Datos Generales

Formación

• Formación académica

  • Concluida

    • Doctorado

      • Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (2008 - 2013)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Aproximaciones de genómica estructural y funcional en tripanosomátidos
        Tutor/es: Beatriz Garat
        Obtención del título: 2013
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
        Palabras Clave: tripanosomátidos Señales conformacionales Traductomica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Molecular
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      Maestría

      • Maestría en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (2004 - 2008)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Estudio de la proteína TcPUF6 de Tripanosoma cruzi
        Tutor/es: Beatriz Garat
        Obtención del título: 2008
        Financiación:
        Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Grado

      • Licenciatura en Bioquímica (1997 - 2004)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Construcción y trnasfección de vectores con luciferasa para el estudio de elementos en cis en T. cruzi
        Tutor/es: Beatriz Garat
        Obtención del título: 2004
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

• Formación complementaria

  • Concluida

    • Cursos de corta duración

      • Laboratorio de bioseguridad Nivel 3 (04/2020 - 04/2020)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Centro Universitario Regional Litoral Norte , Uruguay
        22 horas

      • Mass Spectrometry in Protein Analysis and Characterization EMBO Practical Course. (01/2010 - 07/2010)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
        80 horas

      • Formacion Docente Inicial (01/2009 - 07/2009)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina , Uruguay

      • Programación, Estructuras de Datos y Algoritmos (01/2009 - 07/2009)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • Sistemas de Información. Basese de datos y Web (01/2009 - 07/2009)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        32 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • A. nidulans: Un modelo para el estudio de la reg. génica en eucariotas (01/2003 - 07/2003)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Interacciones Moleculares (01/2003 - 07/2003)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Curso regional de medicina molecular (01/2002 - 01/2002)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Regulación de la expresión génica en eucariotas (01/2001 - 07/2001)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Seminario de cultivos celulares (01/2001 - 01/2001)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay

      • Introducción a la interferencia por RNA (01/2005 )

        Sector Extranjero/Internacional/Enseñanza superior / Universidade Estadual de Campinas , Brasil
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • Realización de un material didáctico multimedia en CD-ROM (01/2001 )

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay

      • Toxicología e Higiene Ambiental (01/2001 )

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Química , Uruguay

      • Técnicas electroquímicas de análisis (01/1999 )

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay

      • RIA y técnicas convexas de investigación y diagnóstico (01/2001 )

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay

      • Mantenimiento de la homeostasis del hierro y otro metales de transición en bacterias (01/2003 )

        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • ARN y Citoesqueleto en Territorio Axonal (PEDECIBA) (01/2005 )

        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Genética Humana (01/2004 )

        Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • Machine Learning and Statistical Learning for Bioinformatics and Genetics (01/2008 )

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Molecular

      • Accessing the Human Genome Sequence (01/2006 )

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • Introducción a la programación de aplicaciones bioinformáticas (01/2007 )

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay

      • Seguridad en el laboratorio (PEDECIBA) (01/2006 )

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Química , Uruguay

      • Genética molecular y medicina (01/2005 )

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • Herramientas básicas de Bioinformática (01/2003 )

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Participación en eventos

      • XXXIV Reunión Anual de la SAP (2023)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Argentina de Protozoología, Argentina
        Alcance geográfico: Regional

      • XIII Jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (2023)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular, Uruguay
        Alcance geográfico: Nacional

      • Políticas de Ciencia, Tecnología e Innovación en Uruguay: opinan quienes investigan (2023)

        Tipo: Seminario
        Institución organizadora: Núcleo Interdisciplinario CiTINDe, Uruguay
        Alcance geográfico: Nacional

      • III Congreso Nacional de Biociencias (2022)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Biociencias, Uruguay
        Alcance geográfico: Nacional

      • Primer encuentro Binacional de Clubes de ARN (2022)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Clubes de ARN de Uruguay y Argentina, Uruguay
        Alcance geográfico: Regional

      • XI Congreso de la Sociedad Argentina de Protozoología, Mendoza (2022)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: XI Congreso de la Sociedad Argentina de Protozoología, Argentina
        Alcance geográfico: Regional

      • XXXIII Reunión Anual de la SAP, Buenos Aires (2022)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Argentina de Protozoología, Argentina
        Alcance geográfico: Regional

      • Frontiers Forum (2022)

        Tipo: Seminario
        Institución organizadora: Frontiers, Uruguay

      • Reemergencia de la enfermedad de Chagas: Diálogo entre la Medicina Clínica y la Medicina Molecular (2022)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Instituto Pasteur Montevideo, Uruguay

      • Chagas Disease: Immunology and Immunotherapies Virtual Symposium (2021)

        Tipo: Simposio
        Institución organizadora: Actividad Virtual INGEBI, IDICER, Uruguay

      • Epigenetics & regulation of gene expression in kinetoplastid protozoa (2021)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Actividad Virtual del Wellcome Centre for Integrative Parasitology, Uruguay

      • Frontiers Editors' Summit (2020)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Editorial Frontiers, Inglaterra

      • Human Cell Atlas Latin America Workshop (2020)

        Tipo: Simposio
        Institución organizadora: Human Cell Atlas, Estados Unidos

      • Nanopore Community Meeting (2020)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Oxford Nanopore, Inglaterra

      • III International Symposium on Integrative Bioinformatics (2019)

        Tipo: Simposio

      • II Congreso Nacional de Biociencias (2019)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SUB, Uruguay

      • VIII Kinetoplastid Molecular Cell Biology Meeting (2019)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: KMCB, Estados Unidos

      • International conference on bioinformatics. 10th Anniversary of Iberoamerican Bioinformatics Society and the Master in Bioinformatics. (2019)

        Tipo: Congreso

      • II Molecular Biosystems Conference (2019)

        Tipo: Congreso

      • Reunión anual de Sociedades de Biociencia (2019)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Argentina de Parasitología, Argentina

      • Joint LV Annual SAIB Meeting and XIV PABMB Congress (2019)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SAIB-PABMB, Argentina

      • Primeras Jornadas del Club del ARN del Uruguay (2019)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Club del ARN del Uruguay, Uruguay

      • Salón de ARN (2019)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Club del ARN del Uruguay, Uruguay

      • Biochemistry Education Workshop en el marco del Joint LV Annual SAIB Meeting and XIV PABMB Congress (2019)

        Tipo: Taller
        Institución organizadora: PABMB, Argentina

      • Primera Bienal de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (2018)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SBBM, Uruguay

      • Jornada Intersectorial en el Abordaje de Enfermedades Transmisibles Endémicas y Emergentes (2018)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: OPS/OMS, Uruguay

      • Workshop en Bioinformática y Bioestadística en Genómica (2018)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Universidad Nacional de Córdoba / Universidad Católica de Córdoba, Argentina

      • Jornadas Área Microbiología (2018)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: IIBCE, MEC, Uruguay

      • Primer Congreso Nacional de Biociencias (2017)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Biociencias, Uruguay

      • VII Kinetoplastid Molecular Cell Biology Meeting. (2017)

        Tipo: Congreso

      • V Simposio Internacional de Biología Celular y Molecular de la Enfermedad de Chagas (2016)

        Tipo: Simposio
        Institución organizadora: Unu-Biolac / Universidad de Rosario, Argentina

      • XXVIII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Protozoología y Enfermedades Parasitarias (2016)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Argentina de Protozoología, Argentina

      • Sixth Kinetoplastid Molecular Cell Biology Meeting (2015)

        Tipo: Congreso

      • 9as Jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (2015)

        Tipo: Congreso

      • XXVII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Protozoología (2015)

        Tipo: Congreso

      • TRAMA Expone (2014)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: ANII, Uruguay

      • XV Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Biociencias (2014)

        Tipo: Congreso

      • Terceras Jornadas de la Sociedad de Genética del Uruguay (2014)

        Tipo: Congreso
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Genómica del Cáncer (2013)

        Tipo: Simposio

      • Workshop on Post-transcriptional Regulation in Eukaryotes (2013)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Instituto Carlos Chagas, Uruguay

      • XIV Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Biociencias (2012)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Biociencias, Uruguay

      • XXXIX Annual Meeting on Basic Research in Chagas’ Disease (2012)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Brazilian Society of Protozoology, Brasil

      • Intracellular RNA Localization & Localized Translation (2011)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: EMBO, Italia
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • VII Jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (2011)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular, Uruguay

      • ISCB Latin America Conference (2010)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: International Society for Computational Biology, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • XIII Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Biociencias (2010)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Biociencias, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Taller de Genómica: desde los microarrays al secuenciado masivo (2009)

        Tipo: Taller
        Institución organizadora: Alianza Uruguay Genoma, Uruguay

      • Simposio Uruguayo "A 100 años del descubrimiento de la Enfermedad de Chagas" (2009)

        Tipo: Simposio

      • VI Jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (2009)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular, Uruguay

      • XXIII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Protozoología (2009)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Argentina de Protozoología, Argentina

      • 150 years of Darwins Evolutionary Theory (2009)

        Tipo: Congreso

      • Browsing Chordate Genomes with Ensembl (2009)

        Tipo: Taller
        Institución organizadora: Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • Organismos modificados genéticamente, su impacto en la producción y en el medio ambiente (2009)

        Tipo: Simposio
        Institución organizadora: UNU-BIOLAC/DICyT, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • VIII Congreso Argentino de Protozoología y enfermedades parasitarias (2008)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Argentina de Protozoología, Argentina
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Jornadas Uruguayas de Bioinformatica (Local) (2008)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: IPMont, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • XII Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Biociencias (2007)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Biociencias, Uruguay

      • XXXV Reunión anual de la SBBq (2006)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SBBq, Brasil

      • Primera Reunión Uruguaya del Programa AMSUD-Pasteur (2006)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: AMSUD-Pasteur, Uruguay

      • VII de Congreso Argentino de Protozoología y enfermedades parasitarias (2005)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Argentina de Protozoología, Argentina

      • XI Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Biociencias (2005)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Biociencias, Uruguay

      • 3er Encuentro de Jóvenes Biólogos (2004)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: PEDECIBA, Uruguay

      • 3as jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (2004)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular, Uruguay

      • I AMSUD-Pasteur Meeting Host-Pathogen Interactions (2003)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: AMSUD-Pasteur, Brasil

      • 2as jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (2003)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular, Uruguay

      • X Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Biociencias (2002)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Biociencias, Uruguay

      • 1as jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (2002)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular, Uruguay

Idiomas

• Portugués

  Entiende bien / Habla regular / Lee bien / Escribe regular

• Inglés

  Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien

Areas de actuación

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Bioquímica y Biología Molecular

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Bioquímica y Biología Molecular /Genómica

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Bioquímica y Biología Molecular /Bioinformatica

Actuación profesional

• Sector Educación Superior/Público - Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas - Uruguay

  Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (12/2023 - a la fecha)

      Invetigador grado 4 1 hora semanal

    • Funcionario/Empleado (01/2014 - 11/2023)

      Investigador Grado 3 1 hora semanal

  • Actividades

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Maestría en Bioinformática (03/2022 - 06/2025 )

        Proyecto para obtener financiamiento de la CAP en el programa de apoyo a posgrados. Este proyecto fue escrito, presentado y ejecutado por mi cada año entre 2022 y 2025.
        2 horas semanales
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister prof:15
        Equipo: SMIRCICH, P. (Responsable)

    • Docencia

      • PEDECIBA Biología (06/2021 - a la fecha)

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Biología Parasitaria, 2 horas, Teórico-Práctico

      • PEDECIBA Biología (10/2023 - a la fecha)

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Transcriptómica II, 2 horas, Teórico-Práctico

      • Maestría Bioinformática (05/2021 - a la fecha)

        Maestría
        Invitado
        Asignaturas:
        Bioinformática 1, 6 horas, Teórico-Práctico

      • Universidad de Buenos Aires, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (02/2024 - 02/2025 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Genómica Aplicada, 4 horas, Teórico
        Genómica Aplicada, 4 horas, Práctico

      • Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas (09/2024 - 09/2024 )

        Doctorado
        Invitado

      • Laboratório Nacional de Computação Científica ? LNCC. Petrópolis, Brasil. (09/2024 - 09/2024 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        II Escola Latino-americana de Bioinformática para as ciências 'ômicas", 10 horas, Teórico-Práctico
        II Escola Latino-americana de Bioinformática para as ciências 'ômicas", 5 horas, Teórico
        II Escola Latino-americana de Bioinformática para as ciências 'ômicas", 5 horas, Práctico

      • Maestría Bioinformática (06/2022 - 11/2023 )

        Maestría
        Responsable
        Asignaturas:
        Seminarios de bioinformática, 20 horas, Teórico-Práctico

      • PEDECIBA Biología (10/2023 - 10/2023 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        1er Curso de Secuenciación masiva en Clínica Hematológica, 2 horas, Teórico

      • EMBL-EBI. Perú (09/2023 - 09/2023 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        II Curso Internacional en Estrategias Bioinformáticas para el estudio de enfermedades tropicales desatendidas, 2 horas, Teórico

      • PEDECIBA Biología (09/2023 - 09/2023 )

        Doctorado
        Invitado

      • Curso UNU-Biolac. INGEBI, Buenos Aires, Argentina (07/2023 - 07/2023 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        X Curso De Biología Molecular De Tripanosomátidos, 2 horas, Teórico

