Datos Generales

• Institución principal

  Universidad de la República/ Facultad de Ingeniería / Instituto de Física / Uruguay

• Dirección institucional

  Institución: Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Sector Educación Superior/Público
  / Instituto de Física
  Dirección: Julio Herrera y Reissig 565 / 11300
  País: Uruguay / Montevideo / Montevideo
  Teléfono: (02) 27142714 / 15100
  Correo electrónico/Sitio Web: julialon@fing.edu.uy http://www.fing.edu.uy/if/
  

Formación

• Formación académica

  • Concluida

    • Doctorado

      • Doctorado en Física (UDELAR-PEDECIBA) (2010 - 2016)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Multi-focus Computational Optical Imaging in Fourier Domain
        Tutor/es: José Ferrari
        Obtención del título: 2016
        Palabras Clave: Image Reconstruction Techniques Three-dimensional image processing Fourier optics Computational photography and imaging techniques
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica de Fourier

      Maestría

      • Maestría en Física (UDELAR-PEDECIBA) (2006 - 2010)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Auto-organización Y Transiciones de Fase en Cuasiespecies Virales
        Tutor/es: Hugo Fort
        Obtención del título: 2010
        Financiación:
        Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas , Uruguay
        Palabras Clave: cuasiespecies transiciones de fase
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos

    • Grado

      • Licenciatura en Física opción Física (1996 - 2006)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa:
        Obtención del título: 2006
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Otras Ciencias Naturales / Otras Ciencias Naturales /

• Formación complementaria

  • Concluida

    • Cursos de corta duración

      • Escuela de Verano - Evaluación de Aprendizaje en la UdelaR (02/2025 - 02/2025)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Comisión Sectorial de Enseñanza , Uruguay
        15 horas

      • Taller Moodle "Diseño de un Curso" (02/2024 - 02/2024)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Unidad de Enseñanza , Uruguay
        2 horas

      • Ciclo de seminarios sobre Óptica estadística: sistemas ópticos con luz de coherencia parcial (Prof. Rafael Piestun, Univ. Boulder, Colorado) (09/2022 - 09/2022)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        12 horas

      • Curso "Ciencia y Periodismo 2021" PEDECIBA (09/2021 - 10/2021)

        Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas , Uruguay

      • OSA Reviewer Certification Course (10/2019 - 10/2019)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Optical Society of America , Estados Unidos
        10 horas

      • Preparatory School to the Winter College on Optics: Advanced Optical Techniques for Bio-imaging (02/2017 - 02/2017)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / The Abdus Salam International Centre for Theoretical Physics , Italia
        40 horas

      • Winter College on Optics: Advanced Optical Techniques for Bio-imaging (02/2017 - 02/2017)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / The Abdus Salam International Centre for Theoretical Physics , Italia
        80 horas

      • Tratamiento de Imágenes por Computadora (03/2014 - 07/2014)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        152 horas
        Palabras Clave: Image Processing
        Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información / Ingeniería Eléctrica y Electrónica / Procesamiento de Señales

      • "Team Based Learning" a cargo del Dr. Larry Michaelsen (03/2013 - 03/2013)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        10 horas

      • Óptica de Fourier dictado por el Prof. Jaime Frejlich de la Universidade Estadual de Campinas, Brasil (12/2010 - 12/2010)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay

      • Curso de Nanotecnología dictado por la Prof. Tatiana Makarova de la Universidad de Umeå, Suecia (11/2005 - 11/2005)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados /

      • Planificación de Clases: Diseño de Unidades Didácticas (Unidad de Enseñanza) (07/2005 - 09/2005)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay

    • Participación en eventos

      • Three-Dimensional Imaging, Visualization, and Display 2025 (2025)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SPIE, Estados Unidos
        Alcance geográfico: Internacional

      • 19th Workshop on Information Optics (WIO 2025) (2025)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: ICFO -The Institute of Photonic Sciences, Castelldefels, Barcelona, Spain, España
        Alcance geográfico: Internacional

      • OPTICA Imaging Congress (2025)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: OPTICA, Estados Unidos
        Alcance geográfico: Internacional

      • Optica Imaging Congress (2024)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: OPTICA, Francia
        Alcance geográfico: Internacional

      • Optica Imaging Congress (2023)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: OPTICA, Estados Unidos
        Alcance geográfico: Internacional

      • European Conferences on Biomedical Optics (2023)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SPIE, OPTICA, Alemania
        Alcance geográfico: Internacional

      • Computational Imaging VII - D+CS SPIE Conference 2023 (2023)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SPIE, Estados Unidos
        Alcance geográfico: Internacional

      • XVII Reunión de la Sociedad Uruguaya de Física (SUF 2022), "José A. Ferrari" (2022)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Física, Uruguay
        Alcance geográfico: Regional

      • 2nd International Workshop on Adaptive, Compressive and Computational Imaging (2022) (2022)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Universidad Industrial de Santander, Colombia., Colombia
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: invited speaker program committee

      • Latin America Optics and Photonics (LAOP) Conference 2022 (2022)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: OPTICA, Brasil
        Alcance geográfico: Internacional
        Palabras Clave: (invited speaker)

      • Imaging and Applied Optics Congress 2022. 3D Image Acquisition and Display: Technology, Perception and Applications. (2022)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: OPTICA, Canadá
        Alcance geográfico: Internacional

      • Imaging and Applied Optics (2021) (2021)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: OSA, Canadá

      • Education and Training in Optics & Photonics Conference 2021 - OSA (2021)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Optical Society of America, Estados Unidos

      • Three-Dimensional Imaging, Visualization, and Display (2020) (2020)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SPIE, Estados Unidos

      • OSA Frontiers in Optics (2020) (2020)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Optical Society of America (OSA), Estados Unidos

      • Spie Photonics Europe (2020) (2020)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SPIE, Francia

      • Imaging and Applied Optics (2020) (2020)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Optical Society of America, Canadá

      • II Congreso Nacional de Biociencias 2019 - Microsocopías Avanzadas de Fluorescencia: Nuevas Instrumentaciones y Aplicaciones en Biología Cuantitativa. (2019)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Seccional Biofísica y Sociedad Uruguaya de Microscopía e Imagenología (SBF-SUMI), Uruguay

      • Primer Workshop Anual de Microscopia Avanzada de Fluorescencia y Biofotónica (2019)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Hospital de Clínicas, Facultad de Medicina, UdelaR, Uruguay

      • International Workshop on Adaptive, Compressive and Computational Imaging WACCI 2019 (2019)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, CONICYT, FONDECYT, Chile

      • X Reunión Iberoamericana de Óptica, XIII Reunión Iberoamericana de Óptica, Láseres y Aplicaciones y Reunión de la Academia Mexicana de Óptica (RIAO-OPTILAS-MOPM 2019) (2019)

        Tipo: Congreso
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica /

      • Three-Dimensional Imaging, Visualization, and Display 2019 (2019)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SPIE, Estados Unidos

      • XVI Reunión de la Sociedad Uruguaya de Física (2018)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SUF, Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Ciencias Físicas /
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Ciencias Físicas /
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Ciencias Físicas /

      • Encontro de Outono da Sociedade Brasileira de Física (2018)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: (Sociedade Brasileira de Física) SBF, Brasil
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica /

      • Del laboratorio a la industria: Cómo valorizar los resultados de las investigaciones. A cargo del Dr. Gerard Ronan (Universidad de Swansea, Gales, Reino Unido) (2017)

        Tipo: Seminario
        Institución organizadora: Unidad de Propiedad Intelectual CSIC, Uruguay

      • IX Reunión Iberoamericana de Óptica y XII Reunión Iberoamericana de Óptica, Láseres y Aplicaciones (RIAO/OPTILAS) (2016)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Centro de Óptica y Fotónica de la Universidad de Concepción (CEFOP-UDEC), Chile

      • OSA Webinar: The Debate: Lightfield vs. Holographic (2016)

        Tipo: Seminario
        Institución organizadora: Optical Society of America (OSA), Estados Unidos
        Palabras Clave: Lightfield Holography
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada

      • Optical Engineering + Applications. (2016)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SPIE, Estados Unidos
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada

      • Imaging and Applied Optics 2016 (2016)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Optical Society of America (OSA), Alemania
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada

      • Identifying and Seizing Value from Conference Participation (AIP) (2015)

        Tipo: Seminario
        Institución organizadora: American Institute of Physics, Estados Unidos

      • Frontiers in Optics 2015 (2015)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Optical Society of America (OSA), Estados Unidos

      • XIV Reunión de la Sociedad Uruguaya de Física (2014)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Física, Uruguay

      • Latin America Optics and Photonics Conference (LAOP) (2014)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Optical Society of America (OSA), México

      • Imaging and Applied Optics Congress 2013 (2013)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Optical Society of America, Estados Unidos

      • Optical Society of America Webinar "What is wrong with my image?" (2012)

        Tipo: Seminario
        Institución organizadora: OSA - Optikos Corporation, Estados Unidos
        Palabras Clave: testing optical imaging systems
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada

      • XIII Encuentro Sociedad Uruguaya de Física - SUF (2012)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Sociedad Uruguaya de Física - SUF, Uruguay

      • Frontiers in Optics 2012 (2012)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: Optical Society of America (OSA), Estados Unidos

      • Segunda reunión conjunta AFA-SUF 2011 (2011)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: SUF y AFA, Uruguay
        Palabras Clave: Física
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Sistemas Complejos

      • PASI 2011: “Frontiers in Imaging Science” (2011)

        Tipo: Congreso

      • "Cómo preparar los manuscritos para que sean publicados en revistas de alto impacto", a cargo del Dr. Gustavo Barbosa Cánovas (Washington State University) (2010)

        Tipo: Seminario
        Institución organizadora: Facultad de Ingeniería, Udelar, Uruguay, Uruguay

      • Hands-On Research in Complex Systems School (Universidade Federal do ABC, Santo André, Sao Paulo, Brasil) (2009)

        Tipo: Congreso
        Institución organizadora: International Centre of Theoretical Physics, ICTP, Brasil

      • Las Competencias Básicas en Educación: enfoque, contexto y desarrollo en la práctica educativa ( Dr. Mario Martín Bris, profesor titular del Departamento de Didáctica de la Universidad de Alcalá) (2009)

        Tipo: Taller
        Institución organizadora: Centro Cultural de España en Montevideo, Uruguay

      • XVI Conference On Nonequilibrium Statistical Mechanics & Nonlinear Physics (MEDYFINOL 08) (2008)

        Tipo: Congreso
        Palabras Clave: Statistical Mechanics
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos

      • Primera Reunión Conjunta AFA-SUF 2008 (2008)

        Tipo: Congreso
        Palabras Clave: Física
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos

      • 6th International Conference of Biological Physics ICBP (2007)

        Tipo: Congreso

      • PASI 2006: “From Disordered Systems to Complex Systems” (2006)

        Tipo: Congreso

      • II Encuentro Latinoamericano de Sistemas Complejos en Ciencias Naturales y Sociales (2005)

        Tipo: Encuentro
        Palabras Clave: Sistemas Complejos
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos

      • I Encuentro Latinoamericano de Sistemas Complejos en Ciencias Naturales y Sociales (2004)

        Tipo: Encuentro
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos

      • Curso Básico de Fotografía, Módulo I Herramientas técnicas (2003)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Foto Club Uruguayo, Uruguay

      • Curso Básico de Fotografía, Módulo II Taller de realización práctica (2003)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Foto Club Uruguayo, Uruguay

      • VIII Jornadas de Jovens Pesquisadores do Grupo Montevideo (2000)

        Tipo: Encuentro
        Institución organizadora: UFSCAR, Brasil., Brasil

Idiomas

• Inglés

  Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien

• Español

  Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien

Areas de actuación

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Físicas /Física de los Materiales Condensados /Sistemas Complejos y Física Estadística

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Físicas /Óptica, Acústica /Óptica Aplicada

Actuación profesional

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - España

  Universidad Jaume I / Departamento de Física

  • Vínculos con la Institución

    • Colaborador (08/2026 - a la fecha)

      5 horas semanales

    • Profesor visitante (06/2026 - 07/2026)

      30 horas semanales

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Imagen de Fase en Microscopía Computacional (06/2026 - a la fecha )

        nuevas técnicas de imagen de fase en microscopía computacional
        Fundamental
        30 horas semanales , Coordinador o Responsable
        Equipo: J R ALONSO / J ALONSO , Enrique Tajahuerce

• Sector Educación Superior/Público - Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas - Uruguay

  Área Física (PEDECIBA)

  • Vínculos con la Institución

    • Otro (11/2024 - a la fecha)Trabajo relevante

      Investigadora Grado 4 40 horas semanales / Dedicación total

    • Otro (03/2017 - 10/2024)

      Investigador Grado 3 40 horas semanales / Dedicación total

  • Actividades

    • Extensión

      • Grupo Foldscopes (08/2026 - a la fecha )

        2 horas

      • Micropasantía PEDECIBA-ANEP: "Diseño e impresión 3D de un microscopio y exploración del mundo celular"- propuesta y coordinación (09/2024 - 09/2024 )

        4 horas

      • Participación por PEDECIBA en el lanzamiento de la Semana de la Ciencia y la Tecnología 2023 en el Espacio Ciencia del LATU. (05/2023 - 05/2023 )

        5 horas

    • Gestión Académica

      • Delegada suplente a la Comisión de Posgrado, Área Física (03/2024 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones 2 horas semanales

      • Delegada titular por el área Física a la Comisión de Maestría en Bioinformática (02/2018 - 03/2025 )

        Participación en consejos y comisiones 3 horas semanales

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Estados Unidos

  University of Connecticut / Electrical and Computational Engineering Department

  • Vínculos con la Institución

    • Colaborador (08/2019 - a la fecha)

      2 horas semanales

    • Profesor visitante (02/2019 - 07/2019)

      Research Scientist 40 horas semanales

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Percepción y visualización 3D (02/2019 - a la fecha )

