• Datos Generales

    • Institución principal

      Institut Pasteur de Montevideo/ Institut Pasteur de Montevideo / Uruguay
    • Dirección institucional

      Institución: Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas
      Dirección: Mataojo 2020 / 11400
      País: Uruguay / Montevideo / Montevideo
      Teléfono: (00598) 2522 0910*
      Correo electrónico/Sitio Web: csalazar@pasteur.edu.uy https://pasteur.uy/
  • Formación

    • Formación académica

      • Concluida

        • Doctorado

          • Doctorado en Ciencias Biológicas (PEDECIBA) (2018 - 2023)
            Institut Pasteur de Montevideo - Institut Pasteur de Montevideo, Laboratorio de Genómica Microbiana , Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Utilización de tecnologías de secuenciación de tercera generación para la caracterización de microorganismos
            Tutor/es: Gregorio Manuel Iraola
            Obtención del título: 2024
            Palabras Clave: Oxford Nanopore Genómica microbiana Perfiles taxonómicos Marcadores moleculares Pipelines
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica y marcadores moleculares
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Secuenciación de tercera generación (ONT)

          Maestría

          • Maestría en Ciencias Biológicas / Biología Celular y Molecular - PEDECIBA (2013 - 2017)
            Universidad de la República - Facultad de Ciencias, Unidad de Biología Parasitaria , Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Estudios de las propiedades inmunogénicas de la Leucina Aminopeptidasa de Fasciola hepatica: contribución de la estructura cuaternaria y evaluación de su capacidad transportadora de péptidos
            Tutor/es: Carlos Carmona García y José F. Tort
            Obtención del título: 2017
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
            Universidad de la República / Comisión Sectorial de Investigación Científica , Uruguay
            Palabras Clave: Fasciola hepatica predicción de epítopes inmunoensayos experimentación animal proteínas recombinantes
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Vacunas
        • Grado

          • Licenciatura en Bioquímica (2005 - 2013)
            Universidad de la República - Facultad de Ciencias, Unidad de Biología Parasitaria - Instituto de Higiene , Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Estudios sobre los mecanismos humorales asociados a protección de una vacuna recombinante contra la fasciolosis ovina
            Tutor/es: Carlos Carmona García
            Obtención del título: 2013
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación / Agencia Nacional de Investigación e Innovación , Uruguay
            Palabras Clave: Fasciola hepatica vacunas veterinarias proteínas recombinantes inmunoensayos
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Evaluación de respuesta humoral frente a la vacunación
    • Formación complementaria

      • Concluida

        • Cursos de corta duración

          • Microbial metagenomics: A 360o approach (06/2019 - 06/2019)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / European Molecular Biology Organization , Alemania
            40 horas
            Palabras Clave: Metagenómica Bioinformática Taxonomía
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Metagenómica
          • Singapore Nanopore Camp (09/2018 - 09/2018)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Institución Extranjera / Genome Institute of Singapore , Singapur
            40 horas
            Palabras Clave: Oxford Nanopore Genómica Bioinformática
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica Microbiana
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Análisis de datos de secuenciación ONT
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Secuenciación ONT
          • Curso CABBIO: VII Curso Avançado em Biologia Celular de Patógenos. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz- FIOCRUZ. Salvador de Bahia, Brasil (07/2016 - 07/2016)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Fundação Oswaldo Cruz , Brasil
            40 horas
            Palabras Clave: Biología celular Bioquímica Inmunología Enfermedades olvidadas
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Interacción hospedero-patógeno
          • Señales de transducción que participan en la regulación del crecimiento celular (01/2015 - 01/2015)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Facultad de Medicina de UBA / Departamento de Química Biológica , Argentina
            48 horas
            Palabras Clave: Cultivo celular Citometría de flujo Quimioluminisencia
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Métodos de Investigación en Bioquímica / Señales de transducción
          • Desmitificando la clonación, bioinformática y banco de datos usando parásitos como modelo (01/2014 - 01/2014)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Veterinaria , Uruguay
          • Curso CABBIO: Desenvolvimento inovador de vacinas e métodos de diagnóstico de enfermidades animais (01/2014 - 01/2014)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Centro Argentino brasileño de Biotecnología / Universidade Católica Dom Bosco , Brasil
            48 horas
            Palabras Clave: Vacunas Diagnóstico ELISA
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Métodos moleculares de diagnóstico
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Métodos de Investigación en Bioquímica / Desarrollo racional de vacunas veterinarias
          • Producción, purificación y caracterización estructural de proteínas (10/2013 - 10/2013)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
            90 horas
            Palabras Clave: proteínas recombinantes sistemas de expresión purificación de proteínas
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Métodos de Investigación en Bioquímica / Expresión, purificación y caracterización de proteínas recombinantes
          • Interacciones entre los parásitos y el sistema inmune del hospedador. Uso de modelos animales para su investigación. (01/2013 - 01/2013)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Veterinaria , Uruguay
            48 horas
            Palabras Clave: Inmunología Cultivo celular Parasitología
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Experimentación animal
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Métodos de Investigación en Bioquímica / Biología celular
          • Sistemas de expresión de proteínas. Desde el diseño del vector al primer escalado (01/2013 - 01/2013)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
            60 horas
            Palabras Clave: proteínas recombinantes sistemas de expresión escalado de producción
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Producción de proteínas recombinantes
          • Curso Básico de Cultivo de Células (01/2013 - 01/2013)
            Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
            Palabras Clave: Técnicas de cultivo celular
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Cultivo celular
          • Uso y manejo de Animales de Laboratorio (01/2013 - 01/2013)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Química , Uruguay
            Palabras Clave: modelos murinos experimentación animal acreditación
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Experimentación animal
          • Proteoma de parásitos. Fundamentos y Aplicaciones (01/2012 - 01/2012)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
            25 horas
            Palabras Clave: Proteómica Electroforesis en 2 dimensiones Espectrometría de masas
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Parasitología
        • Participación en eventos

          • Segunda jornada conjunta de actualización en resistencia a antibióticos en el marco "Una Salud" (2025)
            Tipo: Encuentro
            Institución organizadora: Instituto de Higiene - Facultad de Medicina, Uruguay
            Alcance geográfico: Nacional
            Palabras Clave: Una Salud resistencia a antibióticos
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Epidemiología / Resistencia antimicrobiana
          • 3ras Jornadas de Actualización en Parasitología y Micología (2018)
            Tipo: Encuentro
            Institución organizadora: Cátedra de Parasitología - Facultad de Medicina, Uruguay
            Palabras Clave: Microbioma Vacunas Fasciola hepatica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Vacunas
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma
          • Workshop on Immunological Tools and Livestock Infection Models (2017)
            Tipo: Taller
            Institución organizadora: Universidad de Las Palmas de Gran Canaria (Instituto de Sanidad Animal), España
            Palabras Clave: inmunoensayos Inmunidad de rumiantes
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Inmunología
          • XXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Parasitología- XXIII Congreso Latinoamericano de Parasitología (2015)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: CSBP/FLAP, Brasil
            Palabras Clave: Parasitologia
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Parasitología
          • 8vas Jornadas de la SBBM (2013)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: SBBM, Uruguay
            Palabras Clave: Vacunas Fasciola hepatica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Vacunas
          • 6tas. Jornadas de la SBBM (2009)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: SBBM, Uruguay
            Palabras Clave: Bioquímica, Biología Molecular
          • Congreso Uruguayo de Bioquímica Clínica (2009)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Asociación de Bioquímica Uruguaya, Uruguay
            Palabras Clave: bioquímica, clínica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Enfermedades Infecciosas /
      • En marcha

        • Posdoctorados

          • Del intestino al agua pasando por el suelo y viceversa: descubriendo las vías de diseminación de las comunidades microbianas asociadas a la ganadería. (2024)
            Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
            Financiación:
            Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria / INIA , Uruguay
            Palabras Clave: metagenomica salud animal microbioma
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Metagenómica
  • Idiomas

