la naturaleza de caja negra de los algoritmos DL. La propuesta se centra en el diseño personalizado y puesta en marcha de un microscopio holográfico digital donde se incorpora el Aprendizaje Profundo como herramienta versátil y prometedora para intentar mejorar la calidad de la reconstrucción de las imágenes. También se propone guiar o asistir a los algoritmos de DL con Física, incluyendo información proveniente de los modelos y procesos físicos subyacentes a la formación de imágenes en los algoritmos a implementar. Se espera a través de este proyecto contribuir a desarrollar una nueva línea de investigación interdisciplinaria, que explora las fronteras del conocimiento en microscopía y que puede a su vez aportar a nivel del país con el desarrollo de una técnica como es la Holografía Digital, no disponible actualmente a nivel nacional, lo que permitiría realizar a futuro estudios novedosos por ejemplo en dinámica celular tumoral.
          4 horas semanales
          Investigación
          Integrante del Equipo
          Concluido
          RRHH formados en el proyecto:
          Pregrado:1
          Doctorado:2
          Financiación:
          Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
          Equipo: J R ALONSO / J ALONSO (Responsable) , FEDERICO LECUMBERRY , MIGUEL AROCENA , A FERNÁNDEZ , Juan Llaguno , A E Silva

        • Microscopio dentro de incubador de células: desarrollo de un sistema compacto de enfoque automatizado para monitoreo prolongado en tiempo real con aplicación a nuevos ensayos de migración y proliferación en carcinoma oral (06/2020 - 08/2022 )

          La posibilidad de monitorear células en tiempo real por largos períodos de tiempo es una herramienta clave en muy diversas aplicaciones como el screening de nuevos fármacos o ensayos de la capacidad proliferativa e invasiva de células tumorales. Se trata sin embargo de un proceso muy costoso que habitualmente requiere de un microscopio con jaula de control así como de sistemas de corrección de la deriva de foco que ocurre habitualmente durante registros largos. El objetivo central de este proyecto es el desarrollo de una alternativa de bajo costo mediante un microscopio compacto que pueda caber sin dificultad en un incubador de células, cuyas piezas de montaje específicas se puedan fabricar usando tecnología de impresión 3D, cuya óptica incorpore una lente de foco ajustable eléctricamente para realizar un enfoque completamente no mecánico según Z y controlable externamente a partir de una computadora y que permita la evaluación de diferentes condiciones experimentales simultáneamente, mediante la incorporación de una platina multi-pocillos móvil en el plano XY -impresa en 3D y controlada mediante microcontroladores open source. Este proyecto busca además implementar metodologías de cultivo celular que contribuyan a desarrollar las aplicaciones del microscopio compacto a la biotecnología, la salud humana y animal y la investigación biomédica. Implementaremos ensayos de proliferación -donde se evaluará en un mismo registro la acción de múltiples fármacos- así como de migración en 3D -aprovechando la capacidad de barrido axial de nuestro sistema óptico- usando células de carcinoma oral, un tipo de tumor agresivo y de alta prevalencia en Uruguay.
          15 horas semanales
          Investigación
          Integrante del Equipo
          Concluido
          RRHH formados en el proyecto:
          Doctorado:1
          Financiación:
          Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
          Equipo: A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO (Responsable) , MIGUEL AROCENA (Responsable) , A FERNÁNDEZ , FERRARI, J. A. , Juan Llaguno , BOLOGNA-MOLINA , D'Aiuto N.
          Palabras clave: Microscopía óptica Impresión 3D

        • Imaginería Óptica Computacional y Óptica Adaptiva aplicadas a la Microscopía de Fluorescencia por Lámina de Luz (04/2019 - 03/2021 )