        Esta línea de investigación con diversas aplicaciones en medicina (asistencia a personas con discapacidad visual) y en el entretenimiento (displays para visualización 3D), se centra en resolver los desafíos fundamentales vinculados a la percepción espacial tridimensional (3D) y la visualización efectiva en diferentes entornos (displays). Ejemplos de esto son el llamado conflicto de convergencia-acomodación en los displays estereoscópicos o la visualización en dispositivos de Realidad Aumentada (Augmented Reality - AG). El objetivo es mejorar la percepción visuoespacial del usuario, al proporcionar señales de profundidad más consistentes, que permitan una experiencia 3D más natural.
        Aplicada
        2 horas semanales , Integrante del equipo
        Equipo: J R ALONSO / J ALONSO , A FERNÁNDEZ , B JAVIDI

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Ingeniería

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (07/2017 - a la fecha)Trabajo relevante

      Profesor Adjunto 40 horas semanales / Dedicación total
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 3
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (08/2010 - 07/2017)

      Asistente 40 horas semanales / Dedicación total
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (12/2008 - 08/2010)

      Asistente 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Interino

    • Funcionario/Empleado (07/2004 - 11/2008)

      Ayudante 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Microscopía de Fase Cuantitativa (Quantitative Phase Imaging - QPI) (12/2020 - a la fecha )

        La Microscopía de Fase Cuantitativa (QPI) es una línea de investigación central en la óptica que se dedica a cuantificar y visualizar el retraso de fase que experimenta la luz al pasar a través de una muestra transparente, un retraso que es directamente proporcional a la masa y la estructura interna de la célula o tejido. A diferencia de la microscopía tradicional, que solo capta la intensidad (amplitud) de la luz, la QPI proporciona imágenes que permiten un análisis cuantitativo de las propiedades ópticas sin necesidad de tinciones que puedan alterar la muestra biológica bajo estudio. Dentro de esta línea, se exploran diversas técnicas: la Microscopía por Ecuación de Transporte de la Intensidad - TIE (Transport of Intensity Equation) reconstruye la fase a partir de múltiples imágenes de intensidad tomadas a distintas distancias focales; la Holografía Digital que registra la interferencia de las ondas de referencia y objeto para reconstruir la imagen de la muestra en 3D; y la Ptychografía de Fourier que utiliza la superposición de patrones de iluminación y algoritmos iterativos para lograr a la vez una resolución alta y un gran campo de visión.
        Mixta
        20 horas semanales , Coordinador o Responsable
        Equipo: J R ALONSO / J ALONSO , A E Silva , Juan Llaguno , Demczylo, R. , A FERNÁNDEZ , Belén Gaál

      • Óptica Computacional (04/2010 - a la fecha )

        La Óptica Computacional es una línea de investigación interdisciplinaria que redefine la formación de imágenes al integrar estrechamente el diseño óptico físico con el procesamiento digital algorítmico. Su objetivo es superar las limitaciones inherentes de los sistemas ópticos tradicionales, tratando el sistema de formación de imagen como un todo unificado (óptica, sensor y software). En la técnica de Multifoco, se desarrollan métodos para capturar y fusionar la información de múltiples planos focales, logrando una profundidad de campo extendida tanto en microscopía (para analizar muestras voluminosas) como en aplicaciones macro (para obtener escenas totalmente nítidas) o incluso reconstruir imágenes con diferente perspectiva. Adicionalmente, esta línea impulsa la visualización 3D avanzada, particularmente en el campo de la Realidad Aumentada (RA), donde se diseñan o adaptan sistemas ópticos compactos y eficientes para proyectar imágenes virtuales estables y de alta calidad directamente en el campo de visión del usuario. Otra componente fundamental es la Apertura Sintética, esta técnica utiliza el movimiento físico del sensor en el plano vertical, para adquirir imágenes desde múltiples perspectivas de la escena y permite luego la reconstrucción de imágenes de la escena con diferentes planos en foco a diferentes profundidades.
        Mixta
        20 horas semanales , Coordinador o Responsable
        Equipo: J R ALONSO / J ALONSO , FERRARI, J. A. , A FERNÁNDEZ , A E Silva , MIGUEL AROCENA

      • Perfilometría 3D óptica y Procesamiento de Imágenes (04/2010 - 12/2013 )

        Esta línea de investigación se centra en un método de medición sin contacto. En particular, la técnica de Proyección de Franjas, implica proyectar una secuencia de patrones de luz (franjas) sobre la superficie de un objeto tridimensional. La distorsión que sufren estas franjas al ser capturadas por una cámara codifica la información de profundidad y forma del objeto. El procesamiento de imágenes utiliza algoritmos de desplazamiento de fase para calcular el mapa de fase, y posteriormente aplica el desenvolvimiento de Fase (Unwrapping) para eliminar las ambigüedades de 2pi y obtener el mapa de fase absoluto.
        27 horas semanales , Integrante del equipo
        Equipo: A FERNÁNDEZ , J FERRARI , J RAMOS , D PERCIANTE , M OSORIO , G AYUBI , J. MATÍAS DI MARTINO
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica de Fourier

      • Sistemas Complejos y Física Estadística (03/2005 - 03/2010 )

        Esta línea de investigación aplica herramientas y conceptos de la Física Estadística al estudio de fenómenos en Sistemas Complejos de naturaleza biológica, específicamente la dinámica poblacional y evolutiva de los virus ARN. En particular el análisis de la catástrofe de error (error catastrophe), un fenómeno donde las altas tasas de mutación de un virus que le impiden mantener su información genética funcional, llevando a la extinción de la población viral. Utilizando modelos matemáticos inspirados en las transiciones de fase de la física estadística, se estudia cómo la población viral pasa de un estado estable y viable a un estado no viable. Los trabajos se enfocan en caracterizar esta transición de fase. Este enfoque permite comprender los umbrales de error críticos que podrían explotarse para desarrollar estrategias terapéuticas antivirales.
        20 horas semanales , Integrante del equipo
        Equipo: H FORT , A FERNÁNDEZ
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Microscopía multimodal por polarización e hiperespectral de fluorescencia para el diagnóstico cuantitativo en preparados histopatológicos de muestras completas sin marcadores (05/2025 - a la fecha)

        Código: 22520240100040UD La anatomía patológica es crucial para el diagnóstico, pronóstico y tratamiento de enfermedades. En los últimos años, los avances tecnológicos como los escáneres de láminas completas han revolucionado la forma en que se manejan y analizan las muestras histopatológicas. Estos escáneres permiten digitalizar el portaobjetos en forma completa, generando imágenes de alta resolución que pueden ser visualizadas, analizadas y compartidas de manera remota. Esta aproximación al análisis histológico sin embargo, retiene las limitaciones de la anatomopatología convencional basada principalmente en el reconocimiento por un experto de las características patognomónicas en los tejidos teñidos con colorantes histológicos. En este sentido, surge la necesidad de integrar nuevas técnicas de microscopía multimodal para obtener una valoración cuantitativa de las alteraciones tisulares. La microscopía de luz polarizada y en particular basada en el cálculo de matrices de Mueller es una herramienta emergente para determinar características microestructurales de tejidos sin necesidad de utilizar marcadores y que ha ganado atención por sus significativas ventajas para distinguir cambios en tejidos de forma no invasiva. Por otro lado, la microscopía de fluorescencia combinada con la espectroscopía permite explorar marcadores moleculares endógenos, como las moléculas autofluorescentes en tejido, proporcionando "huellas dactilares" moleculares de las lesiones anatomopatológicas. En este proyecto proponemos el desarrollo de un microscopio multimodal para escaneo de lámina entera que combina la polarimetría de Matrices de Mueller y la autofluorescencia por microscopía hiperespectral utilizando métodos novedosos en cada modalidad implicada: ingeniería de la iluminación para obtener matrices de Mueller en una sola toma y filtros con modulación seno/coseno en la transmitancia para obtener información espectral sin necesidad de obtener el espectro. La integración de estas técnicas de imagen avanzadas ofrece nuevas perspectivas en anatomía patológica para una evaluación cuantitativa y basada en la caracterización molecular de las enfermedades sin prescindir de la evaluación estructural, proporcionando un mejor entendimiento de los procesos patológicos subyacentes.
        2 horas semanales
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Maestría/Magister:1
        Maestría/Magister prof:1
        Doctorado:1
        Equipo: A FERNÁNDEZ (Responsable) , MALACRIDA L. , Demczylo, R. , J R ALONSO / J ALONSO , MIGUEL AROCENA , FEDERICO LECUMBERRY

      • Estudio del potencial predictivo de observables en imágenes de fase cuantitativa para detectar alertas tempranas en la transición epitelio-mesénquima (05/2026 - a la fecha)

        Código: FCE_1_2025_1_186741 La transición epitelio-mesénquima (EMT) es un proceso biológico crucial en la metástasis del cáncer. donde las células epiteliales adquieren características mesenquimales que les permiten migrar e invadir otros tejidos. La microscopía de imagen de fase cuantitativa (QPI) es una técnica sin marcadores que puede cuantificar propiedades morfológicas y biofísicas de las células, permitiendo estudiar la EMT en tiempo real y sin alterar el estado celular. Existe un interés creciente en utilizar observables de QPI como la masa seca (dry mass) y la intensidad de desorden (disorder strength) para detectar alertas tempranas de la EMT. La detección temprana de la EMT mediante QPI podría abrir nuevas vías para anticipar la metástasis. Desde una perspectiva física, la EMT puede interpretarse como una transición de fase. similar a los cambios de estada de la materia. La QPI. con su capacidad para medir la masa seca celular (que refleja el contenido biomolecular) y la intensidad del desorden (relacionada con la organización intracelular y las propiedades mecánicas). podría revelar cambios tempranos que preceden a las alteraciones morfológicas evidentes. La alta sensibilidad de la QPI a la masa seca y la correlación de la intensidad del desorden con las propiedades mecánicas sugieren su potencial para la detección temprana. La adquisición y el procesamiento de imágenes obtenidas por microscopía QPI por holografía digital. ecuación de transporte de intensidad (TIE). holotomografía entre otros métodos. aporta herramientas flexibles y de bajo costo para investigar estas transiciones con una mirada interdisciplinaria que involucra a investigadores y estudiantes de biología celular. óptica e ingeniería.
        10 horas semanales
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Maestría/Magister:2
        Doctorado:4
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: J R ALONSO / J ALONSO (Responsable) , Jimena Paola HOCHMANN VALLS , Felipe Álvaro PARIETTI PINTOS , German Miguel AROCENA SUTZ , Ariel FERNÁNDEZ CASORATTI , Juan Manuel LLAGUNO JAIME , Alejandro Emanuel Silva Miraballes , Cristina MASOLLER , Magdalena Millán Santarcieri , Roman Gregorio Demczylo Batista , Federico LECUMBERRY RUVERTONI , Ana Doblas , Belén Gaál
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Microscopía

      • Microscopía de fase cuantitativa híbrida DHM-TIE asistida por aprendizaje profundo (05/2026 - a la fecha)

        Código: 22420250200299UD El proyecto propone el desarrollo de un sistema híbrido de microscopía de fase cuantitativa que combine microscopía holográfica digital (DHM), la ecuación de transporte de intensidad (TIE) y estrategias de aprendizaje profundo, con el objetivo de mejorar la recuperación de fase y el análisis cuantitativo de muestras biológicas.
        2 horas semanales
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Doctorado:2
        Equipo: Juan Llaguno (Responsable) , J R ALONSO / J ALONSO (Responsable) , A E Silva , A FERNÁNDEZ , FEDERICO LECUMBERRY

      • Incorporación de métodos ópticos cuantitativos de fase en microscopio de diseño personalizado para el monitoreo de ensayos celulares (02/2024 - 05/2026 )

        Código: 22420230100147UD En el presente proyecto se plantea agregar la posibilidad de hacer microscopía de fasecuantitativa a un microscopio personalizado de diseño propio. Muchas muestras biológicas de interés se comportancomo objetos de fase, lo que significa que la luz que las atraviesa experimenta cambios en su fase pero no en suintensidad. Por lo tanto, se requiere adaptar el modelo existente para acceder a la información de fase. Para lograr esteobjetivo, se estudiarán y utilizarán métodos no interferométricos de recuperación de fase. Se presta especial atencióna aquellos métodos que utilizan una secuencia de imágenes enfocadas en diferentes planos y distancias para obtenerla información de fase. El trabajo se llevará a cabo utilizando muestras biológicas con el fin de estudiar las variacionesen el índice de refracción y establecer posibles relaciones entre estas variaciones, la rigidez celular y otras propiedades celulares.
        5 horas semanales
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Doctorado:2
        Equipo: A E Silva (Responsable) , Juan Llaguno , A FERNÁNDEZ , MIGUEL AROCENA , J R ALONSO / J ALONSO

      • CSIC i+d 2022 "Microscopía Holográfica Digital basada en Aprendizaje Profundo consciente de la Física" (04/2023 - 08/2025 )

        Código: 22520220100145UD La Microscopía Holográfica Digital (Digital Holographic Microscopy - DHM) es una técnica que permite medir la información cuantitativa del corrimiento de fase (debido a la diferencia de caminos ópticos) que experimenta la luz cuando pasa a través de especímenes biológicos transparentes tales como células vivas. Esto la convierte en una técnica particularmente útil para el estudio no invasivo de procesos dinámicos en células tumorales (sin necesidad de teñir o etiquetar). En DHM, el holograma que contiene la información del espécimen se graba digitalmente primero para luego, tradicionalmente, intentar recuperar la información de fase en forma computacional basándose en soluciones analíticas y/o en soluciones iterativas que satisfacen la ecuación de ondas. Sin embargo, estas aproximaciones representan un alto costo en tiempo así como la generación de artefactos que degradan la calidad de las imágenes recuperadas. Por otro lado, el Aprendizaje Profundo (Deep Learning - DL) ha revolucionado el campo de la microscopía óptica computacional debido a su habilidad para solucionar eficientemente problemas inversos no lineales complejos. Sin embargo, se le ha recriminado su naturaleza de ?caja negra? por llevar a veces a resultados inconsistentes con las leyes físicas. En este sentido, la aproximación de Aprendizaje Profundo consciente de la Física (Physics-aware Deep-Learning) es atractiva porque fomenta la predicción de características condicionadas por la física y reduce la naturaleza de caja negra de los algoritmos DL. La propuesta se centra en el diseño personalizado y puesta en marcha de un microscopio holográfico digital donde se incorpora el Aprendizaje Profundo como herramienta versátil y prometedora para intentar mejorar la calidad de la reconstrucción de las imágenes. También se propone guiar o asisitir a los algoritmos de DL con Física, incluyendo información proveniente de los modelos y procesos físicos subyacentes a la formación de imágenes en los algoritmos a implementar. Se espera a través de este proyecto contribuir a desarrollar una nueva línea de investigación interdisciplinaria, que explora las fronteras del conocimiento en microscopía y que puede a su vez aportar a nivel del país con el desarrollo de una técnica como es la Holografía Digital, no disponible actualmente a nivel nacional, lo que permitiría realizar a futuro estudios novedosos por ejemplo en dinámica celular tumoral.
        10 horas semanales
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Doctorado:2
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: J R ALONSO / J ALONSO (Responsable) , FEDERICO LECUMBERRY , MIGUEL AROCENA , A FERNÁNDEZ , Juan Llaguno , A E Silva