    • Inglés
      Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien
    • Portugués
      Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe bien
  • Areas de actuación

    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias Biológicas /Bioquímica y Biología Molecular /Evaluación de antígenos vacunales contra la fasciolosis en especies productivas
    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias Biológicas /Bioquímica y Biología Molecular /Aplicaciones de la tecnlogía Oxford Nanopore de secuenciación
    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias Biológicas /Bioquímica y Biología Molecular /Genómica microbiana
    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias de la Computación e Información /Ciencias de la Información y Bioinformática /Estudio del microbioma asociado al ambiente agropecuario
    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias Biológicas /Biología Celular, Microbiología /Microorganismos del ambiente
    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias de la Computación e Información /Ciencias de la Información y Bioinformática /Metagenómica aplicada al estudio del microbioma asociado al ambiente agropecuario y animales de prod
  • Actuación profesional

    • Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas - Institut Pasteur de Montevideo - Uruguay

      Institut Pasteur de Montevideo

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (09/2025 - a la fecha)
          Postdoc 20 horas semanales
          Contrato de investigadora posdoctoral por proyecto INIA-FPTA
        • Funcionario/Empleado (03/2024 - 08/2025)Trabajo relevante
          Postdoc 40 horas semanales
          Contrato de investigadora posdoctoral por proyecto INIA-FPTA
      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • Dinámica de diseminación microbiana entre animales de producción, suelo y agua (03/2024 - a la fecha )
            La diversidad de interacciones ambiente-animal-humano generan distintas oportunidades de dispersión microbiana contribuyendo a moldear el microbioma asociado con las poblaciones humanas y animales, así como con distintos ambientes. La presente plantea generar conocimiento y contribuir en la caracterización del microbioma asociado a sistemas de producción ganadera, identificando patógenos y profundizando en la caracterización de los genes de resistencia que circulan en animales de producción, suelos y aguas. Proyecto INIA-FPTA: Del intestino al agua pasando por el suelo y viceversa: descubriendo las vías de diseminación de las comunidades microbianas asociadas a la ganadería.
            Fundamental
            20 horas semanales
            Institut Pasteur de Montevideo , Integrante del equipo
            Equipo: SALAZAR C. , RODRÍGUEZ S. , FERNÁNDEZ-CALERO T , Fresia P , NAYA H , ROBELLO, C.
            Palabras clave: Una Salud microbioma metagenómica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Metagenómica
        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • Desarrollo de herramientas de aprendizaje automático para comprender el microbioma de la piel (07/2025 - a la fecha)
            Código: ART_X_2024_1_184820 El microbioma de la piel es un área de estudio muy reciente. El proyecto plantea la realización de nuevas herramientas para profundizar en esta área.
            10 horas semanales
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            Equipo: RIERA NADIA (Responsable) , PIATTONI V. , SALAZAR C. , GIMÉNEZ M.
            Palabras clave: microbioma piel
          • Virología y metagenómica aplicadas en el ecosistema antártico: un enfoque clínico y ambiental hacia Una Salud (10/2025 - a la fecha)
            Código: FSIA_1_2024_1_185519 El estudio de la microbiota asociada a aves marinas y al entorno antártico resulta fundamental para comprender la interacción entre virus y comunidades microbianas, así como su impacto en ecosistemas. La aplicación de herramientas metagenómicas permitirá identificar patrones de coexistencia entre microorganismos y virus, contribuyendo al conocimiento de la ecología microbiana en ambientes extremos y su posible implicancia en la salud de las poblaciones animales.
            5 horas semanales
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            Equipo: CRISTINA, J. (Responsable) , Irene Ferreiro (Responsable) , REY S. , MORENO P , Natalia Echeverria , HURTADO J. , No , Juan Gandioli , COSTÁBILE, A , Josefina Vera , RIERA NADIA , SALAZAR C.
            Palabras clave: Virus metagenómica Una Salud
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Virología molecular
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Comunidades microbianas
          • Caracterización genómica poblacional y fenotípica de Catenibacterium (03/2025 - 03/2026 )
            Código: FCE_3_2024_1_181100 Este proyecto propone describir desde el punto de vista genómico el género Catenibacterium y su diversidad genética
            2 horas semanales
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Pregrado:1
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: GIMÉNEZ M. (Responsable) , COSTA, D. (Responsable) , PEÑALBA F. , SALAZAR C. , RIERA NADIA , DAGHERO H.
            Palabras clave: Genómica Pangemoma MAG
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
    • Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

      Pro Rectorado de Investigación / Instituto de Investigación Una Salud

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (08/2025 - a la fecha)Trabajo relevante
          Profesora Adjunta 40 horas semanales
          Escalafón: Docente
          Grado: Grado 3
          Cargo: Contratado
      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • Rutas de propagación de patógenos y genes de resistencia a antimicrobianos en sistemas agropecuarios: un enfoque integral basado en metagenómica (08/2025 - a la fecha )
            El uso extensivo de antibióticos en la producción animal representa un desafío sanitario de elevada relevancia que demanda un abordaje integral bajo el enfoque de Una Salud. Las limitaciones en la detección temprana de patógenos y de la resistencia a los antimicrobianos (RAM), favorece su diseminación ambiental y dificulta la implementación de respuestas oportunas y eficaces. En este contexto, se aplican metodologías metagenómicas para caracterizar el resistoma, el viruloma y el plasmidoma presentes en muestras fecales, así como para evaluar su co-ocurrencia con especies patógenas. De este modo, se busca contribuir al desarrollo y validación de métodos independientes de cultivo como estrategias de detección molecular orientadas a la identificación rápida y precisa tanto de patógenos como de determinantes de RAM. En conjunto, estos aportes permitirán fortalecer el conocimiento sobre el rol de los animales de producción como reservorios y diseminadores de la resistencia a los antimicrobianos.
            Mixta
            20 horas semanales
            Instituto de Investigación Una Salud e Institut Pasteur de Montevideo , Integrante del equipo
            Equipo: SALAZAR C. , RODRÍGUEZ S. , NAYA H , ROBELLO, C. , FERNÁNDEZ-CALERO T , Fresia P
            Palabras clave: microbioma resistoma mobiloma
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Metagenómica
        • Docencia

          • Doctor en Veterinaria (03/2026 - a la fecha)
            Grado
            Invitado
            Asignaturas:
            EFI: Vigilancia de Chlamydia psittaci en ambientes urbanos: integración de salud animal, humana y ambiental, 60 horas, Teórico-Práctico
          • PEDECIBA (03/2026 - a la fecha)
            Maestría
            Organizador/Coordinador
            Asignaturas:
            Una sola Salud: comprendiendo el estrecho vínculo entre la salud humana, animal y ambiental, 54 horas, Teórico
        • Extensión

          • Extensión en Clave de Una Salud: Taller participativo de sensibilización de zoonosis en policlínico veterinario de la sede CENUR Litoral Norte - Salto. Visita al barrio Ceibal. (11/2025 - 11/2025 )
            Actividad previa al Congreso Uruguayo en Una Salud - I Jornada Académica del Instituto de Investigación Una Salud 2 horas
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / NO CORRESPONDE / Taller de sensibilización y actividad en territorio
          • Taller participativo de sensibilización: Murciélagos como especie mamíferos y su ecología. Importancia zoonótica y Epidemiología de la Rabia (11/2025 - 11/2025 )
            Actividad previa al Congreso Uruguayo en Una Salud - I Jornada Académica del Instituto de Investigación Una Salud 2 horas
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ecología / Murciélagos
            Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / NO CORRESPONDE / Zoonosis
            Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Epidemiología / Rabia
          • Participación de uno de los talleres con estudiantes del Espacio de Formación Integral: Salud y producción lechera junto a las Familias Productoras de Colonia Damón (10/2025 - 10/2025 )
            Facultad de Veterinaria, Unidad de Microbiología
            2 horas
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Agrícolas / Ciencias Veterinarias / NO CORRESPONDE / Talleres de discusión
        • Otra actividad técnico-científica relevante

