Datos Generales

• Institución principal

  Universidad de la República/ Facultad de Medicina / Instituto de Higiene / Uruguay

• Dirección institucional

  Institución: Oregon State University / Sector Extranjero/Internacional/Otros
  / Integrative Biology
  Dirección: Cordley Hall, 2701 SW Campus Way, Corvallis / 97331
  País: Estados Unidos / Corvallis / Oregon
  Teléfono: 5417372993 / 1
  Correo electrónico/Sitio Web: calveloj@oregonstate.edu
  

Datos Personales

• Identidad

  Nombre en citaciones bibliográficas: JAVIER CALVELO
  Documento: Cédula de identidad uruguay - 42971825 , Pasaporte/Documento extranjero - D603513
  Sexo: Masculino
  País de pasaporte: Uruguay
  Fecha de nacimiento: 15/02/1990
  Lugar de nacimiento: Uruguay / Montevideo / Montevideo
  País de Nacionalidad: Uruguay

• Dirección personal

  Dirección: 990 NW Spruce / 97330
  País: Estados Unidos / Corvallis / Oregon
  Teléfono: (1) 4582724646
  Correo electrónico: calveloj@oregonstate.edu

Formación

• Formación académica

  • Concluida

    • Doctorado

      • Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (2018 - 2024)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Identificación, análisis y perspectivas evolutivas del SL trans-splicing en gusanos platelmintos
        Tutor/es: Dr. Héctor Musto, Dr. Andrés Iriarte y Dr. Uriel Koziol
        Descripción del título obtenido: Doctor en Ciencias Biológicas
        Obtención del título: 2024
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
        Palabras Clave: Platelmintos Spliced-Leader Trans-Splicing Hymenolepis microstoma
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Transcriptómica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas /

      Maestría

      • Maestría en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (2015 - 2017)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Ensamblado del transcriptoma branquial del Pejerrey y búsqueda de selección positiva a nivel molecular en Actinopterigios: aportes al estudio de la osmorregulación en peces.
        Tutor/es: Alejandro D'Anatro Gómez; Matías Feijoo; Enrique P. Lessa
        Obtención del título: 2017
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
        Palabras Clave: Transcriptómica Osmorregulación Actinopterygii Next Generation Sequencing Odontesthes argentinensis Selección Natural
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genética

    • Grado

      • Licenciatura en Ciencias Biológicas (2008 - 2014)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Filogeografía de Micropogonias furnieri según loci funcionales: El rol de las aquaporinas en la adaptación a diferentes régimenes salinos
        Tutor/es: Alejandro D Anatro
        Obtención del título: 2014
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
        Palabras Clave: filogeografía Microporinas furnieri aquaporinas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Filogeografía

• Formación complementaria

  • Concluida

    • Cursos de corta duración

      • Human Genome Tour 2016: from NGS Technologies to Evolutionary and Medical Genomics (01/2016 - 01/2016)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
        108 horas
        Palabras Clave: Next Generation Sequencing Genoma humano Genómica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica

      • GENOMICA (2015-2016) (01/2015 - 01/2016)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        60 horas
        Palabras Clave: Genómica Secuenciación Masiva
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica

      • Statistics and R for the Life Sciences (01/2015 - 01/2015)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Harvard University , Estados Unidos
        24 horas
        Palabras Clave: Estadística R Project
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Matemáticas / Estadística y Probabilidad /

      • Tópicos en Filogeografía (01/2015 - 01/2015)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Centro Universitario Rivera , Uruguay
        40 horas
        Palabras Clave: filogeografía Genética de poblaciones
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Filogeografía

      • Filogenia Molecular Iinferencia y Aplic. (01/2015 - 01/2015)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / UDELAR - Dirección General de Relaciones y Cooperación , Uruguay
        40 horas
        Palabras Clave: EVOLUCION Filogenia
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Filogenia

      • Ecología General C 2011 (PEDECIBA) (01/2015 - 01/2015)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        Palabras Clave: Ecología
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ecología /

