Datos Generales

• Institución principal

  Universidad Tecnológica/ Instituto Tecnológico Regional Centro-Sur / Laboratorio de Microbiología Ambiental y Biotecnología (LabMAB) / Uruguay

• Dirección institucional

  Institución: Universidad Tecnológica / Instituto Tecnológico Regional Centro-Sur / Sector Educación Superior/Público
  / Laboratorio de Microbiología Ambiental y Biotecnología (LabMAB)
  Dirección: Mciel / 97000
  País: Uruguay / Durazno / Durazno
  Teléfono: (+598) 24871616
  Correo electrónico/Sitio Web: patricia.bovio@utec.edu.uy https://utec.edu.uy/es/sobre-utec/utec-en-territorio/centro-sur/
  

Formación

• Formación académica

  • Concluida

    • Doctorado

      • Doctorado en Biotecnología (2015 - 2021)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Estudio de microorganismos de importancia biotecnológica en reactores metanogénicos para producir energía a partir de desechos.
        Tutor/es: Dra. Claudia Etchebehere.
        Obtención del título: 2021
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay

      Maestría

      • Maestría en Biotecnología (2014 - 2015)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Estudio de microorganismos no cultivables del filo Chloroflexi que pueden causar problemas en reactores metanogénicos
        Tutor/es: Angela Cabezas Da Rosa
        Obtención del título: 2015
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
        Palabras Clave: Chloroflexi metanogénicos
        Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología Medioambiental / Microbiología, Producción de energía

    • Grado

      • Licenciatura en Bioquímica (2006 - 2013)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Efecto del agregado de suplementos enzimáticos en la comunidad microbiana de reactores metanogénicos de tratamiento de efluentes de industria láctea
        Tutor/es: Claudia Etchebehere
        Obtención del título: 2013
        Palabras Clave: Metanogénesis
        Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología Medioambiental / Microbiología, Producción de energía

• Formación complementaria

  • Concluida

    • Posdoctorados

      • Descubriendo el rol de microorganismos no cultivados del filo Chloroflexi en sistemas de tratamiento de aguas residuales a través de la metatranscriptómica (2021 - 2024)

        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Departamento de bioquímica y genómica microbiana , Uruguay
        Financiación:
        Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay

    • Cursos de corta duración

      • Hands-on metagenomics data analysis: tools for bioprospection in clinical and environmental microbiology (09/2017 - 10/2017)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay

      • Curso de microbiología de fangos activos industriales (02/2017 - 09/2017)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universidad de Andalucía , España
        Palabras Clave: Reactor Aerobio

      • Eliminación biológica de nitrógeno de las aguas residuales (07/2017 - 07/2017)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Red Temática CYTED , España

      • Curso de tratamiento y reciclaje de aguas residuales industriales mediante soluciones sostenibles. (01/2016 - 01/2016)

        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay

      • X Curso Latinoamericano de Biotecnología (01/2016 - 01/2016)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Pontifica Univ. Católica de Valparaíso , Chile

      • Microscopía confocal y análisis de imágenes aplicadas a la microbiología. (01/2016 - 01/2016)

        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay

      • Aplicaciones de la PCR en Tiempo Real a la Investigación (01/2014 - 01/2014)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina , Uruguay
        36 horas

      • Gestión de colecciones y conservación de Microorganismos (01/2014 - 01/2014)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        32 horas

      • Profundización en metabolismo microbiano: diversidad metabólica de los microorganismos (01/2014 - 01/2014)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Química , Uruguay
        30 horas

      • Ingeniería de Bioprocesos (01/2013 - 11/2013)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        Palabras Clave: Fermentación Biorreactores
        Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología Medioambiental / Microbiología, Producción de energía

      • III Escuela Regional de Microbiología (01/2013 - 01/2013)

        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
        Palabras Clave: secuenciación masiva Bioinformatica

      • Mass Spectrometry (MS) in Proteomics (01/2012 - 01/2012)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
        38 horas

    • Participación en eventos

      • XIV Latin American Workshop and Symposium on Anaerobic Digestion (2023)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Universidad Nacional Autónoma de Mexico, México
        Alcance geográfico: Internacional

      • ALAM (2023)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Ecuatoriana de Microbiología, Ecuador
        Alcance geográfico: Internacional

      • ISME Lat (2023)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Universidad Nacional de Quilmes Bernal - Buenos Aires, Argentina
        Alcance geográfico: Internacional

      • ISME (2022)

        Tipo: Congreso
        Alcance geográfico: Internacional

      • Congreso de Biociencias (2022)

        Tipo: Congreso
        Alcance geográfico: Nacional

      • Latin American Meetings on Anaerobic Digestion (2020)

        Tipo: Congreso
        Alcance geográfico: Internacional

      • Congreso YWP (2019)

        Tipo: Congreso
        Alcance geográfico: Internacional

      • Congreso MEWE (2019)

        Tipo: Congreso
        Alcance geográfico: Internacional

      • 1er Congreso ISME Latinamericano (2019)

        Tipo: Congreso
        Alcance geográfico: Internacional

      • Congreso de Biociencias (2019)

        Tipo: Congreso
        Alcance geográfico: Nacional

      • II Jornada de la Red Interinstitucional de Metagenómica Ambiental (RIMA). (2019)

        Tipo: Simposio
        Institución organizadora: UdelaR, Intituto Pasteur, Uruguay

      • POLAR 2018 - Where the Poles come together (2018)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Scientific Committee on Antarctic Research SCAR and the International Arctic Science Committee IASC, Suiza
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Tierra y relacionadas con el Medio Ambiente / Ciencias de la Tierra y relacionadas con el Medio Ambiente / Arqueas metanogénicas en ambientes fríos

      • Congreso Latinoamericano de Microbiología (2018)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad de Microbiología de Chile- SOMICH, Chile
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Tierra y relacionadas con el Medio Ambiente / Ciencias Medioambientales /

      • III Encuentro Nacional de Jóvenes Microbiólogos (2018)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Microbiología, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Tierra y relacionadas con el Medio Ambiente / Ciencias de la Tierra y relacionadas con el Medio Ambiente / Microbiología de sistemas de tratamiento de aguas residuales

      • XII Encuentro Nacional de Microbiólogos y II Encuentro Nacional de Virólogos. (2016)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Asociacion Latinoamericana de Microbiologia, Uruguay

      • XXIII Congreso Latinoamericano y XIV Congreso Argentino de Microbiología. (2016)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Asociacion Latinoamericana de Microbiologia, Argentina

      • XI Encuentro Nacional de Microbiólogos. (2015)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Microbiología, Uruguay

      • VIII Congreso Latinoamericano de Ciencia Antártica (2015)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Instituto antártico Uruguayo, Uruguay
        Palabras Clave: Antártida Desnitrificación

      • XXII Congreso Latinoamericano de Microbiología - ALAM (2014)

        Tipo: Congreso
        Palabras Clave: Chloroflexi Reactores Metanogénicos
        Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología Medioambiental / Microbiología, Producción de energía

      • Pasantía: Estudio de crecimiento de organismos del filo Chloroflexi en reactores anaerobios en batch-alimentados operados con baja carga de alimentación y sin alimentación. (2014)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Laboratorio de BioProA, Facultad de Ingeniería. Tutor/a: MSc. Cecilia Callejas, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología Medioambiental / Microbiología, Producción de energía

      • 3er Encuentro Nacional de Ciencias Químicas (ENAQUI 3.0) (2013)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: PEDECIBA, Facultad de Química, Uruguay
        Palabras Clave: Antártida Biorremediación Desnitrificante
        Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología Medioambiental / Microbiología, Producción de energía