          • Participación del Comité Organizador del l Congreso Uruguayo en Una Salud - I Jornada Académica del Instituto de Investigación Una Salud (08/2025 - 12/2025 )
            Instituto de Investigación Una Salud
            2 horas semanales
          • Participante del Comité organizador de las Jornadas de integración entre docentes del Instituto de Investigación Una Salud (08/2025 - 09/2025 )
            Insituto de Invetigación Una Salud
            5 horas semanales
        • Gestión Académica

          • Integrante del Comité de Gobernanza y Funcionamiento (08/2025 - a la fecha )
            Instituto de Investigación en Una Salud
            Participación en consejos y comisiones
          • Integrante de la Comisión de Educación Comunitaria y Sensibilización (08/2025 - a la fecha )
            Instituto de Investigación Una Salud
            Participación en consejos y comisiones
          • Integrante del Comité para el establecimiento de Programas de Formación en Una Salud (08/2025 - a la fecha )
            Instituto de Investigación Una Salud
            Participación en consejos y comisiones
          • Integrante de la Comisión de Apoyo al Desarrollo de Jóvenes Investigadores (08/2025 - a la fecha )
            Instituto de Investigación Una Salud
            Participación en consejos y comisiones
    • Sector Educación Superior/Público - Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas - Uruguay

      Área Biología (PEDECIBA)

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (08/2024 - a la fecha)
      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • Helmintos y microbioma (07/2025 - a la fecha )
            Los helmintos intestinales, comunes en especies productivas como bovinos, ovinos, ejercen una influencia significativa sobre el microbioma intestinal del hospedador. Estas infecciones modifican la diversidad y función del ecosistema microbiano, alterando rutas metabólicas y afectando la eficiencia alimentaria, la inmunidad y el rendimiento productivo de los animales. Al interferir con la homeostasis intestinal, los helmintos predisponen al hospedador a infecciones bacterianas secundarias, lo que con frecuencia conduce al uso de antimicrobianos en la producción animal. El uso repetido y, en muchos casos, preventivo de antibióticos incrementa la presión selectiva hacia bacterias resistentes, un fenómeno de gran preocupación bajo el enfoque de Una Salud. Desde la perspectiva de la salud animal, un control inadecuado de los helmintos, y las infecciones bacterianas secundarias que generan, compromete el bienestar y la productividad. Esta línea de investigación busca entender la co-ocurrencia entre familias de helmintos y especies patógenas a nivel de la microbiota intestinal del ganado bovino y ovino. Para ello se analizan datos de secuenciación de microbiota animal (metabarcoding y metagenómica shotgun) en repositorios públicos como generados por el grupo de trabajo.
            Mixta
            2 horas semanales , Coordinador o Responsable
            Equipo: SALAZAR C. , MAGGIOLI G
            Palabras clave: helmintos microbioma metagenómica metabarcoding antimicrobianos
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma de especies productivas
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Análisis de datos
        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • Helmintos y microbioma: una aproximación molecular integrada (07/2025 - a la fecha)
            Código: Despegue Científico En este proyecto se buscan marcadores moleculares con alto nivel discriminatorio a nivel de familia. Los marcadores moleculares se evaluarán in silico. Se esperan obtener cebadores para la detección de las familias más relevantes de helmintos gastrointestinales para su detección a través de la secuenciación de amplicones con tecnología de lecturas largas Oxford Nanopore Technologies.
            2 horas semanales
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            Financiación:
            Área Biología (PEDECIBA), Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: SALAZAR C. (Responsable)
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Análisis de datos genómicos y datos de secuenciación
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Secuenciación Oxford Nanopore
        • Docencia

          • PEDECIBA Biología (09/2025 - 09/2025 )
            Maestría
            Invitado
            Asignaturas:
            Taller de análisis de datos de metabarcoding, 20 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Análisis de datos 16S con plataformas de segunda generación: Illumina
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Análisis de datos en R: DADA2 y Phyloseq
          • PEDECIBA Biología (06/2025 - 06/2025 )
            Maestría
            Invitado
            Asignaturas:
            ENFERMEDADES VIRALES EMERGENTES Y TRANSFRONTERIZAS DE LOS ANIMALES. BASES BIOLÓGICAS Y MOLECULARES PARA SU DIAGNÓSTICO, MONITOREO Y CONTROL,, 2 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Uso de la secuenciación Oxford Nanopore Technologies para la caracterización de microorganismos en t
          • PEDECIBA Biología (11/2024 - 11/2024 )
            Maestría
            Responsable
            Asignaturas:
            Curso teórico-práctico de introducción a la secuenciación con tecnología Oxford Nanopore Technologies para la caracterización de microorganismos, 40 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Secuenciación con tecnología de tercera generación : Plataforma Oxford Nanopore
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Análisis de datos de genómica microbiana
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Resistencia antimicrobiana de Klebsiella pneumoniae
    • Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas - Institut Pasteur de Montevideo - Uruguay

