Datos Generales

• Dirección institucional

  Institución: Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Sector Educación Superior/Público
  / Laboratorio de Genómica evolutiva - Sección Biomatemática - Instituto de Biología
  Dirección: Mataojo 2020 / 11400
  País: Uruguay / Montevideo / Montevideo
  Teléfono: (00598) 25220910 / 121
  Correo electrónico/Sitio Web: lberna@pasteur.edu.uy
  

Formación

• Formación académica

  • Concluida

    • Doctorado

      • The Open University (2007 - 2011)

        University of Cambridge, Stazione Zoologica Anton Dohrn , Inglaterra
        Título de la disertación/tesis/defensa: Comparative analysis of deuterostome genome
        Tutor/es: Giuseppe D´Onofrio
        Obtención del título: 2011
        Financiación:
        Open University , Inglaterra
        Palabras Clave: Genome deuterostenome
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática

    • Grado

      • Licenciatura en Bioquímica (1999 - 2007)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Comparative genomic and annotation of coding genes of VSG in African trypanosomes
        Tutor/es: Fernando Álvarez-Valín
        Obtención del título: 2007
        Palabras Clave: bioinformática genoma trypanosomas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática

• Formación complementaria

  • Concluida

    • Posdoctorados

      • Dinámica de la expresión de proteínas de membrana de Trypanosoma cruzi: un enfoque genómico (2013 - 2017)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Biología Molecular , Uruguay

      • Genome level analysis of Next Generation Sequences of Saccharomyces cerevisiae strains (2011 - 2013)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Università degli Studi di Firenze , Italia
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Bioinformatica

    • Cursos de corta duración

      • Taller sobre la escritura de tesis de posgrado dirigido a tutores (04/2025 - 04/2025)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Comisión Académica de Posgrado , Uruguay
        6 horas

      • Single cell technologies and analysis (07/2023 - 08/2023)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Instituto Nacional de Cancer / Wellcome connecting science , Brasil
        72 horas
        Palabras Clave: single cell sequencing Smrt2 chomium

      • Curso-Taller: Formación neurodidáctica básica para docencia universitaria (02/2020 - 02/2020)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Veterinaria , Uruguay
        30 horas
        Palabras Clave: Neurodidáctica Formación Enseñanza

      • Behind Evolutionary Trees: Mathematics and Algorithms in Phylogenetics (10/2019 - 10/2019)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Réseau international des instituts Pasteur , Uruguay
        20 horas
        Palabras Clave: phylogeny

      • Urugenomes - training in ew sequencing and mapping technologies (04/2018 - 04/2018)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Macrogen Korea , Corea del Sur
        70 horas
        Palabras Clave: PacBio Oxford Nanopore 10X Genomics Bionano Hi-C Iso-Seq
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática

      • Wellcome Genome Campus Advanced Courses - Working with Parasite Database Resources (01/2016 - 01/2016)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina / Wellcome Genome Campus Advanced Courses , Uruguay
        35 horas
        Palabras Clave: Parasite Database
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica

      • Computational biology: Genomes to systems (01/2014 - 01/2014)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / European Molecular Biology Organization , Chile
        48 horas

      • Bioinformatics and Comparative Genome Analysis course (01/2009 - 01/2009)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Institut Pasteur , Hong Kong
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica comparativa

      • Corso di Biologia Computazionale: Modelli, Dinamica ed Identificazione (01/2008 - 01/2008)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universita degli Studi di Napoli Federico Secondo , Italia

      • Temporal aspects in genetic analysis (01/2008 - 01/2008)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Proust , Estonia
        50 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genetics

      • Exploring Modular Protein Architecture (01/2008 - 01/2008)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / European Molecular Biology Laboratory , Alemania
        Palabras Clave: Protein Architecture
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Bioinformatica

      • Statistics and Introduction to R-programming (01/2008 - 01/2008)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Open University , Italia
        Palabras Clave: Estadistica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Estadistica

      • Introducción a la programación de aplicaciones bioinformáticas en Bash (01/2007 - 01/2007)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        20 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biomatemática

      • Segunda Escuela Argentina de Biomatemática (01/2007 - 01/2007)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Programa de Biomatemática , Argentina
        80 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biomatemática

      • Genética Molecular y Biotecnología Vegetal (01/2005 - 01/2005)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genetics

      • Genómica e Introducción a las herramientas de bioinformática (01/2005 - 01/2005)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática

      • Introducción a la Bioinformática (01/2004 - 01/2004)

        Sector Educación Superior/Privado / Universidad Católica del Uruguay / Universidad Católica del Uruguay , Uruguay

    • Participación en eventos

      • Single Cell Biology (2024)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Wellcome Connecting Science, Inglaterra
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: single cell bioinformatics genomics

      • Single Cell (LAC) (2024)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Wellcome Connecting Science / INCA (Rio de Janeiro), Brasil
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: Single-cell

      • CGUE Conference on Unicellular Eukaryotes (2024)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Marine Biological Laboratory - The Univesity of Chicago - CGUE, España
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: genómica comparativa genómica evolutiva unicelullar organism

      • XXVII Congreso de la Federación Latinoamericana de Parasitología (2024)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: FLAP-SAP, Argentina
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: Protozologia parasitologia genómica comparativa
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Molecular Parasitology Meeting (MPM) (2023)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Marine Biological Laboratory - Whoods Hole - MPM, Estados Unidos
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: parasitology evolution molecular biology

      • XXXIV Reunión Anual SAP (2023)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SAP, Argentina
        Alcance geográfico: Regional
        Palabras Clave: Parasitología

      • Herramientas biotecnológicas para la vigilancia y control de Enfermedades Transmitidas por Vectores (ETVs): Una mirada al potencial biotecnológico del microbioma de insectos vectores (2023)

        Tipo: Taller
        Institución organizadora: CABBIO - Universidad del Rosario - Colombia, Colombia
        Alcance geográfico: Internacional

      • XXXIII Reunión Anual SAP (2022)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SAP, Argentina
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: parasitologia genómica biología celular

      • International Congress of Parasitology (ICOPA) (2022)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: World Federation of Parasitologists, Dinamarca
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: parasitology cellular biology genomics transcriptomics molecular biology

      • V cycle of Bioinformatics and Computational Biology Conferences (2021)

        Tipo: Simposio
        Institución organizadora: Sociedad Peruana de Bioinformática y Biología Computacional, Perú
        Alcance geográfico: Regional

      • Molecular Parasitology Meeting (2021)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: MBL, Estados Unidos
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: Parasitolog? molecular biology genomics

      • X International conference on bioinformatics (2019)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Iberoamerican society of Bioinformatics, Uruguay
        Palabras Clave: Bioinformatics Genomics Algorithms

      • SMRT Leiden (2018)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Leiden University Medical Center, Holanda
        Palabras Clave: PacBio Sequencing Genomic
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática

      • Combating Resistance : microbes and vectors (2018)

        Tipo: Simposio
        Institución organizadora: Institut Pasteur París, Francia
        Palabras Clave: Resistance vectors microbes
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /

      • Molecular Parasitology Meeting (2018)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: MBL, Estados Unidos
        Palabras Clave: cell biology biochemistry genetics and genomics
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica

      • REUNIÓN CONJUNTA DE SOCIEDADES DE BIOCIENCIAS (2017)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Argentina Protozoologia, Argentina
        Palabras Clave: Trypanosoma cruzi ensamblaje familias multigénicas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Sociedad Brasilera de Protozoologia (2017)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SBPz, Brasil
        Palabras Clave: TRYPANOSOMA CRUZI LONG READS Assembly Annotation
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática

      • ISCB Latin America 2016 (2016)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: ISCB, Argentina
        Palabras Clave: Biología computacional

      • Bioinformatics & Computational biology for innovative genomics (2016)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SoIBio, México
        Palabras Clave: Transcriptomic
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica

      • Modeling and Data Analysis for the Healthy Human Global Project (2015)

        Tipo: Taller
        Institución organizadora: Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay
        Palabras Clave: Research Camp
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /

      • Molecular Evolution in the Genomic Era (2011)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Roma Tre, Italia
        Palabras Clave: Evolution

      • 7th Annual RECOMB Satellite on Systems Biology, (2011)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: IDIBELL institute, España
        Palabras Clave: Systems Biology Regulatory Genomics
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Systems Biology

      • Joint Meeting AGI-SIBV-SIGA (2011)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SIGA, Italia
        Palabras Clave: Next-Generation Sequencing genomics genetics

      • Bioinformatica e Biologia Computazionales in Campania (2007)

        Tipo: Seminario
        Institución organizadora: Istituto di Scienze dell´Alimentazione, Italia
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biomatemática

      • Políticas de Estado para el Desarrollo de la Biotecnología: la experiencia chilena (2006)

        Tipo: Seminario
        Institución organizadora: Fundación Zonamérica, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biotecnología

      • Phred-Phrap-Consed / CAP3 / Blast (2006)

        Tipo: Seminario
        Institución organizadora: Universidad de la Republica, Uruguay

      • Promoviendo la innovación y el espítitu emprendedor en América Latina y el Caribe: Estrategias y Alianzas (2006)

        Tipo: Taller
        Institución organizadora: INGENIO, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biotecnología

      • Perspectivas para el desarrollo de la bioinfromática en Uruguay (2005)

        Tipo: Taller
        Institución organizadora: INGENIO, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática

Idiomas

• Inglés

  Entiende muy bien / Habla bien / Lee muy bien / Escribe muy bien

• Italiano

  Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe bien

• Español

  Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien

Areas de actuación

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Bioquímica y Biología Molecular /Bioinformática

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Biología y Biología de la Evolución /Evolución Molecular

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Biología y Biología de la Evolución /Genómica Evolutiva

Actuación profesional

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Ciencias / Sección Biomatemática - Laboratorio de Genómica Evolutiva

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (01/2026 - a la fecha)Trabajo relevante

      Profesor adjunto G. 3 30 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 3
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (03/2020 - 12/2025)

      Asistente Grado 2 16 horas semanales
      G2, efectivo 30h. Actualmente cuento con una reducción horaria a 16hs.

