Datos Generales

• Institución principal

  Universidad de la República/ Facultad de Medicina / Departamento de Bioquímica - Centro de Investigaciones Biomédicas (Ceinbio) / Uruguay

• Dirección institucional

  Institución: Universidad de la República / Facultad de Medicina / Sector Educación Superior/Público
  / Departamento de Bioquímica - Centro de Investigaciones Biomédicas (Ceinbio)
  Dirección: Avda Gral Flores 2125 / 11800
  País: Uruguay / Montevideo / Montevideo
  Teléfono: 29243414
  Correo electrónico/Sitio Web: azeida@fmed.edu.uy https://www.ceinbio.edu.uy/
  

Formación

• Formación académica

  • Concluida

    • Doctorado

      • Ciencias Químicas (2011 - 2015)

        Universidad de Buenos Aires , Argentina
        Título de la disertación/tesis/defensa: Estructura y mecanismo de acción de peroxirredoxinas: estudio teórico y experimental
        Obtención del título: 2015
        Sitio web de la disertación/tesis/defensa: http://digital.bl.fcen.uba.ar/gsdl-282/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=tesis&d=Tesis_5877_ZeidaCamacho
        Financiación:
        Consejo de Investigaciones Cientificas y Tecnicas , Argentina
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /

    • Grado

      • Licenciatura en Bioquímica (2006 - 2011)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa:
        Obtención del título: 2011
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Otras Ciencias Naturales / Otras Ciencias Naturales /
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /

      • Profesorado de Matemática (2000 - 2004)

        Administración Nacional de Educación Pública - Centro Regional de Profesores , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa:
        Obtención del título: 2004
        Palabras Clave: Matemática
        Areas de conocimiento:
        Humanidades / Otras Humanidades / Otras Humanidades /

• Formación complementaria

  • Concluida

    • Posdoctorados

      • Mecanismo catalítico de las metionina sulfóxidoreductasas de Mycobacterium tuberculosis y su interacción con oxidantes celulares (2017 - 2019)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina / Departamento de Bioquímica y CEINBIO , Uruguay
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /

      • Caracterización funcional, estructural y dinámica de la peroxidasa Peroxirredoxina Q de Mycobacterium tuberculosis (2016 - 2017)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universidad de Buenos Aires , Argentina
        Financiación:
        CONICET , Argentina
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Cursos de corta duración

      • Laboratorio de comunicación científica (05/2019 - 05/2019)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Institución Extranjera / Centro de Formación de la Cooperación Española , Uruguay
        16 horas
        Palabras Clave: Comunicación científica Divulgación
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Sociales / Comunicación y Medios / Comunicación y Medios / Comunicación científica

      • IUBMB/IUPAB Advanced School and Workshop "Protein-Protein and Protein-Membrane Interaction: Experimental and Theoretical Approaches" (10/2018 - 10/2018)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Biología. Universidad de La Habana , Cuba
        45 horas
        Palabras Clave: Protein-Protein Interaction; Protein Biophysics
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /

      • Modern Approaches in Drug Discovery for Neglected Infectious Diseases (01/2014 - 01/2014)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
        40 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biología Estructural

      • Herramientas teóricas y experimentales para el estudio de la interacción entre biomoléculas (01/2013 - 01/2013)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Farmacia y Bioquímica , Argentina
        90 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /

      • Coarse Grain Methods for Biomolecular Simulations (01/2011 - 01/2011)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /

      • Redox Chemistry and Biology of Thiols (01/2011 - 01/2011)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
        90 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Theoretical / Practical Course on Molecular Simulations and Design (01/2010 - 01/2010)

        Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
        90 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /

Idiomas

• Inglés

  Entiende muy bien / Habla bien / Lee muy bien / Escribe muy bien

Areas de actuación

• Ciencias Naturales y Exactas

  Otras Ciencias Naturales /Otras Ciencias Naturales /Bioquímica

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Biofísica

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Químicas /Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica

Actuación profesional

• Sector Extranjero/Internacional/Redes Internacionales - Redes Internacionales - Uruguay

  Centro de Biología Estructural del MERCOSUR

  • Vínculos con la Institución

    • Colaborador (06/2021 - a la fecha)

      Miembro Comité Ejecutivo

  • Actividades

    • Docencia

      • Pedeciba Biotecnología (04/2025 - 05/2025 )

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        STRUCTURAL BIOLOGY 2.0: Computational Tools and X-ray Diffraction Integration to Solve and Understand 3D Protein Structures, 90 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Otras Ciencias Naturales / Otras Ciencias Naturales / Bioquímica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Medicina / Departamento de Bioquímica - Centro de Investigaciones Biomédicas (Ceinbio)

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (11/2019 - a la fecha)Trabajo relevante

      Profesor Adjunto Contratado 48 horas semanales / Dedicación total
      En este momento tengo un contrato equiparado con G3 DT. Mi dedicación total está aprobada tanto por Facultad de Medicina como por Comisión de DT Central de la Udelar desde enero del 2023, pero no se ha hecho efectiva por problemas presupuestales.
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 3
      Cargo: Efectivo

  • Actividades

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Caracterización funcional y estructural de la lactonasa clave para la biosíntesis de urolitinas a nivel de la microbiota intestinal (03/2025 - a la fecha)

        proyecto: Las urolitinas son un grupo de compuestos polifenólicos que se generan en el tracto gastrointestinal gracias a la acción metabólica de las bacterias presentes en la microbiota intestinal, a punto de partida de la ingesta de alimentos ricos en ácido elágico y sus derivados. Estos compuestos han demostrado un rol positivo en los procesos de mitofagia, recambio mitocondrial y mejora de la bioenergética celular a nivel del músculo esquelético. Además, presentan un gran potencial en la prevención y tratamiento de enfermedades crónicas, como enfermedades cardiovasculares, cáncer y la enfermedad inflamatoria intestinal. El conocimiento de las bases moleculares de la metabolización del ácido elágico a nivel intestinal es crucial para poder comprender mejor los procesos implicados en la síntesis de urolitinas y desarrollar estrategias más efectivas para aumentar su disponibilidad en el organismo. Se sabe que la metabolización del ácido elágico a urolitinas implica una serie de reacciones bioquímicas que involucran diferentes enzimas presentes en distintas bacterias de la microbiota intestinal. Se ha propuesto que el primer paso, clave para éxito de la síntesis, sería catalizado por una lactonasa de la bacteria Gordonibacter urolithinfaciens, aunque esto no ha sido confirmado in vitro o in vivo. En este proyecto buscaremos caracterizar in vitro e in silico el comportamiento de esta lactonasa, sus propiedades enzimáticas, el producto que efectivamente genera, y las bases moleculares que determinan la especificidad por su sustrato, el ácido elágico. Para conseguir estos objetivos, se integrarán técnicas biofísicas y bioquímicas experimentales con técnicas de simulación computacional, de forma de dar un sustento estructural a las propiedades observadas en la mesada. Esperamos que el conocimiento generado en este proyecto pueda tener un impacto significativo en el entendimiento de la síntesis de urolitinas y sea el puntapié para el desarrollo de estrategias sencillas y económicas para su producción.
        12 horas semanales
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: A. ZEIDA (Responsable) , CHAVARRÍA, C. , RADI, R , AICARDO, A. , S Sastre , Mansilla, S. , A. Taboada , Sebastián F. Villar , Araújo, V. , S. Klinke
        Palabras clave: lactonasa urolitinas microbiota biología estructural
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Funciones biológicas de conformaciones alternativas de citocromo c (03/2025 - a la fecha)

        Código: FCE_1_2023_1_176133 El citocromo c es una proteína ubicada normalmente dentro de la mitocondria y participa en el proceso de respiración celular. Bajo ciertas condiciones, el citocromo c ejecuta otras funciones a nivel extra-mitocondrial, incluyendo la señalización de apoptosis. En la última década, hemos avanzado el concepto que a nivel celular y bajo la acción de interacciones físico-químicas, modificaciones oxidativas postraduccionales, o mutaciones se disparan en una fracción de citocromo c nativo cambios conformacionales a punto de partida de flexibilidad estructural pre-existente. Estas conformaciones alternativas del citocromo c difieren significativamente de la conformación nativa, tanto desde el punto de vista estructural, modificando el estado de coordinación del hemo, como cambiando posibles interacciones con otros blancos celulares y eventualmente participando en nuevas funciones no-canónicas. En particular, las conformaciones alternativas ganan actividad peroxidática y son traslocadas al núcleo celular sin promover apoptosis, por lo que es posible un rol como sensor y/o mediador redox intracelular. Recientemente, hemos reconstruido una herramienta fundamental para estudiar presencia y roles biológicos de conformaciones alternativas de citocromo c, el anticuerpo monoclonal R1D3. El objetivo general del proyecto es avanzar hacia la caracterización estructural, detección e identificación de nuevas funciones de conformaciones alternativas de citocromo c en sistemas in vitro, in cellula e in vivo de relevancia biomédica. La estrategia experimental comprende varias actividades que evalúan propiedades de proteoformas de citocromo c de conformaciones alternativas combinando 1) estudios estructurales in vitro por técnicas espectroscópicas de alta resolución, 2) análisis de respuestas transcriptómicas y proteómicas in cellula y 3) su detección y posible rol biológico en modelos de progresión tumoral in vivo. Los resultados obtenidos con las diferentes aproximaciones estudiadas serán integrados y aportarán información crítica acerca de la generación, detección, resolución estructural y rol biológico de conformaciones alternativas de citocromo c de relevancia en fisiología y patología humanas.
        3 horas semanales
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Doctorado:1
        Equipo: A. ZEIDA , RADI, R (Responsable) , PIACENZA, L (Responsable) , TOMASINA, FLORENCIA , LUCIANA HANNIBAL , M. Pose , SEBASTIÁN CARBALLAL , TÓRTORA, V. , DEMICHELI, V , JENNYFER MARTÍNEZ , CHIRIBAO, M.L

      • Reducción de hidroperóxidos de ácidos grasos por peroxirredoxina 3 humana: estudios en enzima recombinante aislada y en un modelo celular. (03/2021 - 02/2024 )

