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Caracterización molecular de formas recombinantes del Virus de la Inmunodeficiencia Humana Tipo 1 (VIH-1) circulantes en Uruguay (03/2024 - a la fecha)
Caracterizar molecularmente el espectro de formas recombinantes B/F1 del VIH-1 circulantes en Uruguay mediante el análisis de genomas completos, para contribuir al conocimiento epidemiológico y la toma de decisiones en salud pública.
5 horas semanales
Investigación
Integrante del Equipo
En Marcha
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:1
Financiación:
Dirección de Innovación, Ciencia y Tecnología, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
SOLER, AM , MIR D (Responsable) , Añasco, A. , LIZASOAIN, A. , ROMERO H , Gonzalo Wilson BELLO ALMEIDA , FLIELLER M R , Cortinas, M.N. , RUCHANSKY D. , Brasesco M , CHIPARELLI, H. , M.C. MOGDASY , CABRERA, S.
Palabras clave:
VIH-1
Formas Recombinantes
Epidemiologia Molecular
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Caracterización Molecular del Sistema Rhesus en individuos RhD negativos y RhD variantes de Uruguay (03/2024 - a la fecha)
El sistema Rhesus (Rh) es el sistema de grupos sanguíneos más complejo y polimórfico de la membrana eritrocitaria, siendo el segundo en importancia clínica en la medicina transfusional. Las proteínas Rh (RhD y RhCE) son las determinantes antigénicas de este grupo sanguíneo. La proteína RhD expresa el antígeno D mientras que la proteína RhCE porta los antígenos C, c, E y e. El antígeno D es el más inmunogénico y está compuesto por varios epítopos (más de 30); seguido por los antígenos c y E. Estos antígenos desempeñan un papel fundamental en las reacciones hemolíticas transfusionales, en la inmunización de pacientes politransfundidos y en la enfermedad hemolítica del feto. Estas proteínas están codificadas por dos genes (RHD y RHCE), de 10 exones c/u, localizados en tándem en el cromosoma 1 y con una homología de secuencia de 93,8%. En la rutina diaria, mediante pruebas serológicas, los individuos pueden ser clasificados como "D positivos" (aglutinaciones de 3 o 4 cruces) o "D negativos" (ausencia de aglutinación). Sin embargo, en algunos casos se obtiene una aglutinación menor a la esperada (1 o 2 cruces) o una discordancia de reactividad con diferentes antisueros anti-D. En estos casos, se dice que estamos ante un individuo con fenotipo "D variante". En Uruguay, la frecuencia del fenotipo serológico Rh negativo es aproximadamente del 15 %. A nivel molecular, son aquellos que no expresan el gen RHD. Existen tres posibles mecanismos (alelos) que explican la falta de expresión de este gen: 1) deleción total del gen RHD, 2) la existencia de un "pseudogen" RHD (completo pero inactivo) y 3) la presencia de un gen híbrido RHD-CE-RHD. En Uruguay, se desconoce cuál es la frecuencia de cada uno de los alelos que explican esta falta de expresión. Por otro lado, los fenotipos D variantes son producto de un conjunto muy variado de mutaciones en el gen RHD, con una gran variabilidad fenotípica. Estas se clasifican como D débiles y D parciales. La tipificación serológica no permite distinguir los alelos D débiles de los D parciales. Por ende, el genotipado de RHD resulta muy útil en la caracterización precisa de los D variantes, siendo relevante para prevenir la aloinmunización. Por último, aunque los antígenos C y E son menos inmunogénicos que el antígeno D, en pacientes politransfundidos pueden ser un factor de riesgo. En nuestro país, actualmente, no se realiza la tipificación de estos antígenos.
Considerando que la población uruguaya tiene una estructura tri-hibrida y que los alelos/haplotipos de RHD y RHCE presentan diferentes frecuencias en las distintas poblaciones, conocer cuáles son los alelos/haplotipos presentes en nuestro país, es un insumo relevante para el desarrollo de estrategias de genotipado del sistema Rh. Este proyecto pretende caracterizar, por técnicas de biología molecular, los genes RHD y RHCE en una muestra de individuos fenotípicamente RhD negativos y RhD variantes de los bancos de sangre de Montevideo, Salto y Paysandú
10 horas semanales
Investigación
Coordinador o Responsable
En Marcha
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:2
Financiación:
Dirección de Innovación, Ciencia y Tecnología, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
SOLER, AM (Responsable) , DA LUZ J , G.Rivas , Antonella Falcón , RODRÍGUEZ, M.