  • Actividades

    • Docencia

      • Genómica Evolutiva (03/2021 - 12/2025 )

        Grado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Genómica Evolutiva, 30 horas, Práctico
        Genómica Evolutiva, 6 horas, Teórico

      • Transcriptomica I (12/2024 - 12/2024 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        Trancriptomica de reads largos, 3 horas, Teórico-Práctico

      • Maestría en Bioinformática (09/2023 - 09/2023 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        Discusión articulo científico - Seminario de Bioinformática 2023, 2 horas, Teórico-Práctico

      • Maestría en Bioinformática (10/2022 - 10/2022 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        Análisis de genómica comparativa en eucariotas unicelulares - Seminarios de Bioifnromatica, 2 horas, Teórico
        Discusión de un articulo - Seminario de Bioinformática, 2 horas, Teórico-Práctico

    • Gestión Académica

      • Comisión de la Maestría en bioinformática (03/2025 - a la fecha )

        PEDECIBA Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

      • Comisión Directiva de PEDECIBA BIOLOGIA (03/2020 - 02/2024 )

        PEDECIBA Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

• Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas - Institut Pasteur de Montevideo - Uruguay

  Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Biología Molecular

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (03/2020 - a la fecha)Trabajo relevante

      Investigadora Adjunta Senior 40 horas semanales

  • Actividades

    • Docencia

      • PEDECIBA (12/2024 - 12/2024 )

        Especialización
        Invitado
        Asignaturas:
        Mejorando ensamblajes genómicos con lecturas largas: del procesamiento a la aplicación, 1 horas, Teórico

      • Curso internacional (08/2023 - 08/2023 )

        Especialización
        Invitado
        Asignaturas:
        Evolución del tamaño genómico, 2 horas, Teórico

      • Working With Protozoan Parasite Database Resources (03/2020 - 12/2022 )

        Especialización
        Invitado
        Asignaturas:
        Ortólogos y Parálogos, 16 horas, Teórico-Práctico

      • Curso internacional (11/2022 - 11/2022 )

        Especialización
        Invitado
        Asignaturas:
        Latin America Biology of Parasitism - LatAmBoP 2022, 6 horas, Teórico-Práctico

      • Working With Protozoan Parasite Database Resources (10/2020 - 10/2020 )

        Especialización
        Invitado

    • Gestión Académica

      • Comité Asesor del Centro Latinoamericano de Biotecnología (CABBIO) (06/2025 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones 1 horas semanales

• Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas - Institut Pasteur de Montevideo - Uruguay

  Institut Pasteur de Montevideo

  • Vínculos con la Institución

    • Otro (10/2013 - 02/2020)

      Postdoctorado 40 horas semanales / Dedicación total

  • Actividades

    • Docencia

      • Wellcome Genome Campus Advanced Courses and Scientific Conferences (10/2019 - 10/2019 )

        Especialización
        Invitado
        Asignaturas:
        Working with Protozoan Parasite Database Resources, 46 horas, Teórico-Práctico

      • Unidad de Posgrado y Educación Permanente de la Facultad de Agronomía (05/2017 - 05/2017 )

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Herramientas para el análisis de GWAS en cultivos, 40 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica

      • PEDECIBA (10/2015 - 10/2015 )

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Untangling Genomes through bioinformatics using R/Bioconductor and tools for pathway analysis, 40 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática - NGS

      • (09/2015 - 09/2015 )

        Perfeccionamiento
        Invitado
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática, Genómica comparativa

      • (05/2015 - 05/2015 )

        Especialización
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso de Introducción a la genómica funcional, 24 horas, Teórico-Práctico

      • PEDECIBA (12/2014 - 12/2014 )

        Especialización
        Invitado
        Asignaturas:
        Hands-on course on High- Throughput Sequencing data analysis, 30 horas, Teórico-Práctico

      • PEDECIBA (11/2014 - 11/2014 )

        Especialización
        Asistente
        Asignaturas:
        Functional Genomics and its applications in biomedicine Host-Pathogen interaction, 30 horas, Teórico-Práctico

      • Unidad de Posgrado y Educación Permanente de la Facultad de Agronomía (03/2014 - 03/2014 )

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        Búsqueda de variantes tipo SNPs en genomas completos utilizando el programa GATK., 30 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bioinformática - Genómica comparativa

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Italia

  Università degli Studi di Firenze

  • Vínculos con la Institución

    • Colaborador (08/2013 - 12/2019)

      5 horas semanales

    • Funcionario/Empleado (03/2011 - 08/2013)

      Posdoctorado 40 horas semanales

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Italia

  Stazione Zoológica de Napoli

  • Vínculos con la Institución

    • Becario (12/2007 - 12/2010)

      Estudiante de Doctorado 40 horas semanales / Dedicación total

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Ciencias

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (08/2006 - 11/2007)

      Ayudante 25 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

• Sector Gobierno/Público - Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria - Uruguay

  Instituto Nacional de investigación Agropecuaria

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (03/2005 - 02/2006)

      Asistente 30 horas semanales

Carga horaria

• Carga horaria de docencia: 10 horas
  
• Carga horaria de investigación: 30 horas
  
• Carga horaria de formación RRHH: 10 horas
  
• Carga horaria de extensión: Sin horas
  
• Carga horaria de gestión: 2 horas
  

Producción científica/tecnológica

• Genómica comparativa y evolución molecular.
  
  Las nuevas técnicas de secuenciación permiten obtener las secuencias de genomas enteros a un relativamente bajo costo y rápidamente. Esto ha llevado a la disponibilidad de grandes volúmenes información. En particular actualmente es posible tener acceso a información genética, genómica y transcriptómica de una gran gama de organismos, desde bacterias hasta eucariotas superiores.
  Esto permite la investigación a nivel genómico y transcriptómico de aspectos fundamentales de la evolución y el desarrollo de los organismos, así como la posibilidad de entender la arquitectura genómica y los cambios o modificaciones que estos sufrieron a lo largo del tiempo. Se puede investigar como evolucionan y cooperan los genes de un individuo particular, y explorar como los individuos adaptan sus genes/genomas a diferentes ambientes y fenotipos.
  Más recientemente se han desarrollado técnicas que permiten estudios metagenómicos (secuenciación de poblaciones/individuos), ribosome profiling, dual rna-seq y secuenciado de células únicas que amplían los límites de la observación de la biología aportando una gran cantidad de información dónde es necesario el análisis bioinformático.
  
  

Producción bibliográfica

• Artículos publicados

  • Arbitrados

    • Transcriptomic response to different heme sources in Trypanosoma cruzi epimastigotes (Completo, 2026)

      EVELYN TEVERE , MARÍA G. MEDIAVILLA , CECILIA B. DI CAPUA , MARCELO L. MERLI , CARLOS ROBELLO , LUISA BERNÁ , JULIA A. CRICCO
      Microbial Cell, v.: 13 p.:13 - 27, 2026
      E-ISSN: 23112638
      DOI: 10.15698/mic2026.01.865
      https://doi.org/10.15698/mic2026.01.865
      Soy co-corresponding
      
      

    • A Porcine-Isolated Mycobacterium bovis Strain Exhibits Hypervirulence in a Murine Pulmonary Tuberculosis Model (Completo, 2026)

      MARÍA XIMENA CUERDA , MARÍA ALEJANDRA COLOMBATTI , LUISA BERNÁ , ROBERTO DAMIÁN MOYANO , NATALIA ALONSO , MARÍA JOSÉ GRAVISACO , MARTÍN JOSÉ ZUMÁRRAGA , KARINA CAIMI , WANDERSON MARQUES DA SILVA , MARÍA PAZ SANTANGELO
      Biology, v.: 15 p.:335 2026
      Lugar de publicación: Switzerland
      E-ISSN: 20797737
      DOI: 10.3390/biology15040335
      https://doi.org/10.3390/biology15040335
      
      

    • A divide-and-conquer approach to uncover the genomic structure of the highly virulent RA strain of Trypanosoma cruzi (Completo, 2025)

      VIRGINIA BALOUZ , ALDANA ALEXANDRA CEPEDA DEAN , GUADALUPE ROMER , CARLOS ROBELLO , LUISA BERNÁ , CARLOS ANDRÉS BUSCAGLIA
      Scientific Reports, v.: 15 2025
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United kingdom
      E-ISSN: 20452322
      DOI: 10.1038/s41598-025-23742-0
      https://doi.org/10.1038/s41598-025-23742-0
      
      

    • An algorithm for annotation and classification of T. cruzi MASP sequences: towards a better understanding of the parasite genetic variability (Completo, 2025)

      ALDANA ALEXANDRA CEPEDA DEAN , LUISA BERNÁ , CARLOS ROBELLO , CARLOS ANDRÉS BUSCAGLIA , VIRGINIA BALOUZ
      BMC Genomics, v.: 26 2025
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United kingdom
      E-ISSN: 14712164
      DOI: 10.1186/s12864-025-11384-5
      https://doi.org/10.1186/s12864-025-11384-5
      
      

    • mSphere of Influence: Trypanosoma cruzi genome in 3D action (Completo, 2025)

      LUISA BERNÁ
      mSphere, v.: 10 2025
      Lugar de publicación: United states
      Escrito por invitación
      E-ISSN: 23795042
      DOI: 10.1128/msphere.00611-24
      https://doi.org/10.1128/msphere.00611-24
      
      

    • Exploring the genomic landscape of the GP63 family in Trypanosoma cruzi: Evolutionary dynamics and functional peculiarities (Completo, 2025)

      LUISA BERNÁ , MARÍA LAURA CHIRIBAO , SEBASTIÁN PITA , FERNANDO ALVAREZ-VALIN , ADRIANA PARODI-TALICE
      PLoS Neglected Tropical Diseases, v.: 19 2025
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      E-ISSN: 19352735
      DOI: 10.1371/journal.pntd.0012950
      https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0012950
      
      

    • Global epidemiology of Mycobacterium tuberculosis lineage 4 insights from Ecuadorian genomic data (Completo, 2025)

      GABRIEL MOREY-LEÓN , PAULINA M. MEJÍA-PONCE , JUAN CARLOS FERNÁNDEZ-CADENA , EVELYN GARCÍA-MOREIRA , DERLY ANDRADE-MOLINA , CUAUHTÉMOC LICONA-CASSANI , PABLO FRESIA , LUISA BERNÁ
      Scientific Reports, v.: 15 2025
      Lugar de publicación: United kingdom
      E-ISSN: 20452322
      DOI: 10.1038/s41598-025-86079-8
      https://doi.org/10.1038/s41598-025-86079-8
      
      

    • Decoding Ecuadorian Mycobacterium tuberculosis Isolates: Unveiling Lineage-Associated Signatures in Beta-Lactamase Resistance via Pangenome Analysis (Completo, 2025)

