Datos Generales

• Institución principal

  Universidad de la República/ Facultad de Medicina / U.A. de Desarrollo Biotecnológico / Uruguay

• Dirección institucional

  Institución: Universidad de la República / Facultad de Medicina / Sector Educación Superior/Público
  Dirección: Av. Alfredo Navarro 3051 / 11600
  País: Uruguay / Montevideo / Montevideo
  Teléfono: (2) 24871288
  Correo electrónico/Sitio Web: airiarte@higiene.edu.uy http://www.higiene.edu.uy/ddbp/lbc/
  

Formación

• Formación académica

  • Concluida

    • Doctorado

      • Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (2010 - 2013)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Evolución del sesgo selectivo en el uso de codones sinónimos y aminoácidos
        Tutor/es: Héctor Musto
        Obtención del título: 2013
        Financiación:
        Universidad de la República / Comisión Académica de Posgrado , Uruguay
        Palabras Clave: Uso de Codones inferencia bayesiana
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular

      Maestría

      • Maestría en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (2007 - 2009)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: “Estudio de patrones genómicos en organismos totalmente secuenciados miembros de la clase Mollicute, con especial énfasis en el orden Mycoplasmatales” Promedio de aprobaciones = 10
        Tutor/es: Hector Musto
        Obtención del título: 2009
        Palabras Clave: Uso de Codones Genómica Bio-informática
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular

    • Grado

      • Licenciatura en Ciencias Biológicas (2000 - 2007)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Búsqueda de Selección Molecular en el ADN mitocondrial de roedores Subterráneos Promedio de aprobaciones = 8 Promedio general = 6.48
        Tutor/es: Ivanna Tomasco
        Obtención del título: 2007
        Palabras Clave: Roedores Subterráneos ADN mitocondrial Selección Molecular
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular

• Formación complementaria

  • Concluida

    • Posdoctorados

      • ANÁLISIS GENÓMICO DE NUEVAS ESPECIES DE B-RIZOBIOS AISLADAS EN URUGUAY (2013 - 2016)

        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
        Palabras Clave: Bacterias fijadoras de nitrógeno
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /

    • Cursos de corta duración

      • Gestión de la Comunicación Organizacional (07/2023 - 07/2023)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Instituto de Capacitación y Formación José Jorge "Tito" Martínez Fontana , Uruguay
        10 horas
        Palabras Clave: Comunicación organizacional y estratégica Gestión administrativa Diagnóstico Liderazgo
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Sociales / Comunicación y Medios / Comunicación de Medios y Socio-cultural /

      • Integración y conformación de equipos de trabajo (06/2023 - 06/2023)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Pro Rectorado de Gestión Administrativa , Uruguay
        12 horas
        Palabras Clave: Conformación de equipos de trabajo Conflictos y resolución de conflictos Liderazgo

      • Liderazgo y Gestión de Recursos Humanos (06/2022 - 07/2022)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Veterinaria / Educación Permanente , Uruguay
        30 horas
        Palabras Clave: Liderazgo y Motivación Trabajo en equipo Comunicación organizacional efectiva
        Areas de conocimiento:
        Humanidades / Otras Humanidades / Otras Humanidades /

      • Liderazgo y desarrollo de habilidades blandas (05/2022 - 05/2022)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Veterinaria / Educación Permanente , Uruguay
        25 horas
        Palabras Clave: Liderazgo y Motivación Trabajo en equipo Comunicación organizacional efectiva
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Sociales / Economía y Negocios / Negocios y Administración /
        Ciencias Sociales / Psicología / Psicología especial / Liderazgo

      • Reconstrucción y análisis de redes metabólicas en la era postgenómica (01/2015 - 01/2015)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        25 horas
        Palabras Clave: Análisis de genomas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática

      • Biology of bacterial non-coding RNAs, EMBO COURSE (01/2014 - 01/2014)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universidad Nacional de Quilmes , Argentina
        40 horas
        Palabras Clave: Regulation prokaryotes small RNAs
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica y Bioinformática
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / ncRNA

      • Curso básico de tecnologías de secuenciado masivo y biología de pequeños ARNs (01/2011 - 01/2011)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
        Palabras Clave: lncRNA, RNAmisc
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Next Generation Sequencing (NGS) data analysis (punto focal de Montevideo de UNU-BIOLAC, la Facultad de de Ciencias y el INIA) (01/2010 - 01/2010)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        39 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

      • Computational Methods for Next-generation Sequencing Data and Transcriptomics (Maestría en Bioinformática) (01/2010 - 01/2010)

        Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas , Uruguay
        30 horas
        Palabras Clave: Transcriptómica Secuenciación
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias /
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

      • The First Joint Pasteur Institute/Welcome Trust Course on Genomics in S. Am (01/2006 - 01/2006)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
        60 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica

    • Participación en eventos

      • Understanding and predicting microbial evolutionary dynamics 2025 (Microbiology Soc. UK) (2025)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Microbiology Society UK., Reino Unido
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: Dinámica evolutiva microbiana adaptación evolución experimental genómica poblacional modelado predictivo
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica de poblaciones & Evolución

      • FEMS Micro (Congreso anual de la Federación Europea de Sociedades de Microbiología) (2025)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Federación Europea de Sociedades de Microbiología, Italia
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: Microbiología molecular evolución microbiana microbiomas publicación científica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /

      • Pasantía Postdoctoral, Lab. Dr. Gabriel Rinaldi, Oxford, UK. (2025)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Departamento de Biología, Universidad de Oxford, Reino Unido
        Alcance geográfico: Internacional
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Zoología, Ornitología, Entomología, Etología / Parasitología
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica Funcional

      • Ciclo de charlas anuales: Fronteras en Genómica: "Un encuentro con editores para discutir las últimas tendencias y avances del área" (2024)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Unidad Académica de Desarrollo Biotecnológico de la Facultad de Medicina & RSG Uruguay (Grupo regional de estudiantes de la ISCB), Uruguay
        Alcance geográfico: Nacional
        Palabras Clave: Avances en genómica Impacto científico Edición y publicación Perspectiva editorial
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Genómica

      • SMBE Regional Meeting in South America (2022)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Society for Molecular Biology & Evolution, Uruguay
        Alcance geográfico: Regional
        Palabras Clave: Evolución molecular Genómica comparativa Diversidad evolutiva Red regional de investigadores
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución molecular y Genómica comparativa

      • Celebrating the 10th Anniversary of SoIBio and 10th Anniversary of the Master in Bioinformatics Uruguay (2009 - 2019) (2019)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SOIBIO & Maestría en Bioinformática (PEDECIBA), Uruguay
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: Bioinformática Genómica Omica y metagenómica Modelado y algoritmos Colaboración Iberoamericana
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática & Genómica

      • Pasantía Postdoctoral, Lab. Dr. Federico Hoffmann, MISSISSIPPI, EEUU (2019)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Department of Biochemistry and Molecular Biology. Mississippi State University., Estados Unidos
        Palabras Clave: Análisis de filomas e integración de datos de expresión al análisis de familias multigénicas.
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica Comparativa

      • II Reunión Argentina de Biología de ARNs no codificantes (2018)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Universidad Nacional de Quilmes / Universidad Nacional de Buenos Aires / CONICET, Argentina
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Pasantía postdoctoral. Alfonso Valencia, Lab. Barcelona Supercomputing Center, Barcelona, España. (2018)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Alfonso Valencia, Lab., España
        Palabras Clave: Reconstrucción de modelos metabólicos a escala genómica Biología de Sistemas Salmonella enterica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Genómica y Biología de Sistemas

      • EMBO workshop ?Evolution in the time of genome architecture? (2017)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: EMBO, Italia
        Palabras Clave: Chromosome architecture regulation of gene expression. New perspectives on genome evolution
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica

      • Primera Jornada Argentina de Biología de ARN no codificantes (2017)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Universidad Nacional de Quilmes, Bernal & A.A.M., Argentina
        Palabras Clave: ARNs no codificantes Genómica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Pasantía postdoctoral. Francisco Penagaricano Lab., UF, Gainesville, USA. (2016)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Department of Animal Sciences, University of Florida, Estados Unidos
        Palabras Clave: Candidate Genes SNP association studies Bull fertility Generalized linear mixed models
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • PASANTÍA POSTDOCTORAL: Análisis de sistemas metabólicos sumando datos de expresión. Laboratorio de Biología de Sistemas y Epigenómica Prof. Dr. Arndt Benecke. (2015)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Institut de Biologie Paris Seine, Universite Pierre & Marie Curie, Paris, Francia
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Biología de Sistemas,

      • Modeling and data analysis for the Healthy Human Global project-Research Camp (2015)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Institut Pasteur, Uruguay
        Palabras Clave: Data Analysis Genomics NGS
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Biología computacional

      • PASANTÍA POSTDOCTORAL, Lab. Dr. Hasan Khatib, WISCONSIN, EEUU. (2014)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Animal Science Dpt., University of Wisconsin-Madison, Estados Unidos
        Palabras Clave: RNAseq resistencia a la insulina
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica

      • PASANTÍA POSTDOCTORAL, Lab. Dr. Federico Hoffmann, MISSISSIPPI, EEUU. (2013)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Department of Biochemistry and Molecular Biology. Mississippi State University., Estados Unidos
        Palabras Clave: Evolución Molecular Bioinformatica Genómica Comparativa
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución /
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • PASANTÍA Lab. de Genómica Animal del Departamento de Ciencia Animal, UC-DAVIS (2011)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: UNIVERSITY OF CALIFORNIA, DAVIS, Estados Unidos
        Palabras Clave: Transcriptómica RNA-seq Bovino
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática

      • ¿Por qué, cómo y donde publicar artículos científicos? Seminario para Autores (2010)

        Tipo: Seminario
        Institución organizadora: Elsevier America Latina, Uruguay

      • International Society for Computational Biology Regional Latin American Meeting (ISCB-LA) (2010)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: International Society for Computational Biology, Uruguay
        Palabras Clave: Genómica Bioinformática.
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Biología computacional

      • Taller de Genómica: desde los microarrays al secuenciado masivo (2009)

        Tipo: Taller
        Institución organizadora: Unidad de Gestión Científica, IP Montevideo, Uruguay
        Palabras Clave: Genómica Bio-informática Microarrays
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica

      • 1era. Jornada Uruguaya de Bioinformática (Local), JUBiLo 08 (2008)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Instituto Pasteur de Montevideo., Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Bioinformática

      • Primeras Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Genética. (2008)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Genética., Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genética

      • XXXV Congreso Argentino de Genética. (2006)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Universidad Nacional de San Luis. San Luis., Argentina
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genética

      • Aplicaciones del ADN mitocondrial al estudio de la diversidad genética. (2006)

        Tipo: Taller
        Institución organizadora: Universidad Nacional de San Luis. San Luis., Argentina
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genética

      • VIII. Jornadas de la Sociedad Zoológica del Uruguay. (2005)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Zoológica del Uruguay., Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Zoología, Ornitología, Entomología, Etología / Genética

      • 2° Simposio Internacional sobre enfermedades priónicas en el animal y el hombre (2005)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Facultad de Ciencias, UDELAR, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genética

Idiomas

• Inglés

  Entiende muy bien / Habla bien / Lee muy bien / Escribe muy bien

Areas de actuación

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Biología y Biología de la Evolución /Genómica comparativa & Evolución molecular

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Biología Celular, Microbiología /Genómica de patógenos

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Otros Tópicos Biológicos /Biología computacional

Actuación profesional

• Sector Educación Superior/Público - Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas - Uruguay

  Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas

  • Vínculos con la Institución

    • Otro (12/2025 - a la fecha)Trabajo relevante

      Investigador Gr.5 10 horas semanales 10 horas semanales

    • Otro (06/2020 - 12/2025)

      Investigador Gr.4 10 horas semanales

    • Otro (06/2014 - 06/2020)

      Investigador Gr.3 10 horas semanales

  • Actividades

    • Docencia

      • Ciencias Biológicas (03/2017 - a la fecha)

        Maestría
        Responsable
        Asignaturas:
        Introducción a la línea de comandos y a la programación para análisis bioinformáticos, 60 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Genómica & Bioinformática

      • Doctor en Ciencias Biológicas (12/2025 - a la fecha)

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Introducción a la línea de comandos, 70 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Biología computacional

      • Ciencias Biológicas (04/2017 - 12/2020 )

        Maestría
        Responsable
        Asignaturas:
        Genómica Evolutiva y Estructural, 60 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica

      • Ciencias Biológicas (12/2016 - 12/2016 )

        Maestría
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Aplicaciones de la secuenciación masiva a los estudios evolutivos y ecológicos en eucariotas, 30 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica

      • Ciencias Biológicas (11/2015 - 12/2015 )

        Maestría
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Pautas para la formulación de un proyecto de investigación en ciencias biológicas, 30 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos /

    • Gestión Académica

      • Miembro Suplente Comisión Maestría Bioinformática (Representando al área Biología) (06/2020 - 12/2024 )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Miembro titular Comisión Maestría Bioinformática (Representando al área Biología) (04/2017 - 05/2019 )

        Participación en consejos y comisiones 3 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Reino Unido

  Wellcome Genome Campus / Wellcome Connecting Science

  • Vínculos con la Institución

    • Otro (11/2023 - a la fecha)

      Profesor invitado 5 horas semanales
      Profesor invitado en los cursos de Genómica y Bioinformática que se dictan en el Instituto de Higiene, Sala Prof. Hormaeche.

  • Actividades

    • Docencia

      • Curso Wellcome Connecting Science (05/2025 - 05/2025 )

        Perfeccionamiento
        Invitado
        Asignaturas:
        Helminth Bioinformatics - Latin America & the Caribbean, 70 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Biología Computacional
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Zoología, Ornitología, Entomología, Etología / Parasitología

      • Curso Wellcome Connecting Science (11/2023 - 11/2023 )

        Perfeccionamiento
        Invitado
        Asignaturas:
        Cancer Genome Analysis - Latin America and the Caribbean, 70 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Biología Computacional

    • Extensión

      • Taller para educadores: Enseñando sobre ADN, genomas y parásitos (05/2025 - 05/2025 )

        Instituto de Higiene 10 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Parasitología & Genómica

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Medicina / Instituto de Higiene

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (10/2019 - a la fecha)Trabajo relevante

      Profesor Agregado 40 horas semanales / Dedicación total
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 4
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (05/2016 - 10/2019)

      Profesor Adjunto 30 horas semanales / Dedicación total
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 3
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (11/2013 - 04/2016)

      Prof. Adjunto 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 3
      Cargo: Interino

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Genómica Evolutiva y Funcional de Platelmintos (02/2011 - a la fecha )

        The study of genomes confirmed that duplication is a powerful evolutionary mechanism, generating raw material for the acquisition of new functions in the cell. In many cases the increase of copies in a family of genes has proven to be the result of an adaptive process. I have studied the evolution of gene families in platyhelminthes and other phyla. Studies mainly include transcriptomic and phylogenetic analyzes, gene structure identification, protein 3D prediction and molecular distances estimations.
        Fundamental
        20 horas semanales
        Instituto de Higiene, Depto. Desarrollo Biotecnológico , Coordinador o Responsable
        Equipo: Andrés IRIARTE ODINI

      • Genómica Comparativa y Funcional de Patógenos Bacterianos (04/2013 - a la fecha )

        One of the main goals of comparative genomics is the elucidation of the genetic basis of the phenotypic differences among species and strains. The genomic approach is of particular importance when analyzing complex phenotypes that depends on a combination of several genetic elements, such as pathogenicity, virulence or symbiosis. The genomic variability may include several levels (rearrangements, presence/absence of genes, indels or single nucleotide variants). I study these genomic traits and its evolutionary dynamics in pathogenic and nonpathogenic bacteria, including clinical and environmental isolates of Salmonella, Acinetobacter and Shewanella, among other.
        Mixta
        10 horas semanales
        Instituto de Higiene, Depto. Desarrollo Biotecnológico , Coordinador o Responsable
        Equipo: Andrés IRIARTE ODINI
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica y Bioinformática
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Genómica funcional del patógeno zoonótico emergente Staphylococcus pseudintermedius como base para el estudio de la Sensibilidad Colateral, una estrategia innovadora para combatir la resistencia antibiótica. (03/2023 - a la fecha)

        La resistencia a antimicrobianos (RAM) es un problema creciente a nivel mundial que ocupa y preocupa a organizaciones sanitarias nacionales e internacionales vinculadas a la salud humana y animal. Una estrategia prometedora para el tratamiento de infecciones que se basa en la evolución de la Sensibilidad Colateral, es decir, la resistencia contra un fármaco A que causa concomitantemente sensibilidad a un segundo fármaco B. La Sensibilidad Colateral, entre A y B, podría capturar a las bacterias en una restricción, evitando así la aparición de multirresistencia durante el tratamiento. Por otro lado, estudios recientes han identificado que ciertos cambios metabólicos están ligados a la capacidad de adquirir resistencia y que existen vías comunes que convergen funcionalmente con la resistencia frente a un grupo de antimicrobianos, incluso con distintos mecanismos de acción. Esto abre la posibilidad de terapias combinadas que podrían limitar la aparición de dichas resistencias. Varios microorganismos han demostrado alta virulencia y gran capacidad para adquirir resistencia a antimicrobianos, entre ellos especies de los géneros Enterococcus, Staphylococcus, Klebsiella y Acinetobacter. En particular Staphylococcus pseudintermedius es un patógeno oportunista que presenta una gran capacidad de adquirir resistencia antimicrobiana mediante transferencia horizontal y mutaciones. Esta especie representa una amenaza para la salud animal y es un potencial reservorio de determinantes de resistencia. En el marco del concepto de "Una sola salud" este proyecto propone contribuir al conocimiento de los mecanismos de RAM en S. pseudintermedius, un patógeno emergente, de alta relevancia y con gran potencial zoonótico. Mediante análisis transcriptómicos y genómicos comparativos buscamos entender mejor el funcionamiento de la sensibilidad colateral y la asociación del metabolismo y los ARNs no codificantes pequeños a la RAM. De esta forma se busca contribuir al desarrollo de estrategias alternativas para combatir infecciones. Los aspectos funcionales abordados en este proyecto son originales y novedosos, generando información y experiencia que va más allá de la especie seleccionada.
        10 horas semanales
        Laboratorio de Biología Computacional , Departamento Desarrollo Biotecnológico, Instituto de Higiene, Facultad de Medicina.
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Doctorado:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: IRIARTE A. , German Matias Traglia , Lancaster , DIANA L. , L. PARDO
        Palabras clave: Resistencia Sensibilidad Staphylococcus zoonosis
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica funcional

