María Lucía SPANGENBERG TORRE
PhD

  • Datos Personales

    • Identidad

      Nombre en citaciones bibliográficas: LUCIA SPANGENBERG
      Documento: Cédula de identidad uruguay - 42041260 , Pasaporte/Documento extranjero - 42041260
      Sexo: Femenino
      País de pasaporte: Uruguay
      Fecha de nacimiento: 20/09/1983
      Lugar de nacimiento: Uruguay / Montevideo / Montevideo
      País de Nacionalidad: Uruguay

    • Dirección personal

      Dirección: messina 5679 / 11400
      País: Uruguay / Montevideo / Montevideo
      Teléfono: (598) 099528977
      Correo electrónico: lucia83@gmail.com

  • Datos Generales

    • Institución principal

      Institut Pasteur de Montevideo/ Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Bioinformatica / Uruguay

    • Dirección institucional

      Institución: Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas
      Dirección: Mataojo 2020 / 11400
      País: Uruguay / Montevideo / Montevideo
      Teléfono: (00582) 5220910
      Correo electrónico/Sitio Web: lucia@pasteur.edu.uy http://www.pasteur.edu.uy/

  • Formación

    • Formación académica

      • Concluida

        • Doctorado

          • PEDECIBA BIOLOGIA (2011 - 2013)
            Institut Pasteur de Montevideo - Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Estudios bioinformáticos de los mecanismos de diferenciación y autorenovación de las células madre adultas
            Tutor/es: Bruno Dallagiovanna
            Obtención del título: 2014
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
            Palabras Clave: Bioinformática células madre transcriptomica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática

          Maestría

          • Diplom (2007 - 2009)
            Universitat Tuebingen (Eberhard-Karls) , Alemania
            Título de la disertación/tesis/defensa: Algorithms for the comparative analysis of ChIP-chip, ChIP-Seq and expression data
            Tutor/es: Dr. Kay Nieselt, Prof. Dr. Med Carsten Müller-Tidow
            Obtención del título: 2009
            Palabras Clave: ChIP-chip ChIP-seq NGS
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática

        • Grado

          • Diplom (2003 - 2007)
            Universitat Tuebingen (Eberhard-Karls) , Alemania
            Título de la disertación/tesis/defensa: Exploration of signal transduction networks
            Tutor/es: Prof. Dr. Andreas Zell, Dr. Jochen Supper
            Obtención del título: 2007
            Palabras Clave: Bow tie signal transduction
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática

    • Formación complementaria

      • Concluida

        • Posdoctorados

          • genomica humana (2014 - 2017)
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
            Palabras Clave: genomica genomica medica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución /

        • Cursos de corta duración

          • PhD Summer School in Ancient DNA and Human History (08/2019 - 08/2019)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / IT University of Copenhagen / Faculty of science , Dinamarca
            Palabras Clave: ancient DNA genomica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica antigua
          • Introduction to Genetics and Evolution (01/2016 - 01/2016)
            Sector Extranjero/Internacional/Enseñanza superior / Duke University , Estados Unidos
            Palabras Clave: evolution genetics
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución /
          • Taller de internacionalización (01/2016 - 01/2016)
            Sector Gobierno/Público / Ministerio de Industria, Energía y Minería / Ministerio de Industria, Energía y Minería , Uruguay
            16 horas
            Palabras Clave: internacionalizacion
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / bioinformatica
          • Working with the Human Genome Sequence (01/2014 - 01/2014)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Wellcome Trust , Inglaterra
            40 horas
            Palabras Clave: Bioinformatics Human genome Online tools
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • Data Analysis and Statistical Inference (01/2014 - 01/2014)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Duke University , Estados Unidos
            40 horas
            Palabras Clave: Inference R programming
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Matemáticas / Estadística y Probabilidad /
          • Workshop on post-transcriptional regulation in Eukaryotes (01/2013 - 01/2013)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Institu Oswaldo Cruz , Brasil
            30 horas
            Palabras Clave: Stem cell differentiation post-transcriptional regulation NGS
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • Métodos Estadísticos para Predicción Genómica (01/2012 - 01/2012)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Agronomía , Uruguay
            Palabras Clave: estadistica prediccion genomica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Matemáticas / Estadística y Probabilidad /
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • Escuela Latinoamericana de Genética Humana y Médica (01/2011 - 01/2011)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Rede latino americana de genetica humana , Brasil
            40 horas
            Palabras Clave: Genética humana
          • Curso de estadística de datos longitudinales (01/2011 - 01/2011)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
            Palabras Clave: datos longitudinales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
            Ciencias Naturales y Exactas / Matemáticas / Estadística y Probabilidad /
          • Taller de Genomica: desde los microarrays al secuenciado masivo (01/2009 - 01/2009)
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
            25 horas
            Palabras Clave: genomica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          • Citometria de flujo (01/2009 - 01/2009)
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
            6 horas
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Biologia celular

        • Participación en eventos

          • Seminario de bioinformática aplicada (2006)
            Tipo: Seminario
            Institución organizadora: Univarsität Tübingen, Alemania
            Palabras Clave: multiple sequence alignment
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

        • Otras instancias

          • Reunion de trabajo con Bruno Dallagiovanna en ICC Fiocruz Curitiba (2025)
            Brasil
            Palabras Clave: genomica medica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          • Reunion de trabajo conjunta ("Hackathon") con el grupo de Latincells en Ciudad de Mexico (2025)
            México
            Palabras Clave: genomica humana
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          • Defensa presencial ante evaluadores internacionales del proyecto "Latin Pangenome" en la sede del Wellcome Trust en Londres, el cual fue aprobado en febrero 2025. (2025)
            Inglaterra
            Palabras Clave: genomica humana genomica evolutiva
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          • Pasantía en Bioinformática en Eberhardt Karls Universität (2011)
            Alemania
            Palabras Clave: genomica evolutiva bioinformatica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática

  • Idiomas

    • Alemán
      Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien
    • Inglés
      Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien
    • Portugués
      Entiende bien / Habla regular / Lee muy bien / Escribe regular
    • Español
      Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien

  • Areas de actuación

    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias de la Computación e Información /Ciencias de la Información y Bioinformática /Bioinformática

  • Actuación profesional

    • Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

      Hospital de Clínicas / Departamento Básico

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (03/2022 - a la fecha)Trabajo relevante
          Profesor adjunto 20 horas semanales
          Escalafón: Docente
          Grado: Grado 3
          Cargo: Interino

      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • Genómica médica (03/2022 - a la fecha )
            Estudios de genoma o exoma para aportar al diagnóstico de enfermedades genéticas, en especial enfermedades raras.
            Mixta
            20 horas semanales
            Departamento Básico de Medicina , Coordinador o Responsable
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , RAGGIO V , NAYA H , Camila Simoes , M. Brandes
            Palabras clave: genomica medica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Bioinformatica
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • Perfil genético de la Esclero-Hialinosis Focal y Segmentaria Primaria en Uruguay (01/2022 - a la fecha )
            El objetivo es generar una base de datos de pacientes con diagnóstico de EHFyS (Esclero-Hialinosis Focal y Segmentaria Primaria) confirmado por PBR y con alta probabilidad de tener una base genética que explique la lesión histológica. Análisis retrospectivo del Programa de Prevención de Glomerulopatías con el objetivo de reclutar a los pacientes con diagnóstico de EHFyS con debut a edades menores a los 25 años o a cualquier edad con una fuerte sospecha de enfermedad genética familar, cuyo diagnóstico etiológico fue el de EHFyS primaria en algún miembro de la familia y cuyo comportamiento clínico fue de cortico-resistencia. Realizar un análisis descriptivo (prospectivo y retrospectivo) y genómico de pacientes adultos con una lesión de EHFyS documentada y antecedentes familiares de enfermedad renal crónica (especialmente síndrome nefrótico). Resultados esperados: Comprobar causa genética de EHFyS en la población a estudiar que asocien resistencia a los múltiples regímenes de tratamiento inmunosupresor, y en la mayoría de los casos con una historia familiar de ERCT (enfermedad renal crónica terminal) de etiología no aclarada o con lesión documentada de EHFyS. Lograr tener una base genética nacional sobre EHFyS, y en un futuro irla ampliado a otras enfermedades renales de causa genética. Buscar a nivel nacional las causas genéticas más frecuentes que se asocian con un comportamiento de resistencia a los tratamientos inmunosupresores pautados.
            Mixta
            5 horas semanales
            Departamento Básico de Medicina , Integrante del equipo
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , Federico Yandian , Boggia, Jose , NAYA H , RAGGIO V , CAYOTA, A.
            Palabras clave: genómica médica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica
          • Desarrollo e implementación de procedimientos genómicos para el diagnóstico de suceptibilidad hereditaria al cancer de mama y ovario en el Hospital Universitario (01/2016 - a la fecha )
            Al igual que en el mundo occidental, en nuestro país el cáncer de mama es el más frecuente y la primera causa de muerte por cáncer en la mujer con un promedio de más de 1900 casos nuevos por año representando el 28% de todos los cánceres. El cáncer de mama da cuenta de casi 680 muertes anuales con una tasa ajustada de mortalidad de 20,66, lo que representa el 18,6 % de todas las muertes por cáncer. Los objetivos primarios de este proyecto fueron y siguen siendo i) implementar capacidades genómicas diagnósticas en el Hospital de Clínicas; ii) desarrollar procedimientos moleculares propios con tecnologías de última generación que aseguren procedimientos de alta sensibilidad y exactitud; iii) asegurar una reducción significativa de los costos para universalizar el acceso; iv) conocer las características y variablidad genéticas propias de nuestra población; v) aportar asesoramiento genético a familias con predisposición hereditaria al cáncer de mama y ovario; vi) contribuir a la prevención y tratamiento del cáncer de mama y ovario. A través de este trabajo hemos estudiado 104 familias con historia personal y/o familiar compatibles con predisposición hereditaria utilizando distintas herramientas genómicas que incluyeron: secuenciado masivo de un panel de 11 genes con evidencia experimental de contribuir al riesgo hereditario al cáncer de mama, estudios de detección de grandes deleciones de genes BRCA1 y BRCA2 y secuenciado del exoma completo (secuenciado de 180.000 exones de 20.000 genes).
            Mixta
            5 horas semanales
            Departamento Basico de Medicina y Unidad de Bioinformatica del Institut Pasteur de Montevideo , Integrante del equipo
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , CAYOTA, A. , NAYA H , Camila Simoes , ARTAGAVEYTIA N. , POSSI-PEZZALI, T. , SANGUINETTI.J , Blanco, V
            Palabras clave: genomica medica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica medica

        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • Grupos CSIC 2022 (03/2023 - a la fecha)
            Herramientas genómicas aplicadas en salud humana: Las aplicaciones de herramientas de la genética y la genómica en Medicina son múltiples, de larga data y en constante crecimiento. Por otro lado, abarcan a todas las especialidades de la Medicina, siendo en algunas de ellas imprescindibles para el diagnóstico y el manejo del paciente. Nuestro grupo viene trabajando, desde distintas aproximaciones, en el tema desde hace varios años, y desde 2015 en una colaboración que lleva a la conformación del grupo planteado en este proyecto. Nos planteamos para una nueva etapa una serie de objetivos que son, por una parte, la continuación, sistematización y ampliación de las líneas de trabajo que se venían ya desarrollando, y por otro, la incorporación de nuevas tecnologías y nuevas líneas de trabajo, así como nuevas interacciones con grupos clínicos y de investigación pura.Para lograr estos objetivos es necesario el desarrollo de un grupo de trabajo en genética y genómica humana (orientado a la clínica) fuerte, innovador, con proyección de crecimiento, insertado en el sistema de salud, y en continua interacción con otros grupos. Pensamos que con la financiación adecuada y el marco que nos daría este proyecto los mismos se lograrán y el grupo se consolidará a futuro, y tendrían un fuerte impacto en atención a la salud de nuestra población, formación de recursos humanos en genética y genómica y generación de conocimiento.
            10 horas semanales
            Hospital de Clinicas , Departamento Basico de Medicina
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Doctorado:1
            Financiación:
            Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG (Responsable) , Raggio V (Responsable) , Naya H , Batalla A , Dominguez F , Soledad Rodriguez , Alejandra Tapie , Nicolas Delloca
            Palabras clave: genomica medica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          • ESTUDIO FARMACOGENÉTICO DE CLOZAPINA EN PACIENTES CON ESQUIZOFRENIA (03/2022 - 06/2025 )
            Código: FMV_3_2020_1_162251 Estudio de los genes CYPs relevantes en el procesamiento de la Clozapina.
            5 horas semanales
            Integrante del Equipo
            Concluido
            RRHH formados en el proyecto:
            Pregrado:1
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , Magdalena CÁRDENAS RODRÍGUEZ , José Luis BADANO CABALLERO , Mauricio Federico TOLEDO NUNEZ , Marta VÁZQUEZ MESA , Mauricio Gustavo MATO BONILLA , Sabrina Muriel Acuña Alemán , Cecilia MALDONADO CORBO , Natalia Guevara Trimble , Carina Ricciardi , Ismael Raúl OLMOS MALET (Responsable)
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Clínica / Psiquiatría / Psicofarmacología
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          • Perfil genético de la Esclero-Hialinosis Focal y Segmentaria Primaria en Uruguay (05/2022 - 12/2023 )
            La EHFyS (esclerohialinosis focal y segmentaria) es el hallazgo histológico más frecuente de las glomerulopatías primarias a nivel nacional, y uno de los más frecuentes a nivel internacional. Según las causas, la EHFyS se puede clasificar en formas primarias, secundarias (incluyendo las formas adaptativas) y genéticas. Distinguir la EHFyS genética de la enfermedad idiopática puede ser muy difícil o incluso imposible sin el uso de un análisis genético, una historia de enfermedad familiar y muchas veces (sobre todo en niños) un comportamiento clínico con resistencia a los glucocorticoides. Los pacientes con formas genéticas de EHFyS pueden presentar una amplia gama de características clínicas, dependiendo de la mutación genética involucrada. A nivel mundial ha crecido el interés y diagnóstico en las enfermedades genéticas, entrando esta glomerulopatía en un número no despreciable de casos, vinculada a causa genética. El objetivo es generar una base de datos de pacientes con diagnóstico de EHFyS confirmado por PBR y con alta probabilidad de tener una base genética que explique la lesión histológica. Materiales y métodos: Análisis retrospectivo del Programa de Prevención de Glomerulopatías (PPTG) con el objetivo de reclutar a los pacientes con diagnóstico de EHFyS con debut a edades menores a los 25 años o a cualquier edad con una fuerte sospecha de enfermedad genética familar, cuyo diagnóstico etiológico fue el de EHFyS primaria en algún miembro de la familia y cuyo comportamiento clínico fue de cortico-resistencia. Realizar un análisis descriptivo prospectivo y retrospectivo de pacientes adultos con una lesión de EHFyS documentada y antecedentes familiares de enfermedad renal crónica (especialmente síndrome nefrótico). Resultados esperados: Comprobar causa genética de EHFyS en la población a estudiar que asocien resistencia a los múltiples regímenes de tratamiento inmunosupresor, y en la mayoría de los casos con una historia familiar de ERCT (enfermedad renal crónica terminal) de etiología no aclarada o con lesión documentada de EHFyS. Lograr tener una base genética nacional sobre EHFyS, y en un futuro irla ampliado a otras enfermedades renales de causa genética. Buscar a nivel nacional las causas genéticas más frecuentes que se asocian con un comportamiento de resistencia a los tratamientos inmunosupresores pautados.
            10 horas semanales
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            Concluido
            RRHH formados en el proyecto:
            Pregrado:1
            Maestría/Magister:1
            Financiación:
            Hospital de Clínicas, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , Camila Simoes , Lucía Urquiola , Federico Yandian , BOGGIA J. , NAYA H , CAYOTA, A. , NOBOA O , jimena cabrera
            Palabras clave: genomica medica nefrologia

    • Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas - Institut Pasteur de Montevideo - Uruguay

      Institut Pasteur de Montevideo

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (03/2021 - a la fecha)Trabajo relevante
          Investigador adjunto senior 40 horas semanales
        • Funcionario/Empleado (08/2017 - 03/2021)
          Investigador Asociado 16 horas semanales
        • Funcionario/Empleado (04/2014 - 07/2017)
          Post doc 40 horas semanales
        • Becario (03/2011 - 12/2013)Trabajo relevante
          Estudiante de doctorado 30 horas semanales
        • Otro (10/2009 - 03/2011)
          Cargo por proyecto 40 horas semanales / Dedicación total

      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • Estudios bioinformáticos de los mecanismos de diferenciación de las células madre adulta mesequimales (07/2010 - a la fecha )
            En el marco de mi doctorado se estudiarán los mecanismos de diferenciación y de autorrenovación de las células madre mesenquimales con tecnologías del tipo NGS. Hasta el momento, nos centramos mayormente en el meta-analisis e integración de datos; analizamos datos bajados de repositorios públicos y los integramos con el fin de sacar conclusiones de diferentes mecanismos de diferenciación.
            10 horas semanales
            IPMon, Unidad de Bioinformática , Integrante del equipo
            Equipo: H. NAYA , A. CORREA , B. DALLAGIOVANNA
            Palabras clave: Stem cell differentiation NGS SOLiD
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          • Genoma Humano (04/2014 - a la fecha )
            En el marco de esta línea de investigación se secuenciarán individuos uruguayos con el fin de descubrir variantes (SNPs, indels, CNV) características de nuestra población. Se caracterizarán varios subgrupos poblacionales, comenzando por un trío aleatorio (en marcha), seguido por un conjunto de 10 individuos con ancestría indígena, luego 10 de origen africano y culminando con 30 de la población uruguaya general. Una vez culminada esta etapa, se escogerá una enfermedad relevante para el país, y se secuenciarán 30 genomas con este fenotipo. Esta información proporcionará posibilidades de estudios subsiguientes, sobre todo en el área de la antropología biológica, bioinformática, farmacogenómica, etc.
            40 horas semanales
            IP Mon, Unidad de Bioinformática , Integrante del equipo
            Equipo: FARIELLO M , H. NAYA
            Palabras clave: genoma humano secuenciacion masiva descubrimiento de SNPs y variantes
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • Perfiles moleculares del cancer de mama (01/2011 - 01/2016 )
            Se estudian los perfiles moleculares pacientes con cáncer de mama de origen latino americano. La expresión génica se determina mediante microarrays de Agilent. Este proyecto se encuentra en el marco de una colaboración con varios países latinoamericanos y el NCI de USA.
            10 horas semanales
            NCI, Unidad de Bioinformática , Integrante del equipo
            Equipo: H. NAYA , CAYOTA , G. GREIF , USLACRN
            Palabras clave: Microarrays cancer de mama
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • Incorporación de incertidumbre filogenética en el método comparativo BPMM (10/2009 - 12/2013 )
            Se está desarrollando una herramienta para incorporar la incertidumbre filogenética al método comparativo a través de modelos mixtos con enfoques bayesianos. Dicho método permite estimar correlaciones de caracteres teniendo en cuenta las relaciones filogenéticas entre organismos. Se incorpora la incertidumbre de la reconstrucción del árbol filogenético en la estimación de los parámetros a través del promediado de modelos bayesiano ("bayesian model averaging", BMA). Con el lenguaje estadístico R se implementaron scripts para la manipulación y análisis de los datos y para la estimación de los parámetros. Actualmente se está desarrollando una interfaz gráfica en Java para integrar las distintas herramientas, facilitar el uso a usuarios que no dominan el scripting y agregar herramientas de diagnóstico.
            5 horas semanales
            IPMon, Bioinfórmatica , Integrante del equipo
            Equipo: H. NAYA , CAMARGO A , HECTOR ROMERO , N. REGO
            Palabras clave: Phylogenetic mixed models
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • Diseño de microarrays (04/2010 - 12/2012 )
            Diseño de microarrays para el estudio del efecto de drogas en enfermedades descuidadas. Se está interesado en determinar el efecto de fármacos sobre la expresión de genes en el Tripanosoma cruzi, brucei y Leishmania major. Con este fin se diseñaron "custom microarrays" de expresión de Agilent utilizando la herramienta online eArray.
            20 horas semanales
            IPMon, Unidad de Bioinformática , Integrante del equipo
            Equipo: SPANGENBERG L , G. GREIFF , C. ROBELLO , H. NAYA
            Palabras clave: microarrays design
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • Estudio de las enfermedades renales con base patogénica en alteraciones del complemento (06/2024 - a la fecha)
            Código: FOINE V El sistema del complemento tiene un rol creciente en los mecanismos patogénicos de las enfermedades renales. El uso de bloqueadores del complemento demuestra ser eficaz para contrarrestar estos mecanismos y mejorarla sobrevida renal. Sin embargo, el diagnóstico de las alteraciones del complemento es complejo, porlo que es necesario el desarrollo y puesta a punto de biotecnologías que permitan realizar un diagnóstico preciso y un tratamiento dirigido. Objetivos: estudiar el perfil de las alteraciones cuantitativas, funcionales y genéticas del complemento asociadas a la patogenia y tratamientos de enfermedades renales específicas en Uruguay. Material y métodos: captación de pacientes con diagnóstico nefropatías asociadas a activación de la vía del complemento por estudio histológico renal (Nefropatía IgA, Microangiopatía Trombótica, Glomerulopatia Membranoproliferativa y situaciones de Trasplante Renal) . Las fuentes de captación serán amplias incluyendo el Registro Uruguayo de Glomerulopatías (retrospectivo) y la referencia de nuevos casos (prospectivo) incluyendo trasplante renal. Se realizará estudio cuantitativo y funcional de los componentes y reguladores del complemento, así como el estudio genético por secuenciación de exoma para variantes vinculadas a alteración de la vía del complemento. Se interpretarán los resultados para cada caso particular y describirán agrupados por patología. En los casos que lo permitan se buscarán asociaciones entre alteraciones del complemento y la mayor o menor severidad del fenotipo clínico. Se monitorizará la respuesta de los componentes del complemento a los tratamientos instituidos. Resultados esperados: desarrollar y optimizar herramientas biotecnológicas para realizar el estudio cuantitativo, funcional y genético del complemento en enfermedades renales. Identificarlos fenotipos con mayor beneficio de los tratamientos dirigidos a bloquear el complemento. Avanzar en el conocimiento de los mecanismos patogénicos del complemento y de las variantes genéticas en las enfermedades renales. Apostamos al desarrollo y optimización de herramientas biotecnológicas que permitan realizar una medicina de precisión en las enfermedades renales.
            3 horas semanales
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Maestría/Magister:2
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG
          • Identificacion y validacion de biomarcadores relacionados a la obesidad y su respuesta a la cirugia bariatrica (01/2022 - a la fecha)
            Antecedentes: La obesidad plantea desafíos significativos, lo que requiere estrategias integrales para una intervención eficaz. La cirugía bariátrica (CB) ha surgido como un enfoque terapéutico crucial, demostrando éxito en la pérdida de peso y la mejora de comorbilidades. Objetivo: Este estudio tuvo como objetivo evaluar los resultados de la CB en una cohorte de 48 pacientes e investigar la interacción entre la CB y las características clínicas y metabólicas, con un enfoque específico en FSTL1, un biomarcador emergente asociado con la obesidad y la inflamación. Métodos: Realizamos un análisis cuantitativo de los resultados de la CB y construimos modelos lineales para identificar variables que impactan en el éxito de la CB. Se examinaron parámetros, incluidos factores clínicos y niveles prequirúrgicos de FSTL1, para determinar su correlación con las diferencias en el IMC antes y después de la intervención. Resultados: El estudio demostró la efectividad de la CB en la mejora de parámetros metabólicos y clínicos. De manera importante, se identificaron variables correlacionadas con el éxito de la CB, encontrándose que niveles más altos de FSTL1 prequirúrgicos se asociaron con un mayor efecto de la CB en la reducción del IMC. Conclusión: Esta investigación aporta información valiosa para comprender y predecir el éxito de la CB, destacando el potencial de FSTL1 como un biomarcador útil en la obesidad. Los hallazgos enfatizan la viabilidad de intervenciones terapéuticas personalizadas basadas en perfiles clínicos y biológicos individuales.
            5 horas semanales
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Especialización:1
            Financiación:
            Bioerix, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG (Responsable) , Gustavo Bruno (Responsable) , ESCANDE C , BADANO JL , SANTOS L , Mariana Patrone
            Palabras clave: cirugia bariatrica obesidad modelos lineales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformatica
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
            Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Clínica / Medicina General e Interna /
          • LatinCells (05/2023 - a la fecha)
            LatinCells es una iniciativa pionera, financiada por la Chan Zuckerberg Initiative (CZI), que busca mapear la diversidad celular de América Latina, contribuyendo así al Human Cell Atlas. A través de la genómica de célula única, facilitamos la educación, la investigación y la colaboración para descifrar la complejidad de los datos genómicos en la población latino-americana (www.latincells.org).
            5 horas semanales
            Unidad de Bioinformatica
            Investigación
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Maestría/Magister:1
            Doctorado:1
            Financiación:
            Chan Zuckerberg Initiative, Estados Unidos, Apoyo financiero
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , Camila Simoes , I. CORVO , M. Brandes , NAYA H
            Palabras clave: genomica transcriptomica single cell
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          • Caracterización de las fluctuaciones anuales en las comunidades microbianas en sistemas de tratamientos de efluentes (07/2021 - a la fecha)
            El objetivo de este proyecto es utilizar el sistema de monitoreo desarrollado en el proyecto "Puesta a punto de un sistema para el monitoreo de comunidades microbianas en sistemas de tratamientos de efluentes" para la caracterización anual de las comunidades microbianas de sistemas de efluentes y evaluar su relación con distintos parámetros.
            5 horas semanales
            Investigación
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , FERNÁNDEZ-CALERO T , DOMINGUEZ, M
            Palabras clave: genomica microbioma efluentes bioinformatica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica
          • Herramientas genómicas aplicadas en salud humana (Grupos CSIC) (03/2023 - a la fecha)
            Las aplicaciones de herramientas de la genética y la genómica en Medicina son múltiples, de larga data y en constante crecimiento. Por otro lado, abarcan a todas las especialidades de la Medicina, siendo en algunas de ellas imprescindibles para el diagnóstico y el manejo del paciente. Nuestro grupo viene trabajando, desde distintas aproximaciones, en el tema desde hace varios años, y desde 2015 en una colaboración que lleva a la conformación del grupo planteado en este proyecto. Nos planteamos para una nueva etapa una serie de objetivos que son, por una parte, la continuación, sistematización y ampliación de las líneas de trabajo que se venían ya desarrollando, y por otro, la incorporación de nuevas tecnologías y nuevas líneas de trabajo, así como nuevas interacciones con grupos clínicos y de investigación pura.Para lograr estos objetivos es necesario el desarrollo de un grupo de trabajo en genética y genómica humana (orientado a la clínica) fuerte, innovador, con proyección de crecimiento, insertado en el sistema de salud, y en continua interacción con otros grupos. Pensamos que con la financiación adecuada y el marco que nos daría este proyecto los mismos se lograrán y el grupo se consolidará a futuro, y tendrían un fuerte impacto en atención a la salud de nuestra población, formación de recursos humanos en genética y genómica y generación de conocimiento.
            10 horas semanales
            Bioinformatica
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Maestría/Magister:4
            Doctorado:1
            Financiación:
            Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , Camila Simoes , M. Brandes , NAYA H , RAGGIO V , soledad rodriguez , Dra. Ana Batalla , TORT, J F , DOMINGUEZ, M , Tapie, A , FONTENLA S. , DELLOCA N
            Palabras clave: genomica medica enfermedades raras bioinformatica
          • Caracterización de la población uruguaya usando low-pass sequencing (ACIP Pasteur) (09/2022 - a la fecha)
            A través de distintos estudios se ha concluido que Uruguay es una población con mestizaje y con una estructura compleja, sin embargo esta no se encuentra bien caracterizada, dado que la muestra para estos estudios era pequeña (30 genomas). Este proyecto busca caracterizar adecuadamente la población uruguaya mediante un muestreo representativo del país usando low-pass sequencing (aproximadamente 850 individuos), con el fin de crear una representación más completa de la población, como primer paso de análisis en estudios demográficos, de selección y mestizaje.
            15 horas semanales
            Unidad de Bioinformática , Unidad de Bioinformática
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Maestría/Magister:1
            Doctorado:1
            Financiación:
            Institut Pasteur International Network, Francia, Apoyo financiero
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG (Responsable) , Camila Simoes
            Palabras clave: genomica humana genómica de poblaciones
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica
          • Herramientas genómicas costo-efectivas para el diagnóstico de enfermedades raras (ANII Fondo Sectorial de Salud FSS_X_2022_1_173209) (03/2023 - 03/2025 )
            Las enfermedades raras (ER) representan un problema medico, familiar y social, por la problematica que genera para el paciente, su familia, el sistema de salud y la sociedad. Se estima que el 7% de la población mundial padece de este tipo de enfermedades. Los pacientes con ER deben superar con frecuencia una "odisea diagnóstica", la cual implica múltiples consultas con especialistas y diversos estudios, durante largos períodos de tiempo (en promedio 5 años), para obtener un diagnóstico adecuado. Este diagnóstico tardío puede tener un gran impacto en la calidad de vida y aún en el pronóstico, además del desgaste emocional y el gasto económico que implica. Este proyecto busca, por un lado, aportar al diagnóstico de las ER a través de tecnologías de secuenciación masiva, como el exoma completo. Consideramos a esta herramienta la más adecuada, dado que el 80% de las enfermedades mendelianas son ocasionadas por cambios en estas regiones. Por el otro, se plantea desarrollar un pipeline bioinformático basado ?en la nube? para disminuir sustancialmente los tiempos de análisis, pasando de varios días que requiere el análisis bioinformático, incluso en clusters de gran capacidad, a 10 minutos por cada caso. Esto no sólo implica acortar los tiempos diagnósticos, sino que también se democratiza el acceso a dichos análisis ya que no sería necesario contar con una gran infraestructura computacional local. Asimismo, se propondrán lineamientos generales para homogeneizar los pasos diagnósticos para la indiciación de estudios genómicos en los pacientes con ER. Por otro lado, se estimarán los costos que implican para el sistema de salud y el estado en general las enfermedades raras, y el impacto económico de un diagnóstico tardío. Finalmente, los datos de las variantes encontradas se harán disponibles para mejorar los algoritmos de interpretación de variantes para futuros análisis.
            10 horas semanales
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Pregrado:1
            Especialización:2
            Maestría/Magister:2
            Doctorado:1
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , Camila Simoes , Lucía Urquiola , M. Brandes , GERSTENBLÜTH, MARIANA , TRIUNFO, P. , IRENE MUSSIO , Soledad Rodriguez , DELLOCA N
            Palabras clave: genomica medica enfermedades raras analisis de costos
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica
            Ciencias Sociales / Economía y Negocios / Economía, Econometría /
          • Incorporación de Secuenciación de Exoma Completo (WES) como herramienta diagnóstica para niños Uruguayos con enfermedades raras (3 Billion) (03/2022 - 03/2023 )
            Con este proyecto se pretende aumentar el conocimiento de las enfermedades raras, mejorar el rendimiento diagnóstico utilizando WES y aumentar nuestra base de datos de frecuencias de variantes para mejorar los futuros algoritmos de interpretación. Las posibles variantes causales que puedan encontrarse en este contexto se analizarán desde un punto de vista evolutivo, una perspectiva estructural y en el contexto del fenotipo y la historia familiar. familiar. Los fenotipos a estudiar son: discapacidad intelectual retraso del neurodesarrollo con o sin otras características, trastornos neuromusculares o leucodistrofia y error innato del metabolismo. Se tiene prevista la evaluación de 25 pacientes, en su mayoría, del sistema público uruguayo. La secuenciación y análisis inicial serán realizados por la empresa 3billion.
            10 horas semanales
            Unidad de Bioinformática , Unidad de Bioinformática
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Maestría/Magister:1
            Financiación:
            3 Billion, Corea del Sur, Apoyo financiero
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG (Responsable) , NAYA H , RAGGIO V , QUIJANO C , LEMES A
            Palabras clave: genomica medica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica medica
          • Estrategias para el análisis de regiones no codificantes y variantes estructurales en datos de secuenciación masiva para el diagnóstico de enfermedades raras (FSDA_1_2018_1_154283) (06/2020 - 03/2022 )
            De las ~3Gb que componen un genoma humano, sólo ~2% o menos codifica proteínas funcionales, siendo el 98% restante muy mal comprendido. Esta ?región oscura? del ADN compone un elevado número de elementos regulatorios y vastas porciones que son transcritas pero cuyos ARNs son de difícil clasificación funcional. En el caso de la secuenciación de genomas completos en el contexto del diagnóstico clínico, estas porciones del genoma implican una gran dificultad para el análisis. En los casos más ?simples?, cuando la mutación potencialmente causal cae en la región codificante del genoma (i.e. Exoma), encontrar información e intentar asignar un grado de patogenicidad a ésta es más directo, ya que existe amplia información disponible que puede ser utilizada para este fin. Por ejemplo, se puede llegar a proponer un mecanismo molecular subyacente a la enfermedad: un cambio de aminoácido puntual en una maquinaria multi-proteica, con efectos en cascada desde lo molecular hasta el nivel tejido u organismo. Cuando los cambios caen dentro de la ?porción oscura? la priorización de variantes es muchísimo más compleja, no habiendo algoritmos ni procedimientos claros que nos permitan adjudicar un nivel de patogenicidad. También existe un claro sesgo negativo de la literatura en esta región, debido fundamentalmente a la dificultad. Así, pocos grupos se aventuran en una región del genoma en la que es difícil obtener resultados concluyentes, y por ende publicables. Nuestro objetivo es desarrollar una metodología para analizar estas regiones (en conjunto con variantes estructurales) para el diagnóstico de enfermedades raras a partir de genomas completos. Se trabajará inicialmente con una serie de genomas completos de niños con patologías graves sin diagnóstico definitivo. Esperamos obtener resultados para ellos, así como metodologías generales para casos futuros.
            15 horas semanales
            Unidad de Bioinformática
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Pregrado:2
            Especialización:1
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG (Responsable) , Raggio V (Responsable) , Naya H , Graña M
            Palabras clave: Enfermedades raras genomica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Bioinformatica
          • Vigilancia epidemiológica del SARS-COV-2 en la frontera y su dinámica en el interior del país (07/2020 - 07/2021 )
            La aparición de brotes epidémicos genera un conjunto de preguntas, cuyas respuestas son fundamentales para su control y/o mitigación, y en donde la secuenciación del patógeno de interés puede ser la estrategia para responderlas. La información obtenida a partir de las secuencias genómicas y sus metadatos asociados (epidemiológicos y clínicos) son cruciales para entender los brotes de enfermedades infecciosas y ayudar a diseñar políticas de vigilancia y prevención.
            16 horas semanales
            Unidad de Bioinformáticaformática
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            Financiación:
            Fundación Manuel Pérez, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: Andrés Lizasoain , Pablo Smircich , José Sotelo , Emiliano Pereira , Luciana Griffero , Juan Zanetti , Belén González , Cecilia Alonso , María José Benitez , Daiana Mir , Matías Castells , LUCIA SPANGENBERG (Responsable) , Matías Victoria , Mariana Brandes , Camila Simoes , Luisa Berna , Fernando Lopez Tort , Gonzalo Bello , Rodney Colina (Responsable) , Veronica Noya (Responsable) , FERNÁNDEZ-CALERO T , Natalia Rego
            Palabras clave: Sars-cov-2 genomica
          • Desarrollo de herramientas para el análisis de genomas humanos uruguayos (FSDA_1_2017_1_143647) (11/2018 - 12/2019 )
            El proyecto URUGENOMES (desarrollado en el Institut Pasteur de Montevideo) permitió la secuenciación de los genomas de 80 individuos de orígen uruguayo. Si bien esto es una cantidad significativa de datos, la cantidad de muestras y sobre todo las particularidades de nuestra población, resultaron ser un impedimento para extraer conclusiones de dichos datos mediante técnicas estadísticas tradicionales de aplicación general como, por ejemplo, el análisis de componentes principales. Una de las preguntas que se busca responder es si los fragmentos de etnia nativa en la muestra de genomas uruguaya proceden de una misma población (macroetnia Charrúa), o si hay más de una población nativa representada en esos individuos. En los últimos años han surgido algoritmos específicos para datos de tipo genómico, por ejemplo, métodos capaces de analizar matrices con datos categóricos en lugar de numéricos. En particular, docentes del Instituto de Ingeniería Eléctrica de Facultad de Ingeniería (FING) de la UdeLaR han desarrollado recientemente una serie de técnicas novedosas para este tipo de datos. Estas técnicas, aún no publicadas, tienen la particularidad además de ser extremadamente eficientes en términos de costo computacional, lo cual es una ventaja al trabajar con datos genómicos. Por otro lado, en el marco del proyecto, se desarrollarán algoritmos propios para responder preguntas específicas como por ejemplo datar el ancestro nativo puro más reciente en cada individuo. El proyecto tiene por lo tanto varios propósitos: i) aplicar técnicas específicas, en particular las técnicas del IIE, que permitan responder preguntas como la homogeneidad de los nativos, ii) el desarrollo de algoritmos novedosos con la colaboración del IMERL, específicos para nuestros datos y preguntas, iii) la formación de recursos humanos interdisciplinarios y iv) los datos mencionados representan un insumo importante para validar las herramientas desarrolladas, algo fundamental para mejorar, y a la vez poder publicar y difundir dichas herramientas.
            15 horas semanales
            Unidad de Bioinformática
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            RRHH formados en el proyecto:
            Pregrado:2
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: Gregory Randall , Ignacio Ramirez , Ernesto Mordecki , Gabriel Illanes , María Lucía SPANGENBERG TORRE (Responsable) , Maria Ines Fariello , Mariana Brandes , Hugo Naya
            Palabras clave: genomica genomica humana genetica de poblaciones
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformatica
          • GenLives (07/2015 - 07/2016 )
            Se obtuvo el apoyo de la BIOESPINN para la incubación de la empresa GenLives creada en 2014, preincubada en BIOESPINN. La empresa se dedica a los servicios genómicos.
            10 horas semanales
            Desarrollo
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: H. NAYA , SPANGENBERG E , J. P. BANCHERO , RAGGIO V
            Palabras clave: genomica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • BIOESPINN (12/2014 - 07/2015 )
            Se obtuvo una beca de pre-incubación para una start-up que se desarrollará en el marco del convenio BIOESPIN entre el Institut Pasteur de Montevideo y la ANII. La pre-incubación es de un período de 6 meses recibiendo un total de 6000 dólares.
            10 horas semanales
            ANII , Unidad de Bioinformática
            Desarrollo
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: SPANGENBERG E , J. P. BANCHERO
            Palabras clave: BIOESPINN
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