      GABRIEL MOREY-LEÓN , JUAN CARLOS FERNÁNDEZ-CADENA , DERLY ANDRADE-MOLINA , LUISA BERNÁ
      Biomedicines, v.: 13 p.:313 2025
      Lugar de publicación: Switzerland
      E-ISSN: 22279059
      DOI: 10.3390/biomedicines13020313
      https://doi.org/10.3390/biomedicines13020313
      
      

    • A precision overview of genomic resistance screening in Ecuadorian isolates of Mycobacterium tuberculosis using web-based bioinformatics tools (Completo, 2023)

      GABRIEL MOREY-LEÓN , PAULINA M. MEJÍA-PONCE , JUAN CARLOS GRANDA PARDO , KAREN MUÑOZ-MAWYIN , JUAN CARLOS FERNÁNDEZ-CADENA , EVELYN GARCÍA-MOREIRA , DERLY ANDRADE-MOLINA , CUAUHTÉMOC LICONA-CASSANI , LUISA BERNÁ
      PLoS ONE, v.: 18 e0294, 2023
      Lugar de publicación: United states
      E-ISSN: 19326203
      DOI: 10.1371/journal.pone.0294670
      http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0294670
      
      

    • Genomic comparison of two strains of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis with contrasting pathogenic phenotype (Completo, 2023)

      M.A. COLOMBATTI OLIVIERI , P. FRESIA , M. GRAÑA , M.X. CUERDA , A. NAGEL , F. ALVARADO PINEDO , M.I. ROMANO , K. CAIMI , L. BERNÁ , M.P. SANTANGELO
      Tuberculosis, v.: 138 p.:102299 2023
      Palabras clave: Genómica comparativa paratuberculosis microbiología
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 14729792
      DOI: 10.1016/j.tube.2022.102299
      http://dx.doi.org/10.1016/j.tube.2022.102299
      En este articulo soy co-autora de correspondencia
      
      

    • New insights into phenotype and genotype relationships in Neospora caninum (Completo, 2023)

      ANDRES CABRERA , LUISA BERNÁ , LUCÍA LÓPEZ , PAULA FARAL-TELLO , ANA PAULA AREVALO , MARTINA CRISPO , MARIA E. FRANCIA , CARLOS ROBELLO
      Frontiers in Veterinary Science, v.: 10 2023
      Palabras clave: genetic variants neosporosis
      Lugar de publicación: Switzerland
      E-ISSN: 22971769
      DOI: 10.3389/fvets.2023.1214971
      http://dx.doi.org/10.3389/fvets.2023.1214971
      
      

    • Deep serological profiling of the Trypanosoma cruzi TSSA antigen reveals different epitopes and modes of recognition by Chagas disease patients (Completo, 2023)

      GUADALUPE ROMER , LEONEL A. BRACCO , ALEJANDRO D. RICCI , VIRGINIA BALOUZ , LUISA BERNÁ , JUAN C. VILLAR , JANINE M. RAMSEY , MELISSA S. NOLAN , FAUSTINO TORRICO , NORIVAL KESPER , JAIME ALTCHEH , CARLOS ROBELLO , CARLOS A. BUSCAGLIA , FERNÁN AGÜERO
      PLoS Neglected Tropical Diseases, v.: 17 p.:1 2023
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      E-ISSN: 19352735
      DOI: 10.1371/journal.pntd.0011542
      http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0011542
      
      

    • Comparative genomics of drug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis in Ecuador (Completo, 2022)

      GABRIEL MOREY-LEÓN , DERLY ANDRADE-MOLINA , JUAN CARLOS FERNÁNDEZ-CADENA , LUISA BERNÁ
      BMC Genomics, v.: 23 2022
      Palabras clave: genómicas comparativa tuberculosis microbiología
      Lugar de publicación: United kingdom
      E-ISSN: 14712164
      DOI: 10.1186/s12864-022-09042-1
      http://dx.doi.org/10.1186/s12864-022-09042-1
      
      

    • The Elusive Mitochondrial Genomes of Apicomplexa: Where Are We Now? (Completo, 2021)

      LUISA BERNÁ , NATALIA REGO , MARÍA E. FRANCIA
      Frontiers in Microbiology, v.: 12 2021
      Lugar de publicación: Switzerland
      E-ISSN: 1664302X
      DOI: 10.3389/fmicb.2021.751775
      http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2021.751775
      
      

    • Maxicircle architecture and evolutionary insights into Trypanosoma cruzi complex (Completo, 2021)

      LUISA BERNÁ , GONZALO GREIF , SEBASTIÁN PITA , PAULA FARAL-TELLO , FLORENCIA DÍAZ-VIRAQUÉ , RITA DE CÁSSIA MOREIRA DE SOUZA , GUSTAVO ADOLFO VALLEJO , FERNANDO ALVAREZ-VALIN , CARLOS ROBELLO
      PLOS Neglected Tropical Diseases, v.: 15 p.:1 - 15, 2021
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 19352727
      E-ISSN: 19352735
      DOI: 10.1371/journal.pntd.0009719
      http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0009719
      
      

    • Nanopore Long Read DNA Sequencing of Protozoan Parasites: Hybrid Genome Assembly of Trypanosoma cruzi. (Completo, 2021)

      Díaz-Viraqué F , GREIF, G. , BERNA, L. , ROBELLO, C.
      Methods in molecular biology, v.: 2369 p.:3 - 13, 2021
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 10643745
      E-ISSN: 19406029
      DOI: 10.1007/978-1-0716-1681-9_1
      
      

    • Reevaluation of the Toxoplasma gondii and Neospora caninum genomes reveals misassembly, karyotype differences, and chromosomal rearrangements (Completo, 2021)Trabajo relevante

      LUISA BERNÁ , PABLO MARQUEZ , ANDRÉS CABRERA , GONZALO GREIF , MARÍA E. FRANCIA , CARLOS ROBELLO
      Genome Research, v.: 31 p.:823 - 833, 2021
      Lugar de publicación: United states
      E-ISSN: 10889051
      DOI: 10.1101/gr.262832.120
      http://dx.doi.org/10.1101/gr.262832.120
      
      

    • Transcriptome Studies in Trypanosoma cruzi Using RNA-seq. (Completo, 2019)

      BERNA, L. , GREIF, G. , Díaz-Viraqué F , ROBELLO, C.
      Methods in molecular biology, 1955, p.:35 - 45, 2019
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 10643745
      E-ISSN: 19406029
      DOI: 10.1007/978-1-4939-9148-8_3.
      
      

    • Population genomics reveals evolution and variation of Saccharomyces cerevisiae in the human and insects gut (Completo, 2019)

      Ramazzotti M , Stefanini I , Di Paola M , De Filippo C , Rizzetto L , BERNA, L. , Dapporto L , Rivero D , Tocci N , Weil T , Lenucci M , Lionetti P , Cavalieri D
      Environmental Microbiology, 2019
      Palabras clave: yeast evolution genomic whole sequencing
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 14622912
      E-ISSN: 14622920
      DOI: 10.1111/1462-2920.14422
      
      

    • Genomic and Transcriptomic Basis of Hanseniaspora vineae's Impact on Flavor Diversity and Wine Quality (Completo, 2019)

      facundo giorello , Valera, M.J. , VALENTINA MARTÍN , PARADA A , Salzman, V , Camesasca, L , Fariña, L , BOIDO, E. , Medina, K , DELLACASSA, E , BERNA, L. , AGUILAR, PS , Mas, A , GAGGERO, C. , CARRAU, F.
      Applied and Environmental Microbiology, v.: e01959-18 2019
      Palabras clave: transcriptomic genomic wine flavors
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica comparativa
      Medio de divulgación: Otros
      ISSN: 00992240
      E-ISSN: 10985336
      DOI: 10.1128/AEM.01959-18
      https://aem.asm.org/content/85/1/e01959-18
      
      

    • Isolation and molecular characterization of four novel Neospora caninum strains (Completo, 2019)

      Cabrera A. , Fresia P , BERNA, L. , Silveira C. , Macías-Rioseco M3 , AREVALO,AP. , M. CRISPO , PRITSCH, O. , Riet-Correa F. , Giannitti F , MARIA E FRANCIA
      Parasitology Research, v.: 118 12 , p.:3535 - 3542, 2019
      Palabras clave: Neospora caninum typing bovine abortion
      Medio de divulgación: Otros
      ISSN: 09320113
      E-ISSN: 14321955
      DOI: doi: 10.1007/s00436-019-06474-9
      https://link.springer.com/article/10.1007/s00436-019-06474-9
      
      

    • Genomic and Phenotypic Variation in Morphogenetic Networks of Two Candida albicans Isolates Subtends Their Different Pathogenic Potential (Completo, 2018)

      Cavalieri D , Di Paola M , Rizzetto L , Tocci N , De Filippo C , Lionetti P , Ardizzoni A , Colombari B , Paulone S , Gut IG , BERNA, L. , Gut M , Blanc J , Kapushesky M , Pericolini E , Blasi E , Peppoloni S
      Frontiers in Immunology, v.: eCollection 2017 2018
      Palabras clave: Yeast Candida genomic pathogenesis
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 16643224
      DOI: 10.3389/fimmu.2017.01997
      https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fimmu.2017.01997/full
      one
      
      

    • Genomic and phenomic analysis of Hanseniaspora vineae provides insights for understanding yeast fermentation flavours that contribute to wine quality (Completo, 2018)

      Giorello F. , Valera, M.J. , VALENTINA MARTÍN , PARADA A , Salzman V , Camesasca L. , Fariña L. , Boido E. , Medina K. , DELLACASSA, E , BERNA, L. , AGUILAR, PS , Mas A , GAGGERO, C. , CARRAU, F.
      Applied and Environmental Microbiology, v.: AEM.01959-18 2018
      Palabras clave: yeast genome transciptome flavours
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 00992240
      E-ISSN: 10985336
      DOI: 10.1128/AEM.01959-18
      https://aem.asm.org/content/early/2018/10/23/AEM.01959-18.long
      
      

    • Expanding an expanded genome: long-read sequencing of Trypanosoma cruzi (Completo, 2018)Trabajo relevante

      LUISA BERNÁ , MATIAS RODRIGUEZ , MARÍA LAURA CHIRIBAO , ADRIANA PARODI-TALICE , SEBASTIÁN PITA , GASTÓN RIJO , FERNANDO ALVAREZ-VALIN , CARLOS ROBELLO
      Microbial Genomics, v.: 4 2018
      Palabras clave: Assembly Genomics Trypanosoma cruzi long reads
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 20575858
      DOI: 10.1099/mgen.0.000177
      https://doi.org/10.1099/mgen.0.000177
      