      • X Encuentro Nacional de Microbiólogos (2013)

        Tipo: Encuentro
        Palabras Clave: Microbiología Antártida
        Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología Medioambiental / Microbiología, Producción de energía

      • QIIME: a tool for the analysis of high-throughput microbiome data (2013)

        Tipo: Taller

      • XXI Congreso Latinoamericano de Microbiología (2012)

        Tipo: Congreso
        Palabras Clave: Antártida Desnitrificación
        Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología Medioambiental / Microbiología, Producción de energía

      • I WORKSHOP SUL-AMERICANO DE MICROBIOLOGIA POLAR (2012)

        Tipo: Taller
        Palabras Clave: Microbiología Antártida
        Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología Medioambiental / Microbiología, Producción de energía

      • Pasantía: Desarrollo de reactivos fluorescentes para identificar y etiquetar nitrosotioles biológicos (2010)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Laboratorio de Fisicoquímica Biológica, Facultad de Ciencias. Tutor/a: Ana Denicola, Uruguay

    • Otras instancias

      • Pasantía de investigación: Metagenomas aplicados al estudio de reactores de producción de hidrogeno?. (2024)

        Italia

      • Pasantía de investigación: Metagenomas aplicados al estudio de sistemas de tratamiento de aguas residuales (2018)

        Argentina

      • Pasantía de investigación: Desarrollo de una metodología operacional para determinar la factibilidad de tratamiento anaerobio de compuestos de difícil degradación mediante genómica funcional (2016)

        Chile

Idiomas

• Inglés

  Entiende bien / Habla bien / Lee bien / Escribe bien

Areas de actuación

• Ingeniería y Tecnología

  Biotecnología del Medio Ambiente /Biotecnología Medioambiental /Microbiología de sistemas de tratamiento de aguas residuales

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Biología Celular, Microbiología /Ecología microbiana

Actuación profesional

• Sector Gobierno/Público - Agencia Nacional de Investigación e Innovación - Uruguay

  Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Laboratorio de Ecología Microbiana

  • Vínculos con la Institución

    • Colaborador (11/2024 - a la fecha)

      Investigador 20 horas semanales
      Cargo por 20 horas semanales como investigadora en el proyecto "Diseño de sistema para evitar la inhibición del sistema biológico en la planta de tratamiento de la Refinería de La Teja" (FSE_S_2023_1_179126). Actividades desarrolladas en el Instituto de investigaciones Biológicas Clemente Estable

    • Colaborador (05/2024 - a la fecha)

      Investigador 20 horas semanales
      Cargo por 20 horas semanales como investigadora en el proyecto "Emisiones de N2O en la Antártida: ¿quién realiza el proceso a bajas temperaturas?" Actividades desarrolladas en el Instituto de investigaciones Biológicas Clemente Estable

    • Colaborador (05/2022 - a la fecha)

      Investigador 5 horas semanales

    • Colaborador (04/2021 - 10/2023)

      Responsable Cientifico 20 horas semanales
      Responsable científico del proyecto "Descubriendo el rol de microorganismos no cultivados del filo Chloroflexi en sistemas de tratamiento de aguas residuales a través de la metatranscriptómica" (FCE_3_2020_1_162450). Actividades desarrolladas en el Instituto de investigaciones Biológicas Clemente Estable

    • Colaborador (10/2018 - 03/2022)

      Investigador 5 horas semanales

    • Becario (08/2016 - 08/2019)

      Beca de Doctorado- ANII 30 horas semanales

    • Colaborador (12/2015 - 12/2017)

      1 hora semanal
      Tratamiento y reciclaje de aguas industriales mediante soluciones sostenibles fundamentadas en procesos biológicos (TRITÓN). Programa Iberoamericano: Ciencia y Tecnología para el Desarrollo (CYTED). Red CYTED 316RT0508. http://triton-cyted.com/?page_id=110. Cargo: Integrante de equipo, honorario. Responsable de proyecto: Julián Carrera Muyo (Universidad Autónoma de Barcelona, España).

    • Colaborador (05/2015 - 05/2016)

      Integrante de Equipo. Grado 1 20 horas semanales
      Hacia la aplicación de la producción de bio-hidrógeno como energía mediante la valorización de subproductos industriales

    • Becario (03/2014 - 03/2016)Trabajo relevante

      Beca de Maestría 30 horas semanales
      Estudio de microorganismos no cultivables del filo Chloroflexi que pueden causar problemas en reactores metanogénicos.

    • Colaborador (03/2013 - 03/2015)Trabajo relevante

      Integrante de Equipo. Grado 1 20 horas semanales
      Diversidad de organismos no cultivables del filo Chloroflexi en reactores metanogénicos; ¿cuál es su rol en estos ecosistemas?

    • Becario (08/2012 - 08/2013)

      Beca de iniciación a la investigación- ANII 20 horas semanales
      Desnitrificación en diferentes ecosistemas de la Antártida.

  • Actividades

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Chloroflexi en sistemas de tratamiento de aguas residuales: ¿amenazas o guardianes del ecosistema? (05/2022 - a la fecha)

        El filo Chloroflexi se encuentra frecuentemente en diferentes tipos de sistemas de tratamiento de aguas residuales. Sin embargo, no se conoce completamente su rol ni su relevancia para los procesos. Son considerados parte de la ?materia oscura microbiana? ya que se detectan a través de su ADN/ARN pero se conoce muy poco de su ecología. El principal problema es que son muy difíciles de aislar en cultivo puro lo que dificulta analizar sus propiedades fisiológicas. Se han detectado en sistemas biológicos de tratamiento de aguas residuales tanto anaerobios comoaerobios e incluso en sistemas de remoción de nitrógeno. La mayoría presentan morfología filamentosa y se postula que pueden ser fundamentales para formar agregados microbianos que retienen la biomasa dentro de los reactores logrando un adecuado funcionamiento de los sistemas. También se ha propuesto que podrían tener un rol como ?scavengers? degradando restos celulares. Por otro lado, su sobrecrecimiento, ha sido reportado como agente causante de episodios de bulking. En dichos episodios, el sobrecrecimiento de bacterias filamentosas causa la flotación de la biomasa disminuyendo su sedimentabilidad, causando graves problemas operacionales. Las investigadoras proponentes hemos estudiado estos microorganismos en diversos sistemas de nuestro país utilizando diferentes metodologías (secuenciación masiva, FISH, qPCR, metagenómica y ensamblado de genomas). Si bien hemos avanzado en el conocimiento aún no hemos podido dilucidar completamente el rol de estos microorganismos. En este proyecto proponemos un enfoque diferente combinado la operación de reactores de laboratorio con el análisis molecular. La operación de reactores de laboratorio nos permitirá confirmar o descartar las hipótesis planteadas previamente. Se aplicará herramientas de vanguardia en el estudio de microbiomas incluyendo la meta-transcriptómica. Se generará conocimiento de punta sobre un grupo de microorganismos muy poco conocidos que cumplen un rol fundamental como guardianes de los ecosistemas biológicos de tratamiento de aguas residuales.
        5 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: BOVIO-WINKLER, P. , Etchebehere, C , CABEZAS, A

      • Bulking filamentoso - causas y soluciones: una mirada microbiológica (05/2022 - a la fecha)

