Datos Generales

• Institución principal

  Universidad de la República/ Facultad de Medicina / Unidad Académica de Imagenología / Uruguay

• Dirección institucional

  Institución: Universidad de la República / Facultad de Medicina / Sector Educación Superior/Público
  / Unidad Académica de Imagenología
  Dirección: Avda. Gral. Flores 2125 / 11800
  País: Uruguay / Montevideo / Montevideo
  Teléfono: (598) 29243414 / 3604
  Correo electrónico/Sitio Web: hbottialsina@gmail.com
  

Formación

• Formación académica

  • Concluida

    • Doctorado

      • Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (2005 - 2010)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Reacciones y efectos de radicales libres y oxidantes biológicos a nivel molecular: Formación controlada por distancia de peroxinitrito y modulación alostérica redox en la albúmina humana
        Tutor/es: Rafael Radi
        Obtención del título: 2010
        Palabras Clave: Radicales Libres Biología Estructural Peroxinitrito y Óxido Nítrico Química de Tioles Albúmina Sérica Humana
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      Maestría

      • Maestría en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA) (2001 - 2003)

        Universidad de la República - Facultad de Ciencias , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa: Oxidación del alfatocoferol en la LDL mediada por peroxinitrito. Aspectos cinéticos y mecanísticos
        Tutor/es: Homero Rubbo
        Obtención del título: 2003
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioquímica y Fisicoquímica de Radicales Libres

    • Grado

      • Medicina (1992 - 2001)

        Universidad de la República - Facultad de Medicina , Uruguay
        Título de la disertación/tesis/defensa:
        Obtención del título: 2001
        Palabras Clave: Medicina
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Ciencias y Servicios de Cuidado de la Salud / Medicina General

• Formación complementaria

  • Concluida

    • Cursos de corta duración

      • MODELADO Y AGRUPAMIENTO DE DATOS DE ALTA DIMENSION (01/2016 - 01/2016)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        Palabras Clave: Agrupamiento de datos Análisis de componentes principales Aprendizaje no supervisado
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Aprendizaje no supervisado

      • Introducción al Aprendizaje Profundo (01/2016 - 01/2016)

        Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ingeniería , Uruguay
        65 horas
        Palabras Clave: aprendizaje profundo redes neuronales aprendizaje de máquinas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias de la Computación e Información / Ciencias de la Información y Bioinformática / Aprendizaje supervisado

      • CeBEM/CCP4 course “Macromolecular Crystallography school 2013: From data processing to structure refinement and beyond” (01/2013 - 01/2013)

        Sector Extranjero/Internacional/Redes Internacionales / Redes Internacionales / Centro de Biología Estructural del MERCOSUR , Uruguay
        100 horas
        Palabras Clave: Biología Estructural Difracción de rayos X Cristalografía de Proteínas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Estructural

      • Structure and Function of Membrane Proteins - A Practical Course (01/2012 - 01/2012)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) , Brasil
        100 horas
        Palabras Clave: Cristalografía de Proteínas de Membrana Proteínas de membrana radiaciones sincrotrónicas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Estructural

      • CeBEM Course “Macromolecular Crystallography: introduction and applications” (01/2010 - 01/2010)

        Sector Extranjero/Internacional/Redes Internacionales / Redes Internacionales / Centro de Biología Estructural del MERCOSUR , Uruguay
        120 horas
        Palabras Clave: Biología Estructural Difracción de rayos X Cristalografía de Proteínas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Estructural

      • CeBEM/EMBO Structure & Dynamics of Biomolecules by NMR Spectroscopy (01/2009 - 01/2009)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Universidad Nacional de Rosario , Argentina
        100 horas
        Palabras Clave: Biología Estructural Resonancia Magnética Nuclear de Macromolécuals Dinámica de Proteínas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Estructural

      • RapiData 2009 Rapid Data Collection & Structure Solving at the NSLS A Practical Course in Macromolecular X-Ray Diffraction Measurement (01/2009 - 01/2009)

        Sector Extranjero/Internacional/Otros / Brookhaven National Laboratory , Estados Unidos
        70 horas
        Palabras Clave: radiaciones sincrotrónicas Difracción de rayos X Cristalografía de Proteínas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Estructural

    • Participación en eventos

      • Estadia de Investigación en Mecanismo Fisicoquímico General de Inhibición de Proteasomas por Bortezomib y otros fármacos (2016)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Laboratorio de Toxicología Molecular, Instituto Alemán de Nutrición (DIfE), Alemania
        Palabras Clave: Autocompartimentalización Fisicoquímica de proteasomas transporte y reacción Mecanismos cinéticos Biofísica Modelos predictivos
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Enzymología de sistemas autocompartimentalizados

      • Estadía de Entrenamiento en Bioinformática (2016)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Unidad de Bioinformática, Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay
        Palabras Clave: Bioinformática de Redes Transcriptómica
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Otros Tópicos Biológicos / Redes Moleculares y Transcriptómica

      • Estadía de Investigación sobre Mecanismos de Regulación del Sistema Ubiquitina Proteasoma por Electrófilos (2015)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Laboratorio de Toxicología Molecular del Instituto Alemán de Nutrición, Alemania
        Palabras Clave: Deubiquitinasas Proteasoma 20S Proteasoma 26S Inhibidores del Proteasoma
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Bioquímica

      • Entrenamiento en Biología Estructural (2013)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Unidad de Cristalografía de Proteínas, Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay
        Palabras Clave: Cristalografía de Macromoléculas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biología Estructural

      • Entrenamiento en Biología Estructural (2012)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Unidad de Cristalografía de Proteínas, Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay
        Palabras Clave: Cristalografía de Macromoléculas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biología Estructural

      • Estadía de Entrenamiento en Biología y Genética de Espiroquetas (2011)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Institut Pasteur de París, Francia
        Palabras Clave: Genética de microorganismos Metabolismo del hemo Señalización celular Relación hospedero-parásito
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Estructural

      • Entrenamiento en Biología Estructural (2011)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Unidad de Cristalografía de Proteínas, Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay
        Palabras Clave: Cristalografía de Macromoléculas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biología Estructural

      • Entrenamiento en Biología Estructural (2010)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Unidad de Cristalografía de Proteínas, Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay
        Palabras Clave: Cristalografía de Macromoléculas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biología Estructural

      • Entrenamiento en Biología Estructural (2009)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Unidad de Cristalografía de Proteínas, Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay
        Palabras Clave: Cristalografía de Macromoléculas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biología Estructural

      • Entrenamiento en Biología Estructural (2008)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Unidad de Cristalografía de Proteínas, Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay
        Palabras Clave: Cristalografía de Macromoléculas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biología Estructural

      • Entrenamiento en Biología Estructural (2007)

        Tipo: Otro
        Institución organizadora: Unidad de Cristalografía de Proteínas, Institut Pasteur de Montevideo, Uruguay
        Palabras Clave: Cristalografía Proteínas
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biofísica de Proteínas

    • Otras instancias

      • Pasantía de Investigación en Muerte Celular, Inflamación y Experimentación con Hepatocitos Murinos (2017)

        Alemania
        Palabras Clave: Mouse hepatocytes Apoptosis CYLD deubiquitinase Inflamasome Caspase 1
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Bioquímica y Biología Molecular / Señalamiento Celular

Idiomas

• Inglés

  Entiende muy bien / Habla muy bien / Lee muy bien / Escribe muy bien

Areas de actuación

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Bioquímica y Biología Molecular /Biología Redox

• Ciencias Médicas y de la Salud

  Medicina Básica /Bioquímica y Biología Molecular /Medicina Estructural y Fisicoquímica

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Biofísica /Biofísica de Proteínas

• Ciencias Médicas y de la Salud

  Medicina Básica /Inmunología /Inflamación

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias Biológicas /Biofísica /Bioinformática de Redes

• Ciencias Médicas y de la Salud

  Medicina Básica /Farmacología y Farmacia /Estudio de Blancos Terapéuticos Moleculares/Farmacodinamia

• Ciencias Médicas y de la Salud

  Ciencias de la Salud /Ética Médica /Ética y Responsabilidad de Datos

• Ciencias Médicas y de la Salud

  Ciencias de la Salud /Salud Pública y Medioambiental /Dinámica de Enfermedades Transmisibles

• Ciencias Naturales y Exactas

  Ciencias de la Computación e Información /Ciencias de la Computación /Ética de la Computación

Actuación profesional

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Área Ciencias de la Salud / Unidad Académica de Imagenología, Facultad de Medicina

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (06/2025 - a la fecha)

      Profesor Adjunto 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 3
      Cargo: Interino

• Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas - Institut Pasteur de Montevideo - Uruguay

  Institut Pasteur de Montevideo / Unidad de Bioinformática

  • Vínculos con la Institución

    • Otro (11/2016 - a la fecha)

      10 horas semanales
      Participo como pasante en la Unidad de Bioinformática del isntitut Pasteur de Montevideo

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Bioinformática y Biofísica Integrativa del Sistema Ubiquitina Proteasoma en Salud y Enfermedad Humanas (11/2016 - a la fecha )