      • ANII-FMV-1-2019-1-156126 Microscopio dentro de incubador de células: desarrollo de un sistema compacto de enfoque automatizado para monitoreo prolongado en tiempo real con aplicación a nuevos ensayos de migración y proliferación en carcinoma oral (06/2020 - 08/2022 )

        La posibilidad de monitorear células en tiempo real por largos períodos de tiempo es una herramienta clave en muy diversas aplicaciones, como el screening de nuevos fármacos o ensayos de la dinámica proliferativa e invasiva de células tumorales. Se trata sin embargo de un proceso muy costoso, que frecuentemente requiere de un microscopio con jaula de control así como de sistemas de corrección de la deriva de foco habitual en registros largos. El objetivo central de este proyecto es la creación de una alternativa de bajo costo a este proceso mediante el desarrollo de un microscopio compacto que quepa sin dificultad en un incubador de células, cuyas piezas de montaje específicas se puedan fabricar utilizando tecnología de impresión 3D, cuya óptica incorpore una lente de foco ajustable eléctricamente para realizar un enfoque en Z completamente no mecánico y que permita, mediante la incorporación de una platina móvil en el plano XY, la evaluación de diferentes condiciones experimentales simultáneamente. Para ello, implementaremos también nuevas metodologías de cultivo celular, tales como cámaras de cultivo con múltiples micro-pocillos, que harán posible aplicar el microscopio compacto a la biotecnología, la salud humana y animal y la investigación biomédica. En particular, desarrollaremos ensayos de proliferación, así como de migración 3D -aprovechando la capacidad de barrido axial de nuestro sistema óptico-, y evaluaremos en un mismo registro las respuestas celulares a diferentes fármacos con actividad anti-proliferativa o anti-metastática, respectivamente, usando células de carcinoma oral, un tipo de tumor agresivo y de alta prevalencia en Uruguay.
        10 horas semanales
        Instituto de Física
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister prof:2
        Doctorado:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: J R ALONSO / J ALONSO (Responsable) , MIGUEL AROCENA (Responsable) , A FERNÁNDEZ , FERRARI, J. A. , Juan Llaguno , BOLOGNA-MOLINA , A E Silva , D'Aiuto N.

      • Reconocimiento de Patrones en Objetos de Fase Biológicos usando la Transformada de Hough Generalizada Óptica (04/2019 - 08/2021 )

        La Transformada de Hough Generalizada (GHT) es una técnica robusta de reconocimiento de patrones, cuya mplementación óptica presenta el atractivo de una operación altamente en paralelo y capacidad de procesamiento a tiempo real. El procesamiento de imágenes o videos de interés biológico se podría beneficiar enormemente del econocimiento de patrones geométricos para aplicaciones tales como segmentación, seguimiento o conteo celular. El reconocimiento de patrones regular, mediante técnicas digitales, trabaja sobre información de gradiente extraída de una imagen de intensidad, la cual puede estar afectada por la usualmente baja relación señal-ruido de la imaginería microscópica. Además, en muchas técnicas de microscopía los especímenes de interés - como células vivas- no bsorben o dispersan luz de manera significativa, es decir son objetos de fase, que sólo modifican la fase de la luz que los atraviesa. Se necesitan aplicar entonces diferentes técnicas de visualización (por ejemplo Contraste deFase, Ecuación de Transporte de la Intensidad) de manera de traducir variaciones de fase en variaciones de intensidad, capaces de ser detectadas por una cámara. El procesamiento óptico ofrece un aspecto único (en comparación al puramente digital) que es la posibilidad de operar sobre la onda de luz previamente a la captura digital. El propósito de este proyecto es entonces combinar técnicas de visualización y recuperación de fase con la GHT de manera de expandir el horizonte del reconocimiento de patrones a los objetos de fase y explotar el paralelismo natural y capacidad de procesamiento a tiempo real del procesamiento óptico de imágenes para aplicaciones en microscopía biológica.
        5 horas semanales
        Integrante del Equipo
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: J R ALONSO / J ALONSO , A FERNÁNDEZ (Responsable) , Juan Llaguno , FERRARI, J. A. , MIGUEL AROCENA , MALACRIDA L.

      • Imaginería Óptica Computacional y Óptica Adaptiva aplicadas a la Microscopía de Fluorescencia por Lámina de Luz (04/2019 - 08/2021 )

        La microsocpía de fluorescencia por lámina de luz (LSFM por sus siglas en inglés) es una técnica de aplicación biológica relativamente nueva que ha ganado terreno a lo largo del tiempo dado su gran potencial para la visualización de muestras biológicas de gran espesor. En ella la visualización por planos (optical sectioning) de la muestra 3D se obtiene a partir del uso de una lámina u hoja de luz que excita selectivamente un único plano de la muestra en el plano focal de un objetivo de microscopio dispuesto ortogonal al plano de la lámina de luz. Esta técnica permite resolver estructuras en el plano z (optical sectioning) excitando sólo un plano a la vez. Como LSFM excita sólo las moléculas cercanas al plano focal implica menor fototoxicidad y mejora la calidad en la formación de imágenes de las muestras en el tiempo. Sin embargo, a medida que la luz pasa a través del espécimen biológico, las variaciones espaciales en el índice de refracción del mismo introducen aberraciones ópticas que distorsionan la imagen adquirida. Una forma considerada recientemente para corregir esas aberraciones es a través del uso de Óptica Adaptiva (AO). Finalmente, la Imaginería Óptica Computacional combina el diseño óptico de dispositivos personalizados como en este caso la incorporación de AO-LSFM con el procesamiento digital de las imágenes adquiridas. Este procesamiento se realiza por medio de algoritmos basados en la óptica involucrada es decir se basa en modelos físicos subyacentes al set-up óptico utilizado como por ejemplo la respuesta al impulso o PSF (Point Spread Function) del sistema. En este proyecto se propone por tanto, un acercamiento fundamentalmente interdisciplinario del tema de investigación. Se buscará que investigadores y estudiantes provenientes de diferentes disciplinas trabajen en conjunto para el desarrollo de nuevas estrategias experimentales y técnicas de reconstrucción de imágenes que colaboren para una mejor interpretación y comprensión de estructuras 3D de importancia biológica obtenidas a partir de AO-LSFM.
        10 horas semanales
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: J R ALONSO / J ALONSO (Responsable) , A E Silva , A FERNÁNDEZ , MIGUEL AROCENA , FERRARI, J. A. , MALACRIDA L.
        Palabras clave: Microscopía por Hoja de Luz Óptica Adaptiva Procesamiento de Imágenes

      • Reconocimiento de patrones a tiempo real mediante multiplexado espacial de la transformada de Hough generalizada óptica (09/2018 - 01/2021 )

        La Transformada de Hough Generalizada (GHT) se ha consolidado como una técnica robusta de reconocimiento de patrones, cuya implementación óptica presenta el atractivo de una operación altamente paralelizada y capacidad de procesamiento a tiempo real. Numerosas aplicaciones asociadas al procesamiento de imágenes o videos en áreas tales como microscopía, imaginería médica o visión de máquina, se podrían beneficiar enormemente del reconocimiento de patrones geométricos en tareas como son la segmentación, seguimiento (tracking) y reconocimiento automático. El procesamiento digital usual parte de una imagen de intensidad sobre la que se puede llevar a cabo alguna operación (resalte de bordes, umbralización, mejora de contraste) y un eventual reconocimiento de patrones geométricos de interés así como extracción de los mismos (segmentación). Los problemas asociados a este procesamiento digital radican fundamentalmente en el alto costo computacional demandado, en especial para reconocimiento de patrones bajo variación completa de parámetros tales como escala u orientación. Sin paralelización, actualmente es imposible obtener a tiempo real la GHT, en particular en su versión de mayor invarianza. La propuesta de este proyecto se centra en obtener la GHT para diferentes escalas y orientaciones mediante multiplexado espacial, esto es, mediante la captura en una sola imagen conformada por las transformadas simultáneas de un mismo objeto o escena para diferentes parámetros. La realización física prevista para conseguir este multiplexado espacial es la imaginería integral de una escena 2D donde cada imagen elemental corresponderá a una transformación con un conjunto de parámetros diferente. Este acercamiento abre la posibilidad de obtener la GHT a tiempo real aprovechando la naturaleza paralela de los procesadores ópticos. Además de las aplicaciones derivables de la implementación, el proyecto pretende, desde el punto de vista de la investigación básica, contestar preguntas que corresponden al compromiso entre tiempo real y resolución en el reconocimiento de patrones, así como aportar al desarrollo de herramientas para el procesamiento óptico de la información.
        3 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:1
        Financiación:
        Dirección para el desarrollo de la ciencia y el conocimiento, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: A Fernández (Responsable) , J R ALONSO / J ALONSO , J A Ferrari , Juan Llaguno
        Palabras clave: Hough transform

      • Reconstrucción 3D mediante el uso de luz estructurada. (04/2017 - 03/2019 )

        En los últimos 10 años, numerosas aplicaciones tecnológicas e industriales han comenzado a hacer uso de información 3D para muy variados fines. Uno de los ejemplos más populares es la irrupción en el mercado del sensor ?Kinetic?, que ha revolucionado la forma de jugar e interactuar con consolas de vídeo juego. Además, este tipo de tecnologías ha comenzado a utilizarse en el ambiente deportivo y médico para asistir procesos de recuperación. Por otro lado la creciente oferta de impresoras 3D ha impuesto también la necesidad de contar con medios para capturar y escanear objetos en 3 dimensiones. El control de acceso y reconocimiento facial ha sido otro campo que se ha revolucionado con la inclusión de información estructural de los rostros para la mejora de la precisión de los algoritmos de reconocimiento facial. Estos ejemplos son solo algunos de los factores que ha motivado en la última década el desarrollo de diferentes metodologías y sistemas para el escaneo 3D de una escena observada. Este desarrollo ha sido impulsado y acompañado por una creciente atención del ambiente académico, siendo esta área una de las principales lineas de investigación en el área de la Óptica Aplicada y la Visión por Computadora. En este proyecto nos concentraremos en el desarrollo y estudio de prototipos de escáner 3D mediante el uso de luz estructurada. El principio básico de funcionamiento de estos métodos es el siguiente: se proyecta mediante el uso de un proyector de luz un patrón de luz conocido, el cual al ser proyectado sobre una escena que no es plana se observa deformado por una cámara. Mediante el estudio de la deformación percibida por la cámara, es posible inferir información de la forma de la superficie sobre la que fue proyectado el patrón. El grupo de Óptica Aplicada de la Facultad de Ingeniería cuenta con amplia experiencia en este tema, y ha desarrollado en el pasado reciente métodos novedosos de reconstrucción 3D mediante el uso de luz estructurada, los mismos han sido publicados en revistas internacionales arbitradas (ver referencias adjuntas a este proyecto). Dichos trabajos han dado lugar a nuevos temas de investigación y varias nuevas preguntas y retos que imponen métodos propuestos. En este proyecto continuaremos estas lineas de trabajo para obtener métodos de reconstrucción más robustos, eficientes, y que puedan ser utilizados de manera más sencilla en desarrollos tecnológicos que se producen actualmente en el país.
        1 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: J M DI MARTINO (Responsable) , G AYUBI , J FERRARI (Responsable) , Ariel FERNÁNDEZ CASORATTI

      • Desarrollo de nuevas técnicas ópticas y de procesamiento de imágenes en microscopía multifocal para el estudio de la estructura tridimensional de esferoides tumorales multicelulares. (04/2017 - 03/2019 )

        Los avances en microscopía óptica son fundamentales en investigación biomédica, y entre sus objetivos principales está poder visualizar de manera cada vez más detallada y a la vez no invasiva regiones previamente inaccesibles de las estructuras biológicas. Los esferoides tumorales multicelulares (MCTS) de gran tamaño (diámetros mayores a 500µm) constituyen un modelo tridimensional (3D) in vitro que reproduce la organización espacial de los tumores in vivo, ya que posee una zona externa más proliferativa, una zona más profunda quiescente y una región central hipóxica, acidificada y con abundante presencia de células necróticas. La hipoxia y la acidificación de esta región central dan lugar a procesos de selección que pueden generar células más resistentes e invasivas, determinando de forma crucial la evolución futura del tumor. Caracterizar de manera detallada la organización celular de las regiones profundas en MCTS es un paso indispensable para poder modelar in vitro procesos esenciales en el desarrollo tumoral. A su vez, para esto es fundamental visualizar con claridad la estructura 3D en MCTS íntegros de gran tamaño, en particular su región central. Este problema plantea grandes desafíos a las técnicas microscópicas existentes, y hace necesario el desarrollo de nuevas metodologías de adquisición y procesamiento de imágenes. Por un lado, se propone diseñar, montar, caracterizar y poner en funcionamiento un dispositivo óptico experimental que funcione como un microscopio modular, adaptable para trabajar en condiciones de campo claro así como de fluorescencia. Existen dos aspectos instrumentales fundamentales, a incorporar de forma novedosa en el dispositivo: el uso de una lente de foco ajustable eléctricamente (ETL) de última generación y el uso de diodos emisores de luz (LED) como fuente de iluminación (de bajo costo y mayor tiempo operativo útilque las tradicionales lámparas de mercurio). Cabe mencionar que no existen aún microscopios con ambas características a nivel comercial. La incorporación de una ETL permite realizar un escaneo axial óptico multifocal del espécimen de interés evitando los problemas inherentes al convencional escaneo mecánico en la microscopía 3D.Por otro lado, el procesamiento digital de imágenes se ha convertido en parte integral de la microscopía moderna, permitiendo la reconstrucción de imágenes con nuevas características de interés, tales como profundidad de campo extendida, por medio de diferentes algoritmos. Se busca desarrollar e implementar algoritmos que permitan la visualización de todo el volumen de los MCTS y en particular su zona central. Como se trata de muestras de gran espesor se considerarán modelos físicos de variación de la respuesta al impulso (PSF) del sistema óptico con la profundidad. En este proyecto se propone un acercamiento fundamentalmente interdisciplinario en el que investigadores y estudiantes provenientes de Física, Biología e Ingeniería Eléctrica trabajen en conjunto para el desarrollo de nuevas estrategias experimentales de adquisición así como técnicas de reconstrucción de imágenes que colaboren para una mejor interpretación y comprensión de la estructura 3D de los MCTS.
        15 horas semanales
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:2
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: Alejandro Emanuel Silva Miraballes , J M DI MARTINO , J SOTELO SILVEIRA , M AROCENA (Responsable) , G AYUBI , J FERRARI , Ariel FERNÁNDEZ CASORATTI
        Palabras clave: Microscopía tridimensional Procesamiento de Imágenes Esferoides tumorales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada

      • Óptica Física, sensoramiento remoto y procesamiento óptico de la información (05/2011 - 05/2015 )

        
        5 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Doctorado:3
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: P. GERVASINI , A FERNÁNDEZ , G. AYUBI , J FERRARI (Responsable) , E FRINS , N CASABALLE , J RAMOS , D PERCIANTE , M OSORIO , J. MATÍAS DI MARTINO
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada

      • Métodos ópticos para el estudio de emisiones gaseosas generadas en la operación de centrales térmicas (12/2009 - 12/2011 )

        
        10 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:2
        Doctorado:3
        Equipo: J FERRARI , A FERNÁNDEZ , E FRINS (Responsable) , N CASABALLE , J RAMOS , M OSORIO
        Palabras clave: sensoramiento remoto DOAS monitoreo atmosférico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Espectroscopía

      • Sistemas Complejos en Ciencias Naturales y Sociales (03/2005 - 10/2006 )

        
        15 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:2
        Doctorado:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: H FORT (Responsable) , A FERNÁNDEZ , E SICARDI
        Palabras clave: Autómatas Celulares Física Estadística Teoría de juegos
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos

    • Docencia

      • Doctorado en Ingeniería Física (02/2026 - 02/2026 )

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Escuela de Verano en Microscopía Óptica, 40 horas, Teórico-Práctico

      • Ingeniería Eléctrica (08/2024 - 02/2026 )

        Grado
        Responsable
        Asignaturas:
        Física 3, 5 horas, Teórico-Práctico

      • Ciclo Básico - Ingeniería (08/2021 - 07/2024 )

        Grado
        Responsable
        Asignaturas:
        Electromagnetismo, 10 horas, Teórico-Práctico

      • Doctorado en Ingeniería (Ingeniería Física) (08/2021 - 12/2021 )

        Doctorado
        Responsable
        Asignaturas:
        Imaginería Óptica Computacional 2021, 10 horas, Teórico-Práctico

      • Ciclo Básico de las carreras de Ingeniería (03/2020 - 02/2021 )

        Grado
        Responsable
        Asignaturas:
        Física 1, 20 horas, Teórico-Práctico

      • Ingeniería Eléctrica (08/2019 - 02/2020 )

        Grado
        Responsable
        Asignaturas:
        Física 3, 5 horas, Práctico

      • Ingeniería Eléctrica (03/2018 - 07/2018 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Física 1 (modalidad Enfoque), 5 horas, Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ingeniería y Tecnología / Ingeniería Eléctrica, Ingeniería Electrónica e Ingeniería de la Información / Ingeniería Eléctrica y Electrónica /

      • Ingeniería Eléctrica (03/2016 - 02/2018 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Física 1 (Teórico), 10 horas, Teórico

      • Ingeniería Eléctrica (08/2015 - 07/2017 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Electromagnetismo, 5 horas, Práctico

      • (03/2013 - 02/2015 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Física 1 (teórico, práctico y coordinación), 13 horas, Teórico-Práctico

      • (08/2012 - 08/2014 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Óptica (práctico y demostrativas en laboratorio), 13 horas, Práctico

      • Ciclo Básico de las carreras de Ingeniería (03/2012 - 02/2013 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Física1 (práctico), 13 horas, Práctico

      • Ciclo Básico de las carreras de Ingeniería (08/2009 - 07/2012 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Introducción a la Física Moderna (práctico), 13 horas, Práctico

      • Ciclo Básico de las carreras de Ingeniería (03/2011 - 02/2012 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Física 3 (práctico), 13 horas, Práctico

      • Ciclo Básico de las carreras de Ingeniería (03/2009 - 02/2011 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Física General 2 (práctico), 13 horas, Práctico

      • Ciclo Básico de las carreras de Ingeniería (08/2006 - 07/2009 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Electromagnetismo (práctico), 13 horas, Práctico

      • Ciclo Básico de las carreras de Ingeniería (03/2005 - 02/2009 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Física General 1 (práctico), 13 horas, Práctico

      • Ciclo Básico de las carreras de Ingeniería (08/2004 - 07/2006 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Física General 2 (práctico), 13 horas, Práctico

    • Extensión

      • Ingeniería de Muestra 2025 (IdM 2025) - divulgación por medio de set-ups experimentales y pósters: "Ilusiones Ópticas" (10/2025 - 10/2025 )

        12 horas

      • Semana de la Ciencia y la Tecnología 2024_ Charla: 'Imagen Óptica Computacional Informada por Física'. Liceo Nº5, Maldonado (07/2024 - 07/2024 )

        2 horas

      • "Microscopía Óptica Computacional", charla para estudiantes de Licenciatura en Física e Ingeniería Físico-Matemática (06/2024 - 06/2024 )

        5 horas

      • Ingeniería deMuestra 2023 (IdM 2023) - divulgación por medio de set-up experimental y póster: "Microscopio de fluorescencia personalizado impreso en 3D" A. Silva, M. Arocena y J. Alonso (10/2023 - 10/2023 )

        5 horas

      • Ingeniería deMuestra 2023 (IdM 2023) - divulgación por medio de set-up experimental y póster: "Holografía analógica y holografía digital" J. Llaguno, F. Lecumberry y J. Alonso (10/2023 - 10/2023 )

        5 horas

      • Co-organizadora del Taller " Microscopía Computacional" en el marco de la primer escuela de invierno sobre Física: "Invierno Científico 2023" (07/2023 - 07/2023 )

        10 horas

      • Ingeniería deMuestra 2022 (IdM 2022) - divulgación por medio de set-up experimental y póster: "Microscopio en impresión 3D de código abierto" A. Silva y J. Alonso (10/2022 - 10/2022 )

        10 horas

      • Ingeniería deMuestra 2022 (IdM 2022) - divulgación por medio de set-up experimental y póster: "Holografía Analógica y Holografía Digital" J. Llaguno, F. Lecumberry y J. Alonso (10/2022 - 10/2022 )

        10 horas

      • Ingeniería deMuestra 2022 (IdM 2022) - divulgación por medio de set-up experimental y póster: "Fotografía Integral con Apertura Sintética" J. Umpiérrez y J. Alonso (10/2022 - 10/2022 )

        10 horas

      • Ingeniería de Muestra 2020 - Óptica Computacional aplicada a la Microscopía - video explicativo (10/2020 - 10/2020 )

        Instituto de Física 10 horas

      • e Física - Facultad de Ingeniería, Charla de divulgación 'Imaginería Óptica Computacional. ¿Qué es y para qué sirve?' (09/2019 - 0/2019 ) (10/2019 - 10/2019 )

        10 horas

      • Poster y stand "Microscopía Óptica Computacional" (10/2019 - 10/2019 )

        10 horas

      • Ingeniería de Muestra 2018 - Poster y stand "Registro de imágenes por medio de detectores y descriptores de características visuales como preprocesamiento para la fusión de imágenes multifoco" (10/2018 - 10/2018 )

        10 horas

      • Ingeniería de Muestra 2014 - Póster y setup experimental 'Microscopio personalizado para la observación de estructuras biológicas 3D ' (10/2017 - 10/2017 )

        20 horas

      • Entrevista en Radio Uruguay, programa SobreCiencia: 'Línea de Investigación une la física y la biología para el estudio de células tumorales'. (07/2017 - 07/2017 )

        5 horas

      • Semana de la Ciencia y la Tecnología 2017_ Charla: 'Evolución de la Fotografía. De la cámara oscura a la imaginería óptica computacional'. Liceo de Montes, Canelones. (06/2017 - 06/2017 )

        5 horas

      • Semana de la Ciencia y la Tecnología 2017_ Charla: 'Evolución de la Fotografía. De la cámara oscura a la imaginería óptica computacional'. Liceo Nº3 Dámaso Antonio Larrañaga, Montevideo. (06/2017 - 06/2017 )

        5 horas

      • Semana de la Ciencia y la Tecnología 2017_ Charla: 'Evolución de la Fotografía. De la cámara oscura a la imaginería óptica computacional'. Liceo José Luis Zorrilla de San Martín, Canelones. (06/2017 - 06/2017 )

        5 horas

      • Coloquios de Física - Facultad de Ingeniería, Charla de divulgación 'Evolución de la Fotografía. De la Cámara Oscura a la Imaginería Óptica Computacional' (04/2017 - 04/2017 )

        20 horas

      • Ingeniería de Muestra 2014 - póster y set-up experimental 'Fusión de imágenes Multi-foco' (11/2014 - 11/2014 )

        30 horas

      • Semana de la Ciencia y la Tecnología 2014 _ Charla: 'Visión 3D: tecnología e investigación', Liceo Nº2 Prof. Rosalío A. Pereyra, Rocha, Rocha. (07/2014 - 07/2014 )

        10 horas

      • Semana de la Ciencia y la Tecnología 2013 - Charla: "Visión 3D: tecnologías e investigación". Liceo Daniel Armand Ugón, Colonia Valdense, Colonia.. (06/2013 - 06/2013 )

        20 horas

      • Semana de la Ciencia y la Tecnología 2013 - Charla: "Visión 3D: tecnologías e investigación". Liceo Justo Pedro Rodríguez, Cardona, Soriano. (06/2013 - 06/2013 )

        20 horas

      • Semana de la Ciencia y la Tecnología 2013 - charla y visita al Laboratorio del Grupo de Óptica Aplicada (IFFI) (05/2013 - 05/2013 )

        10 horas

      • charla y visita al laboratorio del grupo de Óptica Aplicada (IFFI) para liceales de 6to de Ingeniería (09/2012 - 10/2012 )

        15 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Image Processing

      • Ingeniería deMuestra 2011-divulgación por medio de experiencias demostrativas y póster de las actividades del Grupo de Óptica Aplicada (IF): 'Procesamiento Óptico de Imágenes' (11/2011 - 11/2011 )

        10 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Image Processing

      • semana de la ciencia y la tecnología 2011 - charla y visita al laboratorio del grupo de Óptica Aplicada (IFFI) (05/2011 - 05/2011 )

        10 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada

    • Gestión Académica

      • Integrante de la Subcomisión Académica de Posgrado en Ingeniería Física (02/2026 - a la fecha )

        Participación en consejos y comisiones 3 horas semanales

      • organización del "International Seminar Cycle on Optics and Photonics 2025" (12/2025 - 12/2025 )

        Gestión de la Investigación 10 horas semanales

      • Delegada suplente por el orden docente a la Comisión de Instituto de Física (03/2023 - 02/2025 )

        Participación en cogobierno 3 horas semanales

      • Delegada suplente por el orden docente a la Comisión de Instituto de Física (12/2010 - 10/2012 )

        Participación en cogobierno
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica de Fourier

      • Delegada titular por el orden docente a la Comisión de Instituto de Física (06/2008 - 12/2010 )