          La microscopía de fluorescencia por lámina de luz (LSFM por sus siglas en inglés) es una técnica de aplicación biológica relativamente nueva que ha ganado terreno a lo largo del tiempo dado su gran potencial para la visualización de muestras biológicas de gran espesor. En ella la visualización por planos (optical sectioning) de la muestra 3D se obtiene a partir del uso de una lámina u hoja de luz que excita selectivamente un único plano de la muestra en el plano focal de un objetivo de microscopio dispuesto ortogonal al plano de la lámina de luz. Esta técnica permite resolver estructuras en el plano z (optical sectioning) excitando sólo un plano a la vez. Como LSFM excita sólo las moléculas cercanas al plano focal implica menor fototoxicidad y mejora la calidad en la formación de imágenes de las muestras en el tiempo. Sin embargo, a medida que la luz pasa a través del espécimen biológico, las variaciones espaciales en el índice de refracción del mismo introducen aberraciones ópticas que distorsionan la imagen adquirida. Una forma considerada recientemente para corregir esas aberraciones es a través del uso de Óptica Adaptiva (AO). Finalmente, la Imaginería Óptica Computacional combina el diseño óptico de dispositivos personalizados como en este caso la incorporación de AO-LSFM con el procesamiento digital de las imágenes adquiridas. Este procesamiento se realiza por medio de algoritmos basados en la óptica involucrada es decir se basa en modelos físicos subyacentes al set-up óptico utilizado como por ejemplo la respuesta al impulso o PSF (Point Spread Function) del sistema. En este proyecto se propone por tanto, un acercamiento fundamentalmente interdisciplinario del tema de investigación. Se buscará que investigadores y estudiantes provenientes de diferentes disciplinas trabajen en conjunto para el desarrollo de nuevas estrategias experimentales y técnicas de reconstrucción de imágenes que colaboren para una mejor interpretación y comprensión de estructuras 3D de importancia biológica obtenidas a partir de AO-LSFM.
          10 horas semanales
          Instituto de Física
          Investigación
          Integrante del Equipo
          Concluido
          Financiación:
          Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
          Equipo: A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO (Responsable) , A FERNÁNDEZ , FERRARI, J. A. , MALACRIDA L. , MIGUEL AROCENA (Responsable)
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada

        • Desarrollo de nuevas técnicas ópticas y de procesamiento de imágenes en microscopía multifocal para el estudio de la estructura tridimensional de esferoides tumorales multicelulares. (04/2017 - 04/2019 )

          Los avances en microscopía óptica son fundamentales en investigación biomédica, y entre sus objetivos principales está poder visualizar de manera cada vez más detallada y a la vez no invasiva regiones previamente inaccesibles de las estructuras biológicas. Los esferoides tumorales multicelulares (MCTS) de gran tamaño (diámetros mayores a 500µm) constituyen un modelo tridimensional (3D) in vitro que reproduce la organización espacial de los tumores in vivo, ya que posee una zona externa más proliferativa, una zona más profunda quiescente y una región central hipóxica, acidificada y con abundante presencia de células necróticas. La hipoxia y la acidificación de esta región central dan lugar a procesos de selección que pueden generar células más resistentes e invasivas, determinando de forma crucial la evolución futura del tumor. Caracterizar de manera detallada la organización celular de las regiones profundas en MCTS es un paso indispensable para poder modelarin vitro procesos esenciales en el desarrollo tumoral. A su vez, para esto es fundamental visualizar con claridad la estructura 3D en MCTS íntegros de gran tamaño, en particular su región central. Este problema plantea grandes desafíos a las técnicas microscópicas existentes, y hace necesario el desarrollo de nuevas metodologías de adquisición y procesamiento de imágenes. Por un lado, se propone diseñar, montar, caracterizar y poner en funcionamiento un dispositivo óptico experimental que funcione como un microscopio modular, adaptable para trabajar en condiciones de campo claro así como de fluorescencia. Existen dos aspectos instrumentales fundamentales, a incorporar de forma novedosa en el dispositivo: el uso de una lente de foco ajustable eléctricamente (ETL) de última generación y el uso de diodos emisores de luz (LED) como fuente de iluminación (de bajo costo y mayortiempo operativo útilque las tradicionales lámparas de mercurio). Cabe mencionar que no existen aún microscopios con ambas características a nivel comercial. La incorporación de una ETL permite realizar un escaneo axial óptico multifocal del espécimen de interés evitando los problemas inherentes al convencional escaneo mecánico en la microscopía 3D.Por otro lado, el procesamiento digital de imágenes se ha convertido en parte integral de la microscopía moderna, permitiendo la reconstrucción de imágenes con nuevas características de interés, tales como profundidad de campo extendida, por medio de diferentes algoritmos. Se busca desarrollar e implementar algoritmos que permitan la visualización de todo el volumen de los MCTS y en particular su zona central. Como se trata de muestras de gran espesor se considerarán modelos físicos de variación de la respuesta al impulso (PSF) del sistema óptico con la profundidad. En este proyecto se propone un acercamiento fundamentalmente interdisciplinario en el que investigadores y estudiantes provenientes de Física, Biología e Ingeniería Eléctrica trabajen en conjunto para el desarrollo de nuevas estrategias experimentales de adquisición así como técnicas de reconstrucción de imágenes que colaboren para una mejorinterpretación y comprensión de la estructura 3D de los MCTS.
          15 horas semanales
          Investigación
          Integrante del Equipo
          Concluido
          Financiación:
          Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
          Equipo: Julia Rosa ALONSO SIRI (Responsable) , Ariel FERNÁNDEZ CASORATTI , German Miguel AROCENA SUTZ (Responsable) , Gastón Alí AYUBI ZAVALLA , Juan Matias Di Martino Bolentini , José Roberto SOTELO SILVEIRA , Mercedes Landeira Escames , José Antonio FERRARI DAMIANO , Alejandro Emanuel Silva Miraballes
          Palabras clave: Microscopía 3D Procesamiento de Imágenes Esferoides Tumorales
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica /

      • Docencia

        • Ingeniería Eléctrica (02/2021 - a la fecha)

          Grado
          Asistente
          Asignaturas:
          Mecánica Newtoniana, 10 horas, Práctico
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Ciencias Físicas / Mecánica

        • Ingeniería Eléctrica (07/2020 - a la fecha)

          Grado
          Asistente
          Asignaturas:
          Electromagnetismo, 10 horas, Práctico
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Ciencias Físicas / Electromagnetismo

        • Ingeniería Eléctrica (02/2018 - 08/2020 )

          Grado
          Asistente
          Asignaturas:
          Física 1, 10 horas, Práctico
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Ciencias Físicas /

        • Ingeniería Eléctrica (07/2018 - 12/2019 )

          Grado
          Asistente
          Asignaturas:
          Física Experimental 2, 5 horas, Práctico
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Ciencias Físicas /

      • Extensión

        • Ingeniería de Muestra 2023 - Póster y setup experimental "Microscopio de fluorescencia personalizado impreso en 3D" (10/2023 - 10/2023 )

          Facultad de Ingeniería 10 horas

        • Ingeniería de Muestra 2021 - Vídeo de presentación "Microscopio Dentro de un Incubador de Células" (10/2021 - 10/2021 )

          5 horas
          Areas de conocimiento:
          Ingeniería y Tecnología / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información /

        • Ingeniería de Muestra 2020 - Vídeo de presentación "Cryo-Em volume denoising: Análisis de Algoritmos de Disminución de Ruido sobre Datos Volumétricos Obtenidos con Criomicroscopía Electrónica" (10/2020 - 10/2020 )

          10 horas

        • Ingeniería de Muestra 2019 - Póster y Stand "Microscopía Óptica Computacional" (10/2019 - 10/2019 )

          10 horas

        • Ingeniería de Muestra 2018 - Poster y stand "Registro de imágenes por medio de detectores y descriptores de características visuales como preprocesamiento para la fusión de imágenes multifoco" (10/2018 - 10/2018 )

          10 horas

        • Ingeniería de Muestra 2017 - Póster y setup experimental "Microscopio personalizado para la observación de estructuras biológicas 3D " (10/2017 - 10/2017 )

          10 horas

      • Pasantías

        • Pasantía en Ingeniería Eléctrica realizada en el Grupo de Óptica Aplicada del Instituto de Física de la Facultad de Ingeniería, bajo la supervisión de la Dra. Julia Alonso. (06/2017 - 12/2017 )

          Instituto de Física 15 horas semanales
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Microscopía, Óptica Aplicada

  • Sector Empresas/Privado - Empresa Privada - Uruguay

    SereLabs

    • Vínculos con la Institución

      • Funcionario/Empleado (01/2024 - 04/2026)Trabajo relevante

        AI Team Leader 30 horas semanales

• Producción científica/tecnológica

  • Producción bibliográfica

    • Artículos publicados

      • Arbitrados

        • GPU-optimized matrix method for phase retrieval with the transport of intensity equation (Completo, 2025)Trabajo relevante

          A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
          Applied Optics, 2025
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 21553165
          E-ISSN: 1559128X
          DOI: https://doi.org/10.1364/AO.544976
          
          

        • Quantitative phase microscopy for time-lapse hypoxia-induced cellular assays based on the transport of intensity equation (Completo, 2025)Trabajo relevante