      • Programación Estructura de Datos y Algoritmos (01/2014 - 01/2014)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / UDELAR - Dirección General de Relaciones y Cooperación , Uruguay
        40 horas
        Palabras Clave: Python Programación
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

      • Historia del Concepto de Gen (01/2014 - 01/2014)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        20 horas
        Palabras Clave: Historia de la Ciencia Genética
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • Probabilidad y estadística (01/2014 - 01/2014)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        Palabras Clave: Estadística Probabilidad
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Matemáticas / Estadística y Probabilidad /

      • Introducción a la Panbiogeografía (01/2013 - 01/2013)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        20 horas
        Palabras Clave: Panbiogeografía Biogeografía
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Biogeografía

Idiomas

• Portugués

  Entiende bien / Habla regular / Lee bien / Escribe regular

• Inglés

  Entiende bien / Habla regular / Lee muy bien / Escribe regular

Areas de actuación

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Ciencias Biológicas /Genómica

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Ciencias Biológicas /Transcriptómica

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Otros Tópicos Biológicos /Bioinformática

Actuación profesional

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Estados Unidos

  Oregon State University / Integrative Biology

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (09/2024 - a la fecha)

      Postdoc 40 horas semanales

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Medicina / Instituto de Higiene

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (12/2021 - 09/2024)Trabajo relevante

      Asistente del Laboratorio de Desarrollo Biotecnológico y División Producción del Inst. Higiene 24 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Interino

    • Funcionario/Empleado (07/2020 - 03/2021)

      Docente Asistente 10 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

    • Funcionario/Empleado (05/2019 - 12/2019)

      Nivel 2 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Interino

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • ANII:FCE-2016: Evolución de familias multigénicas codificantes para proteínas de secreción en el phylum Platyhelminthes. (03/2018 - a la fecha )

        Los platelmintos parásitos presentan generalmente ciclos complejos, involucrando hospedadores variados, incluyendo humanos y especies ganaderas y por esto tienen gran impacto en salud humana y animal. Ejemplos de especies de este grupo son: Echinococcus granulosus, Schistosoma mansoni y Fasciola hepatica, entre otros. Estos organismos han sido estudiados profundamente en su biología, pero en términos relativos a su impacto faltaría mucho por hacer. Las aproximaciones genómicas y computaciones han jugado un rol fundamental para seguirla investigación a bajo costo. Actualmente existen genomas de varias especies que se encuentran disponibles y también hay información sobre el nivel de expresión de los genes. El estudio de los genomas ha confirmado que la duplicación es un mecanismo evolutivo poderoso, generador de materia prima para la adquisición de nuevas funciones en la célula. En muchos casos se ha probado que el propio aumento de copias en una familia de genes es elresultado de un proceso adaptativo. Los resultados preliminares sugieren un rol importante de la selección natural en la evolución de los ciclos complejos en muchos platelmintos y especialmente en algunas genes codificantes para proteínas de secreción exocrinas. Mediante una aproximación genómica comparativa y funcional, se propone identificar genes y familias involucrados en el proceso adaptativo en los diferentes estadios del ciclo de distintas especies (incluyendo aspectos relacionados al nicho y a sus hospedadores intermediarios y finales) y cuantificar el efecto de la selección natural operando a nivel de secuencias y sobre el proceso de duplicación en distintos linajes del phylum.
        Mixta
        20 horas semanales , Integrante del equipo
        Equipo: Andrés IRIARTE ODINI , Javier Calvelo Comesaña
        Palabras clave: Cestoda Trematoda Parásitos Candidatos vacunales Proteínas excretadas Péptidos Antimicrobianos Genómica Comparativa Funcional

      • CSIC:I+D 2018: Estudio de asociación del genoma completo (GWAS) en E. coli: una aproximación original en la búsqueda de marcadores genéticos asociados al patotipo productor de la toxina Shiga (STEC). (05/2019 - 12/2019 )