        Participación en cogobierno

Carga horaria

• Carga horaria de docencia: 8 horas
  
• Carga horaria de investigación: 25 horas
  
• Carga horaria de formación RRHH: 5 horas
  
• Carga horaria de extensión: 1 hora
  
• Carga horaria de gestión: 1 hora
  

Producción científica/tecnológica

• Actualmente desarrollo mis actividades de investigación en el Laboratorio de Óptica Computacional del Grupo de Óptica Aplicada en el Instituto de Física de la Facultad de Ingeniería, llevando adelante varias líneas de investigación propias. En este contexto, he llevado adelante como investigadora responsable varios proyectos de investigación (CSIC y ANII-FMV) con equipos interdisciplinarios formados por investigadores y estudiantes provenientes de las áreas de Física, Biología e Ingeniería Eléctrica. En concreto, a través de esta interacción entre distintas áreas del conocimiento, hemos logrado visualizar tanto la estructura 3D de muestras biológicas gruesas, tales como esferoides tumorales multicelulares (MCTS) o muestras de tejido, implementando técnicas de campo claro como de microscopía de fluorescencia en  microscopios personalizados de bajo costo, para lo que utilizamos impresión 3D. 
  Mi línea de investigación más significativa en el presente es la Microscopía de Fase Cuantitativa que apunta a la reconstrucción de Imágenes de Fase Cuantitativa (Quantitative Phase Imaging - QPI). Estamos trabajando desde hace un tiempo en  Microscopía Holográfica Digital (DHM), un método interferométrico sobre el cual buscamos incorporar Aprendizaje Profundo (Deep-Learning, DL) como una herramienta versátil y prometedora para mejorar la calidad de la reconstrucción de las imágenes, así como también guiar o asistir a los algoritmos de DL con la física subyacente a la formación de las imágenes. Complementariamente, investigamos la Ecuación de Transporte de Intensidad (Transport of Intensity Equation - TIE), un método no interferométrico para la recuperación de la información de fase de la luz a partir de imágenes desenfocadas. Esto es crucial para la caracterización de objetos de fase transparentes como las células, permitiendo obtener información cuantitativa sin necesidad de marcadores. Mediante estas técnicas de QPI, es posible derivar observables biofísicos cuantitativos de las muestras, tales como el índice de refracción integrado (vinculado directamente a la información de fase), la masa seca y el disorder strength, relacionados con la composición y estructura celular. Recientemente, estamos aplicando estos principios en el campo emergente de la Microscopía Pticográfica de Fourier (Fourier Ptychographic Microscopy - FPM), enfocándonos en reconstruir imágenes finales con gran campo de visión y alta resolución espacial a partir de secuencias de capturas de imágenes de baja resolución obtenidas bajo diversas iluminaciones angulares. La FPM se complementa directamente con la TIE para mejorar la reconstrucción de las componentes de baja frecuencia espacial de la fase, en busca de un análisis más completo de las muestras biológicas bajo estudio.
  Por otra parte, la Óptica Computacional, en que comencé a incursionar durante mi doctorado, es una línea de investigación interdisciplinaria que redefine la formación de imágenes al integrar estrechamente el diseño óptico físico con el procesamiento digital algorítmico. Su objetivo es superar las limitaciones inherentes de los sistemas ópticos tradicionales, tratando el sistema de formación de imagen como un todo unificado (óptica, sensor y software). En la técnica de Multifoco, se desarrollan métodos para capturar y fusionar la información de múltiples planos focales, logrando una profundidad de campo extendida tanto en microscopía (para analizar muestras voluminosas) como en aplicaciones macro (para obtener escenas totalmente nítidas) o incluso reconstruir imágenes con diferente perspectiva. Otra técnica fundamental es la Apertura Sintética, que utiliza el movimiento físico del sensor en el plano vertical, para adquirir imágenes desde múltiples perspectivas de la escena y permite luego la reconstrucción de imágenes de la escena con diferentes planos en foco a diferentes profundidades. 
  Otra de las líneas, en colaboración con el Prof. Bahram Javidi de UCONN, a partir de una estadía en su laboratorio en 2019 por invitación, es la de Percepción y visualización de información 3D. Esta línea, que continúa en el presente, tiene diversas aplicaciones en medicina (asistencia a personas con discapacidad visual) y en el entretenimiento (displays para visualización 3D), se centra en resolver los desafíos fundamentales vinculados a la percepción espacial tridimensional (3D) y la visualización efectiva en diferentes entornos (displays). Ejemplos de esto son el llamado conflicto de convergencia-acomodación en los displays estereoscópicos o la visualización en dispositivos de Realidad Aumentada (Augmented Reality - AG). El objetivo es mejorar la percepción visuoespacial del usuario, al proporcionar señales de profundidad más consistentes, que permitan una experiencia 3D más natural.
  Tiempo atrás, también colaboré en la línea de Perfilometría 3D óptica y procesamiento de imágenes, con el Prof. José Ferrari. En particular, la técnica de Proyección de Franjas, implica proyectar una secuencia de patrones de luz (franjas) sobre la superficie de un objeto tridimensional. La distorsión que sufren estas franjas al ser capturadas por una cámara codifica la información de profundidad y forma del objeto. El procesamiento de imágenes utiliza algoritmos de desplazamiento de fase para calcular el mapa de fase, y posteriormente aplica el desenvolvimiento de Fase (Unwrapping) para eliminar las ambigüedades de 2pi y obtener el mapa de fase absoluto.
  Por otra parte, durante mi maestría trabajé con el Prof. Hugo Fort (FCIEN), en la línea de Sistemas Complejos y Física Estadística, donde utilizamos métodos de Física Estadística aplicados al estudio de fenómenos en Sistemas Complejos de naturaleza biológica, específicamente la dinámica poblacional y evolutiva de los virus ARN y el análisis de la catástrofe de error (error catastrophe). Este enfoque permite comprender los umbrales de error críticos que podrían explotarse para desarrollar estrategias terapéuticas antivirales.
  
  

Producción bibliográfica

• Artículos publicados

  • Arbitrados

    • Bandwidth-optimized regularization for low-frequency recovery in quantitative phase imaging (Completo, 2026)

      A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
      Journal of the Optical Society of America, A .Optics Image Science and Vision, 2026
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 07403232
      E-ISSN: 23751169
      DOI: https://doi.org/10.1364/JOSAA.586325
      https://opg.optica.org/josaa/abstract.cfm?uri=josaa-43-4-A1
      
      

    • Quantitative phase microscopy for time-lapse hypoxia-induced cellular assays based on the transport of intensity equation (Completo, 2025)

      A E Silva , MIGUEL AROCENA , HOCHMANN J , A FERNÁNDEZ , J R ALONSO / J ALONSO
      Applied Optics, 2025
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 21553165
      E-ISSN: 1559128X
      DOI: https://doi.org/10.1364/AO.544976
      
      

    • GPU-optimized matrix method for phase retrieval with the transport of intensity equation (Completo, 2025)

      A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
      Applied Optics, 2025
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 21553165
      E-ISSN: 1559128X
      DOI: https://doi.org/10.1364/AO.544922
      
      

    • Spatial perception in stereoscopic augmented reality based on multifocus sensing (Completo, 2024)

      J R ALONSO / J ALONSO , A FERNÁNDEZ , B JAVIDI
      Optics Express, 2024
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 10944087
      DOI: https://doi.org/10.1364/OE.510688
      https://opg.optica.org/oe/fulltext.cfm?uri=oe-32-4-5943&id=546321
      
      

    • Real-time phase retrieval in division of aperture microscopy with the transport of intensity equation (Completo, 2024)

      A FERNÁNDEZ , Juan Llaguno , A E Silva , J R ALONSO / J ALONSO
      Journal of the Optical Society of America A, 2024
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 10847529
      E-ISSN: 15208532
      DOI: https://doi.org/10.1364/JOSAA.507385
      https://opg.optica.org/josaa/abstract.cfm?uri=josaa-41-3-A55
      
      

    • Differential effects of coverslip-induced hypoxia and cobalt chloride mimetic hypoxia on cellular stress, metabolism, and nuclear structure (Completo, 2024)

      Florencia M L Dornelles , BOLOGNA-MOLINA , PARIETTI F , vanesa pereira-prado , magdalena millán , A E Silva , Juan Llaguno , J R ALONSO / J ALONSO , A FERNÁNDEZ , SOTELO SILVEIRA, J. , manoela domingues , MIGUEL AROCENA , HOCHMANN J
      Tissue and Cell, 2024
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 00408166
      DOI: https://doi.org/10.1016/j.tice.2024.102408
      https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0040816624001095
      
      

    • Generalized Hough transform for 3D object recognition and visualization in integral imaging (Completo, 2023)

      A FERNÁNDEZ , J UMPIÉRREZ , J R ALONSO / J ALONSO
      Journal of the Optical Society of America A, v.: 40 4 , 2023
      ISSN: 10847529
      E-ISSN: 15208532
      DOI: https://doi.org/10.1364/JOSAA.482640
      
      

    • Contributions of viral oncogenes of HPV-18 and hypoxia to oxidative stress and genetic damage in human keratinocytes (Completo, 2023)

      HOCHMANN J , Magdalena Millan , paola hernandez , laura lafon-hughes , natali d'aiuto , A E Silva , Juan Llaguno , J R ALONSO / J ALONSO , A FERNÁNDEZ , vanesa pereira-prado , SOTELO SILVEIRA, J. , BOLOGNA-MOLINA , MIGUEL AROCENA
      Scientific Reports, 2023
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 20452322
      DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-023-44880-3
      
      

    • Augmented reality three-dimensional visualization with multifocus sensing (Completo, 2022)Trabajo relevante

      J R ALONSO / J ALONSO , A FERNÁNDEZ , B JAVIDI
      Optics Continuum, 2022
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 27700208
      DOI: https://doi.org/10.1364/OPTCON.445068
      
      

    • Computational multifocus fluorescence microscopy for three-dimensional visualization of multicellular tumor spheroids (Completo, 2022)Trabajo relevante

      JULIA R. ALONSO , ALEJANDRO SILVA , ARIEL FERNÁNDEZ , MIGUEL AROCENA
      Journal of Biomedical Optics, v.: 27 2022
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 10833668
      E-ISSN: 15602281
      DOI: 10.1117/1.jbo.27.6.066501
      http://dx.doi.org/10.1117/1.jbo.27.6.066501
      
      

    • Using a Variant of Coverslip Hypoxia to Visualize Tumor Cell Alterations at Increasing Distances from an Oxygen Source (Completo, 2019)

      MIGUEL AROCENA , Mercedes Landeira , Andrés Di Paolo , A E Silva , SOTELO SILVEIRA, J. , A FERNÁNDEZ , J R ALONSO / J ALONSO
      Journal of Cellular Physiology, 2019
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 00219541
      E-ISSN: 10974652
      DOI: 10.1002/jcp.28507
      
      

    • Fully invariant generalized Hough transform by out-of-focus multiview sensing with pupil array (Completo, 2019)

      A FERNÁNDEZ , Juan Llaguno , G García , F Lezama , J R ALONSO / J ALONSO
      Applied Optics, v.: 58 28 , p.:7766 - 7773, 2019
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00036935
      DOI: https://doi.org/10.1364/AO.58.007766
      https://www.osapublishing.org/ao/abstract.cfm?uri=ao-58-28-7766
      
      

    • Fourier domain post-acquisition aperture reshaping from a multi-focus stack (Completo, 2017)

      J R ALONSO
      Applied Optics, v.: 56 9 , 2017
      Palabras clave: Image Reconstruction Techniques Computational imaging Three-dimensional image processing
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 00036935
      DOI: 10.1364/AO.56.000D60
      
      

    • Stereoscopy and refocusing from axial scanning in 3D imaging (Completo, 2017)

      J R ALONSO , J FERRARI
      Optica Pura y Aplicada, v.: 50 3 , p.:297 - 302, 2017
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      Medio de divulgación: Papel
      E-ISSN: 00303917
      
      

    • Reconstruction of perspective shifts and refocusing of a three-dimensional scene from a multi-focus image stack (Completo, 2016)Trabajo relevante

      J R ALONSO , A FERNÁNDEZ , J FERRARI
      Applied Optics, v.: 55 9 , p.:2380 - 2386, 2016
      Palabras clave: Image Reconstruction Techniques Computational imaging Three-dimensional image processing
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      ISSN: 00036935
      DOI: AO.55.002380
      
      

    • Image segmentation by nonlinear filtering of optical Hough transform (Completo, 2016)

      A FERNÁNDEZ , J. L. FLORES , J R ALONSO , J FERRARI
      Applied Optics, v.: 55 13 , p.:3632 - 3638, 2016
      Palabras clave: Analog optical image processing Pattern recognition, image transforms
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      ISSN: 00036935
      
      

    • All-in-focus image reconstruction under severe defocus (Completo, 2015)Trabajo relevante

      J R ALONSO , A FERNÁNDEZ , G AYUBI , J FERRARI
      Optics Letters, v.: 40 9 8, p.:1671 - 1674, 2015
      Palabras clave: Image Processing Deconvolution Fourier Optics and Signal Processing
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 01469592
      E-ISSN: 15394794
      DOI: OL.40.001671
      
      

    • Optical implementation of the generalized Hough transform with totally incoherent light (Completo, 2015)

      A FERNÁNDEZ , J R ALONSO , G AYUBI , M OSORIO , J FERRARI
      Optics Letters, v.: 40 16 , p.:3901 - 3904, 2015
      Palabras clave: Analog optical image processing Transforms Pattern recognition, image transforms
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 01469592
      E-ISSN: 15394794
      DOI: OL.40.003901
      
      

    • Real-time pattern recognition using an optical generalized Hough transform (Completo, 2015)

      A FERNÁNDEZ , J. L. FLORES , J R ALONSO , J FERRARI
      Applied Optics, v.: 54 36 , p.:10586 - 10591, 2015
      Palabras clave: Analog optical image processing Transforms Pattern recognition, image transforms
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00036935
      DOI: AO.54.010586
      
      

    • Single-shot phase recovery using two laterally separated defocused images (Completo, 2013)

      J. MATÍAS DI MARTINO , G AYUBI , E DALCHIELE , J R ALONSO , A FERNÁNDEZ , J FLORES , D PERCIANTE , J FERRARI
      Optics Communications, v.: 293 p.:1 - 3, 2013
      Palabras clave: Transport of Irradiance Phase imaging
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00304018
      DOI: 10.1016/j.optcom.2012.11.084
      
      

    • Edge linking and Image Segmentation by Combining Optical and Digital Methods (Completo, 2013)

      J FLORES , G AYUBI , J R ALONSO , A FERNÁNDEZ , J. MATÍAS DI MARTINO , J FERRARI
      Optik, v.: 124 18 , p.:3260 - 3264, 2013
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00304026
      DOI: 10.1016/j.ijleo.2012.10.036
      http://dx.doi.org/10.1016/j.ijleo.2012.10.036
      
      

    • Edge enhancement of color images using a digital micromirror device (Completo, 2012)

      J. MATÍAS DI MARTINO , J FLORES , G AYUBI , J R ALONSO , A FERNÁNDEZ , J FERRARI
      Applied Optics, v.: 51 16 , p.:3439 - 3444, 2012
      Palabras clave: Image processing: analog optical image processing
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00036935
      DOI: 10.1364/AO.51.003439
      
      

    • Color encoding of binary fringes for gamma correction in 3-D profiling (Completo, 2012)

      G AYUBI , J. MATÍAS DI MARTINO , J R ALONSO , A FERNÁNDEZ , J FLORES , J FERRARI
      Optics Letters, v.: 37 8 , p.:1325 - 1327, 2012
      Palabras clave: Image processing: phase retrieval Fringe analysis
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 01469592
      E-ISSN: 15394794
      DOI: 10.1364/OL.37.001325
      
      

    • Three-dimensional profiling with binary fringes using phase-shifting interferometry algorithms (Completo, 2011)Trabajo relevante

      G AYUBI , J. MATÍAS DI MARTINO , J R ALONSO , A FERNÁNDEZ , D PERCIANTE , J FERRARI
      Applied Optics, v.: 50 2 , p.:147 - 154, 2011
      Palabras clave: fringe projection phase-shifting interferometry binary patterns
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00036935
      DOI: 10.1364/AO.50.000147
      