      Laboratorio de Genómica Microbiana

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (09/2021 - 02/2023)Trabajo relevante
          40 horas semanales
        • Funcionario/Empleado (09/2020 - 08/2021)
          Investigador Asistente 40 horas semanales
        • Funcionario/Empleado (07/2017 - 08/2020)
          Investigador Asistente 25 horas semanales
      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • Vigilancia genómica de SARS-CoV-2 en Uruguay (03/2020 - 04/2023 )
            Desde el comienzo de la emergencia sanitaria en marzo de 2020 causada por la COVID-19, he participado activamente en la caracterización genómica de las variantes de SARS-CoV-2 en el ámbito nacional. Inicialmente, nuestro grupo de trabajo logró generar las primeras secuencias de genomas a partir de muestras positivas de Uruguay. Posteriormente, consolidé mi participación en el Grupo de Trabajo Interinstitucional (GTI) de vigilancia genómica de SARS-CoV-2 desde inicios del 2021. Este grupo ha informado regularmente a las autoridades sobre las variantes circulantes en nuestro país, y mi contribución ha abarcado desde la generación hasta el análisis de los datos de secuenciación. En este contexto, también he participado en el desarrollo de una metodología de relevamiento de variantes basada en el gen S del virus. A su vez, llevé adelante la instalación y certificación de la plataforma de secuenciación GridION X5 de Oxford Nanopore Technologies, convirtiéndose en el primer equipo certificado como proveedor de servicios en Sudamérica. Dentro de este marco, también participé activamente en la capacitación del personal técnico, abarcando desde la preparación de bibliotecas de secuenciación hasta el manejo del equipo.
            Aplicada
            5 horas semanales
            Centro de Innovación en Vigilancia Epidemiológica (CIVE) , Integrante del equipo
            Equipo: SALAZAR C. , GTI
            Palabras clave: Vigilancia genómica SARS-CoV-2 Oxford Nanopore Technologies Genómica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas / Secuenciación de tercera generación
          • Evolución, epidemiología genómica y dinámica de determinantes genéticos de resistencia a antibióticos a partir de aislamientos clínicos (12/2018 - 02/2023 )
            Tanto en el marco de mi investigación doctoral como en colaboración con equipos de investigación locales, me he desempeñado en la generación de genomas bacterianos de alta resolución a partir de aislamientos clínicos, utilizando tanto tecnologías de secuenciación de tercera como de segunda generación, en particular de Oxford Nanopore Technologies e Illumina. En este contexto, hemos explorado la diseminación de patógenos humanos al ambiente, centrándonos, en el caso de Klebsiella pneumoniae resistente al carbapenem (CR-Kp), un patógeno vinculado a infecciones nosocomiales e individuos inmunocomprometidos, capaz de colonizar de forma asintomática el tracto gastrointestinal de personas sanas. A través de la combinación de la genómica de alta resolución y la metagenómica shotgun fue posible identificar el clon de CR-Kp en el entorno urbano. Asimismo, hemos caracterizado el primer genoma de Sudamérica de K. pneumoniae ST15 portando el gen OXA-48, que confiere resistencia a múltiples antibióticos betalactámicos.
            Mixta
            20 horas semanales
            Laboratorio de Genómica Microbiana , Integrante del equipo
            Equipo: SALAZAR C. , Giménez, M. , ANTELO V. , GALIANA A. , GRILL F. , VIEYTES M. , RIERA N. , PARADA A. , PUIG J. , D'ALESSANDRO B. , RISSO J. , IRAOLA G.
            Palabras clave: Genómica Oxford Nanopore resistencia a antimicrobianos microbioma urbano
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica Microbiana
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Secuenciación y análisis de datos genómicos de microorganismos
          • Desarrollo de porefile: un pipeline de análisis de datos de secuenciación obtenidos a partir del gen 16S completo (07/2019 - 02/2023 )
            Con la aparición de las tecnologías de secuenciación de Oxford Nanopore Technologies (ONT), uno de los nichos aún poco explorados es en el desarrollo de herramientas destinadas al análisis de datos provenientes de la secuenciación del gen 16S de ARNr. La secuenciación parcial del gen 16S ha sido fundamental para la obtención de perfiles taxonómicos en comunidades complejas, aunque las clasificaciones raramente van más allá del nivel de género. En contraste, las tecnologías de secuenciación de tercera generación, como las de ONT y PacBio, han simplificado la obtención de secuencias del gen completo 16S, permitiendo clasificaciones a nivel de especie. Sin embargo, debido a los niveles de error asociados con estas plataformas, resulta necesario generar estrategias de análisis alternativas a las empleadas para los datos de secuenciación parcial del gen 16S obtenidos mediante plataformas de segunda generación. En este contexto, surge porefile, una herramienta automatizada diseñada para el preprocesamiento de lecturas de secuenciación ONT y la clasificación taxonómica basada en el algoritmo LCA (Lower Common Ancestor).
            Aplicada
            10 horas semanales
            Laboratorio de Genómica Microbiana , Integrante del equipo
            Equipo: SALAZAR C. , FERRÉS I. , GIMÉNEZ M. , IRAOLA G.
            Palabras clave: 16S ONT pipeline
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Pipelines automatizados
          • Caracterización de microorganismos en ambientes urbanos (01/2018 - 10/2018 )
            La presencia de comunidades microbianas en aguas constituye un reservorio tanto de patógenos como de determinantes de resistencia a antimicrobianos que pueden afectar la salud humana y animal. En este sentido hemos analizado mediante metodologías de secuenciación masiva y técnicas de microbiología la composición de aguas con distinto grado de impacto humano, ya sea aguas costeras de uso recreacional como aguas de saneamiento. A su vez, hemos generado una colección de microorganismos obtenidos a partir de éstos ambientes. Más recientemente hemos comnezado la exploración del microbioma en especies productivas.
            Mixta
            5 horas semanales
            Laboratorio de Genómica Microbiana , Integrante del equipo
            Equipo: ANTELO V. y/o Verónica Antelo , SALAZAR C. , MARTÍNEZ A. , IRAOLA G. , CASTRO M. , BETANCOR L , BARCALA MV. , MIGUEZ D. , GONNET G.
            Palabras clave: Biobanco cultivo colección MALDI-TOF
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Aislamientos
        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • Desarrollo de una vacuna recombinante contra Fasciolosis en ovejas utilizando como adyuvante nanopartículas basadas en saponinas de Quillaja brasiliensis (07/2020 - 02/2023 )
            La infección causada por Fasciola hepatica produce un impacto negativo significativo en rumiantes a nivel local y global. Nuestro grupo de investigación ha acumulado evidencia sobre la efectividad inmunoprotectora de leucin aminopeptidasa 1 (FhLAP1), una metaloproteasa multimérica asociada al tubo digestivo del parásito. La enzima recombinante ha sido expresada en forma funcional en Escherichia coli y los resultados de un importante ensayo de vacunación llevado a cabo en ovinos machos confirman su potencial protector, siendo capaz de inducir niveles de protección en el rango de aplicación comercial. En este contexto, la presente propuesta tiene como objetivos principales: a) Determinar su potencial inmunoprotector en ovinos machos y hembras formulada con nanopartículas basadas en saponinas de Quillaja brasiliensis, perteneciente a la flora nativa uruguaya, b) Definir la contribución de un nuevo antígeno recombinante en la inducción de una respuesta protectora contra fasciola y c) Profundizar en los aspectos inmunológicos desarrollados por estas formulaciones en rumiantes. Rol: Integrante del equipo
            5 horas semanales
            Instituto de Higiene , Unidad de Biologia Parasitaria
            Investigación
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Doctorado:1
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: MAGGIOLI G. (Responsable) , CHECA J. , SILVEIRA F. , SALAZAR C. , CARMONA C. , TORT JF. , RIVERA M. , ALONZO P. , ROSSI A.
            Palabras clave: Fasciolosis Adyuvantes
          • Centro Uruguayo de Metagenómica (07/2017 - 05/2020 )
            Aplicación de la metagenómica para el análisis microbiológico de ambientes urbanos y productivos.
            25 horas semanales
            Instiut Pasteur de Montevideo
            Investigación
            Integrante del Equipo
            Concluido
            RRHH formados en el proyecto:
            Maestría/Magister prof:2
            Doctorado:1
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: IRAOLA G. (Responsable) , GONNET G. (Responsable) , FRESIA P. , ANTELO V. , GIMENEZ G. , SALAZAR C.
            Palabras clave: Metagenómica AMR
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
        • Docencia

          • Hands-on International Course: Molecular, genomic and metagenomic tools to combat antimicrobial resistance. (12/2019 - 12/2019 )
            Perfeccionamiento
            Invitado
            Asignaturas:
            Responsable de laboratorio práctico: Preparación de bibliotecas Oxford Nanopore Technologies de aislamientos bacterianos, 6 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Genómica microbiana
        • Otra actividad técnico-científica relevante

          • Certificación (CSP program) Oxford Nanopore (02/2021 - 02/2023 )
            Centro de Innovación y Vigilancia Epidemiológica (CIVE) 5 horas semanales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Oxford Nanopore Technologies
    • Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

      Facultad de Medicina / Instituto de Higiene

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (07/2015 - 12/2018)
          Asistente contratado 30 horas semanales
          Investigador Asistente contratado en el contexto del proyecto PARAGONE: vaccines for animal parasites del programa Horizon 2020 de la Unión Europea.
          Escalafón: Docente
          Grado: Grado 2
          Cargo: Contratado
        • Funcionario/Empleado (07/2012 - 06/2015)
          Secretaria Académica del Depto. de Desarrollo Biotecnológico 35 horas semanales
          Las tareas se centraron en brindar apoyo académico en la realización de cursos nacionales e internacionales, semianrios y otras actividades académicas en el Depto. de Desarrollo Biotecnológico del Instituto de Higiene
          Escalafón: Docente
          Grado: Grado 2
          Cargo: Contratado
        • Funcionario/Empleado (04/2014 - 05/2015)
          Ayudante contratado 25 horas semanales
          Escalafón: Docente
          Grado: Grado 1
          Cargo: Contratado
      • Actividades

