Gregorio IRAOLA
Dr.

  • Datos Generales

    • Institución principal

      Empresa Privada/ Kinzbio / Uruguay

    • Dirección institucional

      Institución: Empresa Privada / Kinzbio / Sector Empresas/Privado
      Dirección: Avenida Italia 6201 (Edificio Los Tilos) / 11500
      País: Uruguay / Montevideo / Montevideo
      Teléfono: 099394982
      Correo electrónico/Sitio Web: giraola@kinzbio.com http://kinzbio.com

  • Formación

    • Formación académica

      • Concluida

        • Doctorado

          • Doctorado en Ciencias Biológicas (PEDECIBA) (2012 - 2016)
            Institut Pasteur de Montevideo - Institut Pasteur de Montevideo, Unidad de Bioinformática , Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Desarrollo y aplicación de herramientas computacionales para el análisis taxonómico y patogenómico de procariotas
            Tutor/es: Hugo Naya
            Obtención del título: 2016
            Financiación:
            Universidad de la República / Comisión Académica de Posgrado , Uruguay
            Palabras Clave: Genómica comparativa Patogenicidad bacteriana Machine Learning
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana

        • Grado

          • Licenciatura en Ciencias Biológicas (2006 - 2010)
            Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
            Título de la disertación/tesis/defensa: Estandarización De Un Método Molecular Para La Detección De Campylobacteriosis Bovina En Uruguay
            Tutor/es: Ruben Gustavo Pérez Crossa
            Obtención del título: 2010
            Palabras Clave: Campylobacter PCR
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Molecular y Genética Bacteriana

    • Pasaje a doctorado

      • Maestría

        • Maestría en Bioinformática (PEDECIBA) (2010 - 2012)
          Institut Pasteur de Montevideo - Institut Pasteur de Montevideo, Unidad de Bioinformática , Uruguay
          Título de la disertación/tesis/defensa: Pasaje a Doctorado en Biología (PEDECIBA)

          Financiación:
          Universidad de la República / Comisión Sectorial de Investigación Científica , Uruguay
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa

    • Formación complementaria

      • Concluida

        • Cursos de corta duración

          • Molecular Biology of Viral Diseases (01/2011 - 01/2011)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
            40 horas
            Palabras Clave: Virología molecular
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Virología Molecular
          • Bioinformatics & Comparative Genome Analyses (01/2011 - 01/2011)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Institut Pasteur de Paris , Francia
            88 horas
            Palabras Clave: Bioinformática Genómica comparativa
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
          • Molecular Basis of Bacterial Infection (01/2010 - 01/2010)
            Sector Extranjero/Internacional/Otros / Wellcome Trust Sanger Institute , Inglaterra
            45 horas
            Palabras Clave: Bioinformática Mutagénesis Secuenciación
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genética bacteriana
          • Biología Molecular de Enfermedades Virales (01/2010 - 01/2010)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Centro Universitario Regional Litoral Norte , Uruguay
            40 horas
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Biología Molecular
          • Next Generation Sequencing Data Analysis (01/2010 - 01/2010)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
            40 horas
            Palabras Clave: Next Generation Sequencing
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Tecnologías de Secuenciación Masiva
          • Working With Pathogen Genomes Wellcome Trust Sanger Institute (01/2009 - 01/2009)
            Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina , Uruguay
            40 horas
            Palabras Clave: Bioinformática, Artemis, Genómica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa

        • Participación en eventos

          • Genomic Surveillance of Antimicrobial Resistance Workshop (2022)
            Tipo: Taller
            Institución organizadora: Wellcome Trust / Surveillance and Epidemiology of Drug Resistant Infections Consortium (SEDRIC), Reino Unido
            Palabras Clave: Resistencia antibiótica Metagenómica Genómica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Resistencia antibiótica
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Metagenómica
          • First Latin American Symposium (2021)
            Tipo: Simposio
            Institución organizadora: Global Microbiome Network, Perú
          • Congreso Latinoamericano del Microbioma (2021)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Universidad Autónoma Nacional de México (UNAM), México
          • XXV Congreso Latinoamericano de Microbiología (2021)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Asociación Latinoamericana de Microbiología (ALAM), Paraguay
          • Phage Futures Europe (2021)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Kisaco Research, Bélgica
          • First Latinbiota Meeting (2021)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Institut Pasteur Montevideo, Uruguay
          • 9th European Conference on Computational Biology (2020)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Barcelona Supercomputing Center (BSC) / Instituto Nacional de Bioinformática en España (INB/ELIXIR-ES), España
          • Frontiers in Genomics (2020)
            Tipo: Simposio
            Institución organizadora: Universidad Nacional Autonoma de México (UNAM), México
          • MetaSUB International Consortium Virtual Meeting 2020 (2020)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: MetaSUB International Consortium, Estados Unidos
          • XVII Congreso Latinoamericano de Genética (2019)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Asociación Latinoamericana de Genética (ALAG), Argentina
            Palabras Clave: Genética Genómica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /
          • RIIP Latin American Regional Meeting (2019)
            Tipo: Congreso
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Enfermedades Infecciosas /
          • Scientific Symposium of the Institut Pasteur International Network Paris (2018)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Institut Pasteur, Francia
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
          • X-meeting (2018)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Sociedad Brasileña de Biología Computacional, Brasil
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
          • XLI Reunión Anual Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular de Chile (2018)
            Tipo: Congreso
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
          • II Seminario Franco-Argentino en Biociencias (2018)
            Tipo: Seminario
            Institución organizadora: Instituto Franco-Argentino, Argentina
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica
          • MISP Reaserch Camp (2017)
            Tipo: Taller
            Institución organizadora: PERSIMUNE, Dinamarca
            Palabras Clave: Medicina de precisión Metagenómica Genómica bacteriana
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
          • Scientific Symposium of the Institut Pasteur International Network Paris (2016)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Institut Pasteur International Network, Francia
            Palabras Clave: Metagenómica Genómica comparativa Biomarcadores
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
          • MISP Research Camp (2015)
            Tipo: Taller
            Institución organizadora: Institut Pasteur International Network, Uruguay
            Palabras Clave: Genómica Secuenciación masiva Biomedicina
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Biologia computacional
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          • Microbiology after the genomics revolution (2014)
            Tipo: Congreso
            Palabras Clave: Genómica Microbiología
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          • III Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Genética (2014)
            Tipo: Congreso
            Palabras Clave: Genética
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /
          • Scientific Symposium of the Institut Pasteur International Network Paris (2014)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Institut Pasteur, Francia
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
            Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas /
          • ISCB-LA Conference on Bioinformatics (2012)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: International Society of Computational Biology, Uruguay
            Palabras Clave: Bioinformatics Computational Biology
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
          • Pasantía en Bioinformática (2011)
            Tipo: Otro
            Institución organizadora: Institut Pasteur Montevideo, Uruguay
            Palabras Clave: Genómica comparativa Leptospira
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
          • Pasantía en Genética Bacteriana (2011)
            Tipo: Otro
            Institución organizadora: INTA Balcarce, Argentina
            Palabras Clave: Campylobacter Genética Bacteriana
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genética Bacteriana
          • Pasantía en Bioinformática (2011)
            Tipo: Otro
            Institución organizadora: Núcleo de Bioinformática, Universidad de Caxias do Sul, Uruguay
            Palabras Clave: Patogenicidad bacteriana Redes neurales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Patogenicidad bacteriana
          • XX Congreso Latinoamericano de Microbiología (2010)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Asociación Latinoamericana de Microbiología, Uruguay
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genética bacteriana
          • XIII Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Biociencias (2010)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: SUB, Uruguay
          • XII Congreso Argentino de Microbiología (2010)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Sociedad Argentina de Microbiología, Argentina
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genética bacteriana
          • VI Jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular (2009)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Facultad de Ciencas - Institut Pasteur Montevideo, Uruguay
          • VI Jornadas Técnicas de la Facultad de Veterinaria (2009)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: Facultad de Veterinaria, Uruguay
          • Foro de Innovación de las Américas (2009)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: ANII, Uruguay
          • Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Genética (2008)
            Tipo: Congreso
            Institución organizadora: UDELAR, Uruguay

  • Idiomas

    • Español
      Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien
    • Inglés
      Entiende bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien
    • Portugués
      Entiende regular / Lee bien /

  • Areas de actuación

    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias Biológicas /Biología Celular, Microbiología

    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias de la Computación e Información /Ciencias de la Información y Bioinformática /Genómica microbiana

    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias de la Computación e Información /Ciencias de la Información y Bioinformática /Evolución viral

    • Ciencias Naturales y Exactas

      Ciencias de la Computación e Información /Ciencias de la Información y Bioinformática /Microbioma

    • Ciencias Médicas y de la Salud

      Biotecnología de la Salud /Biotecnología relacionada con la Salud /Fagoterapia

  • Actuación profesional

    • Sector Empresas/Privado - Empresa Privada - Uruguay

      Kinzbio

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (09/2023 - a la fecha)
          Director Ejecutivo 40 horas semanales
        • Otro (05/2021 - 09/2023)Trabajo relevante
          Co-fundador y Asesor Científico 4 horas semanales

      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • Desarrollo de soluciones basadas en bacteriófagos para bacterias relevantes en salud humana, animal y ambiental. (05/2021 - a la fecha )
            Kinzbio desarrolla cócteles basados en bacteriófagos naturales activos contra bacterias relevantes para la salud humana, animal y ambiental, tales como Salmonella, Escherichia coli y Klebsiella.
            Aplicada
            4 horas semanales , Integrante del equipo
            Equipo: IRAOLA G.
            Palabras clave: Bacteriófagos Fagos Antimicrobianos
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /

        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • Kinzbio: desarrollando tecnologías basadas en microorganismos para un mundo más seguro (10/2021 - a la fecha)
            A través de este proyecto enmarcado en el instrumento Emprendedores Innovadores de ANII, Kinzbio busca fortalecer sus capacidades de I+D y salida al mercado con productos basados en bacteriófagos para minimizar el riesgo microbiológico en procesos industriales y la contaminación ambiental.
            4 horas semanales
            Desarrollo
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: IRAOLA G. , PUIG J. , JAVIEL G.
            Palabras clave: Bacteriófagos Fagos Antimicrobianos
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /

    • Sector Educación Superior/Público - Programa de Desarrollo de las Ciencias Básicas - Uruguay

      Área Biología (PEDECIBA)

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (12/2021 - a la fecha)
          Investigador Grado 4
        • Funcionario/Empleado (03/2017 - 12/2021)
          Investigador Grado 3

    • Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

      Facultad de Medicina / Centro de Investigaciones Biomédicas (CEINBIO)

      • Vínculos con la Institución

        • Colaborador (05/2021 - a la fecha)
          Investigador Asociado
          Escalafón: No Docente

      • Actividades

        • Otra actividad técnico-científica relevante

          • Comité Científico Asesor (08/2022 - a la fecha )
            Programa de Alimentos y Salud (PAyS)
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma

    • Sector Extranjero/Internacional/Otros - Chile

      Universidad Mayor / Centro de Biología Integrativa

      • Vínculos con la Institución

        • Profesor visitante (03/2018 - a la fecha)
          Profesor Adjunto Internacional

    • Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas - Institut Pasteur de Montevideo - Uruguay

      Institut Pasteur de Montevideo

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (06/2021 - 09/2023)
          Coordinador Científico del Centro de Innovación en Vigilancia Epidemiológica (CiVE) 5 horas semanales
        • Funcionario/Empleado (12/2018 - 09/2023)Trabajo relevante
          Responsable de Grupo G4 40 horas semanales
          Responsable del Laboratorio de Genómica Microbiana
        • Funcionario/Empleado (07/2016 - 12/2018)
          Investigador Adjunto 40 horas semanales
        • Funcionario/Empleado (01/2013 - 06/2016)
          Investigador Asistente 20 horas semanales
        • Funcionario/Empleado (12/2010 - 12/2012)Trabajo relevante
          Pasante honorario 20 horas semanales

