• Datos Generales

    • Institución principal

      Universidad de la República/ Facultad de Medicina / Departamento de Métodos Cuantitativos / Uruguay
    • Dirección institucional

      Institución: Universidad de la República / Facultad de Medicina / Sector Educación Superior/Público
      / Departamento de Métodos Cuantitativos
      Dirección: Av. General Flores 2125 / 11800
      País: Uruguay / Montevideo / Montevideo
      Teléfono: 29243414
      Correo electrónico/Sitio Web: ataboada@gmail.com
  • Formación

    • Formación académica

      • Concluida

        • Maestría

          • PEDECIBA (2021 - 2026)
            Universidad de la República - Centro de Investigaciones Biomédicas , Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Consecuencias estructurales y funcionales de la nitración de tirosinas en proteínas celulares: el caso de la chaperona Hsp90
            Tutor/es: Ari Zeida
            Descripción del título obtenido: Maestría en Bioinformática
            Obtención del título: 2026
            Sitio web de la disertación/tesis/defensa: https://www.colibri.udelar.edu.uy/jspui/handle/20.500.12008/53805
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
        • Grado

          • Licenciatura de Bioquímica (2013 - 2019)
            Universidad de la República - Facultad de Ciencias, Laboratorio de Neurociencias , Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Análisis de la expresión de Cofilina 1 en la a corteza visual de ratón
            Tutor/es: Francesco Mattia Rossi
            Obtención del título: 2019
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Neurociencias /
      • En Marcha

        • Doctorado

          • PEDECIBA Biología (2026)
            Institut Pasteur de Montevideo, Institut Pasteur de Montevideo ,Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Predicción computacional de funciones en bacterias no modelo
            Tutor/es: Flavio Pazos
    • Formación complementaria

      • Concluida

        • Cursos de corta duración

          • Radicales libres y procesos redox en Biomedicina (05/2023 - 05/2023)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Centro de Investigaciones Biomédicas , Uruguay
            54 horas
          • Escuela de Modelado de Biomoléculas (07/2021 - 07/2021)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Ciencias Exactas, Universidad de Buenos Aires , Argentina
            80 horas
          • Enzimología (03/2021 - 05/2021)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
            77 horas
          • Biología y Bioquímica de 18 horas presenciales. (02/2017 - 02/2017)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universitat Autónoma de Barcelona , España
            18 horas
  • Idiomas

    • Inglés
      Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien
  • Areas de actuación

    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias Biológicas /Bioquímica y Biología Molecular
    • Ciencias Médicas y de la Salud

      Medicina Básica /Neurociencias
    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias de la Computación e Información /Ciencias de la Información y Bioinformática
    • Ciencias Naturales y Exactas

      Matemáticas /Estadística y Probabilidad
  • Actuación profesional

    • Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

      Facultad de Medicina / Unidad Académica de Métodos Cuantitativos

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (05/2025 - a la fecha)Trabajo relevante
          Asistente 20 horas semanales
          Escalafón: Docente
          Grado: Grado 2
          Cargo: Efectivo
    • Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas - Institut Pasteur de Montevideo - Uruguay

      Institut Pasteur de Montevideo

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (04/2025 - a la fecha)
          Ayudante/Investigador 15 horas semanales
          Cargo para trabajar en el marco del proyecto "Identificación de nuevos componentes del divisoma y el elongasoma de Mycobacteriales"
      • Actividades

        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • Identificación de nuevos componentes del divisoma y el elongasoma de Mycobacteriales (04/2025 - a la fecha)
            Código: FCE_3_2024_1_180926 El objetivo es identificar proteínas desconocidas que participan en la división y elongación de Mycobacteriales usando una combinación de proteómica experimental, análisis de ubicación de genes en el genoma, y modelos de aprendizaje automático. Los candidatos más prometedores que arrojen los modelos se validarán luego en el laboratorio.
            15 horas semanales
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Doctorado:1
            Equipo: A. Taboada
    • Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