      • Curso UNU-Biolac. Universidad de Buenos Aires, Argentina (02/2023 - 02/2023 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso Internacional ?Genomics and bioinformatics applied to parasitology research?, 8 horas, Teórico-Práctico

      • Universidad de Buenos Aires, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (05/2022 - 05/2022 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Análisis Bioinformático de Resistencia y desarrollo de drogas a partir de genomas bacterianos, 2 horas, Teórico

      • EMBL-EBI. Colombia (06/2021 - 06/2021 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Estrategias bioinformáticas para el estudio de enfermedades tropicales desatendidas (ETDs), 3 horas, Teórico

      • Marine Biological Laboratory (MBL). Woods Hole, EEUU (05/2021 - 05/2021 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso Internacional ?Biology of Parasitism?, 2 horas, Teórico-Práctico

      • Wellcome Genome Campus Advanced Course. Wellcome Trust Sanger Institute. (06/2019 - 06/2019 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso Internacional ?Working with Protozoan Parasite Database Resources?, 2 horas, Teórico-Práctico

      • Laboratório Nacional de Computação Científica ? LNCC. Petrópolis, Brasil. (06/2019 - 06/2019 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso Internacional ?I Escola latino-americana de bioinformática para as ciências ?ômicas?, 6 horas, Teórico-Práctico

      • Doctorado en Biología (04/2019 - 04/2019 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Regulación de la expresión génica en eucariotas., 2 horas, Teórico-Práctico

      • UNUBioLAC, PEDECIBA y CSIC-UdelaR (06/2018 - 06/2018 )

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Curso Internacional ?Genome and Gene Edition in Trypanosomes?, 20 horas, Teórico-Práctico

      • PEDECIBA Biología (03/2018 - 03/2018 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Introducción a la línea de comandos y a la programación para análisis bioinformáticos, 3 horas, Teórico-Práctico

      • PEDECIBA Biología (03/2014 - 06/2017 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Introducción a la Genética Humana, 3 horas, Teórico-Práctico

      • PEDECIBA Biología (05/2017 - 05/2017 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Regulación de la expresión génica en eucariotas, 2 horas, Teórico

      • CABBIO, Petrópolis ? RJ, Brasil (05/2017 - 05/2017 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso Internacional ?Ferramentas de bioinformática para análise de dados de RNA-seq?., 6 horas, Teórico-Práctico

      • Wellcome Genome Campus Advanced Course. Wellcome Trust Sanger Institute. (05/2016 - 05/2016 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso Internacional ?Working with Parasite Database Resources?, 2 horas, Teórico-Práctico

      • UNU-BIOLAC, Universidad Nacional de Rosario (05/2016 - 05/2016 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso Internacional ?V Curso Internacional de Biología Molecular de Tripanosomátidos?, 2 horas, Teórico

    • Extensión

      • Programa Zambullite en la ciencia (02/2020 - 02/2020 )

        IIBCE/Facultad de Ciencias 6 horas

    • Gestión Académica

      • Integrante de la Comisión Directiva de la Maestría en Bioinformática en representación del Área Biología (03/2017 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones

      • Comisión para la formulación del doctorado en Bioinformática (07/2023 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

      • Coordinador de la Maestría en Bioinformática (10/2021 - 01/2025 )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

      • Coordinador alterno de la Maestría en Bioinformática (09/2019 - 09/2021 )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Ciencias

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (06/2021 - a la fecha)Trabajo relevante

      Profesor Adjunto 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 3
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (08/2018 - 05/2021)

      Profesor Adjunto 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 3
      Cargo: Interino

    • Funcionario/Empleado (05/2017 - 08/2018)

      Asistente G2 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (03/2014 - 04/2017)

      Asistente 15 horas semanales / Dedicación total
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (12/2010 - 02/2014)

      Asistente 32 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Interino

    • Funcionario/Empleado (11/2006 - 12/2010)

      Ayudante 40 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (03/2005 - 07/2005)

      Ayudante 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

    • Becario (07/2003 - 06/2005)

      Ayudante 20 horas semanales
      Proyecto “Genómica funcional de T. cruzi. Caracterización de los mecanismos de regulación post transcripcional”. Responsable Dr. Bruno Dallagiovanna.
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Genómica de organismos parásitos (01/2011 - a la fecha )

        
        30 horas semanales
        Facultad de Ciencias, Laboratorio de Interacciones Moleculares , Coordinador o Responsable
        Equipo:
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Expresión génica en T. cruzi (11/2001 - a la fecha )

        
        20 horas semanales
        Facultad de Ciencias, Laboratorio de Interacciones Moleculares , Integrante del equipo
        Equipo:
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática/Genómica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • SABIAM-Alvo-Net: Rede Sul-Americana de Bioinformática, Inteligência Artificial e Modelagem na Prospecção de Alvos Moleculares e Inovação Biotecnológica (03/2025 - a la fecha)

        El proyecto busca integrar bioinformática, IA, modelado computacional, biotecnología y microbiología para identificar nuevos blancos moleculares en patógenos resistentes a múltiples fármacos (AMR). Propone consolidar una red de investigadores de Brasil, Argentina y Uruguay (LNCC, UNIFESP, UFRJ, UBA, UNC, UDELAR) que combine datos biológicos, secuenciación, experimentos microbiológicos y herramientas computacionales para desarrollar terapias innovadoras, incluidas combinaciones antibióticas. En el mismo actúo como co-cordinador por Uruguay.
        2 horas semanales
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:10
        Equipo: SMIRCICH, P. (Responsable)

      • Single cell RNA-seq (scRNA-seq) para comprender la heterogeneidad de poblaciones de T. cruzi (09/2021 - a la fecha)

        Los cambios de ambiente que enfrenta T cruzi conllevan procesos drásticos de diferenciación celular, distinguiéndose al menos cuatro formas, tres de las cuales (tripomastigotas metacíclicos, sanguíneos y amastigotas) interaccionan directamente con las células del mamífero. Nuestro conocimiento actual de los perfiles de expresión genética del parásito en los diferentes estadios, así como durante su diferenciación, se basa en el análisis de transcriptómicos a nivel de poblaciones. Recientemente la metodología de transcriptómica de célula única (scRNA-seq) ha abierto la posibilidad de estudiar la heterogeneidad presente en las poblaciones celulares. Esto ha significado un importante incremento en el poder de resolución para describir la expresión genética de los organismos, resultado en la descripción y caracterización de nuevos aspectos biológicos relevantes en diversos organismos. El presente proyecto busca conocer la heterogeneidad presente en poblaciones de T. cruzi.
        10 horas semanales
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:2
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.

      • Búsqueda y caracterización de lncRNAs en Trypanosoma cruzi (05/2024 - a la fecha)

        Trypanosoma cruzi es el protozoo parásito responsable de la enfermedad de Chagas, patología de alta prevalencia en América Central y del Sur, donde causa serios problemas de salud pública. Los RNAs largos no codificantes (lncRNA), se definen como RNAs cuya secuencia supera los 200 nucleótidos y no son traducidos a proteínas. Se ha descrito que los mismos participan de mecanismos de regulación génica a diferentes niveles, afectan diversos procesos biológicos como la diferenciación y el ciclo celular y son capaces de interaccionar con DNA, RNA, proteínas. En tripanosomátidos, solo recientemente se han descrito lncRNAs en T. brucei, habiendo un único reporte de un lncRNA funcional involucrado en la diferenciación de este organismo. Con estos antecedentes, en la presente propuesta pretendemos identificar y caracterizar lncRNAs en T. cruzi. Este es un proyecto de Iniciación a la Investigación del cual soy referente académico de la estudiante Paola Sosa.
        2 horas semanales
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Doctorado:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P. , Paola Sosa Basso (Responsable)

      • Genómica aplicada al estudio de la regulación de la expresión génica en Trypanosoma cruzi (03/2015 - 05/2023 )

        
        5 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: GARAT, B. (Responsable) , SOTELO-SILVEIRA, J.R. (Responsable)

      • Puesta a punto del sistema de edición genómica CRISPR-Cas9 (03/2020 - 04/2021 )

        
        5 horas semanales
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:4
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.

      • Mismo origen, ¿distinto resultado? Efectos de la diploidización en alotetraploides del grupo Dilatata del género Paspalum (03/2017 - 04/2020 )

        
        3 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: Pablo SMIRCICH RUZO
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Estudios de transcriptómica comparativa en amastigotas axénicos versus amastigotas celulares de Trypanosoma cruzi. (03/2017 - 04/2020 )

        
        10 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Mecanismos regulatorios de familias moduladas a nivel traduccional en Trypanosoma cruzi. (08/2019 - 04/2020 )

        Mecanismos regulatorios de familias moduladas a nivel traduccional en Trypanosoma cruzi.
        5 horas semanales
        Coordinador o Responsable
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.

      • Mecanismos regulatorios de familias moduladas a nivel traduccional en Trypanosoma cruzi (03/2016 - 08/2019 )

        Responsable como orientador del Lic. Santiago Radio
        5 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Desarrollo
        Otros
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Beca
        Equipo: Pablo SMIRCICH RUZO

      • Mecanismos regulatorios de familias moduladas a nivel traduccional en Trypanosoma cruzi. (05/2017 - 08/2018 )

        Mecanismos regulatorios de familias moduladas a nivel traduccional en Trypanosoma cruzi
        30 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Metalomica, proteomica y transcriptomica de un nuevo potencial fármaco contra la enfermedad de chagas basado en vanadio (10/2015 - 03/2017 )

        Metalomica, proteomica y transcriptomica de un nuevo potencial fármaco contra la enfermedad de chagas basado en vanadio
        5 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: Pablo SMIRCICH RUZO

      • Señales de localización subcelular de ARN: análisis de genes nucleares que codifican productos con destino mitocondrial en T. cruzi (01/2013 - 01/2016 )

        
        5 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo:

      • Identificación y caracterización de una nueva familia de elementos transponibles en platelmintos (06/2014 - 06/2015 )

        Responsable como orientador del Br. Santiago Radio. Programa Becas de Iniciación a la Investigación
        2 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo:

      • Señales estructurales en ARNm de Trypanosoma cruzi (03/2013 - 03/2015 )

        
        20 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Estudio comparativo del transcriptoma nuclear y citoplasmico: implicancias en la regulación de la expresión génica en T cruzi (04/2011 - 03/2013 )

        
        8 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: GARAT, B (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • Señales de inicio de la transcripción en T.cruzi: búsqueda y caracterización (03/2009 - 03/2011 )

        
        20 horas semanales
        Facultad de Ciencias. Universidad de la Republica , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        Equipo: SMIRCICH, P. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Molecular

      • Patrones Globales de Transcripción de las ARN Polimerasas en Trytrips (01/2009 - 01/2011 )

        Proyecto de Doctorado. PEDECIBA
        30 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Doctorado:1
        Equipo: GARAT, B
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática/Genómica

      • Transcriptoma de la ARNPI en T. cruzi (01/2009 - 01/2011 )

        
        10 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: GARAT, B (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Investigación y desarrollo de fármacos metálicos de potencial aplicación en medicina humana. Estudio de su mecanismo de acción (01/2007 - 01/2009 )

        
        20 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Desarrollo
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Equipo: GAMBINO, D. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Estudio del blanco de la proteína Tc38 de T. cruzi (01/2007 - 06/2008 )

        
        20 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Equipo: DUHAGON, M. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Single stranded DNA Binding Proteins in Trypanosoma cruzi (01/2001 - 01/2004 )

        
        20 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Institución del exterior, Apoyo financiero
        Equipo: GARAT, B (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Genómica funcional de T. cruzi. Caracterización de los mecanismos de regulación post-transcripcional (01/2002 - 01/2004 )

        
        20 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Equipo: DALLAGIOVANNA, B. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Identificación de las proteínas que forman los complejos macromoleculares que reconocen los motivos poli (TG/CA) en T. cruzi (01/2002 - 01/2004 )

        
        20 horas semanales
        Facultad de Ciencias , Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Equipo: DUHAGON, M. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Docencia

      • (01/2012 - a la fecha)

        Grado
        Responsable
        Asignaturas:
        Dictado de 2 clases teóricas en el Curso de Biología Molecular/Genética Molecular II., 2 horas, Teórico

      • Licenciatura en Bioquímica (03/2004 - a la fecha)

        Pregrado
        
        Asignaturas:
        Biología Molecular/Genética Molecular II, 5 horas, Práctico
        Teórico en el curso Biología Molecular/Genética Molecular II, 4 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica

      • Licenciatura en Bioquimica (04/2010 - a la fecha)

        Pregrado
        Responsable
        Asignaturas:
        Practico de Bioinformatica. Curso Biología Molecular/Genética Molecular II, 30 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • PEDECIBA (06/2012 - a la fecha)

        Grado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Genómica, 15 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica

      • Licenciatura Bioqímica/Ciencias Biológicas (03/2018 - a la fecha)

        Grado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Bioingeniería Molecular y Celular. Universidad de la República, 5 horas, Teórico-Práctico

      • Ciclo Inicial Optativo-CURE (05/2022 - 05/2022 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Bases Biomoleculares, 2 horas, Teórico