      

    • Incoherent optical processor for nondirectional edge enhancement of color images (Completo, 2011)

      J FLORES , G AYUBI , J R ALONSO , A FERNÁNDEZ , J. MATÍAS DI MARTINO , J FERRARI
      Optics Letters, v.: 36 23 , p.:4596 - 4598, 2011
      Palabras clave: Analog optical image processing
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 01469592
      E-ISSN: 15394794
      DOI: 10.1364/OL.36.004596
      
      

    • Optical processing of color images with incoherent illumination: orientation-selective edge enhancement using a modified liquid-crystal display (Completo, 2011)

      A FERNÁNDEZ , J R ALONSO , J FLORES , G AYUBI , J. MATÍAS DI MARTINO , J FERRARI
      Optics Express, v.: 19 21 , p.:21091 2011
      Palabras clave: Analog optical image processing Image enhancement
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 10944087
      DOI: 10.1364/OE.19.021091
      http://www.opticsinfobase.org/oe
      
      

    • Analog image contouring using a twisted-nematic liquid-cristal display (Completo, 2010)

      J FLORES , J FERRARI , J RAMOS , J R ALONSO , A FERNÁNDEZ
      Optics Express, v.: 18 18 , p.:19163 - 19168, 2010
      Palabras clave: Twisted-nematic liquid-crystal Medical and biological imaging
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica de Fourier, Sensores
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 10944087
      DOI: 10.1364/OE.18.019163
      
      

    • Error catastrophe for viruses infecting cells: analysis of the phase transition in terms of error classes (Completo, 2010)Trabajo relevante

      J R ALONSO , H FORT
      Philosophical Transactions of the Royal Society A Mathematical Physical and Engineering Sciences, v.: 368 p.:5569 - 5582, 2010
      Palabras clave: error classes error catastrophe finite-size scaling viral quasi-species
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos y Física Estadística
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 1364503X
      E-ISSN: 14712962
      DOI: 10.1098/rsta.2010.0274
      
      

    • On different implementations of spatial evolutionary games (Completo, 2007)

      H FORT , J R ALONSO , A FERNÁNDEZ
      Physica A Statistical Mechanics and its Applications, v.: 386 2 , p.:760 - 763, 2007
      Palabras clave: Complex adaptive systems Evolutionary game theory
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos y Física Estadística
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 03784371
      DOI: 10.1016/j.physa.2007.07.012
      
      

    • Prisoner`s Dilemma cellular automata revisited: evolution of cooperation under environmental pressure (Completo, 2006)Trabajo relevante

      J R ALONSO , A FERNÁNDEZ , H FORT
      Journal of Statistical Mechanics Theory and Experiment, 2006
      Palabras clave: game-theory interacting agent models
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos y Física Estadística
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 17425468
      DOI: 10.1088/1742-5468/2006/06/P06013
      
      

Producción técnica

• Trabajos Técnicos

  • Proyectos i+d 2018 id 237: " Imaginería Óptica Computacional y Óptica Adaptiva aplicadas a la Microscopía de Fluorescencia por Lámina de Luz (2018)

    Elaboración de proyecto
    J R ALONSO / J ALONSO
    
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Ciudad: Montevideo
    Duración: 24 meses
    Institución financiadora: CSIC-UDELAR
    Palabras clave: Light-sheet microscopy Adaptive Optics Computational Optical Imaging
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Otras Ciencias Naturales / Otras Ciencias Naturales / Física-Biología
    Proyecto CSIC i+d 2018 (id 237) Seleccionado para financiación. Resúmen: La microscopía de fluorescencia por lámina de luz (LSFM por sus siglas en inglés) es una técnica de aplicación biológica relativamente nueva que ha ganado terreno a lo largo del tiempo dado su gran potencial para la visualización de muestras biológicas de gran espesor. En ella la visualización por planos (optical sectioning) de la muestra 3D se obtiene a partir del uso de una lámina u hoja de luz que excita selectivamente un único plano de la muestra en el plano focal de un objetivo de microscopio dispuesto ortogonal al plano de la lámina de luz. Esta técnica permite resolver estructuras en el plano z (optical sectioning) excitando sólo un plano a la vez. Como LSFM excita sólo las moléculas cercananas al plano focal implica menor fototoxicidad y mejora la calidad en la formación de imágenes de las muestras en el tiempo. Sin embargo, a medida que la luz pasa a través del espécimen biológico, las variaciones espaciales en el índice de refracción del mismo introducen aberraciones ópticas que distorsionan la imagen adquirida. Una forma considerada recientemente para corregir esas aberraciones es a través del uso de Óptica Adaptiva (AO). Finalmente, la Imaginería Óptica Computacional combina el diseño óptico des dispositivos personalizados como en este caso la incorporación de AO-LSFM con el procesamiento digital de imágenes adquiridas. Este procesamiento se realiza por medio de algoritmos basados en la óptica involucrada es decir se basa en modelos físicos subyacentes al set-up óptico utilizado como por ejemplo la respuesta al impulso o PSF (Point Spread Function) del sistema. En este proyecto se propone por tanto, un acercamiento fundamentalmente interdisciplinario del tema de investigación. Se buscará que investigadores y estudiantes provenientes de diferentes disciplinas trabajen en conjunto para el desarrollo de nuevas estrategias experimentales y técnicas de reconstrucción de imágenes que colaboren para una mejor interpretación y comprensión de estructuras 3D de importancia biológica obtenidas a partir de AO-LSFM.

  • Proyectos i+d 2016: "Desarrollo de nuevas técnicas ópticas y de procesamiento de imágenes en microscopía multifocal para el estudio de la estructura tridimensional de esferoides tumorales multicelulares." (2016)

    Elaboración de proyecto
    J R ALONSO , M AROCENA
    
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Ciudad: Montevideo
    Número de páginas: 22
    Duración: 24 meses
    Institución financiadora: CSIC-UDELAR
    Palabras clave: Microscopía tridimensional Procesamiento de Imágenes Esferoides tumorales
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Otras Ciencias Naturales / Otras Ciencias Naturales / Física-Biología
    www.csic.edu.uy/renderResource/index/resourceId/44662/siteId/3
    Proyecto CSIC i+d 2016 (ID de proyecto: 331) seleccionado para financiación. Resumen: Los avances en microscopía óptica son fundamentales en investigación biomédica, y entre sus objetivos principales está poder visualizar de manera cada vez más detallada y a la vez no invasiva regiones previamente inaccesibles de las estructuras biológicas. Caracterizar de manera detallada la organización celular de los esferoides tumorales multicelulares (MCTS) es un paso indispensable para poder modelar in vitro procesos esenciales en el desarrollo tumoral. Este problema plantea grandes desafíos a las técnicas microscópicas existentes, y hace necesario el desarrollo de nuevas metodologías de adquisición y procesamiento de imágenes. En este proyecto se propone un acercamiento fundamentalmente interdisciplinario para el desarrollo de nuevas estrategias experimentales de adquisición así como técnicas de reconstrucción de imágenes que colaboren para una mejor interpretación y comprensión de la estructura 3D de los MCTS.

Evaluaciones

• Evaluación de Proyectos

  • Comité evaluación de proyectos

    Subcomisión Evaluadora Programa Iniciación a la Investigación - Área Básica ( 2025 / 2025 )

    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Comisión Sectorial de Investigación Científica , Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    
    

  • Evaluación independiente de proyectos

    ANII - Fondo María Viñas - Edición 2026 - Modalidad II ( 2026 / 2026 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    

  • ANII - Fondo María Viñas - Edición 2020 - Modalidad II ( 2020 / 2020 )

    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Special Program Grant applications submitted by OSA Chapters and Sections ( 2019 / 2019 )

    Estados Unidos
    Optical Society of America (OSA)
    Cantidad: De 5 a 20
    

• Evaluación de Publicaciones

  • Comité editorial

    Computational Optical Sensing and Imaging 2026: feature issue of Applied Optics, Biomedical Optics Express and Optics Express ( 2026 )

    Tipo de publicación: Revista
    Editorial: OPTICA
    Cantidad: De 5 a 20
    Feature Issue Guest Editor

  • Revisiones

    Optics and Lasers Technology ( 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Optica (OPTICA) ( 2024 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Displays (Elsevier) ( 2024 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Nature Communications (Nature) ( 2023 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Journal of Biomedical Optics (SPIE) ( 2023 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Pattern Recognition (Elsevier) ( 2021 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Computer Vision and Image Understanding (Elsevier) ( 2021 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Access (IEEE) ( 2020 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Optics Letters (Optica ex OSA) ( 2020 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Transactions on Computational Imaging (IEEE) ( 2020 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Optik (Elsevier) ( 2018 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Optics Continuum (ex OSA Continuum) (Optica) ( 2018 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

  • Transactions on Image Processing (IEEE) ( 2017 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Journal of Modern Optics (Taylor & Francis) ( 2017 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Journal of the Optical Society of America A (JOSA A) (Optica ex OSA) ( 2017 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Optical Engineering (SPIE) ( 2016 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

  • Optics Express (Optica ex OSA) ( 2015 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

  • Revista Iberoamericana de Automática e Informática Industrial (Elsevier) ( 2015 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Chinese Optics Letters (Optica ex OSA) ( 2015 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Applied Optics (Optica ex OSA) ( 2015 / 2025 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

• Evaluación de eventos y congresos

  • VII "Río de la Plata" Workshop on Optics and Photonics ( 2025 / 2025 )

    Comité programa congreso
    Uruguay
    Arbitrado
    
    OPTICA
    

  • Imaging and Applied Optics Congress 2025 - Computational Optical Sensing and Imaging ( 2025 / 2025 )

    Comité programa congreso
    Estados Unidos
    Arbitrado
    
    OPTICA
    

  • Imaging and Applied Optics Congress 2024 - 3D Image Acquisition and Display Technology Perception and Applications ( 2024 / 2024 )

    Comité programa congreso
    Francia
    Arbitrado
    
    OPTICA
    

  • Imaging and Applied Optics Congress 2023 - 3D Image Acquisition and Display Technology Perception and Applications ( 2023 / 2023 )

    Comité programa congreso
    Estados Unidos
    Arbitrado
    
    OPTICA (ex OSA)
    

  • II International Workshop on Adaptive, Compressive and Computational Imaging (WACCI 2022) ( 2022 / 2022 )

    Comité programa congreso
    Colombia
    Arbitrado
    
    
    

  • Imaging and Applied Optics Congress 2022 - 3D Image Acquisition and Display Technology Perception and Applications ( 2022 / 2022 )

    Comité programa congreso
    Canadá
    Arbitrado
    
    Optica (Formerly OSA)
    

  • International Workshop on Adaptive, Compressive and Computational Imaging WACCI 2019 ( 2019 / 2019 )

    Comité programa congreso
    Chile
    Arbitrado
    
    Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, CONICYT, FONDECYT
    

• Evaluación de premios

  • Premio a la Mejor tesis de Maestría del Área de Física, PEDECIBA, edición 2025 ( 2025 / 2025 )

    Comité de asignación de premios y concursos
    Uruguay
    
    Cantidad: Menos de 5
    Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas
    

  • Fotofísica 2024 - SUF ( 2024 / 2024 )

    Evaluación de premios y concursos
    Uruguay
    
    Cantidad: De 5 a 20
    
    

  • Optica Student Paper Prize ( 2024 / 2024 )

    Evaluación de premios y concursos
    Francia
    
    Cantidad: De 5 a 20
    OPTICA
    

  • Fotofísica 2023 - SUF ( 2023 / 2023 )

    Evaluación de premios y concursos
    Uruguay
    
    Cantidad: Menos de 5
    Sociedad Uruguaya de Física
    

  • Fotofísica 2022 - SUF ( 2022 / 2022 )

    Evaluación de premios y concursos
    Uruguay
    
    Cantidad: Menos de 5
    Sociedad Uruguaya de Física
    

  • Foco en la Ciencia - Pedeciba ( 2021 / 2021 )

    Evaluación de premios y concursos
    Uruguay
    
    Cantidad: Menos de 5
    Programa de Desarrollo de la Ciencias Básicas - PEDECIBA
    

  • Fotofísica 2021 - SUF ( 2021 / 2021 )

    Evaluación de premios y concursos
    Uruguay
    
    Cantidad: Menos de 5
    Sociedad Uruguaya de Física
    

  • Fotofísica 2020 - SUF ( 2020 / 2020 )

    Evaluación de premios y concursos
    Uruguay
    
    Cantidad: De 5 a 20
    Sociedad Uruguaya de Física (SUF)
    

  • Fotofísica 2019 - SUF ( 2019 / 2019 )

    Evaluación de premios y concursos
    Uruguay
    
    Cantidad: Menos de 5
    Sociedad Uruguaya de Física (SUF), PEDECIBA
    

  • Fotofísica 2018 - SUF ( 2018 / 2018 )

    Evaluación de premios y concursos
    Uruguay
    
    Cantidad: Menos de 5
    Sociedad Uruguaya de Física
    Concurso fotográfico organizado por la Sociedad Uruguaya de Física, orientado a promover la ciencia a través de la fotografía

  • Fotofísica 2017 - SUF ( 2017 / 2017 )

    Evaluación de premios y concursos
    Uruguay
    
    Cantidad: Menos de 5
    Sociedad Uruguaya de Física
    Concurso fotográfico organizado por la Sociedad Uruguaya de Física, orientado a promover la ciencia a través de la fotografía

• Evaluación de convocatorias concursables

  • Becas de Posgrados Nacionales 2025 - ANII ( 2025 / 2025 )

    Evaluación independiente
    Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    ANII

  • Integrante del tribunal en el CONCURSO DE MÉRITOS Y PRUEBAS - LLAMADO Nº 28/2025 para la provisión efectiva de un cargo de Asistente (Gº 2, 20 horas semanales, dedicación media) del CENUR Suroeste. ( 2025 / 2025 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5

  • Comisión Asesora - provisión de cargo becario equivalente a Grado 1 para proyecto CSIC - Grupo de Óptica Aplicada, Instituto de Física, Facultad de Ingeniería ( 2025 ) ( 2025 / 2025 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5