        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • PARAGONE: vaccines for animal parasites (07/2015 - 12/2018 )
            Paragone Project. Union Europea- Horizonte 2020. Programa de investigación e innovación. Ref. H2020- EU.3.2
            30 horas semanales
            Depto. de Genética y Unidad de Biología Parasitaria-Instituto de Higiene
            Investigación
            Integrante del Equipo
            Concluido
            Equipo: CARMONA, C. (Responsable) , TORT J. (Responsable) , MAGGIOLI G. , FOSSA F , DOMINGUEZ F. , SALAZAR C.
            Palabras clave: Vacuna recombinante Fasciola hepatica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Parasitología Molecular
          • Evaluación de la respuesta inmunológica asociada a LAP1 y LAP2 de Fasciola hepatica en un modelo murino (04/2018 - 12/2018 )
            La infección causada por Fasciola hepatica produce un impacto negativo significativo en la producción bovina a nivel local y global. Nuestro grupo de investigación ha acumulado evidencia sobre la efectividad inmunoprotectora de leucin aminopeptidasa 1 (FhLAP1), una metaloproteasa multimérica asociada al tubo digestivo del parásito. La enzima recombinante ha sido expresada en forma funcional en Escherichia coli y los resultados de un importante ensayo de vacunación llevado a cabo en ovinos confirman su potencial protector, siendo capaz de inducir niveles de protección en el rango de aplicación comercial. En este contexto, la presente propuesta tiene como objetivos principales: a) expresar de forma funcional la FhLAP2 recombinante del mismo parásito con el fin de identificar su posible rol en la interfase huésped-parásito y b) profundizar en los aspectos inmunológicos desarrollados por el antígeno FhLAP1 y FhLAP2 en un modelo de infección experimental murino. Responsable Técnico - Científico: Dra. Gabriela Maggioli. Rol: Co-responsable Co-Responsable Técnico-Científico. Período: 04/2018-04/2020.
            10 horas semanales
            Unidad de Biología Parasitaria , Instituto de Higiene
            Investigación
            Integrante del Equipo
            Concluido
            RRHH formados en el proyecto:
            Maestría/Magister:1
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: MAGGIOLI G. (Responsable) , SALAZAR C. , CARMONA C. , TORT J. , BERASAIN P. , Checa, J. , SILVEIRA LF.
            Palabras clave: Fasciola hepatica leucina aminopeptidasa vacunas
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Proteinas recombinantes
          • Estudios sobre el rol en la inmuno-estimulación humoral de mucosas de una leucina aminopeptidasa de Fasciola hepatica en un modelo murino. (04/2014 - 10/2015 )
            Dentro de los diferente estudios llevados a cabo por nuestro grupo de trabajo se ha generado evidencia de que una leucina aminopeptidasa de Fasciola hepatica (FhLAP1) implicada en procesos de metabolismo del parásitio, podría actuar como un potencial antígeno vacunal en su forma recombinante debido a los altos niveles de protección alcanzados en el hospedero ovino luego de la infección experimental con F. hepatica. Debido a que parásito ingresa al hospdero a través de la mucosa intestinal del duodeno, el proyecto plantea determinar si FhLAP1 induce una respuesta de anticuerpos detectable a nivel de suero luego de la administración del antígeno vía mucosa.
            25 horas semanales
            Instituto de Higiene - FCien , Unidad de Biología Parasitaria
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            Concluido
            RRHH formados en el proyecto:
            Maestría/Magister:1
            Financiación:
            Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: SALAZAR C. , CARMONA, C.
            Palabras clave: Inmunidad de mucosas Parasitología
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Inmunidad
        • Otra actividad técnico-científica relevante

          • Co-responsable de Proyecto PCET-Malur "Estaciones de Trabajo Seguras: Prevención de Riesgos químicos y posturales en el laboratorio de la Unidad de Biología Parasitaria" (12/2016 - 06/2017 )
            Instituto de Higiene -FCien, Unidad de Biología Parasitaria
            5 horas semanales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Salud Ocupacional / Seguridad en el Laboratorio
          • Responsable de Proyecto PCET-Malur "Mejoras en la Bioseguridad en el Laboratorio de Biología Parasitaria" (06/2012 - 06/2013 )
            Instituto de Higiene - FCien, Unidad de Biología Parasitaria
            5 horas semanales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Salud Ocupacional / Seguridad en el Laboratorio
        • Gestión Académica

          • Parte del equipo de organizacaión local de los Cursos impartidos por Wellcome Trust - Sanger Institute en Uruguay (07/2012 - 06/2015 )
            Instituto de Higiene - Facultad de Medicina, Depto. de Desarrollo Biotecnológico
            Gestión de la Enseñanza 10 horas semanales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Biotecnología relacionada con la Salud / Biotecnología
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Análisis de datos
    • Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

      Facultad de Ciencias / Instituto de Higiene - Unidad de Biología Parasitaria

      • Vínculos con la Institución

        • Becario (08/2011 - 08/2012)
          Becaria ANII 20 horas semanales
          Escalafón: No Docente
          Cargo: Interino
      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • Parasitología molecular (08/2011 - 08/2012 )
            La Unidad de Biología Parasitaria (UBP) lleva adelante la investigación en Parasitología Molecular poniéndo énfasis en el estudio de los mecanismos de interacción hospedero- parásito, con la finalidad de contribuir al control de los parásitos en función de sus impactos sanitarios y/o productivos,
            20 horas semanales
            Instituto de Biología, Unidad de Biología Parasitaria-Instituto de Higiene , Otros
            Equipo: CARMONA C , BERASAIN P , MAGGIOLI G , BOTTINI G , SALAZAR C , FOSSA, F
            Palabras clave: Fasciola hepatica leucina aminopeptidasa Vacunas
  • Carga horaria

    • Carga horaria de docencia: 4 horas
    • Carga horaria de investigación: 40 horas
    • Carga horaria de formación RRHH: 4 horas
    • Carga horaria de extensión: 4 horas
    • Carga horaria de gestión: 8 horas
  • Producción científica/tecnológica

    • El progreso de las tecnologías de secuenciación de tercera generación ha representado un avance significativo en el área de la genómica microbiana. Estas tecnologías, como las de Oxford Nanopore Technologies (ONT) posibilitan la obtención rápida y asequible del ensamblado completo de genomas y elementos extracromosómicos de diversos microorganismos. 

      La introducción de tecnologías portátiles de secuenciación ONT también ha ampliado las capacidades para generar perfiles taxonómicos de comunidades en diferentes ambientes y aislamientos, a través de la secuenciación del gen completo 16S del ARNr, mejorando la resolución en la clasificación taxonómica. En este contexto, hemos desarrollado la herramienta porefile (Salazar C., Ferres I., Giménez M. & Iraola G., https://github.com/microgenlab/porefile), un pipeline que permite obtener información taxonómica de manera rápida y reproducible.

      La experiencia acumulada con la tecnología ONT permitió la generación de los primeros genomas de SARS-CoV-2 al inicio de la emergencia sanitaria por COVID-19 en Uruguay. Asimismo, he contribuido a la detección temprana de la Variante de Preocupación Alfa y el ingreso de la variante de preocupación Gamma al país en el contexto del Grupo de Trabajo Interinstitucional (GTI). El grupo también ha informado sobre la dinámica de los linajes circulantes en la primera parte de 2021 hasta mediados del 2023, reflejado en las publicaciones de distintas revistas internacionales arbitradas en ese período. Asimismo, he contribuido en el desarrollo de metodologías de relevamiento de SARS-CoV-2 en base al gen S viral (Salazar C. et al. 2023).

      En el ámbito de la investigación sobre la evolución, epidemiología genómica y dinámica de resistencia a antibióticos en aislamientos clínicos, el Laboratorio de Genómica Microbiana ha explorado la diseminación de patógenos humanos al ambiente. En este contexto he participado en el estudio retrospectivo de un brote intrahospitalario de Klebsiella pneumoniae, portador de multirresistencia, mediante la utilización de genómica de alta resolución. A través de métodos metagenómicos llevados adelante por el grupo se determinó la presencia del mismo clon en aguas urbanas (Salazar et al., 2022). Siguiendo un enfoque genómico similar, logramos obtener  el genoma de un aislamiento de K. pneumoniae ST-15 portador del gen OXA-48 (Salazar et al., 2022). 