      • Curso Internacional ?Biology of Parasitism?. Marine Biological Laboratory (MBL). Woods Hole, EEUU (07/2021 - 07/2021 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Biology of Parasitism, 3 horas, Teórico

      • PEDECIBA Biología (09/2019 - 09/2019 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Regulación de la expresión génica en eucariotas, 5 horas, Teórico-Práctico

      • Curso Internacional "Genome and Gene Edition in Trypanosomes" (12/2018 - 12/2018 )

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Genome and Gene Edition in Trypanosomes, 10 horas, Teórico-Práctico

      • Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (09/2017 - 09/2017 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Regulación de la expresión génica en eucariotas, 2 horas

      • Curso Internacional (11/2016 - 11/2016 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        V Curso Internacional de Biología Molecular de Tripanosomátidos, 4 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Curso Internacional (10/2016 - 10/2016 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Wellcome Genome Campus Advanced Course: Working with Parasite Database Resources, 1 horas, Teórico

      • Curso Internacional (11/2013 - 11/2013 )

        Grado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Genómica del Cáncer, 10 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Curso Internacional (11/2013 - 11/2013 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Working with Pathogen Genomes. Instituto Sanger, 2 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Curso Internacional (09/2013 - 09/2013 )

        Grado
        Responsable
        Asignaturas:
        III Escuela regional de microbiología, 9 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Maestria en Bioinformatica (04/2013 - 05/2013 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso de Genomica y computacón, 10 horas, Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • PEDECIBA (11/2012 - 11/2012 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Biología Molecular de Tripanosomátidos, 15 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • Maestría en Bioinformática (07/2012 - 08/2012 )

        Grado
        Responsable
        Asignaturas:
        Generation of libraries for next generation sequencing, 30 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Maestría en Bioinformática (04/2009 - 04/2012 )

        Maestría
        Responsable
        Asignaturas:
        Bioquímica y Biología Molecular/Maestría en Bioinformática, 6 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Licenciatura en Bioquímica (03/2008 - 03/2012 )

        Pregrado
        Responsable
        Asignaturas:
        Taller de Biología Molecular, 4 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Maestría en Bioinformática (02/2011 - 03/2011 )

        Grado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Genomics applications, 30 horas, Teórico-Práctico

      • (12/2009 - 12/2009 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Working with Pathogen Genomes. Wellcome Trust Sanger Institute, 2 horas, Teórico

      • Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (12/2009 - 12/2009 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Regulación de la expresión génica en eucariotas, 2 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (05/2008 - 05/2008 )

        Grado
        
        Asignaturas:
        Regulación porst-transcripcional de la expresión génica en eucariotas, 15 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (12/2006 - 12/2006 )

        Grado
        
        Asignaturas:
        Small RNAs: New Mechanisms in gene expression regulation and tools for reverse genetics, 6 horas, Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Extensión

      • Jornadas Latitud Ciencias (09/2023 - 09/2023 )

        10 horas

      • Jornadas de Puertas Abiertas (06/2022 - 06/2022 )

        5 horas

      • Confeccion y mantenimiento de la pagina web (01/2006 - 01/2019 )

        Facultad de Ciencias, Laboratorio de Interacciones Moleculares
        2 horas

      • Jornadas Latitud Ciencias (07/2013 - 07/2018 )

        10 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Jornadas Latitud Ciencias (09/2016 - 09/2016 )

        5 horas

      • Jornadas Latitud Ciencias (07/2014 - 07/2014 )

        15 horas

      • Confección y mantenimiento del Sitio Web de la Sociedad Uruguaya de Biociencias (01/2007 - 06/2013 )

        10 horas

      • Semana de la Ciencia y la Tecnología (05/2006 - 05/2006 )

        Facultad de Ciencias, Laboratorio de Interacciones Moleculares
        6 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Semana de “La Ciencia y la Ética en el Uruguay”. Instituto Crandon. Exponiendo el poster: “Regulación de la expresión génica en Trypanosoma cruzi” (10/2003 - 10/2003 )

        Facultade de Ciencias, Laboratorio de Interacciones Moleculares
        1 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Pasantías

      • Pasantia en Department of Cell Biology and Molecular Genetics, Universidad de Maryland, EEUU (03/2011 - 05/2011 )

        Universidad de Maryland, Department of Cell Biology and Molecular Genetics
        60 horas semanales

      • Pasantia en Department of Cell Biology and Molecular Genetics, Universidad de Maryland, EEUU (11/2010 - 11/2010 )

        Universidad de Maryland, Department of Cell Biology and Molecular Genetics
        60 horas semanales

      • Pasantia en SAIC-Frederick, Instituto Nacional de Cancer del NIH, EEUU (11/2010 - 11/2010 )

        SAIC-Frederick, Instituto Nacional de Cancer del NIH, EEUU
        60 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • Pasantia en Instituto Carlos Chagas. Curitiba. Brasil (02/2010 - 03/2010 )

        Instituto Carlos Chagas. Curitiba. Brasil
        40 horas semanales

      • Pasantia en Department of Cell Biology and Molecular Genetics, Universidad de Maryland, EEUU (06/2009 - 08/2009 )

        Universidad de Maryland, Department of Cell Biology and Molecular Genetics
        60 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Pasantia en Department of Cell Biology and Molecular Genetics, Universidad de Maryland, EEUU (06/2008 - 08/2008 )

        Universidad de Maryland, Department of Cell Biology and Molecular Genetics
        60 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • Pasantia en Universidad Nacional de Rosario, Argentina (02/2008 - 02/2008 )

        Universidad Nacional de Rosario, Argentina, IBR Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas.
        60 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Pasantia en Universidad Nacional de Rosario, Argentina (12/2007 - 12/2007 )

        Universidad Nacional de Rosario, Argentina, IBR Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas
        60 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Pasantia en Instituto de Biología Molecular de Paraná. Curitiba, Brasil (06/2006 - 06/2006 )

        Instituto de Biología Molecular de Paraná. Curitiba, Brasil
        60 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Pasantia en Instituto de Biología Molecular de Paraná. Curitiba, Brasil (06/2005 - 06/2005 )

        Instituto de Biología Molecular de Paraná. Curitiba, Brasil
        60 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Gestión Académica

      • Integrante de la Comisión de Informática de la Facultad. Hasta 2024 en representación del Instituto de Biología (10/2013 - a la fecha )

        Facultad de Ciencias
        Participación en cogobierno 1 horas semanales

      • Integración de comisión asesora de llamado concursable (01/2011 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones

      • Integración de comisión asesora de llamado concursable (01/2015 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones

      • Representante de la Facultad de Ciencias en el Grupo de trabajo para la creación de la Licenciatura en Bioinformática. Area TyC NyH UdelaR (06/2023 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

      • Comisión de compras por licitación de materiales de laboratorio por el Instituto de Biología (01/2018 - 01/2021 )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

      • Comisión de compras por licitación de productos químicos por el Instituto de Biología (01/2017 - 01/2020 )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

      • Integrante en titularidad de la Comisión del Instituto de Química Biológica como representante del Orden Docente. (09/2011 - 09/2014 )

        Facultad de Ciencias, Laboratorio de Interacciones Moleculares
        Participación en cogobierno

• Sector Gobierno/Público - Ministerio de Educación y Cultura - Uruguay

  Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable

  • Vínculos con la Institución

    • Otro (03/2021 - a la fecha)

      Responsable del Laboratorio de Bioinformática 40 horas semanales

    • Funcionario/Empleado (05/2017 - a la fecha)Trabajo relevante

      Profesor Adjunto 40 horas semanales / Dedicación total

  • Actividades

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Translational Approach with AI for Klebsiella Drug Discovery (03/2026 - a la fecha)

        La propuesta tiene como objetivo identificar y priorizar nuevos blancos en Klebsiella pneumoniae utilizando herramientas in silico y de bioinformática, validar estos blancos mediante tecnología CRISPRi, y aprovechar plataformas impulsadas por inteligencia artificial para el diseño de novo de inhibidores, con el fin de descubrir nuevas entidades químicas susceptibles de ser optimizadas mediante enfoques de química medicinal. El equipo involucra nodos en 5 paises diferentes, siendo responsables del nodo en Uruguay.
        2 horas semanales
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:5
        Doctorado:10
        Financiación:
        Bill & Melinda Gates Foundation, Estados Unidos, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P. (Responsable)

      • Conociendo la intimidad de los parientes: Arachis villosa, el tío uruguayo del maní. (03/2023 - a la fecha)

        
        2 horas semanales
        Integrante del Equipo
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Doctorado:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.

      • RASTReo genómico de patOgenos (RASTRO) en CTIs (03/2023 - a la fecha)

        El control y monitoreo microbiológico de ambientes en centros de salud, es una parte imprescindible dentro de los cuidados para disminuir el riesgo de adquirir infecciones nosocomiales y el uso prudente de antibióticos. Habitualmente la detección de microorganismos en áreas asistenciales se hace principalmente mediante cultivos; método que tiene sus limitaciones. Las nuevas técnicas genómicas constituyen un avance en la detección de patógenos y sus regiones de patogenicidad/toxicidad. Este proyecto propone la aplicación de nuevas herramientas basadas en el uso de multiplexado y secuenciación masiva con la capacidad de detectar una o múltiples bacterias nocivas en muestras de superficies de Centros de Tratamientos Intensivos (CTIs).
        5 horas semanales
        Departamento de Genómica , Laboratorio de Bioinformática
        Coordinador o Responsable
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.

      • The role of trypanosome RNA binding protein TcUBP1 in post-transcriptional regulation (03/2023 - a la fecha)

        Chagas disease, a protozoan zoonotic disease caused by the parasite Trypanosoma cruzi, affects more than eight million people and produces around 10,000 annual deaths in the poorest locations of South America. Current pharmacological treatments for T. cruzi have been in use for decades, are most effective in the initial phase of the disease, and present high toxicity. This has made the WHO declare Chagas disease as neglected, a classification that implies that more research efforts are required to design new control strategies. Transcription in trypanosomes is polycistronic and mature mRNAs are generated by trans?splicing and polyadenylation. Given these unusual genetic mechanisms, T. cruzi mainly regulates gene expression at the post-transcriptional level. This highlights the relevance of RNA-binding proteins (RBPs) in the definition of its gene expression profile. The current proposal will focus on the study and characterization of T. cruzi U-rich RBP 1 (TcUBP1), a protein that our previous results underline as a key player in the parasite?s biology. TcUBP1 is expressed across all the stages of the parasite life cycle and can regulate the abundance of several target mRNAs through the recognition of specific binding elements in their 3?UTR regions. Our results show that its overexpression induces profound changes in the parasite phenotype. The effects include morphological and molecular biology alterations, by mechanisms that are only partially understood. The proposal aims to understand its role in post-transcriptional regulation, describing in detail its effects on the shaping of the parasite?s gene expression profiles and its molecular partners.
        5 horas semanales
        Departamento de Genómica , Laboratorio de Bioinformática
        Coordinador o Responsable
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Doctorado:1
        Financiación:
        International Center for Genetic Engineering and Biotechnology, Italia, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P. , De Gaudenzi, J.

      • Búsqueda y caracterización de lncRNAs en Trypanosoma cruzi (05/2024 - a la fecha)

        Trypanosoma cruzi es el protozoo parásito responsable de la enfermedad de Chagas, patología de alta prevalencia en América Central y del Sur, donde causa serios problemas de salud pública. Los RNAs largos no codificantes (lncRNA), se definen como RNAs cuya secuencia supera los 200 nucleótidos y no son traducidos a proteínas. Se ha descrito que los mismos participan de mecanismos de regulación génica a diferentes niveles, afectan diversos procesos biológicos como la diferenciación y el ciclo celular y son capaces de interaccionar con DNA, RNA, proteínas. En tripanosomátidos, solo recientemente en T. brucei se ha descrito el repertorio de lncRNAs, habiendo un único reporte de un lncRNA funcional involucrado en la diferenciación de este organismo. Con estos antecedentes, en la presente propuesta pretendemos identificar y caracterizar lncRNAs en T. cruzi.
        10 horas semanales
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Doctorado:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.

      • Red "genómica de la reproducción" (03/2019 - a la fecha)

        Red "genómica de la reproducción"
        1 horas semanales
        Departamento de Genómica
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Doctorado:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: Pablo SMIRCICH RUZO

      • Desarrollo de un método de detección múltiple de patógenos asociados a enfermedades de bovinos lecheros basado en secuenciación masiva y bioinformática (03/2021 - 12/2024 )

        Desarrollo de un método de detección múltiple de patógenos asociados a enfermedades de bovinos lecheros basado en secuenciación masiva y bioinformática
        3 horas semanales
        Integrante del Equipo
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Doctorado:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.

      • Technological Innovation Network in the study of parasitic diseases caused by helminths: genetic and genomic characterization with a focus on human and animal health (01/2021 - 05/2024 )

        Consorcio Uruguay-Argentina-Brasil
        5 horas semanales
        Coordinador o Responsable
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Doctorado:1
        Financiación:
        Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo, Estados Unidos, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.

      • Impacto de estrategias de alimentación y niveles de inclusión de pastura en la dieta de vacas lecheras sobre el ecosistema microbiano ruminal y las emisiones de gases de efecto invernadero (12/2019 - 12/2023 )

        
        5 horas semanales
        Integrante del Equipo
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.