  • Becas de Posgrados Nacionales 2024 - ANII ( 2024 / 2024 )

    Evaluación independiente
    Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    ANII

  • Becas CAP-UdelaR 2023 ( 2023 / 2023 )

    Evaluación independiente
    Uruguay
    Cantidad: De 5 a 20
    CAP-UdelaR

  • Sub-comisión para la evaluación del PRIMER llamado 2023 a Actividades de Apoyo al Desarrollo de Estudios de Maestría en Bioinformática de PEDECIBA ( 2023 / 2023 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5

  • Sub-Comisión para evaluar las solicitudes de apoyo con fondos de la Comisión Académica de Posgrados a cursos para la Maestría en Bioinformática (Fondos (CAP 2023) ( 2023 / 2023 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5

  • Comisión Asesora - provisión de cargo becario equivalente a Grado 1 para proyecto CSIC - Grupo de Óptica Aplicada, Instituto de Física, Facultad de Ingeniería ( 2023 ) ( 2023 / 2023 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5

  • Integrante del tribunal en el CONCURSO DE MÉRITOS Y PRUEBAS - LLAMADO Nº 77/2022 para la provisión efectiva de dos cargos de Asistente (Gº 2, 20 horas semanales, dedicación media) del Instituto de Física de Facultad de Ingeniería.. ( 2022 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5

  • Sub-Comisión para la evaluación de solicitudes de apoyo para el desarrollo de actividades vinculadas a la Maestría en Bioinformática (2021) ( 2021 / 2021 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5

  • Comisión Asesora llamado N° 081/20 - provisión interina de cuatro cargos de Ayudante del Instituto de Física, Facultad de Ciencias - Perfil Física General ( 2020 )

    Comité evaluador
    Cantidad: Menos de 5

  • Comisión Asesora llamado N° 113/20 - provisión interina de un cargo de Ayudante del Instituto de Física, Facultad de Ciencias - Perfil Física General ( 2020 )

    Comité evaluador
    Cantidad: Menos de 5

  • Comisión Asesora llamado N° 102/20 - provisión interina de un cargo de Ayudante del Instituto de Física, Facultad de Ciencias - Perfil Física General ( 2020 )

    Comité evaluador
    Cantidad: Menos de 5

  • Comisión Asesora llamado N° 162/2019 - lista de prelación de aspirantes provisión interina de cargos de Ayudante del Instituto de Física, Facultad de Ingeniería ( 2019 )

    Comité evaluador
    Cantidad: Menos de 5

  • Comisión Asesora - provisión de cargo becario equivalente a Grado 1 para proyecto CSIC - Grupo de Óptica Aplicada, Instituto de Física, Facultad de Ingeniería ( 2017 )

    Comité evaluador
    Uruguay
    Cantidad: Menos de 5
    Facultad de Ingeniería, Universidad de la República

• Jurado de tesis

  • Maestría en Física ( 2026 / 2026 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Instituto de Física , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Presidenta del tribunal de tesis de maestría de la Lic. Carina Cabrera. Título de la disertación: "Caracterización óptica de perovskitas de halogenuros metálicos a bajas temperaturas"

  • Maestría en Física ( 2025 / 2025 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Instituto de Física , Uruguay
    Nivel de formación: Maestría
    Miembro titular del tribunal de tesis de Maestría del Lic. Piero Beretta. Título de la disertación: "A New Functional Renormalization Group Study of Universality Classes with O(N) Symmetry"

  • Doctorado en Física ( 2024 / 2024 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Instituto de Física , Uruguay
    Nivel de formación: Doctorado
    Miembro titular del tribunal de tesis de Doctorado del MSc. Matías Fernández Lakatos. Título de la disertación: "Visualización y Caracterización de Objetos de Fase"

  • Maestría en Ciencias en Ingeniería Electrónica Y Computación ( 2019 )

    Jurado de mesa de evaluación de tesis
    Sector Extranjero/Internacional/Otros / UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA / Centro Universitario de Ciencias Exactas E Ingenierías , México
    Nivel de formación: Maestría
    

Formación de RRHH

• Tutorías concluidas

  • Posgrado

    • Advancing TIE-based Quantitative Phase Microscopy: From Compact Instrumentation to Numerical Optimization for Label-Free Biological Analysis. (2020 - 2026)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ingeniería (Ingeniería Física)
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Alejandro Silva
      País: Uruguay

    • Síntesis de campos de luz estereoscópicos a partir de secuencias de imágenes multi-foco

      Tesis de maestria
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / UNIVERSIDAD DE GUADALAJARA , México
      Tipo de orientación: Asesor
      Nombre del orientado: Sergio Gómez Angulo
      País: México
      Cotutoría junto al Dr. Ing. Jorge L. Flores del Centro Universitario de Ciencias exactas e Ingenierías, Universidad de Guadalajara.

  • Otras

    • Development of optical systems using additive manufacturing (2025 - 2025)

      Iniciación a la investigación
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Instituto de Física , Uruguay
      Programa: Convenio Le Mans Université - Universidad de la República
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Rémi Liaigre
      País: Uruguay

    • Pasantía de Ingeniería Eléctrica (2025 - 2025)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Instituto de Física , Uruguay
      Programa: Ingeniería Eléctrica
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Belén Gaál
      País: Uruguay

    • Bases físicas del desenfoque en Fotografía de Apertura Sintética (2025 - 2025)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Instituto de Física , Uruguay
      Programa: Ingeniería Físico-Matemática
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Ivo Santín
      País: Uruguay

    • Microscopía Holográfica Digital basada en Aprendizaje Profundo consciente de la Física (CSIC i+d 2022) (2023 - 2024)

      Iniciación a la investigación
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Comisión Sectorial de Investigación Científica , Uruguay
      Programa: Iniciación a la Investigación
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Roman Demczylo
      País: Uruguay

    • Fotografía Integral con Apertura Sintética (2022 - 2022)

      Iniciación a la investigación
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Física (PEDECIBA) , Uruguay
      Programa: Pasantía de Iniciación a la investigación
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Julieta Umpierrez
      País: Uruguay

    • Pasantía en Ingeniería Eléctrica (2022 - 2022)

      Iniciación a la investigación
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
      Programa: Pasantía
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Julieta Umpierrez
      País: Uruguay

    • Proyecto ANII-FMV-1-2019-156126 (2020 - 2022)

      Iniciación a la investigación
      Sector Gobierno/Público / Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
      Programa: Fondo María Viñas
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Alejandro Silva
      País: Uruguay

    • Proyecto CSIC I+D 2016 id 237 (2019 - 2021)

      Iniciación a la investigación
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
      Programa: Pasantía de un proyecto CSIC I+D
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Alejandro Silva
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Microscopía por hoja de luz Óptica Adaptiva Procesamiento de imágenes

    • Proyecto CSIC I+D 2016 id 331 (2017 - 2019)

      Iniciación a la investigación
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
      Programa: Programa de Iniciación a la Investigación-CSIC-UDELAR
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Alejandro Silva
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Microscopía tridimensional Procesamiento de Imágenes Esferoides tumorales
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada

    • Registro automático de imágenes multi-foco (Proyecto de fin de curso de Tratamiento de Imágenes por Computadora - timag- IIE)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Alejandro Silva y Daniel Soria
      País: Uruguay

    • Pasantía de Ingeniería Eléctrica

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
      Nombre del orientado: Alejandro Silva
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Procesamiento de Imágenes Microscopía
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada

    • Procesamiento Óptico de Imágenes y Profilometría 3D

      Iniciación a la investigación
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
      Nombre del orientado: Agustina Pieruccioni
      País: Uruguay
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Perfilometría 3D

• Tutorías en marcha

  • Posgrado

    • Análisis de la Transición Epitelio-Mesénquima en Modelos Celulares de Cáncer mediante Imagenología de Fase Cuantitativa (2026)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Maestria Biologia Celular y Molecular, PEDECIBA
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( J R ALONSO / J ALONSO , MIGUEL AROCENA )
      Nombre del orientado: Carla Serrano
      País/Idioma: Uruguay,

    • Microscopía Holográfica Digital basada en Aprendizaje Profundo guiado por Física para el estudio de la Dinámica Celular Tumoral (2022)

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ingeniería Física
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( J R ALONSO / J ALONSO , FEDERICO LECUMBERRY )
      Nombre del orientado: Juan Llaguno
      País/Idioma: Uruguay, Español

  • Otras

    • Pasantía de Ingeniería Eléctrica - Motion Blur from Synthetic Aperture Imaging (2026)

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Instituto de Física , Uruguay
      Programa: Ingeniería Eléctrica
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( J R ALONSO / J ALONSO , Julieta Umpierrez )
      Nombre del orientado: Martín Mendlewicz
      País/Idioma: Uruguay,

    • Microscopía Ptycográfica de Fourier (2024)

      Iniciación a la investigación
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería / Instituto de Física , Uruguay
      Programa: Bachiller en Ciencias Básicas de Ingeniería
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Belén Gaál
      País/Idioma: Uruguay,

Otros datos relevantes

• Premios, Honores y Títulos

  • Premio "Roberto Caldeyro Barcia 2021" PEDECIBA - Física (2021)

    (Nacional)
    Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas - PEDECIBA
    Los Premios en Ciencias Básicas Roberto Caldeyro Barcia fueron instituidos en memoria del Director Fundador del Programa y se convocaron por primera vez en el año 1999. Se entregan cada dos años y se premia la excelencia académica en ciencias básicas, puesta de manifiesto en la actuación y trayectoria científica de los investigadores en el ámbito nacional.
    

  • OSA Publishing Recognition for peer review during 2017-2018 (2018)

    (Internacional)
    Optical Society of America (OSA)
    
    

  • SPIE Certificate Recognition for serving as a reviewer for Optical Engineering during 2018. (2018)

    (Internacional)
    The International Society for Optics and Photonics (SPIE)
    
    

  • Investigador Grado 3 Pedeciba Física (2017)

    (Nacional)
    Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas - PEDECIBA
    
    

  • Investigador Nivel I (Sistema Nacional de Investigadores - SNI) (2017)

    (Nacional)
    Agencia Nacional de Innovación e Investigación - ANII
    
    

  • Premio como Mejor tesis de Doctorado PEDECIBA-Física 2015-2017 (2017)

    (Nacional)
    PEDECIBA Física
    
    

  • Reconocimiento en la 1era Jornada de Reconocimiento a la Ciencia - MEC (2017)

    (Nacional)
    Ministerio de Educación y Cultura MEC - Dirección para el Desarrollo de la Ciencia y el Conocimiento
    
    

  • Artículo de mi autoría seleccionado para la tapa del "special issue: Applications-Centered Research in Optics" de Applied Optics (2017)

    (Internacional)
    Optical Society of America (OSA)
    Artículo " Alonso, J. R. (2017). Fourier domain post-acquisition aperture reshaping from a multi-focus stack. Applied Optics, 56(9), D60-D65. " seleccionado para la tapa del "special issue: Aplications-Centered Research in Optics" Vol 56 - Issue 9, 20 March 2017.
    

  • Artículo de mi autoría entre los "top downloads in image processing from Optics Letters y Applied Optics 2016" (2016)

    (Internacional)
    Optical Society of America (OSA)
    Artículo "Alonso, J. R., Fernández, A., Ferrari, J. A. (2016). "Reconstruction of perspective shifts and refocusing of a three-dimensional scene from a multi-focus image stack". Applied Optics, 55(9), 2380-2386" destacado por estar entre los top downloads en las revistas Optics Letters y Applied Optics de la OSA en el transcurso del año 2016. (Como reconocimiento la OSA libera el artículo dejándolo en el modo "open access" durante 30 días)
    

  • Extensiones Horarias más Dedicación Total (EH+DT) (CDC 11/5/2010) (2010)

    (Nacional)
    Universidad de la República - UdelaR
    
    

  • Candidato a Investigador (Sistema Nacional de Investigadores - SNI) (2010)

    (Nacional)
    Agencia Nacional de Innovación e Investigación - ANII
    
    

  • Beca de Maestría (2008)

    (Nacional)
    Agencia Nacional de Innovación e Investigación - ANII
    
    

  • Llamados de Oporturnidad de Ascenso (LLOA) (CDC 8/7/2008 Categoría I: muy sobrecalificado) (2008)

    (Nacional)
    Universidad de la República - UdelaR
    
    

  • Beca de Maestría (2006)

    (Nacional)
    Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas - PEDECIBA
    
    

• Presentaciones en eventos

  • 3D Image Acquisition and Display: Technology, Perception and Applications (2026)

    Congreso
    Advances in Light-field and Integral Imaging: Display, Perception, and Computational Reconstruction
    Holanda
    Tipo de participación: Moderador
    Nombre de la institución promotora: OPTICA
    Alcance geográfico: Internacional

  • Imaging Systems and Applications & Computational Optical Sensing and Imaging (2026)

    Congreso
    Super-Resolution Imaging and Microscopy
    Holanda
    Tipo de participación: Moderador
    Nombre de la institución promotora: OPTICA
    Alcance geográfico: Internacional

  • Computational Optical Sensing and Imaging (2026)

    Congreso
    Phase Retrieval and Compressive Imaging
    Holanda
    Tipo de participación: Moderador
    Nombre de la institución promotora: OPTICA
    Alcance geográfico: Internacional

  • Universitat Jaume I (2026)

    Seminario
    Research Overview from the Computational Optics Lab - Montevideo
    España
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Nombre de la institución promotora: Departamento de Física - Universitat Jaume I
    Alcance geográfico: Internacional

  • Three-Dimensional Imaging, Visualization, and Display 2026 (2026)

    Congreso
    3D Active Imaging and Biomedical Applications
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Moderador
    Nombre de la institución promotora: SPIE
    Alcance geográfico: Internacional

  • Three-Dimensional Imaging, Visualization, and Display 2026 (2026)

    Congreso
    Combining optics and algorithms for QPI microscopy
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Nombre de la institución promotora: SPIE
    Alcance geográfico: Internacional

  • UMass Dartmouth (2026)

    Seminario
    Computational Optics Laboratory presentation
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Alcance geográfico: Internacional