          ALEJANDRO SILVA , MIGUEL AROCENA , JIMENA HOCHMANN , ARIEL FERNÁNDEZ , JULIA R. ALONSO
          Applied Optics, v.: 64 p.:1186 2025
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: United states
          ISSN: 21553165
          E-ISSN: 1559128X
          DOI: 10.1364/ao.544976
          https://doi.org/10.1364/ao.544976
          
          

        • Differential effects of coverslip-induced hypoxia and cobalt chloride mimetic hypoxia on cellular stress, metabolism, and nuclear structure (Completo, 2024)

          FLORENCIA LAMELA , RONELL BOLOGNA-MOLINA , FELIPE PARIETTI , VANESA PEREIRA-PRADO , MAGDALENA MILLÁN , ALEJANDRO SILVA , JUAN LLAGUNO , JULIA ALONSO , ARIEL FERNÁNDEZ , JOSÉ SOTELO-SILVEIRA , MANOELA DOMINGUES , MIGUEL AROCENA , JIMENA HOCHMANN
          Tissue and Cell, v.: 88 p.:102408 2024
          Lugar de publicación: United kingdom
          ISSN: 00408166
          DOI: 10.1016/j.tice.2024.102408
          https://doi.org/10.1016/j.tice.2024.102408
          
          

        • Real-time phase retrieval in division of aperture microscopy with the transport of intensity equation (Completo, 2024)

          ARIEL FERNÁNDEZ , JUAN M. LLAGUNO , ALEJANDRO SILVA , JULIA R. ALONSO
          Journal of the Optical Society of America A, v.: 41 2024
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: United states
          ISSN: 10847529
          E-ISSN: 15208532
          DOI: 10.1364/josaa.507385
          https://doi.org/10.1364/josaa.507385
          
          

        • Contributions of viral oncogenes and a hypoxic microenvironmentto oxidative stress and genetic damage in human keratinocytestransduced with E5/E6/E7 oncogenes of HPV-18 (Completo, 2023)

          J Hochmann , M Millán , A E Silva , J R Alonso
          Scientific Reports, 2023
          Palabras clave: Vicral Oncogenes hypoxic microenvironment kerationocytes
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20452322
          
          

        • Computational multifocus fluorescence microscopy for three-dimensional visualization of multicellular tumor spheroids (Completo, 2022)Trabajo relevante

          J R ALONSO / J ALONSO , A E Silva , A FERNÁNDEZ , MIGUEL AROCENA
          Journal of Biomedical Optics, 2022
          ISSN: 10833668
          E-ISSN: 15602281
          DOI: 10.1117/1.jbo.27.6.066501
          
          

        • Using a Variant Of Coverslip Hypoxia to Visualize Tumor Cell Alterations at Increasing Distances from an Oxygen Source (Completo, 2019)

          MIGUEL AROCENA , Mercedes Landeira , Andrés Di Paolo , A E Silva , SOTELO SILVEIRA, J. , A FERNÁNDEZ , J R ALONSO / J ALONSO
          Journal of Cellular Physiology, 2019
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 10974652
          DOI: https://doi.org/10.1002/jcp.28507
          
          

  • Publicación de trabajos presentados en eventos

    • Adaptive phase retrieval refinement for fast and accurate TIE-based quantitative phase imaging (2026)

      A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Completo
      Evento: Internacional
      Año del evento: 2026
      Publicación arbitrada
      Medio de divulgación: Internet
      

    • Understanding biological dynamics in 3D+t: a time-lapse multifocus microscopy approach (2025)

      JULIA R. ALONSO , ALEJANDRO SILVA , JIMENA HOCHMANN , MIGUEL AROCENA
      Publicado
      Resumen
      Descripción: Three-Dimensional Imaging, Visualization, and Display 2025
      Ciudad: Orlando, United States
      Año del evento: 2025
      Anales/Proceedings:Three-Dimensional Imaging, Visualization, and Display 2025
      Editorial: SPIE
      DOI: 10.1117/12.3053853
      https://doi.org/10.1117/12.3053853
      

    • Regularization filter passband width improvement on Quantitative Phase Imaging for Biological Assays in MS-TIE (2025)