      

    • Whole genome sequencing of the monomorphic pathogen Mycobacterium bovis reveals local differentiation of cattle clinical isolates (Completo, 2018)

      MOIRA LASSERRE , PABLO FRESIA , GONZALO GREIF , GREGORIO IRAOLA , MIGUEL CASTRO-RAMOS , ARTURO JUAMBELTZ , ÁLVARO NUÑEZ , HUGO NAYA , CARLOS ROBELLO , LUISA BERNÁ
      BMC Genomics, v.: 19 3 , 2018
      Palabras clave: tuberculosis
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United kingdom
      E-ISSN: 14712164
      DOI: 10.1186/s12864-017-4249-6
      https://doi.org/10.1186/s12864-017-4249-6
      
      

    • Genome-wide diversity and differentiation in New World populations of the human malaria parasite Plasmodium vivax (Completo, 2017)

      THAIS C. DE OLIVEIRA , PRISCILA T. RODRIGUES , MARIA JOSé MENEZES , RAQUEL M. GONçALVES-LOPES , MELISSA S. BASTOS , NATHáLIA F. LIMA , SUSANA BARBOSA , ALEXANDRA L. GERBER , GUILHERME LOSS DE MORAIS , BERNA, L. , JODY PHELAN , C. ROBELLO , ANA TEREZA R. DE VASCONCELOS , JOãO MARCELO P. ALVES , MARCELO U. FERREIRA
      PLoS Neglected Tropical Diseases, 2017
      Palabras clave: genomics plasmodium polymorphism
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 19352735
      DOI: 10.1371/journal.pntd.0005824
      http://journals.plos.org/plosntds/article?id=10.1371/journal.pntd.0005824
      
      

    • Transcriptomic analysis reveals metabolic switches and surface remodeling as key processes for stage transition in Trypanosoma cruzi (Completo, 2017)Trabajo relevante

      BERNA, L. , CHIRIBAO, ML. , G. GREF , RODRIGUEZ, M. , Fernando Álvarez-Valín , C. ROBELLO
      PeerJ, v.: 5 e3017 , 2017
      Palabras clave: metabolism Transcriptomic T. cruzi
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 21678359
      DOI: 10.7717/peerj.3017
      https://peerj.com/articles/3017/
      
      

    • Social wasps are a Saccharomyces mating nest (Completo, 2016)

      IRENE STEFANINI , DAPPORTO, L. , BERNA, L. , POLSINELLI, M. , TURILLAZZI, S. , DUCCIO CAVALIERI
      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v.: 113 8 , p.:2247 - 2251, 2016
      Palabras clave: yeast Saccharomyces cerevisiae Saccharomyces paradoxus hybrid social wasps
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00278424
      E-ISSN: 10916490
      DOI: 10.1073/pnas.1516453113
      http://www.pnas.org/content/113/8/2247.abstract
      
      

    • Evolutionary volatile Cysteines and protein disorder in the fast evolving tunicate Oikopleura dioica (Completo, 2015)

      BERNA, L. , Fernando Álvarez-Valín
      Marine Genomics, v.: 15 300013 1, p.:1 - 7, 2015
      Palabras clave: Evolution Oikopleura Disorder Cysteine
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Evolutionary Genomics
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 18747787
      DOI: 10.1016/j.margen.2015.07.007
      http://dx.doi.org/10.1016/j.margen.2015.07.007
      
      

    • riboFrame: an improved method for microbial taxonomy profiling from non-targeted metagenomics (Completo, 2015)

      MATTEO RAMAZZOTTI , BERNA, L. , DONATI, C. , DUCCIO CAVALIERI
      Frontiers in Genetics, 2015
      Palabras clave: Community profiling Metagenomics 16S gene Variable Region (VR)
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática - NGS
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 16648021
      DOI: 10.3389/fgene.2015.00329
      http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fgene.2015.00329/abstract
      
      

    • Hsp12p and PAU genes are involved in ecological interactions between natural yeast strains (Completo, 2015)

      RIVERO, D. , BERNA, L. , IRENE STEFANINI , BARUFFINI, E , BERGERAT, A. , CSIKáSZ-NAGY A , DUCCIO CAVALIERI
      Environmental Microbiology, 2015
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 14622912
      E-ISSN: 14622920
      DOI: 10.1111/1462-2920.12950
      dx.doi.org/10.1111/1462-2920.12950
      
      

    • Length and GC Content Variability of Introns among Teleostean Genomes in the Light of the Metabolic Rate Hypothesis (Completo, 2014)

      ANKITA CHAURASIA , ANDREA TARALLO , BERNA, L. , M. YAGI , CLAUDIO AGNISOLA , G. D’ONOFRIO
      PLoS ONE, v.: 9 8 , p.:1 - 11, 2014
      Palabras clave: Evolution introns
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bioinformática - Genómica comparativa
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 19326203
      DOI: 10.1371/journal.pone.0103889
      http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0103889
      
      

    • Evolutionary Genomics of Fast Evolving Tunicates (Completo, 2014)Trabajo relevante

      BERNA, L. , Fernando Álvarez-Valín
      Genome Biology and Evolution, v.: 6 7 , p.:1724 - 1738, 2014
      Palabras clave: positive selection genome plasticity Oikopleura
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bioinformática - Genómica comparativa
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 17596653
      DOI: 10.1093/gbe/evu122
      http://gbe.oxfordjournals.org/content/6/7/1724.long
      
      

    • Genome Sequence of the Native Apiculate Wine Yeast Hanseniaspora vineae T02/19AF (Completo, 2014)

      FACUNDO M. GIORELLO , LUISA BERNÁ , GONZALO GREIF , LAURA CAMESASCA , VALENTINA SALZMAN , KARINA MEDINA , CARLOS ROBELLO , CARINA GAGGERO , PABLO S. AGUILAR , FRANCISCO CARRAU
      Genome Announcements, v.: 2 2014
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bioinformática - Genómica comparativa
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      E-ISSN: 21698287
      DOI: 10.1128/genomea.00530-14
      https://doi.org/10.1128/genomea.00530-14
      
      

    • Whole-Genome Sequencing of an Isoniazid-Resistant Clinical Isolate of Mycobacterium tuberculosis Strain MtURU-002 from Uruguay (Completo, 2014)

      LUISA BERNÁ , GREGORIO IRAOLA , GONZALO GREIF , CECILIA COITINHO , CARLOS M. RIVAS , HUGO NAYA , CARLOS ROBELLO
      Genome Announcements, v.: 2 14 , 2014
      Palabras clave: Genome Mycobacterium Sequencing
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bioinformática - Genómica comparativa
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      E-ISSN: 21698287
      DOI: 10.1128/genomea.00655-14
      https://doi.org/10.1128/genomea.00655-14
      
      

    • Complete Genome Sequence of Mycobacterium tuberculosis Strain MtURU-001, Isolated from a Rapidly Progressing Outbreak in Uruguay (Completo, 2014)

      GONZALO GREIF , GREGORIO IRAOLA , LUISA BERNÁ , CECILIA COITINHO , CARLOS M. RIVAS , HUGO NAYA , CARLOS ROBELLO
      Genome Announcements, v.: 2 3 , 2014
      Palabras clave: Genome tuberculosis
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica comparativa
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bioinformática - Genómica comparativa
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      E-ISSN: 21698287
      DOI: 10.1128/genomea.01220-13
      https://doi.org/10.1128/genomea.01220-13
      
      

    • The genome sequence of the hydrocarbon-degrading Acinetobacter venetianus VE-C3 (Completo, 2013)

      MARCO FONDI , ERMANNO RIZZI , GIOVANNI EMILIANI , VALERIO ORLANDINI , LUISA BERNA , MARIA CRISTIANA PAPALEO , ELENA PERRIN , ISABEL MAIDA , GIORGIO CORTI , GIANLUCA DE BELLIS , FRANCO BALDI , LENIE DIJKSHOORN , MARIO VANEECHOUTTE , RENATO FANI
      Research in Microbiology, v.: 164 p.:439 - 449, 2013
      Palabras clave: Genome Acinetobacter
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica Evolutiva
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Netherlands
      E-ISSN: 09232508
      DOI: 10.1016/j.resmic.2013.03.003
      https://doi.org/10.1016/j.resmic.2013.03.003
      
      

    • A computational pipeline to discover highly phylogenetically informative genes in sequenced genomes: application to Saccharomyces cerevisiae natural strains (Completo, 2012)

      MATTEO RAMAZZOTTI , LUISA BERNÁ , IRENE STEFANINI , DUCCIO CAVALIERI
      Nucleic Acids Research, v.: 40 9 , p.:3834 - 3848, 2012
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformatica
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United kingdom
      ISSN: 03051048
      E-ISSN: 13624962
      DOI: 10.1093/nar/gks005
      https://doi.org/10.1093/nar/gks005
      
      

    • The footprint of metabolism in the organization of mammalian genomes (Completo, 2012)

      BERNA, L. , ANKITA CHAURASIA , CLAUDIA ANGELINI , CONCETTA FEDERICO , SALVATORE SACCONE , GIUSEPPE DONOFRIO
      BMC Genomics, v.: 13 174 , 2012
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolucion
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Bioinformatica
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: BioMed Central Ltd.
      E-ISSN: 14712164
      DOI: 10.1186/1471-2164-13-174
      http://www.biomedcentral.com/1471-2164/13/174/
      
      

    • Peculiar patterns of amino acid substitution and conservation in the fast evolving tunicate Oikopleura dioica (Completo, 2011)Trabajo relevante

      BERNA, L. , GIUSEPPE DONOFRIO , Fernando Álvarez-Valín
      Molecular Phylogenetics and Evolution, v.: 62 2 , p.:708 - 717, 2011
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolucion
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Elsevier Inc.
      ISSN: 10557903
      E-ISSN: 10959513
      DOI: 10.1016/j.ympev.2011.11.013
      http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1055790311004842
      
      

    • Metabolic rate and genomic GC. What we can learn from teleost fish (Completo, 2010)

      ERMINIA ULIANO , ANKITA CHAURASIA , BERNA, L. , CLAUDIO AGNISOLA , GIUSEPPE DONOFRIO
      Marine Genomics, v.: 3 p.:29 - 34, 2010
      Palabras clave: metabolic rate fish GC Genome evolution
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Bioinformatica
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 18747787
      DOI: 10.1016/j.margen.2010.02.001
      
      

    • Establishment of micropropagation and cell suspension culture conditions on Achyrocline flaccida (Weinm.) DC. (Asteraceae). (Completo, 2009)