        Por cambios genéticos ciertas cepas de E. coli han dejado de ser comensales para pasar a ser patógenos. De acuerdo a los mecanismos patogénicos involucrados se reconocen distintos patotipos, uno de ellos es el STEC, patotipo productor de toxinas Shiga (Stxs). Las infecciones por STEC ocurren a cualquier edad pero en niños menores de cinco años pueden llegar a producir procesos severos como colitis hemorrágica (CH) o síndrome urémico hemolítico (SUH), el cual puede ser mortal en la etapa aguda o dejar secuelas a largo plazo. No hay tratamiento específico para la infección por STEC en seres humanos e incluso el uso de algunos antibióticos durante la fase diarreica puede aumentarlas chances de desarrollar complicaciones severas como SUH o PPT, Es asi que la estrategia más efectiva hasta el momento es la prevención de la infección. Por otro lado, la presencia de STEC en carnes uruguayas destinadas a la exportación a mercados como el europeo, constituye una importante causa de alertas e incluso ha generado rechazos de los productos que se traducen en pérdidas económicas muy significativas importantes. En ambos casos el diagnóstico de la presencia de este patógeno es fundamental. Según los métodos validados y utilizados, ya sea en la clínica, en alimentos y en ganado, se presenta la problemática de que se debe asegurarla presencia únicamente de los genes stx y eae para así establecerla capacidad patogénica de la cepa. Sin embargo,recientemente se han comenzado a identificar, a nivel mundial, cepas stx positivas y eae negativas que tienen la capacidad patogénica, porlo tanto pensar solo en estos genes a la hora de realizar un screening tiene claras desventajas para evaluarla capacidad patogénica potencial de los cultivos involucrados. En este proyecto se propone una estrategia basada en análisis in-silico para la detección de marcadores genéticos asociados al patotipo STEC. Se implementará la técnica GWAS sobre genomas libremente disponibles, buscando kameros que estén asociados con: 1) el patotipo STEC y 2) el fenotipo STEC invasivo. Se estimará un nivel de confianza de la asociación, un nivel de confianza para la predicción del patotipo en base a la combinación de múltiples marcadores y se identificarán linajes mayormente asociados a las características. La aproximación propuesta en este proyecto incluye además la búsqueda de marcadores en las regiones regulatorias, ARNs no codificantes pequeños y otros marcadores, que a pesar de serrelevantes para la patogenicidad y virulencia en patógenos bacterianos no son muy estudiados. Finalmente utilizando un banco de cepas locales y mediante la secuenciación de genomas completos y/o amplificación/secuenciación de regiones identificadas se procederá a validarlas predicciones en cepas aisladas de Uruguay.
        20 horas semanales , Integrante del equipo
        Equipo: Andrés IRIARTE ODINI , Javier Calvelo Comesaña
        Palabras clave: Escherichia coli Gwas Toxina Shiga (STEC)

    • Docencia

      • Ciclo básico clínico comunitario 6. (CBCC6) (10/2022 - a la fecha)

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Talleres CBCC6, 8 horas, Práctico

      • Maestría en Ciencias Biológicas (08/2018 - 02/2020 )

        Maestría
        Asistente
        Asignaturas:
        Introducción a la línea de comandos y a la programación para análisis bioinformáticos, 60 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Genómica y Bioinformática

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Ciencias

  • Vínculos con la Institución

    • Becario (06/2019 - 08/2024)Trabajo relevante

      30 horas semanales
      Beca de Doctorado: POS_NAC_2018_1_151170

    • Becario (03/2015 - 12/2017)

      20 horas semanales
      Beca de maestría ANII: POS_NAC_2014_1_102790
      Escalafón: Docente

    • Otro (11/2016 - 12/2016)

      Ayudante 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

    • Becario (03/2013 - 03/2014)

      20 horas semanales
      Beca: INI_X_2012_1_4207.