      ALEJANDRO SILVA , MIGUEL AROCENA , JULIA ALONSO
      Publicado
      Completo
      Descripción: 3D Image Acquisition and Display: Technology, Perception and Applications
      Ciudad: Seattle, Washington
      Año del evento: 2025
      Anales/Proceedings:Optica Imaging Congress 2025 (3D, DH, COSI, IS, pcAOP,RadIT)
      Editorial: Optica Publishing Group
      Ciudad: Washington, D.C.
      DOI: 10.1364/3d.2025.jw2a.11
      https://doi.org/10.1364/3d.2025.jw2a.11
      

    • Focus-extended Stokes-Mueller Polarimetric Microscopy (2025)

      ROMAN DEMCZYLO , ALEJANDRO SILVA , JUAN M. LLAGUNO , JULIA R. ALONSO , ARIEL FERNÁNDEZ
      Publicado
      Resumen
      Descripción: Computational Optical Sensing and Imaging
      Ciudad: Seattle, Washington
      Año del evento: 2025
      Anales/Proceedings:Optica Imaging Congress 2025 (3D, DH, COSI, IS, pcAOP,RadIT)
      Editorial: Optica Publishing Group
      Ciudad: Washington, D.C.
      DOI: 10.1364/cosi.2025.jm4b.4
      https://doi.org/10.1364/cosi.2025.jm4b.4
      

    • Understanding Cell Nuclei Dynamics Through Refractive Index Microscopy (2025)

      ALEJANDRO SILVA , FELIPE PARIETTI , JUAN LLAGUNO , ROMAN DEMCZYLO , BELÉN GAÁL , JIMENA HOCHMANN , MIGUEL AROCENA , JULIA R. ALONSO , ARIEL FERNÁNDEZ
      Publicado
      Resumen
      Descripción: 3D Image Acquisition and Display: Technology, Perception and Applications
      Ciudad: Seattle, Washington
      Año del evento: 2025
      Anales/Proceedings:Optica Imaging Congress 2025 (3D, DH, COSI, IS, pcAOP,RadIT)
      Editorial: Optica Publishing Group
      Ciudad: Washington, D.C.
      DOI: 10.1364/3d.2025.3tu2a.1
      https://doi.org/10.1364/3d.2025.3tu2a.1
      

    • Snapshot Quantitative Phase Imaging in Multi-Perspective Microscopy (2024)

      ARIEL FERNÁNDEZ , JUAN M. LLAGUNO , ALEJANDRO SILVA , JULIA R. ALONSO
      Publicado
      Resumen
      Descripción: 3D Image Acquisition and Display: Technology, Perception and Applications
      Ciudad: Toulouse
      Año del evento: 2024
      Anales/Proceedings:Optica Imaging Congress 2024 (3D, AOMS, COSI, ISA, pcAOP)
      Editorial: Optica Publishing Group
      Ciudad: Washington, D.C.
      DOI: 10.1364/3d.2024.dth4h.4
      https://doi.org/10.1364/3d.2024.dth4h.4
      

    • Physics-Informed Multifocus Fluorescence and Quantitative Phase Imaging for Comprehensive Cellular Analysis (2024)

      JULIA R. ALONSO , ALEJANDRO SILVA , JUAN LLAGUNO , ROMAN DEMCZYLO , ARIEL FERNÁNDEZ , MIGUEL AROCENA
      Publicado
      Resumen
      Descripción: Computational Optical Sensing and Imaging
      Ciudad: Toulouse
      Año del evento: 2024
      Anales/Proceedings:Optica Imaging Congress 2024 (3D, AOMS, COSI, ISA, pcAOP)
      Editorial: Optica Publishing Group
      Ciudad: Washington, D.C.
      DOI: 10.1364/cosi.2024.ctu1b.1
      https://doi.org/10.1364/cosi.2024.ctu1b.1
      

    • Integral Phase Imaging for 3D Refractive Index Retrieval with the Transport of Intensity Equation (2024)

      ARIEL FERNÁNDEZ , ALEJANDRO SILVA , MIGUEL AROCENA , JULIA R. ALONSO
      Publicado
      Resumen
      Descripción: 3D Image Acquisition and Display: Technology, Perception and Applications
      Ciudad: Toulouse
      Año del evento: 2024
      Anales/Proceedings:Optica Imaging Congress 2024 (3D, AOMS, COSI, ISA, pcAOP)
      Editorial: Optica Publishing Group
      Ciudad: Washington, D.C.
      DOI: 10.1364/3d.2024.dth1h.3
      https://doi.org/10.1364/3d.2024.dth1h.3
      