      • Estudios de transcriptómica comparativa entre amastigotas celulares y amastigotas axénicos de Trypanosoma cruzi (04/2020 - 11/2023 )

        
        5 horas semanales
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P. (Responsable) , Bilbao, L. (Responsable)

      • Compresión de datos de secuenciación de genomas generados mediante tecnología de nanoporos (04/2018 - 07/2021 )

        
        5 horas semanales
        Departamento de Genómica
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Doctorado:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P. , Martín, A. (Responsable)

      • Dilucidando el sistema ligninolítico: del transcriptoma a la actividad enzimática (04/2019 - 04/2021 )

        
        1 horas semanales
        Otros
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.

      • Vigilancia epidemiológica del COVID-19 en las fronteras uruguayas y análisis de su transmisión en el interior del país (03/2020 - 02/2021 )

        Fundación Manuel Pérez - Fondo especial ?COVID-19?
        5 horas semanales
        Integrante del Equipo
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Especialización:1
        Maestría/Magister:1
        Doctorado:1
        Financiación:
        Contaduría General de la Nación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: Pablo SMIRCICH RUZO

      • Cuantización de indicadores de calidad en datos de secuenciación por nanoporos. Fondo Sectorial de Investigación a partir de Datos (01/2020 - 01/2021 )

        
        2 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Doctorado:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: SMIRCICH, P.

      • Aplicaciones de la Teoría de la Información al procesamiento de datos de secuenciación de genomas por nanoporos (03/2017 - 04/2019 )

        
        5 horas semanales
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: Pablo SMIRCICH RUZO

    • Docencia

      • Maestría en Bioinformática (05/2017 - 10/2022 )

        Maestría
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Taller de Bioinfrmática, 5 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Curso Internacional ?Biology of Parasitism?. Marine Biological Laboratory (MBL). Woods Hole, EEUU (06/2021 - 06/2021 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Curso Internacional ?Biology of Parasitism?. Marine Biological Laboratory (MBL). Woods Hole, EEUU, 5 horas, Teórico-Práctico

      • Curso Internacional "Estrategias bioinformáticas para el estudio de enfermedades tropicales desatendidas (ETDs)". MBL-EBI. Colombia (05/2021 - 05/2021 )

        Doctorado
        Invitado

      • Curso Internacional "Working with Protozoan Parasite Database Resources" (11/2019 - 11/2019 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Working with Protozoan Parasite Database Resources, 5 horas, Teórico

      • Curso Internacional ?I Escola latino-americana de bioinformática para as ciências ?ômicas? (06/2019 - 06/2019 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        I Escola latino-americana de bioinformática para as ciências ?ômicas", 5 horas, Teórico-Práctico

      • PEDECIBA, Biología (03/2018 - 03/2019 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Introducción a la línea de comandos y a la programación para análisis bioinformáticos, 5 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • CABBIO (07/2017 - 07/2017 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Ferramentas de bioinformática para análise de dados de RNA-seq”, 20 horas, Teórico-Práctico

    • Extensión

      • Charla de divulgación en el liceo numero 2 de La Paz (06/2025 - 06/2025 )

        3 horas

      • Charla en el evento "Ciencia que Siembra". Molino de Pérez. (06/2024 - 06/2024 )

        2 horas

      • Visitas de estudiantes de secundaria al Departamento (01/2023 - 12/2023 )

        2 horas

      • Jornadas IIBCE abierto (10/2023 - 10/2023 )

        10 horas

      • Zoomeregite en el IIBCE (08/2020 - 08/2020 )

        5 horas

      • Columna de Ciencia y Tecnología en UYPRESS: "Edición Genómica: Modificando el ADN" (04/2018 - 04/2018 )

        10 horas

    • Otra actividad técnico-científica relevante

      • Parte de los Equipos de Investigación del Centro de Investigación en Ciencias Ambientales (CICA) (06/2023 - a la fecha )

        2 horas semanales

    • Gestión Académica

      • Coordinador del Consejo Consultivo del IIBCE (04/2023 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones 1 horas semanales

      • Integrante de la Comisión Coordinadora de la Plataforma de Secuenciación Masiva del IIBCE (03/2022 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

      • Integración de comisiónes asesoras de llamados concursables (Niveles 1, 2 y 3) (08/2017 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones 1 horas semanales

      • Integrante de la Comisión de Educación (05/2024 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

      • Responsable de la Plataforma deBioseguridad del IIBCE (06/2020 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones 1 horas semanales

      • Integrante de la Comisión de Acervo (06/2025 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

      • Creación y coordinación del Laboratorio de Bioinformática del Departamento de Genómica del IIBCE (05/2021 - a la fecha )

        Gestión de la Investigación 40 horas semanales

      • Integrante de la Comisión de Género (03/2021 - 02/2025 )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

      • Integrante de la Comisión de Servicio de Monitoreo Ambiental (03/2020 - 01/2023 )

        Participación en consejos y comisiones 5 horas semanales

      • Integrante de la comisión que coordina acciones ante la crisis sanitaria por SARS-COV2 (03/2020 - 07/2022 )

        Participación en consejos y comisiones 5 horas semanales

• Sector Gobierno/Público - Agencia Nacional de Investigación e Innovación - Uruguay

  Agencia Nacional de Investigación e Innovación

  • Vínculos con la Institución

    • Otro (06/2020 - a la fecha)Trabajo relevante

      Investigador nivel 2 del Sistema Nacional de Investigadores 5 horas semanales

    • Otro (01/2014 - 05/2020)

      Investigador nivel 1 del Sistema Nacional 5 horas semanales

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Medicina

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (10/2015 - 04/2017)

      Profesor Adjunto 32 horas semanales / Dedicación total
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 3
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (01/2008 - 09/2015)

      Asistente 32 horas semanales / Dedicación total
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (07/2007 - 01/2008)

      Asistente 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Interino

    • Funcionario/Empleado (08/2003 - 07/2007)

      Ayudante 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Efectivo

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Estudios genómicos en helmintos parásitos (01/2007 - a la fecha )

        
        20 horas semanales
        Departamento de Genética , Integrante del equipo
        Equipo: TORT, J.
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática/Genómica

      • Caracterización de lncRNAs en E. granulosus (08/2013 - 05/2016 )

        
        20 horas semanales
        Departamento de Genética , Coordinador o Responsable
        Equipo: Pablo SMIRCICH RUZO
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Reanotación y análisis de genomas de platelmintos incorporando herramientas transcriptomicas de tercera generación (03/2017 - 08/2019 )

        Reanotación y análisis de genomas de platelmintos incorporando herramientas transcriptomicas de tercera generación
        3 horas semanales
        Facultad de Medicina , Departamento de Genetica
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: Pablo SMIRCICH RUZO
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • Generación de plataformas bioinformáticas integradas aplicadas a la búsqueda de compuestos antihelmínticos (03/2013 - 03/2016 )

        
        10 horas semanales
        Facultad de Medicina , Departamenteo de Genética
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Dirección de Innovación, Ciencia y Tecnología, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: TORT, J (Responsable)

      • Genómica Funcional del desarrollo de platelmintos parásitos (07/2011 - 07/2015 )

        
        5 horas semanales
        Facultad de Medicina , Departamento de Genetica
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: TORT, J. (Responsable) , CASTILLO, E. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica

      • Caracterización transcriptómica de neoblastos de platelmintos: hacia nuevas herramientas de genómica funcional (10/2012 - 06/2015 )

        
        10 horas semanales
        Facultad de Medicina , Departamenteo de Genética
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Equipo: TORT, J (Responsable)

      • Caracterización bioinformática de la familia de Leucina-amino-peptidasas en eucariotas (06/2009 - 06/2011 )

        
        5 horas semanales
        Facultad de Medicina , Departamento de Genetica
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Equipo: TORT, J.F. (Responsable)

      • Identificación de roles de las proteasas parasitarias de Fasciola hepatica en el proceso de invasión mediante herramientas de genómica funcional (01/2009 - 01/2011 )

        
        10 horas semanales
        Facultad de Medicina , Departamento de Genetica
        Investigación
        Otros
        Concluido
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: TORT, J.F. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • Caracterización primaria del transcriptoma del estadio invasivo de Fasciola hepatica (07/2006 - 08/2009 )

        
        20 horas semanales
        Departamento de Genética
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Equipo: TORT, J. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Docencia

      • Doctor en Medicina (01/2014 - a la fecha)

        Grado
        Responsable
        Asignaturas:
        Responsable de un teórico y un práctico en el Curso de Introducción a la Genética Humana., 3 horas

      • Medicina (06/2008 - 05/2017 )

        Pregrado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Biología Celular, 3 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • Doctor en Medicina (01/2015 - 05/2017 )

        Grado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Coordiinador del CBCC1 por el Departamento de Genética, 5 horas, Teórico-Práctico

      • PEDECIBA (06/2012 - 03/2017 )

        Maestría
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Taller de Bioinformática, 10 horas, Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • PEDECIBA (03/2014 - 06/2014 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Introducción a la Genética Humana, 10 horas, Teórico

      • Wellcome Trust Sanger Institute. Working with Pathogen Genomes (11/2013 - 11/2013 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Working with pathogen genomes, 10 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

      • PEDECIBA (11/2012 - 11/2012 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Taller Avances en la genomica funcional de helmintos parasitos, 5 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • Medicina (06/2008 - 06/2011 )

        Pregrado
        
        Asignaturas:
        Biología del desarrollo, 3 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • Wellcome Trust Sanger Institute. Working with Pathogen Genomes (12/2009 - 12/2009 )

        Grado
        Invitado
        Asignaturas:
        Working with Pathogen Genomes, 1 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica

      • Medicina (08/2003 - 01/2008 )

        Pregrado
        
        Asignaturas:
        Biología Celular, 6 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • Medicina (08/2003 - 01/2008 )

        Pregrado
        Responsable
        Asignaturas:
        Biología del Desarrollo, 2 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • Medicina (08/2003 - 01/2008 )

        Pregrado
        
        Asignaturas:
        Biología Tisular, 2 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

      • Medicina (08/2003 - 01/2008 )

        Pregrado
        
        Asignaturas:
        Ciclo Básico, 4 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

    • Extensión

      • Confeccion y mantenimiento de la pagina web (01/2006 - 05/2017 )

        Facultad de Medicina, Departamento de Genetica
        2 horas

      • Nota de prense diario "El País" (01/2017 - 01/2017 )

        Departamento de Genética
        2 horas

      • Nota de prensa diario "El Pais" (01/2017 - 01/2017 )

        Departamento de Genética
        2 horas

      • Semana de la Ciencia y Tecnología (05/2007 - 05/2007 )

        Facultad de Medicina
        6 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Semana de la Ciencia y Tecnología (05/2006 - 05/2006 )

        Facultad de Medicina
        6 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Otra actividad técnico-científica relevante

      • Diagnósticos moleculares de Síndrome de X-frágil (11/2003 - 12/2007 )

        Departamento de Genética
        20 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

    • Gestión Académica

      • Comisión Pagina Web (07/2013 - 01/2017 )

        Participación en consejos y comisiones

      • Participación en las “Jornadas Institucionales de Análisis del Nuevo Plan de Estudio” (09/2011 - 09/2011 )

        Facultad de Medicina, Departamento de Genetica
        Gestión de la Enseñanza

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Química

  • Vínculos con la Institución

    • Becario (10/2006 - 09/2007)

      Ayudante 20 horas semanales
      Proyecto “Nuevos metalofármacos de Paladio con tiosemicarbazonas bioactivas y su interacción con biomoléculas”
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

  • Actividades

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Nuevos metalofármacos de Paladio con tiosemicarbazonas bioactivas y su interacción con biomoléculas (11/2005 - 11/2007 )

        
        20 horas semanales
        Cátedra de Química Inorgánica
        Desarrollo
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Equipo: GAMBINO, D. (Responsable)
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Docencia

      • Doctorado en Química (UDELAR-PEDECIBA) (03/2005 - 03/2005 )

        Grado
        
        Asignaturas:
        Metales en Sistemas Biológicos, 4 horas, Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

Carga horaria

• Carga horaria de docencia: 11 horas
  
• Carga horaria de investigación: 40 horas
  
• Carga horaria de formación RRHH: 5 horas
  
• Carga horaria de extensión: 1 hora
  
• Carga horaria de gestión: 3 horas
  

Producción científica/tecnológica

• Las líneas de investigación en las cuales participo, apuntan principalmente a entender fenómenos biológicos a nivel molecular de organismos parásitos con importancia sanitaria y económica en nuestra región. En los últimos años me he focalizado en avanzar el conocimiento de la biología de tripanosomátidos parásitos utilizando fundamentalmente herramientas de genómica y bioinformática. El parásito Trypanosoma cruzi produce la enfermedad de Chagas, patología altamente prevalente en la región, para la cual no contamos con terapias adecuadas. En este sentido, he participado en el estudio del efecto de compuestos con actividad anti-tripanocida resultando en varias publicaciones. Por otra parte, la investigación básica en T. cruzi resulta relevante para conocer mecanismos distintivos que permitan desarrollar nuevas estrategias terapéuticas. En T. cruzi los procesos de expresión génica son especialmente interesantes, siendo la regulación post-transcripcional el principal mecanismo de control. En particular, mediante la utilización de aproximaciones experimentales genómicas y bioinformáticas me he dedicado a la búsqueda de señales que intervinieran en diferentes procesos del metabolismo del ADN y ARN así como en la descripción y a la caracterización de mecanismos de control del traductoma de T. cruzi. Esto resultó en varias publicaciones, algunas de ellas especialmente relevantes (por ejemplo, la publicación que describió por primera vez el traductoma y transcriptoma por RNA-seq de este organismo). Estas líneas de trabajo, junto con otras más recientes, las estoy desarrollando como investigador responsable del Laboratorio de Bioinformática del Departamento de Genómica del IIBCE y responsable de un grupo de trabajo enmarcado en la Sección Genómica Funcional de la Facultad de Ciencias en los que participan estudiantes de grado y posgrado a mi cargo. Por otra parte, la experiencia ganada en estas metodologías de trabajo nos permite interaccionar muy activamente con investigadores tanto nacionales como de la región e internacionales tanto en tripanosomatidos como en otros modelos variados. 