      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • Evolución, epidemiología genómica y dinámica de determinantes genéticos de resistencia a antibióticos en bacterias ambientales, zoonóticas e intrahospitalarias (12/2018 - a la fecha )
            Comparación de genomas bacterianos para el estudio de la evolución de patógenos que afectan la salud humana, de animales de producción y que son transmitidos a través del ambientes. Con especial énfasis en el estudio de la dinámica de dispersión de mecanismos de resistencia a antibióticos.
            Mixta
            1 horas semanales , Coordinador o Responsable
            Equipo: Gregorio IRAOLA , Pablo FRESIA CORONEL , Ignacio FERRÉS CÁCERES , Matías GIMENEZ MARTÍNEZ , María Cecilia SALAZAR GONZÁLEZ
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          • Caracterización de microbiomas ambientales, humanos y de animales de producción (12/2018 - a la fecha )
            Aplicación de herramientas metagenómicas, genómicas y bacteriológicas para la caracterización de la variabilidad de la microbiota ambiental y asociada a hospederos como humanos y animales de producción, con particular énfasis en el estudio de la dinámica de determinantes genéticos de resistencia a antibióticos.
            Mixta
            10 horas semanales , Coordinador o Responsable
            Equipo: Gregorio IRAOLA , Pablo FRESIA CORONEL , María Cecilia SALAZAR GONZÁLEZ , Veronica Beatriz ANTELO GUTIERREZ , Matías GIMENEZ MARTÍNEZ , Ignacio FERRÉS CÁCERES , Feijo R
            Palabras clave: Microbioma Metagenómica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
          • Desarrollo de herramientas bioinformáticas para microbiología computacional (12/2018 - a la fecha )
            Desarrollo de métodos, algoritmos y pipelines bioinformáticos para el análisis de datos de secuenciación masiva
            Mixta
            10 horas semanales , Coordinador o Responsable
            Equipo: Gregorio IRAOLA , Ignacio FERRÉS CÁCERES , Matías GIMENEZ MARTÍNEZ , Feijo R
            Palabras clave: Bioinformática Biología computacional Algoritmos Desarrollo de software
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • Rol de la microbiota intestinal en la respuesta a la inmunoterapia del cáncer en Uruguay (11/2020 - a la fecha)
            Determinación del rol de la microbiota intestinal en la respuesta o resistencia a la inmunoterapia como tratamiento al cáncer de pulmón y melanoma.
            4 horas semanales
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Pregrado:1
            Especialización:1
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            GlaxoSmithKline, Inglaterra, Apoyo financiero
            Equipo: IRAOLA G. , RIERA N. , PARADA A. , OSINAGA E. , BEROIS N.
            Palabras clave: Inmunoterapia Cancer Microbioma
          • Latinbiota: unlocking the composition and variability of human gut microbiota in Latin America (04/2019 - a la fecha)
            El consorcio Latinbiota busca generar datos sobre la variabilidad y composición del microbioma intestinal humano y su rol en la salud y la enfermedad en 8 países de la región latinoamericana.
            10 horas semanales
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            Financiación:
            Wellcome Trust Sanger Institute, Inglaterra, Apoyo financiero
            Equipo: IRAOLA G.
            Palabras clave: Microbioma humano
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
          • A city-scale molecular map of antimicrobial resistance among hospital settings, the urban environment and human population: towards the application of metagenomics for the assessment of stewardship programs (06/2020 - a la fecha)
            El proyecto busca comprender la dinámica de determinantes genéticos de resistencia antibióticos a escala ciudad, comparando el microbioma de los ambientes urbanos (por ejemplo aguas residuales), el microbioma intestinal humano de la población y el microbioma hospitalario.
            5 horas semanales
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            Financiación:
            Pfizer, Estados Unidos, Apoyo financiero
            Equipo: IRAOLA G.
            Palabras clave: Metagenómica Microbioma Resistencia a antibióticos
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
          • Centro Uruguayo de Metagenómica: una plataforma interinsttucional para la incubación de proyectos aplicados al monitoreo de ambientes prioritarios (04/2017 - 05/2020 )
            Aplicación de la metagenómica para el análisis microbiológico de ambientes urbanos y productivos
            10 horas semanales
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            Concluido
            RRHH formados en el proyecto:
            Maestría/Magister:2
            Doctorado:1
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: IRAOLA G. , Gonnet G , Antelo V , Salazar C , Giménez, M. , Fresia P
            Palabras clave: Metagenómica
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
          • Desarrollo y validación de metodologías para el diagnóstico y control de la campylobacteriosis genital bovina (07/2015 - 12/2019 )
            Fondo Sectorial de Sanidad Animal para el desarrollo de metodologías moleculares para el diagnóstico de campylobacteriosis genital bovina en Uruguay
            5 horas semanales
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            Concluido
            RRHH formados en el proyecto:
            Doctorado:1
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: CALLEROS L. (Responsable) , COSTA, D. , PÉREZ R , Riet-Correa F.
            Palabras clave: Genética Bacteriana Campylobacter fetus Biotecnología Genómica bacteriana
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          • Evolución genómica de Mycobacterium avium paratuberculosis en animales silvestres y de producción (04/2017 - 05/2019 )
            Genómica comparativa de cepas de Mycobacterium avium paratuberculosis a nivel global para comprender los patrones evolutivos que detrás de su adaptación a distintos hospederos
            1 horas semanales
            Investigación
            Integrante del Equipo
            Concluido
            RRHH formados en el proyecto:
            Maestría/Magister:1
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: IRAOLA G. , Fresia P , FERRÉS I.
            Palabras clave: Mycobacterium Genómica comparativa
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          • Global diversity, genomic epidemiology and pathogen evolution of Leptospira spp. (03/2017 - 03/2019 )
            Proyecto internacional en conjunto con otros integrantes de la Red Internacional de Institutos Pasteur para estudiar la diversidad genética de las especies pertenecientes al género Leptospira
            1 horas semanales
            Investigación
            Integrante del Equipo
            Concluido
            RRHH formados en el proyecto:
            Doctorado:1
            Financiación:
            Institut Pasteur de Paris, Francia, Apoyo financiero
            Equipo: IRAOLA G. , FERRÉS I. , Picardeau M , BUSCHIAZZO, A. , Zarantonelli L
            Palabras clave: Leptospira Genómica Diversidad Evolución
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          • Tipificación y diagnóstico de Leptospira spp. por técnicas moleculares: hacia el diseño de vacunas recombinantes (03/2014 - 03/2016 )
            La leptospirosis es una de las zoonosis con más amplia distribución en el mundo. Causada por distintas cepas patógenas de Leptospira spp., afecta a todas las especies de animales domésticos. En bovinos es una de las principales causas de aborto, así como un permanente riesgo de dispersión de la zoonosis, en especial para trabajadores vinculados al trabajo de campo. Leptospira spp. presenta una enorme variabilidad antigénica, y una gran cantidad de hospedadores potenciales. Es por ende un tema complicado a la hora de generar programas de control eficaces. La vacunación sigue siendo una herramienta muy preciada para la prevención de los animales sanos y susceptibles. Las vacunas contra leptospirosis bovina actualmente disponibles en el mercado consisten en suspensiones de leptospiras inactivadas. En dichas formulaciones se incluyen uno o más serovares. Sin embargo, la eficacia de las vacunas actuales es cuestionada. Si bien la técnica de microaglutinación (MAT), que lleva adelante la DILAVE (Ministerio de Ganadería, Agricultura y Pesca) continúa siendo la técnica ?gold standard? para diagnosticar infecciones de acuerdo a serovares, es bien conocido que presenta una baja sensibilidad. El MAT puede ser útil para el diagnóstico en casos agudos, pero puede dificultarlo en otros, por ejemplo en el curso crónico y subclínico de la enfermedad. Este proyecto se propone aislar cepas locales de Leptospira, y tipificarlas con aproximaciones tanto serológicas como moleculares. Así se podrá contar con un cepario bien caracterizado, del que hoy no disponen las entidades nacionales de vigilancia y control sanitario. Asimismo, desarrollar un método de diagnóstico molecular rápido de Leptospira a partir de muestras biológicas, permitiría implementar precozmente la terapia con antibióticos.
            10 horas semanales
            Investigación
            Integrante del Equipo
            Concluido
            Financiación:
            Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
            Equipo: Hugo Mario NAYA MONTEVERDE , Zarantonelli L , Picardeau M , Alejandro BUSCHIAZZO , Gregorio IRAOLA
            Palabras clave: Leptospirosis
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
          • Análisis transcripcional en Leptospiras formadoras de biofilms (12/2012 - 12/2014 )

            2 horas semanales
            Institut Pasteur Montevideo , Unidad de Bioinformática
            Investigación
            Integrante del Equipo
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Pregrado:1
            Equipo: RISTOW P , NAYA H (Responsable)
            Palabras clave: Leptospira biofilms NGS
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

    • Sector Extranjero/Internacional/Otros - Inglaterra

      Wellcome Trust Sanger Institute / Host-Microbiota Interactions Laboratory

      • Vínculos con la Institución

        • Otro (12/2018 - 09/2023)
          International Fellow

      • Actividades

        • Proyectos de investigación y desarrollo

          • Latinbiota: understanding the evolution, transmission and antibiotic resistance of microbiota-associated pathogens in South American LMICs (12/2018 - a la fecha)
            Latinbiota es un proyecto de investigación a nivel continental que busca generar información acerca de la variabilidad del microbioma intestinal humano en poblaciones nativas y urbanas de América Latina. El proyecto es liderado por mi, y se enmarca en el contexto de mi vinculación con el Wellcome Sanger Institute del Reino Unido como International Fellow, un programa internacional a 4 años para fortalecer vínculos de colaboración entre dicha institución y científicos extranjeros trabajando en países en desarrollo.
            1 horas semanales
            Host-Microbiota Interactions Laboratory
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Maestría/Magister:1
            Doctorado:1
            Financiación:
            Wellcome Trust Sanger Institute, Inglaterra, Apoyo financiero
            Equipo: Gregorio IRAOLA
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
          • Genomic epidemiology of Clostridium difficile in Latin America (12/2018 - a la fecha)
            Secuenciación y análisis comparativo del genoma completo de 500 cepas de Clostridium difficile aisladas en 8 países latinoamericanos. El proyecto busca comprender la epidemiología de éste patógeno de gran importancia en diarreas intrahospitalarias, resistentes a antibióticos en la región lationamericana.
            1 horas semanales
            Host-Microbiota Interactions Laboratory
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            En Marcha
            RRHH formados en el proyecto:
            Doctorado:1
            Financiación:
            Wellcome Trust Sanger Institute, Inglaterra, Apoyo financiero
            Equipo: Gregorio IRAOLA
          • Comparative genomics of mammal-associated Campylobacter fetus strains (05/2015 - 11/2017 )
            Caracterización genómica a nivel mundial de cepas de Campylobacter fetus aisladas de casos clínicos en humanos y animales de producción (bovinos y ovinos). El proyecto buscaba establecer los patrones evolutivos de esta especie y las adaptaciones genómicas asociadas a su capacidad de infectar humanos y otros animales.
            15 horas semanales
            Host-Microbiota Interactions Laboratory
            Investigación
            Coordinador o Responsable
            Concluido
            Financiación:
            Wellcome Trust Sanger Institute, Inglaterra, Apoyo financiero
            Equipo: Gregorio IRAOLA

        • Pasantías

          • Estadía de investigación para el análisis de datos genómicos (09/2015 - 11/2015 )
            Host-Microbiota Interactions Laboratory 40 horas semanales
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana

    • Sector Extranjero/Internacional/Otros - Chile

      Genoma Mayor

      • Vínculos con la Institución

        • Otro (03/2018 - 12/2019)
          Director de Bioinformática 1 hora semanal

      • Actividades

        • Dirección y Administración

          • Dirección del área Bioinformática (03/2018 - 12/2019 )
            1 horas semanales

    • Sector Educación Superior/Privado - Universidad ORT Uruguay - Uruguay

      Facultad de Ingeniería

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (05/2014 - 09/2017)
          Profesor Asistente 4 horas semanales

      • Actividades

        • Docencia

          • Licenciatura en Biotecnología (05/2014 - 09/2016 )
            Grado
            Asistente
            Asignaturas:
            Bioinformática I, 4 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

    • Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

      Facultad de Ciencias / Sección Genética Evolutiva

      • Vínculos con la Institución

        • Funcionario/Empleado (08/2010 - 08/2015)
          Docente Ayudante 20 horas semanales
          Escalafón: Docente
          Grado: Grado 1
          Cargo: Efectivo
        • Funcionario/Empleado (05/2011 - 07/2011)
          Ayudante de la Maestría en Bioinformática 25 horas semanales
          Dictado de las clases prácticas del curso de posgrado de la Maestría en Bioinformática titulado "Genética y Evolución"
          Escalafón: Docente
          Grado: Grado 1
          Cargo: Interino

      • Actividades

        • Líneas de investigación

          • Evolución de virus que afectan animales de producción y compañía (03/2009 - 07/2018 )
            Análisis evolutivo utilizando herramientas genómicas y filogenéticas de virus que infectan cánidos y aves.
            2 horas semanales
            Sección Genética Evolutiva, Grupo Genética de Microorganismos , Integrante del equipo
            Equipo: CALLEROS L. , PÉREZ R. , TOMÁS G , MARANDINO A. , PANZERA Y. , SARUTE N
            Palabras clave: Genética viral
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genética Viral