        • Docencia

          • PEDECIBA - Maestría en Bioinformática (06/2014 - a la fecha)
            Maestría
            Responsable
            Asignaturas:
            Bioinformática 1 (Algoritmos de la bioinformática), 60 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • PEDECIBA (10/2025 - 10/2025 )
            Especialización
            Organizador/Coordinador
            Asignaturas:
            Fundamentos y Herramientas Bioinformáticas para Análisis Genómicos, 40 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          • Institut Pasteur de Montevideo (03/2016 - 04/2016 )
            Especialización
            Responsable
            Asignaturas:
            Human Genome Tour 2016, 9 horas, Teórico-Práctico
            Human Genome Tour, 6 horas, Teórico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • Institut Pasteur (12/2014 - 12/2014 )
            Especialización
            Asistente
            Asignaturas:
            Hands-on course on High-Throughput Sequencing data analysis, 40 horas
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • PEDECIBA - Maestría en Bioinformática (06/2010 - 09/2013 )
            Maestría
            Asistente
            Asignaturas:
            Bioinformática 1 (Algoritmos de la bioinformática), 60 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          • PEDECIBA - Maestría en Bioinformática (12/2010 - 12/2010 )
            Especialización
            Asistente
            Asignaturas:
            INTRODUCCIÓN A LA GENÓMICA Y BIOINFORMÁTICA EN SALTO, 16 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • Maestría por PEDECIBA (10/2010 - 10/2010 )
            Maestría
            Organizador/Coordinador
            Asignaturas:
            Computational Methods for Next-generation Sequencing Data and Transcriptomics, 30 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática

    • Sector Extranjero/Internacional/Otros - Brasil

      Instituto Carlos Chagas

      • Vínculos con la Institución

        • Colaborador (09/2010 - a la fecha)
          Colaboradora en el marco de mi tesis de docto 4 horas semanales
        • Becario (03/2010 - 09/2010)
          4 horas semanales

      • Actividades

        • Pasantías

          • Colaboradora externa del laboratorio de Biologia Basica de Celulas-Tronco dirigido por Bruno Dallagiovanna, con el que estamos co-dirigiendo una estudiante de posgrado. (09/2010 - a la fecha )
            ICC-Fiocruz, Laboratorio de Biologia Basica de Células-Tronco, PR
            4 horas semanales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Trascriptómica

    • Sector Educación Superior/Privado - Universidad Católica del Uruguay - Uruguay

      Departamento de Informática y Ciencias de la Computación

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (08/2019 - 02/2022)
          Docente 20 horas semanales

      • Actividades

        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • ABORDAJE MULTIDISCIPLINARIO PARA DESENLACES EN SALUD BUCAL EN ESCOLARES DE MONTEVIDEO, URUGUAY (08/2020 - 02/2022 )
            Recientemente surgió un sistema de manejo de riesgo y control de caries (CariesCare International,CCI). El propósito de este trabajo es evaluar su efectividad clínica a 12 meses, en términos de evitarla progresión de lesiones de caries, el dolor odontogénico y elriesgo a desarrollar caries, mediante el análisis metagenómico de la microbiota bucal , así como los determinantes psicosociales de la población y satisfacción del usuario mediante la Teleodontología. Una fortaleza del nuevo sistema es el enfoque de mínima intervención sin generación de aerosoles, lo que se adecúa en términos de bioseguridad a la realidad requerida durante la pandemia por Covid-19, de la mano de la cariología moderna mínimamente invasiva y con sustancial evidencia científica de respaldo. La investigación planteada sirve para orientarla formulación de políticas públicas preventivas en salud oral en la infancia en Uruguay.
            5 horas semanales
            Investigación
            Integrante del Equipo
            Concluido
            RRHH formados en el proyecto:
            Pregrado:1
            Financiación:
            Vicerrectoría de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , FERNÁNDEZ-CALERO T , Magdalena San Martin , HERMIDA L
            Palabras clave: genomica mircrobioma odontologia
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / microbioma
          • Puesta a punto de un sistema para el monitoreo de comunidades microbianas en sistemas de tratamientos de efluentes (02/2020 - 02/2022 )
            El objetivo de este proyecto fue implementar y poner a punto un sistema para el monitoreo de comunidades microbianas en sistemas de tratamiento de efluentes.
            5 horas semanales
            Investigación
            Integrante del Equipo
            Concluido
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , FERNÁNDEZ-CALERO T , DOMINGUEZ, M
            Palabras clave: microbioma genomica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica
          • Caracterización de las fluctuaciones anuales en las comunidades microbianas en sistemas de tratamientos de efluentes (07/2021 - 02/2022 )
            El objetivo de este proyecto es utilizar el sistema de monitoreo desarrollado en el proyecto "Puesta a punto de un sistema para el monitoreo de comunidades microbianas en sistemas de tratamientos de efluentes" para la caracterización anual de las comunidades microbianas de sistemas de efluentes y evaluar su relación con distintos parámetros.
            5 horas semanales
            Investigación
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            Equipo: LUCIA SPANGENBERG , DOMINGUEZ, M , FERNÁNDEZ-CALERO T
            Palabras clave: genomica microbiana bioinformatica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica

        • Docencia

          • INGENIERÍA EN INFORMÁTICA (08/2019 - 02/2022 )
            Grado
            Asistente
            Asignaturas:
            Programación 1, 90 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Computación /