        El Sistema Ubiquitina Proteasoma (SUP) se integra por 1000 a 2000 genes que codifican proteínas. Estos componentes son en sí complejos y mantienen múltiples interacciones específicas y variadas, por lo que el SUP constituye un Sistema Complejo. El SUP ha sido involucrado en múltiples patologías humanas y en procesos de mantenimiento de la Salud. El abordaje de su estudio a través de la minería de datos, el aprendizaje automático, la biología de sistemas y la caracterización molecular detallada es por tanto especialmente necesario para comprender su funcionamiento normal y alterado. El objetivo de esta línea es producir conocimiento útil sobre las relaciones internas de estos componentes y las relaciones del SUP con genes/rnas y proteínas asociadas a enfermedades.
        10 horas semanales
        Institut Pasteur de Montevideo, Unidad de Bioinformática , Coordinador o Responsable
        Equipo: Horacio BOTTI ALSINA , Gregorio IRAOLA
        Palabras clave: Sistema Ubiquitina Proteasoma
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Medicina Básica / Ciencia de Datos y de Sistemas

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Medicina / Departamento de Biofísica

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (11/2016 - 12/2024)Trabajo relevante

      Prof. Adjunto Titular del Dep. de Biofísica 30 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 3
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (06/2005 - 06/2007)

      Asitente Departamento de Bioquímica 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Efectivo

    • Funcionario/Empleado (06/1998 - 06/2002)

      Ayudante Departamento de Bioquímica 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Efectivo

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Estudio fisicoquímicos sobre peroxinitrito y óxido nítrico (01/2003 - a la fecha )

        Estudios de aspectos fundamentales de la formación y reactividad de óxido nítrico, superóxido y peroxinitrito
        10 horas semanales
        CEINBIO , Integrante del equipo
        Equipo: Horacio BOTTI ALSINA , Rafael RADI ISOLA
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Biofísica, fluorescencia y estructura de proteínas (01/2006 - a la fecha )

        Linea de investigación personal iniciada en 2006, que impulsó mi vinculación con la Unidad de Cristalografía de Proteínas del Institut Pasteur de Montevideo y que mantengo con un ritmo bajo de avance, aunque en 2021 pienso comenzar a jerarquizar.
        Fundamental
        1 horas semanales
        Departamento de Biofísica, Laboratorio de Biofísica Integrativa , Coordinador o Responsable
        Equipo: Horacio BOTTI ALSINA

      • Salud y Biofísica de Precisión (01/2019 - a la fecha )

        Línea de Investigación que articula proyectos CIDASH con proyectos en sistema ubiquitina proteasoma y biomedicina en general.
        Mixta
        5 horas semanales
        Departamento de Biofísica, Laboratorio de Biofísica Integrativa , Coordinador o Responsable
        Equipo: Horacio BOTTI ALSINA
        Palabras clave: Medicina de Precisión Medicina Personalizada Medicina de alto rendimiento ciencia de datos biofísica y bioquímica de precisión Biología de sistemas Medicina de redes medicina estructural
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biofísica de sistemas y redes

      • Modulación del sistema ubiquitina-proteasoma por electrófilos y oxidantes: estudio de redes moleculares (FCE_3_2016_1_126877) (03/2016 - a la fecha )

        Proyecto Financiado en el marco de la convocatoria 2016 del FCE
        Fundamental
        10 horas semanales
        Departamento de Biofísica, Facultad de Medicina, UdelaR, Laboratorio de Biofísica Integrativa , Coordinador o Responsable
        Equipo: Horacio BOTTI ALSINA , Gregorio IRAOLA , Eduardo OSINAGA PRADERE , Álvaro Jesús CABANA FAJARDO
        Palabras clave: Mieloma múltiple Sistema Ubiquitina Proteasoma Descubrimiento de fármacos Medicina de redes
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Medicina Básica / Medicina de Sistemas, Redes y Datos

      • Bioinformática y Biofísica Integrativa del Sistema Ubiquitina Proteasoma en Salud y Enfermedad Humanas (11/2016 - a la fecha )

        El Sistema Ubiquitina Proteasoma (SUP) se integra por 1000 a 2000 genes que codifican proteínas. Estos componentes son en sí complejos y mantienen múltiples interacciones específicas y variadas, por lo que el SUP constituye un Sistema Complejo. El SUP ha sido involucrado en múltiples patologías humanas y en procesos de mantenimiento de la Salud. El abordaje de su estudio a través de la minería de datos, el aprendizaje automático, la biología de sistemas y la caracterización molecular detallada es por tanto especialmente necesario para comprender su funcionamiento normal y alterado. El objetivo de esta línea es producir conocimiento útil sobre las relaciones internas de estos componentes y las relaciones del SUP con genes/rnas y proteínas asociadas a enfermedades.
        20 horas semanales
        Departamento de Biofísica y Centro de Investigaciones Biomédicas, Laboratorio de Biofísica Integrativa , Coordinador o Responsable
        Equipo: Horacio BOTTI ALSINA , María Lourdes LEBRATO ONETO
        Palabras clave: Sistema Ubiquitina Proteasoma Biofísica y Bioquímica de Proteasomas Bioinformática Mieloma Múltiple
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Medicina Básica / Medicina de Sistemas, Redes y Datos

      • Estudio de propiedades redox y estructurales de proteínas (01/2003 - a la fecha )

        
        20 horas semanales
        Centro de Investigaciones en Radicales Libres , Integrante del equipo
        Equipo:
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Inferencia y Comparación de Modelos Cinéticos y Evolutivos de Cores Catalíticos de Proteasomas (CSIC I+D 2018) (08/2019 - a la fecha)

        Objetivos generales y específicos. a. Objetivo General: Inferir y comparar modelos cinéticos y evolutivos de variantes proteasomas b. Objetivos Específicos (OEs): OE1 Obtener puros CCPs 20S de H. sapiens, M. tuberculosis y T. cruzi, así como HslV de E. coli y de T. cruzi y una o dos proteínas homólogas de acuerdo con estudios filogenéticos y/o metagenómicos. OE2 Diseñar y realizar experimentos adecuados e inferir modelos cinéticos de actividad y de inhibición de los protesomas antes referidos. OE3 Inferir modelos filogenéticos de la evolución del proteasoma con base en datos actualizados de genomas de bacterianas, arqueas, eucariotas y virus. C. Preguntas que busca responder el proyecto. Las principales preguntas que buscamos responder son las siguientes: a) En relación con OE2. ¿Cómo son los mecanismos cinéticos (actividad e inhibición) de los distintos proteasomas? ¿Son significativamente diferentes? ¿Cuáles son los pasos controlan en cada uno de ellos la catálisis y la inhibición? Suponemos que la compartimentalización en los CCPHslV es menos importante que en los CCP20S, ¿será así? ¿Se confirman los mecanismos ya propuestos de los distintos inhibidores? ¿Es posible establecer una nueva racionalidad en la mejora de inhibidores específicos de cada proteasoma? ¿Cuáles son los inhibidores más específicos de los distintos proteasomas y por qué mecanismo cinético se explica la especificidad? b) En relación con OE3. ¿Qué podemos aprender de la evolución de los proteasomas considerando especialmente las arqueas relacionadas con el origen de los eucariotas? ¿Cómo son las secuencias de las proteínas proteasomales de arqueas del superfilum Asgard? ¿Podremos determinar los eventos de duplicación, pérdida y transferencia horizontal en los diferentes linajes? ¿Surge alguna proteína viral como candidata muy probable a ser un homólogo proteasomal? ¿Qué rol (si corresponde alguno) pueden haber tenido los virus en la evolución de los proteasomas? ¿Encontraremos algún homólogo proteasomal activo en los virus actuales? ¿Qué rol podría este cumplir en el ciclo del virus? ¿Se confirma que secuencias homólogas están solo en bacteriófagos caudados (myoviridae y siphoviridae) y si fuera así, por qué? ¿Qué eventos de selección positiva en diferentes linajes podremos inferir y qué explicaciones ecológicas o fisiológicas podremos eventualmente esgrimir?
        10 horas semanales
        Departamento de Biofísica , Laboratorio de Biofísica Integrativa
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Pregrado:2
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Comisión Sectorial de Investigación Científica, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: Héctor Gabriel ROMERO BRUNETTO , T. Grune , L. Huilin , Ignacio Francisco RAMÍREZ PAULINO , Horacio BOTTI ALSINA
        Palabras clave: Evolución del proteasoma biología de sistemas sistema ubiquitina proteasoma antibacterianos farmacología biofísica enzimática
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Medicina Básica / Biofísica

      • Tamizaje de Pacientes en Riesgo Promedio de Cáncer de Mama por Mamografía 2D: Aplicación de la Ciencia de Datos a la Evaluación Multidimensional de la Calidad de las Imágenes y de las Curvas de Aprendizaje de los Estudiantes en UDAs (FSS_X_2019_1_155097) (06/2019 - a la fecha)