Producción bibliográfica

• Artículos publicados

  • Arbitrados

    • Beyond the transcript: Chromatin implications in trans-splicing in Trypanosomatids (Completo, 2026)

      ROMINA TRINIDAD ZAMBRANO SIRI , PAULA BEATI , LUCAS INCHAUSTI , PABLO SMIRCICH , GUILLERMO DANIEL ALONSO , JOSEFINA OCAMPO
      PLoS ONE, v.: 21 2026
      Lugar de publicación: United states
      E-ISSN: 19326203
      DOI: 10.1371/journal.pone.0343367
      https://doi.org/10.1371/journal.pone.0343367
      
      

    • Transcriptomic dynamics reveals sequential acquisition of complement resistance during prolonged starvation of Trypanosoma cruzi epimastigote (Completo, 2026)

      LETICIA PÉREZ-DÍAZ , PABLO SMIRCICH , FABRICIO HERNANDEZ , MARTIN CIGANDA , MA ANA DUHAGON , BEATRIZ GARAT
      Memorias Do Instituto Oswaldo Cruz, v.: 121 2026
      Lugar de publicación: Brazil
      E-ISSN: 16788060
      DOI: 10.1590/0074-02760250127
      https://doi.org/10.1590/0074-02760250127
      
      

    • Single-cell RNA-seq reveals trans-sialidase-like superfamily gene expression heterogeneity in Trypanosoma cruzi populations (Completo, 2026)

      LUCAS INCHAUSTI , LUCIA BILBAO , VANINA A CAMPO , JOAQUÍN GARAT , JOSÉ SOTELO-SILVEIRA , GABRIEL RINALDI , VIRGINIA M HOWICK , MARIA A DUHAGON , JAVIER G DE GAUDENZI , PABLO SMIRCICH
      eLife, v.: 14 2026
      Lugar de publicación: United kingdom
      E-ISSN: 2050084X
      DOI: 10.7554/elife.105822
      https://doi.org/10.7554/elife.105822
      
      

    • From genome to lifestyle: adaptive strategies of Pseudomonas sp. AU10 and its Antarctic lineage (Completo, 2026)

      CÉSAR X. GARCÍA-LAVIÑA , PABLO SMIRCICH , SUSANA CASTRO-SOWINSKI
      Applied and Environmental Microbiology, v.: 92 2026
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00992240
      E-ISSN: 10985336
      DOI: 10.1128/aem.02470-25
      https://doi.org/10.1128/aem.02470-25
      
      

    • Neuronal Subtype–Specific Ribosomal Protein mRNA Expression (Completo, 2026)

      GARAT, J , Niño Rivero , LAGOS, P. , DI PAOLO A. , SMIRCICH, P. , SOTELO SILVEIRA, J.
      RNA, 2026
      ISSN: 13558382
      E-ISSN: 14699001
      
      

    • Expanding kinetoplastid genome annotation through protein structure comparison (Completo, 2025)

      JUAN MANUEL TRINIDAD-BARNECH , JOSÉ SOTELO-SILVEIRA , DARÍO FERNÁNDEZ DO PORTO , PABLO SMIRCICH
      PLoS Pathogens, v.: 21 2025
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 15537366
      E-ISSN: 15537374
      DOI: 10.1371/journal.ppat.1013120
      https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013120
      
      

    • Exploring a gene co-expression network throughout the Trypanosoma cruzi life cycle (Completo, 2025)

      LUCAS INCHAUSTI , ÁLVARO MARTÍN , LETICIA PÉREZ-DÍAZ , BEATRIZ GARAT , MARÍA ANA DUHAGON , JOSÉ SOTELO-SILVEIRA , JAVIER G. DE GAUDENZI , PABLO SMIRCICH
      BMC Genomics, v.: 26 2025
      Lugar de publicación: United kingdom
      E-ISSN: 14712164
      DOI: 10.1186/s12864-025-12095-7
      https://doi.org/10.1186/s12864-025-12095-7
      
      

    • RNA-seq data exploration after trypanosome RNA-binding protein UBP1 expression is altered by CRISPR-Cas9 gene editing and overexpression (Completo, 2024)

      KARINA B. SABALETTE , VANINA A. CAMPO , JOSÉ R. SOTELO-SILVEIRA , PABLO SMIRCICH , JAVIER G. DE GAUDENZI
      Data in Brief, v.: 53 p.:110156 2024
      Lugar de publicación: Netherlands
      E-ISSN: 23523409
      DOI: 10.1016/j.dib.2024.110156
      http://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2024.110156
      
      

    • Applicability of DNA barcoding-based analyses on the diet of the gray brocket deer (Subulo gouazoubira) in xeric hillside forests (Completo, 2024)

      MARIANA COSSE , ANTONELLA BRUNO , NATALIA MANNISE , NADIA BOU , MARIA ZABALETA , MAURICIO BONIFACINO , ARLEY CAMARGO , PABLO SMIRCICH , ANDRÉS IRIARTE , ALEJANDRO BRAZEIRO
      Therya, v.: 15 p.:51 - 58, 2024
      Lugar de publicación: Mexico
      E-ISSN: 20073364
      DOI: 10.12933/therya-24-5746
      http://dx.doi.org/10.12933/therya-24-5746
      
      

    • Genomic characterization of Moraxella bovis and Moraxella bovoculi Uruguayan strains isolated from calves with infectious bovine keratoconjunctivitis (Completo, 2024)

      LUCÍA BILBAO , SOFÍA ACQUISTAPACE , ANA UMPIÉRREZ , PABLO SMIRCICH , PABLO ALONZO , JOSÉ R. SOTELO-SILVEIRA , PABLO ZUNINO
      Revista Argentina de Microbiología, 2024
      Lugar de publicación: Spain
      ISSN: 03257541
      DOI: 10.1016/j.ram.2023.12.003
      http://dx.doi.org/10.1016/j.ram.2023.12.003
      
      

    • Uncovering a multitude of stage-specific splice variants and putative protein isoforms generated along mouse spermatogenesis (Completo, 2024)

      CARLOS ROMEO-CARDEILLAC , MARÍA FERNANDA TROVERO , SANTIAGO RADÍO , PABLO SMIRCICH , ROSANA RODRÍGUEZ-CASURIAGA , ADRIANA GEISINGER , JOSÉ SOTELO-SILVEIRA
      BMC Genomics, v.: 25 2024
      Lugar de publicación: United kingdom
      E-ISSN: 14712164
      DOI: 10.1186/s12864-024-10170-z
      http://dx.doi.org/10.1186/s12864-024-10170-z
      
      

    • Transcriptomic analysis of N-terminal mutated Trypanosoma cruzi UBP1 knockdown underlines the importance of this RNA-binding protein in parasite development (Completo, 2024)

      KARINA B. SABALETTE , VANINA A. CAMPO , JOSÉ R. SOTELO-SILVEIRA , PABLO SMIRCICH* , JAVIER G. DE GAUDENZI*
      PLoS Neglected Tropical Diseases, v.: 18 2024
      Lugar de publicación: United states
      E-ISSN: 19352735
      DOI: 10.1371/journal.pntd.0012179
      http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0012179
      *Autor de correspondencia
      
      

    • Transcriptome analysis of the allotetraploids of the Dilatata group of Paspalum (Poaceae): effects of diploidization on the expression of defensin and Snakin/GASA genes (Completo, 2024)

      SUSANA RODRÍGUEZ-DECUADRO , STEFANI RAMOS , MARÍA JOSÉ RODRÍGUEZ-USTRA , ANDRÉ MARQUES , PABLO SMIRCICH , MAGDALENA VAIO
      Functional & Integrative Genomics, v.: 24 2024
      Lugar de publicación: Germany
      ISSN: 1438793X
      E-ISSN: 14387948
      DOI: 10.1007/s10142-024-01466-0
      https://doi.org/10.1007/s10142-024-01466-0
      
      

    • Transcriptomic analysis of the adaptation to prolonged starvation of the insect-dwelling Trypanosoma cruzi epimastigotes (Completo, 2023)Trabajo relevante

      PABLO SMIRCICH* , LETICIA PÉREZ-DÍAZ , FABRICIO HERNÁNDEZ , MARÍA ANA DUHAGON , BEATRIZ GARAT*
      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, v.: 13 2023
      Lugar de publicación: Switzerland
      E-ISSN: 22352988
      DOI: 10.3389/fcimb.2023.1138456
      http://dx.doi.org/10.3389/fcimb.2023.1138456
      *Autor de Correspondencia
      
      

    • Omics data integration facilitates target selection for new antiparasitic drugs against TriTryp infections (Completo, 2023)Trabajo relevante

      MARTIN RIVARA-ESPASANDÍN , MIRANDA CLARA PALUMBO , EZEQUIEL J. SOSA , SANTIAGO RADÍO , ADRIÁN G. TURJANSKI , JOSÉ SOTELO-SILVEIRA , DARIO FERNANDEZ DO PORTO* , PABLO SMIRCICH*
      Frontiers in Pharmacology, v.: 14 2023
      Lugar de publicación: Switzerland
      E-ISSN: 16639812
      DOI: 10.3389/fphar.2023.1136321
      http://dx.doi.org/10.3389/fphar.2023.1136321
      *Autor de Correspondencia
      
      

    • RNA-Seq reveals that overexpression of TcUBP1 switches the gene expression pattern toward that of the infective form of Trypanosoma cruzi (Completo, 2023)

      KARINA B. SABALETTE , JOSÉ R. SOTELO-SILVEIRA , PABLO SMIRCICH , JAVIER G. DE GAUDENZI
      Journal of Biological Chemistry, v.: 299 p.:104623 2023
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00219258
      E-ISSN: 1083351X
      DOI: 10.1016/j.jbc.2023.104623
      http://dx.doi.org/10.1016/j.jbc.2023.104623
      
      

    • Translational control byTrypanosoma bruceiDRBD18 contributes to the maintenance of the procyclic state (Completo, 2023)Trabajo relevante

      MARTIN CIGANDA , JOSÉ SOTELO-SILVEIRA , ASHUTOSH P. DUBEY , PARUL PANDEY , JOSEPH T. SMITH , SHICHEN SHEN , JUN QU , PABLO SMIRCICH* , LAURIE K. READ*
      RNA, v.: 29 p.:1881 - 1895, 2023
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 13558382
      E-ISSN: 14699001
      DOI: 10.1261/rna.079625.123
      http://dx.doi.org/10.1261/rna.079625.123
      *Autor de Correspondencia
      
      

    • Improving genome-wide mapping of nucleosomes in Trypanosome cruzi. (Completo, 2023)

      PAULA BEATI , MILENA MASSIMINO STEPÑICKA , SALOMÉ C. VILCHEZ LARREA , PABLO SMIRCICH , GUILLERMO D. ALONSO , JOSEFINA OCAMPO
      PLoS ONE, v.: 18 2023
      Lugar de publicación: United states
      E-ISSN: 19326203
      DOI: 10.1371/journal.pone.0293809
      http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0293809
      
      

    • Nanopore quality score resolution can be reduced with little effect on downstream analysis (Completo, 2022)

      Rivara Espasandín, M. , Balestrazzi, L. , Guillermo Dufort Y Alvarez , Ochoa, I. , Seroussi, G. , SMIRCICH, P. , SOTELO SILVEIRA, J. , ÁLVARO MARTÍN
      Bioinformatics Advances, 2022
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
      E-ISSN: 26350041
      DOI: 10.1093/bioadv/vbac054
      
      

    • Current Status of Regulatory Non-Coding RNAs Research in the Tritryp (Completo, 2022)

      RAFAEL SEBASTIAN FORT , SANTIAGO CHAVEZ , Juan Manuel Trinidad Barnech , OLIVEIRA-RIZZO C. , SMIRCICH, P. , SOTELO SILVEIRA, J. , DUHAGON MA
      Non-Coding RNA, 2022
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      E-ISSN: 2311553X
      DOI: 10.3390/ncrna8040054
      
      

    • Crystal structure of Trypanosoma cruzi heme peroxidase and characterization of its substrate specificity and compound I intermediate (Completo, 2022)

      Freeman, S.L. , Vera Skafar , Kwon, H. , Fielding, A.J. , Moody, P.C.E. , Martínez, A. , Issoglio, F.M. , Lucas Inchausti , SMIRCICH, P. , A. ZEIDA , PIACENZA, L , RADI, R , Raven, E.L.
      Journal of Biological Chemistry, 2022
      ISSN: 00219258
      E-ISSN: 1083351X
      DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102204
      