  • Actividades

    • Docencia

      • Biología (11/2016 - 12/2016 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Genómica, 20 horas, Teórico-Práctico

• Sector Gobierno/Público - Ministerio de Educación y Cultura - Uruguay

  Dirección de Ciencia y Tecnología / IIBCE

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (09/2018 - 12/2018)

      Iniciación a la Investigación 20 horas semanales

  • Actividades

    • Extensión

      • Pasantía en Neurociencias para estudiantes de secundaria (ANEP-PEDECIBA) (11/2018 - 11/2018 )

        8 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Difusión de las Ciencias

      • Taller Teórico Prácticoen Neurociencias - Liceo N°63 (09/2018 - 10/2018 )

        ANEP-PEDECIBA 4 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Difusión de las Ciencias

• Sector Enseñanza Técnico-Profesional/Secundaria/Privado - Educación primaria y secundaria privada - Uruguay

  Colegio y Liceo Clara Jackson de Heber

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (08/2017 - 12/2017)Trabajo relevante

      Docente 6 horas semanales
      Curso de Sexto de Medicina en el marco del programa Extra edad.

  • Actividades

    • Docencia

      • Sexto de Medicina - Libre asistido (08/2017 - 12/2017 )

        Secundario
        Responsable
        Asignaturas:
        Sexto de Medicina - Bachillerato Extraedad, 90 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Curso Bachillerato

Carga horaria

• Carga horaria de docencia: Sin horas
  
• Carga horaria de investigación: 40 horas
  
• Carga horaria de formación RRHH: Sin horas
  
• Carga horaria de extensión: Sin horas
  
• Carga horaria de gestión: Sin horas
  

Otros datos relevantes

• Presentaciones en eventos

  • SMBE Satellite Meeting (2022)

    Congreso
    Presentación de resultados preliminares en el estudio de SL-RNAs en Trematodos y Cestodos
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 32 Palabras Clave: SL Trans-Splicing
    

  • Pasantía en Lab. Dra Michelle (WesternU). OREGON. EEUU. (2022)

    Otra
    Pasantía de corta duración en el extranjero
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Otros
    Nombre de la institución promotora: Western University of Health Sciences Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Parasitología y Bioinformática
    Introducción al mantenimiento de Schistosoma mansoni en el laboratorio (ciclo completo)

  • IV Congreso Uruguayo de Zoología (2016)

    Congreso
    Cuarto Congreso de Zoología
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 1
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Zoológica del Uruguay Palabras Clave: Transcriptómica Odontesthes argentinensis
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / RNAseq
    Trabajo presentado: "Ensamblado de novo del transcriptoma branquial de Odontesthes argentinensis."

  • IV Congreso Uruguayo de Zoología (2016)

    Congreso
    Cuarto Congreso de Zoología
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 1
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Zoológica del Uruguay Palabras Clave: Genética de poblaciones Iheringichthys labrosus
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Filogeografía
    Trbajo presentado: "Análisis de la estructura poblacional de Iheringichthys labrosus en la cuenca baja del Río Uruguay utilizando dos marcadores moleculares"

  • III Congreso Uruguayo de Zoología (2014)

    Congreso
    Tercer Congreso de Zoología
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 1
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Zoológica del Uruguay Palabras Clave: Genética de poblaciones Iheringichthys labrosus Río Uruguay
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Filogeografía
    Trabajo presentado: "Análisis de la esctructura poblacional de Iheringichthys labrosus Lütken 1874 (Siluriformes, Pimelodidae) en la cuenca baja del río Uruguay."

  • Evolución: Procesos y Herramientas de Análisis (2014)

    Taller
    Taller de Formación Permanente para Docentes de Secundaria
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 24
    Nombre de la institución promotora: Consejo Directivo Central. Consejo de Formación en Educación - Instituto de Profesores Artigas Palabras Clave: HERRAMIENTAS DE ANALISIS EVOLUCION BIOLOGIA
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genética
    

  • III Congreso Uruguayo de Zoología (2014)

    Congreso
    Tercer Congreso de Zoología
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 1
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Zoológica del Uruguay Palabras Clave: filogeografía Micropogonias furnieri Selección Natural
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Filogeografía
    Trabajo presentado: "Filogeografía de Micropogonias furnieri (Perciformes: Scianidae) según loci funcionales: el rol de las acuaporinas en la adaptación a diferentes regímenes salinos."