        La incidencia y la tasa de mortalidad atribuible al cáncer de mama en nuestro país se conocen gracias al Registro Nacional de Cáncer (RNC) a cargo de la Comisión Honoraria de Lucha Contra el Cáncer. El cáncer de mama es el que posee la mayor tasa de incidencia y también de mortalidad en mujeres. Uruguay ha sido pionero a nivel mundial en desarrollar métodos y en impulsar un programa nacional de tamizaje por Mamografía de rayos X (MX). Proponemos generar herramientas de medición e información para evaluar la calidad de las MX de tamizaje que son hoy realizadas por equipos docentes y estudiantes avanzados que formen parte de la Unidad Docente Asistencial especializada en Mamografía (UDAMX) de la Carrera de Licenciatura en Imagenología, Escuela de Tecnología Médica (EUTM), Facultad de Medicina, UdelaR. Los objetivos propuestos son tres: i) Desarrollar un método de evaluación de la calidad de las imágenes mamográficas por aprendizaje automático; ii) Inferir curvas de aprendizaje más frecuentes de estudiantes de 4° año de la Carrera de Licenciatura en Imagenología que realicen su practica de internado en la DAMX; iii) Contribuir a identificar los factores más importantes a corregir para mejorar la calidad de las MX desde la perspectiva de la formación de tecnólogos en distintos Servicios de MX. Creemos que la información y conocimiento que se espera generar es indispensable para tomar decisiones educativas y mejorar las MX realizadas por egresados de la EUTM. La Herramienta de Evaluación Automática de Calidad de MX (HEACMX) podría ser mejorada, adaptada y difundida en el Sistema de Información Sanitaria Nacional. Esperamos repercusiones sobre los estándares de calidad de todo el Sistema Nacional Integrado de Salud. La productividad intermedia y los impactos de esta propuesta están en línea con los Objetivos Sanitarios Nacionales (OSN) impulsados por el Ministerio de Salud Pública.
        10 horas semanales
        Departamento de Biofísica , Laboratorio de Biofísica Integrativa
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Especialización:1
        Maestría/Magister:1
        Financiación:
        Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: Federico LECUMBERRY RUVERTONI , REGINA NATALIA HUART SOTTOLANO , Horacio BOTTI ALSINA
        Palabras clave: Mamografía calidad aprendizaje automático
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Ciencias y Servicios de Cuidado de la Salud / imagenología

      • Ciencias de la Información y de Datos Aplicadas a la Salud Humana (CIDASH) (07/2018 - a la fecha)

        CIDASH es un proyecto Interdisciplinario coorganizado por un Grupo Interdisciplinario homónimo integrado por investigadores de Facultad de Medicina, Facultad de Psicología, Facultad de Ingeniería, Instituto de Higiene, Institut Pasteur de Montevideo, Unidad Académica de CSIC y Facultad de Información y Comunicación. A fines de 2018 año el proyecto fue apoyado por Espacio Interdisciplinario UDeLaR, financiándose una propuesta de Eventos Interdisciplinarios y un Semillero de Actividades Interdisciplinarias. Sus objetivos son: 1) Realizar un diagnóstico de situación de las CIDASH en Uruguay, 2) Definir líneas de acción y realizar propuestas para la generación de un contexto propicio al desarrollo de las CIDASH a nivel nacional, 3) Realizar eventos centrales y un ciclo de seminarios en CIDASH y 4) Creación de una plataforma online de colaboración en CIDASH y actividades afines.
        10 horas semanales
        Laboratorio de Biofísica Integrativa, Departamento de Biofísica, Facultad de Medicina
        Investigación
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        RRHH formados en el proyecto:
        Maestría/Magister:1
        Doctorado:3
        Financiación:
        Espacio Interdisciplinario, Uruguay, Apoyo financiero
        Equipo: Horacio BOTTI ALSINA (Responsable) , José Enrique FERNÁNDEZ PEREYRA , Álvaro Jesús CABANA FAJARDO , Ignacio Francisco RAMÍREZ PAULINO , TOMASSINI, C.
        Palabras clave: DATA SCIENCE BIG DATA PRECISION MEDICINE HEALTH INFORMATION SYSTEMS STATISTICS OPEN DATA MEDICAL INFORMATICS
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Otras Ciencias Médicas / Otras Ciencias Médicas / Ciencias de la Información y de Datos aplicadas a la Salud Humana

      • Nitroarachidonate and Cholesteryl nitrolinoleate as Novel Anti-inflammatory Nitrated Lipids: Detection, Synthesis, Characterization and Biological Properties (01/2008 - 12/2010 )

        Proyecto de investigación liderado por el Prof. Homero Rubbo en el cual tuve participación principalmente en su diseño.
        10 horas semanales
        Facultad de Medicina , Facultad de Medicina
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Financiación:
        Institución del exterior, Apoyo financiero
        Equipo: VALERIE O´DONELL (Responsable) , HOMERO RUBBO (Responsable) , HORACIO BOTTI
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Novel biomarkers of oxidative stress in smokers and relation to vascular function (01/2007 - 08/2010 )

        Estudio de biomarcadores de esterés oxidativo relacionado con el hábito tabáquico.
        10 horas semanales
        CEINBIO , Facultad de Medicina
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Financiación:
        Institución del exterior, Apoyo financiero
        Equipo: RAFAEL RADI (Responsable) , HORACIO BOTTI
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Peroxiredoxinas y su rol en la detoxificación de especies reactivas del oxígeno (01/2007 - 12/2009 )

        
        10 horas semanales
        Facultad de Medicina , Departamento de Bioquímica
        Desarrollo
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Equipo: MADIA TRUJILLO (Responsable) , HORACIO BOTTI , BEATRIZ ALVAREZ
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /

      • Oxidación del tiol de la albúmina - modificaciones químicas,conformacionales y funcionales (01/2006 - 12/2008 )

        
        10 horas semanales
        Facultad de Ciencias
        Integrante del Equipo
        En Marcha
        Equipo: RAFAEL RADI , LUCÍA TURELL , HORACIO BOTTI , BEATRIZ ALVAREZ (Responsable)

    • Docencia

      • Ciclo de Estructura y Funciones Normales (ESFUNO-EUTM) (11/2016 - a la fecha)

        Grado
        Responsable
        Asignaturas:
        Biofísica, 1 horas, Teórico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Medicina Básica / Biofísica

      • Medicina (01/1998 - 01/2002 )

        Grado
        
        Asignaturas:
        Ayudante del Departamento de Bioquímica, 20 horas, Teórico-Práctico
        Asistente del Departamento de Biofísica, 20 horas, Teórico-Práctico

    • Gestión Académica

      • Representante de los Docentes en la Comisión de Biblioteca de la Facultad de Medicina (06/2017 - a la fecha )

        Facultad de Medicina, No corresponde
        Participación en consejos y comisiones 1 horas semanales
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Ciencias de la Salud / no corresponde

      • Delegado Estudiantil ante el Consejo de Administración de la Fundación Manuel Pérez (01/2000 - 12/2002 )

        Facultad de Medicina, Asociación de Estudiantes de Medicina
        Participación en consejos y comisiones

      • Delegado Estudiantil ante el Consejo de la Facultad de Medicina (01/1995 - 12/1999 )

        Facultad de Medicina, Asociación de Estudiantes de Medicina
        Participación en consejos y comisiones

      • Delegado Estudiantil-Consejo de Facultad de Medicina (01/1995 - 12/1997 )

        Facultad de Medicina, Asociación Estudiantes de Medicina
        Participación en consejos y comisiones

• Sector Organizaciones Privadas sin Fines de Lucro/Sociedades Científico-Tecnológicas - Institut Pasteur de Montevideo - Uruguay

  Institut Pasteur de Montevideo

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (07/2007 - 11/2016)Trabajo relevante

      Investigador Asociado 60 horas semanales / Dedicación total

  • Actividades

    • Líneas de investigación

      • Cambios alostéricos dependientes del estado redox de la albúmina sérica humana (07/2007 - a la fecha )

        
        20 horas semanales
        Plataforma de Biología Estructural, Cristalografía de Proteínas , Coordinador o Responsable
        Equipo: RAFAEL RADI , BUSCHIAZZO A
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Cristalografía de proteínas

      • Cell signaling in bacterial pathogenesis: iron metabolism regulation in Leptospira as a working model (07/2010 - 12/2013 )

        
        10 horas semanales
        Unidad de Cristalografía de Proteínas, Unidad de Cristalografía de Proteínas , Integrante del equipo
        Equipo: BUSCHIAZZO A , PICARDEAU, M. , MORERO, N.
        Palabras clave: Metabolismo del hemo Señalización en bacterias
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbiología

      • Structural biology and Leptospira virulence regulation: a multidisciplinary approach (09/2010 - 09/2011 )

        
        20 horas semanales
        Plataforma de Biología Estructural, Cristalografía de Proteínas , Integrante del equipo
        Equipo: BUSCHIAZZO A
        Palabras clave: Microbiological Molecular Structural Biology leptospira
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Estructural

    • Proyectos de investigación y desarrollo

      • Structural biology and Leptospira virulence regulation: a multidisciplinary approach (09/2010 - 10/2011 )

        
        20 horas semanales
        Plataforma de Biología Estructural , Cristalografía de Proteínas
        Desarrollo
        Cancelado
        Financiación:
        Institución del exterior, Apoyo financiero
        Equipo: HORACIO BOTTI , BUSCHIAZZO A (Responsable)
        Palabras clave: Leptospira molecular pathology
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Estructural

      • Estudios estructurales de isoformas redox de la albúmina sérica humana (02/2009 - 01/2011 )

        
        20 horas semanales
        Plataforma de Biología Estructural , Cristalografía de Proteínas
        Desarrollo
        Coordinador o Responsable
        En Marcha
        Equipo: HORACIO BOTTI (Responsable) , RAFAEL RADI , BUSCHIAZZO A