    • Quantitative Phase Microscopy of hypoxic epithelial cells using the Transport of Intensity Equation (2024)

      ALEJANDRO SILVA , MIGUEL AROCENA , ARIEL FERNÁNDEZ , JULIA R. ALONSO
      Publicado
      Resumen
      Descripción: Digital Holography and Three-Dimensional Imaging
      Ciudad: Paestum
      Año del evento: 2024
      Anales/Proceedings:Optica Digital Holography and Three-Dimensional Imaging 2024 (DH)
      Editorial: Optica Publishing Group
      Ciudad: Washington, D.C.
      DOI: 10.1364/dh.2024.m3a.3
      https://doi.org/10.1364/dh.2024.m3a.3
      

    • All-in-focus reconstruction of a dynamic scene from multiple-multifocus captures (2023)

      JULIA R. ALONSO , ALEJANDRO SILVA
      Publicado
      Resumen
      Descripción: Computational Imaging VII
      Ciudad: Orlando, United States
      Año del evento: 2023
      Anales/Proceedings:Computational Imaging VII
      Editorial: SPIE
      DOI: 10.1117/12.2663903
      https://doi.org/10.1117/12.2663903
      

    • Cell viability test with images from a 3D printed microscope (2023)

      A E Silva , MIGUEL AROCENA , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Completo
      Evento: Internacional
      Año del evento: 2023
      Publicación arbitrada
      Medio de divulgación: Internet
      DOI: https://doi.org/10.1364/FIO.2023.JM7A.38
      

    • Field-of-view extension and XY-drift correction in microscopy for large samples (2022)

      A E Silva , MIGUEL AROCENA , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: Imaging and Applied Optics Congress
      Ciudad: Vancouver, Canadá
      Año del evento: 2022
      Medio de divulgación: Internet
      DOI: https://doi.org/10.1364/COSI.2022.CTu4F.6
      

    • Field-of-view extension and XY-drift correction in microscopy for large samples (2022)

      ALEJANDRO SILVA , MIGUEL AROCENA , JULIA R. ALONSO
      Publicado
      Completo
      Descripción: Computational Optical Sensing and Imaging
      Ciudad: Vancouver, British Columbia
      Año del evento: 2022
      Anales/Proceedings:Imaging and Applied Optics Congress 2022 (3D, AOA, COSI, ISA, pcAOP)
      Editorial: Optica Publishing Group
      Ciudad: Washington, D.C.
      DOI: 10.1364/cosi.2022.ctu4f.6
      https://doi.org/10.1364/cosi.2022.ctu4f.6
      

    • Impresión 3D y plataformas de código abierto aplicadas a la extensión del campo de visión en microscopía (2022)

      A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Completo
      Evento: Nacional
      Ciudad: Colonia, Uruguay
      Año del evento: 2022
      Medio de divulgación: Internet
      

    • Open-source electronic platforms and 3D printing for Microscopic Imaging. (2022)

      A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: International Workshop on Adaptive, Compressive and Computational Imaging (WACCI)
      Ciudad: Bucaramanga, Colombia
      Año del evento: 2022
      Medio de divulgación: Internet
      

    • 3D printed microscope with open-source electronic platforms for multiplex essays (2022)

      A E Silva , MIGUEL AROCENA , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Resumen
      Descripción: Optics and its Applications (ICTP)
      Ciudad: Cali, Colombia
      Año del evento: 2022
      Medio de divulgación: Internet
      

    • Open Source Electronic Platforms and 3D Printing for Microscopy: a Cost-effective Approach (2022)

      A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Completo
      Evento: Internacional
      Descripción: Latin America Optics and Photonics Congress
      Ciudad: Recife, Pernambuco, Brasil
      Año del evento: 2022
      Medio de divulgación: Internet
      

    • Focus stacking and 3D visualization in multispectral microscopy of thick samples (2021)

      JULIA R. ALONSO , ALEJANDRO SILVA , ARIEL FERNÁNDEZ , MIGUEL AROCENA
      Publicado
      Completo
      Descripción: 3D Image Acquisition and Display: Technology, Perception and Applications
      Ciudad: Washington, DC
      Año del evento: 2021
      Anales/Proceedings:OSA Imaging and Applied Optics Congress 2021 (3D, COSI, DH, ISA, pcAOP)
      Editorial: Optica Publishing Group
      Ciudad: Washington, D.C.
      DOI: 10.1364/3d.2021.3f2a.4
      https://doi.org/10.1364/3d.2021.3f2a.4
      