        Los sistemas de lodos activados son muy utilizados para el tratamiento de aguas residuales. A pesar de que son sistemas muy robustos uno de sus principales problemas es el bulking filamentoso (sobre-crecimiento de bacterias filamentosas). Cuando ocurre este problema la biomasa pierde densidad, se flota causando graves problemas ambientales y altos costos de operación. A pesar de los esfuerzos de investigación a nivel mundial, aún no se ha logrado solucionar este problema. El principal escollo es la identificación de estos organismos ya que pertenecen a varios grupos filogenéticos, muchos de ellos no cultivables. Mediante microscopía clásica no es posible una identificación certera por lo cual es necesario utilizar herramientas basadas en el ADN para identificarlas. Según el grupo al que pertenezcan serán las condiciones que producen su sobrecrecimiento. Este proyecto tiene como objetivo realizar un estudio global y buscar soluciones al problema de bulking filamentoso en sistemas de tratamiento de lodos activados del país. Se realizará un primer diagnóstico y se seleccionaran plantas de tratamiento con problemas en las cuales se realizará un monitoreo de la microbiología durante un año mediante técnicas de secuenciación e hibridación-in-situ-fluorescente. Se buscará parámetros operacionales asociados con los problemas de bulking correlacionando datos microbiológicos, químicos, fisicoquímicos y operacionales. Se testeará experimentalmente en reactores escala laboratorio si dichos parámetros causan bulking filamentoso y se estudiará la eficacia de agentes de control utilizados en nuestro medio. Se dictará un curso técnico y se elaborará un manual sobre control de bulking. Se participará en jornadas con encargados y operarios de las plantas de tratamiento. Se busca aportar conocimiento para controlar un grave problema en sistemas de tratamiento de aguas.
        5 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: BOVIO-WINKLER, P. , CABEZAS, A , Etchebehere

      • Emisiones de N2O en la Antártida:¿quién realiza el proceso a bajastemperaturas? (05/2024 - a la fecha)

        El óxido nitroso (N2O) es un potente gas de efecto invernadero que destruye la capa de ozono,con un potencial de calentamiento global de casi 300 veces mayor al CO2. El N2O puede serproducido por distintos microorganismos mediante desnitrificación, nitrificación y reduccióndesasimilativa de nitrato a amonio (DNRA). Las emisiones de N2O medidas en suelosAntárticos impactados por animales marinos muestran valores comparables con ambientescríticos, como suelos fertilizados y ganaderos. También se ha evidenciado un aumento en laabundancia de genes vinculados a las 3 vías de producción de N2O en suelos impactados. Apesar de esto, la diversidad de microorganismos activos responsables de las emisiones deN2O, ha sido muy poco explorada. En nuestro trabajo previo, se aislaron cepas desnitrificantescon capacidad de producción de N2O a partir de muestras de suelo, sedimentos y agua de laAntártida marítima. Sin embargo, no se pudieron detectar los genes responsables de ladesnitrificación, sugiriendo la presencia de nuevos genes o vías. En la primera parte de este proyecto se propone secuenciar los genomas de una selección deestas cepas con el objetivo de describir los genes responsables de las emisiones de N2O. En lasegunda parte, propone determinar las vías metabólicas y expresión de genes vinculados a laproducción de N2O mediante metagenómica y metatranscriptómica en muestras de laAntártida marítima. Se determinará también el potencial de producción de N2O de estasmuestras en ensayos de microcosmos. Este proyecto contribuirá al conocimiento sobre losprocesos de producción de N2O en un área muy poco explorada como lo son los ambientesfríos.
        20 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: BOVIO-WINKLER, P. , CABEZAS, A , C. ETCHEBEHERE , Gonzalez, M

      • Diseño de sistema para evitar la inhibición del sistema biológico en la planta de tratamiento de la Refinería de La Teja (11/2024 - a la fecha)

        La propuesta presentada se centra en abordar el problema en la planta de tratamiento de efluentes de la Refinería de La Teja, relacionado con la inhibición de la nitrificación en períodos puntuales. El objetivo general de la propuesta es evitar que el efluente generado en esta planta exceda los límites de vertido permitidos por la normativa ambiental. Para lograr este objetivo, se han establecido varios objetivos específicos y actividades detalladas. Los objetivos específicos incluyen el estudio del flujo y la composición del agua residual que ingresa a la planta, la evaluación del funcionamiento del sistema, el estudio de la microbiología del sistema y la identificación de procesos de inhibición. Además, se busca determinar los niveles de inhibición para los posibles inhibidores, diseñar un plan de alerta temprana para detectar eventos de inhibición y establecer un plan de contingencia en caso de que el influente supere las especificaciones. En resumen, la propuesta busca resolver el problema de inhibición en la planta de tratamiento de efluentes mediante la identificación de inhibidores, la implementación de medidas de alerta temprana y la planificación de contingencias, todo ello con el fin de asegurar que el efluente cumpla con los estándares ambientales y minimizar la posibilidad de interrupción en el sistema biológico.
        20 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: BOVIO-WINKLER, P. , CASTELLÓ, E. , C. ETCHEBEHERE

      • Descubriendo el rol de microorganismos no cultivados del filo Chloroflexi en sistemas de tratamiento de aguas residuales a través de la metatranscriptómica (04/2021 - 10/2023 )

        La clase Anaerolineae perteneciente al filo Chloroflexi es reportada como uno de los grupos predominantes en sistemas de tratamiento de aguas residuales. Sin embargo, su rol en estos sistemas permanece desconocido debido a que son difíciles de cultivar. En la base de datos NCBI hay depositadas 24009 secuencias ambientales pertenecientes a Anaerolineae, pero se han aislado solamente 14 especies (12 géneros). Estos aislamientos son anaerobios o aerobios, fermentan carbohidratos y presentan una tasa de crecimiento baja. Por su morfología filamentosa se ha sugerido un rol importante en la formación de gránulos y flóculos esenciales para retener la biomasa dentro de los reactores. Sin embargo, su sobrecrecimiento genera episodios de bulking causando graves problemas operacionales. Debido a que son bacterias difíciles de cultivar, se desconocen los factores desencadenantes del sobrecrecimiento ni su rol en la formación y estructura de gránulos y flóculos. En un proyecto previo se ensamblaron 17 genomas nuevos de Chloroflexi a partir de metagenomas de un reactor aerobio, un anaerobio y un anammox. A pesar de ser sistemas diferentes los genomas compartieron su potencial metabólico, sin embargo, queda determinar qué vías están activas en las distintas condiciones de operación. En este proyecto se propone ensamblar nuevos genomas de Chloroflexi a partir de metagenomas y determinar su expresión génica a partir de la metatranscriptómica en reactores aerobios y anaerobios que traten distintas aguas residuales. Se generará conocimiento sobre una rama del árbol de la vida dominado por especies no cultivables importantes en sistemas de tratamiento de aguas residuales.
        20 horas semanales
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: BOVIO-WINKLER, P. (Responsable) , Guerrero, Leandro , Erijman, Leonardo , CABEZAS, A , C. ETCHEBEHERE

      • Hidrocarburos y microorganismos: Desarrollo de métodos para la prospección microbiana de hidrocarburos y la bio-remediación de suelos (10/2018 - 03/2022 )