        Las peroxirredoxinas (Prxs), una familia de peroxidasas dependiente de tioles, juegan roles importantes en el sensado y transducción de señales derivadas de hidroperóxidos. La Prx3, exclusivamente mitocondrial, está involucrada en procesos fisiológicos y patológicos, incluyendo participación en la homeostasis de glucosa y desarrollo de cáncer. La enzima reduce la mayor parte del peróxido de hidrógeno producido en mitocondria. Si bien se han relacionado disminuciones en la expresión de Prx3 con la oxidación de cardiolipina, fosfolípido abundante y de relevancia fisiopatológica presente en la membrana mitocondrial interna, se desconoce si la enzima es capaz de reducir hidroperóxidos de ácidos grasos (AG-OOH). En este proyecto nos planteamos investigar la actividad de la Prx3 en la reducción de AG-OOH, libres o formando parte de fosfolípidos. Para ello realizaremos experimentos con la enzima recombinante humana, así como en células endoteliales, células sensibles a AG-OOH. En primera instancia haremos una caracterización de la cinética de las reacciones de oxidación y sobreoxidación del tiol peroxidático de Prx3 recombinante por AG-OOH libres o integrando fosfolípidos, mediante cinética de estado estacionario o de ciclo único por espectrometría de flujo detenido. También investigaremos la reactividad de la Prx3 unida a proteína fluorescente verde sensible a cambios redox (Prx3-rsGFP2), sonda fluorescente recientemente desarrollada por integrantes de nuestra propuesta, con estos hidroperóxidos lipídicos en comparación con otros hidroperóxidos, para validar su uso como sonda de dichos compuestos en tiempo real en células. Estudiaremos la afinidad de la Prx3 por AG-OOH por una combinación de técnicas de biofísica de proteínas y modelado molecular. Evaluaremos el efecto de la unión de la porción no reactiva de estos sustratos (AG) a la enzima sobre la reactividad con el grupo peroxilo. Por último, expondremos células endoteliales a dosis subletales de AG-OOH que se conoce ingresan a dichas células y se integran a sus fosfolípidos de membrana, así como a lipoproteínas de baja densidad (LDL) oxidadas. Investigaremos si dicha exposición conduce a la oxidación y sobreoxidación de Prx3 endógena, de Prx3-rsGFP2 y evaluaremos paralelamente las consecuencias en el potencial de membrana y funcionalidad mitocondrial, así como en la liberación de citocromo c hacia el citosol. Consideramos que nuestros resultados permitirán una mejor comprensión del rol de la Prx3 en el sensado de AG-OOH a nivel celular. Asimismo, teniendo en cuenta el rol reportado para la enzima en procesos patológicos, nuestros resultados podrían facilitar futuros desarrollos terapéuticos.
        5 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: A. ZEIDA , TRUJILLO, M. , ANÍBAL M. REYES , MANTA B , RADI, R , Hugo, M , Antonio Martinez Ruiz

      • Metagenómica aplicada al descubrimiento de nuevas enzimas redox (03/2022 - 02/2024 )

        Durante décadas el paradigma central de la biología redox fue que ciertos aminoácidos reactivos como son blanco de oxidantes y que los seres vivos poseen enzimas antioxidantes para reparar o proteger a las biomoléculas de ese ?daño oxidativo?. Sin embargo, hoy sabemos que varias enzimas ?antioxidantes? son en realidad traductores de señales que median entre oxidantes fisiológicos y moléculas efectoras, principalmente factores de transcripción. La mayoría de estas enzimas dependen de la química redox de la cisteína, la cual se oxida reversiblemente en el proceso de transferencia de información. A diferencia de lo que sucede con la cisteína, la oxidación reversible de metionina a sulfóxido de metionina (MetSO) ha recibido menos atención y su rol en biología está menos explorado. Varios organismos poseen metionina sulfóxido reductasas (MSR) que reparan el MetSO, lo que sugiere que ésta oxidación es biológicamente relevante. Recientemente se descubrió una familia de enzimas (MICALs) con capacidad de oxidar metionina (actividad ?oxidasa de metionina?, MOX) y su descubrimiento auguraba una revolución en biología redox, ya que la existencia MOX y MSR sugería la existencia de ciclos de regulación centrados en la oxidación reversible de metionina, análogo al formado por quinasas y fosfatasas. Sin embargo, esta revolución no sucedió, en parte porque muy pocas MOX han sido descubiertas, y restringido a unos pocos organismos, y en parte porque las MSR no son tan ubicuas como originalmente considerábamos. Este proyecto se basa en la hipótesis de que existen nuevas MSR y MOX por descubrir, fundamentalmente en procariotas. Para descubrir estas enzimas proponemos combinar genómica comparativa, metagenomica funcional, ingeniería de genomas y bioquímica de proteínas para revelar, mediante selecciones genéticas y ?screening?, nuevas MRS y MOX. Esperamos que los resultados obtenidos en este proyecto permitan posicionar oxidación reversibles de metioninas como un eje central de la biología redox.
        2 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: MANTA B , IRAOLA G. , A. ZEIDA , COMINI MA , Andrés Binolfi

      • SARS-CoV-2 spike glycoprotein receptor binding domain (RBD) redox susceptibility (04/2021 - 04/2022 )

        The project goal is to evaluate the spike glycoprotein RBD structural redox susceptibility at its four disulfide bonds in connection to binding properties to ACE2 and viral infectivity for SARS-CoV-2 major lineages (B, B.1, B.1.1.7, B.1.351, and P.1). With these studies we aim to a) establish a new research line in our laboratory connecting redox biology with viral infection processes, b) increase our understanding at the molecular level of the mechanisms of SARS-CoV-2 entry to human cells, c) assess structural changes in the spike protein RBD mediated by novel thiol-based compounds as a redox-based therapeutic strategy, d) foster a strong scientific collaboration with a leading US-based research group (Scripps Research, Florida).
        10 horas semanales
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Richard Lounsbery Foundation, Estados Unidos, Apoyo financiero
        Equipo: RADI, R , A. ZEIDA , M. MACHADO , CORREA, A , K. Carroll , MORATORIO, G.

      • Bases moleculares y celulares de la regulación del metabolismo oxidativo mediada por la aconitasa mitocondrial (ACO2). (03/2020 - 02/2022 )

        La aconitasa mitocondrial (ACO2) es una enzima monomérica esencial del ciclo de los ácidos tricarboxílicos que cataliza la isomerización reversible del citrato a isocitrato. Si bien no es considerada una enzima reguladora del ciclo, su inhibición impacta en el flujo de metabolitos del ciclo, en la relación citrato/isocitrato, síntesis de ATP y formación de especies reactivas del oxígeno mitocondrial como ha mostrado nuestro y otros grupos. Contiene en su sitio activo un particular centro ferrosulfurado [4Fe?4S]2+ que no participa en reacciones redox y es altamente sensible a oxidantes biológicos. Cuando se oxida el centro FeS resulta en una enzima inactiva. Se han detectado modificaciones post-traduccionales (PTM) en aminoácidos de la proteína algunas oxidativas y otras relacionadas a cambios en metabolitos o señales celulares. La significancia estructural y funcional de estas modificaciones no ha sido totalmente dilucidada. Se ha postulado que la ACO2 interacciona con otras proteínas mitocondriales como la frataxina e incluso forma parte de los nucleoides al interaccionar con el ADNmt. Estas funciones han sido cuestionadas o poco estudiadas para ACO2 de mamífero. En este proyecto utilizado la ACO2 recombinante humana (hACO2), clonada y purificada por nosotros, buscamos dilucidar a nivel molecular cuáles son los cambios estructurales determinantes de las funciones de la ACO y cómo las PTM impactan en la estructura y función de la ACO2. Para ello se realizará una caracterización bioquímica/biofísica de la proteína in vitro, que será acompañada por simulaciones de dinámica molecular de la misma. Se realizarán estudios para dilucidar si hay interacción entre la hACO2 y la frataxina así como entre la ACO2 y el ADNmt. También planteamos identificar las PTM de la ACO2 en fibroblastos humanos senescentes, modelo que presenta aumento de la producción de ROS mitocondriales y dónde encontramos la ACO2 inhibida. Proponemos también modificar los niveles de expresión de la ACO2 en cultivos celulares para caracterizar los cambios metabólicos acontecidos. Los modelos celulares permitirán determinar además los distintos niveles de regulación que puede ejercer la ACO2, es decir cambios en la actividad por modificación del centro FeS, por PTM en los aminoácidos o en la expresión de la proteína.
        2 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        RRHH formados en el proyecto:
        Doctorado:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: CASTRO, L. ; Castro, L.A. , TÓRTORA, V. , Mansilla, S. , A. ZEIDA , INÉS MARMISOLLE , Javier Adrian DUTRA MOYA
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Susceptibilidad estructural al ambiente redox del dominio de unión al receptor (RBD) de la glicoproteína espicular de SARS-CoV-2 (07/2020 - 05/2021 )

        Proyecto premiado por la Fundación Manuel Pérez, FMed, Udelar, en el marco del llamado "Fondos Especiales (COVID-19)" El objetivo del proyecto fue evaluar la susceptibilidad estructural del dominio RBD de la glicoproteína espicular de SARS-CoV-2 al ambiente redox y su posible efecto en la interacción con ACE2. Para ello se propuso una combinación de técnicas experimentales y simulaciones computacionales que permitieran una caracterización de la importancia del estado redox de los cuatro disulfuros que presenta el RBD.
        5 horas semanales
        Investigación
        Integrante del Equipo
        Concluido
        Financiación:
        Facultad de Medicina, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: RADI, R , M. MACHADO , A. ZEIDA , TRUJILLO, M. , CORREA, A , PORTELA, M.
        Palabras clave: SARS-CoV-2 prote?na Spike disulfuros

    • Docencia

      • Destrezas Experimentales Básicas en Bioquímica (07/2021 - a la fecha)

        Grado
        Invitado
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Otras Ciencias Naturales / Otras Ciencias Naturales / Bioquímica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

      • Maestría en Ciencias de los Alimentos y Salud Humana (07/2025 - 10/2025 )

        Maestría
        Responsable
        Asignaturas:
        Bases fisicoquímicas de los alimentos, 60 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Otras Ciencias Médicas / Otras Ciencias Médicas / Nutrición
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

      • Curso de Posgrado PEDECIBA-PROINBIO (08/2024 - 08/2024 )

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Biología Estructural en Ciencias Médicas, 60 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biología Estructural
        Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas /

      • Doctor en Ciencias Biológicas (PEDECIBA) (05/2023 - 05/2023 )

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Radicales libres y procesos redox en biomedicina, 80 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Redox

    • Extensión

      • Comisión de Divulgación Científica (03/2023 - a la fecha )

        2 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Otras Ciencias Naturales / NO CORRESPONDE / Comunicación Científica

    • Otra actividad técnico-científica relevante

      • Co-organizador del Simposio Internacional "II Conesul Symposium on Biomolecular Simulation" (https://www.conesul2024.lat/) (08/2024 - 08/2024 )

        48 horas semanales

    • Gestión Académica

      • Integrante Comisión Académica "Maestría en Ciencias de los Alimentos y Salud Humana" (12/2023 - a la fecha )

        Facultad de Medicina, Programa de Alimentos y Salud (PAyS)
        Gestión de la Enseñanza 4 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Otras Ciencias Naturales / Otras Ciencias Naturales / Bioquímica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

      • Comisión Multiservicio para la creación de una Licenciatura en Bioinformática (Udelar) (03/2023 - a la fecha )

        Gestión de la Enseñanza 1 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Bioinformática

• Sector Educación Superior/Público - Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas - Uruguay

  Área Química (PEDECIBA)

  • Vínculos con la Institución

    • Otro (10/2018 - a la fecha)

      Investigador Gdo 3 2 horas semanales

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Argentina

  Facultad de Ciencias Exactas y Naturales Universidad de Buenos Aires

  • Vínculos con la Institución

    • Profesor visitante (08/2025 - 08/2025)

      20 horas semanales

    • Profesor visitante (08/2024 - 08/2024)

      20 horas semanales

    • Profesor visitante (08/2021 - 08/2021)