      VICTORIA BONNECARRÈRE , BERNA, L. , A. CASTILLO
      Agrociencia (Uruguay), v.: XIII p.:1 - 6, 2009
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Cultivo invitro de plantas
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: Uruguay
      ISSN: 15100839
      E-ISSN: 23011548
      
      

    • How fast it the sessile Ciona? (Completo, 2009)

      BERNA, L. , Fernando Álvarez-Valín , GIUSEPPE DONOFRIO
      Comparative and Functional Genomics, v.: 2009 p.:1 - 6, 2009
      Palabras clave: Genome Ciona molecular rate divergence
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Bioinformatica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 15326268
      DOI: 2009:875901
      http://www.hindawi.com/journals/cfg/2009/875901.html
      
      

Evaluaciones

• Evaluación de Proyectos

  • Comité evaluación de proyectos

    Comité Posgrados Nacionales (Maestría / Doctorado) ( 2025 )

    Sector Gobierno/Público / Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    
    POS_NAC_2025_1_187868 POS_NAC_2025_1_187895
    

  • Programa de Becas de movilidades de capacitación en el exterior ( 2025 )

    Sector Gobierno/Público / Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    
    MOV_CA_1_2025_1_187362 Capacitación en la técnica hibridación in situ de ARN en mersitemos apicales de arroz

  • Programa de Iniciación a la Investigación 2023 ( 2023 )

    Sector Gobierno/Público / Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Programa de Iniciación a la Investigación 2023 , Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    
    

  • Convocatoria PICT 2021 ( 2022 )

    Sector Extranjero/Internacional/Otros / Fondo Para La Investigación Científica y Tecnológica / convocatoria de los proyectos PICT , Argentina
    Cantidad: Menos de 5
    
    Banco de evaluadores del FONCYT. Convocatoria PICT 2021 Buenos Aires, 16 de Octubre de 2022

  • Becas de Movilidad tipo Capacitación en Campos prioritarios ( 2019 )

    Sector Gobierno/Público / Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    
    

  • Fondo Carlos Vaz Ferreira ( 2019 )

    Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    
    

  • Evaluación independiente de proyectos

    Evaluación Proyecto ANII ( 2019 / 2025 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    
    

• Evaluación de Publicaciones

  • Comité editorial

    MethodsX ( 2022 / 2023 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Gene journal ( 2014 / 2014 )

    
    Cantidad: Menos de 5
    http://www.journals.elsevier.com/gene/

  • Revisiones

    Scientific Data ( 2026 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    Ref: "A chromosome-level, gap-free genome assembly of the fish parasite Trypanosoma larimichthysi from large yellow croaker"

  • Scientific Data ( 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    Ref: "Chromosomal-level genome assembly of Trypanosoma carassii, the etiologic agent of a recent outbreak of trypanosomiasis in cage-cultured large yellow croaker (Larimichthys crocea) in China"

  • European Journal of Protistology ( 2024 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    Manuscript Number: EUJOP-D-23-00094 Parallel reductive evolution in apicomplexan mitochondria.

  • Scientific data - www.nature.com/sdata/ ( 2024 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    Full-length transcriptome annotation of a pyrosome, Pyrosoma atlanticum (Chordata, Thaliacea) - SDATA-23-02043

  • MethodsX ( 2024 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • PLOS Neglected Tropical Diseases ( 2024 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    Article number: PNTD-D-24-01486 "Comparative and systems analyses of Leishmania spp. non-coding RNAs through developmental stages"

  • eLife ( 2023 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    15-12-2023-RA-RC-eLife-95407 Small RNAs from Mitochondrial Genome Recombination Sites are Incorporated into T. gondii Mitoribosomes

  • Molecular Biology and Evolution ( 2022 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    20/07/2022 Thank you for reviewing manuscript MBE-22-0163.R1 27/03/2022 Thank you for reviewing manuscript MBE-22-0163

  • Microbial Genomics ( 2022 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    Manuscript number: MGEN-D-22-00026

  • Frontiers in Cellular and Infection microbiology ( 2022 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    - Mitochondrial genome diversity of Balamuthia mandrillaris revealed by a fatal case of granulomatous amoebic encephalitis

  • Genome Research ( 2021 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    29/10/2021 MS ID#: GENOME/2021/275325

  • MethodsX ( 2020 / 2023 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

  • Journal of Molecular Evolution ( 2018 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Scientific Reports ( 2018 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Genome Biology and Evolution ( 2017 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Molecular BioSystems ( 2017 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • International Journal of Infectious Diseases ( 2017 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Standards in Genomic Sciences ( 2016 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

• Evaluación de eventos y congresos

  • Congreso Nacional de Biociencias ( 2025 / 2025 )

    Revisiones
    Uruguay
    
    Universidad de la República, Pedeciba, CSIC, IBRO
    Evaluación de Posters

  • XV Congreso Iberoamericano de Ciencia, Tecnología y Género ( 2025 / 2025 )

    Revisiones
    Uruguay
    
    Distintas facultades dentro de la Universidad de la República, y muchas institutciones.
    Evaluación de resúmenes (6)

  • International conference of Bioinformatics ISCB-LATAM SoIBio CCBCOL 2024 ( 2024 )

    Revisiones
    Colombia
    
    ICSB
    Evaluación y selección de resúmenes para la conferencia

  • XXVII Congreso de la Federación Latinoamericana de Parasitología ( 2024 )

    Revisiones
    Argentina
    
    FLAP SAP
    Evaluación de mejor expositor oral en la categoría Biología parasitaria

  • XXXIV Reunión Anual Sociedad Argentina de Protozologia ( 2023 / 2023 )

    Comité programa congreso
    Argentina
    
    SAP, Universidad de la Plata, CONICET, CIC
    

• Instituciones y carreras

  • Tipo de evaluación Institución ( 01/01/2025 / 01/01/2025 )

    Par nacional
    Ministerio de Educación y Cultura - Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable, LLAMADO N° 10/2025 A CONCURSO DE MÉRITOS Y OPOSICIÓN PARA PROVEER UN CONTRATO DE HORAS DOCENTES PARA , Uruguay

• Evaluación de premios

  • Premio Mejor Tesis Doctorado Rubio Santoro- Garcia Varela ( 2025 )

    Comité de asignación de premios y concursos
    Uruguay
    
    Cantidad: Menos de 5
    Institut Pasteur de Montevideo
    Comisión asesora ad-hoc

• Evaluación de convocatorias concursables

  • Concurso de méritos y oposición, Nivel III, IIBCE ( 2025 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    CONCURSO DE MÉRITOS Y OPOSICIÓN PARA PROVEER UN CONTRATO DE HORAS DOCENTES PARA ACTIVIDADES DE INVESTIGACIÓN NIVEL III PARA DEPARTAMENTO DE GENOMICA DEL IIBCE.

  • Iniciación a la Investigación ( 2023 )

    Evaluación independiente
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    Universidad de la República
    22420230100245UD SOSA BASSO, PAOLA

  • Becas de Movilidad ( 2019 )

    Evaluación independiente
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    ANII

  • Proyecto Carlos Vaz Ferreira ( 2018 )

    Evaluación independiente
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    PEDECIBA

• Jurado de tesis

  • doctorado PEDECIBA ( 2025 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) / Instituto de Investigaciones Clemente Estable , Uruguay
    Nivel de formación: Doctorado
    Estudiante: Carlos Romeo. Tesis: "Patrones distintivos de expresión génica y procesamiento postranscripcional durante la espermatogénesis"

  • maestría PEDECIBA ( 2024 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Mag. Mauro Martínez Moré "Como responden al déficit hídrico las plantas noduladas, una? ?aproximación desde el estudio del traductoma"

  • doctorado PEDECIBA ( 2024 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) / Facultad de Ciencias , Uruguay
    Nivel de formación: Doctorado
    Estudiante: Daniela Costa Duarte Tesis: ?Genómica poblacional aplicada al estudio de Campylobacter fetus en humanos y animales de producción?

  • doctorado PEDECIBA ( 2024 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
    Nivel de formación: Doctorado
    Javier Calvello, tesis: "Identificación, análisis y perspectivas evolutivas del SL trans-splicing en gusanos platelmintos"

  • maestría PEDECIBA ( 2023 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Sección Genómica Funcional , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Lic. Lucía Bilbao "Estudios de transcriptómica comparativa en amastigotas axénicos versus amastigotas celulares de Trypanosoma cruzi"

  • doctorado PEDECIBA ( 2023 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Subárea - Biología Celular y Molecular , Uruguay
    Nivel de formación: Doctorado
    Mag. Santiago Chávez-García "Análisis de los mecanismos de regulación de la expresión génica en el ciclo proliferativo de Trypanosoma cruzi"

  • doctorado PEDECIBA ( 2022 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina / PEDECIBA , Uruguay
    Nivel de formación: Doctorado
    Estudiante: Santiago Fontenla Rol de los ARN pequeños de Fasciola hepatica en la interacción con el huésped y la conservación de las vías de ARN pequeños en platelmintos

  • maestría PEDECIBA ( 2022 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Lic. Mauricio Langleib de Souza

  • maestría PEDECIBA ( 2022 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) / Sub-área Microbiología , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Lic. Florencia Garabato "Estudio de la proteostasis durante el establecimiento de la simbiosis entre un B-rizobio y su leguminosa hospedera"

  • PEDECIBA - Diego Simón ( 2021 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Maestría en Bioinformática , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Lic. Diego Simón "Análisis composicionales de genomas virales"

  • PEDECIBA ( 2020 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Sección Bioquímica , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Lic. Juliette Dourron "Explotación del genoma de Issatchenkia terricola para la identificación de glicosidasas con potencial aplicación en enología"

  • doctorado PEDECIBA ( 2019 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
    Nivel de formación: Doctorado
    Mag. Alicia Costábile Cristech "Caracterización transcriptómica de las células proliferantes del cestodo Mesocestoides corti"

  • mastría PEDECIBA ( 2018 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    María Noel Irazoqui "Caracterización de la variabilidad composicional y estructural de los cromosomas de Plasmodium vivax"

Formación de RRHH

• Tutorías concluidas

  • Posgrado

    • Buscando el maní perdido: estudio de la diversidad genética y estado de conservación de Arachis hypogaea en Uruguay (2020 - 2023)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Agronomía / Laboratorio de evolución y domesticación de las plantas , Uruguay
      Programa: PEDECIBA
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( VAIO M , BERNA, L. )
      Nombre del orientado: Ignacio Naya
      País: Uruguay
      Palabras Clave: variabilidad genética