      

    • Antimicrobial peptides in the seedling transcriptome of the tree legume Peltophorum dubium (Completo, 2021)

      Rodríguez-Decuadro, S. , da Rosa, G. , Radío, S. , Barraco-Vega, M. , Benko-Iseppon, A.M. , Dans, P. , SMIRCICH, P. , Cecchetto,G.
      Biochimie, v.: 180 2021
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      ISSN: 03009084
      DOI: 10.1016/j.biochi.2020.11.005
      
      

    • Recurrent dissemination of SARS-CoV-2 through the Uruguayan-Brazilian border (Completo, 2021)

      Mendonça, A. C. , Vega, Y. , Salazar, C. , Ferrés, I. , Smircich, P. , Sotelo-Silveira, J. , Fort, R. S. , Matho, C. , Gomes Arantes, I. , Reis Appolinario, L. , Alonso, C. , Benitez-Galeano, M. J. , Simoes, C. , Graña, M. , Motta, F. , Mendonça Siqueira, M. , Bello Bentancor, G. J. , Colina, R. , Spangenberg, L. , Reyes, N. , Mir, D. , Rego, N. , Resende, P. C. , López-Tort, F. , Fernández-Calero, T. , Noya, V. E. , Brandes, M. , Possi, T. , Arleo, M. , SMIRCICH, P. , Victoria, M. , Lizasoain, A. , Castells, M. , Maya, L. , Salvo, M. , Schäffer Gregianini, T. , Mar da Rosa, M. T. , Garay Martins, L.
      Frontiers in Microbiology, 2021
      E-ISSN: 1664302X
      DOI: doi.org/10.3389/fmicb.2021.653986
      
      

    • RENANO: a REference-based compressor for NANOpore FASTQ files (Completo, 2021)

      G. Dufort y Alvarez , G. Seroussi , SMIRCICH, P. , J. Sotelo-Silveira , I. Ochoa , A. Martín
      Bioinformatics, 2021
      ISSN: 13674803
      E-ISSN: 14602059
      DOI: 10.1093/bioinformatics/btab437
      
      

    • Functional Genomics of Axons and Synapses to Understand Neurodegenerative Diseases (Completo, 2021)

      Di Paolo, A. , Garat, J. , Eastman, G. , Farias, J. , Dajas-Bailador, F. , SMIRCICH, P. , Sotelo-Silveira, J.R.
      Frontiers in Cellular Neuroscience, 2021
      E-ISSN: 16625102
      DOI: doi: 10.3389/fncel.2021.686722
      
      

    • Extensive Translational Regulation through the Proliferative Transition of Trypanosoma cruzi Revealed by Multi-Omics (Completo, 2021)

      SANTIAGO CHÁVEZ , MICHAEL D. URBANIAK , CORINNA BENZ , PABLO SMIRCICH , BEATRIZ GARAT , JOSÉ R. SOTELO-SILVEIRA , MARÍA ANA DUHAGON
      mSphere, v.: 6 2021
      Lugar de publicación: United states
      E-ISSN: 23795042
      DOI: 10.1128/msphere.00366-21
      http://dx.doi.org/10.1128/msphere.00366-21
      
      

    • Emergence and Spread of a B.1.1.28-Derived P.6 Lineage with Q675H and Q677H Spike Mutations in Uruguay (Completo, 2021)

      NATALIA REGO , CECILIA SALAZAR , MERCEDES PAZ , ALICIA COSTÁBILE , ALVARO FAJARDO , IGNACIO FERRÉS , PAULA PERBOLIANACHIS , TAMARA FERNÁNDEZ-CALERO , VERONICA NOYA , MATIAS R. MACHADO , MARIANA BRANDES , RODRIGO ARCE , MAILEN ARLEO , TANIA POSSI , NATALIA REYES , MARÍA NOEL BENTANCOR , ANDRÉS LIZASOAIN , VIVIANA BORTAGARAY , ANA MOLLER , ODHILLE CHAPPOS , NICOLAS NIN , JAVIER HURTADO , MELISSA DUQUÍA , MARIA BELÉN GONZÁLEZ , LUCIANA GRIFFERO , MAURICIO MÉNDEZ , MARIA PÍA TECHERA , JUAN ZANETTI , EMILIANO PEREIRA , BERNARDINA RIVERA , MATÍAS MAIDANA , MARTINA ALONSO , PABLO SMIRCICH , IGHOR ARANTES , DAIANA MIR , CECILIA ALONSO , JULIO MEDINA , HENRY ALBORNOZ , RODNEY COLINA , GONZALO BELLO , PILAR MORENO , GONZALO MORATORIO , GREGORIO IRAOLA , LUCÍA SPANGENBERG
      Viruses, v.: 13 p.:1801 2021
      Lugar de publicación: Switzerland
      E-ISSN: 19994915
      DOI: 10.3390/v13091801
      http://dx.doi.org/10.3390/v13091801
      
      

    • Real-Time Genomic Surveillance for SARS-CoV-2 Variants of Concern, Uruguay (Completo, 2021)

      NATALIA REGO , ALICIA COSTÁBILE , MERCEDES PAZ , CECILIA SALAZAR , PAULA PERBOLIANACHIS , LUCÍA SPANGENBERG , IGNACIO FERRÉS , RODRIGO ARCE , ALVARO FAJARDO , MAILEN ARLEO , TANIA POSSI , NATALIA REYES , MA NOEL BENTANCOR , ANDRÉS LIZASOAIN , MARÍA JOSÉ BENÍTEZ , VIVIANA BORTAGARAY , ANA MOLLER , GONZALO BELLO , IGHOR ARANTES , MARIANA BRANDES , PABLO SMIRCICH , ODHILLE CHAPPOS , MELISSA DUQUÍA , BELÉN GONZÁLEZ , LUCIANA GRIFFERO , MAURICIO MÉNDEZ , MA PÍA TECHERA , JUAN ZANETTI , BERNARDINA RIVERA , MATÍAS MAIDANA , MARTINA ALONSO , CECILIA ALONSO , JULIO MEDINA , HENRY ALBORNOZ , RODNEY COLINA , VERONICA NOYA , GREGORIO IRAOLA , TAMARA FERNÁNDEZ-CALERO , GONZALO MORATORIO , PILAR MORENO
      Emerging Infectious Diseases, v.: 27 p.:2957 - 2960, 2021
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 10806040
      E-ISSN: 10806059
      DOI: 10.3201/eid2711.211198
      http://dx.doi.org/10.3201/eid2711.211198
      
      

    • Upstream ORFs Influence Translation Efficiency in the Parasite Trypanosoma cruzi (Completo, 2020)

      Radío, S. , Garat, B, , Sotelo-Silveira, J. , SMIRCICH, P.*
      Frontiers in Genetics, 2020
      E-ISSN: 16648021
      DOI: doi.org/10.3389/fgene.2020.00166
      *Autor de correspondencia
      
      

    • Comparative high-throughput analysis of the Trypanosoma cruzi response to organometallic compounds (Completo, 2020)

      Mosquillo, F. , SMIRCICH, P. , Ciganda, M. , Lima, A. , Gambino, D. , Garat, B. , Pérez-Díaz, L.
      Metallomics, 2020
      ISSN: 17565901
      E-ISSN: 1756591X
      
      

    • High Throughput Approaches to Unravel the Mechanism of Action of a New Vanadium-Based Compound against Trypanosoma cruzi (Completo, 2020)

      Mosquillo, F. , SMIRCICH, P. , Lima, A. , Gehrke,S. , Scalese, G. , Machado, I. , Gambino, D. , Garat, B. , Pérez-Díaz, L.
      Bioinorganic Chemistry and Applications, 2020
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genomica y bioinformática
      ISSN: 15653633
      E-ISSN: 1687479X
      DOI: 10.1155/2020/1634270
      
      

    • ENANO: Encoder for NANOpore FASTQ files (Completo, 2020)

      Dufort y Álvarez, G. , Seroussi, G. , SMIRCICH, P. , Sotelo, J. , Ochoa, I. , Martín, A
      Bioinformatics, 2020
      ISSN: 13674803
      E-ISSN: 14602059
      DOI: doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa551
      
      

    • EIF2 alpha phosphorylation is regulated in intracellular amastigotes for generation of infective Trypanosoma cruzi trypomastigote forms. (Completo, 2020)

      Castro Machado, F. , Bittencourt?Cunha Amaranta, P. , Malvezzi, M. , Árico, M. , Radio, S. , SMIRCICH, P. , Zoltner, M. , Field, MC. , Schenkman, S.
      Cellular Microbiology, 2020
      ISSN: 14625814
      E-ISSN: 14625822
      DOI: 10.1111/cmi.13243
      
      

    • Draft Genome Sequence of the UV-Resistant Antarctic Bacterium Sphingomonas sp. Strain UV9 (Completo, 2019)

      Marizcurrena, J.J. , Morales, D. , SMIRCICH, P. , Castro-Sowinski S.
      Microbiology Resource Announcements, 2019
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática
      E-ISSN: 2576098X
      DOI: doi.org/10.1128/MRA.01651-18
      
      

    • Conserved motifs in nuclear genes encoding predicted mitochondrial proteins in Trypanosoma cruzi (Completo, 2019)

      Becco, L. , SMIRCICH, P. , Garat, B.
      PLoS ONE, 2019
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y bioinformática
      E-ISSN: 19326203
      DOI: 10.1371/journal.pone.0215160
      
      

    • Compositional analysis of flatworm genomes shows strong codon usage biases across all classes (Completo, 2019)

      Lamolle, G. , Fontenla, S. , Rijo, G. , Tort, J.F.* , SMIRCICH, P.*
      Frontiers in Genetics, 2019
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      E-ISSN: 16648021
      DOI: 10.3389/fgene.2019.00771
      *Autor de Correspondencia
      
      

    • Pleiotropic alterations in gene expression in Latin American Fasciola hepatica isolates with different susceptibility to drugs (Completo, 2018)

      Radío , Fontenla , Matos Salim , Araújo , Ortiz , Hoban , Miranda , Gayo , Pais , P. , HOBAN , Solana , Oliveira , Smircich# , Tort#
      Parasites & Vectors, v.: 11 1 56, 2018
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinforática
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 17563305
      DOI: 10.1186/s13071-017-2553-2
      https://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-85041125211&partnerID=40&md5=0c55f2735b712d52210
      Autor de Correspondencia junto al Dr. Tort
      
      

    • Following Ribosome Footprints to Understand Translation at a Genome Wide Level (Completo, 2018)

      Eastman, G. , SMIRCICH, P. , Sotelo-Silveira, J.
      Computational and Structural Biotechnology Journal, 2018
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      E-ISSN: 20010370
      
      

    • Different SNPs in Fasciola hepatica P-glycoprotein from diverse Latin American populations are not associated with Triclabendazole resistance (Completo, 2018)

      Solana, M.V, , Domínguez, M.F. , Scarcella, S. , Radío, S. , SMIRCICH, P. , Fernández, S. , Solana, H. , Tort, J.F.
      Molecular and Biochemical Parasitology, p.:57 - 60, 2018
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      ISSN: 01666851
      
      

    • UTRme: a scoring-based tool to annotate untranslated regions in trypanosomatid genomes. (Completo, 2018)Trabajo relevante

      Radío, S. , Fort, R. S. , Garat, B. , Sotelo-Silveira, J. , SMIRCICH, P.*
      Frontiers in Genetics, 2018
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática
      E-ISSN: 16648021
      DOI: 10.3389/fgene.2018.00671
      * Autor de correspondencia
      
      

    • Nuclear Compartmentalization Contributes to Stage-Specific Gene Expression Control in Trypanosoma cruzi (Completo, 2017)

      PASTRO, L. , SMIRCICH, P. , DI PAOLO, A. , BECCO, L. , DUHAGON, M.A. , SOTELO-SILVEIRA, J. , GARAT, B.
      Frontiers A Journal of Women Studies, v.: 5 8 , 2017
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      ISSN: 01609009
      E-ISSN: 15360334
      
      

    • Genomes of Fasciola hepatica from the Americas reveal colonization with Neorickettsia endobacteria related to the agents of Potomac horse and human Sennetsu fevers. (Completo, 2017)

      MCNULTY, S. , TORT, J.F. , RINALDI, G. , FISCHER, K. , ROSA, B. , SMIRCICH, P. , FONTENLA, S. , CHOI, Y. , TYAGI, R. , HALLWORTH-PEPIN, K. , MANN, V.H. , KAMMILI, L. , LATHAM, P. , DELL’OCA, N. , DOMINGUEZ, F. , CARMONA, C. , FISCHER, P. , BRINDLEY, P. , MITREVA, M.
      PLoS Genetics, v.: 13 1 , 2017
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      ISSN: 15537390
      E-ISSN: 15537404
      DOI: journal.pgen.1006537
      
      

    • Transcriptome-wide analysis of the Trypanosoma cruzi proliferative cycle identifies the periodically expressed mRNAs and their multiple levels of control (Completo, 2017)