        • Docencia

          • Licenciatura en Ciencias Biológicas (08/2010 - 08/2015 )
            Grado
            Asistente
            Asignaturas:
            Genética General, 20 horas, Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /
          • Licenciatura en Ciencias Biológicas (03/2015 - 06/2015 )
            Maestría
            Asistente
            Asignaturas:
            Análisis de la variabilidad genética en microorganismos, 4 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
          • Maestría en Bioinformática PEDECIBA (11/2013 - 12/2013 )
            Maestría
            Invitado
            Asignaturas:
            Taller de Bioinformática, 4 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          • Maestría en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (04/2013 - 06/2013 )
            Maestría
            Asistente
            Asignaturas:
            Análisis de la variabilidad genética en microorganismos, 8 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genéntica viral y bacteriana
          • Maestría en Bioinformática PEDECIBA (05/2011 - 07/2011 )
            Maestría
            Asistente
            Asignaturas:
            Genética y Evolución, 2 horas, Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genética y Evolución
          • Licenciatura en Ciencias Biológicas (04/2010 - 05/2010 )
            Grado
            Asistente
            Asignaturas:
            Análisis de la variabilidad genética en microorganismos, 30 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genética de Microorganismos
          • Maestría en Genética (04/2009 - 06/2009 )
            Maestría
            Asistente
            Asignaturas:
            Organización, variabilidad y función del genoma eucariota, 5 horas, Teórico-Práctico
            Areas de conocimiento:
            Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /

  • Carga horaria

    • Carga horaria de docencia: Sin horas
    • Carga horaria de investigación: 20 horas
    • Carga horaria de formación RRHH: 20 horas
    • Carga horaria de extensión: Sin horas
    • Carga horaria de gestión: 20 horas

  • Producción científica/tecnológica

    • Soy un científico con más de 12 años de experiencia y más de 50 artículos científicos arbitrados publicados, trabajando en los campos de la microbiología, (meta)genómica, biología computacional y análisis de datos para ciencias de la vida. Tengo una vasta experiencia en el estudio de patógenos bacterianos y virales y los microbiomas humanos y ambientales mediante la integración de conjuntos de datos a gran escala generados por tecnologías de secuenciación de segunda y tercera generación con datos experimentales y epidemiológicos. He adquirido y aplicado esta experiencia en prestigiosas organizaciones de investigación académica como el Institut Pasteur (Uruguay) o el Wellcome Sanger Institute (Reino Unido), y en la industria como cofundador de startups de biotecnología o asesor científico de empresas internacionales. A lo largo de los años he desarrollado habilidades de liderazgo estableciendo y gestionando equipos científicos y proyectos internacionales de gran escala, lo que implicó la construcción de nuevas alianzas y colaboraciones estratégicas externas, la coordinación del reclutamiento de pacientes, la recolección de muestras, la generación y análisis de datos en diferentes países en coordinación con equipos científicos locales de diversas instituciones académicas y organizaciones con fines de lucro. También he participado en el establecimiento de nuevos laboratorios centrados en la transferencia de tecnologías derivadas de actividades de investigación básica en biología molecular y servicios de secuenciación. En el contexto de la pandemia de COVID-19, mi trabajo ha sido fundamental para desarrollar e implementar el primer programa de vigilancia genómica en tiempo real implementado a escala nacional en Uruguay, que ha informado periódicamente al gobierno nacional sobre la introducción y la dinámica local de las variantes del SARS-CoV-2. Mi experiencia puede contribuir a generar nuevos enfoques de diagnóstico para enfermedades infecciosas o no transmisibles, a comprender los patrones epidemiológicos de las infecciones bacterianas y virales y a identificar biomarcadores en comunidades microbianas asociadas con diversas condiciones patógenas. Actualmente, es cofundador y CEO de Kinzbio, una empresa de biotecnología que desarrolla productos preventivos y terapéuticos para bacterias resistentes a los antibióticos utilizando una plataforma tecnológica innovadora basada en la biología de los bacteriófagos, busco traducir el conomcimiento y experiencia científica acumulada durante más de una década en nuevas tecnologías para mitigar el principal problema de salud global que enfrenta la humanidad en las próximas décadas: la pandemia por resistencia a los antibióticos.

  • Producción bibliográfica

    • Artículos publicados

      • Arbitrados

        • Genetically divergent Francisella philomiragia associated with septic arthritis, Montevideo, Uruguay (Completo, 2024)
          NADIA RIERA , CECILIA SALAZAR , BERNARDINA RIVERA , ANTONIO GALIANA , ROSARIO DURÁN , MARÍA MAGDALENA PORTELA , VIRGINIA ANTELO , BEATRIZ PI , ÓSCAR GONZÁLEZ , GREGORIO IRAOLA
          New Microbes and New Infections, v.: 57 p.:101210 2024
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: Netherlands
          ISSN: 20522975
          DOI: 10.1016/j.nmni.2023.101210
          http://dx.doi.org/10.1016/j.nmni.2023.101210

        • An antibiotic produced by Pseudomonas fluorescens CFBP2392 with antifungal activity against Rhizoctonia solani (Completo, 2023)
          NADIA RIERA , DANILO DAVYT , ROSARIO DURÁN , GREGORIO IRAOLA , PHILIPPE LEMANCEAU , NATALIA BAJSA
          Frontiers in Microbiology, v.: 14 2023
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
          Lugar de publicación: Switzerland
          E-ISSN: 1664302X
          DOI: 10.3389/fmicb.2023.1286926
          http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2023.1286926

        • What have we learned from a case of convalescent plasma treatment in a two-time kidney transplant recipient COVID-19 patient? A case report from the perspective of viral load evolution and immune response (Completo, 2023)
          FABIAN ALDUNATE , ALVARO FAJARDO , NATALIA IBAÑEZ , FLORENCIA RAMMAURO , HELLEN DAGHERO , RODRIGO ARCE , DIEGO FERLA , MARIANOEL PEREIRA-GOMEZ , CECILIA SALAZAR , GREGORIO IRAOLA , OTTO PRITSCH , JAVIER HURTADO , JORDAN TENZI , MARIELA BOLLATI-FOGOLÍN , SERGIO BIANCHI , NICOLAS NIN , GONZALO MORATORIO , PILAR MORENO
          Frontiers in Nephrology, v.: 3 2023
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Clínica / Sistema Respiratorio / COVID-19
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 28130626
          DOI: 10.3389/fneph.2023.1132763
          http://dx.doi.org/10.3389/fneph.2023.1132763

        • Fast and cost-effective SARS-CoV-2 variant detection using Oxford Nanopore full-length spike gene sequencing (Completo, 2023)
          CECILIA SALAZAR , IGNACIO FERRÉS , MERCEDES PAZ , ALICIA COSTÁBILE , GONZALO MORATORIO , PILAR MORENO , GREGORIO IRAOLA
          Microbial Genomics, v.: 9 2023
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica viral
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20575858
          DOI: 10.1099/mgen.0.001013
          http://dx.doi.org/10.1099/mgen.0.001013

        • Diving into the complexity of the spirochetal endoflagellum (Completo, 2023)
          FABIANA SAN MARTIN , LENKA FULE , GREGORIO IRAOLA , ALEJANDRO BUSCHIAZZO , MATHIEU PICARDEAU
          Trends in Microbiology, v.: 31 p.:294 - 307, 2023
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: Netherlands
          ISSN: 0966842X
          DOI: 10.1016/j.tim.2022.09.010
          http://dx.doi.org/10.1016/j.tim.2022.09.010

        • Phylogenetic and Multiple-Locus Variable number tandem repeat analysis of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates from Argentina (Completo, 2022)
          BRENDA VASINI , PABLO FARACE , AMADIO ARIEL , KARINA CIRONE , LAURA MENDEZ , CLAUDIA MORSELLA , PABLO FRESIA , GREGORIO IRAOLA , ANDREA GIOFFRÉ , FERNANDO PAOLICCHI
          Veterinary Research Communications, 2022
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbiología veterinaria
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: Netherlands
          ISSN: 01657380
          E-ISSN: 15737446
          DOI: 10.1007/s11259-022-09983-8
          http://dx.doi.org/10.1007/s11259-022-09983-8

        • First detection and origin of multi-drug resistant Klebsiella pneumoniae ST15 harboring OXA-48 in South America (Completo, 2022)
          CECILIA SALAZAR , VERÓNICA ANTELO , MARIELA VIEYTES , CRISTINA DÁVILA , FABIO GRILL , ANTONIO GALIANA , GREGORIO IRAOLA
          Journal of Global Antimicrobial Resistance, 2022
          Palabras clave: OXA-48 Klebsiella pneumoniae Nanopore
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: Netherlands
          ISSN: 22137165
          DOI: 10.1016/j.jgar.2022.08.005
          http://dx.doi.org/10.1016/j.jgar.2022.08.005

        • A Two-Time Point Analysis of Gut Microbiota in the General Population of Buenos Aires and Its Variation Due to Preventive and Compulsory Social Isolation During the COVID-19 Pandemic (Completo, 2022)
          PABLO AGUILERA , MARÍA FLORENCIA MASCARDI , FIORELLA SABRINA BELFORTE , AYELÉN DAIANA ROSSO , SOFÍA QUESADA , IGNACIO LLOVET , GREGORIO IRAOLA , JULIETA TRINKS , ALBERTO PENAS-STEINHARDT
          Frontiers in Microbiology, v.: 13 2022
          Palabras clave: COVID-19 Microbiota
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma
          Medio de divulgación: Internet
          Lugar de publicación: Switzerland
          E-ISSN: 1664302X
          DOI: 10.3389/fmicb.2022.803121
          http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2022.803121

        • Annotating unknown species of urban microorganisms on a global scale unveils novel functional diversity and local environment association (Completo, 2021)
          IRAOLA G. , WU J. , DANKO D. , AFSHINNEKOO E. , BEZDAN D. , BHATTACHARYYA M. , CASTRO-NALLAR E. , CHMIELARCZYK A. , HAZLIN N. , DENG Y. , DIAS-NETO E. , FROLOVA A. , MASON-BUCK G. , JANG S. , LABAJ P. , LEES P. , NIETO-CABALLERO M. , OSUOLALEU O. , OZOUNIS C. , PERLIN M. , PRITHIVIRAJ B. , RASCOVAN N. , ROZANSKA A. , SCHRIML L. , SEMMLER T. , SUZUKI H. , UGALDE J. , YOUNG B. , WERNER J. , ZAMBRANO M. , ZHAO Y. , MASON C. , SHI T. , MetaSUB International Consortium
          Environmental Research, 2021
          Palabras clave: Microbioma Metagenómica Ambiente construído
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Metagenómica
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 00139351
          E-ISSN: 10960953

        • Pangenome analysis reveals genetic isolation in Campylobacter hyointestinalis subspecies adapted to different mammalian hosts (Completo, 2021)
          COSTA, D. , LEVESQUE S. , KUMAR N, , Fresia P , FERRÉS I. , LAWLEY T. , IRAOLA G.
          Scientific Reports, v.: 11 1 , p.:1 - 10, 2021
          Palabras clave: Campylobacter hyointestinalis Pangenoma
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Evolución bacteriana
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20452322

        • COVID-19 drug practices risk antimicrobial resistance evolution (Completo, 2021)
          AFSHINNEKOO E. , BHATTACHARYA C. , BURGUETE-GARCIA A. , CASTRO-NALLAR E. , DENG Y. , DESNUES C. , DIAS-NETO E. , ELHAIK E. , IRAOLA G. , JANG S. , LABAJ P. , MASON C. , NAGARAJAN N. , POULSEN M. , PRITHIVIRAJ B. , SIAM R. , SHI T. , SUZUKI H. , WERNER J. , ZAMBRANO M. , BHATTACHARYYA M.
          The Lancet Microbe, 2021
          Palabras clave: COVID-19 Resistencia antimicrobiana
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 26665247

        • Early transcontinental import of SARS-CoV-2 variant of concern 202012/01 (B.1.1.7) from Europe to Uruguay (Completo, 2021)
          SALAZAR C. , COSTÁBILE A. , FERRÉS I. , PERBOLIANACHIS, P , PEREIRA-GÓMEZ M. , SIMÓN D. , GALIANA A. , PI B. , ANTELO V. , GARCÍA R. , MORENO P. , MORATORIO G. , IRAOLA G.
          Frontiers in Virology, 2021
          Palabras clave: SARS-CoV-2 COVID-19 Nanopore VOC Vigiliancia gen?mica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Genómica viral
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 2673818X
          DOI: 10.3389/fviro.2021.685618