      • Grupos-CSIC: Evaluación genómica y proteómica de dos serovariedades de Salmonella enterica subespecie enterica con comportamientos patogénicos diferenciales (04/2013 - a la fecha)

        Genómica gomparativa y evolutiva
        10 horas semanales
        Instituto de Higiene , Depto. Desarrollo Biotecnológico
        Desarrollo
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Maestría/Magister:2
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: YIM L. , CHAVALGOITY, A. , DALESSANDRO B. , BETANCOR L. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica y Bioinformática

      • CSIC:I+D 2018: Estudio de asociación del genoma completo (GWAS) en E. coli: una aproximación original en la búsqueda de marcadores genéticos asociados al patotipo productor de la toxina Shiga (STEC). (03/2018 - 03/2021 )

        Por cambios genéticos ciertas cepas de E. coli han dejado de ser comensales para pasar a ser patógenos. De acuerdo a los mecanismos patogénicos involucrados se reconocen distintos patotipos, uno de ellos es el STEC, patotipo productor de toxinas Shiga (Stxs). Las infecciones por STEC ocurren a cualquier edad pero en niños menores de cinco años pueden llegar a producir procesos severos como colitis hemorrágica (CH) o síndrome urémico hemolítico (SUH), el cual puede ser mortal en la etapa aguda o dejar secuelas a largo plazo. No hay tratamiento específico para la infección por STEC en seres humanos e incluso el uso de algunos antibióticos durante la fase diarreica puede aumentar las chances de desarrollar complicaciones severas como SUH o PPT, Es asi que la estrategia más efectiva hasta el momento es la prevención de la infección. Por otro lado, la presencia de STEC en carnes uruguayas destinadas a la exportación a mercados como el europeo, constituye una importante causa de alertas e incluso ha generado rechazos de los productos que se traducen en pérdidas económicas muy significativas importantes. En ambos casos el diagnóstico de la presencia de este patógeno es fundamental. Según los métodos validados y utilizados, ya sea en la clínica, en alimentos y en ganado, se presenta la problemática de que se debe asegurar la presencia únicamente de los genes stx y eae para así establecer la capacidad patogénica de la cepa. Sin embargo, recientemente se han comenzado a identificar, a nivel mundial, cepas stx positivas y eae negativas que tienen la capacidad patogénica, por lo tanto pensar solo en estos genes a la hora de realizar un screening tiene claras desventajas para evaluar la capacidad patogénica potencial de los cultivos involucrados. En este proyecto se propone una estrategia basada en análisis in-silico para la detección de marcadores genéticos asociados al patotipo STEC. Se implementará la técnica GWAS sobre genomas libremente disponibles, buscando kameros que estén asociados con: 1) el patotipo STEC y 2) el fenotipo STEC invasivo. Se estimará un nivel de confianza de la asociación, un nivel de confianza para la predicción del patotipo en base a la combinación de múltiples marcadores y se identificarán linajes mayormente asociados a las características. La aproximación propuesta en este proyecto incluye además la búsqueda de marcadores en las regiones regulatorias, ARNs no codificantes pequeños y otros marcadores, que a pesar de ser relevantes para la patogenicidad y virulencia en patógenos bacterianos no son muy estudiados. Finalmente utilizando un banco de cepas locales y mediante la secuenciación de genomas completos y/o amplificación/secuenciación de regiones identificadas se procederá a validar las predicciones en cepas aisladas de Uruguay.
        10 horas semanales
        Instituto de Higiene , Depto. Desarrollo Biotecnológico
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Doctorado:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: IRIARTE A.

      • ANII:FCE-2016: Evolución de familias multigénicas codificantes para proteínas de secreción en el phylum Platyhelminthes. (03/2017 - 03/2020 )

        Los platelmintos parásitos presentan generalmente ciclos complejos, involucrando hospedadores variados, incluyendo humanos y especies ganaderas y por esto tienen gran impacto en salud humana y animal. Ejemplos de especies de este grupo son: Echinococcus granulosus, Schistosoma mansoni y Fasciola hepatica, entre otros. Estos organismos han sido estudiados profundamente en su biología, pero en términos relativos a su impacto faltaría mucho por hacer. Las aproximaciones genómicas y computaciones han jugado un rol fundamental para seguir la investigación a bajo costo. Actualmente existen genomas de varias especies que se encuentran disponibles y también hay información sobre el nivel de expresión de los genes. El estudio de los genomas ha confirmado que la duplicación es un mecanismo evolutivo poderoso, generador de materia prima para la adquisición de nuevas funciones en la célula. En muchos casos se ha probado que el propio aumento de copias en una familia de genes es el resultado de un proceso adaptativo. Los resultados preliminares sugieren un rol importante de la selección natural en la evolución de los ciclos complejos en muchos platelmintos y especialmente en algunas genes codificantes para proteínas de secreción exocrinas. Mediante una aproximación genómica comparativa y funcional, se propone identificar genes y familias involucrados en el proceso adaptativo en los diferentes estadios del ciclo de distintas especies (incluyendo aspectos relacionados al nicho y a sus hospedadores intermediarios y finales) y cuantificar el efecto de la selección natural operando a nivel de secuencias y sobre el proceso de duplicación en distintos linajes del phylum.
        20 horas semanales
        Instituto de Higiene , Depto. Desarrollo Biotecnológico
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Maestría/Magister:1
        Doctorado:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: IRIARTE A.
        Palabras clave: Cestoda Trematoda Parásitos Candidatos vacunales proteínas excretadas péptidos antimicrobianos Genómica Comparativa y Funcional

      • CSIC:I+D-2016: Genómica evolutiva y funcional de Salmonella enterica, rol de la regulación mediada por ARNs no codificantes pequeños en la patogenicidad diferencial observada en distintos linajes. (04/2016 - 04/2019 )

        Salmonella enterica es un patógeno de aves y mamíferos, que se distribuye mundialmente y que tiene un impacto considerable en la salud humana y animal, siendo el principal agente causal de infecciones transmitidas por alimentos. Los distintos serotipos dentro de la especie presentan diferencias importantes en el potencial epidémico, la virulencia y la patogenicidad. Las bases genéticas de estas diferencias no se entienden por completo, probablemente porque son el resultado de una combinación de múltiples cambios genéticos ocurridos a lo largo de la evolución. El análisis genómico y fenotípico de las cepas de Salmonella enterica es una de las líneas de investigación dentro el Departamento de Desarrollo Biotecnológico, en el Dpto. se dispone una base de datos con cientos de genomas de la especie, incluidos 200 de cepas aisladas en el Uruguay. Los ARN no codificantes pequeños (ARNncp) son una nueva clase de reguladores de la expresión génica, conservada en bacterias, tienen menos de 250 nucleótidos de longitud y actúan principalmente como ARN antisentido sobre múltiples ARN mensajeros blanco. Así afectan el proceso de traducción y/o la estabilidad de su ARN mensajero. El desarrollo de la secuenciación masiva y las estrategias genómicas han permitido apreciar el rol de estos elementos, involucrados en respuesta al estrés, regulación del metabolismo, regulación de la transferencia horizontal, control de la composición de la envoltura y virulencia en patógenos. A pesar de su rol relevante, hasta el momento pocos trabajos han abordado exclusivamente el estudio comparativo de los ARNncp y su red de ARNm blanco regulados en S. enterica. Menos aún son los trabajos que han investigado la posible asociación de las variaciones fenotípicas observadas entre los distintos linajes con la variabilidad genética asociada a los elementos que forman esta red regulatoria. Este proyecto se enmarca dentro del área de la Genómica, subáreas Genómica Comparativa y Funcional. Mediante el uso de herramientas bioinformáticas el proyecto propone estudiar la evolución y la variablidad de los ARNncp y ARNm, dentro y entre serotipos. Además, el proyecto propone, mediante análisis transcriptomicos, estudiar el rol funcional de los ARNncp y sus genes blancos en las diferencias fenotípicas observadas entre cepas de serotipos Dublin y Enteritidis. Se estudiaran los perfiles transcripcionales de las cepas en ensayos de invasibilidad, supervivencia en clara de huevo y movilidad. El proyecto propuesto contribuirá en varios aspectos: i) permitirá identificar actores moleculares posiblemente responsables de las diferencias fenotípicas entre los serotipos de este importante patógeno transmitido por alimentos, ii) complementará los estudios que se desarrollan actualmente en el Departamento en S. enterica, iii) consolidará el desarrollo de una línea de trabajo liderada por un investigador joven y iv) contribuirá a la formación de recursos humanos en el área de genómica y la biología computacional.
        20 horas semanales
        Instituto de Higiene , Depto. Desarrollo Biotecnológico
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Maestría/Magister:1
        Doctorado:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: IRIARTE A.
        Palabras clave: Enterobacteria Bases genéticas de la patogenicidad & virulencia
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica Funcional y Comparativa

      • ANII:MOV_CO: Caracterización de factores celulares involucrados en la biorremediación de compuestos orgánicos por aislamientos del género Shewanella (08/2016 - 03/2019 )

        La creciente contaminación en el mundo es un grave problema con severas consecuencias a largo plazo. Las principales fuentes de contaminación del agua causada por la mano del hombre incluyen la minería, la industria, la ganadería y agricultura y las sustancias químicas para uso agrícola. En particular, el tratamiento y descarte de residuos industriales requiere de procesamientos complejos que eleva los costos de los productos finales. Debido a esto, existe un interés generalizado para el desarrollo de procesos de biorremediación, los cuales aprovechan las capacidades de diversos microorganismos para la recuperación de nichos ecológicos. Shewanella spp. es una bacteria gram-negativas del orden de las gammaproteobacterias que posee un gran potencial para su aplicación en bioremediación, así como también, para la generación de energía. Shewanella se encuentra comúnmente en medios acuáticos y sedimentos preferentemente marinos. Para ser competitiva en este entorno y responder a la baja disponibilidad de recursos, Shewanella posee un sistema de regulación complejo y de robustos sensores, que pueden ser aplicados tanto en los procesos de degradación de compuestos como de producción de energía. Sin embargo, el estrés generado por diversos factores externos promueve nuevos arreglos en el genoma bacteriano, mediados por la gran variedad de elementos móviles que poseen. La relación que existe entre la versatilidad de este microorganismo para adaptarse y sobrevivir frente ambiente adverso y su capacidad de adquirir y mantener elementos móviles aún no ha sido estudiada. El objetivo de este proyecto es caracterizar el pangenoma de Shewanella spp. a partir de aislamientos recolectados de sedimentos marinos de Antártida, caracterizar los procesos y factores celulares involucrados en la degradación de compuestos orgánicos y determinar el papel que juegan los elementos móviles en la evolución y adaptación de esta bacteria a cambios ambientales y presiones externas.
        5 horas semanales
        Instituto de Higiene , Depto. Desarrollo Biotecnológico
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Argentina, Apoyo financiero
        Equipo: DIANA L. , PARMECIANO G. , QUIROGA C. (Responsable) , MAC CORMACK W.P. , VáZQUEZ S.C.
        Palabras clave: Gammaproteobacterias biocorrección
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /

    • Docencia

      • Carrera de Doctor en Medicina (08/2025 - a la fecha)

        Grado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Medicina Evolutiva (MEDE), 60 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Medicina Evolutiva
        Ciencias Médicas y de la Salud / Otras Ciencias Médicas / Otras Ciencias Médicas / Medicina Evolutiva

      • Carrera de Doctor en Medicina (03/2023 - a la fecha)

        Grado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Introducción al pensamiento evolutivo y su aplicación en medicina (IPEA), 60 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Medicina Evolutiva
        Ciencias Médicas y de la Salud / Otras Ciencias Médicas / Otras Ciencias Médicas / Medicina Evolutiva

      • Carrera de Doctor en Medicina (03/2015 - a la fecha)

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Bases Inmunológicas de la Vacunación, 4 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Biotecnología de la Salud /

      • Carrera de Doctor en Medicina (10/2014 - a la fecha)

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Hematología e Inmunología - CBCC6 Auto-matriculación, 4 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Ciencias de la Salud /

      • Doctor en Ciencias Médicas (05/2014 - 12/2023 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Metodología Cientifica II (2023), 20 horas, Teórico-Práctico
        Metodología Científica II (2014-2016), 30 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Otras Ciencias Médicas / Otras Ciencias Médicas /

      • Doctor en Ciencias Biológicas (PEDECIBA) (08/2018 - 09/2018 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        V ESCUELA REGIONAL DE MICROBIOLOGÍA: ?Conociendo al enemigo: herramientas para el estudio de las interacciones entre bacterias patógenas y sus hospederos?, 60 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica Funcional

    • Extensión

      • (12/2013 - 12/2013 )

        CERP-Maldonado, Red Latinoamericana de Ciencias Biológicas (RELAB)
        10 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica y Bioinformática

    • Gestión Académica

      • Miembro Sub-comisión Biología y Salud, Comisión Académica de Posgrado, UdelaR (10/2018 - a la fecha )

        Comisión Académica de Posgrado, UdelaR Participación en consejos y comisiones 5 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica

      • Miembro Titular Comisión Directiva Instituto de Higiene (& Director Interino) (03/2018 - 08/2022 )

        Instituto de Higiene Participación en cogobierno 5 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Otras Ciencias Médicas / Otras Ciencias Médicas /

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Nigeria

  Institución Extranjera / Nigerian institute of Medical Research

  • Vínculos con la Institución

    • Profesor visitante (08/2025 - 08/2025)

      Profesor invitado 6 horas semanales
      Docente virtual

  • Actividades

    • Docencia

      • Bioinformatic Training Workshop (08/2025 - 08/2025 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Multiple Sequence Alignment and Phylogenetic Analysis, 6 horas, Teórico-Práctico

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Veterinaria

  • Vínculos con la Institución

    • Otro (10/2010 - 01/2023)

      Docente, Programa de Posgrados Fvet 5 horas semanales
      2012 - Actual Docentes Asociado del programa de Posgrados de la Universidad de la República, Facultad de Veterinaria 2010 - 2012 Integrante del Núcleo de Especializaciones del Programa de Posgrados de la Universidad de la República, Facultad de Veterinaria, en calidad de Docente.
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

    • Funcionario/Empleado (10/2004 - 09/2013)

      Ayudante del Área Genética 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Estudio in silico del genoma de animales domésticos. Identificación y análisis de familias génicas de interés. (02/2011 - 12/2014 )

        Genómica Comparativa
        5 horas semanales
        Área Genética, Depto. de Genética y Mejora Animal. , Coordinador o Responsable
        Equipo: Andrés IRIARTE ODINI
        Palabras clave: Bioinformatica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica
        Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias / Genómica de animales domésticos

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Análisis de la expresión diferencial de genes y sus asociaciones en cortes de diez músculos de cordero con alto valor comercial (02/2012 - 11/2018 )

        RNA-seq
        8 horas semanales
        Facultad de Veterinaria , Área Genética, Depto. Genética y Mejora Animal
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Doctorado:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: ARMSTRONG E. (Responsable) , Peñagaricano F.
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica

      • Estudio in silico del genoma de animales domésticos. Identificación y análisis de familias génicas de interés productivo, reproductivo y sanitario (02/2011 - 12/2013 )

        Genómica Comparativa. Evolución molecular.
        5 horas semanales
        Facultad de Veterinaria , Área Genética, Depto. Genética y Mejora Animal
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        Equipo: Andrés IRIARTE ODINI
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica

      • Enfoque genético en el estudio de los reordenamientos cromosómicos en bovinos. Su asociación con problemas reproductivos y evolutivos” (10/2006 - 10/2009 )

        Enfoque genético para el estudio de los reordenamientos cromosómicos asociados a problemas reproductivos y evolutivos.
        20 horas semanales
        Instituto de Produción Animal , Área Genética
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:3
        Equipo: LLAMBÍ S. , POSTIGLIONI A. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Cito-genética

      • Análisis del ADN mitocondrial para el estudio de relaciones filogenéticas del Ganado Criollo Uruguayo. (01/2007 - 01/2009 )

        Actualmente las poblaciones de bovinos Criollos sudamericanos están siendo estudiadas para definir relaciones filogenéticas entre sí y con poblaciones de Europa y África del viejo continente. Se utiliza el análisis de secuencias de la región control (RC) del ADN mitocondrial (ADNmt), principalmente la región hipervariable D loop, como herramienta para entender los patrones filogeográficos de distribución de las reservas de ganado Criollo. Como resultados de estos y otros estudios se han generado cientos de secuencias de dicha región en bovinos Criollos y no Criollos pertenecientes a reservas de América del Sur y el resto del mundo que han permitido definir tiempos de divergencia, variabilidad y relaciones filogenéticas entre estas poblaciones. En el Uruguay, existe una reserva de bovinos Criollos en el Parque Nacional de San Miguel (33º40’S; 53º38’W) que hasta el momento no ha sido incluida en ningún estudio que determine sus relaciones filogenéticas con otras reservas sudamericanas. Dada la importancia de los recursos genéticos locales por la adaptación a las condiciones de nuestro país y el número de investigaciones que se realizan sobre dicha reserva, se hace actualmente imprescindible definir las relaciones filogenéticas de esta población a modo de contextualizar las investigaciones desde un punto de vista evolutivo y genético poblacional. En tal sentido, este proyecto pretende analizar la región control del ADN mitocondrial de animales pertenecientes a la reserva de bovino Criollo Uruguayo, único exponente de ganado típico local, que ha mostrado poseer un alto valor genético, en el marco de la caracterización y conservación de los recursos genéticos animales mundiales.
        7 horas semanales
        Instituto de Producción Animal , Área Genética
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Otra
        Equipo:
        Palabras clave: ADN mitocondrial Ganado Criollo Uruguayo Filogenia
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genética de Poblaciones