      15 horas semanales

    • Funcionario/Empleado (03/2012 - 02/2018)Trabajo relevante

      Ayudante de Primera 12 horas semanales

  • Actividades

    • Docencia

      • Doctorado en Ciencias Químicas (08/2024 - 08/2024 )

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Escuela de Modelado de Biomoléculas, 60 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Bioinformática Estructural

      • Licenciatura en Ciencias Químicas (03/2012 - 02/2018 )

        Grado
        Asistente
        Asignaturas:
        Química General e Inorgánica, 12 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

      • Doctorado en Ciencias Químicas (06/2016 - 07/2016 )

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Simulación computacional avanzada en Química, Bioquímica y Ciencias de Materiales, 40 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

      • Doctorado en Ciencias Químicas (06/2013 - 07/2013 )

        Doctorado
        Asistente
        Asignaturas:
        Simulación computacional avanzada en Química, Bioquímica y Ciencias de Materiales, 40 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

    • Extensión

      • (07/2016 - 07/2016 )

        FCEN - UBA
        10 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

      • (07/2015 - 07/2015 )

        FCEN - UBA
        10 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

      • (07/2014 - 07/2014 )

        FCEN - UBA
        10 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

      • (04/2014 - 05/2014 )

        FCEN - UBA
        5 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

      • (04/2013 - 06/2013 )

        FCEN - UBA
        5 horas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

    • Gestión Académica

      • Organizador: Primer Workshop Latinoamericano de Modelado Molecular y Simulación Computacional (06/2016 - 07/2016 )

        FCEN - UBA
        Gestión de la Enseñanza
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Argentina

  Universidad de Buenos Aires / Facultad de Ciencias Exactas y Naturales

  • Vínculos con la Institución

    • Profesor visitante (08/2024 - 08/2024)

      8 horas semanales

    • Profesor visitante (07/2019 - 08/2019)

      Profesor del curso de posgrado: "Escuela de modelado de biomoleculas" 25 horas semanales

    • Profesor visitante (07/2018 - 08/2018)

      Profesor del curso de posgrado: "Escuela de modelado de biomoleculas" 25 horas semanales

  • Actividades

    • Docencia

      • Doctorado en Química (07/2019 - 08/2019 )

        Doctorado
        Responsable
        Asignaturas:
        Escuela de modelado de biomoleculas, 80 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas /

      • Doctorado en Química (07/2018 - 08/2018 )

        Doctorado
        Responsable
        Asignaturas:
        Escuela de modelado de biomoleculas, 80 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas /

• Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas - Sociedades Científico-Tecnológicas - Uruguay

  Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular

  • Vínculos con la Institución

    • Otro (11/2019 - 11/2021)

      Miembro Comisión Fiscal 2 horas semanales

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Medicina / Departamento de Bioquímica - Centro de Investigaciones Biomédicas (Ceinbio)

  • Vínculos con la Institución

    • Becario (10/2017 - 10/2019)

      Becario Posdoctoral 40 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 3
      Cargo: Interino

  • Actividades

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Estructura, dinámica y función de la enzima metionina sulfóxido reductasa B de Mycobacterium tuberculosis (04/2018 - 10/2019 )

        Mycobacterium tuberculosis (Mt) es un patógeno altamente exitoso, capaz de vivir y proliferar en el fagosoma de macrófagos activados, donde es expuesto a especies oxidantes como superóxido, óxido nítrico y distintos peróxidos. Estas especies son capaces de modificar distintas biomoléculas. Es así que el estudio de los sistemas antioxidantes del patógeno resulta de suma importancia para caracterizar los actores y mecanismos moleculares que determinan su extraordinaria capacidad infectiva. En este contexto, la sulfoxidación de residuos de metionina, es una modificación oxidativa reversible implicada en la regulación de la funcionalidad proteica. Mt expresa dos metionina sulfóxidoreductasas, MtMsrA y MtMsrB, que reducen los epímeros S y R del sulfóxido de metionina, respectivamente. Para ambas enzimas, el primer paso en la catálisis consiste en la interacción de la metionina-sulfóxido con la cisteína nucleofílica del sitio activo, que resulta oxidada a ácido sulfénico y la liberación de metionina reducida. Los siguientes pasos, que varían según la Msr específica, se encargan de la reducción de la forma oxidada de la enzima a la forma nativa y pueden estar acompañados de grandes cambios conformacionales. La ausencia de estos sistemas antioxidantes implica un aumento de la citotoxicidad causada por especies oxidantes, lo que las convierte en potenciales blancos terapéuticos. Este plan tiene como objetivo central caracterizar integralmente la relación estructura/dinámica-función de la MtMsrB. Esta caracterización se realizará mediante un enfoque multi-disciplinario tanto desde el punto vista de las técnicas experimentales a utilizar como desde las estrategias teóricas a desarrollarse. Primeramente, se caracterizará la enzima desde el punto de vista biofísico, con el fin de conocer aspectos microscópicos de la enzima en solución en presencia y ausencia de sustratos. Asimismo, se pretende obtener la estructura cristalográfica de la MtMsrB, que no ha sido reportada hasta el momento. También se caracterizará el sistema desde el punto de vista cinético, y la dependencia de los parámetros catalíticos con el pH y la temperatura. Por último, se utilizarán métodos teóricos de modelado, para determinar las bases moleculares del proceso catalítico. Cabe destacar que aunque el plan de trabajo se realizará en el CEINBIO, FMed-UdelaR, donde se cuenta con amplia experiencia en sistemas antioxidantes de Mt, el mismo significará la interacción activa con grupos de trabajo en el Institut Pasteur de Montevideo y las Facultades de Farmacia y Bioquímica y de Ciencias Exactas de la Universidad de Buenos Aires.
        20 horas semanales
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        Concluido
        Financiación:
        Dirección de Innovación, Ciencia y Tecnología, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: A. ZEIDA , TRUJILLO, M. , RADI, R
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas /

    • Docencia

      • curso Posgrado PEDECIBA (02/2019 - 03/2019 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Biología y Química Redox de Tioles, 60 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Argentina

  CONICET

  • Vínculos con la Institución

    • Becario (03/2016 - 10/2017)

      Becario Posdoctoral 40 horas semanales / Dedicación total

    • Becario (05/2011 - 02/2016)Trabajo relevante

      Becario Doctoral 40 horas semanales / Dedicación total

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Caracterización funcional, estructural y dinámica de la peroxidasa Peroxirredoxina Q de Mycobacterium tuberculosis (03/2016 - a la fecha )

        
        Fundamental
        40 horas semanales
        IQUIFIB, FFyB - UBA , Integrante del equipo
        Equipo:

      • Estructura y mecanismo de acción de peroxirredoxinas: estudio teórico y experimental (05/2011 - 02/2016 )

        
        Fundamental
        40 horas semanales
        INQUIMAE, FCEN - UBA , Integrante del equipo
        Equipo:

• Sector Extranjero/Internacional/Otros - Paraguay

  Facultad Politécnica, Universidad Nacional de Asunción

  • Vínculos con la Institución

    • Profesor visitante (09/2013 - 09/2013)

      20 horas semanales

  • Actividades

    • Docencia

      • Didáctica Universitaria (09/2013 - 09/2013 )

        Doctorado
        Invitado
        Asignaturas:
        Intoducción a la Simulación Computacional de Bioomoléculas, 20 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Ciencias

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (07/2008 - 12/2008)

      20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Interino

Carga horaria

• Carga horaria de docencia: 15 horas
  
• Carga horaria de investigación: 10 horas
  
• Carga horaria de formación RRHH: 20 horas
  
• Carga horaria de extensión: 5 horas
  
• Carga horaria de gestión: 10 horas
  

Producción científica/tecnológica

• En el estudio de las ciencias de la vida, particularmente la bioquímica y la medicina, la aplicación de las herramientas de la fisicoquímica y la biología estructural, resulta en la combinación de conceptos de la física, la química y la biología en un intrincado y complejo mosaico que conduce a una comprensión única de los procesos microscópicos responsables de la vida.
  Entre la gran variedad de clases de biomoléculas presentes en los seres vivos, las proteínas juegan un rol principal. Siendo las biomoléculas más versátiles y diversas; las proteínas están en el centro de la acción en los procesos biológicos. Es así que el estudio de las proteínas con las herramientas y fundamentalmente con la visión de la fisicoquímica y la biología estructural, ha constituido un gran aporte en el avance de la descripción de estos sistemas biomoleculares.
  En este contexto, las preguntas que intentamos abarcar están directamente vinculadas al comportamiento de proteínas en sistemas
  biológicos, incluyendo una perspectiva fisicoquímica y estructural, que permita entender estos fenómenos desde un punto de
  vista microscópico. Muchos eventos celulares dependen del funcionamiento de proteínas y por lo tanto, las líneas de investigación contenidas en este espacio multidisciplinario son muy variadas. En particular, nuestro interés está focalizado en la descripción de las bases moleculares que determinan la capacidad catalítica de enzimas relacionadas con la homeostásis redox de la célula, y cuáles son los mecanismos que subyacen estos procesos, integrando siempre información proveniente de estudios experimentales con aquella obtenida por aproximaciones de la bioinformática estructural.

Producción bibliográfica

• Artículos publicados

  • Arbitrados

    • Tyrosine nitration modulates superfolder green fluorescent protein (Completo, 2026)

      CECILIA CHAVARRÍA , MAURICIO MASTROGIOVANNI , ARI ZEIDA , JOSÉ M. SOUZA
      Redox Biochemistry and Chemistry, v.: 17 p.:100087 2026
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 27731766
      DOI: 10.1016/j.rbc.2026.100087
      https://doi.org/10.1016/j.rbc.2026.100087
      
      

    • Dynamics of flexible intracellular regions modulate communication and fine-tune pH gating in plant aquaporins (Completo, 2026)

      AGUSTINA CANESSA FORTUNA , GERARDO ZERBETTO DE PALMA , ROCÍO BUSSOLINI LIZUNDIA , LORENA SIGAUT , LÍA ISABEL PIETRASANTA , VICTORIA VITALI , ARI ZEIDA , KARINA ALLEVA
      Biochemical Journal, v.: 483 p.:1669 - 1687, 2026
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United kingdom
      ISSN: 02646021
      E-ISSN: 14708728
      DOI: 10.1042/bcj20260366
      https://doi.org/10.1042/bcj20260366
      
      

    • Monoclonal antibodies against nitrated nerve growth factor reveal an oxidation-dependent pathogenic hallmark in ALS (Completo, 2026)

      VALENTINA VARELA , SANTIAGO GARCIMARTÍN , EMILIANO TRIAS , ARI ZEIDA , MONIQUE RICHTER , ANDRÉS DE LEÓN , ERNESTO MIQUEL , PETER H. KING , BRIGITTE VULLIEZ-LE NORMAND , MARIANO MARTINEZ , PEDRO M. ALZARI , SILVINA BARTESAGHI , RAFAEL RADI , LUIS BARBEITO
      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v.: 123 2026
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00278424
      E-ISSN: 10916490
      DOI: 10.1073/pnas.2536562123
      https://doi.org/10.1073/pnas.2536562123
      
      

    • Unraveling the dual immunomodulatory and immunogenic roles of the central conserved cysteine-rich region in respiratory syncytial virus G protein (Completo, 2026)