    • Sector Educación Superior/Privado - Universidad ORT Uruguay - Uruguay

      Facultad de Ingeniería

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (08/2017 - 12/2017)
          Docente Bioinfo 1 4 horas semanales
        • Funcionario/Empleado (08/2014 - 12/2014)
          Docente de bioinformática II 4 horas semanales
        • Funcionario/Empleado (03/2014 - 08/2014)
          docente de bioinformática I 4 horas semanales
        • Funcionario/Empleado (03/2012 - 08/2012)
          Docente de bioinformática I 4 horas semanales

      • Actividades

        • Docencia

          • Ingeniería en Sistemas (03/2014 - a la fecha)
            Grado
            Asistente
            Asignaturas:
            Bioinformática 1, 4 horas, Teórico-Práctico
            Bioinformática 2, 4 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • Ingeniería en Sistemas (03/2012 - 08/2012 )
            Grado
            Asistente
            Asignaturas:
            Bioinformática 1, 4 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

    • Sector Extranjero/Internacional/Otros - Brasil

      Universidad Federal da Bahia

      • Vínculos con la Institución

        • Colaborador (11/2012 - 04/2015)
          4 horas semanales

      • Actividades

        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • INVESTIGAÇÃO DOS MECANISMOS GENÉTICOS E MOLECULARES EM BIOFILMES DE LEPTOSPIRA (11/2012 - a la fecha)
            Los biofilmes son considerados como el principal modo de vida de procariotas y participan en la patogenicidad de varias enfermedades infecciosas. Los mecanismos genéticos de la producción de biofilmes y su regulación son conocidos para algunas bacterias, sin embargo poco se sabe de los mismos en Leptospira. Este proyecto intenta aportar en la dilucidación de los mecanismos responsables de la formación y regulación de biofilm en Leptospira.
            4 horas semanales
            UFBA , Biologia Molecular
            Investigación
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            Financiación:
            CAPES/CNPq/MEC, Brasil, Apoyo financiero
            Equipo:
            Palabras clave: biofilm
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /

        • Docencia

          • (05/2013 - 05/2013 )
            Especialización
            Asistente
            Asignaturas:
            Herramientas bioinformáticas para el análisis de expresión génica, 30 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
          • (11/2012 - 11/2012 )
            Especialización
            Asistente
            Asignaturas:
            Herramientas bioinformáticas para el análisis de expresión génica, 40 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /

    • Sector Extranjero/Internacional/Otros - Alemania

      Universitat Tuebingen (Eberhard-Karls)

      • Vínculos con la Institución

        • Colaborador (02/2011 - 03/2011)
          Investigador 40 horas semanales
        • Funcionario/Empleado (12/2007 - 06/2008)
          Ayudante de cátedra 10 horas semanales

      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • Desarrollo de software para la inferencia de redes de señales de transducción (02/2007 - 06/2008 )
            Las proteinas sensoriales reaccionan a los cambios del exterior transduciendo señales hacia el interior de la célula. Estas señales se van integrando hasta activar un pequeño grupo de células "core", las cuales activan a proteinas blanco como factores de transcripción. Esta estructura se denomina bow tie y les permite a las células responder apropiadamente a condiciones ambientales complejas. Se desarrolló una herramienta en Java llamada BowTieBuilder que infiere las redes de señales a partir de multiples proteinas fuente (p. ej. receptores en la superficie celular) y proteinas blanco (p. ej. factores de transcripción). Dadas las interacciones proteina-proteina de un organismo y las proteinas fuente y blanco que provea el usuario, se van ensamblando pathways agregando la proteinas intermedias que maximicen la probabilidad del pathway. A su vez para validar el resultado obtenido se implementaron distintas heurísticas y medidas de calidad.
            30 horas semanales
            Universität Tübingen (Karl-Eberhard), Arquitectura de sistemas , Integrante del equipo
            Equipo: JOCHEN SUPPER , ANDREAS ZELL
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Computación /

        • Pasantías

          • (02/2011 - 03/2011 )
            Eberhard Karls Universität Tübingen, Integrative Transkriptomik
            40 horas semanales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

  • Carga horaria

    • Carga horaria de docencia: 10 horas
    • Carga horaria de investigación: 40 horas
    • Carga horaria de formación RRHH: Sin horas
    • Carga horaria de extensión: Sin horas
    • Carga horaria de gestión: Sin horas

  • Producción científica/tecnológica

    • Mi trabajo en el área de bioinformática utiliza las tecnologías de secuenciación masiva (o NGS; Next Generation Sequencing) para comprender eventos genómicos en diferentes escenarios como ser expresión diferencial de genes/ARN no codificantes/seudogenes en diferentes condiciones. Mi enfoque principal en este contexto es estudiar los procesos de diferenciación de células madres (mayormente células madre mesenquimales) a diferentes tipos celulares como ser adipocitos, condrocitos, cardiomiocitos, etc.
      Este tipo de proceso es muy complejo desde el punto de vista de la regulación transcriptional y sobre todo post-transcriptional.
      Los ARN no codificantes se revelaron como actores importantes en este proceso de regulación. Con las
      tecnologías de RNA-seq hemos logrado avances en dilucidar los mecanismos de ambos tipos de regulación involucrados en la diferenciación, sobre todo en la adipogénesis. Futuros trabajos (ya en marcha) se centrarán en otros procesos de diferenciación, incluso partiendo
      de células iPS (induced pluripotent stem cells).
      En otro contexto utilizamos las tecnologías de secuenciación masiva para el resecuenciado del genoma humano. Estamos desarrollando metodologías y estrategias para el análisis de variantes alélicas de individuos, con el fin de poner a punto un "pipeline de análisis" para analizar la variabilidad de la población uruguaya. La información obtenida de este proyecto de interés nacional es el punto de partida para diferentes aplicaciones en el área de la farmacogenómica, genética de poblaciones y bioinformática.
      Por otro lado, el costo y complejidad de los experimentos y análisis de datos de NGS y la disponibilidad de dichos experimentos en bases de datos públicas, indican que una buena estrategia de optimización pasaría por el análisis de los resultados obtenidos en estudios previos, mejorando el diseño experimental para nuevos análisis e integrando los nuevos resultados a los existentes (meta-análisis centrado en datos de secuenciación masiva). A esto se agrega las capacidades de generación de nuevas hipótesis a partir de los resultados obtenidos por minería de datos. En este sentido, hemos investigado las relaciones entre expresión génica (tanto de microarrays como de RNA-seq), modificaciones en histonas (ChIP-seq) y además hemos incluído datos de redes de regulación basados en datos de NGS.
      Por otro lado, se está poniendo a punto la técnica para resecuenciar con tecnologías de NGS genes específicos relacionados a fenotipos de interés para poder caracterizar a la población uruguaya. Nuestro particular interés en este caso son los genes BRCA1 y BRCA2 relacionados con el cancer de mama hereditario. A raíz de un estudio preliminar se determina la existencia de ciertas variantes alélicas/mutaciones presentes en las mujeres uruguayas con alta frecuencia. Para lograr caracterizar la población total se ampliará el estudio a varias pacientes.

  • Producción bibliográfica

    • Artículos publicados

      • Arbitrados

        • From the rare to the essential: analyzing the needs of physicians and families managing rare diseases (Completo, 2026)
          IRENE MUSSIO , PATRICIA TRIUNFO , MARIANA GERSTENBLÜTH , VÍCTOR RAGGIO , PATRICIA CARDOZO , HUGO NAYA , LUCIA SPANGENBERG
          BMC Health Services Research, v.: 26 2026
          Palabras clave: enfermedades raras genomica economia
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          Lugar de publicación: United kingdom
          E-ISSN: 14726963
          DOI: 10.1186/s12913-025-13999-6
          https://doi.org/10.1186/s12913-025-13999-6

        • Shaping the future of ADHD genetic research through ancestral diversity (Completo, 2026)
          BRUNA SANTOS DA SILVA , CLAITON HENRIQUE DOTTO BAU , HUMBERTO NICOLINI , MARIA EDUARDA DE ARAUJO TAVARES , VICTOR FERNANDES DE OLIVEIRA , YAGO CARVALHO LIMA , EDUARDO SCHNEIDER VITOLA , ALMA GENIS-MENDOZA , ISABELLA FOLEGO-TEMOTEO , GABRIELA ARIADNA MARTÍNEZ-LEVY , LUCIA SPANGENBERG , GABRIEL BARG , CIBELE EDOM BANDEIRA , RODRIGO SOSA , ZURIEL CEJA , LUCIANA TOVO-RODRIGUES , MARINA XAVIER CARPENA , JULIA PASQUALINI GENRO , IAGO JUNGER-SANTOS , HUGO NAYA , NICOLÁS GARZÓN RODRÍGUEZ , MARÍA FERNANDA QUIROZ-PADILLA , NICOLAS PEREIRA CIOCHETTI , RICARDO LAUBE , GUSTAVO MELO DE ANDRADE , MARIO RODRIGUES LOUZÃ , LUIS AUGUSTO ROHDE , EUGENIO HORACIO GREVET , DIEGO LUIZ ROVARIS , UNDEFINED UNDEFINED , MARIA EDUARDA DE ARAÚJO TAVARES , VICTOR FERNANDES DE OLIVEIRA , YAGO CARVALHO LIMA , ISABELLA FOLEGO TEMOTEO , MARINA XAVIER CARPENA , IAGO JUNGER SANTOS , GUSTAVO MELO DE ANDRADE LIMA , LUIS AUGUSTO ROHDE , EUGENIO HORACIO GREVET , UNDEFINED UNDEFINED , GABRIEL BARG , RODRIGO SOSA , RICARDO LAUBE , UNDEFINED UNDEFINED , ALMA GENIS MENDOZA , GABRIELA ARIADNA MARTÍNEZ-LEVY , CIBELE EDOM BANDEIRA , JULIA PASQUALINI GENRO , NICOLÁS GARZÓN RODRÍGUEZ
          Nature Mental Health, v.: 4 p.:186 - 189, 2026
          Palabras clave: salud mental genomica TADH
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          E-ISSN: 27316076
          DOI: 10.1038/s44220-025-00572-7
          https://doi.org/10.1038/s44220-025-00572-7

        • Salivary microbiota characterization of Yerba Mate consumers in Uruguay (Completo, 2025)
          BARBARA GARCIA , MARÍA FERNANDA DOMINGUEZ , LUCIA SPANGENBERG , TAMARA FERNANDEZ-CALERO
          Clinical Oral Investigations, v.: 29 2025
          Palabras clave: microbiota oral
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / metagenomica
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 14326981
          E-ISSN: 14363771
          DOI: 10.1007/s00784-025-06209-4
          https://doi.org/10.1007/s00784-025-06209-4

        • Petri net modeling and simulation of post-transcriptional regulatory networks of human embryonic stem cell (hESC) differentiation to cardiomyocytes (Completo, 2025)
          ARUANA F. F. HANSEL-FRÖSE , CHRISTOPH BRINKROLF , MARCEL FRIEDRICHS , BRUNO DALLAGIOVANNA , LUCIA SPANGENBERG
          Journal of Integrative Bioinformatics, 2025
          Palabras clave: petri network stem cell
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          Lugar de publicación: Germany
          E-ISSN: 16134516
          DOI: 10.1515/jib-2024-0037
          https://doi.org/10.1515/jib-2024-0037

        • Identification of a novel SACS gene mutation leading to spastic ataxia Charlevoix-Saguenay type: a case report (Completo, 2025)
          VÍCTOR RAGGIO , ANDREA REY , CAMILA SIMOES , FLORENCIA BIRRIEL , SOLEDAD RODRIGUEZ , KATERYN BENTANCOR , ALEJANDRA TAPIÉ , LUCÍA SPANGENBERG
          Journal of Medical Case Reports, v.: 19 2025
          Palabras clave: genomica medica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: United kingdom
          E-ISSN: 17521947
          DOI: 10.1186/s13256-025-05480-z
          https://doi.org/10.1186/s13256-025-05480-z

        • Exploring Latin America one cell at a time (Completo, 2025)
          PATRICIA A. POSSIK , DAVID J. ADAMS , FLAVIA C. AGUIAR , TAMIRES CAIXETA ALVES , FABÍOLA S. ALVES-HANNA , CARLOS MARIO RESTREPO ARBOLEDA , ERICK ARMINGOL , LIÃ BÁRBARA ARRUDA , YESID CUESTA ASTROZ , JACQUELINE M. BOCCACINO , DANIELLE C. BONFIM , JUAN F. CALDERON , ALEXIS GERMÁN MURILLO CARRASCO , DANIELLE G. CARVALHO , BENILTON S. CARVALHO , PAULO VINÍCIUS SANCHES DALTRO DE CARVALHO , ALEX CASTRO , LIA CHAPPELL , RICARDO CHINCHILLA-MONGE , DANIELA DI BELLA , SANDRA MARTHA GOMES DIAS , RAFAELA FAGUNDES , MARINA L. FERNÁNDEZ , BIANCA BRAGA FRADE , FEDERICO J. GARDE , HUGO GONZALEZ , GABRIELA RAPOZO GUIMARÃES , LUCAS INCHAUSTI , EDITH KORDON , LAURA LEADEN , RAFAEL S. LIMA , ALVARO LLADSER , JULIETH LÓPEZ-CASTIBLANCO , ISABELA MALTA , VINICIUS MARACAJA-COUTINHO , DOMENICA MARCHESE , ALICE MATIMBA , ANDRES MORENO-ESTRADA , MARCELO A. MORI , HELDER NAKAYA , SILVANA PEREYRA , YULYE JESSICA ROMO RAMOS , NATALIA REGO , CARLA DANIELA ROBLES-ESPINOZA , ADOLFO ROJAS-HIDALGO , MARIA NATALIA RUBINSZTAIN , LEANDRO SANTOS , ANITA SCOONES , PATRICIA SEVERINO , ANNIE CRISTHINE M. SOUSA-SQUIAVINATO , LUCIA SPANGENBERG , ANA VICTORIA SUESCÚN , NAYARA GUSMÃO TESSAROLLO , MARTHA ESTEFANIA VÁZQUEZ-CRUZ , MA?N H. ZAWATI , JOAO P.B. VIOLA , MARIANA BORONI
          Cell, v.: 188 p.:5790 - 5796, 2025
          Palabras clave: single cell transcriptomica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: United states
          ISSN: 00928674
          E-ISSN: 10974172
          DOI: 10.1016/j.cell.2025.09.013
          https://doi.org/10.1016/j.cell.2025.09.013

        • Activated sludge prokaryote and eukaryote characterization in a pulp mill facility using amplicon sequencing (Completo, 2024)
          Ignacio López Bravo , DOMINGUEZ, M , MIONETTO, A. , Daniela Franca , NAYA H , LUCIA SPANGENBERG , FERNÁNDEZ-CALERO T
          Heliyon, 2024
          Palabras clave: metabarcoding 16S 18S
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / metabarcoding
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 24058440