    • Docencia

      • Doctor en Medicina Veterinária (DMV) (05/2011 - 05/2015 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        BIOINFORMÁTICA APLICADA A ANÁLISIS CELULARES Y MOLECULARES, 15 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
        Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias / Genómica

      • Doctor en Medicina y Tecnología Veterinaria (10/2010 - 11/2013 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Genética. "Introducción a la Genómica", 3 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica

      • Doctor/a en Ciencias Veterinarias (Plan 1998) (03/2005 - 06/2013 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso Biología Molecular y Celular, Primer semestre, Unidad V. Dictado de la clase teórica “Regulación génica en procariotas y eucariotas”., 4 horas, Teórico
        Curso Genética General, Segundo semestre., 8 horas, Teórico-Práctico
        Curso Biología Molecular y Celular, Primer semestre, Unidad V., 6 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genética Veterinaria
        Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias /

      • Maestría en Salud / Nutrición / Reproducción y producción Animal (10/2011 - 12/2012 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        Desmistificando la clonación, bioinformática y banco de datos en biología molecular, usando parásitos como modelo, 20 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
        Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias /

      • Doctor en Medicina Veterinária (DMV) (05/2012 - 05/2012 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Biología Molecular y Celular, "Código genético y ADN mitocondrial", 2 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • (08/2008 - 08/2010 )

        Maestría
        
        Asignaturas:
        Aplicación de la Genética Molecular en Producción, Conservación, Sanidad y Reproducción Animal”, 3 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genética Molecular Aplicada

      • (03/2005 - 03/2010 )

        Maestría
        
        Asignaturas:
        Citogenética y Evolución del PEDECIBA, Modulo Citogenética en Mamíferos Domésticos coordinada por la Dra. Alicia Postiglioni., 4 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Evolución Molecular

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Argentina

  Asociación Argentina de Microbiología

  • Vínculos con la Institución

    • Profesor visitante (04/2018 - 04/2018)

      40 horas semanales
      Curso intensivo

  • Actividades

    • Docencia

      • Microbiología (04/2018 - 04/2018 )

        Doctorado
        Responsable
        Asignaturas:
        Introducción a la Genómica Comparativa de Microorganismos, 40 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /

• Sector Gobierno/Público - Ministerio de Educación y Cultura - Uruguay

  Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (11/2013 - 04/2016)Trabajo relevante

      Investigador (contrato Postdoctorado) 40 horas semanales / Dedicación total

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • ANÁLISIS GENÓMICO DE NUEVAS ESPECIES DE B-RIZOBIOS AISLADAS EN URUGUAY (11/2013 - 04/2016 )

        Los rizobios son bacterias del suelo que fijan nitrógeno atmosférico solo después de haberse establecido endosimbióticamente en nódulos radiculares de leguminosas. Estas bacterias forman un conjunto filogenéticamente diverso distribuido dentro de las α y las β-poteobacterias, siendo los últimos los más recientemente descriptos y los menos estudiados. En Uruguay se han aislado un conjunto de β-rizobios pertenecientes a los géneros Cupriavidus y Burkholderia asociados a una especie del grupo de las Mimoseae: Parapiptadenia rigida (Angico). Algunas de estas cepas seguramente representan nuevas especies con propiedades únicas y una historia evolutiva particular. Describir y entender los cambios linaje-específicos ocurridos en el genoma de diferentes rizobios es vital para entender cabalmente el proceso de fijación de nitrógeno en simbiosis, el cual a su vez, representa un activo importante para la productividad agrícola mundial, la economía agrícola y la sostenibilidad ambiental. En la presente línea de investigación nos planteamos una estrategia basada en herramientas bioinformáticas para estudiar propiedades genómicas de rizobios, haciendo especial hincapié en cepas de β-rizobios en general y en β-rizobios aislados en Uruguay en particular. Se pretende responder preguntas relacionadas con la organización, composición y evolución de los genomas que acompañan el pasaje evolutivo hacia la función bacteriana “rizobio”. El proyecto cuenta con 2 líneas que pueden desarrollarse de forma independiente. En primer lugar y haciendo uso de información actualmente disponible, se pretende lograr una caracterización a nivel de especie y completar estudios descriptivos y comparativos de genoma de dos aislamientos obtenidos en Uruguay y otros producidos principalmente por el proyecto GEBA-RNB. Una segunda línea de trabajo incluye la secuenciación y análisis de nuevas cepas aisladas en Uruguay. Los resultados generados impactarían en el entendimiento de este proceso biológico fundamental a nivel general y en particular en los poco estudiados β-rizobios. Además el proyecto generará información que permitirá plantearse nuevos experimentos, apuntalando líneas de investigación existentes y facilitando la formación de recursos humanos en el área específica de genómica y bioinformática.
        Fundamental
        40 horas semanales
        Departamento de Bioquímica y Genómica Microbiana (BIOGEM) , Coordinador o Responsable
        Equipo: SOTELO-SILVEIRA J. , FABIANO E. , RAÚL PLATERO
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • GENÓMICA COMPARATIVA DE BETA-RIZOBIOS, CON ESPECIAL ENFASIS EN CEPAS AISLADAS EN URUGUAY (08/2014 - 03/2017 )

        Los rizobios son bacterias que fijan nitrógeno atmosférico después de haberse establecido endosimbióticamente en nódulos radiculares de leguminosas. Estas bacterias forman un conjunto filogenéticamente diverso ubicado dentro de las alfa y las beta-poteobacterias, siendo los últimos los menos estudiados. Describir y entender los cambios linaje-específicos ocurridos en el genoma de diferentes rizobios es fundamental para entender cabalmente el proceso de fijación de nitrógeno en simbiosis, el cual a su vez, representa un activo importante para la productividad agrícola mundial, la economía agrícola y la sostenibilidad ambiental. Este proyecto pretende responder preguntas vinculadas con la organización, composición génica y evolución del genoma en relación al pasaje evolutivo hacia la función bacteriana “rizobio”. Se toma una aproximación basada principalmente en el uso de herramientas bioinformáticas, analizando secuencias de genomas actualmente disponibles en bases de datos y otras de cepas aisladas en Uruguay generadas por el propio proyecto. Los resultados generados impactarían en el entendimiento de este proceso biológico fundamental, colaborando en el entendimiento de las bases genómicas del proceso, tanto a nivel general de los rizobios, como en el caso particular de los beta-rizobios y beta-rizobios aislados en Uruguay. Finalmente el proyecto generará información que permitirá plantearse nuevos experimentos, apuntalando líneas de investigación existentes y facilitando la formación de recursos humanos en el área específica de genómica y bioinformática.
        20 horas semanales
        Departamento de Bioquímica y Genómica Microbianas y Depto. Genómica
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Doctorado:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: FABIANO E. , SOTELO-SILVEIRA J.R. , PLATERO R. , RODRIGUEZ C.
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica comparativa

    • Docencia

      • Maestría en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (10/2015 - 10/2015 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        IV ESCUELA REGIONAL DE MICROBIOLOGÍA: ?Diversidad microbiana: aspectos ecológicos y biotecnológicos?, 10 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica & Metagenómica

      • PEDECIBA (09/2013 - 10/2013 )

        Maestría
        Asistente
        Asignaturas:
        III ESCUELA REGIONAL DE MICROBIOLOGÍA, 2 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica y Bioinformática

    • Extensión

      • (06/2014 - 06/2014 )

        Departamento de Bioquímica y Genómica Microbianas y Depto. Genómica
        1 horas

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Ciencias

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (08/2013 - 11/2013)

      Asistente de la Maestría en Bioinformática 20 horas semanales
      Sección Biomatemática.
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Interino

    • Funcionario/Empleado (03/2008 - 09/2013)

      Ayudante Sección Evolución y Sistemática. 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

    • Funcionario/Empleado (03/2006 - 07/2007)

      Ayudante Sección Evolución y Sistemática. 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

    • Funcionario/Empleado (08/2005 - 02/2006)

      Ayudante Sección Evolución y Sistemática. 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Evolución Molecular, Uso de Codones (03/2007 - a la fecha )

        
        6 horas semanales
        Sección Biomatemática, Lab. de Evolución y Organización del Genoma , Integrante del equipo
        Equipo:
        Palabras clave: Uso de Codones
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Uso de codones sinónimos en virus (02/2011 - 12/2017 )

        Evolución Molecular.
        3 horas semanales
        Centro de Investigaciones Nucleares , Laboratorio de Virología Molecular
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Equipo: CRISTINA J. , MUSTO H. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolución Molecular

      • Glutatión S transferasas en Echinococcus granulosus (02/2011 - 09/2013 )

        Evolución Molecular de GSTs en Echinococcus
        2 horas semanales
        Instituto de Higiene , Cátedra de Inmunología
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Equipo: Verónica FERNÁNDEZ MANCEBO (Responsable) , LA ROCCA S. , MUSTO H. , Paula ARBILDI TORRES
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Buscando las bases moleculares del plegamiento in vivo de proteínas de membrana en Aspergillus nidulans. (03/2010 - 03/2012 )

        
        3 horas semanales
        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Bioquimica-Dpto. de B. Celular y Molecular // Lab. Org. Evol. Genoma
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Maestría/Magister:1
        Equipo: SANGUINETTI M. , MUSTO H. , MARIN M. , RAMON A. (Responsable)
        Palabras clave: Uso de Codones Aspergillus
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Plegamiento de proteinas de membrana eucariota

      • Proteasas Microbianas (02/2011 - 02/2012 )

        
        2 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Sección Bioquimíca
        Investigación
        En Marcha
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: HÉCTOR ROMERO , MARTÍNEZ-ROSALES C. , CASTRO-SOWINSKI, S. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /

      • Evolución Molecular de Citocromo c y el Rol Funcional de Tirosina 67 (02/2011 - 02/2012 )

        
        2 horas semanales
        Facultad de Medicina , Departamento de Bioquímica-CEINBIO
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Equipo: TÓRTORA V. , RADI R. (Responsable) , E.P.LESSA
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Reconstrucción de Codones Optimos Ancestrales en Procariotas (03/2007 - 05/2010 )

        La mayoría de las investigaciones acerca del uso de codones sinónimos se han llevado a cabo en una única especie. No obstante, en los escasos estudios que se han hecho en más de una especie de grupos emparentados, se ha visto que los codones óptimos no siempre se mantienen, sino que algunos "aparecen" en determinadas especies y "desaparecen" en otras. Ahora, las preguntas surgen naturalmente: dado un grupo filogenéticamente emparentado ¿cuáles serían los codones óptimos del último ancestro común del grupo? ¿Qué patrones se observarían si, dentro del grupo, se procede a ir "mapeando" la aparición y desaparición de los codones óptimos en cada uno de los nodos internos?¿Cómo son los patrones de coevolucion entre los diferentes codones optimos, aminoácidos con codones óptimos y tRNAs?¿Cómo van cambiando en los diferentes taxa y en los diferentes niveles taxonómicos? En definitiva, ¿cómo es el tempo y el modo de evolución de estas caracaterísticas? La extensión natural de esta idea es llegar a los mismos orígenes de la traducción ¿con los datos disponibles en este momento (genomas completamente secuenciados) es posible detectar los primitivos codones traduccionalmente óptimos? ¿Si esto es así, cuáles eran? En otras palabras, ¿cuáles eran los codones óptimos de LUCA? Este proyecto plantea aportar información para contestar estas preguntas a partir de la construcción de árboles filogenéticos construídos tomando como marcadores moleculares los genes ortólogos presentes en los procariotas completamente secuenciados para cada nivel de clasificación taxonómica elegido.
        5 horas semanales
        Lab. de Organización y Evolución del Genoma , Sección Biomatemática
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Especialización:2
        Maestría/Magister:1
        Doctorado:1
        Equipo: ROMERO H. , MUSTO H. (Responsable)
        Palabras clave: Uso de Codones Reconstrucción de Caracteres Ancestrales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular

    • Docencia

      • Licenciatura en Ciencias Biológicas (05/2011 - 12/2014 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Taller de herramientas para el análisis de secuencias de ácidos nucleicos y aminoácidos, "Uso de Codones Sinónimos", 4 horas, Teórico-Práctico

      • Licenciatura en Ciencias Biológicas (07/2008 - 06/2013 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso Evolución, Sexto semestre., 10 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución /

      • Licenciatura en Ciencias Biológicas (03/2012 - 05/2012 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Biología Molecular, "Organización del Genoma Procariota", 2 horas, Teórico
        Biología Molecular, "Código Genético ", 2 horas, Teórico
        Biología Molecular, "Uso de Codones Sinónimos", 2 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • PEDECIBA (12/2010 - 12/2010 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        Biología Molecular de Enfermedades Virales (Introducción a la teoría de coalescencia), 12 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolución

      • Maestría en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (09/2008 - 11/2010 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        “Introducción a la Genómica Computacional” Participación como docente de práctico con la clase “Análisis de Codones Sinónimos, Uso del programa CodonW”, 2 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular

      • Licenciatura Bioqímica/Ciencias Biológicas (10/2010 - 10/2010 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Evolución. "Evolución de las familias multigénicas", 3 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Familias multigénicas y CNV

      • Maestría en Bioinformática (10/2010 - 10/2010 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        Taller de Genómica Evolutiva, 6 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica

      • Maestría en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (03/2008 - 06/2010 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        Estructura, organización y evolución del genoma bacteriano, 3 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica

      • PEDECIBA (04/2009 - 05/2009 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        Transducción de señales en Fisiología Espermática: aspectos básicos y aplicados, 3 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Reproductiva / Evolución

      • Licenciatura en Ciencias Biológicas (06/2005 - 02/2007 )

        Grado
        
        Asignaturas:
        Evolución, 8 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución

      • Licenciatura en Ciencias Biológicas (08/2006 - 11/2006 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Evolución, “Especiación parapátrida y cromosómica” y “Genómica comparativa de procariotas”., 4 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución

    • Extensión

      • Lab. de Evolución. Proyecto de Popularización: (02/2009 - 02/2009 )

        CERP del suroeste (Colonia)
        1 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución /

    • Otra actividad técnico-científica relevante

      • Integrante del proyecto de Popularización La evolución biológica en la cultura moderna". Responsable Prof. Dr. E. P. Lessa. Aprobado y Financiado (ANII). (02/2011 - 12/2011 )

        Depto. Ecología y Evolución, Sección Evolución y Sistemática
        1 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución /

      • Integrante del proyecto "Elaboración de material audiovisual para el curso de Evolución" En la línea: “Elaboración de Material Didáctico” de la CSE-UDELAR Responsable Prof. Dr. E. P. Lessa. Aprobado y Financiado (02/2010 - 02/2011 )

        Depto. Ecología y Evolución, Sección Evolución y Sistemática
        1 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución /

    • Gestión Académica

      • Miembro de la asamblea del claustro (Suplente) (05/2012 - 09/2013 )

        ASAMBLEA DEL CLAUSTRO – FACULTAD DE CIENCIAS
        Participación en cogobierno

      • Integrante de la Comisión de Adquisiciones del Instituto de Biología – Facultad de Ciencias. (02/2012 - 12/2012 )

        Facultad de Ciencias, Instituto de Biología
        Participación en consejos y comisiones

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Chile

  Univ de Chile

  • Vínculos con la Institución

    • Profesor visitante (11/2012 - 12/2012)

      Docente 20 horas semanales
      Dicté clases para docentes de secundaría sobre genómica y bioinformática.

  • Actividades

    • Extensión

      • Curso Biología Molecular y Genómica para docentes de educación media (11/2012 - 11/2012 )

        Facultad de Medicina, Instituto de Ciencias Biomédicas - Programa de Biología Celular y Molecular
        20 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Dictado de cursos de bioinformática y biología computacional para docentes de secundaria. (11/2012 - 11/2012 )

        20 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Biología computacional

Carga horaria

• Carga horaria de docencia: 10 horas
  
• Carga horaria de investigación: 30 horas
  
• Carga horaria de formación RRHH: 10 horas
  
• Carga horaria de extensión: 1 hora
  
• Carga horaria de gestión: 4 horas
  

Producción científica/tecnológica

• <> Uno de los principales objetivos de la genómica comparativa es dilucidar la base genética de las diferencias fenotípicas entre especies y cepas. El enfoque genómico es de particular importancia al analizar fenotipos complejos que dependen de la combinación de múltiples elementos genéticos, como la patogenicidad, la virulencia o la simbiosis. La variabilidad genómica puede incluir distintos niveles (reordenamientos, presencia/ausencia de genes, indels o variantes de un solo nucleótido). Estudio estos rasgos genómicos y su dinámica evolutiva en bacterias patógenas y no patógenas, incluyendo aislamientos clínicos y ambientales de Salmonella, Acinetobacter y Shewanella, entre otros.

  <> El estudio de los genomas ha confirmado que la duplicación es un mecanismo evolutivo poderoso, que genera materia prima para la adquisición de nuevas funciones celulares. En muchos casos, el aumento en el número de copias dentro de una familia génica ha demostrado ser el resultado de un proceso adaptativo. He estudiado la evolución de familias de genes en platelmintos y otros filos. Estos estudios incluyen principalmente análisis filogenéticos, identificación de la estructura génica, predicción de estructuras proteicas en 3D y estimaciones de distancias moleculares.

  <> El sesgo en el uso de codones (CUB, codon usage bias) es el uso no aleatorio de codones sinónimos, que puede evidenciarse al comparar distintos genomas, genes y regiones dentro de los genes. Se han propuesto diferentes hipótesis para explicar el CUB a estos niveles. En la mayoría de los organismos, la selección es probablemente la principal fuerza responsable de la preferencia por ciertos tripletes en genes altamente expresados y regiones conservadas. Estos tripletes preferidos, conocidos como codones óptimos, pueden ser más eficientes para el proceso de traducción. He estudiado la dinámica evolutiva de la elección de codones óptimos y del CUB en un marco filogenético. La elección de codones óptimos se analiza en relación con el contenido de genes de tRNA, la composición genómica y la variación de rasgos ecofisiológicos.