      JUAN GUTMAN , ANA LUZ PALETTA , FEDERICO BIRNBERG-WEISS , CECILIA ARAHI PRATO , ANALÍA BOUDGOUSTE , CARLA JIMENA GOLDIN , SANTIAGO SASTRE , ALANA BROOKE BYRNE , PABLO PAKCIARZ , FERNANDO PEDRO POLACK , JULIA DVORKIN , ARI ZEIDA , MAURICIO TOMAS CABALLERO , VERÓNICA INÉS LANDONI , GABRIELA CRISTINA FERNÁNDEZ , MARÍA VIRGINIA TRIBULATTI , DAMIAN ALVAREZ-PAGGI , SEBASTIÁN ANDRÉS ESPERANTE
      Frontiers in Microbiology, v.: 17 2026
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Switzerland
      E-ISSN: 1664302X
      DOI: 10.3389/fmicb.2026.1794062
      https://doi.org/10.3389/fmicb.2026.1794062
      
      

    • Nitration-driven structural changes in Hsp90 linked to gain of pathological functions (Completo, 2025)

      TILOTTAMA CHATTERJEE , ALFONSO TABOADA , ISABELLE E. LOGAN , PATIENCE N. PAUL , MIRANDA HUERTA , PATRICK REARDON , RAFAEL RADI , ARI ZEIDA , MARIA CLARA FRANCO
      Biochemical Journal, v.: 482 p.:1209 - 1228, 2025
      Palabras clave: Heat shock proteins Tyrosine nitration Structure-function relationship
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United kingdom
      ISSN: 02646021
      E-ISSN: 14708728
      DOI: 10.1042/bcj20253230
      https://doi.org/10.1042/bcj20253230
      
      

    • Hydrogen peroxide transport by aquaporins: insights from molecular modeling and simulations (Completo, 2025)

      JONATHAN CHEVRIAU , GERARDO ZERBETTO DE PALMA , KARINA ALLEVA , ARI ZEIDA
      Biophysical Reviews, 2025
      Lugar de publicación: Germany
      Escrito por invitación
      ISSN: 18672450
      E-ISSN: 18672469
      DOI: 10.1007/s12551-025-01288-9
      https://doi.org/10.1007/s12551-025-01288-9
      
      

    • Human glutathione transferases catalyze the reaction between glutathione and nitrooleic acid (Completo, 2025)

      MARTINA STEGLICH , NICOLE LARRIEUX , ARI ZEIDA , JOAQUÍN DALLA RIZZA , SONIA R. SALVATORE , MARIANA BONILLA , MATÍAS N. MÖLLER , ALEJANDRO BUSCHIAZZO , BEATRIZ ALVAREZ , FRANCISCO J. SCHOPFER , LUCÍA TURELL
      Journal of Biological Chemistry, p.:108362 2025
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00219258
      E-ISSN: 1083351X
      DOI: 10.1016/j.jbc.2025.108362
      https://doi.org/10.1016/j.jbc.2025.108362
      
      

    • A Noncatalytic Cysteine Residue Modulates Cobalamin Reactivity in the Human B₁₂ Processing Enzyme CblC (Completo, 2025)

      ANNA J. ESSER , SANTIAGO SASTRE , THIEN-LY JULIA DINH , VIOLA TANNER , VICTORIA WINGERT , KATHARINA KLOTZ , DONALD W. JACOBSEN , UTE SPIEKERKOETTER , OLIVER SCHILLING , ARI ZEIDA , RAFAEL RADI , LUCIANA HANNIBAL
      Biochemistry, v.: 64 p.:692 - 709, 2025
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00062960
      E-ISSN: 15204995
      DOI: 10.1021/acs.biochem.4c00613
      https://doi.org/10.1021/acs.biochem.4c00613
      
      

    • Mg2+ binding to coenzyme A (Completo, 2025)

      JONATHAN A. SEMELAK , MARIANA GALLO , F. LUIS GONZÁLEZ FLECHA , SOLANA DI PINO , THELMA A. PERTINHEZ , ARI ZEIDA , IVAN GOUT , DARIO A. ESTRIN , TRUJILLO, M.
      Archives of Biochemistry and Biophysics, v.: 763 p.:110202 2025
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00039861
      E-ISSN: 10960384
      DOI: 10.1016/j.abb.2024.110202
      https://doi.org/10.1016/j.abb.2024.110202
      
      

    • Reaction of peroxynitrite with thiols, hydrogen sulfide and persulfides (Completo, 2024)

      MADIA TRUJILLO , ERNESTO CUEVASANTA , LUCÍA TURELL , DAYANA BENCHOAM , GERARDO FERRER-SUETA , ARI ZEIDA , CELIA QUIJANO , SEBASTIÁN CARBALLAL , RAFAEL RADI , BEATRIZ ALVAREZ
      Redox Biochemistry and Chemistry, p.:100039 2024
      Escrito por invitación
      ISSN: 27731766
      DOI: 10.1016/j.rbc.2024.100039
      http://dx.doi.org/10.1016/j.rbc.2024.100039
      
      

    • Catalytic Mechanism of Mycobacterium tuberculosis Methionine Sulfoxide Reductase A (Completo, 2024)Trabajo relevante

      SANTIAGO SASTRE , BRUNO MANTA , JONATHAN A. SEMELAK , DARIO ESTRIN , MADIA TRUJILLO , RAFAEL RADI , ARI ZEIDA
      Biochemistry, 2024
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00062960
      E-ISSN: 15204995
      DOI: 10.1021/acs.biochem.3c00504
      http://dx.doi.org/10.1021/acs.biochem.3c00504
      ACS Editor's Choice awarded
      
      

    • Revisiting the role of 3-nitrotyrosine residues in the formation of alpha-synuclein oligomers and fibrils (Completo, 2024)

      CECILIA CHAVARRÍA , RODRIGO IVAGNES , ARI ZEIDA , MARÍA DOLORES PIÑEYRO , JOSÉ M. SOUZA
      Archives of Biochemistry and Biophysics, v.: 752 p.:109858 2024
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00039861
      E-ISSN: 10960384
      DOI: 10.1016/j.abb.2023.109858
      http://dx.doi.org/10.1016/j.abb.2023.109858
      
      

    • Permeation mechanisms of hydrogen peroxide and water through Plasma membrane Intrinsic Protein (PIP) aquaporins (Completo, 2024)

      JONATHAN CHEVRIAU , GERARDO ZERBETTO DE PALMA , CINTIA JOZEFKOWICZ , VICTORIA VITALI , AGUSTINA CANESSA FORTUNA , NICOLÁS AYUB , GABRIELA SOTO , GERD PATRICK BIENERT , ARI ZEIDA , KARINA EDITH ALLEVA
      Biochemical Journal, 2024
      Lugar de publicación: United kingdom
      ISSN: 02646021
      E-ISSN: 14708728
      DOI: 10.1042/bcj20240310
      http://dx.doi.org/10.1042/bcj20240310
      
      

    • Comparing thiol and selenol reactivity towards peroxynitrite by computer simulation (Completo, 2024)

      ANDRESA MESSIAS , ANÍBAL RAUBER , SOFÍA VULETICH , ARI ZEIDA , JONATHAN A. SEMELAK , DARÍO A. ESTRIN
      Redox Biochemistry and Chemistry, v.: 9 p.:100035 2024
      Escrito por invitación
      ISSN: 27731766
      DOI: 10.1016/j.rbc.2024.100035
      http://dx.doi.org/10.1016/j.rbc.2024.100035
      
      

    • Minimum Free Energy Pathways of Reactive Processes with Nudged Elastic Bands (Completo, 2023)

      JONATHAN A. SEMELAK , ARI ZEIDA , NICOLÁS O. FOGLIA , DARÍO A. ESTRIN
      Journal of Chemical Theory and Computation, v.: 19 p.:6273 - 6293, 2023
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 15499618
      E-ISSN: 15499626
      DOI: 10.1021/acs.jctc.3c00366
      http://dx.doi.org/10.1021/acs.jctc.3c00366
      
      

    • Kinetic and structural assessment of the reduction of human 2?Cys peroxiredoxins by thioredoxins (Completo, 2023)

      SEBASTIÁN F. VILLAR , LAURA CORRALES?GONZÁLEZ , BELÉN MÁRQUEZ DE LOS SANTOS , JOAQUÍN DALLA RIZZA , ARI ZEIDA , ANA DENICOLA , GERARDO FERRER?SUETA
      FEBS Journal, v.: 291 p.:778 - 794, 2023
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United kingdom
      ISSN: 1742464X
      E-ISSN: 17424658
      DOI: 10.1111/febs.17006
      http://dx.doi.org/10.1111/febs.17006
      
      

    • Novel Lennard-Jones Parameters for Cysteine and Selenocysteine in the AMBER Force Field (Completo, 2023)

      FEDERICO N. PEDRON , ANDRESA MESSIAS , ARI ZEIDA , ADRIÁN E. ROITBERG , DARÍO A. ESTRIN
      Journal of Chemical Information and Modeling, v.: 63 p.:595 - 604, 2023
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 15499596
      E-ISSN: 1549960X
      DOI: 10.1021/acs.jcim.2c01104
      http://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.2c01104
      
      

    • Redox sensitive human mitochondrial aconitase and its interaction with frataxin: In vitro and in silico studies confirm that it takes two to tango (Completo, 2023)

      SANTIAGO MANSILLA , VERÓNICA TÓRTORA , FLORENCIA PIGNATARO , SANTIAGO SASTRE , IGNACIO CASTRO , MA. LAURA CHIRIBAO , CARLOS ROBELLO , ARI ZEIDA , JAVIER SANTOS , LAURA CASTRO
      Free Radical Biology and Medicine, v.: 197 p.:71 - 84, 2023
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Netherlands
      ISSN: 08915849
      E-ISSN: 18734596
      DOI: 10.1016/j.freeradbiomed.2023.01.028
      http://dx.doi.org/10.1016/j.freeradbiomed.2023.01.028
      
      

    • Mitochondrial Peroxiredoxin 3 Is Rapidly Oxidized and Hyperoxidized by Fatty Acid Hydroperoxides (Completo, 2023)

      GIULIANA CARDOZO , MAURICIO MASTROGIOVANNI , ARI ZEIDA , NICOLÁS VIERA , RAFAEL RADI , ANÍBAL M. REYES , MADIA TRUJILLO
      Antioxidants, v.: 12 p.:408 2023
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Switzerland
      Escrito por invitación
      E-ISSN: 20763921
      DOI: 10.3390/antiox12020408
      http://dx.doi.org/10.3390/antiox12020408
      
      

    • Thiol-based chemical probes exhibit antiviral activity against SARS-CoV-2 via allosteric disulfide disruption in the spike glycoprotein (Completo, 2022)Trabajo relevante

      YUNLONG SHI , ARI ZEIDA , CAITLIN E. EDWARDS , MICHAEL L. MALLORY , SANTIAGO SASTRE , MATÍAS R. MACHADO , RAYMOND J. PICKLES , LING FU , KEKE LIU , JING YANG , RALPH S. BARIC , RICHARD C. BOUCHER , RAFAEL RADI , KATE S. CARROLL
      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v.: 119 6 , 2022
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00278424
      E-ISSN: 10916490
      DOI: 10.1073/pnas.2120419119
      http://dx.doi.org/10.1073/pnas.2120419119
      YS, AZ y CE contribuyeron igualmente en este trabajo
      