    • 3D-Printed Autofocus Custom-Built Microscope for Extended Field-of-View Imaging of Large Biological Samples (2021)

      A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: Frontiers in Optics + Laser Science
      Año del evento: 2021
      

    • Computational multimodal and multifocus 3D microscopy (2020)

      J R ALONSO / J ALONSO , A E Silva , MIGUEL AROCENA
      Publicado
      Completo
      Evento: Internacional
      Descripción: SPIE Photonics Europe, 2020, Online Only, France
      Año del evento: 2020
      Anales/Proceedings:Unconventional Optical Imaging II;
      Volumen:11351
      Fascículo: 11351
      Publicación arbitrada
      Medio de divulgación: Internet
      DOI: https://doi.org/10.1117/12.2556008
      

    • Image Registration in Multi-Focus Fluorescence Microscopy (2019)

      A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Completo
      Evento: Internacional
      Ciudad: Valparaíso, Chile
      Año del evento: 2019
      Medio de divulgación: Internet
      

    • 3d visualization in multifocus fluorescense microscopy (2019)

      J R ALONSO / J ALONSO , A E Silva , MIGUEL AROCENA
      Publicado
      Completo
      Evento: Internacional
      Descripción: SPIE Defense + Commercial Sensing
      Ciudad: Baltimore, Maryland, United States
      Año del evento: 2019
      Anales/Proceedings:Three-Dimensional Imaging, Visualization, and Display 2019
      Volumen:10997
      Publicación arbitrada
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica /
      Medio de divulgación: Papel
      DOI: 10.1117/12.2520067
      

    • Corrección automática en escaneo axial óptico multifocal (2018)

      A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Resumen
      Evento: Nacional
      Descripción: XVI Reunión de la Sociedad Uruguaya de Física (SUF)
      Ciudad: Conchillas, Colonia, Uruguay
      Año del evento: 2018
      Publicación arbitrada
      Medio de divulgación: Internet
      

    • Preparación de esferoides tumorales multicelulares, adquisición de imágenes multi-foco y corrección de escala para microscopio personalizado (2017)

      A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Resumen
      Evento: Nacional
      Descripción: Seminario Interdisciplinario "Procesamiento y Análisis de Imágenes Biomédicas" SIMBIO
      Ciudad: Montevideo
      Año del evento: 2017
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      

    • Corrección de escala de imágenes multi-foco para microscopio personalizado (custom-built microscope) (2017)

      A E Silva , Mercedes Landeira , A FERNÁNDEZ , MIGUEL AROCENA , J R ALONSO / J ALONSO
      Publicado
      Resumen
      Evento: Nacional
      Descripción: XV Reunión de la Sociedad Uruguaya de Física (SUF)
      Ciudad: CLUBUR, Montevideo
      Año del evento: 2017
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica /
      Medio de divulgación: Internet
      

  • Otros datos relevantes

    • Premios, Honores y Títulos

      • Mejor Proyecto de Ing. Eléctrica (Categoría Señales) (2020)

        (Nacional)
        Fundación Julio Ricaldoni
        https://www.ricaldoni.org.uy/noticias/428-ingenieria-demuestra-2020-premios.html
        

    • Presentaciones en eventos

      • SPIE WEST (2026)

        Congreso
        Adaptive phase retrieval refinement for fast and accurate TIE-based quantitative phase imaging
        Estados Unidos
        Tipo de participación: Expositor oral
        Nombre de la institución promotora: SPIE
        Alcance geográfico: Internacional

      • SPIE Summer School Biophotonics (2025)

        Encuentro
        Regularization filter passband width improvement on Quantitative Phase Imaging for Biological Assays in MS-TIE
        Suecia
        Tipo de participación: Poster
        Nombre de la institución promotora: SPIE
        Alcance geográfico: Internacional

      • Workshop Río de la Plata (2025)

        Congreso
        Spectrum Optimization for Phase Retrieval through the Transport of Intensity Equation
        Uruguay
        Tipo de participación: Expositor oral
        Alcance geográfico: Internacional

      • Optica Digital Holography and Three-Dimensional Imaging 2024 (DH) (2024)