Producción bibliográfica

• Artículos publicados

  • Arbitrados

    • Transcriptome profiling of intra-snail stages of the liver fluke Fasciola hepatica reveals key mediators underlying parasite development and interaction with the host (Completo, 2026)

      LANGLEIB, M. , FONTENLA S. , DOMINGUEZ, M , Sankaranarayanan G. , Wlodek S. , Berriman M. , G. RINALDI , IRIARTE A. , TORT, J F
      BMC Genomics, 2026
      Palabras clave: Fasciola transcriptomics intermediate host development invasion gene families
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Zoología, Ornitología, Entomología, Etología / Parasitología
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica Comparativa
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica Funcional
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 14712164
      DOI: 10.1186/s12864-026-12670-6
      https://link.springer.com/journal/12864
      Andrés Iriarte y José F. Tort son CO-AUTORES de correspondencia.
      
      

    • Humoral and cellular immune responses in cattle upon Clostridium chauvoei vaccination and challenge (Completo, 2025)

      ROSSI, A , Guarnaschelli J. , RIAL A. , MARÍA MORENO , Rivera-Patron, M , IRIARTE A. , Chabalgoity, JA.
      Frontiers in Immunology, v.: 16 2025
      Palabras clave: C. chauvoei Cattle polyclostridial vaccine humoral immunity vaccine efficacy
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Inmunología
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 16643224
      DOI: 10.3389/fimmu.2025.1584168
      www.frontiersin.org/journals/immunology
      
      

    • IApred: A versatile open-source tool for predicting protein antigenicity across diverse pathogens (Completo, 2025)

      SEBASTIAN MILES , Menafra G. , IRIARTE A. , Chabalgoity, JA.
      ImmunoInformatics, v.: 20 p.:100061 2025
      Palabras clave: Antigenicity Immunology Bioinformatics Immunoinformatics Predictor Vaccines
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Inmunología
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 26671190
      DOI: 10.1016/j.immuno.2025.100061
      https://www.sciencedirect.com/journal/immunoinformatics
      
      

    • Evolution of SL-RNA Genes and Their Splicing Targets in Parasitic Flatworms (Completo, 2025)Trabajo relevante

      JAVIER CALVELO , MUSTO H , URIEL KOZIOL , IRIARTE A.
      Molecular Biology and Evolution, v.: 42 11 , 2025
      Palabras clave: Spliced leader trans-splicing operons comparative genomics of platyhelminthes cestodes concerted evolution
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica Comparativa
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Zoología, Ornitología, Entomología, Etología / Parasitología
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 07374038
      E-ISSN: 15371719
      DOI: 10.1093/molbev/msaf228
      https://academic.oup.com/mbe
      #Andrés Iriarte & Uriel Koziol son co-autores de correspondencia.
      
      

    • Duplex droplet digital PCR detection of Streptococcus uberis and Streptococcus dysgalactiae, major etiological agents of bovine mastitis (Completo, 2024)

      Diana L. M. , Traglia .G.M. , Diana V. , Calvinho L. , JIMENA LAPORTA , IRIARTE A. , PUENTES, R
      Frontiers in Animal Science, v.: 4 2024
      Palabras clave: ddPCR molecular diagnosis dairy cattle bacterial pathogen Gram positive
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Agrícolas / Producción Animal y Lechería / Ciencia Animal y Lechería /
      Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 26736225
      DOI: 10.3389/fanim.2023.1336816
      https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fanim.2023.1336816/full
      
      

    • Applicability of DNA barcoding-based analyses on the diet of the gray brocket deer (Subulo gouazoubira) in xeric hillside forests (Completo, 2024)

      COSSE, M. , Bruno, Antonella , MANNISE, N. , BOU, N. , ZABALETA, MARÍA , JOSE M. BONIFACINO , CAMARGO, A. , SMIRCICH, P. , IRIARTE A. , BRAZEIRO A
      Therya, v.: 15 1 , p.:51 - 58, 2024
      Palabras clave: DNA metabarcoding food habits mammal neotropical cervids noninvasive species identification trnL (UAA)
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Conservación de la Biodiversidad /
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Mexico
      Escrito por invitación
      E-ISSN: 20073364
      https://mastozoologiamexicana.com/therya/index.php/THERYA/article/view/5746
      
      

    • Truncated O-glycosylation in metastatic triple-negative breast cancer reveals a gene expression signature associated with extracellular matrix and proteolysis (Completo, 2024)

      FESTARI MF , JARA.E , COSTA, M. , IRIARTE A. , TERESA FREIRE
      Scientific Reports, v.: 14 p.:1809 2024
      Palabras clave: Cancer Glycosylation Metastasis Differentially expressed genes Transcriptome Immunoregulation Tumor growth
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica Funcional
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Bioquímica y Biología Molecular / Inmunobiología
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 20452322
      DOI: 10.1038/s41598-024-52204-2
      https://www.nature.com/articles/s41598-024-52204-2
      Iriarte & Freire son autores de correspondencia. Festari & Jara contribuyeron de la misma forma al trabajo.
      
      

    • The genome and transcriptome of the snail Biomphalaria sudanica s.l.: Immune gene diversification and highly polymorphic genomic regions in an important African vector of Schistosoma mansoni (Completo, 2024)

      Pennance T. , JAVIER CALVELO , Burd R. , Cayton J. , Bollmann S.R. , Blouin M.S. , Spaan J.M. , HOFFMANN, F. G. , Ogara G. , Rawago F. , Andiego K. , Mulonga B. , Odhiambo M. , Loker E.S. , Laidemitt M.R. , Lu L. , IRIARTE A. , Odiere M. , Steinauer M.L.
      BMC Genomics, v.: 25 192, 2024
      Palabras clave: Biomphalaria sudanica Biomphalaria choanomphala Schistosomiasis Snail vector De novo genome assembly Polymorphism Immunogenetics Gene family evolution Balancing selection Pathogen recognition
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Parasitología
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 14712164
      DOI: 10.1186/s12864-024-10103-w
      https://bmcgenomics.biomedcentral.com/
      
      

    • Developing a DNA metabarcoding method to identify diet taxa in Neotropical foxes. (Completo, 2024)

      MANNISE, N. , COSSE, M. , GREIF, G. , BOU, N. , ROBELLO, C. , S. González , IRIARTE A.
      Frontiers in Ecology and Evolution, v.: 12 1360714 , 2024
      Palabras clave: non-invasive genetic techniques high-throughput sequencing (HTS) molecular ecology environmental DNA wild canids
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Conservación de la Biodiversidad /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 2296701X
      DOI: 10.3389/fevo.2024.1360714
      https://www.frontiersin.org/journals/ecology-and-evolution
      * Correspondence: A. Iriarte (airiarte@higiene.edu.uy); M. Cosse (mcosse@iibce.edu.uy)
      
      

    • Genotypic and phenotypic analysis of Salmonella enterica serovar Derby, looking for clues explaining the impairment of egg isolates to cause human disease (Completo, 2024)

      German Matias Traglia , BETANCOR L , YIM, L , IRIARTE A. , Chabalgoity, JA.
      Frontiers in Microbiology, v.: 15 1357881 , 2024
      Palabras clave: Virulence phenotype acid tolerance ssaG mobile elements outbreaks of salmonellosis Comparative genomics
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 1664302X
      DOI: 10.3389/fmicb.2024.1357881/
      https://www.frontiersin.org/journals/microbiology/articles/10.3389/fmicb.2024.1357881/
      *Corresponding author: Andrés Iriarte & José Alejandro Chabalgoity
      
      

    • Evolutionary analysis of species-specific duplications in flatworm genomes (Completo, 2024)Trabajo relevante

      LANGLEIB, M. , JAVIER CALVELO , COSTÁBILE, A , CASTILLO, E. , TORT, J F , HOFFMANN, F. G. , Anna V. Protasio , URIEL KOZIOL , IRIARTE A.
      Molecular Phylogenetics and Evolution, v.: 199 108141 , 2024
      Palabras clave: Platyhelminthes Comparative genomics Inparalogs Gene family evolution Secreted proteins
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genomica compartiva y evolutiva
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Zoología, Ornitología, Entomología, Etología / Parasitologia
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 10557903
      E-ISSN: 10959513
      DOI: 10.1016/j.ympev.2024.108141
      https://www.sciencedirect.com/journal/molecular-phylogenetics-and-evolution
      Corresponding author A . Iriarte
      
      

    • Exploring Biodiversity of Uruguayan Vascular Plants through DNA Barcoding (Completo, 2024)

      Da Silva C. C. , MANNISE, N. , SEGUÍ R. , IRIARTE A. , BOU, N. , JOSE M. BONIFACINO , Mailhos, A. , Anza, L. , Santiago Chitaro , Ocampo, F. , Gándaras R. , FLORENCIA AREZO , Capurro L , Iturburu M. , Nieto N. , Hernán Juan , Garrido J. , RAÚL PLATERO , Gago J. , LEZAMA, F. , DO CARMO M , COSSE, M.
      Frontiers in Genetics, v.: 15 2024
      Palabras clave: BoldSystem taxonomy Uruguayan flora Molecular markers RBCL trn-psbA trnL (UAA) ITS2
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Conservación de la Biodiversidad /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 16648021
      DOI: 10.3389/fgene.2024.1435592
      https://www.frontiersin.org/journals/genetics
      
      

    • Trans-splicing in the cestode Hymenolepis microstoma is constitutive across the life cycle and depends on gene structure and composition. (Completo, 2023)

      Calvelo J. , Brehm K. , IRIARTE A. , URIEL KOZIOL
      International Journal for Parasitology, v.: 53 2 , p.:103 - 117, 2023
      Palabras clave: Spliced Leader Post-transcriptional regulation Tapeworm Flatworm Platyhelminthes.
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Parasitología
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00207519
      DOI: 10.1016/j.ijpara.2022.11.006
      https://www.sciencedirect.com/journal/international-journal-for-parasitology
      *Iriarte & Koziol are co-corresponding authors
      
      

    • Comparative genome analysis of the genus Shewanella unravels the association of key genetic traits with known and potential pathogenic lineages (Completo, 2023)

      Cerbino G.N. , German Matias Traglia , Ayala T. , Parmeciano G. , Ramírez M.S. , Centrón D. , IRIARTE A. , Quiroga C.
      Frontiers in Microbiology, v.: 14 p.:11242 - 11242, 2023
      Palabras clave: Shewanella accessory genome mobilome resistome virulome horizontal gene transfer
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 1664302X
      DOI: 10.3389/fmicb.2023.1124225
      https://www.frontiersin.org/journals/microbiology
      # Cecilia Quiroga y Andrés Iriarte son co-autores de correspondencia.
      
      

    • Transcriptomic analysis reveals gene expression changes in peripheral white blood cells of cows after embryo transfer: implications for pregnancy tolerance (Completo, 2023)

      De los Santos J.A. , Andrade J.P.N. , Rostoll-Cangiano L. , IRIARTE A. , PEÑAGARICANO F. , Parrish J.
      Reproduction in Domestic Animals, v.: 58 7 , p.:893 - 1020, 2023
      Palabras clave: Bovine interferon-stimulated genes Early pregnancy diagnosis Immune regulation.
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Agrícolas / Producción Animal y Lechería / Producción Animal y Lechería /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Transcriptómica
      Medio de divulgación: Otros
      E-ISSN: 14390531
      DOI: https://doi.org/10.1111/rda.14371
      https://onlinelibrary.wiley.com/journal/14390531
      
      

    • Main factors shaping amino acid usage across evolution (Completo, 2023)

      GUILLERMO LAMOLLE , Diego Simón , IRIARTE A. , MUSTO H
      Journal of Molecular Evolution, v.: 91 4 , p.:382 - 390, 2023
      Palabras clave: amino acids GC content GC skew amino acid cost hydropathy optimal growth temperature
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00222844
      E-ISSN: 14321432
      DOI: 10.1007/s00239-023-10120-5
      https://www.springer.com/journal/239
      Mini review
      
      

    • Amino acid usage and protein expression levels in the flatworm Schistosoma mansoni (Completo, 2023)

      GUILLERMO LAMOLLE , IRIARTE A. , Diego Simón , MUSTO H
      Molecular and Biochemical Parasitology, v.: 255 p.:11158 2023
      Palabras clave: amino acid cost expression levels hydropathy neglected tropical disease schistosomiasis snail fever
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Parasitología
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 01666851
      DOI: 10.1016/j.molbiopara.2023.111581
      https://www.sciencedirect.com/journal/molecular-and-biochemical-parasitology
      
      

    • Revealing the genetic basis of eyelid pigmentation in Hereford cattle (Completo, 2022)

      JARA.E , FRANCISCO PEÑAGARICANO , ARMSTRONG E , CIAPPESONI, G. , IRIARTE A. , E.A. NAVAJAS
      Journal of Animal Science, v.: 100 5 skac1, 2022
      Palabras clave: beef cattle melanocyte biology ocular pathologies
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias /
      Ciencias Agrícolas / Producción Animal y Lechería / Ciencia Animal y Lechería /
      Medio de divulgación: Otros
      ISSN: 00218812
      E-ISSN: 15253163
      DOI: doi.org/10.1093/jas/skac110
      https://academic.oup.com/jas
      
      

    • Staphylococcus aureus alpha-toxin effect on Acinetobacter baumannii behavior (Completo, 2022)

      Fernandez J.S. , Tuttobene M.R. , Montaña S. , Subilis T. , Cantera V. , IRIARTE A. , Tuchscherr L. , Ramirez M.S.
      Biology, v.: 11 4 , p.:570 2022
      Palabras clave: Acinetobacter baumannii Staphylococcus aureus polymicrobial infections commensals
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 20797737
      DOI: doi.org/10.3390/biology11040570
      https://www.mdpi.com/journal/biology
      
      

    • Identification of long noncoding RNAs involved in eyelid pigmentation of Hereford cattle (Completo, 2022)

      JARA.E , FRANCISCO PEÑAGARICANO , ARMSTRONG E , C. Menezes , Tardiz L. , Rodons G. , IRIARTE A.
      Frontiers in Genetics, v.: 13 p.:86456 - 86456, 2022
      Palabras clave: Eye cancer lncRNAs noncoding genetic elements strand-specific RNAseq beef cattle
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica funcional
      Ciencias Agrícolas / Producción Animal y Lechería / Producción Animal y Lechería /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 16648021
      DOI: 10.3389/fgene.2022.864567
      https://www.frontiersin.org/journals/genetics
      *Corresponding author: Andrés Iriarte
      
      

    • Full characterization of plasmids from Achromobacter ruhlandii isolates recovered from a single patient with cystic fibrosis (CF) (Completo, 2021)

      Steffanowski C. , Papalia M. , Galanternik L, , Gutkind G, , Cooper V. , Ramírez M.S, , Radice M.
      Revista Argentina de Microbiología, v.: S0325-7541(21)00048- 2021
      Palabras clave: Achromobacter ruhlandii Cystic fibrosis Fibrosis qu?stica Plasmid Pl?smido
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica funcional
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Argentina
      ISSN: 03257541
      DOI: 10.1016/j.ram.2021.01.005
      https://www.journals.elsevier.com/revista-argentina-de-microbiologia
      
      

    • Stage-specific transcriptomic analysis of the model cestode Hymenolepis microstoma (Completo, 2021)Trabajo relevante

      Preza M. , JAVIER CALVELO , LANGLEIB, M. , Hoffmann F.G. , CASTILLO, E. , URIEL KOZIOL , IRIARTE A.
      Genomics, v.: 113 2 , p.:620 - 632, 2021
      Palabras clave: Antigen B Flatworms functional genomics Gene family evolution RNA-seq Tapeworm
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Genómica
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Parasitología
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 08887543
      E-ISSN: 10898646
      DOI: 10.1016/j.ygeno.2021.01.005
      https://www.journals.elsevier.com/genomics
      
      

    • Molecular detection of coccidian Apicomplexa Parasites isolated from wild crab-eating and pampas foxes through novel TaqManTM probes: a contribution to their molecular epidemiology (Completo, 2021)

      MANNISE, N. , CABRERA A. , Hernán Juan , COSSE, M. , Giannitti F , MARIA E FRANCIA , Telma González , IRIARTE A. , Riet-Correa F. , ROBELLO, C. , GONZÁLEZ, S.
      Molecular Biology Reports, v.: 48 6 , p.:5013 - 5021, 2021
      Palabras clave: Real-time PCR Neosporosis Toxoplasmosis Hammondia spp. Neotropical canids.
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Otros
      ISSN: 03014851
      E-ISSN: 15734978
      DOI: 10.1007/s11033-021-06492-w
      https://www.springer.com/journal/11033/
      
      

    • Codon usage bias: an endless tale (Completo, 2021)

      IRIARTE A. , GUILLERMO LAMOLLE , MUSTO H
      Journal of Molecular Evolution, 2021
      Palabras clave: selection for translation molecular evolution synonymous codon usage
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Lugar de publicación: Estados Unidos
      E-ISSN: 14321432
      DOI: https://doi.org/10.1007/s00239-021-10027-z
      https://www.springer.com/journal/239
      
      

    • Metagenomic analysis of Raphidiopsis raciborskii microbiome: beyond the individual (Completo, 2021)

      Paula Vico , IRIARTE A. , SYLVIA BONILLA , PICCINI, C.
      Biodiversity Data Journal, 9.e72514 , 2021
      Palabras clave: Raphidiopsis raciborskii microbiome 16S rRNA metagenomics phycosphere
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Marina, Limnología /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Metagenómica
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 13142836
      E-ISSN: 13142828
      DOI: https://doi.org/10.3897/BDJ.9.e72514
      https://bdj.pensoft.net/article/72514/instance/7004614/
      
      

    • Imported One-Day-Old Chicks as Trojan Horses for Multidrug-Resistant 2 Priority Pathogens Harboring mcr-9, rmtG and Extended-Spectrum ?3 Lactamase Genes. (Completo, 2021)

      Coppola N. , CORDEIRO N , Trenchi G. , Esposito F. , Fuga B. , Fuentes-Castillo D. , Lincopan N. , IRIARTE A. , BADO I , VIGNOLI R
      Applied and Environmental Microbiology, v.: 88 2 , 2021
      Palabras clave: Antimicrobial resistance One Health rmtG or mcr9.1 aminoglycosides and colistin
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Papel
      E-ISSN: 10985336
      DOI: 10.1128/AEM.01675-21.
      https://journals.asm.org/doi/10.1128/AEM.01675-21
      
      

    • Genomics and transcriptomics insights into luteolin effects on the beta-rhizobial strain Cupriavidus necator UYPR2.512 (Completo, 2021)

      Rodríguez-Esperón, M.C. , EASTMAN, G. , LAURA SANDES , Garabato F. , I. Eastman , IRIARTE A. , FABIANO, E. , SOTELO SILVEIRA, J. , RAÚL PLATERO
      Environmental Microbiology, 2021
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Papel
      E-ISSN: 14622920
      DOI: 10.1111/1462-2920.15845
      https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1462-2920.15845
      Cupriavidus necator UYPR2.512 is a rhizobial strain that belongs to the Beta-subclass of proteobacteria, able to establish successful symbiosis with Mimosoid legumes. The initial steps of rhizobium-legumes symbioses involve the reciprocal recognition by chemical signals, being luteolin one of the molecules involved. However, there is a lack of information on the effect of luteolin in beta-rhizobia. In this work, we used long-read sequencing to complete the genome of UYPR2.512 providing evidence for the existence of four closed circular replicons. We used an RNA-Seq approach to analyze the response of UYPR2.512 to luteolin. One hundred and forty-five genes were differentially expressed, with similar numbers of down- and up-regulated genes. Most repressed genes were mapped to the main chromosome, while the up-regulated genes were overrepresented among pCne512e, containing the symbiotic genes. Induced genes included the nod operon and genes implicated in exopolysaccharides and flagellar biosynthesis. We identified many genes involved in iron, copper, and other heavy metals metabolism. Among repressed genes, we identified genes involved in basal carbon and nitrogen metabolism. Our results suggest that in response to luteolin, C. necator strain UYPR2.512 reshapes its metabolism in order to be prepared for the forthcoming symbiotic interaction.
      