Producción científica/tecnológica

• La clave para el tratamiento y prevención de enfermedades parasitarias radica en entender profundamente la biología del patógeno. Ya sean cuestiones generales a gran escala ¿Cómo, cuándo y dónde se reproduce? ¿Cual es su ciclo de vida? ¿Cómo alcanza a infectar a los humanos y otras especies de interés económico? a las más concretas y específicas como ¿cuales son los mejores blancos fisiológicos para drogas?
  
  Mi trabajo se centra en el uso de aproximaciones genómicas y transcriptomas para mejorar nuestra comprensión de la biología de platelmintos y sus vectores de transmisión.
  
  En particular cave destacar:

  1) Desarrollo de una herramienta para la detección de nuevos SLs (SLFinder). La cual puede ser aplicada a cualquier especie de la que se disponga de datos genómicos y transcriptómicos.

  2) Colaboración en el estudio de los cambios de expresión genética asociados con tres estadios del ciclo de vida de Hymenolepis microstoma.

  3) Caracterización y estudio de los SL-RNA en H. microstoma, sus genes aceptores y su importancia para la anotación precisa de genomas platelmintos.

  4) Análisis de los SL-RNA presentes en Platelmintos Cestodos y Trematodos. (Investigación en cruso)

  5) Colaboración en la anotación del genoma y transcriptoma del caracol Biomphalaria sudanica, un importante vector de la esquistosomiasis. 

  6) Re-anotación de regiones regiones asociadas con la resistencia a Schistosoma mansoni en el caracol B. glabrata. 

  
  
  

Producción bibliográfica

• Artículos publicados

  • Arbitrados

    • Evolution of SL-RNA Genes and Their Splicing Targets in Parasitic Flatworms (Completo, 2025)Trabajo relevante

      JAVIER CALVELO , MUSTO H , URIEL KOZIOL , IRIARTE A.
      Molecular Biology and Evolution, v.: 42 11 , 2025
      Palabras clave: Spliced leader trans-splicing operons comparative genomics of platyhelminthes cestodes concerted evolution
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Transcriptómica
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 07374038
      E-ISSN: 15371719
      DOI: https://doi.org/10.1093/molbev/msaf228
      
      

    • The genome and transcriptome of the snail Biomphalaria sudanica s.l.: immune gene diversification and highly polymorphic genomic regions in an important African vector of Schistosoma mansoni (Completo, 2024)Trabajo relevante

      Penance T , Calvelo J , Tennessen JA , Burd R , Cayton J , Bollmann SR , Blouin MS , Spaan JM , Hoffmann FG , Ogara G , Rawago F , Andiego K , Mulonga B , Odhiambo M , Loker ES , Laidemitt MR , Lu L , IRIARTE A. , Odiere M , Steinauer ML
      BMC Genomics, v.: 25 p.:192 2024
      Palabras clave: Biomphalaria sudanica Biomphalaria choanomphala Schistosomiasis Snail vector De novo genome assembly Polymorphism Immunogenetics Gene family evolution Balancing selection Pathogen recognition
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Genomica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 14712164
      DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-024-10103-w
      https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-024-10103-w
      
      

    • Trans-splicing in the cestode Hymenolepis microstoma is constitutive across the life cycle and depends on gene structure and composition (Completo, 2023)Trabajo relevante

      JAVIER CALVELO , IRIARTE A. , URIEL KOZIOL , KLAUS BREHM
      International Journal for Parasitology, v.: 53 02 , p.:103 - 117, 2023
      Palabras clave: Spliced Leader Trans-splicing Hymenolepis microstoma
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Transcriptómica
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 00207519
      DOI: https://doi.org/10.1016/j.ijpara.2022.11.006
      https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0020751923000012?via%3Dihub
      En este trabajo se analizó en profundidad el complemento de SL-RNAs en Hymenolepis microstoma. Además de identificar un nuevo SL-RNA, se identificaron aproximadamente 600 genes aceptores, su organización y la dinamica de cis-splicing en torno al sitio específico de inserción.
      