Palabras clave:
Sistema Rh
RhD y RhCE
Variantes RhD
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Caracterización Molecular del Sistema Sanguíneo Rh, una estrategia para la optimización del uso de Hemocomponentes (04/2025 - a la fecha)
Código: FMV_3_2024_1_181352 El sistema de grupos sanguíneos Rhesus (Rh) es el más polimórfico de la membrana eritrocitaria, siendo el segundo en importancia clínica en la medicina transfusional. Las proteínas RhD y RhCE son las determinantes antigénicas de este sistema. Específicamente, RhD expresa el antígeno D, que está compuesto por varios epítopes, mientras que RhCE porta los antígenos C, c, E y e. Estos antígenos desempeñan un papel fundamental en las reacciones hemolíticas transfusionales y en la Enfermedad Hemolítica del Feto. Estas proteínas están codificadas por dos genes (RHD y RHCE), de 10 exones c/u, localizados en el cromosoma 1. Mediante serología, los individuos son clasificados como "D positivos" (aglutinación de 3 o 4 cruces) o "D negativos" (sin aglutinación). Sin embargo, en ocasiones la aglutinación es menor (<3 cruces) o discordante entre diferentes antisueros. En estos casos, estamos ante individuos "D variantes".
Los "D negativos" son aquellos que no expresan el gen RHD. Existen tres alelos que explican esta falta de expresión: 1) deleción total del gen, 2) existencia de un "pseudogen" RHD (inactivo) y 3) presencia de un gen híbrido RHD-CE-RHD. En Uruguay, se estima que la frecuencia de "D negativos" es aproximadamente del 10-15 %, pero se desconoce la frecuencia de estos alelos. Por otro lado, la gran variabilidad de fenotipos "D variantes" es producto de una diversidad de mutaciones en el gen RHD. Pueden clasificarse como "D débiles" (menor número de antígenos) y "D parciales" (falta de uno o más epítopes). Sin embargo, la tipificación serológica no permite distinguir entre estos dos fenotipos.
Finalmente, aunque menos inmunogénicos, los antígenos C y E son un factor de riesgo en pacientes politransfundidos. En Uruguay, no se realiza la tipificación de estos antígenos. Este proyecto pretende caracterizar molecularmente los genes RHD y RHCE en individuos con distintos fenotipos serológicos de los bancos de sangre de Montevideo, Salto y Paysandú
10 horas semanales
Coordinador o Responsable
En Marcha
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:2
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
SOLER, AM (Responsable) , DA LUZ J , G.Rivas , Mariana Rodríguez , Antonella Falcón
Areas de conocimiento:
Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica /
Genética Humana /
Genética Grupo Sanguíneo Rh
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Caracterización farmacogenómica de pacientes de la Red de Atención Primaria de la Administración de Servicios de Salud del Estado-Salto (04/2025 - a la fecha)
Las reacciones adversas a medicamentos (RAM) son una causa importante de morbimortalidad, afectan los resultados del tratamiento, aumentan la tasa de admisión a hospitales, aumenta el costo de la terapia, afectan la calidad de vida, y la satisfacción del paciente con la atención médica. Aproximadamente 3,6% de todas las hospitalizaciones en Europa son debidas a RAM. Datos de Uruguay indican que entre un 1,8% y un 4,1% de las hospitalizaciones son debido a RAM. La variabilidad individual de las RAM puede ser explicada en parte por variantes en genes involucrados en la adsorción, distribución, metabolismo y excreción de medicamentos (ADME genes) así como en aquellos que son diana terapéutica de los medicamentos. Diversos estudios han mostrado que el genotipado previo al tratamiento puede reducir significativamente el número de RAM. Muchas de las variantes farmacogenéticas presentan frecuencias diferentes entre las distintas poblaciones geográficas e incluso algunas variantes son privativas de algunas poblaciones, haciendo inadecuado extrapolar los datos de otras poblaciones a poblaciones mezcladas como la uruguaya y las latinoamericanas. La mayoría de los medicamentos son recetados en la atención primaria de la salud, por lo que es adecuado analizar esta población. En Salto, aproximadamente un 60% de la población se atiende en ASSE, por lo que planteamos realizar un estudio de epidemiología genética en pacientes de atención primaria de salud. El objetivo de este proyecto es identificar 34 variantes farmacogenéticas accionables vinculadas a la variabilidad en la respuesta a fármacos recetados en las policlínicas de la RAP-ASSE de Salto y analizar la relación con las RAM, con énfasis en reguladores del colesterol, anticoagulantes y antidepresivos, en una muestra de al menos 250 pacientes.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
En Marcha
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Financiación:
Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
DA LUZ J (Responsable) , SOLER, AM , Burgueño-Rodrígez G. , Varela R
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PD1 nanoparticles charged with shRNACD95, a new immunotherapy to treat Acute Lymphoblastic Leukemia (10/2024 - a la fecha)
Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is the most common malignancy in childhood. ALL is characterized by an uncontrolled proliferation of lymphocytes, type B (80%-85%), T (10%-15%) NK (<5%). The causes of ALL are not clear. Diverse factors have been associated, such as exposure to radiation, viral agents as HTLV-, and genetic aberrations. In ALL, immature cells displace healthy cells, favouring the appearance of recurrent infections, anemia and easy bleeding. The treatment of ALL is mainly chemotherapy, with a good recovery rate and reports of up to 40% of adverse effects. In some cases radiation therapy, bone marrow transplant, and immunotherapy are used. In immunotherapy, the use of mAbs against proteins such as CD19, CD3 and CD22 have been of great relevance, however, with the development of side effects that must be monitored. Therefore, the development of an immunotherapy that allows identifying leukemia cells expressing PDL1, could improve immunotherapy against LLA. PDL1-PD1 is an immunological checkpoint useful in the clinic; T-lymphocytes express PD1 and tumor cells PDL1 (Cao H. et al., 2023), so is a great target to lead treatments.
Despite these promising results, the success of cancer immunotherapy is based on enhancing the immune response against tumor cells and the ability to discriminate tumor cells from healthy. Since refinement of drug delivery systems is essential for improving therapeutic outcomes in this project we focus on the synthesis and characterization of new improved nanoparticles. Thus, our NP (nanoparticle) will carry PD1 in the surface and shRNA against death receptor CD95 which will react against tumoral cells (Putzbach W. et al., 2017), to then eliminate those aberrant cells that cause ALL
5 horas semanales
Integrante del Equipo
En Marcha
Financiación:
Universidad del País Vasco, (UPV/EHU), España, Apoyo financiero
Equipo:
Patricia García Gallastegi (Responsable) , SOLER, AM , Iker Badiola Etxaburu , Laura Gómez Santos , Andrea Carolina Machado Sulbaran , Antonio Topete Camacho
Palabras clave:
Inmunoterapia
Nanoparticulas
Leucemia
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Variabilidad Genética Humana en la Región Norte del Uruguay y aspectos microevolutivos subyacentes (04/2021 - a la fecha)
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3 horas semanales
Investigación
Integrante del Equipo
En Marcha
RRHH formados en el proyecto:
Doctorado:1
Financiación:
Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
SANS, M. (Responsable) , DA LUZ J , Pedro A. HIDALGO MENEDEZ , COLISTRO V. , SOLER, AM , MUT P. , Burgueño-Rodrígez G.
Palabras clave:
Ancestralidad
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Vigilancia genómica del Virus de la Inmunodeficiencia Humana Tipo 1 (VIH-1) en Uruguay (05/2022 - 05/2024 )
La vigilancia epidemiológica es clave para prevenir la propagación de enfermedades infecciosas. Esto es evidente en el caso de COVID-19, donde el enfoque de prueba, rastreo y aislamiento ha demostrado ser exitoso para restringir la diseminación viral. En el caso del VIH, debido a que en general existe un intervalo de tiempo mas grande entre el evento de infección y el diagnóstico clínico, la vigilancia tradicional no siempre puede identificar y responder a los brotes en tiempo real. La vigilancia molecular retrospectiva se ha incorporado en muchos países como un componente de rutina de las estrategias de prevención del VIH debido a que puede auxiliar a identificar las cadenas de transmisión mas activas hacia las cuales deben direccionarse la campañas de prevención. Por su parte, la vigilancia molecular también es importante para el monitoreo de la dinámica y prevalencia de las mutaciones de resistencia a antirretrovirales. El test de resistencia o genotipado en base a secuenciación de Sanger, se considera el gold estándar para identificar mutaciones asociadas con la resistencia viral a los fármacos antirretrovirales. Sin embargo, aprovechando la mejor eficiencia, mayor escalabilidad, menor costo y mayor sensibilidad de la secuenciación de segunda generación, muchos laboratorios están haciendo la transición para la realización de los test de resistencia por esta tecnología. En Uruguay, el genotipado se realiza por parte del Departamento de Laboratorios de Salud Pública, en base a secuenciación de Sanger. Debido a la rutina de genotipado, existe una extensa colección de secuencias genéticas que abarca 14 años de la epidemia del VIH en nuestro país. Este banco de secuencias genéticas virales actualmente infrautilizado, representa una prometedora fuente de datos para el inicio de la vigilancia molecular del VIH en nuestro país. A su vez, el desarrollo de capacidades para la realización del genotipado en base a secuenciación de segunda generación, permitiría la evaluación de las fortalezas y desafíos que conllevaría la implementación de esta prometedora tecnología para la vigilancia de la farmacorresistencia en Uruguay.