      

    • Genotyping and multivariate regression trees reveal ecological diversification within the Microcystis aeruginosa complex along a wide environmental gradient (Completo, 2021)

      Martínez de la Escalera, G. , SEGURA, A.M. , KRUK, C. , Ghattas B. , Cohan F. , IRIARTE A. , PICCINI, C.
      Applied and Environmental Microbiology, v.: 88 3 , 2021
      Palabras clave: ecotypes multivariate CART mcyJ Microcystis aeruginosa complex HRMA
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Otros
      E-ISSN: 10985336
      DOI: 10.1128/aem.01475-21
      https://journals.asm.org/doi/10.1128/aem.01475-21
      
      

    • Codon usage in the flatworm Schistosoma mansoni is shaped by the mutational bias towards A+T and translational selection, which increases GC-ending codons in highly expressed genes. (Completo, 2021)

      GUILLERMO LAMOLLE , IRIARTE A. , MUSTO H
      Molecular and Biochemical Parasitology, v.: 247 January 2022 , 2021
      Palabras clave: Flatworms Flukes Synonymous codon usage bias Composition bias Selection for translation Isochores Synonymous distance
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Parasitología
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 01666851
      DOI: doi.org/10.1016/j.molbiopara.2021.111445
      https://www.journals.elsevier.com/molecular-and-biochemical-parasitology
      Corresponding authors: airiarte@higiene.edu.uy (A. Iriarte) & hmusto@gmail.com (H. Musto).
      
      

    • Comparative genomics of Salmonella enterica serovar Enteritidis ST-11 isolated in Uruguay reveals lineages associated with particular epidemiological traits (Completo, 2020)

      D´ALESSANDRO, B. , V. PÉREZ , Balestrazzi L. , GRATTAROLA F. , IRIARTE A. , Picard D. , YIM, L , Chabalgoity, JA. , BETANCOR L
      Scientific Reports, v.: 10 3638, 2020
      Palabras clave: Phylogenetics Bacterial genomics
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Reino Unido
      E-ISSN: 20452322
      DOI: 10.1038/s41598-020-60502-8
      https://www.nature.com/srep/
      
      

    • Biogeography of the Cyanobacterium Raphidiopsis (Cylindrospermopsis) raciborskii: Integrating Genomics, Phylogenetic and Toxicity Data (Completo, 2020)

      Paula Vico , SYLVIA BONILLA , Cremella B. , AUBRIOT L , IRIARTE A. , PICCINI, C.
      Molecular Phylogenetics and Evolution, v.: 148 10682, 2020
      Palabras clave: Raphidiopsis (Cylindrospermopsis) raciborskii; Saxitoxin; PSPSxt cluster; Biogeography
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United States
      ISSN: 10557903
      E-ISSN: 10959513
      DOI: 10.1016/j.ympev.2020.106824
      https://www.sciencedirect.com/journal/molecular-phylogenetics-and-evolution
      Corresponding authors: Claudia Piccini & Andrés Iriarte.
      
      

    • SLFinder, a pipeline for the novel identification of splice-leader sequences: a good enough solution for a complex problem (Completo, 2020)Trabajo relevante

      JAVIER CALVELO , Hernán Juan , MUSTO H , URIEL KOZIOL , IRIARTE A.
      BMC Bioinformatics, 2020
      Palabras clave: SL trans-splicing De novo assembly RNAseq data
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Reino Unido
      E-ISSN: 14712105
      DOI: 10.1186/s12859-020-03610-6
      https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/
      Corresponding author: Andrés Iriarte
      
      

    • Transcriptomic analysis of eyelid pigmentation in Hereford cattle (Completo, 2020)

      JARA.E , FRANCISCO PEÑAGARICANO , Menezes C. , Tardiz L. , Rodons G. , IRIARTE A. , ARMSTRONG E
      Animal Genetics, v.: 51 6 , p.:935 - 939, 2020
      Palabras clave: gene expression ocular pathologies skin pigmentation
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 13652052
      DOI: 10.1111/age.13004
      https://onlinelibrary.wiley.com/journal/13652052
      
      

    • Proteomic analysis of plasma exosomes from Cystic Echinococcosis patients provides in vivo support for distinct immune response profiles in active vs inactive infection and suggests potential biomarkers. (Completo, 2020)

      FRATINI F. , Tamarozzi F. , Macchia G. , Mariconti M. , Birago C. , IRIARTE A. , Brunetti E. , Cretu C.M. , Akhan O. , Sile-Lucas M. , DÍAZ, A. , Casulli A.
      PLOS Neglected Tropical Diseases, 2020
      Palabras clave: Proteome human plasma exosomes cestodes echinococcus
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Estados Unidos
      ISSN: 19352727
      E-ISSN: 19352735
      DOI: 10.1371/journal.pntd.0008586
      https://journals.plos.org/plosntds/
      
      

    • Genomic analysis of two Acinetobacter baumannii strains belonging to two different STs (ST172 and ST25). (Completo, 2020)

      Montaña S. , Vilacoba E. , Fernandez J.S. , Traglia G.M. , Sucari A. , Pennini M. , IRIARTE A. , Centron D. , Melano R.G. , Ramírez M.S.
      Journal of global antimicrobial resistance, v.: 23 p.:154 - 161, 2020
      Palabras clave: Genomic analysis pathogenesis Acinetobacter baumannii Sequence type
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 22137173
      DOI: 10.1016/j.jgar.2020.09.006.
      https://www.journals.elsevier.com/journal-of-global-antimicrobial-resistance
      
      

    • Interspecies DNA acquisition by a naturally competent Acinetobacter baumannii strain (Completo, 2019)

      Traglia G , Place K. , Dotto C. , Fernandez J.S. , Montaña S. , dos Santos Bahiense C. , Soler-Bistue A. , IRIARTE A. , Perez F. , Tolmasky M.E. , Bonomo R.A. , Melano R.G. , Ramirez M.S.
      International Journal of Antimicrobial Agents, v.: 53 4 , p.:483 - 490, 2019
      Palabras clave: natural transformation Acinetobacter baumannii Klebsiella pneumoniae 27 antibiotic resistance.
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica Comparativa
      Medio de divulgación: Otros
      ISSN: 09248579
      DOI: 10.1016/j.ijantimicag.2018.12.013
      https://www.journals.elsevier.com/international-journal-of-antimicrobial-agents
      
      

    • Draft Genome Sequence of Paraburkholderia sp. UYCP14C, a Rhizobium Strain Isolated from Root Nodules of Calliandra parvifolia (Completo, 2019)

      LANGLEIB M. , MARTI­N BERACOCHEA , ZABALETA, MARÍA , BATTISTONI F. , SOTELO-SILVEIRA J. , FABIANO, E. , IRIARTE A. , RAÚL PLATERO
      Genome Announcements, v.: 8 16 e0017, 2019
      Palabras clave: Rhizobio Genome
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 21698287
      DOI: 10.1128/MRA.00173-19
      https://mra.asm.org/
      
      

    • Nesterenkonia natronophila sp. nov., an alkaliphilic actinobacterium isolated from a soda lake, and emended description of the genus Nesterenkonia. (Completo, 2019)

      MACHIN, E. V. , Devi Asem M. , Salam N. , IRIARTE A. , LANGLEIB, M. , Li W. , MENES, R. J.
      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2019
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 14665026
      E-ISSN: 14665034
      DOI: 10.1099/ijsem.0.003409
      https://ijs.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem
      
      

    • ICE SXT vs. ICESh95: Co-existence of Integrative and Conjugative Elements and Competition for a New Host. (Completo, 2019)

      Parmeciano Di Noto G. , IRIARTE A. , Ramírez M.S. , Centrón D. , Quiroga C.
      Scientific Reports, v.: 9 8045 (2019) , 2019
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica Comparativa
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 20452322
      DOI: 10.1038/s41598-019-44312-1
      https://www.nature.com/srep/
      
      

    • Genetic and Phenotypic Features of a Novel Acinetobacter Species, Strain A47, Isolated from the Clinical Setting (Completo, 2019)

      Schramm S. , Place K. , Montaña S. , Almuzara M. , Fung S. , Fernandez J.S. , Tuttobene M.R. , Golic A. , Altilio M. , Traglia G.M. , Vay C. , Mussi M.A. , IRIARTE A. , Ramirez M.S.
      Frontiers in Microbiology, 2019
      Palabras clave: Acinetobacter spp. biofilm antibiotic resistance virulence traits biofilm natural transformation Biofilm Antibiotc resistance Acinetobacter
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica Comparativa
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 1664302X
      DOI: 10.3389/fmicb.2019.01375
      https://www.frontiersin.org/journals/microbiology
      
      

    • Small Klebsiella pneumoniae Plasmids: Neglected Contributors to Antibiotic Resistance (Completo, 2019)

      Ramírez M.S. , IRIARTE A. , Reyes R. , Sherratt D.J. , Tolmasky M.
      Frontiers in Microbiology, v.: 10 2182 , 2019
      Palabras clave: Transposon integron Plasmid ESKAPE Klebsiella multidrug resistance
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 1664302X
      https://www.frontiersin.org/journals/microbiology
      
      

    • Bacillus natronophilus sp. nov., an alkaliphilic bacterium isolated from a soda lake (Completo, 2019)

      MENES, R. J. , MACHIN, E. V. , IRIARTE A. , LANGLEIB, M.
      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v.: 70 1 , p.:562 - 568, 2019
      Palabras clave: Bacillus natronophilus sp. nov. alkaliphile moderately halophilic soda lake
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Reino Unido
      ISSN: 14665026
      E-ISSN: 14665034
      DOI: 10.1099/ijsem.0.003792
      https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem
      
      

    • A pair of nonoptimal codons are necessary for the correct biosynthesis of the Aspergillus nidulans urea transporter, UreA (Completo, 2019)

      SANGUINETTI, M , IRIARTE A. , Amillis S. , MARIN, M. , MUSTO H , RAMON, A.
      Royal Society Open Science, v.: 6 11 , 2019
      Palabras clave: urea membrane transporter Aspergillus nidulans codon bias
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Reino Unido
      E-ISSN: 20545703
      DOI: 10.1098/rsos.190773
      https://royalsocietypublishing.org/journal/rsos
      
      

    • Plasmidome of a multiresistant Salmonella enterica serovar Typhimurium isolate from Uruguay (Completo, 2019)

      CORDEIRO N , IRIARTE A. , YIM, L , BETANCOR L , Chabalgoity, JA. , Camou T. , VIGNOLI R
      Journal of Global Antimicrobial Resistance, v.: 20 p.:84 - 86, 2019
      Palabras clave: plasmid genome sequence
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Reino Unido
      ISSN: 22137165
      DOI: 10.1016/j.jgar.2019.11.019
      https://www.sciencedirect.com/journal/journal-of-global-antimicrobial-resistance
      
      

    • A novel prophage identified in strains from Salmonella enterica serovar Enteritidis is a phylogenetic signature of the lineage ST-1974. (Completo, 2018)

      D´ALESSANDRO, B. , V. PÉREZ , BALESTRAZZI L. , IRIARTE A. , Pickard D. , YIM L. , Chabalgoity, JA. , BETANCOR L
      Microbial Genomics, v.: 4 2018
      Palabras clave: prophages lineages Salmonella
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United Kindom
      E-ISSN: 20575858
      DOI: 10.1099/mgen.0.000161
      http://mgen.microbiologyresearch.org/
      
      

    • Genomic insights into the broad antifungal activity, plant-probiotic properties, and their regulation, in Pseudomonas donghuensis strain SVBP6 (Completo, 2018)

      Agaras B. , IRIARTE A. , Claudio Valverde
      PLoS ONE, p.:1 - 32, 2018
      Palabras clave: Plant growth promotion Argentinean isolate rhizospheres
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 19326203
      DOI: 10.1371/journal.pone.0194088
      journals.plos.org/plosone/
      http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0194088
      
      

    • EXPANSION OF CAP SUPERFAMILY PROTEINS IN THE GENOME OF MESOCESTOIDES CORTI: AN EXTREME CASE OF A GENERAL BILATERIAN TREND (Completo, 2018)

      COSTÁBILE, A , URIEL KOZIOL , TORT, J F , IRIARTE A. , CASTILLO, E.
      Gene Reports, v.: 11 p.:110 - 120, 2018
      Palabras clave: secreted proteins cestode genomic data ?birth and death? mechanism
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Genómica evolutiva
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 24520144
      DOI: 10.1016/j.genrep.2018.03.010
      https://www.sciencedirect.com/journal/gene-reports
      Corresponding authors: Estela Castillo: castillo@fcien.edu.uy & Andrés Iriarte: airiarte@higiene.edu.uy.
      
      

    • Whole genome analysis of an extensively-drug-resistance Empedobacter falsenii strain reveals distinct features and the presence of a novel metallo-ß-lactamase (EBR-2) (Completo, 2018)

      Collins C. , Almuzara M. , Saigo M. , Montaña S. , Chiem K. , Traglia G. , Mussi M.A. , Tolmasky M. , IRIARTE A. , Vay C. , RAMIREZ M.S.
      Current Microbiology, v.: 75 8, p.:1084 - 1089, 2018
      Palabras clave: metallo-?-lactamase Empedobacter spp. nosocomial pathogen antimicrobial resistant
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 03438651
      E-ISSN: 14320991
      DOI: doi.org/10.1007/s00284-018-1498-9
      https://link.springer.com/journal/284
      
      

    • Temporal evolution of anti-Clostridium antibody responses in sheep after vaccination with polyvalent Clostridial vaccines. (Completo, 2018)

      ROSSI, A , MÓNACO, A. , Guarnaschelli J. , FERNANDO SILVEIRA , IRIARTE A. , Benecke A.G. , Chabalgoity, JA.
      Veterinary Immunology and Immunopathology, v.: 202 p.:46 - 51, 2018
      Palabras clave: Antibodies Clostridium Vaccines Duration of immunity Sheep
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Ciencias Agrícolas / Biotecnología Agropecuaria / Biotecnología Agrícola y Biotecnología Alimentaria /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 01652427
      DOI: doi.org/10.1016/j.vetimm.2018.06.010
      https://www.journals.elsevier.com/veterinary-immunology-and-immunopathology
      
      

    • Molecular Characterization of KPC-2 positive Klebsiella pneumoniae isolates from a neurosurgical center in Argentina (Completo, 2018)

      Montaña S. , Hernandez M. , Fernandez J.S. , Pennini M. , Centrón D. , Sucari A. , IRIARTE A. , Ramírez M.S.
      New Microbes and New Infections, v.: 24 p.:32 - 34, 2018
      Palabras clave: Klebsiella pneumoniae carbapenem resistance blaKPC-2 neurosurgical center
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 20522975
      DOI: doi.org/10.1016/j.nmni.2018.04.002
      https://www.journals.elsevier.com/new-microbes-and-new-infections
      
      

    • Genomics helps deciphering the resistance mechanisms of a rare pneumonia causing Pseudomonas chlororaphis strain (Completo, 2018)

      Montaña S. , Lazzaro T. , Uong S. , Place K. , IRIARTE A. , Ocampo Verca C. , Vay C. , Ramírez M.S.
      New Microbes and New Infections, 2018
      Palabras clave: Pseudomonas MBL carbepenem-resistance
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 20522975
      DOI: doi.org/10.1016/j.nmni.2018.07.002
      https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2052297518300581
      
      

    • Comparison of transcriptomic landscapes of different lamb muscles using RNA-Seq (Completo, 2018)

      ARMSTRONG E , IRIARTE A. , PAULA NICOLINI , De los Santos J. , Ithurralde J. , BIELLI, A. , Bianchi G. , FRANCISCO PEÑAGARICANO
      PLoS ONE, 2018
      Palabras clave: lamb meat ovine muscle quality traits transcriptome
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Agrícolas / Producción Animal y Lechería / Ciencia Animal y Lechería /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 19326203
      DOI: 10.1371/journal.pone.0200732
      https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0200732
      
      

    • Analysis of classical neurotransmitter markers in tapeworms: evidence for extensive loss of neurotransmitter pathways (Completo, 2018)

      Preza M. , Montagne J. , COSTÁBILE, A , IRIARTE A. , CASTILLO, E. , URIEL KOZIOL
      International Journal for Parasitology, 2018
      Palabras clave: Neurotransmitter Cestode Trematode Monogenean Planarian Neuropeptide F
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Parasitología
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00207519
      DOI: 10.1016/j.ijpara.2018.06.004
      
      

    • Draft Genome Sequences of Two Multidrug-Resistant Salmonella enterica Serovar Typhimurium Clinical Isolates from Uruguay (Completo, 2018)