      

    • The superoxide radical switch in the biology of nitric oxide and peroxynitrite (Completo, 2022)

      LUCÌA PIACENZA , ARI ZEIDA , MADIA TRUJILLO , RAFAEL RADI
      Physiological Reviews, 2022
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      Escrito por invitación
      ISSN: 00319333
      E-ISSN: 15221210
      DOI: 10.1152/physrev.00005.2022
      http://dx.doi.org/10.1152/physrev.00005.2022
      
      

    • Possible molecular basis of the biochemical effects of cysteine-derived persulfides (Completo, 2022)

      ERNESTO CUEVASANTA , DAYANA BENCHOAM , JONATHAN A. SEMELAK , MATÍAS N. MÖLLER , ARI ZEIDA , MADIA TRUJILLO , BEATRIZ ALVAREZ , DARÍO A. ESTRIN
      Frontiers in Molecular Biosciences, v.: 9 2022
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: Switzerland
      Escrito por invitación
      E-ISSN: 2296889X
      DOI: 10.3389/fmolb.2022.975988
      http://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2022.975988
      
      

    • Crystal structure of Trypanosoma cruzi heme peroxidase and characterization of its substrate specificity and compound I intermediate (Completo, 2022)

      SAMUEL L. FREEMAN , VERA SKAFAR , HANNA KWON , ALISTAIR J. FIELDING , PETER C.E. MOODY , ALEJANDRA MARTÍNEZ , FEDERICO M. ISSOGLIO , LUCAS INCHAUSTI , PABLO SMIRCICH , ARI ZEIDA , LUCÍA PIACENZA , RAFAEL RADI , EMMA L. RAVEN
      Journal of Biological Chemistry, v.: 298 p.:102204 2022
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00219258
      E-ISSN: 1083351X
      DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102204
      http://dx.doi.org/10.1016/j.jbc.2022.102204
      
      

    • De novo sequencing and construction of a unique antibody for the recognition of alternative conformations of cytochrome c in cells (Completo, 2022)

      FLORENCIA TOMASINA , JENNYFER MARTÍNEZ , ARI ZEIDA , MARÍA LAURA CHIRIBAO , VERÓNICA DEMICHELI , AGUSTÍN CORREA , CELIA QUIJANO , LAURA CASTRO , ROBERT H. CARNAHAN , PAIGE VINSON , MATT GOFF , TRACY COOPER , W. HAYES MCDONALD , NATALIE CASTELLANA , LUCIANA HANNIBAL , PAUL T. MORSE , JUNMEI WAN , MAIK HÜTTEMANN , RONALD JEMMERSON , LUCÍA PIACENZA , RAFAEL RADI
      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v.: 119 2022
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00278424
      E-ISSN: 10916490
      DOI: 10.1073/pnas.2213432119
      http://dx.doi.org/10.1073/pnas.2213432119
      
      

    • Cardiolipin interactions with cytochrome c increase tyrosine nitration yields and site-specificity (Completo, 2021)

      VERÓNICA DEMICHELI , FLORENCIA TOMASINA , SANTIAGO SASTRE , ARI ZEIDA , VERÓNICA TÓRTORA , ANALÍA LIMA , CARLOS BATTHYÁNY , RAFAEL RADI
      Archives of Biochemistry and Biophysics, v.: 703 108824 , 2021
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00039861
      E-ISSN: 10960384
      DOI: 10.1016/j.abb.2021.108824
      http://dx.doi.org/10.1016/j.abb.2021.108824
      
      

    • PIP aquaporin pH?sensing is regulated by the length and charge of the C?terminal region (Completo, 2021)

      FLORENCIA SCOCHERA , GERARDO ZERBETTO DE PALMA , AGUSTINA CANESSA FORTUNA , JONATHAN CHEVRIAU , ROXANA TORIANO , GABRIELA SOTO , ARI ZEIDA , KARINA ALLEVA
      FEBS Journal, v.: 289 p.:246 - 261, 2021
      Medio de divulgación: Internet
      Lugar de publicación: United kingdom
      ISSN: 1742464X
      E-ISSN: 17424658
      DOI: 10.1111/febs.16134
      http://dx.doi.org/10.1111/febs.16134
      A. Zeida, K. Alleva (corresponding authors)
      
      

    • Akt Is S-Palmitoylated: A New Layer of Regulation for Akt (Completo, 2021)

      MATÍAS BLAUSTEIN , ESTEFANÍA PIEGARI , CAMILA MARTÍNEZ CALEJMAN , ANTONELLA VILA , ANALÍA AMANTE , MARÍA VICTORIA MANESE , ARI ZEIDA , LAURENCE ABRAMI , MARIELA VEGGETTI , DAVID A. GUERTIN , F. GISOU VAN DER GOOT , MARÍA MARTHA CORVI , ALEJANDRO COLMAN-LERNER
      Frontiers in Cell and Developmental Biology, v.: 9 2021
      Lugar de publicación: Switzerland
      E-ISSN: 2296634X
      DOI: 10.3389/fcell.2021.626404
      http://dx.doi.org/10.3389/fcell.2021.626404
      
      

    • In vivo observation of peroxiredoxins oligomerization dynamics (Completo, 2020)

      A. ZEIDA , MANTA B , TRUJILLO, M.
      PNAS, v.: 117 32 , p.:18918 - 18920, 2020
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
      Escrito por invitación
      ISSN: 1091649
      DOI: DOI: 10.1073/pnas.2012207117
      
      

    • Genetic and transcriptomic evidences suggest ARO10 genes are involved in benzenoid biosynthesis by yeast (Completo, 2020)

      Valera, M.J. , A. ZEIDA , BOIDO, E. , G. Beltrán , Torija, M.J. , Mas, A. , RADI, R , DELLACASSA, E , CARRAU, F.
      Yeast, p.:1 - 9, 2020
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      ISSN: 0749503X
      E-ISSN: 10970061
      DOI: 10.1002/yea.3508
      
      

    • Substrate and Product-Assisted Catalysis: Molecular Aspects behind Structural Switches along Organic Hydroperoxide Resistance Protein Catalytic Cycle (Completo, 2020)

      R. M. Domingos , R. D. Teixeira , A. ZEIDA , W. A. Agudelo , T. G. P. Alegria , J. F. da Silva Neto , P. S. Vieira , M. T. Murakami , C. S. Farah , D. A. Estrin , L. E. S. Netto
      ACS Catalysis, v.: 10 p.:6587 - 6602, 2020
      Palabras clave: peroxiredoxina cisteínas reactivas cambios estructurales biofíca de proteínas
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 21555435
      DOI: https://doi.org/10.1021/acscatal.0c01257
      
      

    • Exploring the conformational transition between the fully folded and locally unfolded substates of Escherichia coli thiol peroxidase (Completo, 2020)

      D. S. Vazquez , A. ZEIDA , W. A. Agudelo , M. R. Montes , FERRER-SUETA, G. , J. Santos
      Physical Chemistry Chemical Physics, v.: 22 p.:9518 - 9533, 2020
      Palabras clave: peroxirredoxinas cambio conformacional biofísica de proteínas cisteínas reactivas
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 14639076
      E-ISSN: 14639084
      DOI: https://doi.org/10.1039/D0CP00140F
      
      

    • Mechanisms and consequences of protein cysteine oxidation: the role of the initial short-lived intermediates (Completo, 2020)

      TURELL, L , A. ZEIDA , TRUJILLO, M.
      Essays in Biochemistry, v.: 64 1 , p.:55 - 66, 2020
      Escrito por invitación
      ISSN: 00711365
      E-ISSN: 17441358
      DOI: 10.1042/EBC20190053
      Turell, L. y Zeida, A. contribuyeron igualmente en este trabajo
      
      

    • Acidity and nucleophilic reactivity of glutathione persulfide (Completo, 2020)

      DAYANA BENCHOAM , JONATHAN A. SEMELAK , ERNESTO CUEVASANTA , MAURICIO MASTROGIOVANNI , JUAN S. GRASSANO , GERARDO FERRER-SUETA , ARI ZEIDA , MADIA TRUJILLO , MATÍAS N. MÖLLER , DARÍO A. ESTRIN , BEATRIZ ALVAREZ
      Journal of Biological Chemistry, v.: 295 p.:15466 - 15481, 2020
      Lugar de publicación: United states
      ISSN: 00219258
      E-ISSN: 1083351X
      DOI: 10.1074/jbc.ra120.014728
      http://dx.doi.org/10.1074/jbc.ra120.014728
      
      

    • A computational investigation of the reactions of tyrosyl, tryptophanyl, and cysteinyl radicals with nitric oxide and molecular oxygen (Completo, 2019)

      FN PEDRÓN , BARTESAGHI, S. , DA ESTRIN , RADI, R , A. ZEIDA
      Free Radical Research, v.: 53 1 , p.:18 - 25, 2019
      Palabras clave: Amino acid-derived radicals; nitric oxide; one-electron oxidation; oxygen
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 10715762
      E-ISSN: 10292470
      DOI: 10.1080/10715762.2018.1541322
      
      

    • From quantum to subcellular scales: multiscale simulation approaches and the SIRAH force field (Completo, 2019)

      M. MACHADO , A. ZEIDA , DARRÉ L. , PANTANO S.
      Interface Focus, v.: 9 3 , 2019
      Palabras clave: molecular dynamics coarse-grain SIRAH QM/MM/CG hybrid
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 20428898
      E-ISSN: 20428901
      DOI: 10.1098/rsfs.2018.0085
      
      

    • Gating in plant plasma membrane aquaporins: the involvement of leucine in the formation of a pore constriction in the closed state (Completo, 2019)

      CANESSA FORTUNA A. , ZERBETTO DE PALMA G. , ALIPERTI CAR L. , ARMENTIA L. , VITALI V. , A. ZEIDA , ESTRIN DA , ALLEVA K.
      FEBS Journal, 2019
      Palabras clave: aquaporin; gating; leucine plug; molecular dynamics; water transport
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 1742464X
      E-ISSN: 17424658
      DOI: 10.1111/febs.14922
      
      

    • Commentary on "Using resonance synchronous spectroscopy to characterize the reactivity and electrophilicity of biologically relevant sulfane sulfur". Evidence that the methodology is inadequate because it only measures unspecific light scattering (Completo, 2019)

      CUEVASANTA, E. , BENCHOAM, D , FERRER-SUETA, G. , A. ZEIDA , DENICOLA, A , ALVAREZ, B. , MÖLLER, MN
      Redox Biology, 2019
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 22132317
      DOI: 10.1016/j.redox.2019.101281
      
      

    • Kinetics of formation and reactivity of the persulfide in the one-cysteine peroxiredoxin from Mycobacterium tuberculosis (Completo, 2019)