    • Variabilidad genética en aislados clínicos de Mycobacterium tuberculosis resistentes a medicamentos antituberculosos de primera y segunda línea. (2018 - 2023)

      Tesis de doctorado
      Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Biología Molecular , Uruguay
      Programa: Programa de Desarrollo de Ciencias Básicas
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Gabriel Morey
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Mycobacterium secuenciación Ecuador diversidad evoluciòn
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática, biología molecular

    • Genómica comparativa funcional de Mycobacterium bovis: aproximaciones epidemiológicas y filogenéticas

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas , Uruguay
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Moira Lasserre
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Mycobacterium
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bioinformática - Genómica comparativa

  • Grado

    • Comparative Analysis of Mitochondrial Genome Variability in Toxoplasma gondii (2023 - 2024)

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Privado / Universidad ORT Uruguay / Facultad de Ingeniería , Uruguay
      Programa: Biotecnologia
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Josefina Bonomi
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Mitocondria enriquecimiento marcadores secuenciación análsisi genómico comparativo

    • Análisis in silico de la familia Athila de retrotransposones en Acca sellowiana (2022 - 2023)

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Unidad de Genómica Evolutiva , Uruguay
      Programa: 1992 - LICENCIATURA EN CIENCIAS BIOLOGICAS
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( BERNA, L. , PRITSCH C )
      Nombre del orientado: Mathias Joaquin Mangino
      País: Uruguay

    • Identificación y análisis de familias multigénicas en Toxoplasma gondii y Neospora caninum (2022 - 2023)

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Laboratorio de Genómica Evolutiva , Uruguay
      Programa: Licenciatura en CIencias Biológicas
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Joaquín Pereira Pagola
      País: Uruguay

    • Ensamblaje de genomas de Neospora caninum a partir de datos de secuenciación de tercera generación (2019 - 2020)

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura de Bioquímica
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Pablo Márquez
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Neospora caninum Genómica comparativa PacBio Nanopore

  • Otras

    • Caracterización in silico de retrotransposones en el genoma de Trypanosoma cruzi

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Gastón Rijo
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Trypansoma cruzi Retrotransposones Anotación
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática

• Tutorías en marcha

  • Posgrado

    • Explorando la Estructura Genómica y los Mecanismos de Segregación Mitocondrial en Toxoplasma gondii (2024)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Laboratorio de Genómica Evolutiva , Uruguay
      Programa: Maestría en Biotecnología
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( BERNA, L. , MARIA E FRANCIA )
      Nombre del orientado: Josefina Bonomi
      País/Idioma: Uruguay,

    • Caracterización e historia evolutiva de las proteínas Dispersed Gene Family 1 (DGF-1) en Trypanosoma cruzi y otros kinetoplástidos (2024)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Laboratorio de Genómica Evolutiva - Sección Biomatemáticas - Instituto de Biología , Uruguay
      Programa: Maestría en Bioinformática
      Tipo de orientación: Cotutor
      Nombre del orientado: Mathias Mangino
      País/Idioma: Uruguay,

    • Biosíntesis y función de ubiquinona y rodoquinona en Caenorhabditis elegans y helmintos (2023)

      Tesis de doctorado
      Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Biología de gusanos , Uruguay
      Programa: PEDECIBA
      Tipo de orientación: Cotutor
      Nombre del orientado: Rosina Comas
      País/Idioma: Uruguay,

    • Descifrando la estructura genómica de parásitos coccidios: estrategias computacionales para la identificación de secuencias mitocondriales y sus rearreglos (2023)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Laboratorio de Genómica Evolutiva , Uruguay
      Programa: Programa de Desarrollo de Ciencias Básicas - PEDECIBA
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Joaquín Pereira Pagola
      País/Idioma: Uruguay,
      Palabras Clave: Bioinformática genómica comparativa mitocondria apicomplejos

Otros datos relevantes

• Premios, Honores y Títulos

  • Bursary award winner at the Single Cell Latin American Course (2024)

    (Internacional)
    Wellcome connecting Science - Chan Suckerberg Initiative
    Con Mag. Lucas Inchausti ganamos como mejor Presentación de un proyecto/idea de investigación aplicando las herramientas incorporadas en el curso "Single Cell Latin American Course". Este premio consisistió en el pasaje y beca para participar del congreso Single Cell Biology organizado por Wellcome Connecting Science - EMBL en Hinxton Inglaterra
    

  • Best Abstract award competittion - Travel Grant winner (2018)

    (Internacional)
    Leiden University Medical Center
    SMRT Ledien 2018 - Best Abstract Award Competition. Travel Grant Winner with the abastract "Expanding an expanded Genome: Long-Read Sequencing of Trypanosoma cruzi"
    

  • travel award winners (2018)

    (Internacional)
    Molecular Parasitology Meeting - MBL
    Travel Award to Attend Molecular Parasitology Meeting 2018
    

  • Financial Support to participate to "Combating Resistance : microbes and vectors" 4th Institut Pasteur International Network Symposium (2018)

    (Internacional)
    Institut Pasteur
    Travel and expenses award - 4th Institut Pasteur International Network Symposium
    

  • Beca de Doctorado (2007)

    (Internacional)
    Stazione Zoologica A. Dohrn - Open University
    
    

• Presentaciones en eventos

  • ISCB-LATAM SoIBio CCBCOL (2024)

    Congreso
    Poster: "Advancements in Genomic Sequencing of Toxoplasma gondii: A Focus on Mitochondrial Diversity" Joaquín Pereira, Joasefina Bonomi, Natalia Rego, Maria Francia, Luisa Berná
    Colombia
    Tipo de participación: Poster
    Nombre de la institución promotora: ISCB / Universidad de Antioquia
    Alcance geográfico: Internacional Palabras Clave: Participación al congreso y presentación del poster por parte de Joaquín Pereira.
    

  • XXVII Congreso de la Federación Latinoamerica de Parasitología (FLAP), XII Congreso de la Sociadad Argentina de Protozoologia (SAP ) (2024)

    Congreso
    Poster: "Análisis comparativo de la variabilidad del genoma mitocndrial en cepas silvetres de Toxoplasma gondii"
    Argentina
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 30
    Alcance geográfico: Regional Palabras Clave: Poster presentado por Josefina Bonomi
    

  • XXVII Congreso de la Federación Latinoamerica de Parasitología (FLAP), XII Congreso de la Sociadad Argentina de Protozoologia (SAP ) (2024)

    Congreso
    Poster: "Caracterización e historia evolutiva de las proteínas Dispersed Gene Family 1 (DGF-1) en Trypanosoma cruzi y otros Kinetoplastidos" Mangino, Mathias1; Trinidad, Juan1; Alvarez-Valin, Fernando1; Elias, Carolina2; Parodi-Talice, Adriana3,4; Berná, Luisa 1,5
    Argentina
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 30
    Nombre de la institución promotora: FLAP/SAP
    Alcance geográfico: Regional Poster presentado por Mathias Mangino

  • XXVII Congreso de la Federación Latinoamerica de Parasitología (FLAP), XII Congreso de la Sociadad Argentina de Protozoologia (SAP ) (2024)

    Congreso
    Poster: "Nuevas estrategias bioinformáticas para el estudio de transcriptomas en Trypanosoma cruzi" CEPEDA DEAN ALDANA A.1,2, BALOUZ VIRGINIA1,2 , ROBELLO CARLOS3, BUSCAGLIA CARLOS A.1,2*, REGO NATALIA3,4* , BERNÁ LUISA3,4*.
    Tipo de participación: Poster Poster presentado por Aldana Cepeda

  • Single Cell (LAC) (2024)

    Congreso
    Poster: "Applying Single-Cell Long-Read Sequencing to Explore Mitochondrial Genomes in Toxoplasma gondii and Related Parasites"
    Brasil
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 24
    Nombre de la institución promotora: Wellcome Connecting Science / INCA (Rio de Janeiro)
    Alcance geográfico: Internacional Palabras Clave: Single cell genomics transcriptomics bioinformatics
    

  • 2024 CGUE Conference on Unicellular Eukaryotes (2024)

    Congreso
    Poster: "Comparative Analysis of Mitochondrial Genome Variability in Toxoplasma gondii"
    España
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 30
    Nombre de la institución promotora: Marine Biological Laboratory, The University of Chicago
    Alcance geográfico: Internacional Palabras Clave: Genomics evolution ecology
    

  • XXVII Congreso de la Federación Latinoamerica de Parasitología (FLAP), XII Congreso de la Sociadad Argentina de Protozoologia (SAP ) (2024)

    Congreso
    "Análisis of the GP63 family in Trypanosoma cruzi: evolutionary dynamics and functional peculiarities"
    Argentina
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 30
    Nombre de la institución promotora: FLAP/SAP
    Alcance geográfico: Regional Palabras Clave: parasitology bioinformatics genomics transcriptomic molecular biology cellular biology
    

  • Single Cell Biology (2023)

    Congreso
    Poster: "Exploring Potential Methodologies in Single-Cell Mitogenome Sequencing for Enhanced Mitochondrial Characterization"
    Inglaterra
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 20
    Nombre de la institución promotora: Wellcome Connecting Science
    Alcance geográfico: Internacional Palabras Clave: Single cell bioinformatics genomics deseases
    

  • Molecular Parasitology Meeting (2023)

    Congreso
    Unveiling the Unique Architecture and Evolutionary Dynamics of the Trypanosoma cruzi Genome
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Otros
    Carga horaria: 50
    Nombre de la institución promotora: MBL
    Alcance geográfico: Internacional Palabras Clave: Parasitlogía genómica biología molecular
    

  • XXXIV Reunión Anual SAP (2023)

    Congreso
    Explorando la plasticidad, arquitectura y dinámica evolutiva del genoma de Trypanosoma cruzi
    Argentina
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Carga horaria: 24
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Argentina de Protozología
    Alcance geográfico: Regional

  • Sociedad Uruguaya de Biociencias (2022)

    Congreso
    Poster: "Análisis in silico de los retrotransposones del linaje Athila/Tat en Acca sellowiana" Mangino, Mathias1 ; Vaio, Magdalena2 ; Oberti, Hector 3 ; Pritsch, Clara 3 ; Berná, Luisa 1,4,5,6
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster
    Nombre de la institución promotora: SUB
    Alcance geográfico: Nacional Participación y presentación de poster por parte de Mathias Mangino. Premio mejor poster

  • XI congreso SAP (2022)