    • Docencia

      • International Course : Macromolecular Crystallography - Introduction and Applications (04/2010 - 05/2010 )

        Doctorado
        Organizador/Coordinador
        Asignaturas:
        Biología Estructural, 60 horas, Teórico-Práctico
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Estructural

    • Gestión Académica

      • Delegado de los Investigadores a la Comisión de Educación del Institut Pasteur de Montevideo (05/2009 - 05/2011 )

        Plataforma de Biología Estructural, Cristalografía de Proteínas
        Gestión de la Enseñanza
        Areas de conocimiento:
        Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Estructural

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Medicina / Departamento de Biofísica

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (07/2005 - 08/2007)

      Asistente 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2
      Cargo: Interino

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Medicina / Departamento de Bioquímica

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (04/2003 - 06/2004)

      Asistente Contratado por Proyecto 10 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 2

• Sector Educación Superior/Público - Universidad de la República - Uruguay

  Facultad de Medicina / Departamento de Bioquímica

  • Vínculos con la Institución

    • Funcionario/Empleado (05/1998 - 04/2002)Trabajo relevante

      Ayudante de Clases 20 horas semanales
      Escalafón: Docente
      Grado: Grado 1
      Cargo: Efectivo

Carga horaria

• Carga horaria de docencia: 5 horas
  
• Carga horaria de investigación: 20 horas
  
• Carga horaria de formación RRHH: 10 horas
  
• Carga horaria de extensión: 1 hora
  
• Carga horaria de gestión: 10 horas
  

Producción científica/tecnológica

• He desarrollado una trayectoria de investigación y construcción académica situada en la interfaz entre la biofísica, la bioquímica molecular, la biología estructural, la ciencia de datos, la imagenología y la salud humana. Mi producción incluye artículos en revistas arbitradas, capítulos de libro, reportes científico-técnicos, modelos estructurales depositados en bases internacionales y trabajos orientados a la creación de capacidades institucionales para la investigación biomédica, sanitaria y educativa.

  Una primera etapa de mi trabajo estuvo centrada en la bioquímica redox, la fisicoquímica de especies reactivas, la biología estructural y la caracterización molecular de proteínas de relevancia biomédica. En ese período participé en estudios sobre óxido nítrico, peroxinitrito, albúmina sérica humana, lipoproteínas, estrés oxidativo, proteínas bacterianas y blancos moleculares de interés farmacológico. Esta etapa consolidó una formación experimental, mecanística y cuantitativa, así como experiencia en cinética, estructura-función de proteínas, modelado biofísico e inferencia de mecanismos en sistemas moleculares complejos.

  A partir de 2018–2019 orienté crecientemente mi agenda hacia problemas de integración entre datos, modelos, formación científica y salud. Esta transición se expresó en el desarrollo de CIDASH, iniciativa interdisciplinaria sobre ciencias de la información y de datos aplicadas a la salud humana, y en proyectos vinculados a salud de precisión, medicina de sistemas, interoperabilidad, gobernanza de datos, ética de la investigación y producción de conocimiento útil para los sistemas de salud. En este marco, mantuve una línea de investigación sobre el sistema ubiquitina-proteasoma, abordado como sistema molecular complejo mediante modelos cinéticos, mecanismos de transporte y catálisis, compartimentalización, evolución molecular e inferencia de modelos a partir de datos experimentales.

  Durante la pandemia de COVID-19 dediqué una parte sustantiva de mi actividad académica al análisis de datos, la modelización epidemiológica, la discusión metodológica y la producción de insumos científico-técnicos orientados a la comprensión de la epidemia y sus medidas de control. Participé en reportes sobre ciencia y datos para el análisis de la epidemia, crecimiento subexponencial de casos, inferencia de modelos epidémicos y evaluación del impacto de medidas sanitarias. Esta experiencia reforzó mi interés por las infraestructuras de datos, la responsabilidad pública de la investigación, la calidad de la evidencia, la comunicación científica y la relación entre producción de conocimiento, toma de decisiones y sistemas de vigilancia en salud.

  Desde 2019 hasta 2025 estuve especialmente abocado a la mejora académica de la Licenciatura en Imagenología, con énfasis en la formación científica de estudiantes y docentes. Este trabajo incluyó la coordinación y fortalecimiento del curso Introducción al Trabajo Científico, la organización de trabajos finales de grado, la formación de equipos docente-estudiantiles de investigación, la elaboración de materiales didácticos, la introducción de herramientas cuantitativas y cualitativas de investigación, y la promoción de una cultura académica orientada a formular preguntas, revisar literatura, analizar datos, evaluar evidencia y comunicar resultados. Esta línea permitió articular docencia, investigación y mejora institucional en torno a problemas propios de la imagenología y de los servicios de salud.

  En ese marco, he impulsado trabajos sobre calidad de imágenes mamográficas, aprendizaje automático, evaluación del proceso de enseñanza-aprendizaje, herramientas de apoyo a la toma de decisiones en tamizaje de cáncer de mama, ontologías computacionales, inequidades sanitarias y sistemas de información aplicados a la prevención, el control y la investigación en salud. Estas actividades integran dimensiones técnicas, educativas, organizacionales, éticas y sanitarias, y buscan fortalecer la capacidad de la imagenología como campo académico capaz de producir conocimiento propio, evaluar críticamente sus prácticas y contribuir a la mejora del sistema de salud.

  
  

  Mi perfil actual combina biofísica, modelado mecanístico, ciencia de datos, imagenología, causalidad, evaluación, ética de la investigación y filosofía de la ciencia. Busco contribuir al desarrollo de capacidades académicas e institucionales que integren datos, modelos, evidencia, formación científica y evaluación en sistemas de salud aprendientes, responsables y orientados a la utilidad social del conocimiento.

Producción bibliográfica

• Artículos publicados

  • Arbitrados

    • Data and knowledge infrastructures for scientific research on humans and health in Uruguay: an experience report on a critical constructive design process (Completo, 2022)Trabajo relevante

      HORACIO BOTTI ALSINA , Silvia Méndez , NAYA H , Camila Simoes , Valentina Martufi
      Informatio, v.: 27 2022
      Palabras clave: Salud Colectiva Sistemas de Datos y Conocimientos Filosofía de la Ciencia Medicina Preventiva y Social
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Ética Médica / Ética y Responsabilidad de Datos
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 23011378
      DOI: 10.35643/info.27.1.12
      https://doi.org/10.35643/info.27.1.12
      
      

    • Desafíos de la datificación de la salud en Uruguay durante la pandemia de COVID-19 (Completo, 2021)

      H. BOTTI , Silvia Méndez
      Revista Médica del Uruguay, v.: 37 2 , 2021
      Palabras clave: Políticas Públicas Sociología de la Salud COVID-19
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Sociales / Sociología / Tópicos Sociales / Salud Pública
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 03033295
      E-ISSN: 16880390
      http://www.scielo.edu.uy/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1688-03902021000201101
      
      

    • Glucose-6-Phosphate Dehydrogenase from the Human Pathogen Trypanosoma cruzi Evolved Unique Structural Features to Support Efficient Product Formation (Completo, 2019)

      C. Ortiz , H. BOTTI , BUSCHIAZZO, A. , COMINI MA
      Journal of Molecular Biology, 2019
      Palabras clave: Tripanosoma cruzi Glucosa-6-fostafo deshidrogenasa Cristalografía de Proteínas
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Otras Ciencias Médicas / Otras Ciencias Médicas / Biofísica
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 00222836
      E-ISSN: 10898638
      DOI: j.jmb.2019.03.023
      https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022283618306910
      
      

    • Lung nitroxidative stress in mechanically-ventilated septic patients: a pilot study (Completo, 2019)

      H. BOTTI , J. Gorrasi , PELUFFO , G , BATTHYANY, C. , Naviliat M , E.BARRIOS , RADI, R
      Journal of Critical Care, 2019
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 08839441
      
      

    • HPLC separation of human serum albumin isoforms based on their isoelectric points (Completo, 2014)

      TURELL, L. , H. BOTTI , BONILLA, L. , TORRES, M. J. , SCHOPFER, F. , FREEMAN, B. A. , ARMAS, L. , RICCIARDI, A. , ALVAREZ, B. , RADI, R.
      Journal of Chromatography B, 2014
      Palabras clave: estres oxidativo vascular albúmina humana biomarcadores
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Inmunología / Inflamación
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 15700232
      Botti, H. primer autor y autor de correspondencia
      
      

    • Allosteric activation of bacterial response regulators: the role of the cognate histidine kinase beyond phosphorylation (Completo, 2014)

      TRAJTENBERG, F. , ALBANESI, D. , RUETALO, N. , H. BOTTI , MECHALY, A. E. , NIEVES, M. , AGUILAR, P. S , CYBULSKI, L. , LARRIEUX, N. , DE MENDOZA, D. , BUSCHIAZZO, A.
      Molecular Biology, 2014
      Palabras clave: Cristalografía de Proteínas sistemas de señalización a dos componentes
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Biología Estructural
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 00268933
      E-ISSN: 16083245
      DOI: 10.1128/mBio.02105-14
      
      

    • HemR is an OmpR/PhoB-like response regulator from Leptospira, which simultaneously effects transcriptional activation and repression of key haem metabolism genes. (Completo, 2014)

