La resistencia a antimicrobianos (RAM) se encuentra dentro de las diez prioridades sanitarias del plan estratégico quinquenal lanzado en 2019 por la OMS. Del mismo modo, la ONU ha reconocido que: La RAM es una de las mayores amenazas que enfrentamos como comunidad global.
Desde mi ingreso a la Unidad Académica de Bacteriología y Virología de Facultad de Medicina en el año 1996, he trabajado en distintos aspectos de la RAM, fundando en el 2002 el Laboratorio de Resistencia a Antibióticos (LRA) en dicha UA el cual dirijo en la actualidad.
Dentro del desarrollo de nuestro trabajo hemos establecido una red de colaboración multidisciplinaria que ha permitido realizar trabajos dentro del marco de la salud humana, con los hospitales Maciel, Pasteur, Pereira Rossell y Clínicas, llegando a realizar un proyecto de vigilancia de resistencia a colistina que involucró 28 instituciones públicas y privadas de 17 departamentos del país.
Por su parte en el campo de la salud animal, hemos desarrollado colaboraciones con el Departamento de Microbiología del Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable (IIBCE), con la División de Laboratorios Veterinarios (DILAVE) Miguel Rubino, tanto de Montevideo como de Paysandú, con INIA La Estanzuela y con la UA de Microbiología y el Departamento de Salud Pública de la Facultad de Veterinaria.
A nivel internacional realizamos trabajos en colaboración con los laboratorios de los Dres. Gabriel Gutkind, de la UBA-Argentina, el Dr. Juan Ayala de la Universidad Autónoma de Madrid y el Doctor Bruno Gonzalez-Zorn de la Universidad Complutense de Madrid España, la Dra. Lucía Pallecchi de la Universidad de Siena, Italia y el Dr. Nilton Lincopan de la Universidad de San Pablo de Brasil.
En el marco del enfoque promocionado por la OMS de "Una Salud" participamos en diversas líneas de trabajo relacionadas a la determinación de RAM a nivel veterinario. En este sentido he orientado y oriento a diversos estudiantes de maestría y Doctorado dentro del área Salud Animal de la Facultad de Veterinaria, así como estudiantes de Facultad de Ciencias y Medicina en PEDECIBA y PROINBIO. Represento al LRA como grupo de investigación en RAM en el Programa Nacional de Vigilancia de la RAM del Ministerio de Ganadería Agricultura y Pesca y he participado en distintas instancias del proyecto "Trabajando juntos para combatir la resistencia a los antimicrobianos" financiado por la Unión Europea y con el patrocinio de la cuatripartita Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y Agricultura (FAO), la Organización Mundial de Sanidad Animal (OMSA) y la Organización Panamericana de la Salud (OPS) y el Programa de las Naciones Unidas por el Medio Ambiente (PNUMA). En este contexto durante los años 2020/21 participé y organice la participación de integrantes del LRA de diversos talleres realizados por la Facultad de Veterinaria en conjunto con varios Centros Médicos Veterinarios Departamentales sobre RAM en el marco de una Salud. Durante los años 2021/22 participé en la elaboración de un plan Piloto para estudio de la RAM colaborando con los laboratorios del MSP y MGAP y finalmente el año 2023 fui tallerista durante la elaboración del Plan de Acción Nacional único contra la Resistencia a los Antimicrobianos en Uruguay.
En los últimos años, fui responsable de la instalación de una plataforma de secuenciación en la UA de Bacteriología y Virología con la incorporación de dos secuenciadores, uno de lectura larga (MinION Nanopore) y uno de lectura corta (Illumina MiniSeq) que nos ha permitido avanzar en la secuenciación de genomas completos de microorganismos de interés.