    Congreso
    Participación en tres posters: 1)Maxicircle architecture and evolutionary insights into Trypanosoma cruzi complex 2)Respuesta al hemo en el transcriptoma de Trypanosoma cruzi. 3)Anotación funcional del genoma de la cepa RA de Trypanosoma cruzi
    Argentina
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 32
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Argenitna de Protozologia Palabras Clave: Trypanosoma cruzi maxicircle evolution parasite host-pathogen interactions
    Participación en tres posters: 1) Maxicircle architecture and evolutionary insights into Trypanosoma cruzi complex 2) Respuesta al hemo en el transcriptoma de Trypanosoma cruzi. 3) Anotación funcional del genoma de la cepa RA de Trypanosoma cruzi

  • ICOPA - International Congress of Parasitology (2022)

    Congreso
    Recent insights into the elusive mitochondrial genome of apicomplexa
    Dinamarca
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 40
    Nombre de la institución promotora: World Federation of Parasitologists
    Alcance geográfico: Internacional

  • Sociedad Uruguaya de Biociencias (2022)

    Congreso
    Poster: "Identification and analysis of multigenic families in Toxoplasma gondii and Neospora caninum" Pereira, Joaquín1 ; Berná, Luisa2,3
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster
    Nombre de la institución promotora: SUB
    Alcance geográfico: Nacional Participación y presentación por parte de Joaquín Pereira. Premio a mejor poster

  • Molecular Parasitology Meeting (2021)

    Congreso
    Maxicircle architecture and evolutionary insights into Trypanosoma cruzi complex
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 32
    Nombre de la institución promotora: MPM

  • Molecular Parasitology Meeting (2021)

    Congreso
    Reshuffling mitochondrial genomes in apicomplexan parasites
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 32
    Nombre de la institución promotora: MPM

  • V Ciclo de COnferencias de Bioinformatica y Biologia Computacional (2021)

    Seminario
    Uso de tecnologías de secuenciacioón de tercera generación para la resolución de genomas complejos
    Venezuela
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 2
    Nombre de la institución promotora: Unidad de Estudios Genéticos y Forenses,

  • Molecular Parasitology Meeting (2020)

    Congreso
    Reevaluation of the Toxoplasma gondii and Neospora caninum genomes reveals misassembly, karyotype differences, and chromosomal rearrangements
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 32
    Nombre de la institución promotora: MPM EL congreso fue virtual

  • X International conference on bioinformatics (2019)

    Congreso
    The complete maxircle genomes of Trypanosoma cruzi
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 24
    Nombre de la institución promotora: Iberoamerican society of Bioinformatics

  • SMRT Leiden (2018)

    Congreso
    PacBio sequencing methods, application and software develpoment
    Holanda
    Tipo de participación: Otros
    Carga horaria: 24
    Nombre de la institución promotora: Leiden University Medical Center Palabras Clave: Sequencing genomics PacBio
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática
    

  • VII SIMPOSIO BIOLOGÍA MOLECULAR DE LA ENFERMEDAD DE CHAGAS (2018)

    Encuentro
    Participación con el trabajo "El nuevo genoma de Trypanosoma cruzi"
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 10
    Nombre de la institución promotora: UNU-Biolac, Facultad de Ciencias, Insititu Pasteur Montevideo Palabras Clave: trypanosoma genómica biología molecular resistencia drug discovery
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular
    

  • Molecular Parasitology Meeting (2018)

    Congreso
    This meeting covers all aspects of parasite molecular biology, cell biology, biochemistry, genetics and genomics, focusing on protozoan parasites.
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 24
    Nombre de la institución promotora: MBL Palabras Clave: parasites molecular biology genomics trypansoma
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular
    

  • Combating Resistance : microbes and vectors (2018)

    Simposio
    4th Institut Pasteur International Network Symposium
    Francia
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 24
    Nombre de la institución promotora: Institut Pasteur Paris Palabras Clave: resistance microbes vectors
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología
    Travel and expenses grant

  • Reunión conjunta de sociedades de Biociencias (2017)

    Congreso
    Trypanosoma cruzi long reads based assembly: revealing the real extent of genome complexity
    Argentina
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 40
    Nombre de la institución promotora: SAP y otras sociedades Palabras Clave: Genome Sequencing
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica
    

  • XXXIII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XLIV Annual Meeting on Basic Research in Chagas'Disease (2017)

    Congreso
    Trypanosoma cruzi long reads based assembly: revealing the real extent of genome complexity
    Brasil
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 24
    Nombre de la institución promotora: SBPz Palabras Clave: genomics T. cruzi pacbio
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica
    

  • Bioinformatics & Computational Biology for Innovative Genomics (2016)

    Congreso
    Transcriptomic analysis reveals that metabolic switch and surface remodeling are key processes for stage transition in Trypanosoma cruzi
    México
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 24
    Nombre de la institución promotora: SolBio IC&W Palabras Clave: metabolism Trypanosoma cruzi surface RNA-seq
    

  • 27th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology (2015)

    Congreso
    Social Wasps are Mating Nests for Yeasts
    Italia
    Tipo de participación: Otros
    Carga horaria: 48
    Nombre de la institución promotora: Fondazione Edmund Mach Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología
    Social Wasps are Mating Nests for Yeasts Irene Stefanini1, Leonardo Dapporto2, Luisa Berná3, Mario Polsinelli4, Stefano Turillazzi4,5, Duccio Cavalieri1,6 1Centre for Research and Innovation, Fondazione Edmund Mach, San Michele all’Adige, Trento, Italy; 2Department of Biological and Medical Sciences, Oxford Brookes University, Headington, Oxford, OX3 0BP, UK, 3Molecular Biology Unit, Institut Pasteur, Montevideo, Uruguay, 4Department of Biology, University of Florence, Italy, 5Centro di Servizi di Spettromeria di Massa, University of Florence, Florence, Italy, 6Department of Neuroscience, Psychology, Drug Research and Child's health, University of Florence, Florence, Italy

  • 27° International conference on yeast genetics and molecular biology (2015)

    Congreso
    C. albicans With Different Genomic Background Reveal Diverse Host Adaptation And Differential Processing By Phagocytes
    Italia
    Tipo de participación: Otros
    Carga horaria: 48
    Nombre de la institución promotora: Fondazione Edmund Mach C. albicans With Different Genomic Background Reveal Diverse Host Adaptation And Differential Processing By Phagocytes Lisa Rizzetto1, Monica Di Paola2, Bruna Colombari3, Carlotta De Filippo1, Andrea Ardizzoni2, Luisa Bernà4, Noemi Tocci1, Paolo Lionetti2, Elisabetta Blasi3, Duccio Cavalieri3, Samuele Peppoloni1 1Research and Innovation Centre, Fondazione Edmund Mach, S. Michele all’Adige (TN), Italy; 2Dip. di Neuroscienze, Psicologia, Area del Farmaco e Salute del Bambino, Università di Firenze, Firenze, Italy; 3Dip. di Medicina Diagnostica, Clinica e di Sanità Pubblica, Università di Modena e Reggio Emilia, Modena, Italy; 4Unidad de Biología Molecular, Institut Pasteur de Montevideo, Montevideo, Uruguay

  • 27th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology (2015)

    Congreso
    Hsp12p And PAU Genes Are Involved In Ecological Interactions Between Natural Yeast Strains.
    Italia
    Tipo de participación: Otros
    Carga horaria: 48
    Nombre de la institución promotora: Fondazione Edmund Mach Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología
    Hsp12p And PAU Genes Are Involved In Ecological Interactions Between Natural Yeast Strains. Damaríz Rivero1, Luisa Berná2, Irene Stefanini3, Enrico Baruffini4, Agnes Bergerat5, Attila Csikász-Nagy3, Carlotta De Filippo3 and Duccio Cavalieri1,3 1- Department of Neurosciences, Psychology, Drug Research and Child Health, University of Florence, Florence, Italy. 2- Molecular Biology Unit, Institut Pasteur, Montevideo, Uruguay. 3- Centre for Research and Innovation, Fondazione Edmund Mach, San Michele all'Adige, Trento, Italy. 4- Department of Life Sciences, University of Parma, Parma, Italy. 5- Department of Pathology, Boston University School of Medicine, Boston, USA

  • 27th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology (2015)

    Congreso
    Population Genomics of Saccharomyces cerevisiae Human Isolates Reveals Adaptation to the Gastrointestinal Tract.
    Italia
    Tipo de participación: Otros
    Carga horaria: 48
    Nombre de la institución promotora: Fondazione Edmund Mach Population Genomics of Saccharomyces cerevisiae Human Isolates Reveals Adaptation to the Gastrointestinal Tract. Monica Di Paola1, Carlotta De Filippo2, Irene Stefanini2, Lisa Rizzetto2, Luisa Berná3, Matteo Ramazzotti4, Leonardo Dapporto5, Damariz Rivero1, Ivo G Gut6, Jean-Luc Legras7,8,9, Noemi Tocci2, Marcello S. Lenucci10, Luigina Romani11, Paolo Lionetti1, Duccio Cavalieri1,2 1 Department of Neuroscience, Psychology, Drug Research and Child Health, Meyer Children Hospital, University of Florence, Viale G. Pieraccini 6, 50139 Florence, Italy. 2 Fondazione E. Mach, Research and Innovation Centre, Via E. Mach 1, 38010 San Michele all’ Adige (Trento), Italy. 3 Unidad de Biología Molecular, Institut Pasteur de Montevideo, Montevideo, Uruguay. 4 Department of Experimental and Clinical Biomedical Sciences, University of Florence, viale Morgagni 50, 50134 Florence, Italy. 5 Department of Biological and Medical Sciences, Oxford Brookes University, Headington, Oxford, OX30BP, UK. 6 Centro Nacional d’Anàlisi Genòmica, CNAG, Parc Cientific de Barcelona 08028 Barcelona, Spain. 7 Institut National de la Recherche Agronomique, INRA, Unité Mixte de Recherche Sciences pour l’Oenologie, UMR1083, F-34060 Montpellier, France. 8 Montpellier SupAgro, Unité Mixte de Recherche Sciences pour l’Oenologie, UMR1083, F-34060 Montpellier, France. 9 Université Montpellier I, Unité Mixte de Recherche Sciences pour l’Oenologie, UMR1083, F-34060, Montpellier, France. 10 Dipartimento di Scienze e Tecnologie Biologiche ed Ambientali (Di.S.Te.B.A.), Università del Salento, via Prov.le Lecce-Monteroni, 73100 Lecce, Italy. 11 Department of Experimental Medicine and Biochemical Sciences, Polo Unico Sant'Andrea delle Fratte, University of Perugia, piazza Università 1, 06132 Perugia, Italy.