      Cordeiro N.F. , D?Alessandro B. , IRIARTE A. , Pickard D. , Yim L. , Chabalgoity J.A. , Betancor L. , Vignoli R.
      Microbiology Resource Announcements, v.: 7:e00917-18 2018
      Palabras clave: Enterobacteria Genome Sequence
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 2576098X
      DOI: 10.1128/MRA.00917-18
      https://mra.asm.org/
      
      

    • Whole-genome analysis and description of an outbreak due to carbapenem-resistant Ochrobactrum anthropi causing pseudo-bacteremias (Completo, 2018)

      Montaña S. , Fernandez J.S. , Barenboim M. , Hernandez M. , IRIARTE A. , Kayriyama C. , Carulla M. , Ramirez M.S. , Almuzara M.
      New Microbes and New Infections, 2018
      Palabras clave: Ochrobactrum antrophi pseudo-outbreak carbapenem-resistant
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 20522975
      DOI: doi.org/10.1016/j.nmni.2018.09.002
      https://www.journals.elsevier.com/new-microbes-and-new-infections
      
      

    • Human serum albumin alters specific genes that can play a role in survival and persistence in Acinetobacter baumannii (Completo, 2018)

      Quinn B. , Rodman N. , Jara E. , Fernandez J.S. , Martinez J. , Traglia G.M. , Montaña S. , Cantera V. , Place K. , Bonomo R. , IRIARTE A. , Ramirez M.S.
      Scientific Reports, 2018
      Palabras clave: Acinetobacter baumannii human serum albumin (HSA) antibiotic resistance biofilm persistence survival metabolism transcriptomic analysis
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 20452322
      DOI: I:10.1038/s41598-018-33072-z
      https://www.nature.com/articles/s41598-018-33072-z
      
      

    • Genome sequence analysis of an extensively drug-resistant Acinetobacter baumannii indigo-pigmented strain depicts evidence of increase genome plasticity (Completo, 2018)

      Traglia G. , Chiem K. , Quinn B. , Fernandez J.S. , Montaña S. , Almuzara M. , Mussi M.A. , Tolmasky M. , IRIARTE A. , Centrón D. , Ramírez M.S.
      Scientific Reports, v.: 8 16961 (2018) , 2018
      Palabras clave: Acinetobacter baumannii antibiotic resistance sequence genome indigo pigment
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Enfermedades Infecciosas / Genómica Microbiana
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 20452322
      DOI: 10.1038/s41598-018-35377-5
      https://www.nature.com/srep/
      
      

    • Draft Genome Sequence of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Infantis Strain SPE101, Isolated from a Chronic Human Infection (Completo, 2017)

      IRIARTE A. , GINER-LAMIA J. , SILVA C. , BETANCOR L. , ASTOCONDOR L. , CESTERO J.J. , OCHOA T. , GARCíA C. , PUENTE J.L. , CHABALGOITY J.A. , GARCíA-DEL PORTILLO F.
      Genome Announcements, 2017
      Palabras clave: annotation assembly
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 21698287
      DOI: 10.1128/genomeA.00679-17
      http://genomea.asm.org/
      http://genomea.asm.org/content/5/29/e00679-17.abstract
      
      

    • Genetic analysis of a PER-2 producing Shewanella spp. strain harboring a variety of mobile genetic elements and antibiotic resistant determinants (Completo, 2017)

      ALMUZARA M. , MONTAñA S. , LAZZARO T. , UONG S. , PARMECIANO G. , TRAGLIA G. , BAKAI R. , CENTRON D. , IRIARTE A. , QUIROGA C. , RAMIREZ M.S.
      Journal of Global Antimicrobial Resistance, v.: 11 p.:81 - 86, 2017
      Palabras clave: Antibiotic resistance uncommon pathogen
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 22137165
      DOI: 10.1016/j.jgar.2017.06.005
      Journal of Global Antimicrobial Resistance (JGAR)
      
      

    • A Naturally Occurring Deletion in FliE from Salmonella enterica Serovar Dublin Results in an Aflagellate Phenotype and Defective Proinflammatory Properties. (Completo, 2017)

      SASÍAS M., S. , Martínez, A , BETANCOR L , Martinez A. , Bruno D'Alessandro , IRIARTE A. , Chabalgoity, JA. , Yim L.
      Infection and Immunity, v.: 86 1 e0051, 2017
      Palabras clave: aflagellate strains FliA-anti-Sigma factor revertants in-frame 42-nucleotide-deletion
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Estados Unidos
      ISSN: 00199567
      E-ISSN: 10985522
      DOI: 0.1128/IAI.00517-17
      http://iai.asm.org/
      
      

    • The complex pattern of codon usage evolution in the family Comamonadaceae (Completo, 2017)

      JARA.E , MOREL, M.A. , Lamolle G. , CASTRO SOWINSKI, S , Simón D. , IRIARTE A. , MUSTO H
      Ecological Genetics and Genomics, v.: 6 p.:1 - 8, 2017
      Palabras clave: Translational selection Optimal codons Codon bias Synonymous divergence Betaproteobacteria
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica y Transcriptómica bacteriana, Evolución molecular
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 24059854
      DOI: doi.org/10.1016/j.egg.2017.11.002
      https://www.journals.elsevier.com/ecological-genetics-and-genomics
      Musto & Iriarte son ambos autores de correspondencia
      
      

    • An isochore-like structure in the genome of the flatworm Schistosoma mansoni (Completo, 2016)

      LAMOLLE G. , PROTASIO A.V. , IRIARTE A. , JARA E. , SIMóN D. , MUSTO H.
      Genome Biology and Evolution, v.: 8 8 , p.:2312 - 2318, 2016
      Palabras clave: Platyhelminthes
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Genómica
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Oxford, UK
      E-ISSN: 17596653
      http://gbe.oxfordjournals.org/
      
      

    • Draft genome of Shewanella frigidimarina Ag06-30, a marine bacterium isolated from Potter Peninsula, King George Island, Antarctica (Completo, 2016)

      PARMECIANO G. , VáZQUEZ S. , MAC CORMACK W. , IRIARTE A. , QUIROGA C.
      Genome Announcements, v.: 4 3 e00289-16, 2016
      Palabras clave: Alteromonadales Bacterias antarticas
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 21698287
      http://genomea.asm.org/
      
      

    • Novel Cupriavidus strains isolated from root nodules of native Uruguayan Mimosa species (Completo, 2016)

      PLATERO R. , JAMES EK , RíOS C. , SANDES L. , IRIARTE A. , ZABALETA M. , BATTISTONI F. , FABIANO E.
      Applied and Environmental Microbiology, v.: 82 11 , p.:3150 - 3164, 2016
      Palabras clave: Rhizobium Host-Microbial Interactions
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Estados Unidos
      ISSN: 00992240
      E-ISSN: 10985336
      http://aem.asm.org/
      
      

    • Revealing the biotechnological potential of Delftia sp. JD2 by a genomic approach (Completo, 2016)

      MOREL M.A. , IRIARTE A. , JARA E. , MUSTO H. , CASTRO-SOWINSKI, S.
      AIMS Quarterly Journal, v.: 3 2 , p.:156 - 175, 2016
      Palabras clave: Delftia; plant-growth promotion; bioremediation comparative genomic; plant-microbe interaction
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica Comparativa
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: AIMS
      ISSN: 02655004
      DOI: 10.3934/bioeng.2016.2.156
      http://www.aimspress.com/journal/Bioengineering
      AIMS Bioengineering (ISSN(Online):2375-1495)
      
      

    • Genome analysis of a clinical isolate of Shewanella sp. uncovered an active hybrid integrative and conjugative element (ICE) carrying an integron platform inserted in a novel genomic locus. (Completo, 2016)

      PARMECIANO G. , JARA E. , IRIARTE A. , CENTRON D. , QUIROGA C.
      Microbiology, v.: 162 8 , p.:1335 - 1345, 2016
      Palabras clave: integrative conjugative element horizontal transfer event antimicrobial resistance
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica Comparativa
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: UK
      ISSN: 13500872
      E-ISSN: 14652080
      http://www.microbiologyresearch.org/
      
      

    • The genetic analysis of a Acinetobacter johnsonii clinical strain evidenced the presence of horizontal genetic transfer (Completo, 2016)

      MONTAñA S. , SCHRAMM S.T.J. , TRAGLIA G.M. , CHIEM K. , PARMECIANO G. , ALMUZARA M. , BARBERIS C. , VAY C. , QUIROGA C. , TOLMASKY M. , IRIARTE A. , RAMIREZ M.S.
      PLoS ONE, v.: 11 08 e0161528, 2016
      Palabras clave: Acinetobacter, HGT, mobile elements transposon, Oxacillinase, resistance traits
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 19326203
      http://journals.plos.org/plosone/
      
      

    • Draft Genome Sequence of Cupriavidus UYMMa02A, a novel Beta-rhizobium species (Completo, 2016)

      IRIARTE A. , PLATERO R. , ROMERO V. , FABIANO E. , SOTELO-SILVEIRA J.
      Genome Announcements, 2016
      Palabras clave: Nodulation Nitrogen Fixation Genome
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 21698287
      DOI: 10.1128/genomeA.01258-16
      http://genomea.asm.org/
      http://genomea.asm.org/content/4/6/e01258-16?related-urls=yes&legid=ga;4/6/e01258-16
      
      

    • The use of next-generation molecular tools in the analysis of archaeological neotropical deer samples (Completo, 2016)

      MORENO F. , FIGUEIRO G. , MANNISE N. , IRIARTE A. , GONZáLEZ S. , BARBANTI DUARTE J.M. , COSSE M.
      Journal of Archaeological Science Reports, v.: 10 p.:403 - 410, 2016
      Palabras clave: Ancient DNA Cervidae deer management Uruguayan lowlands
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 2352409X
      http://www.journals.elsevier.com/journal-of-archaeological-science-reports/
      
      

    • Draft Genome Sequence of Empedobacter falsenii comb. nov. (ex- Wautersiella falsenii) Wf282, a strain isolated from a cervical neck abscess (Completo, 2015)

      TRAGLIA G. , DIXON C. , CHIEM K. , ALMUZARA M. , BARBERIS C. , MONTAñA S. , MERINO C. , MUSSI M. , TOLMASKY M. , IRIARTE A. , VAY C. , RAMIREZ M.S.
      Genome Announcements, v.: 3 2 , 2015
      Palabras clave: antibiotic resistance Empedobacter carbapenems pathogen
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Estados Unidos
      E-ISSN: 21698287
      http://genomea.asm.org/
      
      

    • Characterizing proteases in an Antarctic Janthinobacterium sp. isolate. Evidence of a protease horizontal gene transfer event (Completo, 2015)

      MARTÍNEZ-ROSALES C. , MARIZCURRENA J.J. , IRIARTE A. , FULLANA N. , HÉCTOR ROMERO , CASTRO-SOWINSKI, S.
      ADVANCES IN POLAR SCIENCE, v.: 26 p.:88 - 95, 2015
      Palabras clave: Antarctic cold-active protease horizontal gene transfer Janthinobacterium subtilisin
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: China
      ISSN: 16749928
      http://journal.polar.org.cn/EN/volumn/current.shtml
      C. Martinez-Rosales, J.J. Marizcurrena and A. Iriarte equally contributed to this work
      
      

    • Draft genome sequence of taxonomically unique Acinetobacter clinical strain with proteolytic and hemolytic activities (Completo, 2015)

      TRAGLIA G. , ALMUZARA M. , BARBERIS C. , MONTANIA S. , SCHRAMM S.T.J. , ENRIQUEZ B. , MUSSI M. , VAY C. , IRIARTE A. , RAMIREZ M.S.
      Genome Announcements, v.: 5 3 2, 2015
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Estados Unidos
      E-ISSN: 21698287
      DOI: 10.1128/genomeA.00030-15
      http://genomea.asm.org/
      
      

    • Conservation of CFTR codon frequency through Primates suggests synonymous mutations could have a functional effect (Completo, 2015)

      PIZZO L. , IRIARTE A. , ALVAREZ-VALIN F. , MARÍN M.
      Mutation Research: Fundamental And Molecular Mechanisms Of Mutagenesis, v.: 775 p.:19 - 25, 2015
      Palabras clave: CFTR synonymous mutations codon frequency conservation Cystic fibrosis
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 13861964
      E-ISSN: 1873135X
      http://www.journals.elsevier.com/mutation-research-fundamental-and-molecular-mechanisms-of-mutagenes
      Pizzo L. and Iriarte A. contributed equally to this work.
      
      

    • Est10: a novel alkaline esterase isolated from bovine rumen belonging to the new family XV of lipolytic enzymes (Completo, 2015)

      RODRíGUEZ M. C. , LOACES I. , AMARELLE V. , SENATORE D. , IRIARTE A. , FABIANO E. , NOYA F.
      PLoS ONE, p.:1 - 16, 2015
      Palabras clave: esterases rumen metagenomics
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 19326203
      DOI: 10.1371/journal.pone.0126651
      http://www.plosone.org/
      
      

    • Trends in amino acid usage across the Class Mollicutes (Completo, 2014)

      IRIARTE A. , BARAIBAR J. D. , DIANA L. , CASTRO-SOWINSKI, S. , ROMERO H. , MUSTO H.
      Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, v.: 32 1 , p.:65 - 74, 2014
      Palabras clave: Mycoplasma Complete genome amino acid usage highly expressed genes evolution
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias / Microbiología - Genómica
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Estados Unidos
      ISSN: 07391102
      E-ISSN: 15380254
      DOI: 10.1080/07391102.2012.748636
      http://www.jbsdonline.com
      
      

    • General trends in selectively codon usage biases in the domain Archaea (Completo, 2014)

      IRIARTE A. , JARA E. , LEYTóN L. , DIANA L. , MUSTO H.
      Journal of Molecular Evolution, v.: 79 3 4, p.:105 - 110, 2014
      Palabras clave: Selección en la traducción uso de codones sinónimos
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Estados Unidos
      ISSN: 00222844
      E-ISSN: 14321432
      DOI: 10.1007/s00239-014-9647-7
      http://link.springer.com/journal/239
      
      

    • Draft Genome Sequence of an of extensively drug-resistant Acinetobacter baumannii indigo-pigmented strain (Completo, 2014)

      TRAGLIA G.M. , VILACOBA E. , ALMUZARA M.N. , DIANA L. , IRIARTE A. , CENTRON D. , RAMIREZ M.S.
      Genome Announcements, v.: 2 6 , 2014
      Palabras clave: antibiotic resistance sequence genomes genome analysis
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Estados Unidos
      E-ISSN: 21698287
      http://genomea.asm.org/
      
      

    • Three crocodilian genomes reveal ancestral patterns of evolution among archosaurs (Completo, 2014)

      GREEN RE , BRAUN EL , ARMSTRONG J , EARL D. , NGUYEN N. , HICKEY G. , VANDEWEGE M.W. , ST. JOHN J.A. , CAPELLA-GUTIéRREZ S. , CASTOE T.A. , KERN C. , FUJITA M.K. , OPAZO J.C. , JURKA J. , KOJIMA K.K. , CABALLERO J. , HUBLEY R.M. , SMIT A.F. , PLATT R.N. , LAVOIE C.A. , RAMAKODI M.P. , FINGER JR. J. W. , SUH A. , ISBERG S.R. , MILES L. , CHONG A.Y. , JARATLERDSIRI W. , GONGORA J. , MORAN C. , IRIARTE A. , MCCORMACK J. , BURGESS S.C. , EDWARDS S.V. , LYONS E. , WILLIAMS C. , BREEN M. , HOWARD J.T. , GRESHAM C.R. , PETERSON D.G. , SCHMITZ J. , POLLOCK D.D. , HAUSSLER D. , TRIPLETT E.W. , ZHANG G. , IRIE N. , JARVIS E.D. , BROCHU C.A. , SCHMIDT C.J. , MCCARTHY F.M. , FAIRCLOTH B.C. , HOFFMANN F.G. , GLENN T.C. , GABALDóN T. , PATEN B. , RAY D.A.
      Science, v.: 346 6215 , p.:1335 - 1254449, 2014
      Palabras clave: genome evolution Reptiles and birds Phylogeny
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica Comparativa y Evolutiva
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Estados Unidos
      ISSN: 00368075
      E-ISSN: 10959203
      DOI: 10.1126/science.1254449
      http://www.sciencemag.org/content/346/6215/1254449.full
      To provide context for the diversification of archosaurs—the group that includes crocodilians, dinosaurs, and birds—we generated draft genomes of three crocodilians: Alligator mississippiensis (the American alligator), Crocodylus porosus (the saltwater crocodile), and Gavialis gangeticus (the Indian gharial). We observed an exceptionally slow rate of genome evolution within crocodilians at all levels, including nucleotide substitutions, indels, transposable element content and movement, gene family evolution, and chromosomal synteny. When placed within the context of related taxa including birds and turtles, this suggests that the common ancestor of all of these taxa also exhibited slow genome evolution and that the comparatively rapid evolution is derived in birds.The data also provided the opportunity to analyze heterozygosity in crocodilians, which indicates a likely reduction in population size for all three taxa through the Pleistocene. Finally, these data combined with newly published bird genomes allowed us to reconstruct the partial genome of the common ancestor of archosaurs, thereby providing a tool to investigate the genetic starting material of crocodilians, birds, and dinosaurs.
      
      

    • Genetic diversity analysis of the Uruguayan Creole cattle breed using microsatellites and mtDNA markers (Completo, 2013)

      ARMSTRONG E. , IRIARTE A. , MARTÍNEZ A. M. , FEIJOO M. , VEGA-PLA J. L. , DELGADO J. V. , POSTIGLIONI A.
      Genetics and Molecular Research, v.: 12 2 , p.:1119 - 1131, 2013
      Palabras clave: Creole cattle breeds population analysis molecular markers
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genética de Poblaciones
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Conservación de Recursos Zoogenéticos
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Brasil
      E-ISSN: 16765680
      http://geneticsmr.com/
      Primer y el Segundo autor contribuyeron de igual manera en la realización del trabajo.
      