        • A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance (Completo, 2021)
          DANKO D. , BEZDAN D. , AFSHIN E. , AHSANUDDIN S. , BHATTACHARYA C. , BUTLER D. , CHNG REI K. , DONNELLAN D. , HECHT J. , JACKSON K. , KUCHIN K. , KARASIKOV M. , LYONS A. , MAK L. , MELESHKO D. , MUSTAFA H. , MUTAI B. , NECHES R. , NG A. , NIKOLAYEVA O. , NIKOLAYEVA T. , PNG E. , RYON K. , SANCHEZ J. , SHAABAN H. , SIERRA M. , THOMAS D. , YOUNG B. , ABUDAYYEH O. , ALICEA J. , BHATTACHARYYA M. , BLEKHMAN R. , CASTRO-NALLAR E. , CAÑAS A. , CHATZIEFTHIMIOU A. , CRAWFORD R. , DE FILIPPIS F. , DENG Y. , DESNUES C. , DIAS-NETO E. , DYBWAD M. , ELHAIK E. , ERCOLINI D. , FROLOVA A. , GANKIN D. , GOOTENBERG J. , GRAF A. , GREEN D. , HAJIRASOULIHA I. , HASTINGS J. , HERNANDEZ M. , IRAOLA G. , JANG S. , KHALES A. , KELLY F. , KNIGHTS K. , KYRPIDES N. , LABAJ P. , LEE P. , LEUNG M. , LJUNGDAHL P. , et al.
          Cell, 2021
          Palabras clave: Microbioma urbano Bioinform?tica Resistencia a antibi?ticos Metagen?mica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Metagenómica
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 00928674
          E-ISSN: 10974172
          DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.05.002
          https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00585-7

        • Accurate and fast identification of Campylobacter fetus in bulls by real-tie PCR targeting a 16S rRNA gene sequence (Completo, 2021)
          IRAOLA G. , Delpiazzo R. , BARCELLOS M. , BARRIOS S. , FRAGA M. , BETANCOR L. , GIL J. , MORSELLA C. , PAOLICCHI F. , PÉREZ R. , RIET-CORREA F. , SANGUINETTI M. , SILVA A. , SILVEIRA, C.S. , CALLEROS L
          Veterinary and Animal Science, v.: 11 2021
          Palabras clave: Campylobacter Real-Time PCR Campylobacteriosis Bovinos Diagnóstico
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbiología Molecular
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 2451943X
          DOI: https://doi.org/10.1016/j.vas.2020.100163

        • Emergence and spread of a B. 1.1. 28-derived P. 6 lineage with Q675H and Q677H Spike mutations in Uruguay (Completo, 2021)
          REGO N. , SALAZAR C. , PAZ M. , COSTÁBILE A. , FAJARDO A. , FERRÉS I. , PERBOLIANACHIS P. , FERNÁNDEZ-CALERO T. , NOYA V. , MACHADO M. , BRANDES M. , ARCE R. , ARLEO M. , POSSI T. , REYES N. , BENTANCOR MN. , LIZASOAIN A. , BORTAGARAY V. , MOLLER A. , CHAPPOS O. , NIN N. , HURTADO J. , DUQUÍA M. , GRIFFERO L. , MÉNDEZ M. , TECHERA MP. , ZANETTI J. , PEREIRA E. , RIVERA B. , MAIDANA M. , ALONSO M. , SMIRCICH P. , ARANTES I. , MIR D. , Cecilia Alonso Bianco , MEDINA J. , ALBORNOZ H. , COLINA R. , BELLO G. , MORENO P. , MORATORIO G. , IRAOLA G. , SPANGENBERG L.
          Viruses, v.: 11 2021
          Palabras clave: SARS-CoV-2 COVID-19 Vigilancia genómica Variantes Secuenciación genómica Oxford Nanopore
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Epidemiología / Vigilancia genómica
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Filogenética
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Virología
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 19994915
          DOI: https://doi.org/10.3390/v13091801
          Co-autores de correspondencia: L. Spangenberg, G. Iraola, P. Moreno, G. Moratorio.

        • An object-oriented framework for evolutionary pangenome analysis (Completo, 2021)Trabajo relevante
          FERRÉS I. , IRAOLA G.
          Cell Reports Methods, v.: 1 2021
          Palabras clave: Pangenoma R Software
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Desarrollo de software
          ISSN: 26672375
          DOI: https://doi.org/10.1016/j.crmeth.2021.100085

        • Protocol for post-processing of bacterial pangenome data using Pagoo pipeline (Completo, 2021)
          FERRÉS I. , IRAOLA G.
          STAR Protocols, v.: 2 4 , 2021
          Palabras clave: R Pangenoma Evolución Protocolo Software
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Desarrollo de software
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 26661667
          DOI: https://doi.org/10.1016/j.xpro.2021.100802

        • Real-time genomic surveillance for SARS-CoV-2 variants of concern, Uruguay (Completo, 2021)
          REGO N. , COSTÁBILE, A , PAZ M. , SALAZAR C. , SPANGENBERG L. , FERRÉS I. , ARCE R. , FAJARDO A. , ARLEO M. , POSSI T. , REYES N. , BENTANCOR MN. , LIZASOAIN A. , BENITEZ-GALEANO MJ. , BORTAGARAY V. , MOLLER A. , BELLO G. , ARANTES I. , BRANDES M. , SMIRCICH P. , CHAPPOS O. , DUQUÍA M. , GONZÁLEZ B. , GRIFFERO L. , MÉNDEZ M. , TECHERA MP. , ZANETTI J. , RIVERA B. , MAIDANA M. , ALONSO M. , Cecilia Alonso Bianco , MEDINA J. , ALBORNOZ H. , COLINA R. , NOYA V. , IRAOLA G. , FERNÁNDEZ-CALERO T. , MORATORIO G. , MORENO P.
          Emerging Infectious Diseases, v.: 27 2021
          Palabras clave: Vigilancia genómica SARS-CoV-2 COVID-19 Secuenciación
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica viral
          Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Epidemiología / Vigilancia genómica
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 10806040
          E-ISSN: 10806059
          DOI: 10.3201/eid2711.211198

        • Schwann cell reprogramming into repair cells increases miRNA-21 expression in exosomes promoting axonal growth (Completo, 2020)
          López-Leal R. , Díaz-Viraqué F , IRAOLA G. , Catalán R. , Saquel C. , Enright A. , Court F.
          Journal of Cell Science, v.: 133 12 , 2020
          Palabras clave: miRNAs expresión génica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 14779137
          DOI: 10.1242/jcs.239004

        • Occurrence and diversity of Campylobacter species in captive chelonians (Completo, 2020)
          De Luca C. , IRAOLA G. , Apostolakos I. , Boetto E. , Piccirillo A.
          Veterinary Microbiology, v.: 241 p.:10856 2020
          Palabras clave: Campylobacter
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bacteriología
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 03781135

        • Draft genome sequences of 40 pathogenic Leptospira strains isolated from cattle in Uruguay (Completo, 2019)
          Nieves C , FERRÉS I. , Díaz-Viraqué F , BUSCHIAZZO, A. , ZARANTONELLI L , IRAOLA G.
          Microbiology Resource Announcements, v.: 8 47 , 2019
          Palabras clave: Leptospirosis Genómica Genómica microbiana Secuenciación
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica Microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 2576098X
          DOI: 10.1128/MRA.00893-19

        • Urban metagenomics uncover antibiotic resistance reservoirs in coastal beach and sewage waters (Completo, 2019)Trabajo relevante
          Fresia P , ANTELO V. y/o Verónica Antelo , SALAZAR C. , Giménez, M. , D'Alessandro B. , Afshinnekoo E , Mason C , Gonnet G. , IRAOLA G.
          Microbiome, 2019
          Palabras clave: Microbioma Microbioma urbano Metagenómica Resistencia a antibióticos Playas Saneamiento Patógenos
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Metagenómica
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20492618
          DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-019-0648-z

        • The fecal, oral, and skin microbiota of children with Chagas disease treated with benznidazole (Completo, 2019)
          ROBELLO, C. , Maldonado DP , Hevia A , Hoashi M , Frattaroli P , Montacutti V , Heguy A , Dolgalev I , Mojica M , IRAOLA G. , Domínguez-Bello MG
          PLoS ONE, 2019
          Palabras clave: Microbioma Chagas Benznidazole Trypanosoma
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 19326203
          DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0212593

        • Nanopore sequencing significantly improves genome assembly of the protozoan parasite Trypanosoma cruzi (Completo, 2019)
          Díaz-Viraqué F , PITA, S , GREIF, G. , Moreira de Souza RC , IRAOLA G. , ROBELLO, C.
          Genome Biology and Evolution, v.: 11 7 , p.:1952 - 1957, 2019
          Palabras clave: Enfermedad de Chagas Trypanosoma cruzi Oxford Nanopore Technologies Secuenciación de tercera generación Secuenciación genómica Ensamblado híbrido
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Computación e Información / Genómica microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 17596653
          DOI: https://doi.org/10.1093/gbe/evz129

        • simurg: simulate bacterial pangenomes in R (Completo, 2019)
          FERRÉS I. , IRAOLA G.
          Bioinformatics, 2019
          Palabras clave: Pangenoma Evolución neutral Software R
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 13674803
          E-ISSN: 14602059
          DOI: 10.1093/bioinformatics/btz735
          Author de correspondencia

        • Integrated genomic epidemiology and phenotypic profiling of Clostridium difficile across intra-hospital and community populations in Colombia (Completo, 2019)
          Muñoz M , Restrepo-Montoya D , Kumar N , IRAOLA G. , Camargo M , Díaz-Arévalo D , Roa-Molina N , Tellez M , Herrera G , Ríos-Chaparro D , Birchendall C , Pinilla D , Pardo-Oviedo J , Rodríguez-Leguizamón G , Josa D , Lawley , Patarroyo A , Ramírez JD
          Scientific Reports, 2019
          Palabras clave: Clostridium difficile Genómica comparativa Colombia
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Computación e Información / Genómica microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20452322
          DOI: 10.1038/s41598-019-47688-2

        • Pathogenomics of emerging Campylobacter species (Completo, 2019)Trabajo relevante
          COSTA, D. , IRAOLA G.
          Clinical Microbiology Reviews, 2019
          Palabras clave: Campylobacter; infecciones emergentes; genómica comparativa; patogenómica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbiología clínica
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 08938512
          E-ISSN: 10986618

        • Polyclonal Campylobacter fetus infections among unrelated patients, Montevideo, Uruguay, 2013-2018 (Completo, 2019)
          COSTA, D. , BETANCOR L , GADEA P. , CABEZAS, L. , CAIATA L. , PALACIO R. , SEIJA V , A.Galiana , VIEYTES M. , CHRISTOPHERSEN I. , CALLEROS L , IRAOLA G.
          Clinical Infectious Diseases, 2019
          Palabras clave: Campylobacter Epidemiología Uruguay Campylobacter fetus Genómica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 10584838
          E-ISSN: 15376591
          DOI: https://doi.org/10.1093/cid/ciz657

        • Comparative genomics identifies potential virulence factors in Clostridium tertium and C. paraputrificum (Completo, 2019)
          MUÑOZ M. , RESTREPO-MONTOYA D. , KUMAR N. , IRAOLA G. , HERRERA G. , RÍOS-CHAPARRO DI. , DÍAZ-ARÉVALO D. , PATARROYO MA. , LAWLEY TD. , RAMÍREZ JD.
          Virulence, v.: 10 1 , p.:657 - 676, 2019
          Palabras clave: Clostridium Virulencia Infecciones intrahospitalarias Genómica Secuenciación
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 21505594
          E-ISSN: 21505608
          DOI: https://doi.org/10.1080/21505594.2019.1637699

        • Surveying what's flushed away (Completo, 2018)
          IRAOLA G. , Kumar N
          Nature Reviews Microbiology, v.: 16 456 , 2018
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 17401526
          E-ISSN: 17401534
          DOI: https://doi.org/10.1038/s41579-018-0047-7
          https://www.nature.com/articles/s41579-018-0047-7

        • First Release of the Bacterial Biobank of the Urban Environment (BBUE) (Completo, 2018)
          Antelo V , Salazar C , Martínez A , D'Alessandro B , Castro M , BETANCOR L , María Victoria Barcala , Míguez D , Gonnet G , IRAOLA G.
          Microbiology Resource Announcements, 2018
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bacteriología
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 2576098X
          DOI: https://doi.org/10.1128/MRA.01201-18
          https://mra.asm.org/content/7/16/e01201-18