Este proyecto tiene como objetivo fortalecer la complementariedad de experiencia y conocimiento de docentes de la UdelaR y técnicos del DLSP-MSP para actualizar la metodología de vigilancia molecular de VIH-1 en Uruguay a través de la implementación de herramientas genómicas y de análisis bioinformático.
4 horas semanales
Investigación
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Financiación:
Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
MIR D (Responsable) , SOLER, AM , FLIELLER M R , Cortinas, M.N. , ROMERO H , LIZASOAIN, A. , M.C. MOGDASY , CHIPARELLI, H. , RUCHANSKY D. , Brasesco M , CABRERA S. , Bello, Gonzalo
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Factores Genéticos involucrados en las recaídas de pacientes pediátricos con Leucemia Linfoblástica Aguda (03/2021 - 03/2023 )
El objetivo de este proyecto es identificar posibles variantes genéticas hereditarias involucradas en el riesgo de recaída en pacientes pediátricos uruguayos con LLA que se atienden en el Servicio de Hemato-Oncología Pediátrica (SHOP-CHPR) del Centro Hospitalario Pereira Rossell a cargo de la Fundación Pérez-Scremini. Estas variantes genéticas se buscarán/identificaran por medio de secuenciación de última generación del exoma en aproximadamente 40 pacientes con y sin recaídas.
10 horas semanales
Investigación
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:1
Financiación:
Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
DA LUZ J (Responsable) , SOLER, AM , Burgueño-Rodrígez G. , Rodriguez-Osorio Nelida , Castillo, LA
Palabras clave:
Leucemia Linfoblástica Aguda
Recaida
Farmacogenómica
NGS
exoma
Areas de conocimiento:
Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica /
Genética Humana /
Farmacogenética
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Caracterización fármaco-genómica de la toxicidad debida al metotrexato en niños con leucemia linfoblástica aguda mediante tecnología de secuenciación masiva (04/2019 - 12/2021 )
El objetivo de este proyecto es determinar las causas genéticas de la toxicidad ocasionada por el metotrexato en niños con Leucemia Linfoblástica Aguda, mediante la identificación de variantes de genes y polimorfismos de microRNAs vinculados al transporte y metabolismo de dicho fármaco, utilizando secuenciación de última generación.
20 horas semanales
Investigación
Coordinador o Responsable
Concluido
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
SOLER, AM (Responsable) , DA LUZ J , Rodriguez-Osorio Nelida , D´ANDREA, L.
Palabras clave:
Farmacogenómica
Leucemia Linfoblpastica Aguda
Metotrexato
Areas de conocimiento:
Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica /
Genética Humana /
Farmacogenómica
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Análisis fármaco-genómico de la respuesta a la 6-Mercaptopurina en la Leucemia Linfoblástica Aguda (03/2018 - 03/2020 )
Las variantes genéticas de enzimas involucradas en las vías de distribución y metabolización de los fármacos administrados a pacientes con LLA, juegan un rol importante en los efectos adversos y la eficacia del tratamiento. Recientemente nuestro grupo ha identificado que variantes en los genes TPMT y NUDT15 explican parte de las toxicidades hematológicas observadas en la etapa de mantenimiento en pacientes con LLA. Sin embargo, estas variantes explican aproximadamente un 30% de las toxicidades observadas. El objetivo de este proyecto es identificar cuáles son las causas genéticas de toxicidad debido a 6-mercaptopurina. Para esto analizaremos variantes no relevadas en los genes TPMT y NUDT15 y polimorfismos en otros genes vinculados al metabolismo de la 6-mercaptopurina en pacientes con LLA.