      Facultad de Medicina / Departamento de Métodos Cuantitativos

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (08/2022 - 05/2025)Trabajo relevante
          Ayudante Grado 1 24 horas semanales
          Escalafón: Docente
          Grado: Grado 1
          Cargo: Efectivo
    • Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

      Centro de Investigaciones Biomédicas

      • Vínculos con la Institución

        • Becario (03/2021 - 03/2023)Trabajo relevante
          40 horas semanales
          Estudiante de la maestría en bioinformática PEDECIBA. Becario ANII
    • Sector Gobierno/Público - Ministerio de Educación y Cultura - Uruguay

      Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Laboratorio de Neurofisiología Celular y Molecular

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (09/2019 - 12/2019)
          Ayudante homologado a grado 1 20 horas semanales
    • Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

      Facultad de Ciencias

      • Vínculos con la Institución

        • Otro (10/2016 - 10/2019)
          30 horas semanales
          Escalafón: No Docente
      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • cofilina (10/2016 - 10/2019 )
            Análisis del rol de la Cofilina 1 en los procesos de plasticidad estructural y funcional de la corteza visual del ratón.
            Fundamental
            30 horas semanales , Integrante del equipo
            Equipo: F.M. ROSSI
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Neurociencias /
        • Pasantías

          • Pasantía de grado en el Laboratorio de Neurosciencias (Unidad Neuroplasticidad), Facultad de Ciencias (10/2016 - 10/2019 )
            30 horas semanales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Neurociencias /
    • Sector Gobierno/Público - Ministerio de Educación y Cultura - Uruguay

      Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Laboratorio de Biología Celular

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (09/2018 - 12/2018)
          Pasante 20 horas semanales
    • Sector Gobierno/Público - Ministerio de Educación y Cultura - Uruguay

      Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Laboratorio de Neurofisiología

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (08/2016 - 12/2016)
          Pasante 20 horas semanales / Dedicación total
  • Carga horaria

    • Carga horaria de docencia: 24 horas
    • Carga horaria de investigación: 20 horas
    • Carga horaria de formación RRHH: Sin horas
    • Carga horaria de extensión: Sin horas
    • Carga horaria de gestión: Sin horas
  • Producción científica/tecnológica

    • Realicé la pasantía de grado en el laboratorio de Neurociencias de la Facultad de Ciencias.  El trabajo se basó en caracterizar la expresión de la Cofilina 1 en la corteza visual de ratón durante el desarrollo postnatal en función de la edad de los individuos, y relacionarla con los diferentes niveles de plasticidad. De esta forma, se pudo contribuir a elucidar el rol que juega la Cofilina 1 en los mecanismos celulares y moleculares de plasticidad en la corteza visual de ratón. 

      Realicé el proyecto de maestría dentro del CEINBIO (Centro de Investigaciones Biomédicas), Facultad de Medicina.  Este proyecto consistió en analizar en detalle molecular (mediante simulaciones de dinámica molecular) factores estructurales asociados a los cambios funcionales de la proteína Hsp90(Beta) de Humano, luego de la nitración en algunos de sus residuos de Tirosina. 

      En paralelo me desempeño como docente con un cargo de Asistente Grado 2 en el Departamento de Métodos Cuantitativos, Facultad de Medicina. En dicho departamento se dictan clases de cursos vinculados con la Probabilidad y Estadística para estudiantes de medicina de distintos años.

      Actualmente me desempeño como asistente de investigación en el Institut Pasteur de Montevideo, en el marco de un proyecto financiado por el Fondo Clemente Estable. En este contexto, me encuentro realizando el Doctorado, participando en el proyecto “Predicción computacional de funciones en bacterias no modelo”, orientado al desarrollo y aplicación de métodos de aprendizaje automático para la predicción de funciones génicas en bacterias poco caracterizadas.