        En la última década el gobierno ha apostado fuertemente a la incorporación de fuentes de energía renovable en la matriz energética del Uruguay. Sin embargo, los hidrocarburos aun conforman el 40% de la matrizenergética mayormente debido a su uso en el sector transporte. Uruguay no es actualmente un país productor de hidrocarburos aunque recientemente se han realizado actividades de exploración onshore y offshore. Existen diversos procesos microbianos que se pueden utilizar en diferentes etapas de la prospección y producción de petróleo que brindan información o resolución a problemas de forma rápida, son amigables con el medioambiente y son menos costosos que otros procesos. En nuestro país, no hay ningún grupo de investigación que profundice en el desarrollo de técnicas microbiológicas relacionadas a la prospección y producción de petróleo. En el presente proyecto proponemos desarrollar y aplicar técnicas microbiológicas para la exploración de hidrocarburos y para la biorremediación de suelos y aguas subterráneas contaminados con petróleo crudo y o derivados. La prospección microbiana de petróleo y gas es una tecnología de exploración de hidrocarburos superficial que ha sido utilizada a nivel mundial. Se basa en la detección de poblaciones microbianas especializadas que se desarrollan en el suelo que se encuentra encima de los depósitos de hidrocarburos. Se propone el desarrollo de métodos dependientes de cultivo y moleculares para la detección de estas bacterias. Con respecto a la bioremediación se propone el desarrollo de consorcios eficientes en degradar hidrocarburos para remediar aguas subterráneas y estudiar el compostaje con residuos orgánicos como estrategia para la biorremediación de suelos contaminados con hidrocarburos. Se espera poder contribuir al desarrollo de metodologías novedosas que permitan aportar a la exploración de petróleo y al cuidado del medio ambiente en los procesos de extracción, refino y comercialización del mismo.
        5 horas semanales
        Laboratorio de Ecología Microbiana
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Especialización:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: BOVIO-WINKLER, P. , C. ETCHEBEHERE , CABEZAS, A (Responsable) , MALAN A.K.

      • Hacia la aplicación de la producción de bio-hidrógeno como energía mediante la valorización de subproductos industriales (05/2015 - 05/2016 )

        .
        20 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Equipo: BOVIO-WINKLER, P.

      • Estudio de microorganismos no cultivables del filo Chloroflexi que pueden causar problemas en reactores metanogénicos. (03/2014 - 03/2016 )

        Tesis de Maestria
        30 horas semanales
        Investigación
        Otros
        Concluido
        Equipo: BOVIO-WINKLER, P.

      • Diversidad de organismos no cultivables del filo Chloroflexi en reactores metanogénicos; ¿cuál es su rol en estos ecosistemas? (03/2013 - 03/2015 )

        
        20 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo:

      • Desnitrificación en diferentes ecosistemas de la Antártida (08/2012 - 08/2013 )

        
        20 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Equipo:

• Sector Educación Superior/Público - Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas - Uruguay

  Área Química (PEDECIBA)

  • Vínculos con la Institución

    • Colaborador (03/2021 - a la fecha)

      Grado 3 10 horas semanales

• Sector Gobierno/Público - Ministerio de Educación y Cultura - Uruguay

  Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Laboratorio de Ecología Microbiana

  • Vínculos con la Institución

    • Otro (07/2012 - a la fecha)

      40 horas semanales

    • Funcionario/Empleado (11/2021 - 10/2024)

      Investigadora Posdoctoral 40 horas semanales

    • Otro (01/2022 - 12/2022)

      Docencia 5 horas semanales

    • Funcionario/Empleado (11/2019 - 10/2021)Trabajo relevante

      Grado 2 30 horas semanales
      Grado 2 en Laboratorio de Ecología Microbiana, BIOGEM.

    • Otro (10/2020 - 10/2020)

      Responsable curso practico 45 horas semanales

    • Funcionario/Empleado (07/2017 - 10/2019)

      Grado 1 25 horas semanales

  • Actividades

    • Docencia

      • UNU-BIOLAC. Programa de Biotecnología para América Latina y el Caribe. (11/2022 - 11/2022 )

        Especialización
        Invitado

      • Genómica (08/2022 - 09/2022 )

        Grado
        Invitado

      • VI Escuela Regional de Microbiología (10/2020 - 10/2020 )

        Especialización
        Responsable

    • Extensión

      • IIBCE Abierto - Visitas del publico en general - Difusión de las actividades de investigacion (10/2012 - a la fecha )

        1 horas

      • Visitas escolares (10/2012 - a la fecha )

        1 horas

      • Entrevista en El Observador - Las bacterias que "comen" nitrógeno en la Antártida (12/2013 - 12/2013 )

        1 horas

    • Gestión Académica

      • Organización de seminarios del departamento (03/2023 - 12/2023 )

        Otros 1 horas semanales

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Argentina

  Centro Austral de Investigaciones Científicas (CONICET) / INGEBI

  • Vínculos con la Institución

    • Profesor visitante (10/2022 - 11/2022)

      Docente 45 horas semanales
      Genome-centric metagenomics for bioremediation and resource recovery. Curso de posgrado de carácter regional, con financiamiento UNU-BIOLAC, realizado en el Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular ?Dr Héctor N. Torres? (INGEBI- CONICET) in Buenos Aires, Argentina del 31 de octubre al 4 de.

  • Actividades

    • Docencia

      • UNU-BIOLAC (11/2022 - 11/2022 )

        Perfeccionamiento
        Invitado

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Química / Laboratorio de Ecología Microbiana

  • Vínculos con la Institución

    • Becario (07/2011 - 10/2012)

      Pasante de grado 20 horas semanales
      Efecto del agregado de suplementos enzimáticos en la comunidad microbiana de reactores metanogénicos de tratamiento de efluentes de industria láctea.
      Escalafón: No Docente

Carga horaria

• Carga horaria de docencia: Sin horas
  
• Carga horaria de investigación: 40 horas
  
• Carga horaria de formación RRHH: 5 horas
  
• Carga horaria de extensión: Sin horas
  
• Carga horaria de gestión: Sin horas
  

Producción científica/tecnológica

• Desde 2012, he centrado mi investigación en el estudio de comunidades microbianas en diversos ecosistemas, con un énfasis particular en microorganismos no cultivables. Para esto aplicado diversas herramientas de biología molecular, como la hibridación in situ fluorescente (FISH), la secuenciación masiva de amplicones, la metagenómica y la metatranscriptómica, entre otras.

  Mi línea principal de investigación hasta la actualidad se enfoca en el análisis de microorganismos no cultivables presentes en sistemas de tratamiento de aguas residuales. Este tipo de tratamiento biológico es fundamental para la eliminación de contaminantes, como materia orgánica y nutrientes, contribuyendo así a la protección de ecosistemas acuáticos y terrestres. Sin embargo, la mayoría de los microorganismos responsables de estos procesos aún no han sido aislados en cultivo puro, lo que limita nuestro conocimiento sobre su papel específico en estos ecosistemas.

  Mediante el uso de técnicas de biología molecular, he contribuido a generar nuevo conocimiento sobre la diversidad y el metabolismo de grupos microbianos clave, tanto en ecosistemas naturales como en sistemas artificiales. Este conocimiento es esencial para optimizar procesos biotecnológicos y comprender las dinámicas microbianas en entornos complejos.