      En la línea de Caracterización de microbiomas urbanos, nuestro grupo ha empleado metodologías de secuenciación shotgun para estudiar aguas de diversos ambientes (Fresia et al., 2019) y ha generado una colección de microorganismos obtenidos de estos ambientes (Antelo V. et al., 2018).

  • Producción bibliográfica

    • Artículos publicados

      • Arbitrados

        • Genetically divergent Francisella philomiragia associated with septic arthritis, Montevideo, Uruguay (Completo, 2023)
          RIERA N. , SALAZAR C. , RIVERA B. , GALIANA A. , DURÁN R. , PORTELA M , ANTELO V. , PI B. , GONZÁLEZ O. , IRAOLA G.
          New Microbes and New Infections, 2023
          Palabras clave: Oxford Nanopore
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 20522975
          DOI: 10.1016/j.nmni.2023.101210
          https://www.sciencedirect.com/journal/new-microbes-and-new-infections

        • A promising new target to control fasciolosis: Fasciola hepatica leucine aminopeptidase 2 (Completo, 2023)
          Checa J. , SALAZAR C. , Goyeche A. , Rivera M. , Silveira F. , Maggioli G.
          Veterinary Parasitology, 2023
          Palabras clave: Fasciola hepatica Trematoda Leucine aminopeptidase Metalloprotease Vaccine
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 03044017
          DOI: https://doi.org/10.1016/j.vetpar.2023.109959
          https://www.sciencedirect.com/journal/veterinary-parasitology

        • What have we learned from a case of convalescent plasma treatment in a two-time kidney transplant recipient COVID-19 patient? A case report from the perspective of viral load evolution and immune response (Completo, 2023)
          Aldunate F. , Fajardo A. , Ibañez N. , Rammauro F. , Daghero H. , Arce R. , Ferla D. , Pereira-Gomez M. , SALAZAR C. , Iraola G. , Pritsch O. , Hurtado J. , Tenzi J. , Bollati-Fogolín M. , Bianchi S. , Nin N. , Moratorio G. , Moreno P.
          Frontiers in Nephrology, 2023
          Palabras clave: COVID-19 kidney transplant convalescent plasma therapy SARS-CoV-2 molecular diagnosis
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 28130626
          DOI: 10.3389/fneph.2023.1132763
          https://www.frontiersin.org/journals/nephrology

        • Fast and cost-effective SARS-CoV-2 variant detection using Oxford Nanopore full-length spike gene sequencing (Completo, 2023)Trabajo relevante
          SALAZAR C. , Ferrés I. , Paz M. , Costábile A. , Moratorio G. , Moreno P. , Iraola G.
          Microbial Genomics, v.: 9 5 , 2023
          Palabras clave: SARS-CoV-2 spike gene Oxford Nanopore Technologies surveillance
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / TGS
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20575858
          DOI: 10.1099/mgen.0.001013
          https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/mgen

        • One-year monitoring SARS-CoV-2 RNA surface contamination in hospitals reveals no correlation with organic material and negative pressure as a limiting factor for contamination (Completo, 2023)
          Pereira-Gómez M , Arce R , Ferla D , Simón D , SALAZAR C. , Perbolianachis P , Costábile A , Fajardo A , Aldunate F , Nin N , Hurtado J , Iraola G , Moreno P , Moratorio G
          Heliyon, v.: 9 3 , 2023
          Palabras clave: SARS-CoV2 RNA Ct value Fomites Organic material dirtiness ATP measurements Negative pressure system Variant of concern
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas /
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 24058440
          DOI: https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2023.e13875
          https://www.cell.com/heliyon/home

        • Human microbiota drives hospital-associated antimicrobial resistance dissemination in the urban environment and mirrors patient case rates (Completo, 2022)Trabajo relevante
          SALAZAR C. , GIMÉNEZ M. , RIERA N. , PARADA A. , PUIG J. , GALIANA A. , GRILL F. , VIEYTES M. , MASON CE. , ANTELO V. , D'ALESSANDRO B. , RISSO J. , IRAOLA G.
          Microbiome, v.: 10:208 2022
          Palabras clave: Urban metagenomics Antimicrobial resistance Nanopore sequencing Carbapenem resistance Nosocomial outbreak KPC Urban wastewater
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica Microbiana
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Metagenómica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20492618
          DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-022-01407-8
          https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-022-01407-8#citeas

        • First detection and origin of multi-drug resistant Klebsiella pneumoniae ST15 harboring OXA-48 in South America (Completo, 2022)
          SALAZAR C. , ANTELO V. , VIEYTES M. , DÁVILA C. , GRILL F. , GALIANA A. , IRAOLA G.
          Journal of global antimicrobial resistance, v.: Volume 30, 2022
          Palabras clave: OXA-48 Carbapenem resistance Klebsiella pneumonia Multi-drug resistance Whole-genome sequencing
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica Microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 22137173
          DOI: https://doi.org/10.1016/j.jgar.2022.08.005

        • Case Report: Early Transcontinental Import of SARS-CoV-2 Variant of Concern 202012/01 (B.1.1.7) From Europe to Uruguay (Completo, 2021)
          SALAZAR C. , COSTÁBILE, A , FERRÉS I. , PERBOLIANACHIS, P , Pereira-Gómez, M , Diego Simón , A.Galiana , Pi, B , ANTELO V , García, R , Moreno, P , Moratorio, G , IRAOLA G.
          Frontiers in Virology, 2021
          Palabras clave: SARS-CoV-2 Case report
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Virología molecular
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 2673818X
          DOI: 10.3389/fviro.2021.685618

        • Recurrent Dissemination of SARS-CoV-2 Through the Uruguayan - Brazilian Border (Completo, 2021)
          MIR D , REGO N. , Resende, PC , Tort, F , FERNÁNDEZ-CALERO T , Noya, V , Brandes, M , Possi, T , ARLEO M. , N.Reyes , VICTORIA M , LIZASOAIN, A. , Castells M , Maya, L , Salvo, M , Schäffer, T , Mar da Rosa, MT , Garay, L , Cecilia Alonso Bianco , Vega, Y , SALAZAR C. , FERRES F. , SMIRCICH P. , SOTELO J. , FORT RS. , MATHÓ C. , ARANTES I. , APPOLINARIO L. , MENDONÇA AC. , BENÍTEZ-GALEANO MJ. , SIMOES C. , GRAÑA M. , MOTTA F. , MENDONÇA M. , BELLO G. , COLINA R. , SPANGENBERG L.
          Frontiers in Microbiology, 2021
          Palabras clave: SARS-CoV-2 Frontera
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas /
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 1664302X
          DOI: 10.3389/fmicb.2021.653986

        • Real-Time Genomic Surveillance for SARS-CoV-2 Variants of Concern, Uruguay (Completo, 2021)
          REGO N. , COSTÁBILE, A , Paz M , SALAZAR C. , PERBOLIANACHIS, P , SPANGENBERG L. , FERRES I. , ARCE R. , FAJARDO A. , ARLEO M. , POSSI T. , REYES N. , BETANCOR M- , LIZASOAIN A. , BENÍTEZ MJ. , BORTAGARAY V. , MOLLER A. , BELLO G. , ARANTES I. , BRANDES M. , SMIRCHICH P. , CHAPPOS O. , DUQUÍA M. , GONZÁLEZ B. , GRIFFERO L. , MÉNDEZ M. , TECHERA MP. , ZANETTI J. , RIVERA B. , MAIDANA M. , ALONSO M. , ALONSO C. , MEDINA J. , ALBORNOZ H. , COLINA R. , NOYA V. , IRAOLA G. , FERNÁNDEZ-CALERO T. , MORATORIO G. , MORENO P.
          Emerging Infectious Diseases, 2021
          Palabras clave: SARS-CoV-2 Genomic survelliance Nanopore sequencing P.1
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología y Biología de la Evolución / Biología Molecular
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 10806059
          DOI: 10.3201/eid2711.211198
          https://wwwnc.cdc.gov/eid/about