        • The Tritryps comparative repeatome: insights on repetitive element evolution in Trypanosomatid pathogens (Completo, 2018)
          PITA, S , Díaz-Viraqué F , IRAOLA G. , ROBELLO, C.
          Genome Biology and Evolution, 2018
          Palabras clave: Trypanosoma Repeatoma Secuenciación masiva Tripanosomátidos
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 17596653
          DOI: https://doi.org/10.1093/gbe/evz017

        • Inter-and intracontinental migrations and local differentiation have shaped the contemporary epidemiological landscape of canine parvovirus in South America (Completo, 2018)
          GRECCO S. , IRAOLA G. , Decaro N , Alfieri A , Alfieri AM , Calderón MG , da Silva AP , Name D , Aldaz J , CALLEROS L , Marandino A , Tomás G , Maya L , Francia L , PANZERA, Y. , PÉREZ R
          Virus Evolution, 2018
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Evolución viral
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20571577
          DOI: https://doi.org/10.1093/ve/vey011
          https://academic.oup.com/ve/article/4/1/vey011/4965880

        • MLSTar: automatic multilocus typing of bacterial genomes in R (Completo, 2018)
          FERRÉS I. , IRAOLA G.
          PeerJ, v.: 6 e2663, 2018
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 21678359

        • Biodiversity of environmental Leptospira: improving identification and revisiting the diagnosis (Completo, 2018)
          Thibeaux R , Girault D , Bierque E , Soupé-Gilbert ME , Rettinger A , Douyere A , Meyer M , IRAOLA G. , Picardeau M , Goarant C
          Frontiers in Microbiology, 2018
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 1664302X
          DOI: 10.1099/mgen.0.000144
          http://mgen.microbiologyresearch.org/content/journal/mgen/10.1099/mgen.0.000144

        • Whole genome sequencing of the monomorphic pathogen Mycobacterium bovis reveals local differentiation of cattle clinical isolates (Completo, 2018)
          LASSERRE, M. , Fresia P , GREIF, G. , IRAOLA G. , Castro-Ramos M , , Alvaro NÚÑEZ FERNANDEZ , NAYA H , ROBELLO, C. , BERNA, L.
          BMC Genomics, 2018
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 14712164
          DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-017-4249-6
          https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-4249-6

        • Deciphering the unexplored Leptospira diversity from soils uncovers genomic evolution to virulence (Completo, 2018)Trabajo relevante
          Thibeaux R , IRAOLA G. , FERRÉS I. , Bierque E , Girault D , Soupé-Gilbert ME , Picardeau M , Goarant C
          Microbial Genomics, v.: 4 2018
          Palabras clave: Leptospira Diversidad Taxonomía genómica Virulencia Evolución Genómica comparativa
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20575858
          DOI: 10.1099/mgen.0.000144
          http://mgen.microbiologyresearch.org/content/journal/mgen/10.1099/mgen.0.000144
          Primer autor compartido con Roman Thibeaux.

        • Phylen: automatic phylogenetic reconstruction using the EggNOG database (Completo, 2018)
          FERRÉS I. , IRAOLA G.
          Journal of Open Source Software, 2018
          Palabras clave: Filogenética Filogenómica bacteriana R
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Filogenética
          E-ISSN: 24759066
          DOI: 10.21105/joss.00593
          https://joss.theoj.org/papers/aeedb5e6a0e6d0cd88ec273eb50e1254
          Autor de correspondencia.

        • Distinct Campylobacter fetus lineages adapted as livestock pathogens and human pathobionts in the intestinal microbiota (Completo, 2017)Trabajo relevante
          IRAOLA G. , FORSTER S. , KUMAR N , LEHOURS P , BEKAL S. , GARCíA-PEñA F. , PAOLICCHI F , MORSELLA C , HOTZEL H. , HSUEH PR. , VIDAL A. , LEVéSQUE S. , YAMAZAKI W. , BALZAN C. , VARGAS A. , PICCIRILLO A , CHABAN B. , HILL J. , BETANCOR L , COLLADO L , TRUYERS I. , MIDWINTER A. , DAGI HT. , MéGRAUD F. , CALLEROS L. , PÉREZ R. , NAYA H , LAWLEY T.D.
          Nature Communications, v.: 8 1 , 2017
          Palabras clave: Campylobacter fetus Genómica Microbiota Adaptación Patobionte
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 20411723
          DOI: 10.1038/s41467-017-01449-9
          Autor de correspondencia compartido con Trevor D. Lawley.

        • Campylobacter ornithocola sp. nov., a new member of the Campylobacter lari group isolated from wild bird faecal samples (Completo, 2017)
          CáCERES A , MUñOZ I , IRAOLA G. , DíAZ-VIRAQUé F , COLLADO L
          International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017
          Palabras clave: Campylobacter Taxonomía genómica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
          Medio de divulgación: Papel
          ISSN: 14665026
          E-ISSN: 14665034

        • Leptospira venezuelansiae sp. nov., a new intermediate species isolated from rats, cattle and humans (Completo, 2017)
          PUCHE R , FERRéS I , CARABALLO L , PICARDEAU M , TAKRIFF H , IRAOLA G.
          International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017
          Palabras clave: Leptospira Taxonomía genómica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
          Medio de divulgación: Papel
          ISSN: 14665026
          E-ISSN: 14665034
          Autor de correspondencia.

        • Genomic and clinical evidence uncovers the enterohepatic species Helicobacter valdiviensis as a potential human instestinal pathogen (Completo, 2017)
          FRESIA P , JARA R , SIERRA R , FERRéS I , GREIF G , IRAOLA G. , COLLADO L
          Helicobacter, 2017
          Palabras clave: Genómica Helicobacter Enteroepática
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 10834389
          E-ISSN: 15235378
          DOI: 10.1111/hel.12425
          Autor de correspondencia compartido con Luis Collado.

        • Assessing the intra-species genetic variability in the clonal pathogen Campylobacter fetus: CRISPRs are highly polymorphic DNA markers (Completo, 2017)
          CALLEROS L. , BETANCOR L , IRAOLA G. , MÉNDEZ A , MORSELLA C , PAOLICCHI F , SILVEYRA S , VELILLA A , PÉREZ R.
          Journal of Microbiological Methods, v.: 132 p.:86 - 94, 2017
          Palabras clave: Campylobacter fetus CRISPR
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genética bacteriana
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Evolución bacteriana
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
          Medio de divulgación: Papel
          ISSN: 01677012

        • Transcriptome sequencing reveals wide expression reprogramming of basal and unknown genes in Leptospira biflexa biofilms (Completo, 2016)Trabajo relevante
          IRAOLA G. , SPANGENBERG L , LOPES BASTOS B , GRAñA M , VASCONCELOS L , ALMEIDA A , GREIF G , ROBELLO C , RISTOW P , NAYA H
          mSphere, 2016
          Palabras clave: Leptospira biofilms transcriptoma
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 23795042

        • A novel real-time PCR assay for quantitative detection of Campylobacter fetus based on ribosomal sequences (Completo, 2016)
          IRAOLA G. , PÉREZ R. , BETANCOR L , MARANDINO A. , MORSELLA C , MÉNDEZ A , PAOLICCHI F , PICCIRILLO A , CALLEROS L.
          BMC Veterinary Research, 2016
          Palabras clave: Campylobacter fetus Campylobacteriosis Real-Time PCR
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genética bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 17466148

        • Campylobacter geochelonis sp. nov. isolated from the western Hermann's tortoise (Testudo hermanni hermanni) (Completo, 2016)
          NIERO G , PICCIRILLO A , CALLEROS L. , PÉREZ R. , NAYA H , IRAOLA G.
          International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, p.:3468 - 3476, 2016
          Palabras clave: Campylobacter Testudo hermanni Reptiles Taxonomía Filogenética
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Taxonomía bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: 14665026
          E-ISSN: 14665034
          DOI: 10.1099/ijsem.0.001219
          Autor de correspondencia compartido con Alessandra Piccirillo.

        • Genetic characterization of South American Infectious Bursal Disease Virus reveals the existence of a distinct worldwide-spread genetic lineage (Completo, 2015)
          HERNÁNDEZ M. , TOMÁS G , MARANDINO A. , IRAOLA G. , MAYA L. , MATTION N , HERNÁNDEZ D. , VILLEGAS P , BANDA A , PANZERA Y. , PÉREZ R.
          Avian Pathology, 2015
          Palabras clave: Evolución IBDV Filogenética
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Genética Viral
          Medio de divulgación: Papel
          ISSN: 03079457
          E-ISSN: 14653338

        • Phylodynamics analysis of avian infectious bronchitis virus in South America (Completo, 2015)
          MARANDINO A. , PEREDA A , TOMÁS G , HERNÁNDEZ M. , IRAOLA G. , CRAIG MI , HERNÁNDEZ D. , BANDA A , VILLEGAS P , PANZERA Y. , PÉREZ R.
          Journal of General Virology, 2015
          Palabras clave: Filodinámica Virus de la Bronquitis Infecciosa Aviar Evolución
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Filogenética
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Genética Viral
          Medio de divulgación: Papel
          ISSN: 00221317
          E-ISSN: 14652099

        • A rural worker infected with a bovine-prevalent genotype of Campylobacter fetus subsp. fetus supports zoonotic transmission and inconsistency of MLST and whole-genome typing (Completo, 2015)
          IRAOLA G. , BETANCOR L , CALLEROS L. , GADEA P , ALGORTA G , GALEANO S , MUXI P , GREIF G , PÉREZ R.
          European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, v.: 34 8 , p.:1593 - 1596, 2015
          Palabras clave: Campylobacter fetus MLST Genómica Cancer Bacteremia
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
          ISSN: 09349723
          E-ISSN: 14354373
          DOI: 10.1007/s10096-015-2393-y
          https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10096-015-2393-y
          Autor de correspondencia.

        • Molecular phylogeography of canine distemper virus: geographic origin and global spreading (Completo, 2015)
          PANZERA Y. , SARUTE N , IRAOLA G. , HERNÁNDEZ M. , PÉREZ R.
          Molecular Phylogenetics and Evolution, 2015
          Palabras clave: Filogeografía Virus Distemper Canino Evolución viral
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Evolución viral
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Filogenética
          Medio de divulgación: Papel
          E-ISSN: 10959513

        • Whole-genome sequences of Mycobacterium bovis strain MbURU-001, isolated from fresh bovine infected samples (Completo, 2015)
          LASSERRE M , BERNÁ L , GREIF G , DíAZ-VIRAQUé F , IRAOLA G. , NAYA H , CASTRO-RAMOS M , JUAMBELTZ A , ROBELLO C
          Genome Announcements, 2015
          Palabras clave: Genómica tuberculosis Mycobacterium
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          E-ISSN: 21698287

        • Phylogenetic and Genome-Wide Deep-Sequencing Analyses of Canine Parvovirus Reveal Co-Infection with Field Variants and Emergence of a Recent Recombinant Strain (Completo, 2014)
          PÉREZ R. , CALLEROS L. , MARANDINO A. , SARUTE N , IRAOLA G. , GRECCO S , BLANC H , VIGNUZZI M , ISAKOV O , SHOMRON N , CARRAU L , HERNÁNDEZ M. , FRANCIA L , SOSA K , TOMÁS G , PANZERA Y.
          PLoS ONE, 2014
          Palabras clave: Secuenciación Parvovirus Recombinación Co-infección
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología /
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 19326203

        • Whole-Genome Sequencing of an Isoniazid-Resistant Clinical Isolate of Mycobacterium tuberculosis Strain MtURU-002 from Uruguay (Completo, 2014)
          BERNÁ L , IRAOLA G. , GREIF G , COITINHO C , RIVAS C , NAYA H , ROBELLO C
          Genome Announcements, 2014
          Palabras clave: NGS Genómica tuberculosis Mycobacterium
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          E-ISSN: 21698287

        • Complete genome sequence of Mycobacterium tuberculosis strain MtURU-001, isolated from a rapidly progressing outbreak in Uruguay (Completo, 2014)
          GREIF G , IRAOLA G. , BERNÁ L , COITINHO C , RIVAS C , NAYA H , ROBELLO C
          Genome Announcements, 2014
          Palabras clave: NGS Mycobacterium
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 21698287

        • Genomic evidence for the emergence and evolution of pathogenicity and niche preferences in the genus Campylobacter (Completo, 2014)Trabajo relevante
          IRAOLA G. , PÉREZ R. , NAYA H , PAOLICCHI F , PASTOR E , VALENZUELA S , CALLEROS L. , VELILLA A , HERNÁNDEZ M. , MORSELLA C
          Genome Biology and Evolution, 2014
          Palabras clave: Patogenicidad Campylobacter sputorum Tropismo de tejido Genómica bacteriana Patgenicidad
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica Bacteriana
          Medio de divulgación: Papel
          E-ISSN: 17596653
          Autor de correspondencia.