Producción bibliográfica

• Artículos publicados

  • Arbitrados

    • Global diversity and distribution of antibiotic resistance genes in human wastewater treatment systems (Completo, 2025)

      CONGMIN ZHU , LINWEI WU , DALIANG NING , RENMAO TIAN , SHUHONG GAO , BING ZHANG , JIANSHU ZHAO , YA ZHANG , NAIJIA XIAO , YAJIAO WANG , MATHEW R. BROWN , QICHAO TU , UNDEFINED UNDEFINED , DANY ACEVEDO , MIRIAM AGULLO-BARCELO , JULIANA CALABRIA DE ARAUJO , ÉRIKA FERREIRA DE ABREU MAC CONELL , KEVIN BOEHNKE , PHILIP BOND , CHARLES B. BOTT , PATRICIA BOVIO-WINKLER , REBECCA K. BREWSTER , FAIZAL BUX , ANGELA CABEZAS , LÉA CABROL , SI CHEN , CLAUDIA ETCHEBEHERE , AMANDA FORD , JANETH SANABRIA GÓMEZ , JAMES S. GRIFFIN , APRIL Z. GU , MOSHE HABAGIL , LAUREN HALE , MARC HARMON , HARALD HORN , ZHIQIANG HU , DAVID R. JOHNSON , DEBORAH GARBANI MARCANTINI , ALEXANDER KEUCKEN , SHEENA KUMARI , CINTIA DUTRA LEAL , ZARRAZ MP LEE , YONG LI , ZHENXIN LI , MENGYAN LI , YU LIU , LEDA C. MENDONÇA-HAGLER , FRANCISCA GLEIRE RODRIGUEZ DE MENEZES , ARTHUR J. MEYERS , ANDREW PALMER , PRATHAP PARAMESWARAN , VALERIA REGINATTO , FRANCIS L. DE LOS REYES , SIMONA ROSSETTI , JATINDER SIDHU , KYLIE SMITH , OSCARINA VIANA DE SOUSA , KYLE STEPHENS , CHENXIANG SUN , NICHOLAS B. TOOKER , JOY D. VAN NOSTRAND , STEVE WAKELIN , BEI WANG , JOSEPH E. WEAVER , STEPHANIE WEST , SUNG-GEUN WOO , JER-HORNG WU , LIYOU WU , CHUANWU XI , TAO YAN , MIN YANG , MICHELLE YOUNG , CHIQIAN ZHANG , QIAN ZHANG , WEN ZHANG , WANLIN ZHENG , HONGDE ZHOU , WEIQIN ZHUANG , FENG JU , GEORGE F. WELLS , JIANHUA GUO , ZHILI HE , PER H. NIELSEN , AIJIE WANG , YU ZHANG , TING CHEN , QIANG HE , CRAIG S. CRIDDLE , MICHAEL WAGNER , JAMES M. TIEDJE , THOMAS P. CURTIS , XIANGHUA WEN , YUNFENG YANG , LISA ALVAREZ-COHEN , DAVID A. STAHL , PEDRO J. J. ALVAREZ , BRUCE E. RITTMANN , JIZHONG ZHOU
      Nature Communications, v.: 16 2025
      Lugar de publicación: United kingdom
      E-ISSN: 20411723
      DOI: 10.1038/s41467-025-59019-3
      https://doi.org/10.1038/s41467-025-59019-3
      
      

    • Unraveling the biological mechanisms of biohydrogen production through dark fermentation using assembled genomes from metagenomic data (Completo, 2025)

      PATRICIA BOVIO-WINKLER , ESTEBAN ORELLANA , STEFANO CAMPANARO , JOSÉ DE JESÚS MONTOYA-ROSALES , LUCAS TADEU FUESS , JULIÁN CARRILLO-REYES , ELENA CASTELLÓ , KARLA M. MUÑOZ-PÁEZ , IVÁN MORENO-ANDRADE , GERMÁN BUITRÓN , ELÍAS RAZO-FLORES , CLAUDIA ETCHEBEHERE
      Bioprocess and Biosystems Engineering, v.: 49 p.:489 - 503, 2025
      Lugar de publicación: Germany
      ISSN: 16157591
      E-ISSN: 16157605
      DOI: 10.1007/s00449-025-03267-6
      https://doi.org/10.1007/s00449-025-03267-6
      
      

    • Microbial community evolution in a lab-scale reactor operated to obtain biomass for biochemical methane potential assays (Completo, 2024)

      DE LA SOVERA, V. , BOVIO-WINKLER, P. , Zinola, G. , C. ETCHEBEHERE
      Applied Microbiology and Biotechnology, 2024
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 01757598
      E-ISSN: 14320614
      DOI: https://doi.org/10.1007/s00253-024-13305-0
      
      

    • Unveiling the hidden diversity and functional role of Chloroflexota in full-scale wastewater treatment plants through genome-centric analyses (Completo, 2024)Trabajo relevante

      BOVIO-WINKLER, P. , CABEZAS, A , C. ETCHEBEHERE
      ISME Communications, 2024
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 27306151
      
      

    • Thermophilic fermentation of sugarcane vinasse: Process flexibility explained through characterizing microbial community and predicting metabolic functions (Completo, 2024)

      Fuess , Rogeri , Eng , Borges , BOVIO-WINKLER, P. , Etchebehere , Zaiat
      International Journal of Hydrogen Energy, 2024
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      E-ISSN: 03603199
      DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijhydene.2024.06.200
      
      

    • Multi-stage process for mixed microbial culture production of polyhydroxyalkanoates from sugarcane stillage: Assessment of external nutrient supplementation (Completo, 2024)

      Oliveira , Sánchez , Guevara , Fuentes , BOVIO-WINKLER, P. , Bovio-Winkler, P , Etchebehere, C , Zaiat , Rodrigues
      Biochemical Engineering Journal, 2024
      Escrito por invitación
      ISSN: 1369703X
      DOI: https://doi.org/10.1016/j.bej.2024.109438
      
      

    • Anaerobic methane oxidation: High-rate performance of a continuous bioreactor using nitrate and nitrite as electron acceptors (Completo, 2023)

      Contreras , Valenzuela , BOVIO-WINKLER, P. , Etchebehere , Gabaldón , Quijano
      Chemical Engineering Journal, 2023
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 13858947
      DOI: https://doi.org/10.1016/j.cej.2023.143137
      
      

    • Putative metabolism of Ca. Accumulibacter via the utilization of glucose (Completo, 2023)Trabajo relevante

      AGUSTINA ZILIANI , PATRICIA BOVIO-WINKLER , ANGELA CABEZAS , CLAUDIA ETCHEBEHERE , HECTOR A. GARCIA , CARLOS M. LÓPEZ-VÁZQUEZ , DAMIR BRDJANOVIC , MARK C.M. VAN LOOSDRECHT , FRANCISCO J. RUBIO-RINCÓN
      Water Research, v.: 229 p.:119446 2023
      Lugar de publicación: Netherlands
      ISSN: 00431354
      DOI: 10.1016/j.watres.2022.119446
      http://dx.doi.org/10.1016/j.watres.2022.119446
      
      

    • Acetoclastic archaea adaptation under increasing temperature in lake sediments and wetland soils from Alaska (Completo, 2023)

      Dellagnezze, B , BOVIO-WINKLER, P. , Lavergne, C , Menoni, D , Mosquillo, M. F. , C. ETCHEBEHERE , Cabrol, L , Barret, M
      Polar Biology, 2023
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 07224060
      E-ISSN: 14322056
      DOI: https://doi.org/10.1007/s00300-023-03120-0
      
      

    • Genome-centric metagenomic insights into the role of Chloroflexi in anammox, activated sludge and methanogenic reactors (Completo, 2023)Trabajo relevante

      PATRICIA BOVIO-WINKLER , LEANDRO D. GUERRERO , LEONARDO ERIJMAN , PÍA OYARZÚA , MARÍA EUGENIA SUÁREZ-OJEDA , ANGELA CABEZAS , CLAUDIA ETCHEBEHERE
      BMC Microbiology, v.: 23 2023
      Lugar de publicación: United kingdom
      E-ISSN: 14712180
      DOI: 10.1186/s12866-023-02765-5
      http://dx.doi.org/10.1186/s12866-023-02765-5
      
      