      MORERO, N. , H. BOTTI , NITTA, K. R. , CARRION, F. , OBAL, G. , PICARDEAU, M. , BUSCHIAZZO, A.
      Molecular Microbiology, 2014
      Palabras clave: metabolismo microbiano regulación de la expresión génica hemo
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biología Celular, Microbiología / Microbiología Molecular
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 0950382X
      E-ISSN: 13652958
      DOI: 10.1111/mmi.12763
      
      

    • Sevoflurane anesthesia deteriorates pulmonary surfactant promoting alveolar collapse in male Sprague-Dawley rats. (Completo, 2014)

      MALACRIDA, L. , RETA, G. , PIRIZ, H. , ROCCHICCIOLI, F. , H. BOTTI , DENICOLA, A. , BRIVA, A.
      Pulmonary Pharmacology & Therapeutics, 2014
      Palabras clave: Surfactante pulmonar Distress pulmonar lesión pulmonar aguda
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Patología / fisopatología
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 10945539
      E-ISSN: 15229629
      DOI: 10.1016/j.pupt.2013.12.005
      
      

    • Modulation of the reactivity of the thiol of human serum albumin and its sulfenic derivative by fatty acids (Completo, 2012)

      MJ TORRES , LUCÍA TURELL , H. BOTTI , L. ANTMAN , CARBALLAL, S , FERRER-SUETA, G , RADI, R , BEATRIZ ALVAREZ
      Archives of Biochemistry and Biophysics, v.: 521 1–2 , p.:102 - 110, 2012
      Palabras clave: human serum albumin redox stress lipid transport
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biología y Bioquímica Estructurales
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00039861
      E-ISSN: 10960384
      DOI: 10.1016/j.abb.2012.03.011
      
      

    • Swapping FAD binding motifs between plastidic and bacterial ferredoxin-NADP (H) reductases (Completo, 2011)

      MUSUMECI, M. A. , H. BOTTI , BUSCHIAZZO A , CECCARELLI, E. A.
      Biochemistry, 2011
      Palabras clave: Transporte electrónico en plantas Fisiología y bioquímica d plantas
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Medicina Estructural
      ISSN: 00062960
      E-ISSN: 15204995
      
      

    • Expression, crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of glucose-6-phosphate dehydrogenase from the human pathogen Trypanosoma cruzi in complex with substrate (Completo, 2011)

      ORTÍZ, C. , LARRIEUX N , MEDEIROS, A. , H. BOTTI , COMINI, M. , BUSCHIAZZO A
      Acta Crystallographica Section F Structural Biology and Crystallization Communications, 2011
      Palabras clave: Trypanosoma cruzi Cristalografía de Proteínas blanco de drogas
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Bioquímica y Biología Molecular /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Medicina Estructural
      E-ISSN: 17443091
      
      

    • Genetic toxicology and preliminary in vivo studies of nitric oxide donor tocopherol analogs as potential new class of antiatherogenic agents (Completo, 2011)

      CABRERA, M. , LÓPEZ, G. V. , GÓMEZ, L. E. , BREIJO, M. , PINTOS, C. , H. BOTTI , RAYMONDO, S. , VETTORAZZI, A. , LÓPEZ DE CERÁIN, A. , MONGE, A. , HOMERO RUBBO , GONZÁLEZ, M. , CERECETTO, H.
      Drug and Chemical Toxicology, 2011
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Farmacología y Farmacia /
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Medicina Química /
      ISSN: 01480545
      E-ISSN: 15256014
      DOI: 10.3109/01480545.2010.536769
      
      

    • Factors affecting protein thiol reactivity and specificity in peroxide reduction (Completo, 2011)

      FERRER-SUETA, G , MANTA B , H. BOTTI , RADI, R , TRUJILLO,M , DENICOLA A
      Chemical Research in Toxicology, v.: 24 4 , p.:434 - 450, 2011
      Palabras clave: Thiol peroxidases hydrogen peroxide antioxidants cell signaling
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Bioquímica y Biología Molecular /
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 0893228X
      E-ISSN: 15205010
      DOI: 10.1021/tx100413v
      
      

    • Distance-Dependent Diffusion-Controlled Reaction of .NO and O2.- at Chemical Equilibrium with ONOO- (Completo, 2010)Trabajo relevante

      H. BOTTI , MÖLLER M , STEINMANN D , NAUSER T , DENICOLA A , RAFAEL RADI
      Journal of Physical Chemistry B, v.: 114 49 , p.:16584 - 16593, 2010
      Palabras clave: Diffusion-controlled reactions Law of mass action
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Físicas / Física de los Fluidos y Plasma / Fisicoquímica de reacciones controladas por difusión
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 10895647
      E-ISSN: 15205207
      
      

    • Structural and enzymatic insights into the ATP-binding and autophosphorylation mechanism of a sensor histidine kinase (Completo, 2010)

      TRAJTENBERG F , RUÉTALO N , H. BOTTI , BUSCHIAZZO A
      Journal of Biological Chemistry, 2010
      Palabras clave: Histidine Kinases, Two component systems Protein Crystallography
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Fisicoquímica Biológica y Biología Estructural
      Medio de divulgación: Papel
      Lugar de publicación: pubmed [Epub ahead of print]
      ISSN: 00219258
      E-ISSN: 1083351X
      
      

    • Thiol and sulfenic acid oxidation of AhpE, the one-cysteine peroxiredoxin from Mycobacterium tuberculosis: kinetics, acidity constants, and conformational dynamics (Completo, 2009)

      HUGO M , TURELL, L , MANTA B , H. BOTTI , MONTEIRO G , NETTO LE , ALVAREZ, B , RAFAEL RADI , TRUJILLO,M
      Biochemistry, 2009
      Palabras clave: Redox Biochemistry
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Fisicoquímica Biológica
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00062960
      E-ISSN: 15204995
      
      

    • Sulfenic acid-A key intermediate in albumin thiol oxidation. (Completo, 2009)

      LUCÍA TURELL , H. BOTTI , CARBALLAL, S , RADI, R , BEATRIZ ALVAREZ
      Journal of Chromatography B Biomedical Sciences and Applications, 2009
      Palabras clave: Thiol Albumin Sulfenic acid Plasma Mixed disulfides
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Bioquímica y Biología Molecular / Biología y Medicina de Radicales Libres
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 03784347
      DOI: 10.1016/j.jchromb.2009.03.035
      http://www.sciencedirect.com/science/journal/15700232
      artículo en prensa review The single thiol of human serum albumin (HSA-SH) is the predominant plasma thiol. Both circulating albumin and pharmaceutical preparations are heterogeneous regarding the thiol redox status, as revealed by anion-exchange–hydrophobic interaction chromatography. Sulfenic acid (HSA-SOH) is an intermediate in HSA-SH oxidation processes that was detected through different techniques including mass spectrometry. Recently, quantitative data led to the determination of rate constants. The preferred fate of HSA-SOH is the formation of mixed disulfides. Alternatively, HSA-SOH can be further oxidized to sulfinic and sulfonic acids. Oxidized forms increase under disease conditions, underscoring the importance of HSA-SH as a plasma scavenger of intravascular oxidants. We here provide a critical review of the oxidation of HSA-SH in the context of the intravascular compartment, with emphasis in the methodological approaches of mass spectrometry and chromatography for the analysis of albumin thiol redox states.
      
      

    • Oxidation of the albumin thiol to sulfenic acid and its implications in the intravascular compartment. (Completo, 2009)

      LUCÍA TURELL , CARBALLAL, S , H. BOTTI , RADI,R , BEATRIZ ALVAREZ
      Brazilian Journal of Medical and Biological Research, v.: 42 4 , p.:305 - 311, 2009
      Palabras clave: Thiol Sulfhydryl Albumin Sulfenic acid Plasma Mixed disulfides
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Bioquímica y Biología Molecular / Biología y Medicina de Radicales Libres
      Medio de divulgación: Internet
      E-ISSN: 0100879X
      DOI: 10.1590/S0100-879X2009000400001
      Review Human serum albumin (HSA) is the most abundant protein in the intravascular compartment. It possesses a single thiol, Cys34, which constitutes ~80% of the total thiols in plasma. This thiol is able to scavenge plasma oxidants. A central intermediate in this potential antioxidant activity of human serum albumin is sulfenic acid (HSA-SOH). Work from our laboratories has demonstrated the formation of a relatively stable sulfenic acid in albumin through complementary spectrophotometric and mass spectrometric approaches. Recently, we have been able to obtain quantitative data that allowed us to measure the rate constants of sulfenic acid reactions with molecules of analytical and biological interest. Kinetic considerations led us to conclude that the most likely fate for sulfenic acid formed in the plasma environment is the reaction with low molecular weight thiols to form mixed disulfides, a reversible modification that is actually observed in ~25% of circulating albumin. Another possible fate for sulfenic acid is further oxidation to sulfinic and sulfonic acids. These irreversible modifications are also detected in the circulation. Oxidized forms of albumin are increased in different pathophysiological conditions and sulfenic acid lies in a mechanistic junction, relating oxidizing species to final thiol oxidation products.
      