  • Producción bibliográfica

    • Artículos publicados

      • Arbitrados

        • Nitration-Driven Structural changes in Hsp90 linked to gain of pathological functions (Completo, 2025)Trabajo relevante
          Alfonso Taboada , Tilottama Chatterjee , Isabelle E. Logan , Patience N. Pau , Patrick Reardon , Rafael Radi , Ari Zeida , Maria Clara Franco
          Biochemical Journal, 2025
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 02646021
          E-ISSN: 14708728

        • Proteomic Identification of Cofilin 1 as a candidate protein associated to mouse visual cortex plasticity (Completo, 2020)Trabajo relevante
          A. Taboada
          Neuroscience Letters, 2020
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 03043940

  • Publicación de trabajos presentados en eventos

    • Neuropilin-2 (NRP2) but not neuropilin-1 (NRP1) regulates sympathetic axon outgrowth inhibition by estrogenized myometrial explants in 3D co-cultures (2020)
      A. Taboada , A.Richeri , G.Vierci , G.Martinez , I.Sosa , M.Brauer
      Publicado
      Completo
      Evento: Regional
      Descripción: congreso de la Sociedad Argentina de Neurociencias
      Año del evento: 2020
  • Otros datos relevantes

    • Premios, Honores y Títulos

      • Beca de Maestría de la ANII (2021)
        (Nacional)
        ANII
        Obtención de la beca de Maestría de la ANII por un período de dos años en el marco del proyecto "Consecuencias estructurales y funcionales de la nitración de tirosinas en proteínas celulares: el caso de la chaperona Hsp90"
    • Presentaciones en eventos

      • 1er Congreso Regional CICADA: Ciencia de Datos, Aprendizaje automático e Inteligencia Artificial (2025)
        Congreso
        Presentación de un proyecto doctoral orientado al desarrollo de estrategias computacionales basadas en aprendizaje automático para la predicción de funciones génicas en bacterias Mycobacteriales.
        Uruguay
        Tipo de participación: Poster
        Nombre de la institución promotora: Centro Interdisciplinario en Ciencia de Datos y Aprendizaje Automático (CICADA)
        Alcance geográfico: Regional
      • XII reunión de la Sociedad Latinoamericana de Tuberculosis y otras Micobacteriosis (2025)
        Congreso
        Presentación de un proyecto doctoral orientado al desarrollo de estrategias computacionales basadas en aprendizaje automático en grafos para la predicción de funciones génicas en bacterias poco caracterizadas, integrando datos multi-ómicos, interactómica y enriquecimiento funcional local.
        Uruguay
        Tipo de participación: Poster
        Nombre de la institución promotora: Sociedad Latinoamericana de Tuberculosis y otras Micobacteriosis (SLAMTB)
        Alcance geográfico: Regional
      • XIII Jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (SBBM) (2023)
        Congreso
        Consecuencias estructurales y funcionales de la nitración de tirosinas en proteínas celulares: el caso de la chaperona Hsp90
        Uruguay
        Tipo de participación: Poster
        Nombre de la institución promotora: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular
        Alcance geográfico: Nacional
      • 30th Annual Conference of the Society for Redox Biology and Medicine (SfRBM) (2023)
        Congreso
        Consecuencias estructurales y funcionales de la nitración de tirosinas en proteínas celulares: el caso de la chaperona Hsp90
        Uruguay
        Tipo de participación: Expositor oral
        Nombre de la institución promotora: Society for Redox Biology and Medicine
        Alcance geográfico: Internacional
      • LI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biofísica (SAB) (2023)
        Congreso
        Consecuencias estructurales y funcionales de la nitración de tirosinas en proteínas celulares: el caso de la chaperona Hsp90
        Argentina
        Tipo de participación: Poster
        Nombre de la institución promotora: Sociedad Argentina de Biofísica
        Alcance geográfico: Internacional
      • VII Simposio CEINBIO (2022)
        Simposio
        Consecuencias estructurales y funcionales de la nitración de tirosinas en proteínas celulares: el caso de la chaperona Hsp90
        Uruguay
        Tipo de participación: Poster
        Alcance geográfico: Regional
  • Indicadores de producción

    Actividades

    3
    Líneas de investigación
    1
    Proyectos Investigación Desarrollo
    1
    Pasantia
    1

    Producción bibliográfica

    3
    Artículos publicados en revistas científicas
    2
    Completo 2
    Trabajos en eventos
    1