      

    • Evolution of optimal codon choices in the family Enterobacteriaceae (Completo, 2013)Trabajo relevante

      IRIARTE A. , J.D. BARAIBAR , ROMERO H. , CASTRO-SOWINSKI, S. , MUSTO H.
      Microbiology, v.: 159 p.:555 - 564, 2013
      Palabras clave: tRNA content enteric bacteria optimal codons choices selection on translation protein conserved regions
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: UK
      ISSN: 13500872
      E-ISSN: 14652080
      http://mic.sgmjournals.org/
      
      

    • A detailed comparative analysis on the overall codon usage patterns in West Nile Virus (Completo, 2013)

      MORATORIO G. , IRIARTE A. , MORENO P. , MUSTO H. , CRISTINA J.
      Infection Genetics and Evolution, v.: 14 p.:396 - 400, 2013
      Palabras clave: codon usage evolution West Nile Virus
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología /
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Netherlands
      ISSN: 15671348
      http://www.journals.elsevier.com/infection-genetics-and-evolution/
      Primer y el Segundo autor contribuyeron de igual manera en la realización del trabajo
      
      

    • Translational selection on codon usage in the genus Aspergillus (Completo, 2012)

      IRIARTE A. , SANGUINETTI M. , FERNÁNDEZ-CALERO T. , NAYA H. , RAMÓN A. , MUSTO H.
      Gene, v.: 506 p.:98 - 105, 2012
      Palabras clave: Optimal codons tRNA content Aspergilli Neosartorya
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Micología / Genómica
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / uso de codones sinónimos
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Holanda
      ISSN: 03781119
      http://www.journals.elsevier.com/gene/
      
      

    • Identification of novel glutathione transferases in Echinococcus granulosus. An evolutionary perspective. (Completo, 2012)

      IRIARTE A. , ARBILDI P. , LA-ROCCA S. , MUSTO H. , FERNÁNDEZ V.
      Acta Tropica, v.: 123 p.:208 - 216, 2012
      Palabras clave: glutathione transferase Family Taeniidae Gene family
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Zoología, Ornitología, Entomología, Etología / Parasitología
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 0001706X
      http://www.journals.elsevier.com/acta-tropica/
      
      

    • Pandemic influenza A virus codon usage revisited: biases, adaptation and implications for vaccine strain development. (Completo, 2012)

      GOÑI N. , IRIARTE A. , COMAS V. , SOÑORA M. , MORENO P. , MORATORIO G. , MUSTO H. , CRISTINA J.
      Virology Journal, v.: 9 p.:263 2012
      Palabras clave: codon usage evolution Influenza A virus
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología /
      Medio de divulgación: Papel
      E-ISSN: 1743422X
      DOI: 10.1186/1743-422X-9-263
      http://www.virologyj.com
      Primer y el segundo autor contribuyeron de igual manera en la realización del trabajo.
      
      

    • Variability of UL49 in bovine herpesvirus type 1 (BoHV-1) from Uruguayan isolates. (Completo, 2012)

      PUENTES, R. , LLAMBÍ S. , IRIARTE A. , FURTADO, A. , FRANCO, G. , MAISONNAVE, J. , CRISTINA J. , MURAKAMI, K. , ESTEVES, PA.
      InVet, 2012
      Palabras clave: UL49 variability BoHV isolates
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología /
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Argentina
      ISSN: 15146634
      E-ISSN: 16683498
      http://www.scielo.org.ar/scielo.php/script_sci_serial/pid_1668-3498/lng_es/nrm_iso
      
      

    • Selective codon usage bias in members of the class Mollicutes (Completo, 2011)Trabajo relevante

      IRIARTE A. , BARAIBAR J. , ROMERO H. , MUSTO H.
      Gene, v.: 473 p.:110 - 118, 2011
      Palabras clave: Mycoplasma Optimal codons tRNA content Complete Genomes
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias / Genómica
      Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias / Microbiología
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 03781119
      DOI: 10.1016/j.gene.2010.11.010
      http://www.elsevier.com/wps/find/journaldescription.cws_home/506033/description#description
      
      

    • Resecuenciación y análisis bioinformático de una región del gen trofinina (BTA Xq25-33) en bovinos (Resumen, 2011)

      LLAMBÍ S. , IRIARTE A. , GAGLIARDI R. , MONTENEGRO M.
      Journal of Basic and Applied Genetics, v.: 2 1 , p.:69 - 69, 2011
      Palabras clave: fragilidad cromosómica
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Argentina
      E-ISSN: 18526233
      http://www.sag.org.ar
      
      

    • Developmental expression of high molecular weight tropomyosin isoforms in Mesocestoides corti (Completo, 2010)

      KOZIOL U. , COSTÁBILE A. , DOMÍNGUEZ M.F. , IRIARTE A. , ALVITE G. , KUN A. , CASTILLO E.
      Molecular and Biochemical Parasitology, v.: 175 p.:181 - 191, 2010
      Palabras clave: Mesocestoides tropomyosin alternative splicing development muscle
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología del Desarrollo /
      Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias / Genómica
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 01666851
      DOI: 10.1016/j.molbiopara.2010.11.009
      http://www.elsevier.com/wps/find/journaldescription.cws_home/506086/description
      
      

    • Characterization of a putative hsp70 pseudogene transcribed in protoscoleces and adult worms of Echinococcus granulosus (Completo, 2009)Trabajo relevante

      KOZIOL U. , IRIARTE A. , CASTILLO E. , SOTO J. , BELLO G. , CAJARVILLE A. , ROCHE L. , MARÍN M.
      Gene, v.: 443 p.:1 - 11, 2009
      Palabras clave: Echinococcus hsp70 Pseudogene Genomic duplication
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 03781119
      DOI: 10.1016
      www.elsevier.com/locate/gene
      *1er y 2do autor contribuyeron igualmente al trabajo
      
      

    • Effects of 5-azacytidine on lymphocyte-metaphases of Creole cows 3 carrying the rob(1;29) (Completo, 2009)

      ARTIGAS R. , IRIARTE W. , IRIARTE A. , DE BETHENCOURT M. , LLAMBÍ S. , POSTIGLIONI A.
      Research in Veterinary Science, v.: 88 p.:263 - 266, 2009
      Palabras clave: 5-aza-C Rob(1;29) Decondensation Methylation
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Citogenética
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00345288
      DOI: 10.1016/j.rvsc.2009.10.004
      www.elsevier.com/locate/rvsc
      
      

    • Aphidicolin induced break points in heterozygous Robertsonian translocation (rob1;29) in Creole cattle. (Completo, 2008)

      ARTIGAS R. , IRIARTE A. , LLAMBÍ S. , DE BETHENCOURT M. , POSTIGLIONI A.
      Journal of Basic and Applied Genetics, v.: 19 1 , p.:1 - 10, 2008
      Palabras clave: Uruguayan Creole cattle rob(1;29) break point Aphidicolin
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Citogenética
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Sociedad Argentina de Genética
      ISSN: 16660390
      E-ISSN: 18526233
      http://www.sag.org.ar/06_1revista.htm
      
      

    • Descondensación de la heterocromatina en bovinos criollos portadores de la translocación Robertsoniana (Rob 1;29). Acción del inductor 5-azacitidina-C. (Completo, 2008)

      ARTIGAS R. , IRIARTE W. , DE SOTO L. , IRIARTE A. , LLAMBÍ S. , DE BETHENCOURT M. , POSTIGLIONI A.
      Acta Agronómica, v.: 57 1 , p.:65 - 69, 2008
      Palabras clave: 5-azacitidina-C Descondensación Rob 1;29 bovinos criollos
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Citogenética
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Colombia
      ISSN: 01202812
      E-ISSN: 23230118
      http://www.revistas.unal.edu.co/index.php/acta_agronomica
      
      

    • Acción de la Afidicolina sobre la translocación Robertsoniana ROB (1;29) en Bovinos Criollos del Uruguay. (Resumen, 2006)

      ARTIGAS R. , IRIARTE A. , TELLECHEA B. , POSTIGLIONI A. , LLAMBÍ S. , DE BETHENCOURT M.
      Journal of Basic and Applied Genetics, v.: 17 2 , p.:116 - 116, 2006
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Citogenética
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Argentina
      ISSN: 16660390
      E-ISSN: 18526233
      www.sag.org.ar/06_1revista.htm
      
      

    • Estudio de polimorfismos del receptor de la hormona estimulante de melanocitos (MC1R) y su relación con el cáncer de ojo en Ganado Hereford. (Resumen, 2006)

      DI MAURO M.J. , ARMSTRONG E. , IRIARTE A. , POSTIGLIONI A.
      Journal of Basic and Applied Genetics, v.: 17 2 , p.:165 - 165, 2006
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Molecular Aplicada
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Argentina
      ISSN: 16660390
      E-ISSN: 18526233
      www.sag.org.ar/06_1revista.htm
      
      

• Artículos aceptados

  • Arbitrados

    • Characterisation of the Perere-3/Sr3 LINE-RTE Families in Schistosoma mansoni and Related Snail Genomes - a case for horizontal transposable element transfer? (Completo, 2026)

      Brann T. , Souza de Oliveira F. , IRIARTE A. , Protasio A.
      
      Genome Biology and Evolution, 2026
      Palabras clave: schistosoma mansoni transposable element horizontal gene transfer host-parasite relationship schistosomatidae
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica evolutiva
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Zoología, Ornitología, Entomología, Etología / Parasitología
      Medio de divulgación: Internet
      Fecha de aceptación: 07/04/2026
      E-ISSN: 17596653
      https://academic.oup.com/gbe/

Producción técnica

• Trabajos Técnicos

  • Informes de productos en el marco del contrato CON25-00010923 OPS - Instituto de Higiene: "Fortalecimiento de la capacidad de análisis genómico de virus respiratorios en el DLSP" (2025)

    Consultoría
    Hernán Juan , IRIARTE A.
    Organización Panamericana de la Salud (OPS): fondos asignados por REVELAC-i , la Red para la Evaluación de Virus Respiratorios. Colaboración orientada a fortalecer las capacidades del Departamento de Laboratorio de Salud Pública para el análisis genómico de virus respiratorios mediante tecnologías de secuenciación de nueva generación. El trabajo se centró en el desarrollo e implementación de pipelines bioinformáticos reproducibles que cubren todas las etapas del análisis, desde la organización y control de calidad de los datos de secuenciación, pasando por el ensamblado de genomas virales, hasta el análisis filogenético y la detección y anotación de variantes. Estos desarrollos se apoyaron en una infraestructura híbrida de almacenamiento y en la generación de bases de datos locales de referencia, permitiendo un manejo ordenado y seguro de secuencias y metadatos. El principal aporte técnico de la colaboración fue la creación de un conjunto integrado de scripts y flujos de trabajo que estandarizan el procesamiento de datos genómicos para virus como RSV, Influenza y SARS-CoV-2. Estos pipelines permiten automatizar tareas críticas, reducir errores manuales y asegurar la reproducibilidad de los análisis, facilitando su aplicación en el trabajo rutinario del laboratorio. Asimismo, se desarrollaron herramientas específicas para el análisis filogenómico y el estudio de variantes, integrando información de bases de datos públicas y generando resultados directamente utilizables para estudios epidemiológicos y de vigilancia molecular. La contribución más relevante de los desarrollos realizados es la instalación de capacidades locales sostenibles, tanto a nivel de infraestructura computacional como de formación de recursos humanos. A través de talleres y actividades prácticas, el personal del laboratorio adquirió competencias en línea de comandos, análisis filogenético y uso de los pipelines desarrollados, promoviendo una mayor autonomía en el análisis de datos genómicos. En conjunto, el trabajo sienta las bases para la expansión futura de estas herramientas a otros patógenos y para su integración en sistemas de vigilancia genómica, fortaleciendo la respuesta ante eventos sanitarios de relevancia nacional.
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Disponibilidad: Restricta
    
    Duración: 6 meses
    Institución financiadora: OPS
    Palabras clave: Vigilancia genómica bioinformática virus respiratorios filogenómica análisis de variantes
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología /
    https://www.paho.org/es/noticias/11-12-2025-uruguay-refuerza-capacitacion-analisis-virus-respiratorios-importancia-para

  • Informe Técnico Situación Unidad de Biología Parasitaría (UBP), Instituto de Higiene - Facultad de Ciencias. (2020)

    Asesoramiento
    IRIARTE A.
    Informe para el Instituto de Biología - Facultad de Ciencias.
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Disponibilidad: Restricta
    
    Duración: 1 mes

Formación de RRHH

• Tutorías concluidas

  • Posgrado

    • Estudio del SL Trans-Splicing como mecanismo regulador en el ciclo de vida de Hymenolepis microstoma y su evolucio?n en los platelmintos. (2019 - 2024)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) / Instituto de Higiene/Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas (PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( IRIARTE A. , URIEL KOZIOL , MUSTO H )
      Nombre del orientado: Javier Calvelo
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Genómica helmintos. Genómica funcional. Cestoda Splice leader trans-splicing Genómica evolutiva
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Parasitología / Genómica
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución

    • Análisis genómico de Cylindrospermopsis raciborskii: evolución y biogeografía de su toxicidad (2014 - 2024)

      Tesis de doctorado
      Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas (PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Paula Vico
      País: Uruguay
      Palabras Clave: cyanobacteria cylindrospermopsin anatoxin-a and saxitoxin
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica comparativa

    • Identificación de mecanismos y nuevos actores moleculares involucrados en el proceso de FBN en β-rizobios, utilizando una aproximación genómica funcional (2014 - 2024)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Cotutor ( RAÚL PLATERO , FABIANO, E. , IRIARTE A. )
      Nombre del orientado: María Cecilia Rodríguez Esperón
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Nodulación y fijación biológica de nitrógeno Beta-proteobacterias Transcriptómica RNAseq
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica funcional
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología

    • Predicción de Secuencias de Inserción en genomas bacterianos utilizando algoritmos de Machine Learning. (2020 - 2023)

      Tesis de maestria
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universidad de Buenos Aires , Argentina
      Programa: Maestría en Explotación de Datos y Descubrimiento del Conocimiento
      Tipo de orientación: Cotutor ( IRIARTE A. , German Matias Traglia )
      Nombre del orientado: MIGUEL ÁNGEL BARROS.
      País: Argentina
      Palabras Clave: Aprendizaje automático Genómica bacteriana Análisis de secuencias Desarrollo de Software
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología

    • Análisis del transcriptoma y detección de polimorfismos en piel pigmentada y no pigmentada del párpado en ganado Hereford. (2018 - 2022)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Veterinaria / Dpto. Genética y Mejora Animal , Uruguay
      Programa: Doctorado en Producción Animal
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( IRIARTE A. , ARMSTRONG E , PENAGARICANO F )
      Nombre del orientado: Eugenio Jara
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Ganado de carne Cáncer
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / Ciencias Veterinarias

    • ?Ana?lisis de datos transcripto?micos de platelmintos desde una perspectiva evolutiva? (2018 - 2022)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) / Facultad de Medicina , Uruguay
      Programa: Maestría en Biología
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( IRIARTE A. , TORT, J F )
      Nombre del orientado: Mauricio Langleib
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Genómica Comparativa y funcional Helmintos
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Parasitología / Genómica

    • Roles ecológicos y conflictos antrópicos de los zorros del Uruguay (2015 - 2022)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( IRIARTE A. , GONZÁLEZ, S. , COSSE, M. )
      Nombre del orientado: Natalia Mannisse
      País: Uruguay
      Palabras Clave: NGS Conservaci`on Barcodes
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Biología computacional
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Conservación de la Biodiversidad

    • CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA Y GENOTÍPICA DE CEPAS DE ESCHERICHIA COLI PRODUCTORAS DE TOXINA SHIGA (O157 Y NO O157) PROVENIENTES DE ALIMENTOS, GANADO Y CASOS CLÍNICOS. IDENTIFICACIÓN DE NUEVOS BLANCOS ÚTILES PARA SU DETECCIÓN Y CONTROL (2016 - 2021)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Biotecnología
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( IRIARTE A. )
      Nombre del orientado: Sylvia Vázquez Zeballos
      País: Uruguay
      Palabras Clave: E. coli enterohemorrágica STEC PFGE Genómica
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología
      Doctorado en Biotecnología 2016-2021

    • Secuenciado y estudios evolutivos del genoma de la bacteria Delftia sp. JD2 y de la familia Comamonadaceae (2013-2016)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Maestría en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
      Nombre del orientado: Eugenio Jara
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Secuenciación, ensamblado y anotación uso de codones sinónimos
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Evolución molecular
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica comparativa

  • Grado

    • Familias multigénicas codificantes para proteínas de secreción y su rol adaptativo en el phylum Platyhelminthes

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Mauricio Langleib
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Genómica Comparativa Duplicación génica Gusanos planos
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Genómica evolutiva

    • Genómica de Echinococcus granulosus: evolución molecular de glutatión transferasas de clase Mu (EgGST1)

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Bioquímica
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
      Nombre del orientado: Pilar dos Santos
      País: Uruguay
      Palabras Clave: anotación expresión diferencial análisis filogenético
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular

    • Estudio delsesgo en el uso de codones sinónimos en regiones transmembrana en bacterias

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Ciencias Biológicas
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
      Nombre del orientado: Eugenio Jara
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Proteínas trasnmembrana Selección en la traducción
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica

    • Firmas moleculares en el superreino Archaea

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Ciencias Biológicas
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
      Nombre del orientado: Lucía Leytón
      País: Uruguay
      Palabras Clave: indels Archaea
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica

    • Introducción al análisis bioinformatico del gen TRO (trofinina) en bovinos.

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Ciencias Biológicas
      Tipo de orientación: Asesor
      Nombre del orientado: Manuela Silveira
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genómica

    • Uso de codones en Enterobacteriaceae; hacia la detección de codones óptimos ancestrales

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Ciencias Biológicas
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
      Nombre del orientado: Juan Diego Baraibar
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Uso de Codones Enterobacteriaceae
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
      cita asociada: BARAIBAR JD.; Iriarte A.; ROMERO H.; MUSTO H. Codon usage analysis in Enterobacteriaceae towards the detection of ancestral optimal triplets. In: Darwin 200 South American Celebration , 2009 Punta del Este, Maldonado . 2009. Palabras Clave: codon usage; Enterobacteriaceae; Reconstruction of ancestral states

    • Estudio de la cromatina en ovinos Criollos Uruguayos. Acción de agentes clastogénicos.