    • Methanogenic consortia from thermophilic molasses-fed structured-bed reactors: microbial characterization and responses to varying food-to-microorganism ratios (Completo, 2022)

      LUCAS TADEU FUESS , FELIPE ENG , PATRICIA BOVIO-WINKLER , CLAUDIA ETCHEBEHERE , MARCELO ZAIAT , CLAUDIO AUGUSTO OLLER DO NASCIMENTO
      Brazilian Journal of Chemical Engineering, 2022
      Lugar de publicación: Brazil
      ISSN: 01046632
      E-ISSN: 16784383
      DOI: 10.1007/s43153-022-00291-x
      http://dx.doi.org/10.1007/s43153-022-00291-x
      
      

    • A combined microbial and biogeochemical dataset from high-latitude ecosystems with respect to methane cycle (Completo, 2022)

      MAIALEN BARRET , LAURE GANDOIS , FREDERIC THALASSO , KARLA MARTINEZ CRUZ , ARMANDO SEPULVEDA JAUREGUI , CÉLINE LAVERGNE , ROMAN TEISSERENC , POLETTE AGUILAR , OSCAR GERARDO NIETO , CLAUDIA ETCHEBEHERE , BRUNA MARTINS DELLAGNEZZE , PATRICIA BOVIO WINKLER , GILBERTO J. FOCHESATTO , NIKITA TANANAEV , METTE M. SVENNING , CHRISTOPHE SEPPEY , ALEXANDER TVEIT , ROLANDO CHAMY , MARÍA SOLEDAD ASTORGA ESPAÑA , ANDRÉS MANSILLA , ANTON VAN DE PUTTE , MAXIME SWEETLOVE , ALISON E. MURRAY , LÉA CABROL
      Scientific Data, v.: 9 2022
      Lugar de publicación: United kingdom
      Escrito por invitación
      E-ISSN: 20524463
      DOI: 10.1038/s41597-022-01759-8
      http://dx.doi.org/10.1038/s41597-022-01759-8
      
      

    • Modeling of hydrogen and organic acid production using different concentrations of sugarcane vinasse under thermophilic conditions and a link with microbial community 16S rRNA gene sequencing data (Completo, 2022)

      P.T. COUTO , F. ENG , P. BOVIO-WINKLER , W.A. CAVALCANTE , C. ETCHEBEHERE , L. FUENTES , I. NOPENS , M. ZAIAT , R. RIBEIRO
      Journal of Cleaner Production, v.: 370 p.:133437 2022
      Lugar de publicación: Netherlands
      Escrito por invitación
      ISSN: 09596526
      DOI: 10.1016/j.jclepro.2022.133437
      http://dx.doi.org/10.1016/j.jclepro.2022.133437
      
      

    • Optimization of volatile fatty acid production by sugarcane vinasse dark fermentation using a response surface methodology. Links between performance and microbial community composition (Completo, 2022)

      FELIPE ENG , LUCAS TADEU FUESS , PATRICIA BOVIO-WINKLER , CLAUDIA ETCHEBEHERE , ISABEL KIMIKO SAKAMOTO , MARCELO ZAIAT
      Sustainable Energy Technologies and Assessments, v.: 53 p.:102764 2022
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 22131388
      DOI: 10.1016/j.seta.2022.102764
      http://dx.doi.org/10.1016/j.seta.2022.102764
      
      

    • Ubiquity and Diversity of Cold Adapted Denitrifying Bacteria Isolated From Diverse Antarctic Ecosystems (Completo, 2022)

      ANGELA CABEZAS , GASTÓN AZZIZ , PATRICIA BOVIO-WINKLER , LAURA FUENTES , LUCÍA BRAGA , JORGE WENZEL , SILVIA SABARIS , SILVANA TARLERA , CLAUDIA ETCHEBEHERE
      Frontiers in Microbiology, v.: 13 2022
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Switzerland
      Escrito por invitación
      E-ISSN: 1664302X
      DOI: 10.3389/fmicb.2022.827228
      http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2022.827228
      
      

    • Sulfate- and pH-driven metabolic flexibility in sugarcane vinasse dark fermentation stimulates biohydrogen evolution, sulfidogenesis or homoacetogenesis (Completo, 2022)

      MICHAEL ANTONIO PIFFER , CRISTIANE ARRUDA OLIVEIRA , PATRICIA BOVIO-WINKLER , FELIPE ENG , CLAUDIA ETCHEBEHERE , MARCELO ZAIAT , CLAUDIO AUGUSTO OLLER DO NASCIMENTO , LUCAS TADEU FUESS
      International Journal of Hydrogen Energy, v.: 47 p.:31202 - 31222, 2022
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United kingdom
      Escrito por invitación
      E-ISSN: 03603199
      DOI: 10.1016/j.ijhydene.2022.07.039
      http://dx.doi.org/10.1016/j.ijhydene.2022.07.039
      
      

    • Full details on continuous biohydrogen production from sugarcane molasses are unraveled: Performance optimization, self-regulation, metabolic correlations and quanti-qualitative biomass characterization (Completo, 2021)

      Fuess, L , Fuentes, L , BOVIO-WINKLER, P. , Eng, F , C. ETCHEBEHERE , Zaiat, M , Oller do Nascimento, c
      Chemical Engineering Journal, 2021
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 13858947
      DOI: 10.1016/j.cej.2021.128934
      
      

    • Temporal analysis of the microbiota involved in the anaerobic degradation of sugarcane vinasse in a full-scale methanogenic UASB reactor (Completo, 2021)

      CALLEJAS, C. , I. LÓPEZ , BOVIO-WINKLER, P. , C. ETCHEBEHERE , L. BORZACCONI
      Biomass Conversion and Biorefinery, 2021
      Medio de divulgación: Papel
      E-ISSN: 21906823
      DOI: 10.1007/s13399-021-01281-8
      
      

    • Database Mining to Unravel the Ecology of the Phylum Chloroflexi in Methanogenic Full Scale Bioreactors (Completo, 2021)Trabajo relevante

      BOVIO-WINKLER, P. , CABEZAS, A , C. ETCHEBEHERE
      Frontiers in Microbiology, 2021
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 1664302X
      DOI: 10.3389/fmicb.2020.603234
      
      

    • Biohydrogen-producing from bottom to top? Quali-quantitative characterization of thermophilic fermentative consortia reveals microbial roles in an upflow fixed-film reactor (Completo, 2021)

      Fuess, L , Fuentes, Laura , BOVIO-WINKLER, P. , Eng, F , C. ETCHEBEHERE , Zaiat, M , Oller do Nascimento, C
      Chemical Engineering Journal Advances, 2021
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 26668211
      DOI: https://doi.org/10.1016/j.ceja.2021.100125
      
      

    • Microbial communities in an anammox reactor treating municipal wastewater at mainstream conditions: Practical implications of different molecular approaches (Completo, 2021)

      Oyarzúa, Pía , BOVIO-WINKLER, P. , C. ETCHEBEHERE , Suárez-Ojeda, María
      Journal of Environmental Chemical Engineering, 2021
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 22133437
      DOI: https://doi.org/10.1016/j.jece.2021.106622
      https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2213343721015992
      
      

    • Commercial formulation amendment transiently affects the microbial composition but not the biogas production of a full scale methanogenic UASB reactor (Completo, 2019)Trabajo relevante

      CABEZAS, A , BOVIO, P. , C. ETCHEBEHERE
      Environmental Technology, 2019
      ISSN: 09593330
      E-ISSN: 1479487X
      DOI: 10.1080/09593330.2019.1600042
      
      