      CUEVASANTA, E. , ANÍBAL M. REYES , A. ZEIDA , MASTROGIOVANNI, M. , María Inés De Armas , RADI, R , ALVAREZ, B. , TRUJILLO, M.
      Journal of Biological Chemistry, 2019
      Palabras clave: hydrogen sulfide; persulfide; hydrodisulfide; sulfenic acid peroxiredoxin (Prx); alkyl hydroperoxide reductase E; Mycobacterium tuberculosis; signaling compound; antioxidant defense
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 00219258
      E-ISSN: 1083351X
      DOI: 10.1074/jbc.RA119.008883
      
      

    • Catalysis of Peroxide Reduction by Fast Reacting Protein Thiols (Completo, 2019)Trabajo relevante

      ZEIDA, A. , TRUJILLO, M. , FERRER-SUETA, G. , DENICOLA, A , ESTRIN, DA , RADI, R
      Chemical Reviews, v.: 119 19 , p.:10829 - 10855, 2019
      Palabras clave: thiol peroxides thiol peroxidases
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas /
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 00092665
      E-ISSN: 15206890
      DOI: 10.1021/acs.chemrev.9b00371
      
      

    • Multiscale Modeling of Thiol Overoxidation in Peroxiredoxins by Hydrogen Peroxide (Completo, 2019)

      J. A. SEMELAK , F. BATTISTINI , RADI, R , TRUJILLO, M. , A. ZEIDA , D. A. ESTRIN
      Journal of Chemical Information and Modeling, v.: 60 p.:843 - 853, 2019
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas /
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 15499596
      E-ISSN: 1549960X
      DOI: 10.1021/acs.jcim.9b00817
      Zeida, A. es co-autor de correspondencia
      
      

    • Chemical Reactivity and Spectroscopy Explored From QM/MM Molecular Dynamics Simulations Using the LIO Code (Completo, 2018)

      J.P. MARCOLONGO , A. ZEIDA , J.A. SEMELAK , N.O. FOGLIA , U.N. MORZÁN , D.A. ESTRIN , M.C. GONZÁLEZ LEBRERO , D.A. SCHERLIS
      Frontiers in Chemistry, v.: 6 2018
      Palabras clave: QM/MM DFT GPU free energy TDDFT
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas / Química Teórica y Computacional
      Escrito por invitación
      E-ISSN: 22962646
      DOI: 10.3389/fchem.2018.00070
      Marcolongo, J.P. y Zeida, A. contribuyeron igualmente en este trabajo
      
      

    • Kinetics, subcellular localization, and contribution to parasite virulence of a Trypanosoma cruzi hybrid type A heme peroxidase (TcAPx-CcP) (Completo, 2017)Trabajo relevante

      M HUGO , A. MARTINEZ , M. TRUJILLO , D. ESTRADA , M. MASTROGIOVANNI , E LINARES , O AUGUSTO , F. ISSOGLIO , A. ZEIDA , DA ESTRIN , HF HEIJNEN , L. PIACENZA , R. RADI
      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v.: 114 8 , 2017
      Palabras clave: kinetics Trypanosoma cruzi heme peroxidase virulence oxidants
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      ISSN: 00278424
      E-ISSN: 10916490
      
      

    • Exploring the Catalytic Mechanism of Human Glutamine Synthetase by Computer Simulations (Completo, 2016)

      F. M. ISSOGLIO , N. CAMPOLO , A. ZEIDA , T. GRUNE , R. RADI , D. A. ESTRIN , S. BARTESAGHI
      Biochemistry, v.: 55 42 , p.:5907 - 5916, 2016
      Palabras clave: Catalytic mechanisms Classical molecular dynamics Glutamine synthetase Reaction free energy
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 00062960
      E-ISSN: 15204995
      DOI: 10.1021/acs.biochem.6b00822
      
      

    • PrxQ B from Mycobacterium tuberculosis is a monomeric, thioredoxin-dependent and highly efficient fatty acid hydroperoxide reductase (Completo, 2016)

      ANIBAL M. REYES , D. S. VAZQUEZ , A. ZEIDA , M HUGO , M. D. PIñEYRO , M. I. DE ARMAS , D. A. ESTRIN , R. RADI , J. SANTOS , M. TRUJILLO
      Free Radical Biology and Medicine, v.: 101 p.:249 - 260, 2016
      Palabras clave: Mycobacterium tuberculosis Fatty acid hydroperoxides Peroxidatic and resolving cysteine Peroxiredoxin Thiol-dependent peroxidase
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 08915849
      E-ISSN: 18734596
      DOI: 10.1016/j.freeradbiomed.2016.10.005
      
      

    • Nitrosodisulfide [S2NO]− (perthionitrite) is a true intermediate during the “cross-talk” of nitrosyl and sulfide (Completo, 2016)

      J. P. MARCOLONGO , U. N. MORZáN , A. ZEIDA , D. A. SCHERLIS , J. A. OLABE
      Physical Chemistry Chemical Physics, v.: 18 p.:30047 - 30052, 2016
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 14639076
      E-ISSN: 14639084
      DOI: 10.1039/C6CP06314D
      
      

    • Theoretical investigation of the mechanism of nitroxyl decomposition in aqueous solution (Completo, 2016)

      M. BRINGAS , J. SEMELAK , A. ZEIDA , D. A. ESTRIN
      Journal of Inorganic Biochemistry, v.: 162 p.:102 - 108, 2016
      Palabras clave: Aqueous decomposition Mechanism Nitroxyl QM/MM Reactive nitrogen species
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 01620134
      DOI: 10.1016/j.jinorgbio.2016.06.016
      
      

    • Insights into the mechanism of the reaction between Hydrogen sulfide and peroxynitrite (Completo, 2015)

      E. CUEVASANTA , A. ZEIDA , S. CARBALLAL , R. WEEDMAN , U. N. MORZáN , M. TRUJILLO , R. RADI , D. A. ESTRIN , M. R. FILIPOVIC , B. ALVAREZ
      Free Radical Biology and Medicine, v.: 80 2015
      Palabras clave: Peroxynitrite hydrogen sulfide kinetics persulfides free radiclas
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      ISSN: 08915849
      E-ISSN: 18734596
      
      

    • Molecular Basis of Hydroperoxide Specificity in Peroxiredoxins: The Case of AhpE from Mycobacterium tuberculosis (Completo, 2015)Trabajo relevante

      A. ZEIDA , ANIBAL M. REYES , P. LICHTIG , M HUGO , D. S. VAZQUEZ , J. SANTOS , L. GONZáLEZ FLECHA , R. RADI , D. A. ESTRIN , M. TRUJILLO
      Biochemistry, v.: 54 49 , p.:7237 - 7247, 2015
      Palabras clave: Peroxiredoxins Mycobacterium tuberculosis Bacterial Proteins Molecular Dynamics Simulation Substrate Specificity
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 00062960
      E-ISSN: 15204995
      DOI: 10.1021/acs.biochem.5b00758
      
      

    • The Extraordinary Catalytic Ability of Peroxiredoxins: a Combined Experimental and QM/MM Study on the Fast Thiol Oxidation Step (Completo, 2014)Trabajo relevante

      A. ZEIDA , ANIBAL M. REYES , M. C. G. LEBRERO , R. RADI , M. TRUJILLO , D. A. ESTRIN
      Chemical Communications, v.: 70 p.:10070 - 10073, 2014
      Palabras clave: Peroxiredoxins Thiol oxidation Activation parameters QM/MM simulations
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      ISSN: 13597345
      E-ISSN: 1364548X
      DOI: 10.1039/c4cc02899f
      
      

    • Improving Efficiency in SMD Simulations Through a Hybrid Differential Relaxation Algorithm (Completo, 2014)

      C. L. RAMIREZ , A. ZEIDA , G. E. JARA , A. E. ROITBERG , M. A. MARTI
      Journal of Chemical Theory and Computation, v.: 10 p.:4609 - 4617, 2014
      Palabras clave: QM/MM simulations
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /
      ISSN: 15499618
      E-ISSN: 15499626
      DOI: 10.1021/ct500672d
      
      

    • Thiol redox biochemistry: insights from computer simulations (Completo, 2014)

      A. ZEIDA , C. M. GUARDIA , P. LICHTIG , L. L. PERISSINOTTI , L. A. DEFELIPE , A. TURJANSKI , R. RADI , M. TRUJILLO , D. A. ESTRIN
      Biophysical Reviews, v.: 6 p.:27 - 46, 2014
      Palabras clave: Thiols Oxidation Redox homeostasis Computer simulations
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
      Escrito por invitación
      ISSN: 18672450
      E-ISSN: 18672469
      DOI: 10.1007/s12551-013-0127-x
      
      

    • Assessing the Accuracy of the SIRAH Force Field to Model DNA at Coarse Grain Level (Completo, 2013)

      P. D. DANS , L. DARRé , M. R. MACHADO , A. ZEIDA , A. F. BRANDNER , PANTANO, S
      Lecture Notes in Computer Science, v.: 8213 p.:71 - 81, 2013
      Palabras clave: Molecular dynamics nucleic acids simulations WT4 flexibility
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
      Escrito por invitación
      ISSN: 03029743
      E-ISSN: 16113349
      DOI: 10.1007/978-3-319-02624-4_7
      
      

    • Mechanism of cysteine oxidation by peroxynitrite: an integrated experimental and theoretical study (Completo, 2013)

      A. ZEIDA , M. C. G. LEBRERO , R. RADI , M. TRUJILLO , D. A. ESTRIN
      Archives of Biochemistry and Biophysics, v.: 539 p.:81 - 86, 2013
      Palabras clave: Thiols Cysteine Peroxynitrite Oxidation SN2 Redox homeostasis
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica /
      ISSN: 00039861
      E-ISSN: 10960384
      DOI: 10.1016/j.abb.2013.08.016
      
      

    • Molecular basis of the mechanism of thiol oxidation by hydrogen peroxide in aqueous solution: challenging the SN2 paradigm (Completo, 2012)

      A. ZEIDA , R. BABBUSH , GONZALEZ LEBRERO, M. , M. TRUJILLO , R. RADI , ESTRIN, D
      Chemical Research in Toxicology, v.: 25 3 , p.:741 - 746, 2012
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 15205010
      DOI: 10.1021/tx200540z
      
      

    • Breathing, bubbling, and bending: DNA flexibility from multimicrosecond simulations (Completo, 2012)

      A. ZEIDA , MACHADO, M. R. , P. D. DANS , PANTANO, S
      Physical Review E, v.: 86 p.:21903 2012
      Palabras clave: Molecular dynamics nucleic acids Coarse-grained force field
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 15393755
      E-ISSN: 15502376
      DOI: 10.1103/PhysRevE.86.021903
      http://pre.aps.org/abstract/PRE/v86/i2/e021903
      
      

    • A Coarse Grained Model for Atomic-Detailed DNA Simulations with Explicit Electrostatics (Completo, 2010)

      P. D. DANS , A. ZEIDA , MACHADO, M. , PANTANO, S
      Journal of Chemical Theory and Computation, v.: 6 p.:1711 - 1725, 2010
      Palabras clave: Acidos nucleicos Coarse-grain Dinámica Molecular
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 15499618
      E-ISSN: 15499626
      DOI: 10.1021/ct900653p
      http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ct900653p?prevSearch=%255Bauthor%253A%2BDans%252C%2BP.%2BD.%255D
      
      

Producción técnica

• Otras Producciones

  • Desarrollo de material didáctico o de instrucción

    • Selenio (2019)