  • VII 'Rio de la Plata' Workshop on Optics and Photonics (2025)

    Congreso
    Co-designing Optics and Algorithms for Enhanced Microscopy: a multidisciplinary journey
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Alcance geográfico: Internacional

  • Computational Optical Sensing and Imaging (2025)

    Congreso
    AI-Based Imaging and Microscopy
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Moderador
    Nombre de la institución promotora: OPTICA
    Alcance geográfico: Internacional

  • 19th Workshop on Information Optics (2025)

    Congreso
    Computational Optical Imaging: Advancing Microscopy for Bioscience
    España
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Nombre de la institución promotora: Institute of Photonic Sciences
    Alcance geográfico: Internacional

  • Three-Dimensional Imaging, Visualization, and Display 2025 (2025)

    Congreso
    Understanding biological dynamics in 3D+ t: a time-lapse multifocus microscopy approach
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Nombre de la institución promotora: SPIE
    Alcance geográfico: Internacional

  • Computational Optical Sensing and Imaging (2024)

    Congreso
    Physics-Informed Multifocus Fluorescence and Quantitative Phase Imaging for Comprehensive Cellular Analysis
    Francia
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Nombre de la institución promotora: OPTICA
    Alcance geográfico: Internacional

  • SIMBIO 2024 (2024)

    Simposio
    Microscopía Óptica Computacional informada por Física
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: Grupo de Adquisión y Análisis de Imágenes Biomédicas
    Alcance geográfico: Regional

  • Seminarios del IFFI 2024 (2024)

    Seminario
    Imagen Óptica Computacional
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Alcance geográfico: Nacional

  • 3D Image Acquisition and Display: Technology, Perception and Applications (2024)

    Congreso
    3D visuospatial perception in augmented reality based on multifocus imaging
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: OPTICA
    Alcance geográfico: Internacional

  • International Workshop on Adaptive, Compressive and Computational Imaging WACCI 2024 (2024)

    Congreso
    Computational Imaging for Biomedical applications
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Alcance geográfico: Internacional

  • 3D Image Acquisition and Display: Technology, Perception and Applications (2023)

    Congreso
    Multi-Focus Imaging in Fluorescence Microscopy and Augmented Reality
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: OPTICA
    Alcance geográfico: Internacional

  • European Conferences on Biomedical Optics (ECBO 2023 - SPIE) (2023)

    Congreso
    3D visualization of multicellular tumor spheroids in fluorescence microscopy
    Alemania
    Tipo de participación: Poster
    Nombre de la institución promotora: SPIE

  • Computational Imaging VII (SPIE 2023) (2023)

    Congreso
    All-in-focus reconstruction of a dynamic scene from multiple-multifocus captures
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: SPIE
    Alcance geográfico: Internacional

  • Latin America Optics and Photonics Conference (LAOP 2022) (2022)

    Congreso
    Recent Advances in 3D Visualization with Multifocus Sensing in Augmented Reality and Fluorescence Microscopy
    Brasil
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Nombre de la institución promotora: Optica

  • II International Workshop on Adaptive, Compressive and Computational Imaging (WACCI 2022) (2022)

    Encuentro
    3D Visualization in Augmented Reality and Fluorescence Microscopy with Multifocus Sensing and Fourier Domain Processing
    Colombia
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Nombre de la institución promotora: Universidad Industrial de Santander, Bucaramanga, Colombia

  • Procesamiento de Imágenes para Biología y Medicina (PIMBIO 2022) (2022)

    Seminario
    Recent Advances in 3D Visualization with Multifocus Sensing in Augmented Reality and Fluorescence Microscopy
    Uruguay
    Tipo de participación: Conferencista invitado

  • XVII Reunión de la Sociedad Uruguaya de Física (SUF 2022), "José A. Ferrari" - 4 y 5 de noviembre 2022, Hotel Nirvana, Nueva Helvecia (2022) (2022)

    Encuentro
    "Visualización 3D en Realidad Aumentada y Microscopía de Fluorescencia con sensado multifocal y procesamiento en el dominio de Fourier.?
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral

  • Imaging and Applied Optics 2022 - 3D Sensing, Imaging, and Microscopy (2022)

    Congreso
    Manipulation of the Parallax Values for Depth Perception Flexibility from Multifocus Stacks
    Canadá
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: Optica Publishing Group (ex OSA)

  • Seminarios de Física 2022 (2022)

    Seminario
    Enfoque Múltiple aplicado a Microscopía de Fluorescencia y Realidad Aumentada
    Tipo de participación: Expositor oral

  • 3D Image Acquisition and Display: Technology, Perception and Applications (2021)

    Congreso
    Focus Stacking and 3D Visualization in Multispectral Microscopy of Thick Samples
    Canadá
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: OSA

  • Education and Training in Optics and Photonics 2021 - OSA (2021)

    Congreso
    Learning Optics with a DIY Polarization-based 3D display
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: Optical Society of America - OSA

  • Unconventional Optical Imaging II (2020)

    Congreso
    Computational multimodal and multifocus 3D microscopy
    Francia
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: SPIE

  • International Workshop on Adaptive, Compressive and Computational Imaging WACCI 2019 (2019)

    Encuentro
    Multi-focus Computational Optical Imaging: macro and microscopic applications
    Chile
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Nombre de la institución promotora: Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, CONICYT, FONDECYT

  • Primer Workshop Anual de Microscopia Avanzada de Fluorescencia y Biofotónica (2019)

    Encuentro
    Óptica Computacional aplicada a la Microscopía de Fluorescencia
    Uruguay
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Nombre de la institución promotora: Hospital de Clínicas, Facultad de Medicina, UdelaR Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica
    

  • Mesa SBF-SUMI: Microscopías avanzadas de fluorescencia: Nuevas instrumentaciones y aplicaciones en biología cuantitativa, Congreso Nacional de Biociencias (2019)

    Congreso
    Microscopía óptica computacional
    Uruguay
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Nombre de la institución promotora: SBF-SUMI

  • RIAO-OPTILAS-MOPM 2019 (2019)

    Congreso
    COMPUTATIONAL MULTIFOCAL IMAGING IN 3D FLUORESCENCE MICROSCOPY
    México
    Tipo de participación: Expositor oral

  • Three-Dimensional Imaging, Visualization, and Display 2019 (2019)

    Congreso
    3D visualization in multifocus fluorescence microscopy
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: SPIE

  • XVI Reunión de la Sociedad Uruguaya de Física (SUF) 2018 "Félix Cernuschi" - 7 y 8 setiembre 2018, Colonia West Hotel, Conchillas (2018)

    Congreso
    "Imaginería Óptica Computacional: la revolución"
    Uruguay
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Uruguaya de Física (SUF)

  • Curso de seminarios para primer año (2018)

    Seminario
    ? Luz, Cámara, Acción! Hacia la Imaginería Óptica Computacional.?
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: Instituto de Física, Facultad de Ciencias, UdelaR

  • Encontro de Outono da Sociedade Brasileira de Física (EOSBF), Foz do Iguazú, 2018 (2018)

    Encuentro
    "Axial Scanning Computational Optical Imaging in Fourier Domain"
    Brasil
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: Sociedade Brasileira de Física

  • Seminario Interdisciplinario “Procesamiento y Analisis de Imágenes Biomedicas" SIMBIO (2017)

    Seminario
    Desarrollo de técnicas ópticas y de procesamiento de imágenes para la construcción de un microscopio personalizado para el estudio de esferoides tumorales multicelulares.
    Uruguay
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Carga horaria: 5
    Nombre de la institución promotora: Núcleo Interdisciplinario IMAGINA ("Centro de Obtención y Análisis de Imágenes Biomédicas")

  • Winter College on Optics: Advanced Optical Techniques for Bio-imaging (2017)

    Congreso
    Multi-focus Computational Optical Imaging in Fourier Domain
    Italia
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 6
    Nombre de la institución promotora: The Abdus Salam International Centre for Theoretical Physics (ICTP)

  • Seminario Interdisciplinario “Procesamiento y Analisis de Imágenes Biomedicas" SIMBIO (2017)

    Seminario
    Preparación de esferoides tumorales multicelulares, adquisición de imágenes multi-foco y corrección de escala para microscopio personalizado.
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 10
    Nombre de la institución promotora: Núcleo Interdisciplinario IMAGINA ("Centro de Obtención y Análisis de Imágenes Biomédicas")

  • Reunión 25 Aniversario de la Sociedad Uruguaya de Física - SUF (2017)

    Encuentro
    Corrección de escala de imágenes multi-foco para microscopio personalizado (custom-built)
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 10
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Uruguaya de Física

  • Ciclo de conferencias del Centro de Investigación y Desarrollo de Tecnología Digital, del Instituto Politécnico Nacional (CITEDI-IPN), Tijuana, Baja California. (2016)

    Seminario
    Imaginería Óptica Computacional Multifoco en el dominio de Fourier
    México
    Tipo de participación: Conferencista invitado
    Carga horaria: 10
    Nombre de la institución promotora: Centro de Investigación y Desarrollo de Tecnología Digital, del Instituto Politécnico Nacional (CITEDI-IPN)

  • IX Reunión Iberoamericana de Óptica y XII Reunión Iberoamericana de Óptica, Láseres y Aplicaciones (RIAO/OPTILAS) (2016)

    Congreso
    Stereoscopy and refocusing from axial scanning in 3D imaging
    Chile
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 40
    Nombre de la institución promotora: Centro de Óptica y Fotónica de la Universidad de Concepción (CEFOP-UDEC)

  • Optics and Photonics for Information Processing X (2016)

    Congreso
    Stereoscopic 3D-scene synthesis from a monocular camera with an electrically tunable lens
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 10
    Nombre de la institución promotora: SPIE Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
    

  • Imaging and Applied Optics 2016 (2016)

    Congreso
    Fourier Domain Method for Extended Deph-of-field From a Multi-focus Image Stack
    Alemania
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 40
    Nombre de la institución promotora: Optical Society of America (OSA) Palabras Clave: Fourier Optics and Signal Processing Image Reconstruction Techniques Three-dimensional image processing
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
    

  • Imaging and Applied Optics 2016 (2016)

    Congreso
    Synthetically Reshaped Aperture for Postacquisition Three-dimensional Scene Refocusing from a Multi-focus Image Stack
    Alemania
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 40
    Nombre de la institución promotora: Optical Society of America (OSA) Palabras Clave: Image Reconstruction Techniques Computational imaging Three-dimensional image processing
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
    

  • Frontiers in Optics 2015 (2015)

    Congreso
    From Frequency Domain Multi-Focus Fusion to Focus Slicing
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Expositor oral
    Carga horaria: 40
    Nombre de la institución promotora: Optical Society of America (OSA)

  • XIV Reunión de la Sociedad Uruguaya de Física (2014)

    Congreso
    Fusión de imágenes Multi-foco
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster
    Carga horaria: 40
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Uruguaya de Física (SUF)

  • XIII Encuentro Sociedad Uruguaya de Física - SUF (2012)

    Congreso
    Procesamiento de imágenes: fusión de imágenes multi-foco
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: Sociedad Uruguaya de Física - SUF Palabras Clave: image fusion multi-focus images focus-stacking
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
    

  • Segunda reunión conjunta AFA-SUF 2011 (2011)

    Congreso
    Optical processing of color images with incoherent illumination: orientation-selective edge enhancement using a digital micromirror device
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster
    Nombre de la institución promotora: Asociadión de Física Argentina - Sociedad Uruguaya de Física

  • PASI 2011: Frontiers in Imaging Science (2011)

    Congreso
    Three-dimensional profiling with binary fringes using phase-shifting interferometry algorithms
    Colombia
    Tipo de participación: Poster
    Nombre de la institución promotora: Pan American Advanced Studies Institute Palabras Clave: imaging technology
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Óptica, Acústica / Óptica Aplicada
    

  • Seminarios de Sistemas Complejos (IFFC) (2009)

    Seminario
    Un posible modelo de Cuasiespecies Virales
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral

  • Primera reunión conjunta AFA-SUF (2008)

    Congreso
    Auto-organización en cuasiespecies virales
    Argentina
    Tipo de participación: Poster
    Nombre de la institución promotora: Asociadión de Física Argentina - Sociedad Uruguaya de Física Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos
    

  • XVI Conference on Nonequilibrium Statistical Mechanics & Nonlinear Physics (MEDYFINOL 08) (2008)

    Congreso
    RNA viruses: Quasispecies point of view
    Uruguay
    Tipo de participación: Poster
    Nombre de la institución promotora: Facultad de Ciencias, Udelar Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos
    

  • II Encuentro Latinoamericano de Sistemas Complejos en Ciencias Naturales y Sociales (2005)

    Encuentro
    Prisioner`s Dilemma revisited: cooperation under pressure
    Uruguay
    Tipo de participación: Expositor oral Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Sistemas Complejos
    

  • VIII Jornadas de Jovens Pesquisadores do Grupo Montevideo (2000)

    Encuentro
    Fabricación y Caracterización de Cerámicas PZT Ultrasensibles
    Brasil
    Tipo de participación: Poster
    Nombre de la institución promotora: Grupo Montevideo - UFSCar Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Materiales Condensados / Estado Sólido
    

• Jurado/Integrante de comisiones evaluadoras de trabajos académicos

  • Síntesis de campos de luz estereoscópicos a partir de secuencias de imágenes multi-foco (2019)

    Candidato: Sergio Gómez Angulo
    Tipo Jurado: Tesis de Maestría
    J R ALONSO / J ALONSO , J. L. Flores , M. Strojnik , G. García-Torales
    Maestría en Ciencias en Ingeniería Electrónica y Computación / Sector Extranjero/Internacional/Otros / Institución Extranjera / Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de Ciencias Exactas e Ingenierías / México
    País: México
    Idioma: Español
    

Información adicional

Miembro de la Optical Society of America (OSA/OPTICA)

Miembro de la Sociedad Uruguaya de Física (SUF)

Miembro de la International Society for Optics and Photonics (SPIE) 

Financiada en el LLAMADO DE EQUIPOS, SOFTWARE Y ACCESO A BIBLIOGRAFÍA Y A BASES DE DATOS, PEDECIBA 2026. Equipamiento financiado: Liquid Crystal Tunable Filter

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