    • Global diversity and biogeography of bacterial communities in wastewater treatment plants (Completo, 2019)

      Wu , Ning , Zhang , Li , Zhang , Shan , Zhang , BOVIO, P. , Zhou
      Nature Biotechnology, 2019
      ISSN: 10870156
      E-ISSN: 15461696
      DOI: 10.1038/s41564-019-0426-5
      
      

    • Microbiota adaptation after an alkaline pH perturbation in a full-scale UASB anaerobic reactor treating dairy wastewater (Completo, 2019)

      CALLEJAS, C. , FERNÁNDEZ, ALFONSINA , M. PASSEGGI , WENZEL J. , BOVIO, P. , L. BORZACCONI , C. ETCHEBEHERE
      Bioprocess and Biosystems Engineering, 2019
      Areas de conocimiento:
      Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología del Medio Ambiente /
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 16157591
      E-ISSN: 16157605
      DOI: 10.1007/s00449-019-02198-3
      
      

    • Towards centralized biogas plants: Co-digestion of sewage sludge and pig manure maintains process performance and active microbiome diversity (Completo, 2019)

      LAVERGNE, C. , BOVIO, P. , C. ETCHEBEHERE , Garcia-Gen, S
      Bioresource Technology, 2019
      Areas de conocimiento:
      Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología Medioambiental /
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 09608524
      DOI: 10.1016/j.biortech.2019.122442
      
      

    • Preliminary analysis of Chloroflexi populations in full scale UASB methanogenic reactors (Completo, 2018)Trabajo relevante

      BOVIO, P. , CABEZAS, A , C. ETCHEBEHERE
      Journal of Applied Microbiology, 2018
      Areas de conocimiento:
      Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología del Medio Ambiente / Microbiología de sistemas de tratamiento de aguas residuales
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 13645072
      E-ISSN: 13652672
      DOI: https://doi.org/10.1111/jam.14115
      
      

    • Active and total microbial community dynamics and the role of functional genes bamA and mcrA during anaerobic digestion of phenol and p-cresol (Completo, 2018)Trabajo relevante

      Franchi, O , BOVIO, P. , Ortega-Martínez, E , Rosenkranz, F , Chamy, R
      Bioresource Technology, 2018
      Areas de conocimiento:
      Ingeniería y Tecnología / Biotecnología del Medio Ambiente / Biotecnología Medioambiental / Microbiología de sistemas de tratamiento de aguas residuales
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 09608524
      
      

  • No Arbitrados

    • Potentialities of biotechnological recovery of hydrogen and short- and medium-chain organic acids from the co-fermentation of cheese whey and Yerba Mate (Ilex paraguariensis) waste (Completo, 2021)

      Ferraz, Djalma , Fuentes, Laura , DE LA SOVERA, V. , BOVIO-WINKLER, P. , Eng, Felipe , Garcia, M , C. ETCHEBEHERE
      
      Industrial Crops and Products, 2021
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 09266690
      DOI: 10.1016/j.indcrop.2021.113897
      https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0926669021006610?via%3Dihub

    • Temperature increase affects acetate-derived methane production in Alaskan lake sediments and wetland soils (Completo, 2021)

      Dellagnezze, BM , BOVIO-WINKLER, P. , Lavergne, C , Menoni, D , Mosquillo, F , Cabrol, L , Barret, M , C. ETCHEBEHERE
      
      bioRxiv, 2021
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 26928205
      DOI: 10.1101/2021.08.22.457279
      https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.08.22.457279v1

Producción técnica

• Otras Producciones

  • Cursos de corta duración dictados

    • Análisis bioinformático de datos de secuenciación masiva para el estudio de comunidades microbianas (2023)

      BOVIO-WINKLER, P.
      Especialización
      País: Uruguay
      Idioma: Español
      Tipo de participación: Docente
      Duración: 1 semanas
      Lugar: Laboratorio de Microbiología Ambiental y Biotecnología (LabMAB)
      Institución Promotora/Financiadora: UTEC
      

    • Curso de Genómica (2022)

      BOVIO-WINKLER, P.
      Extensión extracurricular
      País: Uruguay
      Idioma: Español
      Tipo de participación: Docente
      Unidad: Licenciatura en Bioquímica y Biología
      Duración: 10 semanas
      Lugar: Facultad de Ciencias
      Institución Promotora/Financiadora: Facultad de Ciencias, Udelar
      Información adicional: Docente curso práctico de la materia Genómica
      

    • Genome-centric metagenomics for bioremediation and resource recovery (2022)

      BOVIO-WINKLER, P.
      Especialización
      País: Argentina
      Idioma: Español
      Tipo de participación: Docente
      Duración: 2 semanas
      Lugar: Buenos Aires, Argentina
      Institución Promotora/Financiadora: UNU-BIOLAC, INGEBI-CONICET
      

    • Producción de energía y compuestos con valor agregado mediante procesos microbianos (2022)

      BOVIO-WINKLER, P.
      Especialización
      País: Uruguay
      Idioma: Español
      Tipo de participación: Docente
      Duración: 2 semanas
      Lugar: Montevideo, Uruguay
      Institución Promotora/Financiadora: UNU-BIOLAC, Facultad de Química e IIBCE
      

    • Curso Análisis integral de experimentos de fermentación oscura para la producción de hidrógeno (2021)

      BOVIO-WINKLER, P.
      Especialización
      País: Uruguay
      Idioma: Español
      Tipo de participación: Docente
      Duración: 1 semanas
      Lugar: Montevideo, Uruguay
      Institución Promotora/Financiadora: Red Latinoamericana de Biohidrógeno
      

    • Sistemas de tratamiento de desechos (2020)

      BOVIO-WINKLER, P.
      Especialización
      País: Uruguay
      Idioma: Español
      Tipo de participación: Docente
      Duración: 2 semanas
      Lugar: IIBCE
      Institución Promotora/Financiadora: VI Escuela Regional de Microbiología
      

    • Producción de energía mediante procesos microbianos (2019)

      BOVIO-WINKLER, P.
      Especialización
      País: Uruguay
      Idioma: Español
      Tipo de participación: Docente
      Duración: 2 semanas
      Lugar: Montevideo
      Institución Promotora/Financiadora: CABBIO, Facultad de Química-UDELAR
      

    • Curso de Bioenergía (2019)

      BOVIO-WINKLER, P.
      Perfeccionamiento
      País: Uruguay
      Idioma: Español
      Medio divulgación: Otros
      Tipo de participación: Docente
      Duración: 2 semanas
      Lugar: Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable
      Ciudad: Montevideo
      Institución Promotora/Financiadora: CABBIO
      

    • Curso Bioinformática y Meta-análisis aplicado al estudio de la diversidad microbiana (2019)

      BOVIO-WINKLER, P.
      Especialización
      País: Chile
      Idioma: Español
      Medio divulgación: Otros
      Tipo de participación: Docente
      Duración: 2 semanas
      Lugar: The Environmental Biogeochemistry in Extreme Ecosystems Laboratory
      Ciudad: Punta Arenas
      Institución Promotora/Financiadora: Universidad de Magallanes
      

    • Diversidad microbiana: aspectos ecológicos y biotecnológicos (2015)

      BOVIO-WINKLER, P.
      Perfeccionamiento
      País: Uruguay
      Idioma: Español
      Medio divulgación: Otros
      Tipo de participación: Docente
      Duración: 2 semanas
      Lugar: Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable
      Ciudad: Montevideo
      Institución Promotora/Financiadora: IV Escuela Regional de Microbiología
      