15 horas semanales
Investigación
Coordinador o Responsable
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:1
Doctorado:1
Financiación:
Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
SOLER, AM , DA LUZ J , Luis Alberto Castillo Villalba , Burgueño-Rodrígez G.
Palabras clave:
Farmacogenómica
Mercaptopurina
Leucemia Linfoblástica Aguda
Población Uruguaya
Areas de conocimiento:
Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica /
Genética Humana /
Farmacogenómica
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Prevalência e Caracterização Molecular das Talassemias Alfa em Indivíduos com Hipocromia e Microcitose de uma População Uruguaia (02/2014 - 12/2018 )
As talassemias constituem um grupo de doenças hereditárias, de distribuição mundial, causadas pela deficiência de síntese das cadeias da hemoglobina. Mecanismos genéticos variados podem ocasionar a redução ou a ausência completa de expressão dos genes , mas as deleções são as causas mais comuns da doença. A microcitose e a hipocromia, sem o concomitante aumento da Hb A2, podem ser resultantes da presença de talassemia , de anemia por eficiência de ferro ou, ocasionalmente, da anemia de doenças crônicas. As duas primeiras podem ser similares e não raramente são confundidas. Comumente, indivíduos com microcitose e hipocromia sem anemia e sem elevação da Hb A2 são detectados em exames hematológicos de rotina. O objetivo do presente projeto é avaliar a contribuição das talassemias como causa de microcitose e
hipocromia em uma população uruguaia, através da caracterização das bases
moleculares deste tipo de hemoglobinopatia nesta população. As mutações que mais comumente causam talassemia serão triadas pela técnica de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) e análise com enzimas de restrição. A técnica de MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification), será utilizada para os casos cujas mutações permanecerem não caracterizados após a realização das técnicas moleculares convencionais.
5 horas semanales
Investigación
Integrante del Equipo
En Marcha
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:2
Doctorado:2
Financiación:
CAPES, Brasil, Cooperación
Equipo:
SONATI, MF. (Responsable) , SANTOS, MN. , RIBEIRO,DM , DE OLIVEIRA, N. , DA LUZ, J. (Responsable)
Palabras clave:
Hemoglobinopatías
Talasemias
Hipocromia
Microcitosis
Areas de conocimiento:
Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica /
Genética Humana /
Hemoglobinopatias
Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica /
Genética Humana /
Hemoglobinopatias
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Rol de los Factores Genéticos en la prevalencia de anemia en niños de Salto, Uruguay (04/2015 - 04/2017 )
La anemia es una condición donde los valores de hemoglobina se encuentran disminuídos y afecta a una proporción importante de la población uruguaya y mundial. La principal causa de anemia es la deficiencia de hierro, debido a una alimentación pobre en alimentos ricos en hierro. También, alteraciones en la absorción de hierro o en su disponibilidad en la célula son causas de anemia por déficit de hierro.
El tratamiento para la anemia por déficit de hierro puede incluir dietas específicas o el suministro de hierro oral. Estos tratamientos son adecuados cuando hay un déficit de hierro en la alimentación pero no cuando el déficit es debido a causas genéticas.
Adicionalmente otras alteraciones genéticas frecuentes como las alfa talasemias producen anemia y presentan un perfil clínico similar a la anemia por déficit de hierro y por lo tanto llevar a la confusión entre las dos causas de anemia.
De forma resumida, este proyecto determinar la prevalencia de anemia en una población de aproximadamente 150 niños de 6 a 48 meses de edad del CAIF Karen y la UBA 8 (Unidad Básica Asistencial 8) y por otra parte analizar la presencia de alteraciones genéticas que puedan causar anemia en dos muestras de aproximadamente 150 niños cada una que se atiendan en el hospital de Salto y otros centros de salud del Departamento de Salto. La primera muestra será de niños de la misma edad (6 a 48 meses) con diagnóstico de anemia y con datos de perfil férrico y la otra de niños sin anemia. Este proyecto de investigación se desarrollará en la Regional Norte, Salto de la Universidad de la República, Hospital Regional de Salto, CAIF Karen, Unidad Básica Asistencial 8 y en la Facultad de Medicina de la Universidad de la República.
5 horas semanales
Investigación
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Financiación:
Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
DA LUZ, J. (Responsable) , SAVIO, E.
Palabras clave:
Anemia
Deficit de hierro
Talasemia
Areas de conocimiento:
Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica /
Genética Humana /
Anemias