      

    • Discovery of novel inhibitors of Trypanosoma cruzitrans-sialidase from in silico screening. (Completo, 2009)

      NERES J. , BREWER M. L. , RATIER L. , H. BOTTI , BUSCHIAZZO A , EDWARDS P. N. , MORTENSON P. N. , CHARLTON M. H. , ALZARI P. M. , FRASCH A. C. , BRYCE R. A. , DOUGLAS K. T.
      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 2009
      Palabras clave: trans-Sialidase Inhibitors Virtual screening Trypanosoma cruzi Chagas disease
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Otras Ciencias Médicas / Otras Ciencias Médicas / Química Orgánica Médica y Parasitología Estructural
      Medio de divulgación: Internet
      ISSN: 0960894X
      trans-Sialidase from Trypanosoma cruzi (TcTS) has emerged as a potential drug target for treatment of Chagas disease. Here, we report the results of virtual screening for the discovery of novel TcTS inhibitors, which targeted both the sialic acid and sialic acid acceptor sites of this enzyme. A library prepared from the Evotec database of commercially available compounds was screened using the molecular docking program GOLD, following the application of drug-likeness filters. Twenty-three compounds selected from the top-scoring ligands were purchased and assayed using a fluorimetric assay. Novel inhibitor scaffolds, with IC50 values in the submillimolar range were discovered. The 3-benzothiazol-2-yl-4-phenyl-but-3-enoic acid scaffold was studied in more detail, and TcTS inhibition was confirmed by an alternative sialic acid transfer assay. Attempts to obtain crystal structures of these compounds with TcTS proved unsuccessful but provided evidence of ligand binding at the active site.
      
      

    • Reactivity of sulfenic acid in human serum albumin (Completo, 2008)

      TURELL,L , H. BOTTI , CARBALLAL, S , FERRER-SUETA,G , SOUZA, J.M. , DURÁN,R , FREEMAN, B.A. , RADI, R , ALVAREZ, B
      Biochemistry, v.: 47 1 , p.:358 - 367, 2008
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00062960
      E-ISSN: 15204995
      
      

    • Sulfenic acid in human serum albumin (Completo, 2007)

      CARBALLAL, S , ALVAREZ, B , TURELL, L , H. BOTTI , FREEMAN, B. A. , RADI, R
      Amino Acids, v.: 32 4 , p.:543 - 551, 2007
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 09394451
      E-ISSN: 14382199
      
      

    • Reactivity of peroxynitrite and nitric oxide with LDL (Completo, 2005)

      H. BOTTI , TROSTCHANSKY, A , BATTHYANY, C , RUBBO, H
      IUBMB Life, v.: 57 6 , p.:407 - 412, 2005
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 15216543
      E-ISSN: 15216551
      
      

    • Design, synthesis, and biological characterization of potential antiatherogenic nitric oxide releasing tocopherol analogs (Completo, 2005)

      LÓPEZ,G. V. , BATTHYANY, C , BLANCO, F , H. BOTTI , TROSTCHANSKY, A , MIGILARO, E , RADI, R , GONZÁLEZ, M , CERECETTO,H , RUBBO, H
      Bioorganic & Medicinal Chemistry, v.: 13 20 , p.:5787 - 5796, 2005
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 09680896
      E-ISSN: 14643391
      
      

    • Direct measurement of nitric oxide and oxygen partitioning into liposomes and low density lipoprotein (Completo, 2005)Trabajo relevante

      MOLLER,M , H. BOTTI , BATTHYANY, C , RUBBO, H , RADI,R , DENICOLA,A
      Journal of Biological Chemistry, v.: 280 10 , p.:8850 - 8854, 2005
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00219258
      E-ISSN: 1083351X
      
      

    • Homolytic pathways drive peroxynitrite-dependent Trolox C oxidation (Completo, 2004)Trabajo relevante

      H. BOTTI , TRUJILLO,M , BATTHYANY ,C , RUBBO, H , FERRER-SUETA, G , RADI, R
      Chemical Research in Toxicology, v.: 17 10 , p.:1377 - 1384, 2004
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 0893228X
      E-ISSN: 15205010
      
      

    • Septic diaphragmatic dysfunction is prevented by Mn(III)porphyrin therapy and inducible nitric oxide synthase inhibition (Completo, 2004)

      NIN,N , CASSINA, A , BOGGIA,J , ALFONSO, E , H. BOTTI , PELUFFO, G , TROSTCHANSKY, A , BATTHYANY, C , RADI, R , RUBBO, H , HURTADO, F. J.
      Intensive Care Medicine, v.: 30 12 , p.:2271 - 2278, 2004
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 03424642
      E-ISSN: 14321238
      
      

    • Nitric oxide inhibits prooxidant actions of uric acid during copper-mediated LDL oxidation (Completo, 2004)

      SANGUINETTI, SM , BATTHYANY, C , TROSTCHANSKY, A , H. BOTTI , LÓPEZ, GI , WIKINSKI, RL , RUBBO, H , SCHREIER, LE
      Archives of Biochemistry and Biophysics, v.: 423 2 , p.:302 - 308, 2004
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00039861
      E-ISSN: 10960384
      
      

    • Peroxynitrite-mediated alpha-tocopherol oxidation in low-density lipoprotein: a mechanistic approach (Completo, 2004)Trabajo relevante

      H. BOTTI , BATTHYANY, C , TROSTCHANSKY, A , RADI, R , FREEMAN, BA , RUBBO,H
      Free Radical Biology and Medicine, v.: 36 2 , p.:152 - 162, 2004
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 08915849
      E-ISSN: 18734596
      
      

    • Peroxynitrite flux-mediated LDL oxidation is inhibited by manganese porphyrins in the presence of uric acid (Completo, 2003)

      TROSTCHANSKY, A , FERRER-SUETA, G , BATTHYANY, C , H. BOTTI , BATINIC-HABERLE, I , RADI. R , RUBBO, H
      Free Radical Biology and Medicine, v.: 35 10 , p.:1293 - 1300, 2003
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 08915849
      E-ISSN: 18734596
      
      

    • Antioxidant and diffusion properties of nitric oxide in low-density lipoprotein. (Completo, 2002)

      RUBBO, H. , H. BOTTI , Trostchansky, A. , DENICOLA, A , RADI, R
      Methods in Enzymology, v.: 359 p.:200 - 209, 2002
      Palabras clave: nitric oxide antioxidant low density lipoprotein
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Internet
      Escrito por invitación
      ISSN: 00766879
      E-ISSN: 15577988
      
      

    • Interactions of nitric oxide and peroxynitrite with low-density lipoprotein (Completo, 2002)

      RUBBO, H , TROSTCHANSKY, A , H. BOTTI , BATTHYANY, C
      Biological Chemistry, v.: 383 3-4 , p.:547 - 552, 2002
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 14316730
      E-ISSN: 14374315
      
      

    • Formation of lipid-protein adducts in low-density lipoprotein by fluxes of peroxynitrite and its inhibition by nitric oxide (Completo, 2001)

      TROSTCHANSKY. A , BATTHYANY,C , H. BOTTI , RADI,R , DENICOLA,A , RUBBO, H
      Archives of Biochemistry and Biophysics, v.: 395 2 , p.:225 - 232, 2001
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00039861
      E-ISSN: 10960384
      
      

    • Direct evidence for apo B-100-mediated copper reduction: studies with purified apo B-100 and detection of tryptophanyl radicals (Completo, 2000)

      BATTHYANY,C , SANTOS,CX , H. BOTTI , CERVENANSKY, C , RADI, R , AUGUSTO,O , RUBBO, H
      Archives of Biochemistry and Biophysics, v.: 384 2 , p.:335 - 340, 2000
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular /
      Medio de divulgación: Papel
      ISSN: 00039861
      E-ISSN: 10960384
      
      

Producción técnica

• Trabajos Técnicos

  • Reporte 4: Evidencia del impacto sobre la evolución de la epidemia de algunas medidas de control (2020)

    Otra
    H. BOTTI , A ALEMAN / Riganti AA , Pintos J , PONZO J. , Martín Salgado
    Diferentes medidas de control se aplican en diferentes países para interrumpir o disminuir al máximo la transmisión del virus causante de COVID-19. Se aplican con diferente intensidad y en diferentes momentos de la evolución de la epidemia, y uno de sus objetivos principales es evitar el desborde de los servicios de salud provocado por un incremento acelerado de casos graves. La evidencia existente muestra que una combinación de diversas medidas de aislamiento y distanciamiento físico reducen de manera marcada la transmisión del virus. La mayoría de las estimaciones del impacto tiene un alto grado de imprecisión, y es muy difícil cuantificar la contribución de cada una de las medidas dado que en general se ha aplicado una combinación de las mismas. Una de las intervenciones más eficaces es la identificación y cuarentena temprana de contactos, que podría evitar 44% a 81% de nuevos casos y 31% a 63% de todas las muertes.
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Disponibilidad: Irrestricta
    
    Duración: 2 meses
    Institución financiadora: Universidad de la República
    Palabras clave: Evaluación de Políticas Públicas
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Salud Pública y Medioambiental / Evaluación
    https://guiad-covid.github.io/publication/nota4/

  • Reporte 2: Crecimiento subexponencial de casos confirmados de COVID-19 (2020)