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Ciencias Biológicas
      Tipo de orientación: Asesor
      Nombre del orientado: Franko Graziano
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Citogenética

    • Estudio de polimorfismos del receptor de la hormona estimulante de melanocitos (MC1R) y su relación con el cáncer de ojo en Ganado Hereford

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Bioquímica
      Tipo de orientación: Asesor
      Nombre del orientado: María Jose Di Mauro
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia
      Asesoramiento en el manejo y uso de herramientas de analisis de secuencias.

  • Otras

    • Pasantía de técnica del Instituto IMPaM UBA-CONICET (Facultad de Medicina de la Universidad de Buenos Aires). (2020 - 2020)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina / Dpto. Desarrollo Biotecnológico , Uruguay
      Programa: Biologia Celular y Molecular
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Gabriela N. Cerbino
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Genómica comparativa Genómica funcional
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología
      Comparative genomics reveals virulent lineages of Shewanella and their evolution towards multidrug resistance

    • Pasantía de estudiante Doctoral del Instituto IMPaM UBA-CONICET (Facultad de Medicina de la Universidad de Buenos Aires).

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Elisabet Vilacoba
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Genómica Comparativa Actinobacter Ensamblado y anotación de genomas
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática

• Tutorías en marcha

  • Posgrado

    • ?Caracterización del genoma accesorio del género Shewanella y su asociación con factores que contribuyen a la patogenicidad? (2024)

      Tesis de doctorado
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Ciencias Exactas y Naturales Universidad de Buenos Aires / IMPAM , Argentina
      Programa: Doctorado de la Universidad de Buenos Aires, Área Ciencias Biológicas
      Tipo de orientación: Cotutor
      Nombre del orientado: Gabriela N. Cerbino
      País/Idioma: Argentina,
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología
      Estudio molecular, comparativo y evolutivo de genomas

    • Análisis de parásitos protozoarios y helmintos presentes en fecas de zorros de campo (Lycalopex gymnocercus) y perros domésticos (Canis lupus familiaris), mediante metabarcoding de ADN y coproparasitarios. (2021)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Valeria Da Silva Sena
      Medio de divulgación: Internet
      País/Idioma: Uruguay, Español
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Conservación de la Biodiversidad

    • Estudio de la O-glicosilación aberrante en la función de la Neuropilin-2 en el cáncer de mama (2021)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) / Facultad de Medicina, UdelaR , Uruguay
      Programa: Doctorado en Biología
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( TERESA FREIRE , FESTARI MF , IRIARTE A. )
      Nombre del orientado: Mercedes Landeira Escames
      País/Idioma: Uruguay, Español
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Transcriptómica
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Bioquímica y Biología Molecular

    • Análisis metagenómico de suelos para la detección y caracterización de comunidades de geohelmintos (2019)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Maestría en Bioinformática , Uruguay
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Hernán Juan
      País/Idioma: Uruguay, Español
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica & Metagenómica

  • Otras

    • Evolución molecular de los compenentes del complejo SRP en hongos. (2024)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina / U.A. Desarrollo Biotecnológico , Uruguay
      Programa: Maestría
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Ania Gómez
      País/Idioma: Uruguay,

Otros datos relevantes

• Premios, Honores y Títulos

  • Financiación total de la pasantía a desarrollarse en University of Florida, Gainesville, FL, USA. (2015)

    (Nacional)
    ANII - Beca de Movilidad
    
    

  • Premio Elio García-Austt a la mejor Tesis de Doctorado 2013 (2014)

    (Nacional)
    PEDECIBA
    El premio se concede a la mejor Tesis de Doctorado, desarrollada principalmente en el país y que constituye un aporte relevante al conocimiento científico en su área de estudio. El Tribunal que entiende en la adjudicación del premio esta constituido por 3 miembros designados por el CCA Biología. En todos los casos el Tribunal estará formado por destacados investigadores Grados 4 y/o 5 del Área Biología.
    

  • Financiación total de la pasantía a desarrollarse en University of Madison-Wisconsin, WI, USA. (2014)

    (Nacional)
    CSIC - Programa Pasantías en el Exterior
    
    

  • Financiación de posición Postdoctoral (Asistente en Investigación) en IPMont. (2013)

    (Internacional)
    IPMont
    
    

  • Financiación de posición Postdoctoral (Contrato de Investigación) (2013)

    (Internacional)
    IIBCE - Instituto de Investigaciones Biológicas "Clemente Estable"
    
    

  • Financiación total de la pasantía a desarrollarse en Mississippi State University, USA. (2012)

    (Nacional)
    CSIC - Programa Pasantías en el Exterior
    
    

  • Beca de posgrado nacional (2011)

    (Nacional)
    Agencia Nacional de Investigación e Innovación
    El directorio de la ANII, atendiendo a la recomendación del CESBE aprobó la solicitud de la beca.
    

  • Financiación total de la pasantía a desarrollarse en UC Davis, California, USA. (2011)

    (Nacional)
    CSIC - Programa de pasantías en el exterior
    El cierre del primer llamado del ejercicio 2011 del Programa de Pasantías en el Exterior fue el 19 de octubre de 2010.
    

  • Beca de Posgrado para docentes (2010)

    (Nacional)
    Comisión Académica de Posgrado, UdelaR
    La Comisión Académica de Posgrado de la Universidad de la República otorgará becas de apoyo a docentes para realizar estudios de doctorado de la Universidad de la República. Monto equivalente a Grado 2, 40 horas semanales, 24 meses, a partir de la aprobación del CDC de las becas otorgadas. La selección de los estudiantes becados la realizó por la Comisión Académica de Posgrado tomando en cuenta los antecedentes académicos del postulante.
    

  • Beca de Estudio (2000)

    (Internacional)
    St. Clares International College, Oxford, Inglaterra
    Curso de Perfeccionamiento general. Además de Guided Self-Access (Técnicas Autodidactas) e ingles de negocios.
    

• Presentaciones en eventos

  • Primeras Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Genética. (2008)

    Congreso
    ESTUDIO DE LA ASOCIACIÓN ENTRE DIVERGENCIA MOLECULAR Y POSIBLES EVENTOS DE ESPECIACIÓN CROMOSÓMICA ENTRE Bos taurus y Ovis aries.
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 3
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Uruguaya de Genética. Palabras Clave: Genómica Bio-informática
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica, Evolución Molecular
    

  • Primeras Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Genética. (2008)

    Congreso
    Efectos de la 5-Azacitidina-C sobre la cromatina de bovinos Criollos portadores de la translocación Robertsoniana (rob1;29).
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 3
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Uruguaya de Genética. Palabras Clave: 5-azacitidina-C Cromatina Bovinos Criollos
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Citogenética
    

  • Encuentro Enseñanza-aprendizaje (2005)

    Seminario
    Aplicación de metodologías de enseñanza-aprendizaje en Genética Veterinaria.
    Uruguay
    Tipo de participación: Otros
    Carga horaria: 4
    Nombre de la institución promotora: Facultad de Ciencias. Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Otras Ciencias Naturales / Otras Ciencias Naturales / Enseñanza
    

• Construcción institucional

  • 2013: Delegado de ADUR Ciencias al Consejo Federal de ADUR Central.
  • 2012-2013: Miembro suplente de la Asamblea del Claustro - Facultad de Ciencias, (Orden Docentes).
  • 2012-2013: Miembro titular de la Comisión Directiva de ADUR Ciencias.
  • 2018-2020. Miembro Titular de la Comisión Directiva del  Instituto de Higiene, Facultad de Medicina, UdelaR. Representante del orden Docentes. (Director Interino).
  • 2020-2022. Miembro Suplente de la Comisión Directiva del Instituto de Higiene, Facultad de Medicina, UdelaR. Representante del orden Docentes.
  • 2017-2019. Miembro Titular de la Comisión de Maestría en Bioinformática, PEDECIBA. Representante del área PEDECIBA-Biología.
  • 2019-2025. Miembro Suplente de la Comisión de Maestría en Bioinformática, PEDECIBA. Representante del área PEDECIBA-Biología. 

Información adicional

2 entrevistas en los medios: TV ciudad y la diaria.

Indicadores de producción

Evaluaciones

• Evaluación de Proyectos

  • Comité evaluación de proyectos

    Comite CTA: Fondo María Viñas 2022 Modalidad II ( 2022 )

    Sector Gobierno/Público / Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    
    

  • Evaluación independiente de proyectos

    Fondo Vaz Ferreira (MEC - PEDECIBA) ( 2019 / 2020 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    Evaluacion de dos presentaciones de propuestas y una de seguimiento.

  • Fondo Clemente Estable 2018 ( 2018 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    

  • CSIC, Programa Iniciación a la Investigación ( 2013 / 2023 )

    Uruguay
    CSIC, Programa Iniciación a la Investigación
    Cantidad: Menos de 5
    

• Evaluación de Publicaciones

  • Comité editorial

    BMC Genomics ( 2023 / 2026 )

    Tipo de publicación: Revista
    Editorial: BMC
    Cantidad: Mas de 20
    Editorial Board Member (desde 2023 - a la fecha)

  • Revisiones

    Journal of Helminthology ( 2026 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Nucleic Acid Research - Genomics and Bioinformatics ( 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • iScience ( 2025 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Folia Microbiologica ( 2025 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Ecology and Evolution ( 2025 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Plos Neglected Tropical Diseases ( 2024 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Frontiers in Genetics ( 2024 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Molecular Phylogenetics and Evolution ( 2022 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Infection, Genetics and Evolution ( 2020 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Scientific Reports ( 2018 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Genomics, Proteomics & Bioinformatics ( 2018 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • The Journal of Microbiology ( 2017 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • RESEARCH MICROBIOLOGY ( 2017 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • FEBS Letters ( 2016 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Archives of Virology ( 2016 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Genomics ( 2015 / 2018 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

  • Genome Biology and Evolution ( 2015 / 2020 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Molecular Genetics and Genomics ( 2014 / 2014 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Molecular Biology and Evolution ( 2014 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • PLOS One ( 2014 / 2022 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • The Journal of Microbiology ( 2013 / 2013 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Journal of Biomolecular Structure & Dynamics ( 2012 / 2012 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Gene ( 2012 / 2014 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

  • Journal of Molecular Evolution ( 2010 / 2019 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

• Evaluación de convocatorias concursables

  • Llamados Grado 3 (Efectivo) Laboratorio de Organización y Evolución del Genoma ( 2025 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    Facultad de Ciencias, UdelaR

  • Llamado Grado 2 (Efectivo), Unidad de Biología Parasitaría. ( 2024 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    Facultad de Ciencias, UdelaR

  • Llamado Grado 2 (interino), Unidad de Biología Parasitaría ( 2024 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    Facultad de Ciencias, UdelaR

  • Llamado a contratos posdoctorales - PEDECIBA - 2023 ( 2023 )

    Evaluación independiente
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    PEDECIBA
    Subárea Genética

  • INVESTIGACIÓN APLICADA: FONDO MARÍA VIÑAS - MODALIDAD II ( 2022 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    ANII

  • Llamado a aspirantes para la provisión interina de un cargo de Asistente del Laboratorio de Biología Parasitaria ( 2022 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    Facultad de Ciencias
    LLAMADO Nº 064/22 - Llamar a aspirantes para la provisión interina de un cargo de Asistente del Laboratorio de Biología Parasitaria del Departamento de Biología Celular y Molecular del Instituto de Biología - INTERINO Gdo. 2, 16 hs., dedicación media, cargo N° 12097

  • Miembro de la subcomisión para evaluación de becas - CAP ( 2018 / 2025 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Mas de 20
    Universidad de la República
    Comisión Académica de Posgrado (CAP), UDELAR

  • Becas de Movilidad y Capacitación (ANII) ( 2016 )

    Evaluación independiente
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    ANII

  • Beca de Posgrado Docentes-Comisión Académica de Posgrado (CAP-UdelaR) ( 2015 / 2025 )

    Evaluación independiente
    Uruguay
    Cantidad: Mas de 20
    UdelaR

  • Vinculación con Cientificos y Tecnologos en el Exterior ( 2015 )

    Evaluación independiente
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    ANII

  • Becas de Posgrados Nacionales - Investigación Fundamental 2015 ( 2015 / 2025 )

    Evaluación independiente
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    ANII

  • Llamados Horas Docentes - IIBCE ( 2014 / 2015 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable (IIBCE)-MEC

• Jurado de tesis

  • Doctorado en Ciencias Biologicas ( 2023 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
    Nivel de formación: Doctorado
    1. "Variabilidad genética en aislados clínicos de Mycobacterium tuberculosis resistentes a medicamentos antituberculosos de primera y segunda línea." Estudiante: Gabriel Morey León Directora Académica: Dra. Luisa Berná Zanotta Co-director: Dr. Carlos Robello Porto Tribunal: Dra. Rosario Durán, Dr. Andrés Iriarte, Dra Andrea Villarino

  • Doctorado en Biotecnología ( 2021 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
    Nivel de formación: Doctorado
    1. "Taxonomía y función de organismos del filo Chloroflexi en sistemas de tratamiento de aguas residuales" Licenciada Patricia Bovio Winkler. Directoras de tesis: Dra. Claudia Etchebehere, Dra. Angela Cabezas. Tribunal: Dr. Javier Menes, Dr. Andrés Iriarte y Dra. Valeria Maia Merzel.

  • Licenciatura en Bioquímica ( 2020 / 2023 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
    Nivel de formación: Grado
    1. 2023. "Análisis de familias multigénicas de Toxoplasma gondii y Neospora caninum". Joaquín Pereira. Tutora: Dra. Luisa Berná. Tribunal: Dra. Natalia Mannise, Dr. Andres Iriarte.

  • Maestría en Biotecnología ( 2017 / 2018 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Evaluación y Seguimiento de Proyecto de Maestría en Biotecnología-GONZALEZ REVELLO, ALVARO MARTIN. "Generación de métodos basados en genómica para detectar microorganismos nocivos en sistemas acuáticos"

  • Maestría en Bioinformática ( 2016 / 2018 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Maestría en Bioinformática , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    1) Tesis de Maestría en Bioinformática - Santiago Fontenla. Directores de tesis: José Tort y Guilherme Correa de Oliveira. Título: "Análisis del perfil de expresión de microARNs en el estadio Juvenil de Fasciola hepatica e identificación de genes de las Vías de Regulación por ARN pequeños en Platelmintos". Tribunal: Dres. Fernando Álvarez-Valín, Alfonso Cayota y Andrés Iriarte. 2) Tesis de Maestría en Bioinformática - Matías Rodríguez. Directores de tesis: Fernando Álvarez y Alberto Ferrarini. Título: "Estudio de la organización y dinámica evolutiva del genoma de Trypanosoma vivax". Tribunal: Dres. Héctor Romero, Lorena Etcheverry y Andrés Iriarte. 3) Tesis de Maestría en Bioinformática - Martín Beracochea. Directores de tesis: Dres. Federico Battistoni y Álvaro Martín, Co-orientador: Dr. José Sotelo-Silveira. Título: "Bioinformática aplicada al estudio genómico de las cepas endófitas Kosakonia sp. UYSO10 y Rhizobium sp. UYSO24". Tribunal: Dres. Héctor Romero, Gonzalo Vázquez. y Andrés Iriarte.

  • Maestría en Ciencias Biológicas ( 2015 / 2020 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    1) 2015 - Tesis Maestría - Lucía Graña. Director de tesis: Héctor Romero. Título: “Estudios de composición nucleotídica y uso de codones en la familia Pelagibacteriaceae del ubicuo clado marino SAR11.” Tribunal: Cecilia Alonso, Ivanna Tomasco y Andrés Iriarte. 2) 2017 - Tesis de Maestría en Ciencias Biológicas - Javier Calvelo. Directores de tesis: Alejandro D'Anatro, Matías Feijoo y Enrique P. Lessa. Título: "Ensamblado del transcriptoma branquial del Pejerrey y búsqueda de selección positiva a nivel molecular en Actinopterigios: aportes al estudio de la osmorregulación en peces." Tribunal: Dres. Héctor Romero, María José Arezo y Andrés Iriarte. 3) 2018 - Tesis de Maestría en Ciencias Biológicas - Florencia Cancela. Directores de tesis: Juan Arbiza y Santiago Mirazo. Título: "Aproximación al estudio de la replicación in vitro del virus de la Hepatitis E a través de análisis proteómicos y transcriptómicos" Tribunal: Dres. Matias Victoria, Héctor Romero, y Andrés Iriarte. 4) 2019 - Tesis de Maestría en Ciencias Biológicas - Fabián Aldunate Caramori. Directores de tesis: Dr. Juan Cristina y Dra. Pilar Moreno. Titulo: "Sustituciones Asociadas a Resistencia a Drogas Antivirales Directas en las Regiones NS5A y NS5B del genoma del Virus de la Hepatitis C en pacientes uruguayos". Tribunal: Dr. Santiago Mirazo, Dra. Jimena Hochmann y Dr. Andrés Iriarte. 5) 2020 - Tesis de Maestría en Ciencias Biológicas - LicŠ Jullie Dourron. Directores de tesis: Dra. Ana Ramon y Dra. Paula Gonzalez-Pombo. Titulo: "Explotación del genoma de Issatchenkia terricola para la identificación de glicosidasas con potencial aplicación en enología.". Tribunal: Dra. Luisa Berná, Dra. Gabriela Irazoqui y Dr. Andrés Iriarte. 6) 2019 - Tesis de Maestría en Ciencias Biológicas - Lic. Nicolás Boullosa. Directores de tesis: Dra. Ivanna Tomasco y Dr. Matías Feijoo. Titulo: "Avances en el estudio de los tucu-tucus (Ctenomys?Ctenomydae) en Uruguay: filogeografía y transcriptómica". Tribunal: Dr. Marcelo Loureiro, Dra. Mariana Cosse y Dr. Andrés Iriarte.

  • Licenciado en Ciencias Biológicas ( 2015 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
    Nivel de formación: Grado
    Diego Simón. Título: GENERACIÓN DE UNA BASE DE DATOS COMPLETA Y NO REDUNDANTE DE VIRUS Y SU ANÁLISIS COMPOSICIONAL. Orientador: Dr. Héctor Musto.