        • Optimization of Clozapine Treatment: Study of Variables Affecting Response in Uruguayan Patients With Schizophrenia (Completo, 2024)
          ISMAEL OLMOS , CARINA RICCIARDI , MAURICIO MATO , NATALIA GUEVARA , SABRINA ACUÑA , CECILIA MALDONADO , MARTA VÁZQUEZ , MAURICIO TOLEDO , CLARA MENÉNDEZ , VALENTINA BLANCO , JOSÉ L. BADANO , ALFONSO CAYOTA , LUCIA SPANGENBERG , MAGDALENA CARDENAS-RODRIGUEZ
          Journal of Clinical Psychopharmacology, 2024
          Palabras clave: clozapina farmacogenomica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / genomica
          Lugar de publicación: United states
          ISSN: 02710749
          E-ISSN: 1533712X
          DOI: 10.1097/jcp.0000000000001933
          http://dx.doi.org/10.1097/jcp.0000000000001933

        • Impact of Bariatric Surgery on metabolic health in a Uruguayan cohort and the emerging predictive role of FSTL1 (Completo, 2024)
          LEONARDO SANTOS , MARIANA PATRONE , VICTORIA PRIETO-ECHAGÜE , SILVANA LAPI , MAURO PERDOMO , ANDREA VAUCHER , GUSTAVO RODRIGUEZ , PABLO VALSANGIACOMO , HUGO NAYA , CARLOS ESCANDE , JOSE L. BADANO , LUCIA SPANGENBERG , GUSTAVO BRUNO
          Scientific Reports, v.: 14 2024
          Palabras clave: bariatrica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas /
          Lugar de publicación: United kingdom
          E-ISSN: 20452322
          DOI: 10.1038/s41598-024-65651-8
          http://dx.doi.org/10.1038/s41598-024-65651-8

        • Two compound heterozygous variants in the CLN8 gene are responsible for neuronal cereidolipofuscinoses disorder in a child: a case report (Completo, 2024)
          FEDERICO BALTAR , CAMILA SIMOES , FRANCISCO GARAGORRY , MARTÍN GRAÑA , SOLEDAD RODRÍGUEZ , MARÍA HAYDÉE AUNCHAYNA , ALEJANDRA TAPIÉ , ALFREDO CERISOLA , GABRIEL GONZÁLEZ , HUGO NAYA , LUCÍA SPANGENBERG , VÍCTOR RAGGIO
          Frontiers in Pediatrics, v.: 12 2024
          Palabras clave: genómica medica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas / genomica
          Lugar de publicación: Switzerland
          E-ISSN: 22962360
          DOI: 10.3389/fped.2024.1379254
          http://dx.doi.org/10.3389/fped.2024.1379254

        • Alternative polyadenylation and dynamic 3? UTR length is associated with polysome recruitment throughout the cardiomyogenic differentiation of hESCs (Completo, 2024)
          ARUANA F. F. HANSEL-FROSE , JENS ALLMER , MARCEL FRIEDRICHS , HELLEN GEREMIAS DOS SANTOS , BRUNO DALLAGIOVANNA , LUCÍA SPANGENBERG
          Frontiers in Molecular Biosciences, v.: 11 2024
          Palabras clave: transcriptomica bioinformatica celulas madre
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Trascriptomica
          Lugar de publicación: Switzerland
          E-ISSN: 2296889X
          DOI: 10.3389/fmolb.2024.1336336
          http://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2024.1336336

        • Unveiling Polysomal Long Non-Coding RNA Expression on the First Day of Adipogenesis and Osteogenesis in Human Adipose-Derived Stem Cells (Completo, 2024)
          BERNARDO BONILAURI , ANNANDA LYRA RIBEIRO , LUCÍA SPANGENBERG , BRUNO DALLAGIOVANNA
          International Journal of Molecular Sciences, v.: 25 p.:2013 2024
          Palabras clave: Transcriptomica celulas madre
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Transcriptomica
          Lugar de publicación: Switzerland
          E-ISSN: 14220067
          DOI: 10.3390/ijms25042013
          http://dx.doi.org/10.3390/ijms25042013

        • Exome Sequencing Reveals Biallelic Mutations in MBTPS1 Gene in a Girl with a Very Rare Skeletal Dysplasia (Completo, 2024)
          VÍCTOR RAGGIO , SOLEDAD RODRÍGUEZ , SANDRA FEDER , ROSARIO GUEÇAIMBURÚ , LUCÍA SPANGENBERG
          Diagnostics, v.: 14 p.:313 2024
          Palabras clave: genomica medica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas / Bioinformatica
          Lugar de publicación: Switzerland
          E-ISSN: 20754418
          DOI: 10.3390/diagnostics14030313
          http://dx.doi.org/10.3390/diagnostics14030313

        • Case Report: Mycosis fungoides as an exclusive manifestation of common variable immunodeficiency in a family with a NFKB2 gene mutation (Completo, 2023)
          MARÍA NOEL SPANGENBERG , SOFÍA GRILLE , CAMILA SIMOES , MARIANA BRANDES , JOAQUÍN GARCIA-LUNA , ANA INÉS CATALÁN , SABRINA RANERO , MATILDE BOADA , ANDREÍNA BRUGNINI , NATALIA TRIAS , DANIELA LENS , VÍCTOR RAGGIO , LUCÍA SPANGENBERG
          Frontiers in Oncology, v.: 13 2023
          Palabras clave: genomica medica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas / Bioinformatica
          Lugar de publicación: Switzerland
          E-ISSN: 2234943X
          DOI: 10.3389/fonc.2023.1248964
          http://dx.doi.org/10.3389/fonc.2023.1248964

        • Computational and mitochondrial functional studies of novel compound heterozygous variants in SPATA5 gene support a causal link with epileptogenic encephalopathy (Completo, 2023)Trabajo relevante
          VÍCTOR RAGGIO , MARTÍN GRAÑA , ERIK WINIARSKI , SANTIAGO MANSILLA , CAMILA SIMOES , SOLEDAD RODRÍGUEZ , MARIANA BRANDES , ALEJANDRA TAPIÉ , LAURA RODRÍGUEZ , LUCÍA CIBILS , MARTINA ALONSO , JENNYFER MARTÍNEZ , TAMARA FERNÁNDEZ-CALERO , FERNANDA DOMÍNGUEZ , MELANIA ROSAS MEZQUIDA , LAURA CASTRO , ALFREDO CERISOLA , HUGO NAYA , ADRIANA CASSINA , CELIA QUIJANO , LUCÍA SPANGENBERG
          Human Genomics, v.: 17 p.:14 - 14, 2023
          Palabras clave: genomica medica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: United kingdom
          E-ISSN: 14797364
          DOI: 10.1186/s40246-023-00463-x
          http://dx.doi.org/10.1186/s40246-023-00463-x

        • Human endogenous retrovirus and multiple sclerosis: A review and transcriptome findings (Completo, 2022)
          LUIZ H. NALI , GUILHERME S. OLIVAL , HORÁCIO MONTENEGRO , ISRAEL T. DA SILVA , EMMANUEL DIAS-NETO , HUGO NAYA , LUCIA SPANGENBERG , AUGUSTO C. PENALVA-DE-OLIVEIRA , CAMILA M. ROMANO
          Multiple Sclerosis and Related Disorders, v.: 57 p.:103383 2022
          Palabras clave: genomica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: United states
          ISSN: 22110348
          DOI: 10.1016/j.msard.2021.103383
          http://dx.doi.org/10.1016/j.msard.2021.103383

        • Novel frameshift mutation in LIS1 gene is a probable cause of lissencephaly: a case report (Completo, 2022)
          CAMILA SIMOES , MARTÍN GRAÑA , SOLEDAD RODRIGUEZ , FEDERICO BALTAR YANES , ALEJANDRA TAPIÉ , NICOLÁS DELL?OCA , HUGO NAYA , VÍCTOR RAGGIO , LUCÍA SPANGENBERG
          BMC Pediatrics, v.: 22 2022
          Palabras clave: genomica médica genomica humana
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: United kingdom
          E-ISSN: 14712431
          DOI: 10.1186/s12887-022-03595-6
          http://dx.doi.org/10.1186/s12887-022-03595-6

        • Two mutations in theSBDSgene reveal a diagnosis of Shwachman?Diamond syndrome in a patient with atypical symptoms (Completo, 2022)
          MARÍA NOEL SPANGENBERG , SOFIA GRILLE , CAMILA SIMOES , NICOLÁS DELL'OCA , MATILDE BOADA , CECILIA GUILLERMO , VICTOR RAGGIO , LUCÍA SPANGENBERG
          Molecular Case Studies, v.: 8 p.:62 - 62, 2022
          Palabras clave: genomica medica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica medica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 23732873
          DOI: 10.1101/mcs.a006237
          http://dx.doi.org/10.1101/mcs.a006237

        • Testing the existence of an unadmixed ancestor from a specific population t generations ago (Completo, 2022)
          Illanes, G. , FARIELLO, M.I. , LUCIA SPANGENBERG , MORDECKI, E. , NAYA H
          PLoS ONE, p.:271 - 271, 2022
          Palabras clave: genomica humana
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: Estados Unidos
          E-ISSN: 19326203
          DOI: 10.1371/journal.pone.0271097

        • Whole genome sequencing reveals a frameshift mutation and a large deletion in YY1AP1 in a girl with a panvascular artery disease (Completo, 2021)Trabajo relevante
          LUCIA SPANGENBERG
          Human Genomics, 2021
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 14797364

        • Filogeografía de mitogemonas indígenas de Uruguay (Completo, 2021)
          Gonzalo Figueiro , Patricia Mut , Lucas Ale , Sara Flores-Gutiérrez , Gonzalo Greif , Pedro C. Hidalgo , Silvana Lorena Luna , Elizabeth Ackermann , Raúl Germán Negro , LUCIA SPANGENBERG , Hugo Naya , Mónica Sans
          Revista Argentina de Antropología Biológica, 2021
          Palabras clave: antropologia biologica genomica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / genomica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 15147991

        • Novel frameshift mutation in PURA gene causes severe encephalopathy of unclear cause (Completo, 2021)
          LUCIA SPANGENBERG , Rosario Guecaimburú , Alejandra Tapié , Susana Vivas , Soledad Rodríguez , GRAÑA, M. , NAYA H , RAGGIO V
          Molecular Genetics & Genomic Medicine, 2021
          Palabras clave: genomica medica bioinformatica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas / genomica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 23249269

        • Recurrent dissemination of SARS-CoV-2 through the Uruguayan-Brazilian border (Completo, 2021)Trabajo relevante
          MIR D , REGO N. , Paola Cristina Resende , Fernando López-Tort , Tamara Fernandez-Calero , Verónica Noya , Mariana Brandes , Tania Possi , Mailen Arleo , Natalia Reyes , Matías Victoria , Andrés Lizasoain , Matías Castells , Leticia Maya , Matías Salvo , Tatiana Schäffer Gregianini , Marilda Tereza Mar da Rosa , Letícia Garay Martins , Cecilia Alonso , Yasser Vega , Cecilia Salazar , Ignacio Ferrés , Pablo Smircich , Rafael Sebastián Fort , Cecilia Mathó , Ighor Arantes , Luciana Appolinario , Ana Carolina Mendonça , María José Benitez-Galeano , Fernando Motta , Marilda Mendonça Siqueira , Gonzalo Bello , LUCIA SPANGENBERG
          Frontiers in Aging, 2021
          Palabras clave: epidemiologia molecular genomica SARS-CoV-2
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / genomica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 26736217

        • CBG Montevideo: a clinically novel SERPINA6 mutation leading to haploinsufficiency of corticosteroid-binding globulin (Completo, 2021)
          EMILY JANE MEYER , LUCÍA SPANGENBERG , MARIA JOSÉ RAMÍREZ , SUNITA MARIA CHRISTINA DE SOUSA , VICTOR RAGGIO , DAVID JAMES TORPY
          Journal of the Endocrine Society, 2021
          E-ISSN: 24721972
          DOI: 10.1210/jendso/bvab115
          http://dx.doi.org/10.1210/jendso/bvab115

        • Real-Time Genomic Surveillance for SARS-CoV-2 Variants of Concern, Uruguay (Completo, 2021)
          NATALIA REGO , ALICIA COSTÁBILE , MERCEDES PAZ , CECILIA SALAZAR , PAULA PERBOLIANACHIS , LUCÍA SPANGENBERG , IGNACIO FERRÉS , RODRIGO ARCE , ALVARO FAJARDO , MAILEN ARLEO , TANIA POSSI , NATALIA REYES , MA NOEL BENTANCOR , ANDRÉS LIZASOAIN , MARÍA JOSÉ BENÍTEZ , VIVIANA BORTAGARAY , ANA MOLLER , GONZALO BELLO , IGHOR ARANTES , MARIANA BRANDES , PABLO SMIRCICH , ODHILLE CHAPPOS , MELISSA DUQUÍA , BELÉN GONZÁLEZ , LUCIANA GRIFFERO , MAURICIO MÉNDEZ , MA PÍA TECHERA , JUAN ZANETTI , BERNARDINA RIVERA , MATÍAS MAIDANA , MARTINA ALONSO , CECILIA ALONSO , JULIO MEDINA , HENRY ALBORNOZ , RODNEY COLINA , VERONICA NOYA , GREGORIO IRAOLA , TAMARA FERNÁNDEZ-CALERO , GONZALO MORATORIO , PILAR MORENO
          Emerging Infectious Diseases, v.: 27 p.:2957 - 2960, 2021
          Palabras clave: SARS-CoV-2
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Bioinformatica
          Lugar de publicación: United states
          ISSN: 10806040
          E-ISSN: 10806059
          DOI: 10.3201/eid2711.211198
          http://dx.doi.org/10.3201/eid2711.211198

        • Evaluation of different approaches for missing data imputation on features associated to genomic data (Completo, 2021)
          BEN OMEGA PETRAZZINI , HUGO NAYA , FERNANDO LOPEZ-BELLO , GUSTAVO VAZQUEZ , LUCÍA SPANGENBERG
          BioData Mining, v.: 14 2021
          Palabras clave: genomic medicine imputation missing data
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genomica
          Lugar de publicación: United kingdom
          E-ISSN: 17560381
          DOI: 10.1186/s13040-021-00274-7
          http://dx.doi.org/10.1186/s13040-021-00274-7