        • Phylodynamics analysis of canine parvovirus in Uruguay: evidence of two successive invasions by different variants (Completo, 2013)
          MAYA L. , CALLEROS L. , FRANCIA L , HERNÁNDEZ M. , IRAOLA G. , PANZERA Y. , SOSA K , PÉREZ R.
          Archives of Virology, 2013
          Palabras clave: Canine Parvovirus Phylodynamics
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Virología / Genética Viral
          Medio de divulgación: Papel
          Lugar de publicación: Vienna
          ISSN: 03048608
          E-ISSN: 14328798
          http://www.springer.com/biomed/virology/journal/705

        • Glycerol-3-phosphate dehydrogenase Isoforms´ Differential Expression in Flight Muscles of the Chagas Disease Vector Triatoma infestans (Hemiptera, Reduviidae) (Completo, 2013)
          STOPPA M. , LAGUNAS M , GARCÍA B. , PANZERA Y. , IRAOLA G. , GEREZ DE BURGOS N
          American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 2013
          Palabras clave: Triatoma infestans Chagas Glycerol-3-fosfato deshidrogenasa
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia /
          Medio de divulgación: Papel
          ISSN: 00029637
          E-ISSN: 14761645

        • High local genetic diversity of canine parvovirus from Ecuador (Completo, 2013)
          ALDAZ J , GARCÍA J , CALLEROS L. , SOSA K , IRAOLA G. , MARANDINO A. , HERNÁNDEZ M. , PANZERA Y. , PÉREZ R.
          Veterinary Microbiology, 2013
          Palabras clave: Parvovirus canino Ecuador
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Genética viral
          Medio de divulgación: Papel
          ISSN: 03781135

        • Complete genome sequence of Campylobacter fetus subsp. venerealis biovar. intermedius, isolated from the prepuce of a bull (Completo, 2013)
          IRAOLA G. , PÉREZ R. , NAYA H , PAOLICCHI F , HARRIS D , LAWLEY T , REGO N , HERNÁNDEZ M. , CALLEROS L. , CARRETTO L. , VELILLA A , MORSELLA C , MÉNDEZ A , GIOFFRE A
          Genome Announcements, 2013
          Palabras clave: Campylobacter fetus venerealis intermedius Campylobacteriosis Secuenciación genómica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 21698287
          Autor de correspondencia.

        • Reduced set of virulence genes allows high accuracy prediction of bacterial pathogenicity in humans (Completo, 2012)Trabajo relevante
          IRAOLA G. , VAZQUEZ G. , SPANGENBERG L , NAYA H
          PLoS ONE, v.: 7 8 e42144, p.:1 - 14, 2012
          Palabras clave: Machine Learning bacterial pathogenicity virulence genes
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Patogenicidad bacteriana
          Medio de divulgación: Internet
          E-ISSN: 19326203
          http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0042144

        • Application of a multiplex PCR assay for detection and subspecies differentiation of Campylobacter fetus from uncultured samples of bovine aborted fetuses (Completo, 2012)Trabajo relevante
          IRAOLA G. , HERNÁNDEZ M. , CALLEROS L. , PAOLICCHI F , SILVEYRA S , CARRETTO L. , VELILLA A , RODRÍGUEZ E , PÉREZ R.
          Journal of Veterinary Science, v.: 13 4 , p.:371 - 376, 2012
          Palabras clave: Multiplex PCR Campylobacter fetus
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genética bacteriana
          Medio de divulgación: Papel
          ISSN: 1229845X
          E-ISSN: 1976555X

      • No Arbitrados

        • Multiple introductions, regional spread and local differentiation during the first week of COVID-19 epidemic in Montevideo, Uruguay (Completo, 2020)
          SALAZAR C. , Díaz-Viraqué F , MARIANOEL PEREIRA-GÓMEZ , FERRÉS I. , MORENO P , MORATORIO G. , IRAOLA G.

          BioRxiv, 2020
          Palabras clave: SARS-CoV-2 COVID-19 Epidemiología genómica Oxford Nanopore
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Epidemiología / Epidemiología genómica
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Virología
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: CCBCCB
          DOI: 10.1101/2020.05.09.086223
        • Wedding higher taxonomic ranks with metabolic signatures coded in prokaryotic genomes (Completo, 2016)
          IRAOLA G. , NAYA H

          BioRxiv, 2016
          Palabras clave: Machine learning Taxonomía
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
          Medio de divulgación: Internet
          ISSN: CCBCCB
          https://www.biorxiv.org/content/early/2016/04/22/044115

  • Libros

    • Pathogenesis of Bacterial Infections in Animals ( Participación , 2022)
      IRAOLA G. , Boyce Publicado

      Editor/Compilador: Wiley-Blackwell
      Editorial: John Wiley & Sons
      Tipo de puplicación: Material didáctico
      Referado
      Escrito por invitación
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN/ISBN: 978-1-119-75479-4


      Capítulos:
      Understanding Pathogenesis Through Pathogenomics and Bioinformatics
      Página inicial 32, Página final 55

  • Publicación de trabajos presentados en eventos

    • Pangenome estimation takes a walk inside taxonomy (2018)
      Ferrés I , IRAOLA G.
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: X-meeting
      Ciudad: Sao Pedro
      Año del evento: 2018
      Publicación arbitrada
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
      Medio de divulgación: Internet
    • Clinical cases of Mycobacterium tuberculosis in Uruguay boarded by whole genome sequencing (2014)
      IRAOLA G. , GREIF G , BERNÁ L , COITINHO C , RIVAS C , NAYA H , ROBELLO C
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: Scientific Symposium of the Institut Pasteur International Network
      Ciudad: París
      Año del evento: 2014
      Publicación arbitrada
      Palabras clave: Genómica tuberculosis Mycobacterium
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
      Medio de divulgación: Internet
    • Genomic evidences for the emergence and evolution of pathogenicity and tissue tropism in the genus Campylobacter (2014)
      IRAOLA G. , PÉREZ R. , NAYA H , PAOLICCHI F , PASTOR E , VALENZUELA S , CALLEROS L. , VELILLA A , MORSELLA C , HERNÁNDEZ M. , MÉNDEZ A
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: Microbiology after the genomic era
      Ciudad: París
      Año del evento: 2014
      Palabras clave: Campylobacter Genómica Patogenicidad
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
      Medio de divulgación: Internet
    • Genome-wide characterization of Mycobacterium tuberculosis otbreaks in the low-risk uruguayan population (2014)
      IRAOLA G. , GREIF G , BERNÁ L , NAYA H , ROBELLO C
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: Microbiology after the genomic era
      Ciudad: París
      Año del evento: 2014
      Palabras clave: Genómica Mycobacterium tuberculosis
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
      Medio de divulgación: Internet
    • Dinámica evolutiva de la familia de proteínas Old Yellow Enzyme: la prostaglandina f2a sintasa de Trypanosoma cruzi (2014)
      DíAZ-VIRAQUé F , IRAOLA G. , ROBELLO C
      Publicado
      Resumen
      Evento: Nacional
      Año del evento: 2014
      Palabras clave: Old Yellow Enzyme Trypanosoma cruzi
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Evolución Molecular
      Medio de divulgación: Otros
    • Evolución genómica de la patogenicidad y el tropismo de tejido en el género Campylobacter (2014)
      IRAOLA G. , PASTOR E , PAOLICCHI F , CALLEROS L. , VALENZUELA S , VELILLA A , HERNÁNDEZ M. , MORSELLA C , MÉNDEZ A , NAYA H , PÉREZ R.
      Publicado
      Resumen
      Evento: Nacional
      Año del evento: 2014
      Palabras clave: Campylobacter Genómica Patogenicidad
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
    • Uso de CRISPRs (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat) como herramienta para la tipificación genética del patógeno clonal Campylobacter fetus. (2013)
      CALLEROS L. , VELILLA A , MORSELLA C , MÉNDEZ A , HERNÁNDEZ M. , IRAOLA G. , PÉREZ R.
      Publicado
      Resumen
      Evento: Regional
      Descripción: XIII Congreso Argentino de Microbiología
      Ciudad: Buenos Aires
      Año del evento: 2013
      Palabras clave: Campylobacter CRISPR
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genética Bacteriana
      Medio de divulgación: Internet
    • Detección mediante bacteriología y Real Time PCR de Campylobacter fetus subespecie fetus y subespecie venerealis en muestras de bovinos experimentalmente infectados. (2013)
      VELILLA A , IRAOLA G. , MORSELLA C , MÉNDEZ A , CALLEROS L. , PÉREZ R. , PAOLICCHI F
      Publicado
      Resumen
      Evento: Regional
      Descripción: XIII Congreso Argentino de Microbiología
      Ciudad: Buenos Aires
      Año del evento: 2013
      Palabras clave: Campylobacter PCR Infección experimental
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genética Bacteriana
      Medio de divulgación: Internet
    • Análise bioinformática de genes implicados na formação de biofilmes de Leptospira (2013)
      DOS SANTOS RIBEIRO P , LIMA G , SPANGENBERG L , IRAOLA G. , DA CUNHA S , CAFEZEIRO G , ALMEIDA A , VASCONCELOS L , NAYA H , RISTOW P
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: Congresso Brasileiro de Microbiologia
      Año del evento: 2013
      Palabras clave: Leptospira Biofilm Leptospirosis
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
      Medio de divulgación: Internet
    • Identificación de marcadores para el estudio de la variabilidad genética en Campylobacter fetus (2012)
      CALLEROS L. , HERNÁNDEZ M. , IRAOLA G. , PÉREZ R.
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: XXI Congreso de la Asociación Latinoamericana de Microbiología
      Ciudad: Santos
      Año del evento: 2012
      Palabras clave: variabilidad CRISPR
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología /
      Medio de divulgación: Internet
    • Shedding light into bacterial pathogenicity prediction: a machine learning approach (2012)
      IRAOLA G. , VAZQUEZ G. , SPANGENBERG L , NAYA H
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: ISCB-LA
      Ciudad: Santiago de Chile
      Año del evento: 2012
      Palabras clave: Machine Learning Bacterial pathogenicity prediction
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
      Medio de divulgación: Papel
    • Predicción de patogenicidad bacteriana en humanos (2012)
      IRAOLA G. , SPANGENBERG L , VAZQUEZ G. , NAYA H
      Publicado
      Resumen
      Evento: Regional
      Descripción: Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Biociencias
      Ciudad: Piriápolis
      Año del evento: 2012
      Palabras clave: Patogenicidad bacteriana
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genética bacteriana
      Medio de divulgación: Papel
    • Modeling the emergence of new human pathogens: bacteria as their own worst friends (2012)
      IRAOLA G. , SPANGENBERG L , VALENZUELA S , NAYA H
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: Second Meeting of the Institut Pasteur International Network Americas Region
      Año del evento: 2012
      Palabras clave: Bacteria Patogenicidad Emergente
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
      Medio de divulgación: Otros
    • Estudios de la organización del gen GPDH en Rhodnius prolixus y Triatoma infestans (Hemiptera-Reduviidae) (2011)
      STROPPA MM , CARRIAZO C , LAGUNAS M , IRAOLA G. , PANZERA Y. , GEREZ DE BURGOS N
      Publicado
      Resumen
      Evento: Regional
      Descripción: IX Congreso Argentino de Protozoología y Enfermedades Parasitarias
      Ciudad: Mar del Plata, Argentina
      Año del evento: 2011
      Anales/Proceedings:Revista Médica de Rosario
      Volumen:77
      ISSN/ISBN: 03275019
      Palabras clave: GDPH Triatoma Rhodnius
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Genética y Herencia / Citogenética
      Medio de divulgación: Papel
    • Genética aplicada al estudio de virus aviares (2011)
      HERNÁNDEZ M. , TOMÁS G , MARANDINO A. , IRAOLA G. , MAYA L. , HERNÁNDEZ D. , PANZERA Y. , FERRARA F. , PÉREZ R.
      Publicado
      Resumen
      Evento: Local
      Descripción: II Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Genética
      Ciudad: Montevideo
      Año del evento: 2011
      Palabras clave: PCR Diagnóstico Virus aviares
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genética Viral
      Medio de divulgación: Internet
    • Análisis de la variabilidad genética de Campylobacter fetus en Uruguay mediante MLST (2011)
      CALLEROS L. , HERNÁNDEZ M. , IRAOLA G. , SILVEYRA S , CARRETTO L.
      Publicado
      Resumen
      Evento: Local
      Descripción: II Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Genética
      Ciudad: Montevideo
      Año del evento: 2011
      Palabras clave: Campylobacter fetus MLST Variabilidad genética
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Genética Bacteriana
      Medio de divulgación: Internet
    • Genómica comparativa del género Campylobacter: identificación de nuevos blancos de diagnóstico para C. fetus (2010)
      IRAOLA G. , HERNÁNDEZ M. , CALLEROS L. , CARRETTO L. , PÉREZ R.
      Publicado
      Resumen
      Evento: Nacional
      Descripción: XIII Jornadas de la Sociedad Urugaya de Biociencias
      Ciudad: Pirápolis
      Año del evento: 2010
      Palabras clave: Genómica comparativa
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
      Medio de divulgación: Internet
      www.pasteur.edu.uy/sub
    • Detección de Campylobacter fetus venerealis mediante multiplex PCR (2010)
      IRAOLA G. , HERNÁNDEZ M. , CALLEROS L. , CARRETTO L. , SILVEIRA S. , PÉREZ R.
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: XX Congreso Latinoamericano de Microbiología
      Ciudad: Montevideo
      Año del evento: 2010
      Anales/Proceedings:XX Congreso Latinoamericano de Microbiología - Presentación oral
      Pagina inicial: 32
      ISSN/ISBN: 9789974819429
      Palabras clave: Campylobacter Multiplex PCR Diagnóstico
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genética bacteriana
      Medio de divulgación: Papel
      www.alam2010.org.uy
      Este trabajo fue seleccionado para ser presentado en forma oral
    • Desarrollo de un método molecular basado en RealTime PCR para el diagnóstico de Campylobacter fetus venerealis (2010)
      IRAOLA G. , HERNÁNDEZ M. , CALLEROS L. , CARRETTO L. , PÉREZ R.
      Publicado
      Resumen
      Evento: Internacional
      Descripción: XII Congreso Argentino de Microbiología
      Ciudad: Buenos Aires
      Año del evento: 2010
      Anales/Proceedings:XII Congreso Argentino de Microbiología
      Palabras clave: Campylobacter RealTime PCR Diagnóstico
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genética bacteriana
      Medio de divulgación: Papel
      www.aam.org.ar
    • Diagnóstico y caracterización de subespecies de Campylobacter fetus circulantes en ganado bovino uruguayo (2009)
      IRAOLA G. , HERNÁNDEZ M. , CALLEROS L. , SILVERA S. , CARRETTO L. , PÉREZ R.
      Publicado
      Resumen
      Evento: Regional
      Descripción: VI Jornadas de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular
      Ciudad: Montevideo
      Año del evento: 2009
      Palabras clave: Campylobacter, Diagnóstico, PCR
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Molecular y Genética Bacteriana
      Medio de divulgación: CD-Rom
    • Detección Molecular de Campylobacter fetus en ganado bovino uruguayo (2009)
      CALLEROS L. , IRAOLA G. , HERNÁNDEZ M. , CARRETTO L. , PÉREZ R.
      Publicado
      Resumen expandido
      Evento: Regional
      Descripción: Sextas Jornadas Técnicas de Veterinaria
      Ciudad: Montevideo
      Año del evento: 2009
      Palabras clave: Campylobacter, Diagnóstico, PCR
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Molecular y Genética Bacteriana
      Medio de divulgación: Internet
      www.fvet.edu.uy