      A. ZEIDA
      
      País: Argentina
      Idioma: Español
      Medio divulgación: Papel
      Web: https://elgatoylacaja.com.ar/selenio/
      Nota sobre el elemento Selenio en el contexto del libro "118. El universo en una tabla"
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas /
      

  • Programas en radio o TV

    • A partir del desarrollo de conocimiento generar beneficios para la salud (2019)

      A. ZEIDA
      Entrevista
      País: Uruguay
      Idioma: Español
      Web: https://historiasdeciencia.uy/
      Emisora: TVCiudad
      

    • Fondo Vaz Ferreira para investigar la tuberculosis, un flagelo muy vigente (2018)

      A. ZEIDA
      Entrevista
      País: Uruguay
      Idioma: Español
      Web: https://sobreciencia.uy/fondo-vaz-ferreira-para-investigar-la-tuberculosis-un-flagelo-muy-vigente/
      Emisora: Radio Uruguay (1050 AM)
      

  • Organización de eventos

    • Segundo Encuentro Bienal de la SBBM (2020)

      A. ZEIDA
      Congreso
      Sub Tipo: Otra
      Lugar: Uruguay
      Idioma: Español
      Web: https://www.sbbm.edu.uy/bienal2020
      Institución Promotora/Financiadora: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular
      

• Evaluaciones

  • Evaluación de Proyectos

    • Evaluación independiente de proyectos

      CSIC Iniciación ( 2023 / 2023 )

      Uruguay
      Cantidad: Menos de 5
      

    • CEBEM Mobility Fellowships 2023 ( 2023 / 2023 )

      Argentina
      Cantidad: Mas de 20
      

    • CEBEM Mobility Fellowships 2022 ( 2022 / 2022 )

      Argentina
      Cantidad: Mas de 20
      

    • Becas ALAPA-iB3-FCEN ( 2022 / 2022 )

      Argentina
      Cantidad: De 5 a 20
      

    • Evaluación Proyecto ANII ( 2018 / 2025 )

      Uruguay
      Cantidad: Menos de 5
      
      

  • Evaluación de Publicaciones

    • Comité editorial

      Comité Editorial "Redox Biochemistry and Chemistry" ( 2025 )

      Tipo de publicación: Revista
      Cantidad: Menos de 5
      

    • Comité Editorial "Redox Biochemistry and Chemistry" ( 2024 )

      Tipo de publicación: Revista
      Editorial: ScienceDirect
      Cantidad: De 5 a 20
      

    • Revisiones

      Revisor de Archives of Biophysics and Biochemistry ( 2025 )

      Tipo de publicación: Revista
      Cantidad: Menos de 5
      

    • Revisor de Computational Biology and Chemistry ( 2024 )

      Tipo de publicación: Revista
      Cantidad: Menos de 5
      

    • Revisor de Journal of Chemical Information and Modeling (ACS) ( 2024 )

      Tipo de publicación: Revista
      Cantidad: Menos de 5
      

    • Revisor de Free Radical Biology and Medicine ( 2023 )

      Tipo de publicación: Revista
      Cantidad: Menos de 5
      

    • Revisor de Proceedings of the National Academy of Science ( 2022 )

      Tipo de publicación: Revista
      Cantidad: Menos de 5
      

    • Revisor de Free Radical Biology and Medicine ( 2017 )

      Tipo de publicación: Revista
      Cantidad: Menos de 5
      

  • Evaluación de eventos y congresos

    • XIV Jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular del Uruguay ( 2025 / 2025 )

      Revisiones
      Uruguay
      
      
      

    • Sociedad Argentina de Biofísica (SAB 2025) ( 2025 / 2025 )

      Revisiones
      Argentina
      
      
      

    • II Conesul Symposium on Biomolecular Simulation (Conesul 2024) ( 2024 / 2024 )

      Comité programa congreso
      Argentina
      
      
      

  • Evaluación de convocatorias concursables

    • Concurso Gr.2 del Laboratorio de Química Teórica y Computacional, FCyEN, Udelar ( 2018 / 2018 )

      Comité evaluador
      Uruguay
      Cantidad: Menos de 5

  • Jurado de tesis

    • Licenciatura en Bioquímica: "Estudio in silico de propiedades de ácidos grasos nitrados (NOTFA) en diversos entornos hacia su interacción y reactividad con APX, un ascorbato peroxidasa vegetal" ( 2025 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Nivel de formación: Grado
      

    • Doctorado en Ciencias Biológicas "Aproximación estructural e integrativa al estudio del endoflagelo de Leptospira" ( 2025 / 2025 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
      Nivel de formación: Doctorado
      

    • Doctorado en Ciencias Químicas: "?Interconversión ?NO/HNO en sistemas inorgánicos por acción de compuestos azufrados biológicamente relevantes? ( 2025 / 2025 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Ciencias Exactas y Naturales Universidad de Buenos Aires , Argentina
      Nivel de formación: Doctorado
      

    • Pós-Graduação do Instituto de Química: "Efeitos de solvente na termodinamica do enovelamento de proteínas" ( 2025 / 2025 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universidade Estadual de Campinas , Brasil
      Nivel de formación: Doctorado
      

    • Magíster en Biología Celular y Molecular: "Descubrimiento de fármacos contra blancos moleculares de SARS-CoV-2: dirigidos a la invasión y replicación celular" ( 2024 / 2024 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) , Uruguay
      Nivel de formación: Maestría
      

    • Doctor en Ciencias Químicas: "Estudio mecanístico y diseño de fármacos asistido por computadora contra el virus del dengue" ( 2023 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Ciencias Exactas y Naturales Universidad de Buenos Aires , Argentina
      Nivel de formación: Doctorado
      

    • Magister en Ciencias Químicas: "Estudio de la reacción de la hemoperoxidasa híbrida tipo A de Trypanosoma cruzi (APx-CcP) con peroxinitrito in vitro e in vivo" ( 2022 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Química , Uruguay
      Nivel de formación: Maestría
      

    • Doctor en Ciencias Químicas: "Reactividad de sulfuro inorgánico frente a modelos de sus blancos bioquímicos" ( 2020 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Ciencias Exactas y Naturales Universidad de Buenos Aires , Argentina
      Nivel de formación: Doctorado
      

    • Licenciatura en Ciencias Físicas: "Dinámica molecular de proteínas a pH constante con modelos de grano grueso" ( 2019 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Ciencias Exactas y Naturales - UBA / Departamento de Física , Argentina
      Nivel de formación: Grado
      

    • Licenciatura en Bioquímica: "Caracterización cinética de la proteína de fusión TR-Trx-Tpx de Escherichia coli" ( 2019 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Nivel de formación: Grado
      

    • Tesina Licenciatura en Bioquímica: "Modificaciones post-traduccionales de la peroxirredoxina 6 humana: consecuencias de su fosforilación y glicación" ( 2018 )

      Jurado de mesa de evaluación de tesis
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Nivel de formación: Grado
      

• Formación de RRHH

  • Tutorías concluidas

    • Posgrado

      • Consecuencias estructurales y funcionales de la nitración de tirosinas en proteínas celulares: el caso de la chaperona Hsp90 (2020 - 2026)

        Tesis de maestria
        Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas , Uruguay
        Programa: Bioinformática
        Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( A. ZEIDA , RADI, R )
        Nombre del orientado: Alfonso Taboada
        País: Uruguay
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioinformática

      • Estudio del transporte de agua y peróxido de hidrógeno en canales MIP (2021 - 2025)

        Tesis de doctorado
        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Farmacia y Bioquímica, Universidad de Buenos Aires , Argentina
        Programa: Doctorado en Bioquímica
        Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( A. ZEIDA , Karina Alleva )
        Nombre del orientado: Jonathan Jesús Chevriau
        País: Argentina
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica

      • Metionina sulfóxido reductasa A de Mycobacterium tuberculosis: desentrañando los secretos de su ciclo catalítico (2019 - 2022) Trabajo relevante

        Tesis de maestria
        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina / Departamento de Bioquímica - CEINBIO , Uruguay
        Programa: Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas (PEDECIBA)
        Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( A. ZEIDA , RADI, R )
        Nombre del orientado: Santiago Sastre
        País: Uruguay
        Palabras Clave: Mycobacterium tuberculosis metionina sulfóxido reductasa biología redox
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas / Bioquímica

    • Otras

      • Bases moleculares de la reactividad de persulfuros y tiolatos frente a peróxido de hidrógeno

        Iniciación a la investigación
        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Ciencias Exactas y Naturales - UBA , Argentina
        Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
        Nombre del orientado: Jonathan Semelak
        País: Argentina

      • Bases moleculares de la reducción de peróxido de hidrógeno por peroxirredoxinas

        Iniciación a la investigación
        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Ciencias Exactas y Naturales - UBA , Argentina
        Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
        Nombre del orientado: Jonathan Semelak
        País: Argentina

  • Tutorías en marcha

    • Posgrado

      • Consecuencias dinámicas asociadas a la formación y reducción de disulfuros proteicos: el caso del dominio de unión al receptor de la proteína S de SARS-CoV-2 (2022)

        Tesis de doctorado
        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina , Uruguay
        Programa: Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas (PEDECIBA)
        Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( A. ZEIDA , RADI, R )
        Nombre del orientado: Santiago Sastre
        País/Idioma: Uruguay,
        Palabras Clave: SARS-CoV2; glicoproteína espicular; disulfuros
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas / Bioquímica

      • Mecanismo catalítico de enzimas humanas encargadas de la oxidación y reducción estereoespecífica de metioninas proteicas. (2021)

        Tesis de doctorado
        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Ciencias Exactas y Naturales - UBA , Argentina
        Programa: Doctorado en Ciencias Químicas
        Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( A. ZEIDA , D. A. Estrin )
        Nombre del orientado: Andresa Messias
        País/Idioma: Argentina,
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Ciencias Químicas / Bioquímica

    • Otras

      • Caracterización funcional y estructural de la lactonasa clave para la biosíntesis de urolitinas a nivel de la microbiota intestinal (2025)

        Iniciación a la investigación
        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina / Centro de Investigaciones Biomédicas , Uruguay
        Programa: Bioquímica
        Tipo de orientación: Tutor único o principal
        Nombre del orientado: Santiago Rodriguez
        País/Idioma: Uruguay,

• Otros datos relevantes

  • Premios, Honores y Títulos

    • Mejor Póster (2018)

      (Nacional)
      Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular
      
      

    • The Carl Storm International Diversity Fellowship (2014)

      (Internacional)
      Gordon Conferences
      
      

  • Presentaciones en eventos

    • Sociedad Argentina de Biofísica (SAB 2025) (2025)

      Congreso
      Structure(dynamics)-function relationship in methionine sulfoxide reductases
      Argentina
      Tipo de participación: Conferencista invitado
      Carga horaria: 30
      Nombre de la institución promotora: Sociedad Argentina de Biofísica
      Alcance geográfico: Regional

    • Thiol-based redox switches: From chemistry to physiology and pathology (2025)

      Congreso
      Integrating low-resolution biophysical approaches and computational simulations to characterize disulfide roles in protein conformational landscapes
      España
      Tipo de participación: Expositor oral
      Carga horaria: 30
      Nombre de la institución promotora: EMBO
      Alcance geográfico: Internacional