  • International Workshop on Human and Bovine Tuberculosis (2015)

    Simposio
    Tuberculosis humana y bovina
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 16
    Nombre de la institución promotora: Institut Pasteur Montevideo Palabras Clave: tuberculosis Mycobacterium One health
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular
    

  • XV Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Biociencias (2014)

    Congreso
    Estudio genómico de proteínas MASP en Trypanosoma cruzi
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 24
    Nombre de la institución promotora: SUB Palabras Clave: Surface multigene families
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática
    

  • Microbiology after the genomics revolution: Genomes 2014 (2014)

    Congreso
    Microbiology after the genomics revolution: Genomes 2014 - Genome-wide characterization of Mycobacterium tuberculosis outbreaks in the low-risk uruguayan population
    Francia
    Tipo de participación: Poster
    Nombre de la institución promotora: EMBO Conference Series Genome-wide characterization of Mycobacterium tuberculosis outbreaks in the low-risk uruguayan population

  • Experimental Approaches to Evolution and Ecology using Yeast & other Model Systems (2014)

    Congreso
    Experimental Approaches to Evolution and Ecology using Yeast & other Model Systems - Social wasps are mating nests for yeasts
    Alemania
    Tipo de participación: Poster
    Nombre de la institución promotora: EMBO Conference Series Social wasps are mating nests for yeasts Stefanini I.1, Dapporto L.2, Berná L.3, Polsinelli M.4, Turillazzi S.4,5, Cavalieri D.1,6

  • Symbiomes: Systems Metagenomics of Host Microbe interactions (2013)

    Congreso
    International 3-day Workshop and Winter School of FIRS> PhD Programme. Symbiomes: Systems Metagenomics of Host Microbe interactions
    Italia
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 24
    Nombre de la institución promotora: Fondazione Edmund Mach Palabras Clave: metagenomica levadura
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica Evolutiva
    Evolutionary genomics of Saccharomyces cerevisiae populations. Using next generation sequencing to describe evolutionary trayectories at individual level

  • SNP calling of M28 strains, finding morphology genes (2012)

    Seminario
    Istituto Agrario di San Michele All’adige
    Italia
    Tipo de participación: Expositor oral Palabras Clave: variacion genetica polimorfismos
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica Evolutiva
    

  • Joint Meeting AGI-SIBV-SIGA (2011)

    Congreso
    Joint Meeting AGI-SIBV-SIGA
    Italia
    Tipo de participación: Poster Palabras Clave: Systems Biology
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución
    “Friend or Foe: Using System Biology to elucidate the interaction between fungi and their hosts”

  • 4th Joint RECOMB Conference on Regulatory Genomics, Systems Biology, and DREAM Challlenges (2011)

    Congreso
    4th Joint RECOMB Conference on Regulatory Genomics, Systems Biology, and DREAM Challlenges
    España
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 18 Palabras Clave: Systems Biology Networks
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Bioinformatica
    Phylogenomics applied to Saccharomyces cerevisiae strains reveals genes with high evolutionary resolution

  • Molecular Evolution in the Genomic Era (2011)

    Congreso
    Molecular Evolution in the Genomic Era
    Italia
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Carga horaria: 26
    Nombre de la institución promotora: Universidad de Roma III. Revista Genome Biology and Evolution Palabras Clave: Evolucion genomica
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Evolución Molecular
    "Fast evolving Tunicates, Patterns and rates of amino acid evolution"

  • Internal Seminar SZN (2010)

    Seminario
    Compatative genome analyses of Deuterostomes
    Italia
    Tipo de participación: Expositor oral "Metabolism and base compositions of tunicates, fish and mammals genomes"

  • Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution (2010)

    Congreso
    Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution
    Francia
    Tipo de participación: Poster Palabras Clave: Evolution GC content
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica Evolutiva
    “Metabolic rate and genomic GC. What we can learn from teleost fish”

  • (2009)

    Congreso
    150 years of Darwin’s Evolutionary Theory: a South American Celebration
    Uruguay
    Tipo de participación: Palabras Clave: Evolution
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica Evolutiva
    

  • XII Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Biociencias (2007)

    Congreso
    Identificación y anotación de genes codificantes de proteínas variables de superficie en tripanosomas africanos
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral Palabras Clave: Evolucion
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Estadistica
    

  • V Reunión de la Sociedad Latinoamericana de Fitoquímica (2006)

    Congreso
    Estudio de la producción de fenólicos en cultivos in vitro de Achyrocline flaccida
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster Palabras Clave: Cultivo celular
    

  • V Reunión de la Sociedad Latinoamericana de Fitoquímica (2006)

    Congreso
    Establecimiento de suspensiones celulares de Achyrocline flaccida para el estudio y producción de metabolitos secundarios
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster Palabras Clave: Cultivo celular metabolitos secundarios
    

• Jurado/Integrante de comisiones evaluadoras de trabajos académicos

  • Búsqueda de genes bajo selección asociados a la invasión del nicho subterráneo en roedores octodontoideos (2024)

    Candidato: Joaquín Arzeno
    Tipo Jurado: Pregrado
    BERNA, L. , Da Silva C. C.
    1992 - LICENCIATURA EN CIENCIAS BIOLOGICAS / Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Uruguay
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Palabras Clave: Evolución selección natural polimorfismos
    

  • Comisión de Admisión y Seguimiento - Annotation and functional characterization of lncRNAs in Trypanosoma cruzi (2024)

    Candidato: Paola Sosa
    Tipo Jurado: Tesis de Doctorado
    BERNA, L. , RODRÍGUEZ-CASURIAGA, R. , TOSAR, J.P.
    Doctorado en Ciencias Biológicas , PEDECIBA / Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Uruguay
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Proyecto: Annotation and functional characterization of lncRNAs in Trypanosoma cruzi

  • Comisión de Admisión y Seguimiento - Circadian rhythms in the Uruguayan population. Incidence of environmental, social, behavioral and genetic factors (2023)

    Candidato: Mariana Marchesano
    Tipo Jurado: Tesis de Doctorado
    BERNA, L. , FARIELLO, M.I. , ESTEVAN, I.
    Doctorado en Biología, PEDECIBA / Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Uruguay
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Proyecto: ? Circadian rhythms in the Uruguayan population. Incidence of environmental, social, behavioral and genetic factors?

  • Comisión de Admisión y Seguimiento - Estudios computacionales de fusógenos celulares y su rol en la eucariogénesis (2022)

    Candidato: Mauricio Langleib
    Tipo Jurado: Tesis de Doctorado
    BERNA, L. , PAOLA BERMOLEN , TRAJTENBERG, F
    Doctorado en Ciencias Biológicas , PEDECIBA / Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Uruguay
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    

  • Comisión de Admisión y Seguimiento - Strain improvement of Beauveria bassiana for biocontrol of the redbanded stink bug Piezodorus guildinii (2021)

    Candidato: Hector Luis Oberti
    Tipo Jurado: Tesis de Doctorado
    PONCE DE LEON, I. , BERNA, L. , LUPO, S
    PEDECIBA - Biologia / Sector Gobierno/Público / Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria / INIA / Uruguay
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Palabras Clave: Comisión de Seguimiento CAS
    

  • Comisión de Admisión y Seguimiento - "Rol funcional de las proteínas MARCKS durante la morfogénesis del tubo neural en pez cebra (Danio rerio ) (2020)

    Candidato: Lucía Veloz Castro
    Tipo Jurado: Tesis de Doctorado
    BERNA, L. , CHIFFLET, S. , Prieto D
    PEDECIBA Biología / Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Uruguay
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    

  • Comisión de Admisión y Seguimiento - Aproximaciones ómicas y genómica funcional para la validación de blancos moleculares de potenciales agentes antichagásicos (2017)

    Candidato: Florencia Mosquillo
    Tipo Jurado: Tesis de Doctorado
    BERNA, L. , ALVAREZ MN , PARODI-TALICE, A.
    Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas (PEDECIBA) / Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Uruguay
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Palabras Clave: Trypanosoma cruzi genómica proteomica blancos moleculares
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática
    

  • Comisión de Admisión y Seguimiento - Estudio de la regulación global de la traducción en el ciclo celular de Trypanosoma cruzi (2017)

    Candidato: Santiago Chávez
    Tipo Jurado: Tesis de Doctorado
    BERNA, L. , PARODI-TALICE, A. , FABIANO, E.
    Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas (PEDECIBA) / Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Uruguay
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Palabras Clave: Trypanosoma cruzi traducción ciclo celular regulación
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática
    

• Construcción institucional

  Construcción Institucional

  Mi interés en la construcción institucional se ha reflejado en la participación activa en diversas actividades de fortalecimiento organizacional y de vinculación con la comunidad en los espacios donde he trabajado.

  2024 (En desarrollo): Co-fundadora de la Sociedad Uruguaya de Bioinformática (SUBI) como seccional de la Sociedad Uruguaya de Biociencias (SUB). Actualmente trabajando en su desarrollo e institucionalización.

  
  

  2022 - 2024: Representante de los investigadores en el Consejo Científico del Área (CCA) de PEDECIBA Biología.

  2021 - 2022: Representante de los investigadores en el Consejo Científico del Área (CCA) de PEDECIBA Biología.

  2019 - 2020: Miembro del Consejo Académico del Institut Pasteur de Montevideo, en calidad de delegada del Colectivo de Investigadores, Técnicos y Estudiantes (CITE).

  2019: Delegada del Colectivo de Investigadores, Técnicos y Estudiantes (CITE) del Institut Pasteur de Montevideo.

  2019: Miembro de la Comisión de Seminarios del Institut Pasteur de Montevideo.

  2017 - Actualidad: Miembro de la Comisión de Predio del Institut Pasteur de Montevideo.

  
  

  Actividades de divulgación científica y vinculación con la comunidad: 
  Participación anual en visitas guiadas para grupos escolares y liceales al Institut Pasteur de Montevideo (2 a 4 veces por año).
  Participación anual en jornadas de puertas abiertas y actividades relacionadas con el Día Internacional de la Mujer y la Niña en la Ciencia, así como el Día Internacional de la Mujer.
  Colaboración en actividades de divulgación científica, incluyendo entrevistas, generación de videos educativos, talleres en escuelas y otras iniciativas de comunicación científica.

  
  

Indicadores de producción