      

    • Stage-specific transcriptomic analysis of the model cestode Hymenolepis microstoma (Completo, 2021)

      Preza, M. , Calvelo, J. , Langleib, M. , Hoffmann, F , Castillo, E. , Koziol, U , Iriarte, A
      Genomics, v.: 133 2 , p.:620 - 632, 2021
      Palabras clave: Antigen B Flatworms functional genomics Gene family evolution RNA-seq Tapeworm
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Parasitología
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 08887543
      E-ISSN: 10898646
      DOI: 10.1016/j.ygeno.2021.01.005
      https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0888754321000318
      Estudio del perfil de expresión genética asociado con sus distintos ciclos de vida.
      
      

    • Mitochondrial genome architecture and phylogenetic relationships of Odontesthes argentinensis within Atherinomorpha (Completo, 2021)

      JAVIER CALVELO , D'Anatro, A.
      Genetica, v.: 149 2 , p.:129 - 141, 2021
      Palabras clave: Atherinomorpha Pejerrey Phylogeny Silversides Transcriptomics
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Genómica
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 15736857
      DOI: 10.1007/s10709-021-00116-8
      Secuenciación y anotación del genoma mitocondrial de Odontesthes argentinensis
      
      

    • Real and Virtual Biological Science Living Laboratory for Science Teachers? formation: promoting global scientific literacy and critical thinking for sustainable development. (Completo, 2020)

      CASTELLO, M.E. , PELLERINO, V. , ARGENTE, D. , GÓMEZ-MARQUÉZ, J. , GAUDENZ, U. , RANDALL, G. , PEREIRA, A.C. , ALONSO, S. , CALVELO, J. , YOUNG, A. , ACOSTA, F. , ALBARRÁN, N. , GIMENEZ, M. , SEDRASCHI, P. , UMPIÉRREZ, M. , Figares, M , REHERMANN, M.I.
      EPiC Series in Education Science, v.: 3 p.:27 - 34, 2020
      Palabras clave: BYOD DIWO Critical Thinking DIY Virtual Reality
      Areas de conocimiento:
      Humanidades / Otras Humanidades / Otras Humanidades / Enseñanza
      E-ISSN: 25162306
      DOI: 10.29007/72c2
      https://easychair.org/publications/paper/Qp5B
      Pruebas de nuevas técnicas de enseñanza
      
      

    • SLFinder, a pipeline for the novel identification of splice-leader sequences: a good enough solution for a complex problem (Completo, 2020)Trabajo relevante

      J. CALVELO , H. JUAN , MUSTO H , U. KOZIOL , IRIARTE A.
      BMC Bioinformatics, 2020
      Palabras clave: SL trans-splicing De novo assembly RNAseq data
      E-ISSN: 14712105
      DOI: https://doi.org/10.1186/s12859-020-03610-6
      Pipeline para la identificación de nuevas secuencias SLs a partir de datos ARN por secuenciación masiva
      
      

    • De-novo assembly and transcriptome analysis of Odontesthes argentinensis gill tissue, with development of single sequence repeat markers (Completo, 2018)Trabajo relevante

      JAVIER CALVELO , FEIJOO M. , GIORELLO FM , D'Anatro, A.
      Gene Reports, v.: 11 p.:220 - 228, 2018
      Palabras clave: Fish Silverside RNA-Seq De novo assembly Functional annotation Gene expression Microsatellites SNPs
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Transcriptómica
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 24520144
      DOI: https://doi.org/10.1016/j.genrep.2018.04.002
      Secuenciación, ensamblado y anotación del transcriptoma de Odontesthes argentinensis. Una especie de interes económico para las pesquerías nacionales
      
      

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