        • Emergence and Spread of a B.1.1.28-Derived P.6 Lineage with Q675H and Q677H Spike Mutations in Uruguay (Completo, 2021)Trabajo relevante
          REGO N. , SALAZAR C. , Paz M. , COSTÁBILE, A , FAJARDO A. , FERRES I. , PERBOLIANACHIS P. , FERNÁNDEZ-CALERO T. , NOYA V. , MATCHADO M. , BRANDES M. , ARCE R. , ARLEO M. , POSSI T. , REYES N. , BETANCOR MN. , LIZASOASIN A. , BORTAGARAY V. , MOLLER A. , CHAPPOS O. , NIN N. , HURTADO J. , DUQUÍA M. , GONZALEZ MB. , GRIFFERO L. , MENDEZ M. , TECHERA MP. , ZANETTI J. , PEREIRA E. , RIVERA B. , MIR D. , ALONSO C. , MEDINA J. , ALBORNOZ H. , COLINA R. , BELLO G. , MORENO P. , MORATORIO G. , IRAOLA G. , SPANGERNBERG L.
          Viruses, 2021
          Palabras clave: P.6 SARS-CoV-2 Genomic surveilliance Oxford Nanopore sequencing
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Vigilancia genómica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 19994915
          DOI: 10.3390/v13091801

        • Urban metagenomics uncover antibiotic resistance reservoirs in coastal beach and sewage waters. (Completo, 2019)
          FRESIA P. , ANTELO V. , SALAZAR C. , GIMÉNEZ M. , D'ALESSANDRO B. , AFSINNEKOO E. , MASON C. , GONNET G , IRAOLA G.
          Microbiome, v.: 7 2019
          Palabras clave: urban metagenomics AMR
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Metagenómica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20492618
          DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-019-0648-z
          https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-019-0648-z#citeas

        • First Release of the Bacterial Biobank of the Urban Environment (BBUE). (Completo, 2018)
          Antelo V. , SALAZAR C. , Martínez A , D?Alessandro B , Castro M. , Betancor L. , Barcala MV. , Míguez D. , Gonnet G. , Iraola G.
          Microbiology Resource Announcements, 2018
          Palabras clave: Biobank Urban environment
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bacteriología
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 2576098X
          DOI: 10.1128/MRA.01201-18
          https://mra.asm.org/

    • Artículos aceptados

      • Arbitrados

        • Impact of timely vaccination and genomic surveillance on controlling consecutive waves of SARS-CoV-2 variants (Completo, 2026)Trabajo relevante
          SALAZAR C. , Trovão NS. , Ferrés I. , COSTÁBILE, A , Paz M. , PERBOLIANACHIS, P , Ana Moller , Bortagaray V , Colina R , REGO N. , Fernández-Calero T. , LUCIA SPANGENBERG , B.RIVERA , Alonso M. , Matías Maidana , Interinstitutional Working Group , IRAOLA G. , MORATORIO, G. , MORENO P

          Scientific Reports, 2026
          Palabras clave: SARS-CoV-2 vaccination genomic surveillance VOCs
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Dinámica de SARS-CoV-2
          Medio de divulgación: Internet
          Preprint disponible
          Fecha de aceptación: 06/04/2026
          E-ISSN: 20452322
  • Libros

    • Fasciola hepatica ( Participación , 2020) Publicado
      MAGGIOLI G. , SALAZAR C. , FOSSA F. , CARMONA C.
      Editor/Compilador: Martín Cancela, Gabriela Maggioli
      Editorial: Springer , New York
      Tipo de puplicación: Divulgación
      DOI: 10.1007/978-1-0716-0475-5_15
      Escrito por invitación
      Palabras clave: Vaccine Liver fluke Fasciola heaptica Livestock
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN/ISBN: 978-1-07-160475-5


      Capítulos:
      Liver Fluke Vaccine Assessment in Cattle
      Página inicial 205, Página final 2012
    • Fasciola hepatica ( Participación , 2020) Publicado Trabajo relevante
      SALAZAR C. , TORT J. , CARMONA C.
      Editor/Compilador: Martin Cancela y Gabriela Maggioli
      Editorial: Springer , New York
      Tipo de puplicación: Divulgación
      DOI: 10.1007/978-1-0716-0475-5_14
      Escrito por invitación
      Palabras clave: peptide carrier system epitopes
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Ciencias Biológicas / Protocolo de predicción de epitopes B lineales
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN/ISBN: 978-1-07-160475-5


      Capítulos:
      Design of a Peptide-Carrier Vaccine Based on the Highly Immunogenic Fasciola hepatica Leucine Aminopeptidase
      Página inicial 191, Página final 204
  • Publicación de trabajos presentados en eventos

    • Plataforma biotecnológica para aislamiento, estudio y caracterización de vesículas extracelulares (VEs) de interés biomédico. (2018)
      BERASAIN P , M. Abboud , GOYECHE A , ABREU J , COMAS R , SALAZAR C. , MAGGIOLI G , MARCO M , OLIVERA S , CASANOVA G , MÉNDEZ E , CARMONA, C.
      Publicado
      Resumen
      Evento: Local
      Descripción: Primer Encuentro Bienal de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular
      Año del evento: 2018
      Palabras clave: Exosomas
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Vesículas extracelulares
      Medio de divulgación: Internet
    • Serpins: a New Insight in Fasciola hepatica Host-Parasite Interactions. (2013)
      BERASAIN P , TIRLONI L , GAMBETA D , SALAZAR C. , CARMONA C , DA SILVA VAZ JR. I , TERMIGNONI C
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: Simposio SBBq-Conosur de la Sociedad Brasilera de Bioquímica y Biología Molecular
      Ciudad: Foz do Iguacu
      Año del evento: 2013
      Palabras clave: Fasciola hepatica Serpinas
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Parasitología
      Medio de divulgación: CD-Rom
    • A tale of two antigens in the quest for a vaccine against fasciolosis in ruminants (2012)
      CARMONA C , MAGGIOLI G , SALAZAR C. , BOTTINI G , SALINAS G
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: Tha Australian Society for Parasitology 2012
      Ciudad: Launceston, Tasmania
      Año del evento: 2012
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Vacunas recombinantes
      Medio de divulgación: Internet
      parasite.org.au/arcnet/conference/2012ConferenceAbstractBooksmall.pdf
  • Preprint

    • Impact of Timely Vaccination and Genomic Surveillance on Controlling Consecutive Waves of SARS-CoV-2 Variants (2024)
      SALAZAR C. , TROVAO NS. , FERRÉS I. , COSTÁBILE, A , Paz M. , PERBOLIANACHIS, P , Ana Moller , Bortagaray V , Colina R , REGO N. , FERNÁNDEZ-CALERO T , LUCIA SPANGENBERG , B.RIVERA , ALONSO, M. , MAIDANA M. , Interinstitutional Working Group , IRAOLA G. , MORATORIO G. , MORENO P

      Palabras clave: SARS-CoV2 vaccination genomic survilliance VOCs
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Epidemiología /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica de SARS-CoV-2
      Medio de divulgación: Internet
      https://papers.ssrn.com/sol3/papers.cfm?abstract_id=5016431
    • Multiple introductions, regional spread and local differentiation during the first week of COVID-19 epidemic in Montevideo, Uruguay (2020)
      SALAZAR C. , DÍAZ-VIRAQUÉ F. , MARIANOEL PEREIRA-GÓMEZ , FERRÉS I. , MORENO P , MORATORIO G. , IRAOLA G.