        • Emergence and Spread of a B.1.1.28-Derived P.6 Lineage with Q675H and Q677H Spike Mutations in Uruguay (Completo, 2021)
          NATALIA REGO , CECILIA SALAZAR , MERCEDES PAZ , ALICIA COSTÁBILE , ALVARO FAJARDO , IGNACIO FERRÉS , PAULA PERBOLIANACHIS , TAMARA FERNÁNDEZ-CALERO , VERONICA NOYA , MATIAS R. MACHADO , MARIANA BRANDES , RODRIGO ARCE , MAILEN ARLEO , TANIA POSSI , NATALIA REYES , MARÍA NOEL BENTANCOR , ANDRÉS LIZASOAIN , VIVIANA BORTAGARAY , ANA MOLLER , ODHILLE CHAPPOS , NICOLAS NIN , JAVIER HURTADO , MELISSA DUQUÍA , MARIA BELÉN GONZÁLEZ , LUCIANA GRIFFERO , MAURICIO MÉNDEZ , MARIA PÍA TECHERA , JUAN ZANETTI , EMILIANO PEREIRA , BERNARDINA RIVERA , MATÍAS MAIDANA , MARTINA ALONSO , PABLO SMIRCICH , IGHOR ARANTES , DAIANA MIR , CECILIA ALONSO , JULIO MEDINA , HENRY ALBORNOZ , RODNEY COLINA , GONZALO BELLO , PILAR MORENO , GONZALO MORATORIO , GREGORIO IRAOLA , LUCÍA SPANGENBERG
          Viruses, v.: 13 p.:1801 2021
          Palabras clave: SARS-CoV-2
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / bioinformatica
          Lugar de publicación: Switzerland
          E-ISSN: 19994915
          DOI: 10.3390/v13091801
          http://dx.doi.org/10.3390/v13091801

        • Indigenous Ancestry and Admixture in the Uruguayan Population (Completo, 2021)Trabajo relevante
          LUCÍA SPANGENBERG , MARÍA INÉS FARIELLO , DARÍO ARCE , GABRIEL ILLANES , GONZALO GREIF , JONG-YEON SHIN , SEONG-KEUN YOO , JEONG-SUN SEO , CARLOS ROBELLO , CHANGHOON KIM , JOHN NOVEMBRE , MÓNICA SANS , HUGO NAYA
          Frontiers in Genetics, v.: 12 2021
          Palabras clave: population genomics ancestry
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / bioinformatica
          Lugar de publicación: Switzerland
          E-ISSN: 16648021
          DOI: 10.3389/fgene.2021.733195
          http://dx.doi.org/10.3389/fgene.2021.733195

        • Blood cell respiration rates and mtDNA copy number: A promising tool for the diagnosis of mitochondrial disease (Completo, 2021)
          MARTINA ALONSO , CRISTINA ZABALA , SANTIAGO MANSILLA , LAUREANA DE BRUN , JENNYFER MARTÍNEZ , MARIELA GARAU , GABRIELA RIVAS , CECILIA ACOSTA , DANIELA LENS , ALFREDO CERISOLA , MARTÍN GRAÑA , HUGO NAYA , RODRIGO PUENTES , LUCÍA SPANGENBERG , VÍCTOR RAGGIO , AÍDA LEMES , LAURA CASTRO , CELIA QUIJANO
          Mitochondrion, v.: 61 p.:31 - 43, 2021
          Palabras clave: mitochondrial disease medical genomics
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas / bioinformatica
          Lugar de publicación: Netherlands
          ISSN: 15677249
          DOI: 10.1016/j.mito.2021.09.004
          http://dx.doi.org/10.1016/j.mito.2021.09.004

        • Análisis ecocardiográfico de pacientes con obesidad de un Programa de Obesidad y Cirugía Bariátrica (Completo, 2021)
          Eugenia Thomas Burjel , Gustavo Bruno , LUCIA SPANGENBERG , Andrea Fernando , Alvaro Huarte , Mariana Paolillo , Pablo Valsagiacomo , Gustavo Rodriguez
          Revista de la Sociedad Española de Cirugía de Obesidad y Metabólica y de la Sociedad Española para el Estudio de la Obesidad, v.: 11.2.7 p.:2923 - 2929, 2021
          Palabras clave: obesidad
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Ciencias de la Salud / Bioinformatica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 2250737X

        • Human Endogenous Retrovirus and Multiple Sclerosis: a review and transcriptome findings (Completo, 2021)
          LUIZ H. NALI , GUILHERME S. OLIVAL , HORÁCIO MONTENEGRO , ISRAEL T. DA SILVA , EMMANUEL DIAS-NETO , HUGO NAYA , LUCIA SPANGENBERG , AUGUSTO C. PENALVA-DE-OLIVEIRA , CAMILA M. ROMANO
          Multiple Sclerosis and Related Disorders, p.:103383 2021
          Lugar de publicación: United states
          ISSN: 22110348
          DOI: 10.1016/j.msard.2021.103383
          http://dx.doi.org/10.1016/j.msard.2021.103383

        • Increased expression of CDKN1A/p21 in HIV-1 controllers is correlated with upregulation of ZC3H12A/MCPIP1 (Completo, 2020)
          Suwellen de Azevedo , Marcelo Ribeiro-Alves , Fernanda Heloise Côrtes , Edson Delatorre , LUCIA SPANGENBERG , Hugo Naya , Mariza Gonçalves Morgado , Thiago Moreno Lopes Souza , Gonzalo Bello
          Retrovirology, 2020
          Palabras clave: Virus RNA-seq
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bioinformatica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 17424690

        • Whole Transcriptome analysis of Multiple Sclerosis patients reveals active inflammatory profile in relapsing patients and downregulation of neurological repair pathways in secondary progressive cases (Completo, 2020)
          Luiz H Nali , Guilherme S Olival , Francielle T G Sousa , Ana Carolina S de Oliveira , Horácio Montenegro , Israel T da Silva , Emamnuel Dias-Neto , Hugo Naya , LUCIA SPANGENBERG , Augusto C Penalva-de-Oliveira , Camila M Romano
          Multiple Sclerosis Journal, 2020
          Palabras clave: Esclerosis Multiple
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / bioinformatica
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 13524585
          E-ISSN: 14770970

        • Effects of PUMILIO1 and PUMILIO2 knockdown on cardiomyogenic differentiation of human embryonic stem cells culture (Completo, 2020)
          Isabelle Leticia Zaboroski Silva , Anny Waloski Robert , Guillermo Cabrera Cabo , LUCIA SPANGENBERG , Marco Augusto Stimamiglio , Bruno Dallagiovanna , Daniela Fiori Gradia , Patrícia Shigunov
          PLoS ONE, 2020
          Palabras clave: transcriptomica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 19326203

        • Polysome-associated lncRNAs during cardiomyogenesis of hESCs (Completo, 2020)
          Pereira, I.T. , LUCIA SPANGENBERG , Cabrera, G. , Dallagiovanna, B
          Molecular and Cellular Biochemistry, 2020
          Palabras clave: lncRNA RNAseq
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / bioinformatica
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / bioinformatica
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas /
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 03008177
          E-ISSN: 15734919
          https://doi.org/10.1007/s11010-020-03709-7

        • Cardiomyogenic differentiation is fine-tuned by differential mRNA association with polysomes (Completo, 2019)
          Isabella T. Pereira , LUCIA SPANGENBERG , Robert, A.W , Amorín, R , Marco Augusto Stimamiglio , Naya, H , Bruno Dallagiovanna
          BMC Genomics, v.: 20 p.:219 2019
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: BMC Genomics
          E-ISSN: 14712164

        • Mutation update for the SATB2 gene (Completo, 2019)
          Zarate YA , Bosanko KA , Caffrey AR , Bernstein JA , Martin DM , Williams MS , Berry-Kravis EM , Mark PR , Manning MA , Bhambhani V , Vargas M , Seeley AH , Estrada-Veras JI , van Dooren MF , Schwab M , Vanderver A , Melis D , Alsadah A , Sadler L , Van Esch H , Callewaert B , Oostra A , Maclean J , Dentici ML , Orlando V , Lipson M , Sparagana SP , Maarup TJ , Alsters SI , Brautbar A , Thropp EK , Naidu S , Lees M , Smith DM , Turner L , Raggio V , LUCIA SPANGENBERG , Garcia-Miñaúr S , Roeder ER , Littlejohn RO , Grange D , Pfotenhauer J , Jones MC , Balasubramanian M , Martinez-Monseny A , Blok LS , Gavrilova R , Fish JL
          Human Mutation, 2019
          Palabras clave: genomics SATB2
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica humana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 10981004
          DOI: 10.1002/humu.23771

        • Cell cycle genes are downregulated after adipogenic triggering in human adipose tissue-derived stem cells by regulation of mRNA abundance (Completo, 2019)
          Bruna H Marcon , Patrícia Shigunov , LUCIA SPANGENBERG , Isabela T. Pereira , Alessandra M de Aguiar , Rocio Amorin , Carmen K Rebelatto , Alejandro Correa , Dallagiovanna, B
          Scientific Reports, v.: 9 p.:5611 2019
          Palabras clave: transcriptomics adipogenesis post-transcriptional regulation
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20452322

        • Deep sequencing discovery of causal mtDNA mutations in a patient with unspecific neurological disease (Completo, 2018)
          LUCIA SPANGENBERG , Martín Graña , Santiago Mansilla , Jennyfer Martínez , Gonzalo Greif , Nélida Montano , Alicia Vaglio , Rosario Guecaimburú , Carlos Robello , Laura Castro , Celia Quijano , Victor Raggio , Naya H
          Mitochondrion, 2018
          Palabras clave: Mitochondrial disease genomics
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Médicas y de la Salud / Otras Ciencias Médicas / Otras Ciencias Médicas / Bioinformatica
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 15677249

        • Polysome profiling followed by RNA-seq of cardiac differentiation stages in hESCs (Completo, 2018)
          Isabella T. Pereira , LUCIA SPANGENBERG , Anny Robert , Rocio Amorin , Marco Stimamiglio , Naya, H , DALLAGIOVANNA, B.
          Scientific Data, v.: 5 p.:18028 2018
          Palabras clave: Cardiomyocyte differentitation transcriptomics
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20524463
          https://www.nature.com/sdata/

        • Gene expression analysis of human adipose tissue-derived stem cells during the initial steps of in vitro osteogenesis (Completo, 2018)
          Anny Waloski Robert , Addeli Bez Batti Angulski , LUCIA SPANGENBERG , Patrícia Shigunov , Isabela Tiemy Pereira , Paulo Sergio Loiacono Bettes , Naya H , Alejandro Correa , DALLAGIOVANNA, B. , Marco Augusto Stimamiglio
          Scientific Reports, v.: 8 p.:4739 2018
          Palabras clave: osteogenesis stem cell transcriptomics RNA-seq
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / bioinformatica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20452322
          DOI: 10.1038

        • lncRNAs are associated with polysomes during adipose-derived stem cell differentiation (Completo, 2017)
          B. DALLAGIOVANNA , ISABELA T. PEREIRA , ANA CAROLINA ORIGA-ALVES , P. SHIGUNOV , H. NAYA , LUCIA SPANGENBERG
          Gene, v.: 17 p.:30082 - 30083, 2017
          Palabras clave: adipogenesis lncRNA RNA-seq stem cell
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución /
          Lugar de publicación: web
          ISSN: 03781119
          DOI: j.gene.2017.02.004

        • 3697G > A in MT-ND1 is a causative mutation in mitochondrial disease (Completo, 2016)
          LUCIA SPANGENBERG , M. GRAÑA , G. GREIF , SUAREZ-RIVERO JM , KRYSZTAL K , TAPIé A , BOIDI M , FRAGA V , LEMES A , GUEçAIMBURú R , CERISOLA A , SáNCHEZ-ALCáZAR JA , C. ROBELLO , RAGGIO V , H. NAYA
          Mitochondrion, v.: 24 28 , p.:54 - 59, 2016
          Palabras clave: Next Generation Sequencing leigh disease mitochondrial disease
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 15677249
          DOI: 10.1016/j.mito.2016.03.006

        • Transcriptome Sequencing Reveals Wide Expression Reprogramming of Basal and Unknown Genes in Leptospira biflexa Biofilms (Completo, 2016)
          G IRAOLA , LUCIA SPANGENBERG , BRUNO LOPES BASTOS , M. GRAÑA , LARISSA VASCONCELOS , ÁUREA ALMEIDA , G. GREIF , C. ROBELLO , PAULA RISTOW , H. NAYA
          mSphere, v.: 1 2 , 2016
          Palabras clave: Transcriptomics biofilm Leptospira
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          E-ISSN: 23795042

        • Polysome profiling shows the identity of human adipose-derived stromal/stem cells in detail and clearly distinguishes them from dermal fibroblasts. (Completo, 2014)
          J. ZYCH , LUCIA SPANGENBERG , M. STIMAMIGLIO , A. ABUD , P. SHIGUNOV , MARCHINI F , C. KULIGOVSKI1 , AXEL R. COFRÉ , A. SCHITTINI , AGUIAR A M , SENEGAGLIA A , PAULO R.S. BROFMAN , S. GOLDENBERG , B. DALLAGIOVANNA , H. NAYA , A. CORREA
          Stem Cells and Development, 2014
          Palabras clave: Transcriptomics Mesenchymal stem cell fibroblast NGS
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 15473287
          E-ISSN: 15578534

        • How does evolutionary variation in Basal metabolic rates arise? A statistical assessment and a mechanistic model. (Completo, 2013)
          DANIEL E. NAYA , LUCIA SPANGENBERG , H. NAYA , FRANCISCO BOZINOVIC
          Evolution, v.: 67 5 , p.:1463 - 1476, 2013
          Palabras clave: Phylogenetic mixed models metabolic rate
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 00143820
          E-ISSN: 15585646
          DOI: 10.1111

        • Polysome profiling shows extensive posttranscriptional regulation during human adipocyte stem cells differentiation into adipocytes (Completo, 2013)
          LUCIA SPANGENBERG , P. SHIGUNOV , A. ABUD , AXEL R. COFRÉ , M. STIMAMIGLIO , C. KULIGOVSKI1 , J. ZYCH , A. SCHITTINI , A. TAVARES COSTA , C. REBELATTO , PAULO R.S. BROFMAN , S. GOLDENBERG , A. CORREA , H. NAYA , B. DALLAGIOVANNA
          Stem Cell Research, 2013
          Palabras clave: Stem cell differentiation adipogenesis post-transcriptional regulation
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 18735061
          DOI: 10.1016

        • Thermal conductance and basal metabolic rate are part of a coordinated system for heat transfer regulation. (Completo, 2013)
          DANIEL E. NAYA , LUCIA SPANGENBERG , H. NAYA , FRANCISCO BOZINOVIC
          Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences, v.: 280 1767 , p.:2013162 - 2013162, 2013
          Palabras clave: endothermy macrophysiology bayesian models
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 14712954
          DOI: 10.1098

        • Role of alternative polyadenylation during adipogenic differentiation: an in silico approach. (Completo, 2013)Trabajo relevante
          LUCIA SPANGENBERG , A. CORREA , B. DALLAGIOVANNA , H. NAYA
          PLoS ONE, v.: 8 10 , 2013
          Palabras clave: Alternative polyadenylation miRNA linear models
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          E-ISSN: 19326203