      CHáVEZ, S. , EASTMAN, G. , SMIRCICH, P. , BECCO, L. , OLIVEIRA-RIZZO, C. , FORT, R. , POTENZA, M. , GARAT, B. , SOTELO-SILVEIRA, J. , DUHAGON, M.A.
      PLoS ONE, 2017
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      E-ISSN: 19326203
      
      

    • Conservation and diversification of small RNA pathways within flatworms (Completo, 2017)

      FONTENLA, S. , RINALDI, G. , SMIRCICH, P. , TORT, J.F.
      BMC Evolutionary Biology, v.: 17 215 , 2017
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      E-ISSN: 14712148
      DOI: 10.1186/s12862-017-1061-5
      http://rdcu.be/vKmy
      
      

    • Intrinsic DNA curvature in trypanosomes (Completo, 2017)

      SMIRCICH, P. , EL-SAYED, N. , GARAT, B.
      BMC Research Notes, v.: 10 1 , p.:585 - 592, 2017
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      E-ISSN: 17560500
      DOI: 10.1186/s13104-017-2908-y
      
      

    • Ribosome profiling reveals translation control as a key mechanism generating differential gene expression in Trypanosoma cruzi (Completo, 2015)Trabajo relevante

      SMIRCICH, P. , EASTMAN, G. , BISPO, S. , DUHAGON, M. , GUERRA-SLOMPO, E. P. , GARAT, B. , GOLDENBERG, S. , MUNROE, D. , DALLAGIOVANNA, B. , HOLETZ, F. , SOTELO-SILVEIRA, J.R.
      BMC Genomics, v.: 16 443 , 2015
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      E-ISSN: 14712164
      ; ; ; ;
      
      

    • A Novel Terminal-Repeat Retrotransposon in Miniature (TRIM) Is Massively Expressed in Echinococcus multilocularis Stem Cells (Completo, 2015)

      KOZIOL, U. , RADíO, S. , SMIRCICH, P. , ZAROWIECKI, M. , FERNANDEZ, C. , BREHM, K.
      Genome Biology and Evolution, v.: 7 8 , 2015
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      E-ISSN: 17596653
      
      

    • The miRnome of Fasciola hepatica juveniles endorses the existence of a reduced set of highly divergent micro RNAs in parasitic flatworms (Completo, 2015)

      FONTENLA, S. , DELL OCA, N. , SMIRCICH, P. , TORT, J. , SILES LUCAS, M.
      International Journal for Parasitology, v.: 15 2015
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      ISSN: 00207519
      DOI: 10.1016/j.ijpara.2015.06.007
      
      

    • Conserved Curvature of RNA Polymerase I Core Promoter Beyond rRNA Genes: The Case of the Tritryps (Completo, 2015)

      SMIRCICH, P. , DUHAGON, M.A. , GARAT, B.
      Genomics Proteomics & Bioinformatics, v.: 13 6 , p.:355 - 363, 2015
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      ISSN: 16720229
      DOI: 10.1016/j.gpb.2015.09.005
      
      

    • Genomic Analysis of Sequence-Dependent DNA Curvature in Leishmania (Completo, 2013)Trabajo relevante

      SMIRCICH, P. , FORTEZA, D. , EL-SAYED, N. , GARAT, B
      PLoS ONE, v.: 8 4 , 2013
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 19326203
      DOI: :10.1371/journal.pone.0063068
      
      

    • Implication of CA repeated tracts on post-transcriptional regulation in Trypanosoma cruzi (Completo, 2013)

      PASTRO L , SMIRCICH, P. , PEREZ-DIAZ L , DUHAGON MA , GARAT B
      Experimental Parasitology, 2013
      Palabras clave: cruzi ca gene expression dinucleotide transcription
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      E-ISSN: 10902449
      DOI: S0014-4894(13)00116-1
      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&dopt=Citation&list_uids=2363187
      
      

    • Evidence for a negative feedback control mediated by the 3' untranslated region assuring the low expression level of the RNA binding protein TcRBP19 in T. cruzi epimastigotes (Completo, 2013)

      PÉREZ-DÍAZ, L. , PASTRO L , SMIRCICH, P. , DALLAGIOVANNA, B. , GARAT, B
      Biochemical and Biophysical Research Communications, v.: 436 2 , p.:295 - 299, 2013
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 0006291X
      E-ISSN: 10902104
      DOI: 10.1016/j.bbrc.2013.05.096
      
      

    • Vasa-Like DEAD-Box RNA Helicases of Schistosoma mansoni (Completo, 2012)

      SKINNER, D.E. , RINALDI, G. , SUTTIPRAPA, S. , MANN, V.H. , SMIRCICH, P. , COGSWELL, A.A. , WILLIAMS, D.L. , BRINDLEY, P.J.
      PLoS Neglected Tropical Diseases, v.: 6 6 , 2012
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      E-ISSN: 19352735
      DOI: 10.1371/journal.pntd.0001686
      
      

    • DNA as molecular target of analogous palladium and platinum anti-Trypanosoma cruzi compounds: a comparative study. (Completo, 2011)

      VIEITES, M. , SMIRCICH, P. , PAGANO, L. , OTERO, L. , LUANE FISCHER, F. , TERENZI, H. , PRIETO, M. J. , MORENO, V. , GARAT, B , GAMBINO, D.
      Journal of Inorganic Biochemistry, v.: 105 12 , p.:1704 - 1711, 2011
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 01620134
      
      

    • Comparative genomic analysis of dinucleotide repeats in Tritryps (Completo, 2011)

      DUHAGON, M.A. , SMIRCICH, P. , FORTEZA, D. , NAYA, H. , WILLIAMS, N. , GARAT, B
      Gene, 2011
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformatica
      ISSN: 03781119
      
      

    • Survey of transcripts expressed by the invasive juvenile stage of the liver fluke Fasciola hepatica (Completo, 2010)

      CANCELA, M. , RUETALO, N. , DELLOCA, N. , DASILVA, E. , SMIRCICH, P. , RINALDI, G. , ROCHE, L. , CARMONA, C. , ALVAREZ-VALÍN, F. , ZAHA, A. , TORT, J.F.
      BMC Genomics, v.: 11 227 , 2010
      Palabras clave: Transcriptomica Trematodo Invasion Fasciola hepatica
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Métodos de Investigación en Bioquímica / Transcriptomica
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biologia Molecular de Parasitos
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Bioinformatica
      Medio de divulgación: Papel
      E-ISSN: 14712164
      www.biomedcentral.com/bmcgenomics/
      
      

    • Synthesis and characterization of a pyridine-2-thiol N-oxide gold(I) complex with potent antiproliferative effect against Leishmania sp. Insight into its mechanism of action (Completo, 2009)

      VIEITES, M. , SMIRCICH, P. , GUGGERI, L. , MARCHAN, E. , GÓMEZ-BARRIO, A. , NAVARRO, M. , GARAT, B. , GAMBINO, D.
      Journal of Inorganic Biochemistry, 2009
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: PMID: 19361864
      ISSN: 01620134
      Mar 17. [Epub ahead of print] PMID: 19361864
      
      

    • Cytotoxic palladium complexes of bioreductive quinoxaline N1,N4-dioxide prodrugs (Completo, 2009)

      URQUIOLA, C. , VIEITES, M. , TORRE, M. H. , CABRERA, M. , LAVAGGI, L. , CERECETTO, H. , GONZÁLEZ, M. , LÓPEZ DE CERAIN, A. , MONGE, A. , SMIRCICH, P. , GARAT, B , GAMBINO, D.
      Bioorganic & Medicinal Chemistry, v.: 17 4 , p.:1623 - 9, 2009
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 09680896
      E-ISSN: 14643391
      
      

    • Potent in vitro anti-Trypanosoma cruzi activity of pyridine-2-thiol N-oxide metal complexes having an inhibitory effect on parasite-specific fumarate reductase (Completo, 2008)

      VIEITES, M. , SMIRCICH, P. , PARAJÓ-COSTA, B. , RODRÍGUEZ, J. , GALAZ, V. , OLEA-AZAR, C. , OTERO, L. , AGUIRRE, G. , CERECETTO, H. , GONZÁLEZ, M. , GÓMEZ-BARRIO, A. , GARAT, B , GAMBINO, D.
      JBIC Journal of Biological Inorganic Chemistry, v.: 13 p.:723 - 735, 2008
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 09498257
      E-ISSN: 14321327
      
      

    • Functional genomic characterization of mRNAs associated with TcPUF6, a pumilio-like protein from Trypanosoma cruzi (Completo, 2008)

      DALLAGIOVANNA, B. , CORREA, A. , PROBST, C.M. , HOLETZ, F. , SMIRCICH, P. , DE AGUIAR, A.M. , MANSUR, F. , DA SILVA, C.V. , MORTARA, R.A. , GARAT, B , BUCK, G.A. , GOLDENBERG, S. , KRIEGER, M.A.
      Journal of Biological Chemistry, v.: 283 13 , p.:8266 - 8273, 2008
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00219258
      E-ISSN: 1083351X
      
      

    • DNA conformational changes and cleavage by ruthenium(II) nitrofurylsemicarbazone complexes (Completo, 2007)

      OTERO, L.# , SMIRCICH, P.# , VIEITES, M. , CIGANDA, M. , CARDOSO-SEVERINO, P. , TERENZI, H. , CERECETTO, H. , GAMBINO, D. , GARAT, B
      Journal of Inorganic Biochemistry, v.: 101 p.:74 - 79, 2007
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 01620134
      # co primer autor
      
      

    • Trypanosoma cruzi: Molecular characterization of an RNA binding protein differentially expressed in the parasite life cycle (Completo, 2007)

      PÉREZ-DÍAZ, L. , DUHAGON, M.A. , SMIRCICH, P. , SOTELO-SILVEIRA, J. , ROBELLO, C. , KRIEGER, M.A. , GOLDENBERG, S. , WILLIAMS, N. , GARAT, B
      Experimental Parasitology, v.: 117 1 , p.:99 - 105, 2007
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00144894
      E-ISSN: 10902449
      
      

    • Trypanosoma cruzi: molecular characterization of TcPUF6, a Pumilio protein (Completo, 2005)

      DALLAGIOVANNA, B. , PÉREZ-DÍAZ, L. , SOTELO-SILVEIRA, J. , SMIRCICH, P. , DUHAGON, M.A. , GARAT, B
      Experimental Parasitology, v.: 109 4 , p.:260 - 264, 2005
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00144894
      E-ISSN: 10902449
      
      

Producción técnica

• Trabajos Técnicos

  • Monitoreo de superficies para detección de SARS-Cov2 en líneas de transporte metropolitano (2020)

    Informe o Pericia técnica
    SMIRCICH, P.
    
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Ciudad: Montevideo, Uruguay
    Disponibilidad: Restricta
    
    Duración: 8 meses

Evaluaciones

• Evaluación de Proyectos

  • Comité evaluación de proyectos

    Comité de Evaluación y Seguimiento del llamado a Becas de Posgrados Nacionales ( 2022 / 2023 )

    Sector Gobierno/Público / Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    
    

  • Comité de evaluación de proyectos posdoctorales IIBCE ( 2022 )

    Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    
    

  • Subcomisión Asesora para el llamado a proyectos CSIC Iniciación por el Área Básica ( 2021 / 2025 )

    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Comisión Sectorial de Investigación Científica , Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    
    Particippe en la subcomisión del área básica los años 2021, 2023 y 2025

  • Evaluación independiente de proyectos

    Becas de posgrados CAP-CSIC ( 2024 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Proyectos Fondo Clemente Estable, ANII ( 2024 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Proyecto ICGEB - programa CRP ( 2023 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Proyecto ICGEB - programa CRP ( 2022 )

    Argentina
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Becas de Movilidad. ANII ( 2022 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Proyectos de I+D. CSIC ( 2022 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Convocatoria PICT. Comisión de Ciencias Médicas I (CMI). Agencia I+D+i, Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva ( 2020 / 2022 )

    Argentina
    Cantidad: Menos de 5
    

  • ANII - Sistema de Donaciones Especiales del MEF ( 2020 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Evaluador de programas concursables para UNU-BIOLAC ( 2019 / 2024 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    Años 2019, 2022 y 2024

  • Centro Argentino-Brasileño de Biotecnología (CABBIO) - Programa de proyectos conjuntos de investigación. ( 2018 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Fondo Carlos Vaz Ferreira (FVF). ( 2017 / 2023 )

    Uruguay
    Dirección de Innovación Ciencia y Tecnología para el Desarrollo
    Cantidad: Menos de 5
    

  • ANII - Fondo María Viñas ( 2016 / 2018 )

    Uruguay
    ANII
    Cantidad: De 5 a 20
    

  • ANII - Becas de Posdoctorado Nacional. ( 2015 / 2024 )

    Uruguay
    ANII
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Evaluación Proyecto ANII ( 2015 / 2021 )

    Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    
    

  • Becas de posgrado nacionales. ANII ( 2015 / 2024 )

    Uruguay
    Cantidad: Mas de 20
    

  • ANPCyT - Fondo para la Investigación Científica y Tecnológica (FONCyT). Convocatoria PICT 2014. ( 2014 )

    Argentina
    Agencia Nacional de Promoción Científica, Tecnológica y de Innovación (ANPCyT).
    Cantidad: Menos de 5
    