        Congreso
        Quantitative Phase Microscopy of hypoxic epithelial cells using the Transport of Intensity Equation
        Italia
        Tipo de participación: Expositor oral
        Alcance geográfico: Internacional

      • International Workshop on Adaptive, Compressive and Computational Imaging WACCI (2024)

        Congreso
        Transport of Intensity Equation in Microscopy: improvements in algorithms and biological applications
        Uruguay
        Tipo de participación: Expositor oral
        Alcance geográfico: Internacional

      • Frontiers in Optics 2023 (2023)

        Congreso
        Cell viability test with images from a 3D printed microscope
        Estados Unidos
        Tipo de participación: Poster
        Alcance geográfico: Internacional

      • Latin America Optics and Photonics Conference 2022 (2022)

        Congreso
        Open Source Electronic Platforms and 3D Printing for Microscopy: a Cost-effective Approach
        Brasil
        Tipo de participación: Poster
        Alcance geográfico: Internacional

      • Imaging and Applied Optics Congress (2022)

        Congreso
        Field-of-view extension and XY-drift correction in microscopy for large samples
        Canadá
        Tipo de participación: Expositor oral

      • Optics and its Applications (ICTP) (2022)

        Congreso
        3D printed microscope with open-source electronic platforms for multiplex essays
        Colombia
        Tipo de participación: Poster

      • International Workshop on Adaptive, Compressive and Computational Imaging WACCI (2019)

        Congreso
        When imaging a 3D biological sample through a microscope the resulting images within the multi-focus z-stack often show both defocus and different field-of-view (FOV) due to limitations of the optics. Image registration then becomes a necessary step prior to the implementation of a multi-focus image fusion algorithm to reconstruct an all-in-focus image or a 3D visualization of the sample. New approaches to this problem are needed since traditional solutions such as visual feature descriptors tends to fail due to strong defocus.
        Chile
        Tipo de participación: Poster
        Carga horaria: 15
        Nombre de la institución promotora: Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, Chile.

      • International Workshop on Adaptive, Compressive and Computational Imaging WACCI (2019)

        Congreso
        When imaging a 3D biological sample through a microscope the resulting images within the multi-focus z-stack often show both defocus and different field-of-view (FOV) due to limitations of the optics. Image registration then becomes a necessary step prior to the implementation of a multi-focus image fusion algorithm to reconstruct an all-in-focus image or a 3D visualization of the sample. New approaches to this problem are needed since traditional solutions such as visual feature descriptors tends to fail due to strong defocus.
        Chile
        Tipo de participación: Expositor oral
        Carga horaria: 15
        Nombre de la institución promotora: Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, Chile.

      • Primer Workshop Anual de Microscopia Avanzada de Fluorescencia y Biofotónica (2019)

        Taller
        Corrección de FOV en Microscopía Óptica Computacional
        Uruguay
        Tipo de participación: Poster
        Nombre de la institución promotora: Hospital de Clínicas, UdelaR

      • XVI Reunión de la Sociedad Uruguaya de Física (2018)

        Congreso
        Corrección automática en escaneo axial óptico multifocal
        Uruguay
        Tipo de participación: Poster
        Nombre de la institución promotora: Sociedad Uruguaya de Física Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica
        

      • XV Reunión de la Sociedad Uruguaya de Física (2017)

        Congreso
        Corrección de escala de imágenes multi-foco para microscopio personalizado
        Uruguay
        Tipo de participación: Poster
        Nombre de la institución promotora: Sociedad Uruguaya de Física Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica
        

      • Seminario Interdisciplinario "Procesamiento y Análisis de Imágenes Biomédicas", SIMBIO. (2017)

        Seminario
        Preparación de esferoides tumorales multicelulares, adquisición de imágenes multi-foco y corrección de escala para microscopio personalizado
        Uruguay
        Tipo de participación: Poster Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información / Ingeniería Eléctrica y Electrónica / Procesamiento de señales
        

    • Construcción institucional

      Participación como suplente en la comisión de instituto del instituto de física de la Facultad de Ingeniería

  • Formación de RRHH

    • Tutorías en marcha

      • Otras

        • Pasantía en Ingeniería Eléctrica en Laboratorio de Óptica Aplicada (2025)

          Otras tutorías/orientaciones
          Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Instituto de Física , Uruguay
          Programa: Ingeniería Eléctrica
          Tipo de orientación: Cotutor
          Nombre del orientado: Belén Gaàl
          País/Idioma: Uruguay,