        • Reduced set of virulence genes allows high accuracy prediction of bacterial pathogenicity in humans (Completo, 2012)
          G IRAOLA , G VAZQUEZ , LUCIA SPANGENBERG , H. NAYA
          PLoS ONE, 2012
          Palabras clave: SVM classifier Pathogenicity prediction
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 19326203

        • Latitudinal Patterns in Rodent Metabolic Flexibility (Completo, 2012)
          DANIEL E. NAYA , LUCIA SPANGENBERG , H. NAYA , FRANCISCO BOZINOVIC
          The American Naturalist, v.: 179 p.:172 - 179, 2012
          Palabras clave: metabolic flexibility
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ecología /
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          ISSN: 00030147
          E-ISSN: 15375323

        • Identifying associations between amino acid changes and meta information in alignments (Completo, 2011)Trabajo relevante
          LUCIA SPANGENBERG , BATTKE F , M. GRAÑA , NIESELT K , H. NAYA
          Bioinformatics, 2011
          Palabras clave: amino acid properties phylogenetic mixed model
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          Medio de divulgación: Papel
          ISSN: 13674803
          E-ISSN: 14602059

        • BowTieBuilder: modeling signal transduction pathways (Completo, 2009)
          JOCHEN SUPPER , LUCIA SPANGENBERG , HANNES PLANATSCHER , ANDREAS DRÄGER , ADRIAN SCHRÖDER , ANDREAS ZELL
          BMC Systems Biology, v.: 3 67 , p.:1 - 13, 2009
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 17520509
          DOI: 10.1186/1752-0509-3-67
          Este artículo fue uno de los top ten mas leído de la editorial

    • Artículos aceptados

      • Arbitrados

        • A labeled medical records corpus for the timely detection of rare diseases using machine learning approaches (Completo, 2025)
          NAYA H , RAGGIO V , LUCIA SPANGENBERG , Leticia Cagnina

          Scientific Reports, 2025
          Palabras clave: aprendizaje automatico arboles de decision SVM
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          Fecha de aceptación: 16/02/2025
          E-ISSN: 20452322
        • Post-transcriptional regulation in early cell fate commitment of germ layers (Completo, 2025)
          Rubens Gomes-Júnior , Cintia Delai Silva Horinouchi , Aruana Fagundes Fiuza Hansel-Fröse , Annanda Lyra Ribeiro , Isabela Tiemy Pereira , LUCIA SPANGENBERG , Bruno Dallagiovanna

          BMC Genomics, 2025
          Palabras clave: transcriptomica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / transcriptomica
          Medio de divulgación: Internet
          Fecha de aceptación: 24/02/2025
          E-ISSN: 14712164

  • Publicación de trabajos presentados en eventos

    • Post-transcriptional regulation during adipogenic differentiation via RNAseq data (SOLiD) (2013)
      LUCIA SPANGENBERG , A. CORREA , B. DALLAGIOVANNA , H. NAYA
      Publicado
      Completo
      Evento: Internacional
      Descripción: Workshop em Regulação Pós Transcricional em Eucariotos
      Ciudad: Curitiba
      Año del evento: 2013
      Palabras clave: Stem cell differentiation NGS SOLiD
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
    • Estudios bioinformáticos de la diferenciación de CÉLULAS MADRE mesenquimales con tecnologías de nueva generación (2012)
      LUCIA SPANGENBERG , A. ABUD , P. SHIGUNOV , A COFRE , M. STIMAMIGLIO , C. KULIGOVSKI1 , J. ZYCH , A. SCHITTINI , A. TAVARES COSTA , C. REBELATTO , P. BROFMAN , S. GOLDENBERG , A. CORREA , H. NAYA , B. DALLAGIOVANNA
      Publicado
      Resumen
      Evento: Nacional
      Descripción: Sociedad Uruguaya de Biociencias
      Ciudad: Piriápolis
      Año del evento: 2012
      Palabras clave: células madre mesenquimales diferenciación
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / transcriptómica
      Medio de divulgación: Papel
    • Identifying associations between amino acid changes and meta information in alignments (2012)
      LUCIA SPANGENBERG , BATTKE F , M. GRAÑA , NIESELT K , H. NAYA
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: ISCB
      Ciudad: Santiago de Chile
      Año del evento: 2012
      Palabras clave: Bioinformatics Amino acid changes in alignments
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
      Medio de divulgación: Internet
    • A comparative study of CLL transcriptomic: Microarrays and NGS (2011)
      LUCIA SPANGENBERG , BIANCHI S , N. REGO , PRITSCH O , DIGHIERO G , H. NAYA
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: Escuela Latinoamericana de Genética Humana
      Ciudad: Caxias do Sul (Brasil)
      Año del evento: 2011
      Palabras clave: Chronic Lymphocytic Leukemia Microarrays Next Generation Sequencing
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
      Medio de divulgación: Papel
    • Evaluando la robustez del metodo comparativo (2010)Trabajo relevante
      LUCIA SPANGENBERG , N. REGO , HECTOR ROMERO , H. NAYA
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: Congreso de la Sociedad Uruguaya de Biociencias
      Año del evento: 2010
      Palabras clave: phylogenetic mixed model bayesian model average
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
      Medio de divulgación: CD-Rom
    • An easy way to incorporate phylogenetic uncertainty in the comparative model (2010)
      LUCIA SPANGENBERG , N. REGO , HECTOR ROMERO , H. NAYA
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: ISCB - LA 2010
      Ciudad: Montevideo
      Año del evento: 2010
      Palabras clave: phylogenetic mixed model bayesian model average
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
      Medio de divulgación: Papel

  • Textos en periódicos o revistas

    • Farmacogenómica: aportes de las nuevas tecnologías hacia una medicina personalizada (2013)
      Tendencias en Medicina
      Revista
      LUCIA SPANGENBERG , NAYA H

      Palabras clave: genomica medica farmacogenomica
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
      Medio de divulgación: Papel
      Fecha de publicación: 01/10/2013

  • Producción técnica

    • Productos

      • MyATGC (2017)
        , Software
        LUCIA SPANGENBERG , RAGGIO V , HERRERA G , ROJAS M , VAZQUEZ L , H. NAYA , LOPEZ F

        País: Uruguay
        Disponibilidad: Restricta
        Institución financiadora: ANII
        Palabras clave: interpretacion mutaciones medicina genomica Procesamiento de lenguaje natural
        Medio de divulgación: Otros
        Plataforma para la interpretación de variantes humanas encontradas por NGS.
      • bacfier (2013)
        , Software
        LUCIA SPANGENBERG , G IRAOLA , H. NAYA
        Un programa escrito en Java para la predicción de la patogenicidad en bacterias. El paper asociado "Reduced set of virulence genes allows high accuracy prediction of bacterial pathogenicity in humans"
        País: Uruguay
        Disponibilidad: Irrestricta
        Institución financiadora: Institut Pasteur de Montevideo
        Palabras clave: patogenicidad predicción
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
        Medio de divulgación: Internet
        https://code.google.com/p/bacfier/
      • bcool: Bringing to light significant Columns correlated with Organism Labels (2011)
        , Software
        LUCIA SPANGENBERG , H. NAYA
        Paquete de R para la identificación de columnas de alineamientos asociados a meta data
        País: Uruguay
        Disponibilidad: Irrestricta
        Institución financiadora: Instituto Pasteur de Montevideo
        Palabras clave: amino acid properties phylogenetic mixed model R packages
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
        Medio de divulgación: Internet
        http://cran.r-project.org/web/packages/bcool/index.html
      • BowtieBuilder (programa para la inferencia de redes de señales en la célula) (2009)
        , Software
        LUCIA SPANGENBERG
        Programa que calcula redes de señales de transducción en la célula con la ayuda de estructuras bow tie
        País: Alemania
        Disponibilidad: Irrestricta
        Institución financiadora: German Federal Ministry of Education and Research
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Computación /
        Medio de divulgación: Internet

    • Evaluaciones

      • Evaluación de Proyectos

        • Evaluación independiente de proyectos

          Proyecto CSIC ( 2021 )
          Uruguay
          Cantidad: Menos de 5
          Proyectos de Vinculación Universidad - Sociedad y Producción
        • Proyecto CSIC ( 2019 )
          Uruguay
          Cantidad: Menos de 5

      • Evaluación de Publicaciones

        • Revisiones

          Publicacion en Human Genetics ( 2023 )
          Tipo de publicación: Anales
          Cantidad: Menos de 5
        • Publicaciones en revistas arbitradas internacionales ( 2021 )
          Tipo de publicación: Anales
          Cantidad: Menos de 5
        • Publicaciones en revistas arbitradas ( 2019 / 2019 )
          Tipo de publicación: Anales
          Cantidad: Menos de 5

      • Evaluación de eventos y congresos

        • LatinR 2018, Argentina ( 2018 / 2018 )
          Revisiones
          Argentina

          LatinR

      • Jurado de tesis

        • Posgraduaçao Biociencias e Biotecnologia ( 2025 )
          Jurado de mesa de evaluación de tesis
          Sector Extranjero/Internacional/Otros / Insituto Carlos Chagas/Fiocruz , Brasil
          Nivel de formación: Maestría
        • PEDECIBA Bioinformatica ( 2025 )
          Jurado de mesa de evaluación de tesis
          Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Bioinformatica , Uruguay
          Nivel de formación: Maestría
        • PEDECIBA Biologia ( 2023 )
          Jurado de mesa de evaluación de tesis
          Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
          Nivel de formación: Doctorado
        • Licenciatura en Matematica ( 2023 )
          Jurado de mesa de evaluación de tesis
          Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Matematicas , Uruguay
          Nivel de formación: Grado
        • Ingeniería Matemática ( 2021 )
          Jurado de mesa de evaluación de tesis
          Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Centro de Matematica , Uruguay
          Nivel de formación: Maestría
        • Ingeniería en computación, UDELAR ( 2011 / 2011 )
          Jurado de mesa de evaluación de tesis
          Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Inco , Uruguay
          Nivel de formación: Grado
          Plataforma de Integración de aplicaciones biológicas basada en ESB, estudiantes Javier Deferrari, Santiago Lopez, Jorge Sosa

    • Formación de RRHH

      • Tutorías concluidas

        • Posgrado

          • Clasificación de los subtipos de Cáncer de Pulmón de Células Pequeñas basada en aprendizaje automático: implicaciones para el pronóstico y la selección de la terapia (2022 - 2024)
            Tesis de maestria
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Bioinformática , Uruguay
            Programa: Maestría en Bioinformática (PEDECIBA)
            Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( LUCIA SPANGENBERG , Eike Staub )
            Nombre del orientado: Nicole Kiedansky
            País: Uruguay
          • Construction of a Post-Transcriptional Regulatory Network During Cardiomyocyte Differentiation (2020 - 2024)
            Tesis de doctorado
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Insituto Carlos Chagas/Fiocruz / Curitiba , Brasil
            Programa: Programa de Pós-graduação em Biociências e Biotecnologia
            Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( LUCIA SPANGENBERG )
            Nombre del orientado: Aruana Hansel
            País: Brasil
            Palabras Clave: diferenciacion de celulas madre bioinformatica RNAseq
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / bioinformatica
          • Caracterización de la microbiota salival en estudiantes de odontología UDELAR consumidores de Yerba Mate (2019 - 2024)
            Tesis de maestria
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Odontología / CAPFO , Uruguay
            Programa: Carrera de Maestría en Ciencias Odontológicas Opción Biología Oral
            Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( LUCIA SPANGENBERG , Tamara Fernandez Calero )
            Nombre del orientado: Barbara Garcia
            País: Uruguay
            Palabras Clave: microbiota oral
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / microbiota

        • Grado

          • Scores de predicción de patogenicidad en variantes de splicing (2023 - 2024)
            Tesis/Monografía de grado
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / CENUR regional Norte , Uruguay
            Programa: Bioingeniería
            Tipo de orientación: Cotutor ( LUCIA SPANGENBERG , Camila Simoes )
            Nombre del orientado: Lucia Sosa
            País: Uruguay
            Palabras Clave: genomica medica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          • Estrategias de machine learning para el an ?alisis de historias cl ??nicas electr ?onicas para la detecci ?on precoz de enfermedades raras (2022 - 2023)
            Tesis/Monografía de grado
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Bioinformática , Uruguay
            Programa: Licenciatura en Bioquímica
            Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( LUCIA SPANGENBERG , Leticia Cagnina )
            Nombre del orientado: Matias Rolando
            País: Uruguay
            Palabras Clave: Enfermedades raras procesamiento de lenguaje natural aprendizaje automatico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
          • Base de datos de variantes estructurales representativas de la población uruguaya (DBStructUR) (2022 - 2023)
            Tesis/Monografía de grado
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Bioinformatica , Uruguay
            Programa: Licenciatura en Ingeniería Biológica
            Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( LUCIA SPANGENBERG , Camila Simoes , Gaston Note )
            Nombre del orientado: Lucia Urquiola
            País: Uruguay
            Palabras Clave: variantes estructurales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
          • Identificando variantes patogénicas en regiones no codificantes del genoma humano
            Tesis/Monografía de grado
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Bioinformática , Uruguay
            Tipo de orientación: Tutor único o principal
            Nombre del orientado: Omega Petrazzini
            País: Uruguay
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
          • Estudio de 41 marcadores genéticos de riesgo para la enfermedad de Alzheimer de inicio tardío en 20 genomas uruguayos y 26 del mundo
            Tesis/Monografía de grado
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
            Programa: Licenciatura en Biología Humana
            Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
            Nombre del orientado: Melanie Nuesch
            País: Uruguay
            Palabras Clave: genomica medica Alzheimer
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución
          • BioWiz: Una suite informática enfocada al laboratorio
            Tesis/Monografía de grado
            Sector Educación Superior/Privado / Universidad ORT Uruguay / Facultad de Ingeniería , Uruguay
            Tipo de orientación: Asesor
            Nombre del orientado: Federico Machado, Roque Giordano
            País: Uruguay
            Palabras Clave: suite informatica java
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática

        • Otras

          • Uso de chatbots en la medicina: Desarrollo de un Chatbot Dual basado en LLMs y RAG para la Asistencia en Alzheimer (2023 - 2025)
            Orientación de posdoctorado
            Sector Educación Superior/Privado / Universidad Católica del Uruguay / Departamento de Ingeniería , Uruguay
            Programa: Maestría en Ciencias de la Ingeniería
            Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( LUCIA SPANGENBERG , Leticia Cagnina )
            Nombre del orientado: Eugenia Pais, Justina Brito, Valentina Da Silva
            País: Uruguay
            Palabras Clave: Inteligencia artificial Aprendizaje automatico Alzheimers
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Computación
          • Analisis de RIP-seq en tripanosomátidos
            Otras tutorías/orientaciones
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Instituto Carlos Chagas , Brasil
            Tipo de orientación: Asesor
            Nombre del orientado: Saloe Bispo
            País: Brasil
            Palabras Clave: NGS SOLiD RIP-seq
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformatica
          • Análisis de regiones intergénicas de espiroquetas
            Otras tutorías/orientaciones
            / , Uruguay
            Nombre del orientado: Elma Leite
            País: Uruguay
            Palabras Clave: Leptospira BLAST
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
          • miRNAs en la diferenciación de células madre
            Otras tutorías/orientaciones
            , Brasil
            Tipo de orientación: Asesor
            Nombre del orientado: Carol Origa
            País: Brasil
            Palabras Clave: células madre mesenquimales diferenciación miRNAs
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática

      • Tutorías en marcha

        • Posgrado

          • Implementaci ?on de herramientas de aprendizaje autom ?atico para la identificaci ?on de genes asociados a enfermedades raras neurol ?ogicas (2023) Trabajo relevante
            Tesis de doctorado
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Bioinformática , Uruguay
            Programa: PEDECIBA Biologia
            Tipo de orientación: Tutor único o principal
            Nombre del orientado: Camila Simoes
            País/Idioma: Uruguay,
            Palabras Clave: genomica medica inteligencia artificial genomica humana
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica humana
          • Utilización de tecnologías de secuenciado masivo para la detección de variantes estructurales y haplotipos largos asociados a enfermedades (2021)
            Tesis de maestria
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Bioinformatica , Uruguay
            Programa: Maestría en Bioinformática (PEDECIBA)
            Tipo de orientación: Tutor único o principal
            Nombre del orientado: Mariana Brandes
            Medio de divulgación: Internet
            País/Idioma: Uruguay, Español
            Palabras Clave: genomica medica variantes estructurales
          • Perfil genético de la Esclero-Hialinosis Focal y Segmentaria Primaria en Uruguay (2021)
            Tesis de maestria
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Bioinformática , Uruguay
            Programa: PROINBIO
            Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( LUCIA SPANGENBERG , Jose Boggia )
            Nombre del orientado: Federico Yandián
            País/Idioma: Uruguay,
            Palabras Clave: enfermedad renal genomica medica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Bioinformatica
          • Desarrollo de herramienta para el análisis de ADN mitocondrial en el contexto de enfermedades raras (2020)
            Tesis de maestria
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de bioinformática , Uruguay
            Programa: Maestría en Bioinformática (PEDECIBA)
            Tipo de orientación: Tutor único o principal
            Nombre del orientado: Gonzalo Javiel
            Medio de divulgación: Internet
            País/Idioma: Uruguay, Español
            Palabras Clave: medicina genomica enfermedades mitocondriales plataforma de analisis
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática

    • Otros datos relevantes

      • Premios, Honores y Títulos

        • Gran Premio Nacional de Medicina (2024)
          (Nacional)
          Academia nacional de Medicina
          Proyecto "Estudio de las variables que afectan la respuesta de la clozapina en pacientes del Hospital Vilardebo"
        • Integrante del comite cientifico internacional del "Single Cell Symposium Rio 2024" (2024)
          (Internacional)
          Wellcome Connecting Sciences
          Conferencia asociada al curso de single cell en Rio 2024 financiado por Wellcome Connecting Sciences.
        • Anneke Levelt-Senger's Prize 2023 (2023)
          (Internacional)
          premio internacional IANAS
          Postulada por la academia Nacional de Ciencias Uruguaya para el premio internacional IANAS - Women for Science Winner of Anneke Levelt-Senger's Prize 2023, obteniendo una mención honorífica.
        • Gran premio Nacional de Medicina (2021)
          (Nacional)
          Academia Nacional de Medicina
          ?Desarrollo e implementación de procedimientos genómicos para el diagnóstico de susceptibilidad hereditaria al cáncer de mama y ovario en el hospital universitario?. Cayota, A., Delgado, L., Artagaveytia, N., Silveyra, N., Ximénez, S., Manrique, G., Simoes, C., Spangenberg, L., Naya, H., Sanguinetti, J., Blanco, V., Possi, T., Camejo, N., Castillo, C., y Cataldi, S.
        • Premio al proyecto "Vigilancia epidemiológica del COVID-19 en las fronteras uruguayas y análisis de su transmisión en el interior del país" (2020)
          (Nacional)
          Fundación Manuel Perez
          Se obtuvo un premio por ser uno de los 7 proyectos aprobados en el llamado de la Fundación Manuel Perez para la lucha contra el COVID-19
        • seedstars for emerging countries (2017)
          (Internacional)
          Seedstars
          Premio a emprendedores innovadores para competir en Suiza por una inversión de 500.000 dólares. Se ganó la fase regional (Uruguay) lo que nos permitió ir a competir contra los otros ganadores regionales en un evento global en Laussane.
        • ProExport (2017)
          (Internacional)
          URUGUAY XXI
          ProExport es una herramienta que potencia la exportación de servicios. En este marco el programa selecciona a determinado emprendimientos para participar de una gira comercial a un país de interés. En este caso fue Colombia (Bogotá). En dicha gira, Uruguay XXI selecciona una agenda para tener reuniones intensivas durante dos días y facilitar la exportación de servicios.
        • MIT Technology Review under 35 (Uruguay-Argentina) (2016)
          (Internacional)
          MIT Technology Review
          Obtuve un premio de innovación por el desarrollo de un algoritmo de determinacíon de patogenicidad de mutaciones en el marco de mi start-up GenLives incubada en BIOESPINN en el área de genomica médica. El premio fue otorgado por MIT-TR. Ganaban 10 participantes de todo Uruguay y Argentina. Fuimos 3 uruguayos y 7 Argentinos los ganadores.

      • Presentaciones en eventos

        • Jornada Academica, Dia de la obesidad (2026)
          Simposio
          Charla sobre el proyecto "Identificación de biomarcadores en la expresión génica de pacientes con obesidad y esteatosis hepática"
          Uruguay
          Tipo de participación: Conferencista invitado
          Carga horaria: 5
          Nombre de la institución promotora: Hospital Maciel
          Alcance geográfico: Regional Palabras Clave: obesidad higado graso transcriptomica scRNA-seq
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
        • ESHG European Society of Human Genetics (2025)
          Congreso
          Poster
          Italia
          Tipo de participación: Otros
          Carga horaria: 6
          Nombre de la institución promotora: ESHG
          Alcance geográfico: Internacional Palabras Clave: genomica medica genomica de poblaciones
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
        • 26th Human Genome Meeting - HUGO-HGM 2023 (2023)
          Congreso
          URUGENOMES a national human genomics project
          Brasil
          Tipo de participación: Conferencista invitado
          Nombre de la institución promotora: HUGO
          Alcance geográfico: Internacional Palabras Clave: genomica humana genomica de poblaciones
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica
        • EMBO | EMBL Symposium: Reconstructing the human past: using ancient and modern genomics (2022)
          Congreso
          Indigenous ancestry in the Uruguayan population
          Alemania
          Tipo de participación: Poster
          Nombre de la institución promotora: EMBL
          Alcance geográfico: Internacional Palabras Clave: genomica humana aDNA ADN antiguo
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica
        • Primer simposio Ecuatoriano-Venezolano de Jóvenes en Bioinformática (2021)
          Congreso
          Avances de la genomica humana en el contexto cientifico-medico uruguayo
          Venezuela
          Tipo de participación: Conferencista invitado Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Bioinformatica
        • Women in Bioinformatics & Data Science LA Conference (2021)
          Congreso
          Charla oral del trabajo en genómica de poblacione y genómica médica
          Argentina
          Tipo de participación: Conferencista invitado
          Nombre de la institución promotora: Women in Bioinformatics & Data Science LA Conference Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Bioinformática
        • Symposium Mitochondria and cell metabolism (2018)
          Congreso
          Diagnosis of mitochondrial diseases using NGS technologies
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral Palabras Clave: mitocondria
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / bioinformatica
        • Pasteurizarte (2018)
          Encuentro
          Pasteurizarte es un evento en el Institut Pasteur de Montevideo en el que se busca combinar la ciencia, el arte y la sociedad.
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral
          Carga horaria: 1
          Nombre de la institución promotora: Institut Pasteur de Montevideo Palabras Clave: Lo que puede hacer la genómica por el deporte.
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genomica
        • Move de Movistar (2018)
          Otra
          MOVE es un evento que Movistar Uruguay organiza desde 2014, un foro de innovación y tecnología donde participan oradores nacionales e internacionales
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral
          Carga horaria: 1
          Nombre de la institución promotora: Movistar Palabras Clave: Speaker en el área de tecnologías disruptivas para el diagnóstico médico
          Areas de conocimiento:
          Ingeniería y Tecnología / Ingeniería Médica / Ingeniería Médica / Genomica y secuenciación
        • Genome Informatics (2018)
          Congreso
          Urugenomes project
          Inglaterra
          Tipo de participación: Expositor oral
          Carga horaria: 40
          Nombre de la institución promotora: Welcome Trust Genome Center Palabras Clave: Genomics Population genomics
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genomica
        • ANII10 (2017)
          Encuentro
          Charla para los 10 años de ANII
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral
          Carga horaria: 5 Palabras Clave: emprendedores ciencia
        • I Foro Internacional de Telemedicina y Telesalud-Uruguay (2017)
          Congreso
          Herramientas de análisis para interpretación de la secuenciación genômica en el contexto clínico
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / genomica medica
        • SmartTalent (2017)
          Simposio
          Evento motivacional para estudiantes
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral
          Carga horaria: 1 Palabras Clave: emprendedores motivacional
        • Workshop in Cancer Perspectives (2017)
          Simposio
          Simposio de estudiantes de doctorado del IBIOBA (Institución partner del Max-Plank Institut)
          Argentina
          Tipo de participación: Expositor oral
          Carga horaria: 18
          Nombre de la institución promotora: IBIOBA Palabras Clave: genomica medica cancer
        • Seminario Fiocruz pos graduação (2017)
          Seminario
          Seminario para los estudiantes e investigadores del Fiocruz Curitiba
          Brasil
          Tipo de participación: Expositor oral
          Carga horaria: 1
          Nombre de la institución promotora: Fiocruz Palabras Clave: genomica genomica medica genomica de poblaciones
        • XXII Congreso Latinoamericano de Patología Clínica (2014)
          Congreso
          Aportes del secuenciado masivo al análisis genómico en Medicina
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral
          Carga horaria: 2
          Nombre de la institución promotora: alapac/personas Palabras Clave: Bioinformática Secuenciado masivo
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
        • Seminario Pasteur (2013)
          Seminario
          Stem cells differentiation mechanisms from a bioinformatics perspective - gene expression and post transcriptional regulation
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral
          Carga horaria: 1 Palabras Clave: Stem cell differentiation Transcriptomics NGS SOLiD
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
        • Novos e velhos saberes (2013)
          Seminario
          Diferenciação de células tronco mesenquimais: uma perspectiva de bioinformática. - Uma jornada controlada pela expressão e regulação -
          Brasil
          Tipo de participación: Expositor oral
          Carga horaria: 1
          Nombre de la institución promotora: UFBA Palabras Clave: Stem cell differentiation Transcriptomics NGS SOLiD
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
        • Workshop em Regulação Pós Trascricional em Eucariotos (2013)
          Congreso
          Post-transcriptional regulation during adipogenic differentiation via RNAseq data (SOLiD)
          Uruguay
          Tipo de participación: Poster
          Carga horaria: 16
          Nombre de la institución promotora: ICC-Fiocruz Palabras Clave: Stem cell differentiation NGS SOLiD
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
        • ISCB-LA (2012)
          Congreso
          Identifying associations between amino acid changes and meta information in alignments . ISCB
          Chile
          Tipo de participación: Poster
          Carga horaria: 24 Palabras Clave: R programming Alignments
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
        • SUB (2012)
          Congreso
          Estudios bioinformáticos de la diferenciación de CÉLULAS MADRE mesenquimales con tecnologías de nueva generación
          Uruguay
          Tipo de participación: Poster
          Carga horaria: 16 Palabras Clave: NGS SOLiD
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
        • ELAG Caxias do Sul (2011)
          Congreso
          A comparative study of CLL transcriptomic: Microarrays and NGS Escuela Latinoamericana de Genética Humana
          Brasil
          Tipo de participación: Poster
          Carga horaria: 40
          Nombre de la institución promotora: ELAG Palabras Clave: Transcriptomics
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática
        • ISCB-LA (2010)
          Congreso
          An easy way to incorporate phylogenetic uncertainty in the comparative model
          Uruguay
          Tipo de participación: Poster
          Nombre de la institución promotora: International Society for Computational Biology Palabras Clave: Comparative phylogenetic model Bayesian model averaging
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          SPANGENBERG L; REGO N; ROMERO H; NAYA H
        • XIII Jornadas de la SUB (2010)
          Congreso
          Evaluando la robustez del método comparativo
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral
          Nombre de la institución promotora: Sociedad Uruguaya de Biociencias Palabras Clave: Modelo filogenético comparativo Promediado bayesiano de modelos
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformática
          SPANGENBERG L; REGO N; ROMERO H; NAYA H

      • Jurado/Integrante de comisiones evaluadoras de trabajos académicos

        • CAS: comisión académica de seguimiento de doctorado (2018)
          Candidato: Florencia Diaz
          Tipo Jurado: Tesis de Doctorado
          LUCIA SPANGENBERG , TORT, J.
          Doctorado en Ciencias Básicas (UDELAR-PEDECIBA) / Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Uruguay
          País: Uruguay
          Idioma: Español
          Palabras Clave: T. cruzi transcriptomica pequeños ARN
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

    • Indicadores de producción

      Actividades
      43
      Líneas de investigación
      		 9
      Proyectos Investigación Desarrollo
      		 20
      Docencia
      		 12
      Pasantia
      		 2

      Producción bibliográfica
      62
      Artículos publicados en revistas científicas
      		53
      Completo 53
      Artículos aceptados para publicación en revistas científicas
      		2
      Completo 2
      Trabajos en eventos
      		 6
      Textos en periódicos
      		 1
      Revistas 1

      Producción técnica

      4
      Productos tecnológicos
      		 4

      Evaluaciones

      12
      Evaluación de proyectos
      		2
      Evaluación de eventos
      		1
      Evaluación de publicaciones
      		3
      Jurado de tesis
      		6

      Formación RRHH

      17
      Tutorías/Orientaciones/Supervisiones concluidas
      		 13
      Tesis/Monografía de grado 6
      Otras tutorías/orientaciones 3
      Tesis de doctorado 1
      Tesis de maestria 2
      Orientación de posdoctorado 1
      Tutorías/Orientaciones/Supervisiones en marcha
      		 4
      Tesis de maestria 3
      Tesis de doctorado 1