    • III Workshop de Química y Bioquímica RedOx Oxidantes, Señalización y Control Metabólico (2025)

      Encuentro
      Bases moleculares del mecanismo catalítico de metionina sulfóxido reductasas: una excusa con motivo de discutir estrategias para entender la relación estructura-función en enzimas redox
      Chile
      Tipo de participación: Conferencista invitado
      Nombre de la institución promotora: Pontificia Universidad Católica de Chile
      Alcance geográfico: Regional

    • EMBO Workshop: Computational structural biology (2023)

      Congreso
      Presentación de póster
      Alemania
      Tipo de participación: Otros
      Nombre de la institución promotora: Organización Europea de Biología Molecular (EMBO)
      Alcance geográfico: Internacional Palabras Clave: Biología Estructural; Bioinformática Estructural
      

    • Thiol-Based Redox Regulation and Signaling (2022)

      Congreso
      Role of Thiol Redox Status in SARS-CoV2 Spike Glycoprotein Recognition by the Host Receptor ACE2
      España
      Tipo de participación: Expositor oral
      Nombre de la institución promotora: Gordon Reasearch Conference
      Alcance geográfico: Internacional

    • Quién es Quién en Biofísica AUGM (2022)

      Seminario
      Compuestos basados en tioles exhiben actividad antiviral contra SARS-CoV-2 a través de efectos alostériscos asociados a la reducción de disulfuros de la glicoproteína Spike
      Argentina
      Tipo de participación: Expositor oral
      Nombre de la institución promotora: Asociación Universidades Grupo Montevideo (AUGM)

    • ENAQUI 7 (2021)

      Congreso
      Susceptibilidad redox del dominio de unión al receptor (RBD) de la glicoproteína espicular de SARS- CoV-2
      Uruguay
      Tipo de participación: Expositor oral
      Nombre de la institución promotora: PEDECIBA Química

    • II SAIMS Webinar (2020)

      Seminario
      Understanding the catalytic mechanism of methionine sulfoxide reductases from a multi-scale simulation approach
      Brasil
      Tipo de participación: Expositor oral
      Nombre de la institución promotora: South American Initiative on Molecular Simulations (SAIMS)

    • 4th Protein Biophysics at the End of the World (2019)

      Congreso
      Chair "Protein Catylisis" session
      Uruguay
      Tipo de participación: Moderador Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica
      

    • 4th Protein Biophysics at the End of the World (2019)

      Congreso
      "Role of enzyme structure and dynamics in methionine sulfoxide reductases catalytic mechanism"
      Uruguay
      Tipo de participación: Expositor oral Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica
      

    • Primer Encuentro Bienal de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (2018)

      Encuentro
      Presentación de póster
      Uruguay
      Tipo de participación: Otros
      Nombre de la institución promotora: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular
      

    • Thiol-Based Redox Regulation & Signaling (2018)

      Congreso
      Catalytic Mechanism of the Methionine Sulfoxide Reductases from Mycobacterium Tuberculosis: Structural, Dynamical and Biochemical Characterization
      España
      Tipo de participación: Poster
      Nombre de la institución promotora: Gordon Research Conference Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular
      

    • Thiol-Based Redox Regulation & Signaling (2018)

      Seminario
      Catalytic Mechanism of the Methionine Sulfoxide Reductases from Mycobacterium Tuberculosis: Structural, Dynamical and Biochemical Characterization
      España
      Tipo de participación: Expositor oral
      Nombre de la institución promotora: Gordon Research Seminar Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular
      

    • V Latin American Protein Society Meeting (2016)

      Congreso
      PrxQ B from Mycobacterium tuberculosis is a monomeric, thioredoxin- dependent and highly efficient fatty acid hydroperoxide reductase
      Brasil
      Tipo de participación: Expositor oral
      Carga horaria: 40

    • Thiol Metabolism and Redox Regulation of Cellular Functions (2015)

      Simposio
      Exploring the molecular basis of MtAhpE function: reaction mechanism and substrate specificity
      Uruguay
      Tipo de participación: Expositor oral
      Carga horaria: 40

    • Latin American Crosstalk in Biophysics and Physiology. SBF.uy-SAB (2015)

      Congreso
      Molecular basis of hydroperoxide specificity in peroxiredoxins: studies in AhpE from Mycobacterium tuberculosis
      Uruguay
      Tipo de participación: Expositor oral
      Carga horaria: 40

    • Sociedad Argentina de Investigación en Bioquímica y Biología Molecular (2015)

      Congreso
      Kinetic and dynamical characterization of an antioxidant system from Mycobacterium Tuberculosis
      Argentina
      Tipo de participación: Expositor oral
      Carga horaria: 40

    • 10th Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemistry (2014)

      Congreso
      Understanding the Catalytic Ability of Peroxiredoxins: a Combined Experimental and QM/MM Study on the Fast Thiol Oxidation Step
      Chile
      Tipo de participación: Poster
      Carga horaria: 40

    • Thiol-Based Redox Regulation & Signaling, 2014 (2014)

      Seminario
      Molecular basis of thiol oxidation by peroxides: aqueous solution and peroxiredoxins
      España
      Tipo de participación: Expositor oral
      Nombre de la institución promotora: Gordon Research Seminar

    • Thiol-Based Redox Regulation & Signaling (2014)

      Congreso
      Molecular basis of thiol oxidation by peroxides: aqueous solution and peroxiredoxins
      España
      Tipo de participación: Poster
      Nombre de la institución promotora: Gordon Research Conference

    • XLII Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (2014)

      Congreso
      Catalytic ability of peroxiredoxins: an example of the power of biomolecular simulations
      Brasil
      Tipo de participación: Expositor oral
      Carga horaria: 40

    • 2das Jornadas +Biofísica (2013)

      Congreso
      Oxidación de tioles por peróxidos: entendiendo a las peroxirredoxinas
      Uruguay
      Tipo de participación: Expositor oral
      Carga horaria: 40

    • VIII Meeting of the Society for Free Radical Biology and Medicine - South American Group (2013)

      Congreso
      Molecular basis of thiol oxidation by peroxides
      Argentina
      Tipo de participación: Expositor oral
      Carga horaria: 40

    • XVIII Congreso Argentino de Fisicoquímica y Química Inorgánica (2013)

      Congreso
      Bases moleculares del mecanismo de oxidación de tioles por peróxidos
      Argentina
      Tipo de participación: Poster
      Carga horaria: 40

    • ISCB Latin America 2012 Conference on Bioinformatics (2012)

      Congreso
      Molecular basis of the mechanism of thiol oxidation by hydrogen peroxide in aqueous solution: challenging the SN2 paradigm
      Chile
      Tipo de participación: Poster
      Carga horaria: 40

    • II Latin American Federation of Biophysical Societies Congress (2012)

      Congreso
      Cysteine as a peroxidatic agent: aqueous solution vs. protein environment
      Brasil
      Tipo de participación: Poster
      Carga horaria: 40

    • XL Reunión Anual Sociedad Argentina de Biofísica (2011)

      Congreso
      Dilucidando el mecanismo molecular de la oxidación de tioles por peróxido de hidrógeno
      Argentina
      Tipo de participación: Poster
      Carga horaria: 40

    • 1er Congreso Argentino de Bioinformática y Biología Computacional (2010)

      Congreso
      Development of a Coarse-Grained Model at the base level for DNA Simulations
      Argentina
      Tipo de participación: Poster
      Nombre de la institución promotora: Asociación Argentina de Bioinformática y Biología Computacional Palabras Clave: coarse grain model DNA
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Biología Computacional
      

    • 6tas. JORNADAS Sociedad Uruguaya de Bioquímica y Biología Molecular (2009)

      Congreso
      Desarrollo de un modelo de grano-grueso para simulación de ADN
      Uruguay
      Tipo de participación: Expositor oral

  • Construcción institucional

    Uno de los proyectos transversales del Departamento de Bioquímica y el CEINBIO dentro de la Facultad de Medicina, UDELAR, es el estudio de la relación estructura-función en distintas enzimas de relevancia redox, tanto en humanos como en organismos patógenos, como Trypanosoma cruzi y Mycobacterium tuberculosis. Esta línea de trabajo general, ha dado lugar a una diversidad de proyectos particulares que han sido financiados en varias oportunidades por subsidios tanto nacionales como internacionales, permitiendo su consolidación, y han dado lugar a un importante número de publicaciones en revistas arbitradas de gran impacto para el área. Es así que desde el 2021, impulsé la creación de la plataforma "Bioquímica Computacional y Estructural" en nuestro laboratorio, buscando profundizar el impacto de esta área particular en los distintos proyectos. En ese contexto, venimos desarrollando fuertemente diferentes líneas de investigación promoviendo la inclusión de conceptos de Biología Estructural en las mismas, así como la formación de recursos humanos en el área, y la inclusión de estas herramientas en las distintas actividades de enseñanza tanto de grado como de posgrado.

    Además, cabe destacar que desde el 2019 vengo trabajando en la consolidación y puesta en marcha del Programa de Alimentos y Salud Humana. Este Programa, ya en marcha, significa un gran hito para la Facultad de Medicina, significando la remodelación de cientos de metros cuadrados de su planta edilicia, instalación de nuevos grupos de investigación en el área, formación de recursos humanos especializados, así como nuevas oportunidades de vinculación con el sector productivo. Durante los próximos años continuaré trabajando en este sentido, apoyando distintas tareas referidas al Programa, en particular en la coordinación del recientemente aprobado programa de posgrado: Maestría en Ciencias de los Alimentos y Salud Humana.

    En lo que respecta a la labor de Extensión, soy parte de la Comisión de Divulgación Científica de la FMed, Udelar desde el 2023. Desde allí fomentamos y coordinamos una serie de actividades que permitan difundir la actividad científica de nuestra institución y su relacionamiento con la sociedad, en particular distintas instituciones educativas de primaria y secundaria. Destaco aqui la organización a cago de la Comisión nombrada, de las Jornadas anuales de "Medicina Investiga", una feria de ciencias que permite poner en conocimiento la gran variedad de líneas de investigación de la Facultad.

    
    

    
    

• Indicadores de producción

  Actividades	33
  Líneas de investigación	2
  Proyectos Investigación Desarrollo	8
  Docencia	13
  Extensión	6
  Gestión Académica	3
  Otra Actividad Técnica	1
  Producción bibliográfica	64
  Artículos publicados en revistas científicas	56
  Completo	56
  Libros y Capítulos	4
  Capítulos de libro publicado	4
  Textos en periódicos	4
  Periodicos	4
  Otros tipos	4
  Producción técnica	4
  Evaluaciones	28
  Evaluación de proyectos	5
  Evaluación de eventos	3
  Evaluación de publicaciones	8
  Evaluación de convocatorias concursables	1
  Jurado de tesis	11
  Formación RRHH	8
  Tutorías/Orientaciones/Supervisiones concluidas	5
  Tesis de maestria	2
  Iniciación a la investigación	2
  Tesis de doctorado	1
  Tutorías/Orientaciones/Supervisiones en marcha	3
  Tesis de doctorado	2
  Iniciación a la investigación	1