      DOI: https://doi.org/10.1101/2020.05.09.086223
      Palabras clave: SARS-CoV-2 genomic epidemiology Uruguay South America COVID-19
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Epidemiología /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica de SARS-CoV-2
      Medio de divulgación: Internet
      https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.09.086223v1
  • Producción técnica

    • Productos

      • Porefile: a Nextflow full-length 16S profiling pipeline for ONT reads (2020)
        Proyecto, Software
        SALAZAR C. , FERRÉS I. , GIMÉNEZ M. , IRAOLA G.
        Herramienta para la obtención de perfiles taxonómicos a partir de la secuenciación del gen completo del 16S del ARNr utilizando tecnología de Oxford Nanopore. Porefile compila una serie de herramientas de código abierto de pre-procesamiento y asignación taxonómica
        País: Uruguay
        Disponibilidad: Irrestricta
        Palabras clave: Oxford Nanopore Perfil Taxonómico gen 16S ARNr gen 18S ARNr
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
        Medio de divulgación: Internet
        https://github.com/microgenlab/porefile
    • Otras Producciones

    • Evaluaciones

      • Evaluación de Proyectos

        • Evaluación independiente de proyectos

          Evaluación Proyecto ANII ( 2025 )
          Uruguay
          Cantidad: Menos de 5

    • Formación de RRHH

      • Tutorías en marcha

        • Otras

          • Relevamiento de comunidades microbianas en el ambiente productivo a través de la aplicación de secuenciación de tercera generación Oxford Nanopore Technologies (ONT). (2024)
            Iniciación a la investigación
            Sector Educación Superior/Público / Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas / Área Biología (PEDECIBA) / Laboratorio de Genómica Microbiana - Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
            Programa: Primera Experiencia de Investigación (PREXI)
            Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( SALAZAR C. , FERNÁNDEZ-CALERO T )
            Nombre del orientado: Santiago Rodríguez
            País/Idioma: Uruguay,
            Palabras Clave: microbioma agua suelos producción secuenciación
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bibliotecas de secuenciación Oxford Nanopore Technologies
    • Otros datos relevantes

      • Premios, Honores y Títulos

        • 2do Premio Gran Premio Nacional de Medicina (2022)
          (Nacional)
          Academia Nacional de Medicina

        • EMBO Travel Grant (2019)
          (Internacional)
          European Molecular Biology Organization
          Otorgamiento de beca económica para la participación del curso Microbial metagenomics: A 360o approach
        • Beca de Posgrados Nacionales-Maestría (2015)
          (Nacional)
          ANII
          Estudios de la leucina aminopeptidasa de Fasciola hepatica como transportador de péptidos antigénicos. POS_NAC_2014_1_102216.
        • Programa de Iniciación a la Investigación 2013-Modalidad I (2013)
          (Nacional)
          CSIC
          En la convocatoria se aprobó el proyecto "Estudios sobre el rol en la inmuno-estimulación humoral de mucosas de una leucina aminopeptidasa de Fasciola hepatica en un modelo murino"
        • Beca de Iniciación a la Investigación 2010 (2011)
          (Nacional)
          Agencia Nacional de Innovación e Investigación
          Estudios sobre los mecanismos protectores de una vacuna contra la fasciolosis ovina basada en la Leucina aminopeptidasa recombinante de Fasciola hepatica (FhLAPr). INI_X_2010_2_2799.
      • Presentaciones en eventos

        • Congreso Uruguayo en Una Salud - I Jornada Académica del Instituto de Investigación Una Salud (2025)
          Congreso
          Rutas de propagación de patógenos y genes de resistencia a antimicrobianos en sistemas agropecuarios: un enfoque integral basado en metagenómica en tiempo real
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral
          Carga horaria: 25
          Nombre de la institución promotora: Instituto de Investigación Una Salud
          Alcance geográfico: Nacional Palabras Clave: Una Salud transdisciplina
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Patógenos asociados al microbioma del ganado
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Análisis de datos de secuenciación
        • London Calling (virtual) (2023)
          Congreso
          porefile: automatic profiling of microbial communities using full-length 16S rRNA gene sequencing data
          Inglaterra
          Tipo de participación: Poster
          Nombre de la institución promotora: Oxford Nanopore Technologies
          Alcance geográfico: Internacional Palabras Clave: taxonomic profile software Oxford Nanopore Technologies
          Presentación on line de póster https://nanoporetech.com/es/resource-centre/porefile-automatic-profiling-microbial-communities-using-full-length-16s-rrna-gene
        • SARS CoV-2 in South America: Testing Strategies, Genomic Surveillance and Basic Research Workshop (2022)
          Taller
          Fast and cost effective SARS-CoV-2 sample screening based on Nanopore sequencing
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral
          Nombre de la institución promotora: Institut Pasteur de Montevideo Palabras Clave: SARS CoV-2 Nanopore sequencing
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Secuenciación con Oxford Nanopore
        • Congreso Interdisciplinario COVID-19, pandemia y post pandemia (virtual) (2022)
          Congreso
          SARS-CoV-2 Real Time Genomic Surveillance in Uruguay en "Aplicaciones de Biología Molecular para el diagnóstico y monitoreo de variantes de SARS CoV-2"
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral
          Nombre de la institución promotora: UdelaR Palabras Clave: Vigilancia genómica SARS-CoV-2 Secuenciación Nanopore
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genómica viral
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Vigilancia
        • III Congreso Nacional de Biociencias (2022)
          Congreso
          Vigilancia de variantes basada en el gen S de SARS-CoV-2
          Uruguay
          Tipo de participación: Poster
          Nombre de la institución promotora: Sociedad Uruguaya de Biociencias Palabras Clave: SARS-CoV-2 gen S secuenciación Oxford Nanopore
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Secuenciación Oxford Nanopore
          Las variantes de preocupación (VOCs) se definen en gran medida por las mutaciones presentes en la secuencia del gen S, por lo que su secuencia podría utilizarse para la clasificación de linajes y/o variantes de SARS-CoV-2. En este contexto, hemos desarrollado un método de relevamiento rápido y de bajo costo de variantes de SARS-CoV-2 basado en la generación de amplicones solapantes del gen S y posterior secuenciación con tecnología portable de Oxford Nanopore.
        • 3a JORNADA DE ACTUALIZACIÓN EN PARASITOLOGÍA Y MICOLOGÍA (2018)
          Encuentro
          Interacción microbiota-helminto
          Uruguay
          Tipo de participación: Expositor oral
          Nombre de la institución promotora: Instituto de Higiene Palabras Clave: Microbioma intestinal Metagenómica Fasciola hepatica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Análisis metagonómico de la microbiota intestinal
        • 8vas Jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (2013)
          Congreso
          Estudios de los mecanismos humorales asociados a protección de una vacuna contra la fasciolosis ovina
          Uruguay
          Tipo de participación: Poster
          Nombre de la institución promotora: Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular Palabras Clave: Fasciola hepatica Vacunas
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Vacunas
      • Construcción institucional


    • Información adicional


    • Indicadores de producción

      Actividades

      36
      Líneas de investigación
      8
      Proyectos Investigación Desarrollo
      9
      Docencia
      6
      Extensión
      3
      Gestión Académica
      5
      Otra Actividad Técnica
      5

      Producción bibliográfica

      21
      Artículos publicados en revistas científicas
      13
      Completo 13
      Artículos aceptados para publicación en revistas científicas
      1
      Completo 1
      Trabajos en eventos
      3
      Libros y Capítulos
      2
      Capítulos de libro publicado 2
      Preprints
      2

      Producción técnica

      6
      Productos tecnológicos
      1
      Otros tipos
      5

      Evaluaciones

      1
      Evaluación de proyectos
      1

      Formación RRHH

      1
      Tutorías/Orientaciones/Supervisiones en marcha
      1
      Iniciación a la investigación 1