  • Textos en periódicos o revistas

    • El cosquilleo intestinal que salvó al mundo (2018)
      ECOS Uruguay
      Periodicos
      IRAOLA G.

      Medio de divulgación: Internet
    • El camino del conocimiento es la recompensa (2018)
      ECOS Uruguay
      Periodicos
      IRAOLA G.

      Medio de divulgación: Internet
      http://ecos.la/WW/18/opinion/2018/07/26/25400/el-camino-del-conocimiento-es-la-recompensa/
    • Una sola salud y el efecto mariposa (2018)
      ECOS Uruguay
      Periodicos
      IRAOLA G.

      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Resistencia antimicrobiana
      Medio de divulgación: Internet
      Fecha de publicación: 21/04/2018
      http://ecos.la/LA/18/opinion/2018/04/21/22693/una-sola-salud-y-el-efecto-mariposa/

  • Producción técnica

    • Productos

      • Pagoo (2021)
        , Software
        FERRÉS I. , IRAOLA G.

        País: Uruguay
        Disponibilidad: Irrestricta
        Patente o Registro:

        Otros registros
        https://github.com/iferres/pagoo, Pagoo
        Depósito: 10/08/2021; Examen: ; Concesión:
        Patente nacional: NO
        Palabras clave: Genómica comparativa R Orientación a objetos Pangenoma
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
        Medio de divulgación: Internet
      • MLSTar (2018)
        , Software
        FERRÉS I. , IRAOLA G.
        Software escrito en R para genotipificación de bacterias usando datos genómicos
        País: Uruguay
        Disponibilidad: Irrestricta
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Filogenética
        Medio de divulgación: Internet
        https://github.com/iferres/MLSTar
      • Pewit (2018)
        , Software
        FERRÉS I. , Fresia P , IRAOLA G.
        Reconstrucción de pan-genomas bacterianos
        País: Uruguay
        Disponibilidad: Irrestricta
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
        Medio de divulgación: Internet
        https://github.com/iferres/Pewit
      • Phylen (2018)
        , Software
        FERRÉS I. , IRAOLA G.
        Reconstrucción filogenética utilizando la base de datos EggNOG
        País: Uruguay
        Disponibilidad: Irrestricta
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Filogenética
        Medio de divulgación: Internet
        https://github.com/iferres/phylen
      • Bacfier (2014)
        , Software
        SPANGENBERG L , IRAOLA G. , VAZQUEZ G. , NAYA H
        Predicción de patogenicidad bacteriana a partir de datos genómicos
        País: Uruguay
        Palabras clave: Patogenicidad bacteriana Genómica Predicción
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica
        Medio de divulgación: CD-Rom

    • Trabajos Técnicos

      • Métodos moleculares para el diagnóstico y tipificación de Brucelosis: aplicabilidad, desarrollo y transferencia de tecnologías (2015)
        Informe o Pericia técnica
        IRAOLA G.
        Asesoramiento en herramientas para el diagnóstico molecular de patógenos bacterianos
        País: Uruguay
        Idioma: Español
        Ciudad: Montevideo
        Número de páginas: 5
        Duración: 1 mes
        Palabras clave: PCR Diagnóstico MLST Brucella
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genética bacteriana

  • Otras Producciones

    • Cursos de corta duración dictados

      • Molecular, genomic and metagenomic tools to combat antimicrobial resistance (2019)
        IRAOLA G.
        Otro
        País: Uruguay
        Idioma: Inglés
        Medio divulgación: Internet
        Tipo de participación: Organizador
        Duración: 1 semanas
        Lugar: Institut Pasteur Montevideo
        Ciudad: Montevideo
        Institución Promotora/Financiadora: Institut Pasteur Montevideo
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
      • Herramientas básicas de bioinformática con aplicaciones en metagenómica (2019)
        NAYA H , GRAÑA, M. , Fresia P , IRAOLA G.
        Otro
        País: Bolivia
        Idioma: Español
        Medio divulgación: Internet
        Tipo de participación: Docente
        Duración: 2 semanas
        Lugar: Universidad Mayor de San Andrés
        Ciudad: La Paz
        Institución Promotora/Financiadora: Universidad Mayor de San Andrés
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
      • Hands-on microbiome data analysis: tools for understanding microbial communities in health and disease (2018)
        IRAOLA G.
        Otro
        País: Uruguay
        Idioma: Inglés
        Medio divulgación: Internet
        Tipo de participación: Organizador
        Duración: 1 semanas
        Lugar: Institut Pasteur de Montevideo
        Ciudad: Montevideo
        Institución Promotora/Financiadora: Institut Pasteur de Montevideo
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
      • Metagenómica funcional y descriptiva como herramientas de bioprospección (2018)
        IRAOLA G.
        Otro
        País: Uruguay
        Idioma: Español
        Medio divulgación: Internet
        Tipo de participación: Docente
        Duración: 2 semanas
        Lugar: Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable
        Ciudad: Montevideo
        Institución Promotora/Financiadora: Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
      • Hands-on metagenomics data analysis: tools for bioprospection in clinical and environmental microbiology (2017)
        IRAOLA G.
        Otro
        País: Uruguay
        Idioma: Inglés
        Medio divulgación: Internet
        Web: pasteur.uy
        Tipo de participación: Organizador
        Unidad: Unidad de Bioinformática
        Duración: 2 semanas
        Lugar: Institut Pasteur de Montevideo
        Ciudad: Montevideo
        Institución Promotora/Financiadora: Institut Pasteur de Montevideo
        Palabras clave: Metagenómica Microbioma Análisis de datos
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /
        Información adicional: Financiado por UNU-Biolac, Embajada Francesa en Uruguay e Institut Pasteur de Montevideo.
      • Hands-on course on high-throughput sequencing data analysis (2014)
        IRAOLA G.
        Otro
        País: Uruguay
        Idioma: Inglés
        Tipo de participación: Docente
        Duración: 2 semanas
        Lugar: Institut Pasteur de Montevideo
        Ciudad: Montevideo
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática /

  • Evaluaciones

    • Evaluación de Proyectos

      • Evaluación independiente de proyectos

        Vinculación con Científicos y Tecnólogos del Exterior ( 2022 )
        Uruguay
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII)
        Cantidad: Menos de 5
      • Comisión Sectorial de Investigación Científica (CSIC) ( 2021 )
        Uruguay
        Cantidad: Menos de 5
      • Fondo María Viñas ( 2020 / 2021 )
        Uruguay
        Cantidad: De 5 a 20
      • FONDECYT ( 2018 )
        Chile
        Cantidad: Menos de 5
      • BBSRC/NERC-CONICET Joint Awards for AMR in the Environment ( 2018 )
        Argentina
        British Bioscience Research Council
        Cantidad: Menos de 5
      • Agencia Nacional de Investigación e Innovación ( 2015 )
        Uruguay
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación
        Cantidad: De 5 a 20
      • Agencia Nacional de Promoción de Ciencia y Tecnología (ANPCyT) ( 2015 )
        Argentina
        Agencia Nacional de Promoción de Ciencia y Tecnología (ANPCyT)
        Cantidad: Menos de 5

    • Evaluación de Publicaciones

      • Comité editorial

        Frontiers in Cellular and Infection Microbiology ( 2022 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • Frontiers in Genetics ( 2020 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5

      • Revisiones

        Cell Reports Methods ( 2021 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • Frontiers in Genetics ( 2021 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: De 5 a 20
      • ISME Communications ( 2021 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • PLoS Genetics ( 2021 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • Microbial Genomics ( 2020 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • Microbiome ( 2019 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • Bioinformatics ( 2019 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • BMC Microbiology ( 2019 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • PeerJ ( 2019 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • Infection, Genetics and Evolution ( 2019 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • eLife ( 2019 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • Clinical Microbiology and Infection ( 2018 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • Science of the Total Environment ( 2018 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • Journal of Open Source Software ( 2018 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • Royal Society Open Science ( 2017 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5
      • International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology ( 2017 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: De 5 a 20
      • Journal of Microbiological Methods ( 2016 / 2018 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: De 5 a 20
      • Gene ( 2015 )
        Tipo de publicación: Revista
        Cantidad: Menos de 5

    • Evaluación de eventos y congresos

      • XLI Encuentro Anual de la Sociedad Chilena de Bioquímica y Biología Molecular ( 2018 )
        Revisiones
        Chile


      • X-meeting ( 2018 )
        Revisiones
        Brasil

        Sociedad Brasileña de Biología Computacional

    • Evaluación de premios

      • Premios INJU 2020 ( 2020 )
        Evaluación de premios y concursos

        Cantidad: Menos de 5

    • Evaluación de convocatorias concursables

      • Cargo concursable proyecto ANII "Centro Uruguayo de Metagenómica" ( 2017 )
        Comité evaluador
        Uruguay
        Cantidad: Menos de 5
      • Cargo concursable proyecto ANII-FSSA-X-2014-1-105252 ( 2016 )
        Comité evaluador
        Uruguay
        Cantidad: Menos de 5

    • Jurado de tesis

      • Ingeniería en Biotecnología ( 2021 )
        Jurado de mesa de evaluación de tesis
        Sector Educación Superior/Privado / Universidad ORT Uruguay / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        Nivel de formación: Grado