• Evaluaciones

  • Evaluación de Proyectos

    • Comité evaluación de proyectos

      Becas de investigación UTEC ( 2026 / 2026 )

      Sector Educación Superior/Público / Universidad Tecnológica / Instituto Tecnológico Regional Centro-Sur , Uruguay
      Cantidad: Menos de 5
      
      

    • Instituto Antártico Chileno (INACH) ( 2023 )

      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Instituto Antártico Chileno , Chile
      Cantidad: Menos de 5
      
      

  • Evaluación de Publicaciones

    • Revisiones

      Journal of Pure and Applied Microbiology ( 2023 )

      Tipo de publicación: Revista
      Cantidad: Menos de 5
      

    • Bioresource Technology ( 2023 )

      Tipo de publicación: Revista
      Cantidad: Menos de 5
      

  • Evaluación de eventos y congresos

    • Noveno Encuentro Nacional de Química (ENAQUI9) ( 2025 / 2025 )

      Revisiones
      Uruguay
      
      
      

  • Jurado de tesis

    • Ingeniero/a en Biotecnología ( 2023 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Educación Superior/Privado / Universidad ORT Uruguay / Centro Biotecnológico de Investgación e Innovación , Uruguay
      Nivel de formación: Grado
      

• Formación de RRHH

  • Tutorías concluidas

    • Posgrado

      • Estudio de la función de bacterias filamentosas del filo Chloroflexi en sistemas de tratamiento de aguas residuales (2022 - 2025)

        Tesis de maestria
        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Laboratorio de Ecología Microbiana , Uruguay
        Programa: Maestria en Biotecnología, Facultad de Ciencias, UdelaR
        Tipo de orientación: Cotutor ( BOVIO-WINKLER, P. , Etchebehere )
        Nombre del orientado: Gerardo Viera
        País: Uruguay

    • Grado

      • Estudio de la desnitrificación en ambientes fríos, ¿existen vías aún no conocidas? (2022 - 2024)

        Tesis/Monografía de grado
        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
        Programa: Facultad de Ciencias-Licenciatura en Ciencias Biológicas y Bioquímica
        Tipo de orientación: Cotutor ( BOVIO-WINKLER, P. , Etchebehere )
        Nombre del orientado: Micaela Gonzalez
        País: Uruguay

      • Caracterización de bacterias filamentosas en sistemas de lodos activados para el tratamiento de aguas residuales industriales.

        Tesis/Monografía de grado
        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
        Nombre del orientado: Mariangeles Garcia
        País: Uruguay

    • Otras

      • Composición de las comunidades microbianas de un sistema de tratamiento de efluentes vitivinícolas y valorización de los residuos sólidos. Técnica de Real Time PCR específico para organismos del filo Chloroflexi y análisis de datos.

        Otras tutorías/orientaciones
        Sector Educación Superior/Privado / Universidad ORT Uruguay / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        Tipo de orientación: Asesor
        Nombre del orientado: Angeline Saadoun, Agustina Ziliani.
        País: Uruguay

      • Entrenamiento en cultivo de microorganismos desnitrificantes, extracción de ADN de cepas, PCR y entrenamiento en análisis de secuencias (bioinformática)

        Otras tutorías/orientaciones
        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
        Tipo de orientación: Asesor
        Nombre del orientado: Silvia Sabaris
        País: Uruguay
        Palabras Clave: Antártida Desnitrificación

  • Tutorías en marcha

    • Posgrado

      • Desnitrificación en la Antártida, usos como biorremediación de hidrocarburos a bajas temperaturas (2024)

        Tesis de maestria
        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        Programa: Maestría en Biotecnología - Facultad de Ciencias
        Tipo de orientación: Cotutor
        Nombre del orientado: Micaela González
        País/Idioma: Uruguay,

      • Estudio de microorganismos que causan problemas de bulking filamentoso en sistemas aerobios de tratamiento de aguas residuales (2020)

        Tesis de maestria
        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Laboratorio de Ecología Microbiana , Uruguay
        Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
        Nombre del orientado: Mariangeles Garcia
        Medio de divulgación: Papel
        País/Idioma: Uruguay, Español
        Palabras Clave: Bacterias filamentosas Bulking lodos activados secuenciación masiva
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Tierra y relacionadas con el Medio Ambiente / Ciencias Medioambientales / Biotecnología

• Otros datos relevantes

  • Premios, Honores y Títulos

    • Beca de movilidad-Formación (2023)

      (Nacional)
      ANII
      Beca de movilidad proporcionada para realizar una pasantía en la Universidad de Padova, Italia
      

    • Investigador Grado 3 de PEDECIBA Química (2021)

      (Nacional)
      PEDECIBA
      
      

    • Investigador Nivel Iniciación en el Sistema Nacional de Investigadores (2019)

      (Nacional)
      Agencia Nacional de Investigación e Innovación
      
      

    • Beca de finalización de Doctorado-CAP (2018)

      (Nacional)
      Comisión Académica de Posgrado-CAP
      Estudio de microorganismos de importancia biotecnológica en reactores metanogénicos para producir energía a partir de desechos
      

    • Beca de movilidad-Formación ANII (2017)

      (Nacional)
      Agencia Nacional de Investigación e Innovación
      Proyecto de pasantía: Metagenomas aplicados al estudio de sistemas de tratamiento de aguas residuales. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular ?Dr Héctor N. Torres? (INGEBI-CONICET), Buenos Aires, Argentina. Orientador: Leonardo Erijman. Setiembre a diciembre 2018.
      

    • Beca de Doctorado-ANII (2016)

      (Nacional)
      Agencia Nacional de Investigacion e Innovacion
      Estudio de microorganismos de importancia biotecnológica en reactores metanogénicos para producir energía a partir de desechos.
      

    • Beca de Maestría-ANII (2014)

      (Nacional)
      Agencia Nacional de Investigación en Innovación (ANII)
      Estudio de microorganismos no cultivables del filo Chloroflexi que pueden causar problemas en reactores metanogénicos
      

    • Beca de iniciación-ANII (2012)

      (Nacional)
      Agencia Nacional de Investigación en Innovación (ANII)
      Desnitrificación en diferentes ecosistemas de la Antártida La desnitrificación es un proceso microbiano por el cual el nitrato es convertido en N2 que se vuelve a la atmósfera. Este proceso es parte fundamental del ciclo del Nitrógeno y está muy poco estudiado en ambientes fríos. Ocurre naturalmente en suelos, sedimentos marinos, agua dulce y marina. Además, estos microorganismos son capaces de degradar diferentes compuestos recalcitrantes. En este trabajo se pretende estudiar el proceso de desnitrificación en diferentes ecosistemas de la Antártida con el objetivo final de poder utilizarlos en estrategias de bio-remediación a bajas temperaturas.
      

• Indicadores de producción

  Actividades	18
  Proyectos Investigación Desarrollo	10
  Docencia	4
  Extensión	3
  Gestión Académica	1
  Producción bibliográfica	73
  Artículos publicados en revistas científicas	29
  Completo	29
  Trabajos en eventos	43
  Textos en periódicos	1
  Periodicos	1
  Otros tipos	10
  Producción técnica	10
  Evaluaciones	6
  Evaluación de proyectos	2
  Evaluación de eventos	1
  Evaluación de publicaciones	2
  Jurado de tesis	1
  Formación RRHH	7
  Tutorías/Orientaciones/Supervisiones concluidas	5
  Otras tutorías/orientaciones	2
  Tesis/Monografía de grado	2
  Tesis de maestria	1
  Tutorías/Orientaciones/Supervisiones en marcha	2
  Tesis de maestria	2