    Otra
    H. BOTTI , Alejo Acuña Alemán , Pintos J , ROMERO H , M ARIM , FARIELLO, M.I. , SANGUINETTI-SCHECK J I
    En esta segunda nota se analiza la dinámica de crecimiento en el comienzo de la epidemia de Covid-19 en Uruguay. Se observa que el crecimiento de los casos confirmados hasta el momento en nuestro país es subexponencial. Se analizan posibles explicaciones para este fenómeno que pueden resumirse en efectos de muestreo y/o mecanismos reales del desarrollo de la epidemia. En ambos casos el análisis brinda información a ser considerada sobre el avance y/o registro de la enfermedad. Se advierte finalmente sobre la posibilidad de una rápida transición a un régimen de crecimiento exponencial.
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Disponibilidad: Irrestricta
    
    Duración: 2 meses
    Institución financiadora: Universidad de la República
    Palabras clave: COVID-19 Políticas Públicas
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Epidemiología / Enfermedades Transmisibles
    https://guiad-covid.github.io/publication/nota2/

  • Reporte 1: Ciencia y Datos para el análisis de la epidemia (2020)

    Otra
    H. BOTTI , FARIELLO, M.I. , Herrera Daniel , Pintos J , ROMERO H , A ALEMAN / Riganti AA , SANGUINETTI-SCHECK J I
    Esta nota trata sobre el alcance de los modelos matemáticos y las simulaciones computaciones como herramientas de análisis en epidemiología. Refiere además a la necesidad y la importancia de considerar las particularidades de nuestro país (climáticas, sanitarias, culturales, económicas, geográficas y demógraficas entre otras) al momento de validar modelos para la dinámica del COVID-19 en Uruguay. Se muestran predicciones realizadas considerando la incertidumbre sobre los parámetros para concluir que al momento actual es cuestionable el sustento de las estimaciones de parámetros disponibles para Uruguay y lo apropiado de los modelos propuestos a nuestra realidad. La capacidad de aportar en esta dirección dependerá en gran medida del acceso por la comunidad científica a la información de la epidemia.
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Disponibilidad: Irrestricta
    
    Duración: 2 meses
    Institución financiadora: Universidad de la República
    Palabras clave: Políticas Públicas COVID-19 Simulaciones Computacionales Dinámica
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Médicas y de la Salud / Ciencias de la Salud / Enfermedades Infecciosas / Dinámica de epidemias
    https://guiad-covid.github.io/publication/nota1/

  • Trypanosoma cruzi Glucose-6-P Dehydrogenase in complex with G6P (2018)

    Asesoramiento
    H. BOTTI , ORTIZ, C. , COMINI MA , LARRIEUX, N.
    Refinar un modelo para la estructura de un cristal de la proteína trunca N delta 37 Glucosa-6-Fosfato Deshidrogenasa de Trypanosoma cruzi en complejo con el segundo sustrato, la G6P. Este complejo se está estudiando en varios laboratorios como blanco farm
    País: Uruguay
    Idioma: Inglés
    Ciudad: Montevideo
    Duración: 2 meses
    Institución financiadora: ANII
    Palabras clave: Chagas Trypanosma cruzi pentose phosphate pathway XRD Protein Biophysics
    Medio de divulgación: Internet
    http://www.rcsb.org/structure/6D24

  • GLUCOSE-6-P DEHYDROGENASE (APO FORM) FROM TRYPANOSOMA CRUZI (2018)

    Asesoramiento
    H. BOTTI , ORTIZ, C. , COMINI MA , LARRIEUX, N. , BUSCHIAZZO, A.
    Refinar un modelo para la estructura de un cristal de la proteína trunca N delta 37 Glucosa-6-Fosfato Deshidrogenasa de Trypanosoma cruzi, la que se está estudiando en varios laboratorios como blanco farmacológico para combatir la enfermedad de Chagas.
    País: Uruguay
    Idioma: Inglés
    Ciudad: Montevideo
    Disponibilidad: Irrestricta
    
    Duración: 2 meses
    Institución financiadora: ANII
    Palabras clave: Chagas disease pentose phosphate pathway Trypanosmosma cruzi XRD Protein Biophysics
    Medio de divulgación: Internet
    http://www.rcsb.org/structure/6D23

  • Crystal structure analysis of Human Serum Albumin in complex with chloride anions at cryogenic temperature (2012)Trabajo relevante

    Asesoramiento
    H. BOTTI , L. BONILLA , TRAJTENBERG, F , RADI, R , BUSCHIAZZO, A.
    Refinar un modelo para la estructura de un cristal de la proteína albúmina sérica humana en estado redox reducido de la Cys34
    País: Uruguay
    Idioma: Inglés
    Ciudad: Montevideo
    Disponibilidad: Irrestricta
    
    Duración: 12 meses
    Institución financiadora: ANII
    Palabras clave: XRD Protein Biophysics Human Serum Albumin Redox Biology and Medicine
    Medio de divulgación: Internet
    http://www.rcsb.org/structure/4EMX

  • Crystal structure of an engineered Ferredoxin(flavodoxin) NADP(H) Reductase (FPR) from Escherichia coli (2011)

    Asesoramiento
    H. BOTTI , MUSUMECI, M. , CECCARELLI, E. , BUSCHIAZZO, A.
    Refinar un modelo para la estructura de un cristal de la proteína Ferredoxina NADP reductasa, enzima clave en la producción vegetal.
    País: Uruguay
    Idioma: Inglés
    Ciudad: Montevideo
    Duración: 2 meses
    Palabras clave: XRD Pisum sarivum Redox Biology Plant Physiology Enzymology Protein Biophysics
    Medio de divulgación: Internet
    http://www.rcsb.org/structure/2XNJ

  • Crystal structure of an engineered Ferredoxin NADP reductase (FNR) from Pisum sativum (2011)

    Asesoramiento
    H. BOTTI , MUSUMECI, M. , CECCARELLI, E. , BUSCHIAZZO, A.
    Refinar un modelo para la estructura de un cristal de la proteína Ferredoxina NADP reductasa, enzima clave en la producción vegetal.
    País: Uruguay
    Idioma: Inglés
    Ciudad: Montevideo
    Disponibilidad: Irrestricta
    
    Duración: 2 meses
    Palabras clave: Pisum sarivum Redox Biology Plant Physiology Enzymology Protein Biophysics
    Medio de divulgación: Internet
    http://www.rcsb.org/structure/2XNC

Evaluaciones

• Evaluación de Proyectos

  • Comité evaluación de proyectos

    Comité Evaluador de Proyectos de Maestría del International Master/PhD Program in Biomedical Sciences ( 2017 )

    Sector Extranjero/Internacional/Otros / Albert-Ludwigs-Universität Freiburg / Institut für Molekulare Medizin und Zellforschung , Alemania
    Cantidad: Menos de 5
    Universidad de Buenos Aires
    

• Evaluación de Publicaciones

  • Comité editorial

    Journal of Biological Chemistry ( 2013 / 2013 )

    
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Revisiones

    Oxidative Medicine and Cellular Longevity ( 2015 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: Menos de 5
    

  • Free Radical Research ( 2012 / 2019 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

  • Free Radical Biology and Medicine ( 2010 / 2019 )

    Tipo de publicación: Revista
    Cantidad: De 5 a 20
    

Formación de RRHH

• Tutorías concluidas

  • Posgrado

    • Surfactante pulmonar durante la lesión pulmonar aguda: desde la fisiología a aspectos biofísicos de su disfunción

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Asesor
      Nombre del orientado: Leonel Malacrida
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Daño pulmonar agudo Fluorescencia
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Sistemas lipidicos

    • Ácido sulfénico en albúmina sérica humana

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Asesor
      Nombre del orientado: Lucía Turell
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Bioquímica de tioles Cromatografía de albúmina sérica humana
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Modificaciones postraduccionales de proteínas

    • Solubilidad del óxido nítrico y del oxígeno en biocompartimentos hidrofóbicos y sus consecuencias biológicas

      Tesis de doctorado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Doctorado en Ciencias Biológicas (UDELAR-PEDECIBA)
      Tipo de orientación: Asesor
      Nombre del orientado: Matías Möller
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Fisicoquímica biológica Óxido Nítrico compartimientos lipídicos
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biofisicoquímica

  • Grado

    • Purificación de proteasomas humanos y estudio de su regulación por electrófilos

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Privado / Universidad ORT Uruguay / Facultad de Ingeniería , Uruguay
      Programa: Ingeniería en Biotecnología
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Paulina Invernizzi
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Proteasomas Inhibición enzimática
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Farmacología y Farmacia / Desarrollo de fármacos
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Enzimología

    • MECANISMOS ANTIINFLAMATORIOS DE LOS NITROALQUENOS: Regulación del Inflamasoma NLRP3

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Bioquímica
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
      Nombre del orientado: Germán Galliussi
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Regulación de la Inflamación Sensores de patrones moleculares de peligro/daño Interleuquina 1 beta
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Inmunología / Regulación de la inflamación
      Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Bioquímica y Biología Molecular / Señalización de la inflamación

    • Efecto de los ácidos grasos en las propiedades del tiol de la albúmina y de su derivado ácido sulfénico

      Tesis/Monografía de grado
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias , Uruguay
      Programa: Licenciatura en Bioquímica
      Tipo de orientación: Asesor
      Nombre del orientado: María José Torres
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Biomarcadores de estrés oxidativo
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Bioquímica y Biología Molecular / Medicina y Biología Redox

  • Otras

    • Estudio de la purificación de proteasomas humanos y de su modulación por electrófilos