  • CSIC - Iniciación a la Investigación. Modalidades 1 y 2 ( 2013 / 2025 )

    Uruguay
    CSIC
    Cantidad: De 5 a 20
    

• Evaluación de Publicaciones

  • Comité editorial

    Editor en jefe - Parasitology International ( 2025 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Editorial: Elsevier
    Cantidad: Mas de 20
    

  • Academic Editor - PLOS Neglected Tropical Diseases ( 2024 )

    Tipo de publicación: Revista
    Editorial: PLOS
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Associate Editor Frontiers in Microbiology - Infectious Agents and Disease ( 2023 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Community Reviewer para las publicaciones Frontiers in Ecology and Evolution, Frontiers in Genetics y Frontiers in Microbiology ( 2019 )

    Tipo de publicación: Revista
    Editorial: Frontiers
    Cantidad: De 5 a 20
    

  • Revisiones

    Wellcome Open Research ( 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Scientific Reports ( 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Heliyon ( 2023 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Communications Biology ( 2023 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • BMC Genomics ( 2023 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Bioinformatics ( 2022 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • European Journal of Plant Pathology ( 2021 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • ncRNA ( 2021 / 2024 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Front. Mol. Biosci. - Metabolomics ( 2021 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Mitochondrion ( 2021 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Frontiers Cell Infect Microbiol ( 2021 / 2022 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • PeerJ ( 2020 / 2022 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • BMC Bioinformatics ( 2020 / 2023 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Mitochondrial DNA Part A ( 2020 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Memorias do Instituto Oswaldo Cruz ( 2020 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Frontiers in Microbiology ( 2019 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

  • PlosOne ( 2017 / 2019 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • JBC (The Journal of Biological Chemistry) ( 2017 / 2018 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Symbiosys ( 2016 / 2020 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

  • PLOS Neglected Tropical Diseases ( 2015 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Frontiers in Genetics ( 2014 / 2023 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

• Evaluación de eventos y congresos

  • III International Symposium on Integrative Bioinformatics ( 2019 )

    Revisiones
    Chile
    
    
    

  • Congreso Nacional de Biociencias ( 2017 / 2025 )

    Revisiones
    Uruguay
    
    
    

  • Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Bioquímica y Biología Molecular ( 2015 / 2024 )

    Revisiones
    Uruguay
    
    
    Evaluador de pósters

  • Terceras Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Genética ( 2014 )

    
    Uruguay
    
    
    Evaluador de pósters

  • Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Biociencias ( 2012 / 2019 )

    Revisiones
    Uruguay
    
    
    

• Evaluación de convocatorias concursables

  • Llamado a concurso de G3 efectivo Facultad de Agronomía ( 2023 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5

  • Proyectos CSIC Iniciación por el Área Básica ( 2023 )

    Comité evaluador
    Cantidad: De 5 a 20

  • Llamado a concurso de G2 efectivo CENUR Salto ( 2022 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5

  • Contratos Posdoctorales en el IIBCE ( 2022 )

    Comité evaluador
    Cantidad: Menos de 5

  • Llamado a Becas de Posgrados Nacionales. ANII ( 2022 / 2024 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    Comité de Evaluación y Seguimiento (CESBE). Años 2022, 2023 y 2024

  • Proyectos CSIC Iniciación por el Área Básica ( 2021 )

    Comité evaluador
    Cantidad: De 5 a 20

  • Integración de comisiones asesoras de llamados concursables (Niveles 1, 2 y 3) en el IIBCE ( 2017 / 2024 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20

  • PEDECIBA - Programa de apoyo a pasantias y congreso ( 2015 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    Maestría en Bioinformática

  • Integración de comisiones asesoras de llamados concursables de la Facultad de Ciencias (Grados 1 y 2)) ( 2011 / 2023 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5

• Jurado de tesis

  • Maestría en Ingeniería Matemática ( 2022 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Tesis del estudiante Diego Silvera

  • Doctorado en Biología - Buenos Aires, Argentina ( 2022 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universidad de San Martín , Argentina
    Nivel de formación: Doctorado
    

  • Doctorado en Ciencias Biológicas. Bogotá, Colombia ( 2021 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Extranjero/Internacional/Otros / Pontificia Universidad Javeriana , Colombia
    Nivel de formación: Doctorado
    

  • Doctorado en Biología - PEDECIBA ( 2020 / 2024 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
    Nivel de formación: Doctorado
    Tesis de los estudiantes: Paula Vico, Natalia Rego, Diego Carvalho, Tamara Fernandez, Fernanda Trovero, Flavio Pazos

  • Posgrado en Biotecnología ( 2018 / 2019 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Tesis de las estudiantes: Valentina Russo, Sofía Acquistapace

  • Posgrado de Biología - Medellín, Colombia ( 2016 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universidad de Antioquia - FACULTAD DE CIENCIAS EXACTAS Y NATURALES , Colombia
    Nivel de formación: Doctorado
    

  • Maestría en Bioinformática ( 2014 / 2023 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Tesis de los estudiantes: Ignacio Naya, Martin Soñora, Adriana Errico

  • Maestría en Biología ( 2014 / 2023 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Tesis de los estudiantes: Mauricio Langleib, Marcos Davyt Borthagaray, Matías Giménez, Pablo Peraza, Florencia Díaz Viraqué, Eugenio Jara, Joaquina Farías

Formación de RRHH

• Tutorías concluidas

  • Posgrado

    • Caracterización proteómica de la maquinaria traduccional de Trypanosoma cruzi (2022 - 2025)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
      Programa: Maestría en Ciencias Biológicas (PEDECIBA-UdelaR)
      Tipo de orientación: Cotutor ( SMIRCICH, P. )
      Nombre del orientado: Martin Rivara
      País: Uruguay

    • Anotación funcional de genes en kinetoplástidos mediante búsqueda de homología remota basada en estructura (2022 - 2025)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
      Programa: Doctorado en Biología
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Juan Trinidad
      País: Uruguay

    • Análisis funcionales de perfiles de co-expresión génica en Trypanosoma cruzi (2021 - 2023)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas , Uruguay
      Programa: Maestría en Bioinformática
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Lucas Inchausti
      País: Uruguay

    • Estudios de transcriptómica comparativa en amastigotas axénicos versus amastigotas celulares de Trypanosoma cruzi (2018 - 2023)

      Tesis de maestria
      Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Departamento de Genómica , Uruguay
      Programa: PEDECIBA Biología
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Lucia Bilbao
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática
      Fecha de defensa programada para el 21 de diciembre de 2023

    • Mecanismos regulatorios de familias moduladas a nivel traduccional en Trypanosoma cruzi (2016 - 2019)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Maestría en Bioinformática PEDECIBA
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Santiago Radío
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

    • Compuestos metálicos anti-Trypanosoma cruzi: evaluación celular y transcriptómica (2015 - 2017)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Maestría en Biología Celular y Molecular (UDELAR-PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Cotutor ( SMIRCICH, P. )
      Nombre del orientado: Florencia Mosquillo
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

    • Señales características de transcriptos de origen nuclear que codifican productos mitocondriales en Trypanosoma cruzi (2012 - 2016)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Maestría en Biología Celular y Molecular (UDELAR-PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Cotutor ( SMIRCICH, P. )
      Nombre del orientado: Lorena Becco
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

  • Grado

    • Búsqueda in silico de posibles blancos drogables en kinetoplastidos (2020 - 2021)

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Departamento de Genómica , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Biología, Facultad de Ciencias
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Martin Rivara
      País: Uruguay

    • Relación entre en el uso de codones y niveles de tRNAs y su influencia en la eficiencia traduccional de proteínas en T. cruzi. (2019 - 2020)

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Departamento de Genómica , Uruguay
      Programa: Facultad de Ciencias-Licenciatura en Ciencias Biológicas
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Lucas Inchausti
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

    • Caracterización por microscopía de fuerza atómica (AFM) de regiones promotoras de ARNPI en tripanosomátidos. (2018 - 2019)

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Laboratorio de Interacciones Moleculares , Uruguay
      Programa: Tecnicatura en Biotecnología. UTU
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Victoria Coello
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular

    • Puesta a punto y establecimiento de cultivo in vitro de amastigotas axénicos de Trypanosoma cruzi como posible modelo de estudio de amastigotas celulares. (2017 - 2018)

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Laboratorio de Interacciones Moleculares , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Bioquímica
      Tipo de orientación: Cotutor ( SMIRCICH, P. )
      Nombre del orientado: Lucia Bilbao
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular

    • Caracterización de ARNs largos no codificantes asociados a elementos repetidos en E. granulosus (2013 - 2015)

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Bioquímica
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Santiago Radío
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

    • Clonado y expresion de la proteína TcPop2 de T. cruzi (2009 - 2010)

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Bioquímica
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Lorena Becco
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular

  • Otras

    • Orientación de pasantía de Investigación (estudiante de doctorado internacional) (2025 - 2025)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universidad Nacional de San Martín , Argentina
      Programa: Doctorado
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Guadalupe Romer
      País: Argentina

    • Orientación de pasantía de Investigación (estudiante de doctorado internacional) (2025 - 2025)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Laboratório Nacional de Computação Científica , Brasil
      Programa: Doctorado
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( SMIRCICH, P. , SOTELO SILVEIRA, J. )
      Nombre del orientado: Erica Zeighe
      País: Brasil

    • Orientación de pasantía de Investigación (estudiante de doctorado internacional) (2024 - 2024)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular - CONICET , Argentina
      Programa: Programa de Doctorado
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Alejo Prego
      País: Argentina
      Pasantía de investigación de un mes de duración en el Laboratorio de Bioinformática del IIBCE

    • Orientador de trabajo posdoctoral junto con la Dr. Pamela Cribb. (2021 - 2023)

      Orientación de posdoctorado
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universidad de Rosario , Argentina
      Programa: Beca posdoctoral - CONICET
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( SMIRCICH, P. )
      Nombre del orientado: Andrea Vargas
      País: Argentina

    • Orientación de pasantía de Investigación (estudiante de doctorado internacional) (2019 - 2019)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Departamento de Genómica , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas. Universidad Nacional de Cuyo. Mendoza, Argentina
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Andrea Vargas
      País: Uruguay
      Pasantía de 6 semanas en nuestro la boratorio

    • Orientación de pasantía de Investigación (estudiante de doctorado internacional). (2018 - 2018)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Departamento de Genómica , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ciencias-Bioquímica. Universidad Nacional de Colombia sede Bogotá
      Tipo de orientación: Asesor
      Nombre del orientado: Eliana Bustos
      País: Uruguay
      Pasantía de 3 meses en Uruguay.

    • Caracterización bioinformática de familias relevantes en la regulación traduccional en T. cruzi. (2017 - 2018)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Departamento de Genómica , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Bioquímica, Facultad de Ciencias, UdelaR
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Omega Petrazzini
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y Bioinformática

• Tutorías en marcha

  • Posgrado

    • Estudio de la asociación entre la expresión de los ARN bóveda y el microambiente tumoral (2025)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas (PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( SMIRCICH, P. , DUHAGON MA )
      Nombre del orientado: Laura Vera
      País/Idioma: Uruguay,

    • Secuenciación masiva de amplicones para el estudio de patógenos microbianos en superficies de Unidades de Cuidados Intensivos (2024)

      Tesis de maestria
      Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
      Programa: Posgrado en Biotecnología
      Tipo de orientación: Cotutor
      Nombre del orientado: Santiago Licandro
      País/Idioma: Uruguay,

    • Anotación y caracterización funcional de lncRNAs en Trypanosoma cruzi (2024)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
      Programa: Doctorado en Biología
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Paola Sosa
      País/Idioma: Uruguay,

    • Análisis de pequeños ARNs no codificantes derivados de los vault ARNs en la biología del cáncer de próstata (2024)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas (PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( SMIRCICH, P. , RAFAEL SEBASTIAN FORT )
      Nombre del orientado: Jake Sheppard
      País/Idioma: Uruguay,

    • Rol de la proteína de unión al ARN TcUBP1 en la regulación traduccional de Trypanosoma cruzi (2023)

      Tesis de doctorado
      Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable / Laboratorio de Bioinformática - Departamento de Genómica , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas (PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Lucas Inchausti
      País/Idioma: Uruguay,

    • Detección simultánea de múltiples patógenos y resistencia antimicrobiana en bovinos lecheros mediante secuenciación masiva de amplicones (2021)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
      Programa: PEDECIBA Biología
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Alvaro Gonzalez
      País/Idioma: Uruguay, Español
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Agrícolas / Biotecnología Agropecuaria / Biotecnología Agropecuaria / Genómica y bioinformática
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica y bioinformática
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica y bioinformática

    • Ribosomas Heterogéneos: contribución desde la transcriptómica en compartimentos subcelulares y células diferenciadas (2021)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas
      Tipo de orientación: Cotutor
      Nombre del orientado: Joaquín Garat
      País/Idioma: Uruguay,

  • Otras

    • Ecología microbiana con un enfoque aplicado a sistemas de tratamiento de aguas residuales. Extracción de ADN y ARN, análisis de metagenoma, ensamblado de genomas y metatransciptoma (2022)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Posgrado en Biotecnología
      Tipo de orientación: Asesor
      Nombre del orientado: Gerardo Viera
      País/Idioma: Uruguay,