Dentro de los principales resultados de nuestras líneas de trabajo se destacan:
A nivel veterinario la caracterización de los mecanismos de resistencia presentes en E. coli enteropatógenas y Salmonella enterica aisladas de ganado bovino, así como la presencia de mecanismos de resistencia, plásmidos y clones de E. coli en materia fecal de bovinos, suinos, aves de corral, perros y caballos pura sangre. En este mismo contexto, detectamos que algunos de los mecanismos de resistencia que se encuentran en aves en edad productiva, ya se encuentran presentes en los pollitos de 1 día que se importan de Brasil, estableciendo una posible ruta de diseminación de la resistencia.
En lo que respecta a salud humana, estudiamos las BLEE presentes en E. coli aisladas de infecciones del tracto urinario de pacientes atendidos en 28 centros de salud del país y las carbapenemasas detectadas en Enterobacterales del Hospital de Clínicas así como en Pseudomonas spp.
El análisis de genomas completos de microorganismos multi resistentes nos ha permitido identificar estructuras complejas de trasnposones vinculados a la diseminación de diferentes mecasnismos de resistencia como BLEE, carbapenemasas y resistencia a fosfomicina y aminoglucósidos. Hemos determinado que algunos problemas de resistencia parecen ser de transmisión fundamentalmente interhumana como ser la presencia de la BLEE CTX-M-15 o las carbapenemasas KPC-2 y NDM-1. En el mismo sentido hemos podido identificar que los genes de resistencia a colistina detectados en cerdos de dos establecimientos de cría, pertenecen a variantes allelicas diferentes a las detectadas en humanos. Por otro lado, algunos mecanismos de resistencia como ser CTX-M-55, CMY-2 y qnrB19 es posible plantear que animales de la cadena productiva de alimentos podrían actuar como reservorios
Paralelamente, contribuimos al estudio de un importante brote de Pseudomonas aeruginosa ocurrido en el Hospital de Clínicas que presentaba un perfil de multi resistencia que incluía resistencia a oximinocefalosporinas, quinolonas y amikacina así como la búsqueda de los reservorios dentro del ambiente hospitalario.
Participación como contenidista y tutor de los cursos On Line para Iberoaamérica: Hospital-Acquired Infections and Antimicrobial Resistance ediciónes 2014-2015 organizado por la American Society of Microbiology, The Society for Worldwide Medical Exchange y la Cátedra de Enfermedades Infecciosas. Curso de 8 semanas de duración con una carga horaria estimada de 26 horas de estudio.
Participación como contenidista y tutor del curso On Line de profundización para Iberoaamérica: Infecciones hospitalarias y resistencia a antibióticos Nuevos desafíos 2015 organizado por la American Society of Microbiology, The Society for Worldwide Medical Exchange y la Cátedra de Enfermedades Infecciosas. Curso de 8 semanas de duración con una carga horaria estimada de 27 horas de estudio.
Participación como Co-Coordinador, Contenidista y tutor del curso On line para Iberoamérica "Interpretación del Antibiograma en la práctica clínica diaria" Apoyado por la European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Organizado por el Departamento de Bacteriología y Virología y el Departamento de Laboratorio Clínico del Hospital de Clínicas de la Facultad de Medicina- Universidad de la República. Curso de 8 semanas de duración con una carga horaria estimada de 30 horas.
Producción bibliográfica | 97 |
Artículos publicados en revistas científicas | 58 |
| Completo | 56 |
| Reseña | 2 |
Trabajos en eventos |
33 |
Libros y Capítulos |
6 |
| Capítulos de libro publicado | 6 |
Evaluaciones | 28 |
Evaluación de proyectos | 15 |
Evaluación de eventos | 2 |
Evaluación de publicaciones | 8 |
Jurado de tesis | 3 |
Formación RRHH | 19 |
Tutorías/Orientaciones/Supervisiones concluidas |
14 |
| Tesis/Monografía de grado | 7 |
| Tesis de maestria | 3 |
| Tesis de doctorado | 4 |
Tutorías/Orientaciones/Supervisiones en marcha |
5 |
| Tesis de maestria | 2 |
| Tesis de doctorado | 3 |
|   |   |