      Otras tutorías/orientaciones
      Sector Educación Superior/Privado / Universidad ORT Uruguay / Facultad de Ingeniería , Uruguay
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Paulina Invernizzi
      País: Uruguay
      Palabras Clave: Purificación de proteasomas humanos ensayos de actividad proteasomal inhibidores del proteasoma humano
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud / Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas

• Tutorías en marcha

  • Posgrado

    • Evaluación por expertos y aprendizaje automático de la calidad de imágenes mamográficas y del proceso enseñanza aprendizaje en la Licenciatura en Imagenología de la EUTM (2019)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina / PROINBIO , Uruguay
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: María Sarasua
      Medio de divulgación: Otros
      País/Idioma: Uruguay, Español
      Palabras Clave: Calidad de imágenes aprendizaje autmático

    • Estudio de modelos de la actividad y modulación de núcleos proteasomales 20S (2018)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / PEDECIBA , Uruguay
      Tipo de orientación: Tutor único o principal
      Nombre del orientado: Lourdes Lebrato Oneto
      Medio de divulgación: Otros
      País/Idioma: Uruguay, Español
      Palabras Clave: Biofísica y Bioquímica de enzimas compartimentalizadas Farmacodinamia de proteasomas Inferencia de Modelos Mecanísticos Bortezomib Mieloma múltiple Mycobacterium tuberculosis
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Farmacología y Farmacia / Estudio de Blancos Terapéuticos Moleculares/Farmacodinamia

    • MECANISMOS MOLECULARES DE LA MODULACIÓN POR NITROALQUENOS DEL INFLAMASOMA NLRP3 (2016)

      Tesis de maestria
      Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Medicina , Uruguay
      Programa: PROINBIO
      Tipo de orientación: Cotutor en pie de igualdad
      Nombre del orientado: Germán Galliussi
      Medio de divulgación: Papel
      País/Idioma: Uruguay, Español
      Palabras Clave: Regulación de la Inflamación y la Inmunidad
      Areas de conocimiento:
      Ciencias Médicas y de la Salud / Medicina Básica / Inmunología / Regulación de la inflamación y de la inmunidad

Otros datos relevantes

• Premios, Honores y Títulos

  • PhD en Biología (2010)

    (Internacional)
    Facultad de Ciencias, PEDECIBA, Universidad de la República.
    
    

  • Young Investigator Award de la Society for Free Radical Biology and Medicine (2007)

    Society for Free Radical Biology and Medicine
    
    

  • Travel Award de la Society for Free Radical Biology and Medicine (2003)

    Society for Free Radical Biology and Medicine (previamente denominada «Oxygen Society»)
    
    

  • Magíster en Biología (2003)

    (Internacional)
    Facultad de Ciencias, PEDECIBA, Universidad de la República.
    
    

  • Dr. en Medicina (2001)

    (Nacional)
    Facultad de Medicina, Universidad de la República.
    
    

• Presentaciones en eventos

  • Conferencia de Prof. Invitado (2011)

    Otra
    Brownian distance-dependent reactions of ·NO and O2·- under equilibrium and disequilibrium
    Suiza
    Tipo de participación: Expositor oral
    Nombre de la institución promotora: Eidgenössische Technische Hochschule Zürich - Bioinorganic and Solution Chemistry Group Palabras Clave: Reacciones controladas por difusión termodinámica
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas / Físico-Química, Ciencia de los Polímeros, Electroquímica
    

  • Gordon Research Conference on Oxygen Radicals (2006)

    Congreso
    REDOX VARIANTS OF HUMAN SERUM ALBUMIN: FOCUS ON SULFUR OXIDATION
    Estados Unidos
    Tipo de participación: Comentarista
    Nombre de la institución promotora: Gordon Research Conference on Oxygen Radicals Areas de conocimiento:
    Ciencias Médicas y de la Salud / Otras Ciencias Médicas / Otras Ciencias Médicas
    

  • South American Group for Free Radical Research II Congress (2001)

    Congreso
    NITRIC OXIDE AND PEROXYNITRITE INTERACTIONS WITH LOW DENSITY LIPOPROTEIN LIPOPHILIC ANTIOXIDANTS
    Argentina
    Tipo de participación: Comentarista
    Nombre de la institución promotora: Free Radical Research Areas de conocimiento:
    Ciencias Médicas y de la Salud / Otras Ciencias Médicas / Otras Ciencias Médicas
    

  • (1999)

    Otra
    Apolipoprotein B-100 Promotes Copper-Dependent LDL Oxidation". Biology and Pathology of Free Radicals: Plant and Wine Polyphenol Antioxidants
    Uruguay
    Tipo de participación:

• Jurado/Integrante de comisiones evaluadoras de trabajos académicos

  • Estudios estructurales en el sistema de dos componentes DesK/DesR de Bacillus subtilis (2008)

    Candidato: Mathias Ferrari
    Tipo Jurado: Tesis/Monografía de grado
    MARIN, M. , H. BOTTI
    Licenciatura en Ciencias Biológicas / Sector Educación Superior/Público / Universidad de la República / Facultad de Ciencias / Uruguay
    País: Uruguay
    Idioma: Español
    Palabras Clave: Biología Estructural Sistemas a dos componentes bacterianos
    Areas de conocimiento:
    Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas / Biofísica / Biología Estructural
    

• Construcción institucional

  1) Responsable de proyectos de desarrollo institucional financiados:

  A) Semillero de Iniciativas Interdisciplinarias del Espacio Interdisciplinario (SEM2019). "Iniciativa Interdisciplinaria para el desarrollo de las Ciencias de la Información y de Datos Aplicadas a la Salud Humana (CIDASH)" 

  Participantes : Horacio Botti1, Juan Eduardo Gil2, Hugo Rodríguez3, Dra. Frances Borches3, Delia Sánchez4, Franco González5, Marcia Barbero5; Ignacio Ramírez6, Federico Lecumberry6, Gregory Randall6, Pablo Musé6, Juan Bazerque6, Alicia Fernández6; Cecilia Tomassini78, Camila Zeballos7; José Fernández9, Natalia Aguirre-Ligüera9, Exequiel Fontans9; Alvaro Cabana10, Victor Ortuño10, Carolina Guidotti11; Hugo Naya12, Lucia Spangenberg12.

  1 Coordinador, Laboratorio de Biofísica Integrativa, Departamento de Biofísica, Facultad de Medicina

  2 Departamento de Métodos Cuantitativos, Facultad de Medicina

  3 Departamento de Medicina Legal y Ciencias Forenses, Facultad de Medicina

  4 Unidad Académica de Bioética, Facultad de Medicina

  5 Unidad de Sociología, Dpto. de Medicina Preventiva y Social, Facultad de Medicina

  6 Instituto de Ingeniería Eléctrica, Facultad de Ingeniería

  7 Unidad Académica de CSIC

  8 Departamento de Sociología, Facultad de Ciencias Sociales

  9 Instituto de Información, Facultad de Información y Comunicación

  10 Instituto de Fundamentos y Métodos en Psicología, Facultad de Psicología

  11 Instituto de Psicología Social, Facultad de Psicología

  12 Unidad de Bioinformática, Institut Pasteur de Montevideo

  
  

  B) Proyecto de ENSEÑANZA CSE2018.

  Equipamiento e infraestructura destinados a la enseñanza de grado ? ?Desarrollo del Centro de Recursos para el Aprendizaje y la Información en la Biblioteca de la Facultad de Medicina: Creación de la Sala de Lectura y Aprendizaje?. Proyecto Interdisciplinario diseñado y en desarrollo a través de la cooperación con la Lic. Karina Camps y la Arq. Lucía Facio. (2018-2019).

  
  

  C) Proyecto de MEJORA EDILICIA PECET-MALUR2017.

  Adecuaciones para la evacuación y salidas de emergencia en Pisos 1 y 2 del Edificio Central de la Facultad de Medicina?. Departamentos de Biofísica y Fisiología de la Facultad de Medicina. (2018) Corresponsable junto con el Dr. S. Curti.

  
  

  2) Participación en el Cogobierno:

  Consejo Directivo de la Facultad de Medicina por el Orden Estudiantil (1998-2002).

  Asamblea del Claustro de la Facultad de Medicina por el Orden Estudiantil (1998-2000).

  Consejo de Administración de la Fundación Manuel Pérez por el Orden Estudiantil (2001-2003).

  Comisión Directiva del PEDECIBA en representación de los Estudiantes (2008-2010).

  Comisión de Educación del Institut Pasteur de Montevideo en representación de los Investigadores (2009-2011).

  Consejo Científico del Área Biología del PEDECIBA en representación de los Investigadores (2015-2016).

  Comisión de Biblioteca de la Facultad de Medicina, delegado del Órden Docente (2017-).

  
  

Información adicional

Asesoré en el desarrollo de las Tesis de Doctorado de Lucía Turell, Matías Möller, Felipe Trajtenberg, Lucía Bonilla.

Asesoré en el desarrollo de la tesis de grado de María José Torres.

Asesoré en la Tesis de Maestría de Leonel Malacrida.

Dictado de cursos recientes:

Introducción a la inferencia y validación de modelos a partir de datos experimentales. Curso de Posgrado PROINBIO. Organizadores: Ignacio Ramírez y Horacio Botti

Indicadores de producción