  • Formación de RRHH

    • Tutorías concluidas

      • Posgrado

        • Análisis metagenómico de la microbiota fecal de bovinos durante la infección con Fasciola hepatica utilizando tecnología Oxford Nanopore (2018 - 2024)
          Tesis de doctorado
          Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo , Uruguay
          Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas (PEDECIBA)
          Tipo de orientación: Tutor único o principal
          Nombre del orientado: Cecilia Salazar
          País: Uruguay
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
        • Genómica aplicada al estudio de Campylobacter fetus en humanos y animales de producción (2016 - 2024)
          Tesis de doctorado
          Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
          Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA)
          Tipo de orientación: Tutor único o principal
          Nombre del orientado: Daniela Costa
          País: Uruguay
          Palabras Clave: Campylobacter fetus Genómica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica comparativa
        • Desarrollo, implementación y optimización de herramientas de genómica comparativa para el género Leptospira
          Tesis de maestria
          Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Bioinformática , Uruguay
          Tipo de orientación: Tutor único o principal
          Nombre del orientado: Ignacio Ferrés
          País: Uruguay
          Palabras Clave: Genómica Leptospira Pangenoma MLST
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
        • Detección y caracterización de plásmidos asociados a resistencia a antibióticos en muestras de la Penlnsula Fildes fisla Rey forge)
          Tesis de maestria
          Sector Gobierno/Público / Ministerio de Educación y Cultura / Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable , Uruguay
          Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
          Nombre del orientado: Matías Giménez
          País: Uruguay
          Palabras Clave: Plásmidos Metagenómica Antártida Resistencia a antimicrobianos
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana

      • Grado

        • Caracterización de patógenos bacterianos en ambulancias
          Tesis/Monografía de grado
          Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Laboratorio de Genómica Microbiana , Uruguay
          Tipo de orientación: Tutor único o principal
          Nombre del orientado: Pablo Valdez
          País: Uruguay
          Palabras Clave: Microbioma Ambulancias Patógenos Resistencia a antimicrobianos Metagenómica Genómica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica Microbiana
        • Estudios genómicos en Campylobacter sputorum bv. sputorum
          Tesis/Monografía de grado
          Sector Educación Superior/Privado / Universidad ORT Uruguay / Facultad de Ingeniería , Uruguay
          Programa: Licenciatura en Biotecnología
          Nombre del orientado: Eugenia Pastor
          País: Uruguay
          Palabras Clave: Campylobacter Genómica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
        • Identificación de los genes involucrados en el metabolismo del ácido siálico en Leptospira
          Tesis/Monografía de grado
          Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
          Programa: Licenciatura en Ciencias Biológicas
          Nombre del orientado: Gabriel Martínez
          País: Uruguay
          Palabras Clave: Leptospira Ácido siálico
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana

    • Tutorías en marcha

      • Posgrado

        • Metagenómica funcional aplicada al descubrimiento de nuevas enzimas (2022)
          Tesis de doctorado
          Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Laboratorio de Genómica Microbiana , Uruguay
          Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas
          Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad ( IRAOLA G. , MANTA B )
          Nombre del orientado: Valeria Florez
          País/Idioma: Uruguay, Español
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica Microbiana
        • Análisis de comunidades microbianas de suelo en sistemas ganaderos sobre campo natural (2020)
          Tesis de doctorado
          Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Laboratorio de Genómica Microbiana , Uruguay
          Tipo de orientación: Tutor único o principal
          Nombre del orientado: Matías Giménez
          Medio de divulgación: Internet
          País/Idioma: Uruguay, Español
          Palabras Clave: Microbioma del suelo Campo natural Resistencia a antibióticos Carbono Metagenómica
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
        • Diversidad, evolución y genómica comparada del género Leptospira (2019)
          Tesis de doctorado
          Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Laboratorio de Genómica Microbiana , Uruguay
          Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
          Nombre del orientado: Ignacio Ferrés
          Medio de divulgación: Internet
          País/Idioma: Uruguay, Español
          Palabras Clave: Leptospira Bioinformática Leptospirosis Genómica comparativa Evolución
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana

      • Otras

        • A city-scale molecular map of antimicrobial resistance among hospital settings, the urban environment and human population: towards the application of metagenomics for the assessment of stewardship programs (2020)
          Orientación de posdoctorado
          Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Laboratorio de Genómica Microbiana , Uruguay
          Tipo de orientación: Tutor único o principal
          Nombre del orientado: Andrés Parada
          Medio de divulgación: Internet
          País/Idioma: Uruguay, Español
          Palabras Clave: Metagenómica Genómica microbiana Resistencia a antibióticos Microbioma
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
        • Rol de la microbiota intestinal en la respuesta a inmunoterapias contra el cáncer en Uruguay (2020)
          Orientación de posdoctorado
          Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas / Institut Pasteur de Montevideo / Institut Pasteur de Montevideo / Laboratorio de Genómica Microbiana , Uruguay
          Tipo de orientación: Tutor único o principal
          Nombre del orientado: Nadia Riera Faraone
          Medio de divulgación: Otros
          País/Idioma: Uruguay, Español
          Palabras Clave: Microbiota Inmunoterapia Melanoma Cáncer de pulmón
          Areas de conocimiento:
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Metagenómica
          Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Clínica / Oncología
          Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma humano

  • Otros datos relevantes

    • Premios, Honores y Títulos

      • Pasteur Network Talent Award (2021)
        (Internacional)
        Institut Pasteur International Network (RIIP)

      • León de Oro (2021)
        (Nacional)
        Club de Leones de Cardona y Florencio Sánchez

      • Reconocimiento de la Academia Nacional de Ciencias (2021)
        (Nacional)
        Academia Nacional de Ciencias
        Reconocimiento por la labor durante la pandemia por COVID-19 en Uruguay.
      • Beca de Doctorado (2014)
        (Nacional)
        CSIC

      • Beca de Maestría (2012)
        (Nacional)
        Comisión Sectorial de Investigación Científica (CSIC)

      • Mejor poster (SUB) (2012)
        (Nacional)
        Sociedad Uruguaya de Biociencias
        Premio al mejor poster, titualdo "Predicción de patogenicidad bacteriana en humanos", presentado en el congreso de la Sociedad Uruguaya de Biociencias 2012
      • Beca de Maestría (2011)
        (Nacional)
        CSIC

      • Beca de Iniciación a la Investigación (2010)
        (Nacional)
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación

    • Presentaciones en eventos

      • Phage Option (2024)
        Congreso
        A Bacteriophage Platform for the Treatment and Prevention of Bacterial Infections in Humans
        Colombia
        Tipo de participación: Conferencista invitado
        Alcance geográfico: Internacional Palabras Clave: Bacteriófagos Fagoterapia
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Biotecnología relacionada con la Salud / Fagoterapia
      • Global Microbiome Network - Fist Latin American Symposium (2021)
        Congreso
        The Latinbiota Consortium: understanding the gut microbiome composition and variability in LatAm populations
        Perú
        Tipo de participación: Conferencista invitado Palabras Clave: Microbioma América Latina
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
      • XXV Congreso Latinoamericano de Microbiología (2021)
        Congreso
        Presentación de 30 minutos en el simposio sobre microbiología ambiental
        Paraguay
        Tipo de participación: Conferencista invitado Palabras Clave: Microbiología ambiental Gen?mica microbiana Metagen?mica Bioinform?tica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica microbiana
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Metagenómica
      • Congreso Latinoamericano del Microbioma (2021)
        Congreso
        Presentación de 20 minutos sobre microbioma intestinal de poblaciones latinoamericanas
        México
        Tipo de participación: Conferencista invitado
        Nombre de la institución promotora: Universidad Autónoma de México (UNAM) Palabras Clave: Microbioma Metagen?mica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Metagenómica
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma humano
      • First Latinbiota Consortium Meeting (2021)
        Encuentro
        Primer encuentro virtual del Consorcio Latinbiota
        Uruguay
        Tipo de participación: Moderador Palabras Clave: Microbioma América Latina
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología
      • XVII Congreso Uruguayo de Medicina Intensiva (2021)
        Congreso
        Aportes de la biología molecular y la metagenómica en el combate de la multi-resistencia
        Uruguay
        Tipo de participación: Conferencista invitado Palabras Clave: Metagenómica Resistencia a antibióticos Microbiología clínica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genómica bacteriana
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Microbioma
      • 19th European Conference on Computational Biology (2020)
        Congreso
        Conferencista en la sección "Global Bioinformatics Communities Latin America"
        España
        Tipo de participación: Conferencista invitado Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
      • RIIP South American Regional Meeting (2019)
        Taller
        Surveying what?s flushed away: using urban wastewater as a proxy to population?s health
        Brasil
        Tipo de participación: Conferencista invitado
        Nombre de la institución promotora: Institut Pasteur International Network Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
      • XVII Congreso Latinoamericano de Genética (2019)
        Congreso
        Surveying the gut microbiota from urban wastewater: implications in risk assessment and public health
        Argentina
        Tipo de participación: Conferencista invitado
        Nombre de la institución promotora: Sociedad Latinoamericana de Genética Palabras Clave: Metagenómica Microbioma Patógenos Resistencia a antibióticos
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
      • X-meeting (2018)
        Congreso
        Bacterial pangenome estimation walks inside taxonomy
        Brasil
        Tipo de participación: Conferencista invitado
        Nombre de la institución promotora: Sociedad Brasileña de Biología Computcional Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
      • Scientific Symposium of the Institut Pasteur International Network (2018)
        Congreso
        City-wide metagenomics uncover antibiotic resistance reservoirs in urban beach and sewage waters
        Francia
        Tipo de participación: Expositor oral
        Nombre de la institución promotora: Institut Pasteur International Network Palabras Clave: Metagenómica Resistencia a antibióticos
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica microbiana
      • Scientific Symposium of the Institut Pasteur International Network (2014)
        Congreso
        Clinical cases of Mycobacterium tuberculosis in Uruguay boarded by whole genome sequencing
        Uruguay
        Tipo de participación: Expositor oral
        Carga horaria: 8 Palabras Clave: Genómica Mycobacterium Patógenos
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
      • Jornadas de la Sociedad Uruguaya de Genética (2014)
        Congreso
        Evolución genómica de la patogenicidad y el tropismo de tejido en el género Campylobacter
        Uruguay
        Tipo de participación: Expositor oral
        Carga horaria: 8 Palabras Clave: Campylobacter Genómica Patogenicidad
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Genómica bacteriana
      • XX Congreso Latinoamericano de Microbiología (2010)
        Congreso
        Detección de Campylobacter fetus venerealis mediante múltiplex PCR
        Uruguay
        Tipo de participación: Expositor oral
        Carga horaria: 8 Palabras Clave: Campylobacter Diagnóstico Microbiología
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Genética bacteriana

    • Jurado/Integrante de comisiones evaluadoras de trabajos académicos

      • Diseño de una PCR múltiplex para detectar Pseudomonas aeruginosa y Mycobacterium avium en agua potable (2022)
        Candidato: Milly Bruzo
        Tipo Jurado: Tesis/Monografía de grado
        IRAOLA G.
        Bioquimico Clinico / Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Química / Uruguay
        País: Uruguay
        Idioma: Español
        Palabras Clave: PCR Microbiología
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Bacteriología
      • Rol del microbioma intestinal en el mecanismo de la remisión temprana de la diabetes mellitus tipo 2 ocasionada por la cirugía bariátrica (2021)
        Candidato: Fernando Slamovitz
        Tipo Jurado: Tesis/Monografía de grado
        IRAOLA G. , VIOLA M.
        Ingeniería en Biotecnología / Sector Educación Superior/Privado / Universidad ORT Uruguay / Facultad de Ingeniería / Uruguay
        País: Uruguay
        Idioma: Español
        Palabras Clave: Microbioma intestinal Diabetes Cirugía bari?trica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbioma
        Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Biotecnología de la Salud

  • Indicadores de producción

    Actividades
    29
    Líneas de investigación
    		 5
    Proyectos Investigación Desarrollo
    		 13
    Docencia
    		 8
    Dirección Administración
    		 1
    Pasantia
    		 1
    Otra Actividad Técnica
    		 1

    Producción bibliográfica
    88
    Artículos publicados en revistas científicas
    		63
    Completo 63
    Trabajos en eventos
    		 21
    Libros y Capítulos
    		 1
    Capítulos de libro publicado 1
    Textos en periódicos
    		 3
    Periodicos 3

    Producción técnica

    12
    Productos tecnológicos
    		 5
    Con registro o patente 1
    Trabajos técnicos
    		 1
    Otros tipos
    		 6

    Evaluaciones

    32
    Evaluación de proyectos
    		7
    Evaluación de eventos
    		2
    Evaluación de publicaciones
    		20
    Evaluación de convocatorias concursables
    		2
    Jurado de tesis
    		1

    Formación RRHH

    12
    Tutorías/Orientaciones/Supervisiones concluidas
    		 7
    Tesis/Monografía de grado 3
    Tesis de doctorado 2
    Tesis de maestria 2
    Tutorías/Orientaciones/Supervisiones en marcha
    		 5
    Tesis de doctorado 3
    Orientación de posdoctorado 2