-
Biosensor de lipoperóxidos aplicado a la identificación de moléculas hepato- protectoras (03/2024 - a la fecha)
Código: FVF_2023_505 Desarrollar herramientas de screening de fármacos hepatoprotectores basada en el empleo de un biosensor de lipoperóxidos, empleando hepatocitos y células hepáticas estrelladas que reproducen situaciones patológicas.
1 horas semanales
Integrante del Equipo
En Marcha
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:1
Equipo:
COMINI MA , ODDONE N. (Responsable)
-
Persistencia en la patología Leishmaniasis visceral (03/2024 - a la fecha)
Código: FVF_2023_441 Identificación y caracterización de formas quiescentes de Leishmania infantum
1 horas semanales
Integrante del Equipo
En Marcha
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Maestría/Magister:1
Equipo:
COMINI MA , D. BENÍTEZ (Responsable)
-
Search for inhibitors of BLV and HTLV virus proteases with antiviral activity (03/2025 - a la fecha)
Código: Actions Concertées InterPasteuriennes - ACIP 2024 The project aims to identify compounds capable of inhibiting BLV-PR and
HTLV-PR applying complementary screening and validation strategies. To
accelerate the discovery of compounds that may rapidly be implemented in
clinical studies, a library of clinical drugs will be screened in silico against
aspartic protease from HTLV/BLV, and the hits will be experimentally
confirmed. Secondly, the consortium will assess whether the most potent
hits identified exhibit antiviral activity in state-of-the-art cell infection models
for BLV and HTLV.The proposal represents an innovative pionneer large
drug discovery screening campaign against BLV-PR and HTLV-PR.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
En Marcha
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Especialización:1
Maestría/Magister:1
Equipo:
COMINI MA , FLÓ, M. , David Shum , Alan Talevi , Philippe Afonso
-
Potenciales agentes antimicrobianos presentes en alimentos vegetales de interés regional (03/2024 - a la fecha)
Código: REDALIM-MIC - Aislar e identificar compuestos con actividad antimicrobiana a partir de especies vegetales alimenticias, evaluar el efecto de los compuestos a nivel del sistema inmunológico y el aporte nutricional de los alimentos involucrados
- Establecer una Red de trabajo interdisciplinario entre los países involucrados
- Formar recursos humanos a través de cursos, estudios de posgrado y estancias de carácter experimental y promover el intercambio de investigadores y estudiantes.
- Realizar cursos y/o talleres relacionados con la temática
- Difundir los resultados de la investigación en congresos, revistas científicas y materiales de difusión para el público general
- Desarrollar un libro o manual enfocado al estudio de alimentos vegetales con actividad antiviral y/o antibacteriana para alumnos de posgrado
- Propiciar la producción y transformación comercial de alimentos regionales con actividad biocida para darles un enfoque funcional y preventivo
- Otorgar valor agregado a los productos comercializados por empresas del sector alimenticio, así como a productores locales de la región.
- Brindar a la sociedad información científica respaldatoria con relación a los alimentos vegetales
2 horas semanales
Integrante del Equipo
En Marcha
RRHH formados en el proyecto:
Especialización:2
Equipo:
COMINI MA , Valeria Sulsen (Responsable) , Claudia Sepúlveda , Ericson Coy Barrera , Lianet Monzote Fidalgo , Suzana Guimarães Leitão , Hector Alonzo Gomez , Luis Dyner , Cecilia Laurella , Sully Cruz , Maria Costa do Ceus , Dr. Fernando B. da Costa , Gilda Leitão
-
Ampliando la serie de paullonas N5-sustituidas como inhibidores de la biosíntesis de tripanotión: Un enfoque desde la Química Inorgánica (04/2025 - a la fecha)
Código: FCE_3_2024_1_181280 Síntesis y evaluación de actividad sobre tripanotiona sintetasa y tripanosomátidos de complejos metálicos generados sobre el andamio orgánico paulona.
1 horas semanales
Integrante del Equipo
En Marcha
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:1
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
COMINI MA , Rodrigo Alejandro Moreira Fernández , Diego Raúl BENÍTEZ BONÉ , Dinorah Cecilia GAMBINO VEDANI , Gonzalo Scalese (Responsable)
Palabras clave:
paulonas
tripanotión
biosensor
tripanosomátidos
química medicinal
Areas de conocimiento:
Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas /
Química Inorgánica y Nuclear /
Quìmica Inorgánica Medicinal
-
Desarrollo de un ensayo serológico rápido para determinar la actividad neutralizante frente a diferentes variantes de SARS-CoV-2. (03/2023 - a la fecha)
Código: FMV_3_2022_1_172395 Desarrollo y optimización de ensayo que permita detectar distintas variantes de SARS-CoV2
1 horas semanales
Integrante del Equipo
En Marcha
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
COMINI MA , María Florencia RAMMAURO SANGUINETTI (Responsable) , Martín FLÓ DÍAZ , Natalia OLIVERO DEIBE , Sergio BIANCHI CANTERA , Federico CARRIÓN RUNCO (Responsable)
Areas de conocimiento:
Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud /
Tecnologías que involucran la identificación de ADN, proteínas y enzimas /
Inmunovirología
-
Intestinal organoid models for studying host-parasite interaction in Chagas disease (03/2023 - 11/2025 )
Código: Actions Concertées InterPasteuriennes - ACIP 2022 This project aims to shed light on host-parasite interactions at the intestinal epithelium during infection by T. cruzi using organoids as physiologically relevant in vitro models.
By the coordinated action of four teams from different institutes of the Pasteur Network (IP Montevideo, IP Paris and Fiocruz-Belo Horizonte), which have multidisciplinary and complementary expertise, this project will pursue the following specific objectives:
1) Determine the pathogen´ tropism for intestinal cells of organoids using a fluorescent reporter cell line of a T. cruzi
2) Evaluate the involvement of immune and stromal cells during intestinal infection by T. cruzi.
3) Study the progression of infection of intestinal organoids under conditions mimimicking the acute and chronic phase of CD.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA , Giulia Nigro , Silvane Fonseca Murta , BOLLATI-FOGOLIN M , PAGOTTO RM , DAGHERO H. , MEDEIROS, A.
-
Inhibidores de la MPro de SARS-CoV-2 identificados en una campaña nacional de cribado: modo de inhibición y unión a su diana molecular (04/2023 - 09/2025 )
Código: 22520220100475UD El objetivo general de este proyecto es elucidar el modo de inhibición e interacción con su blanco molecular de un grupo de inhibidores de la MPro de SARS-CoV-2. Esta información será sumamente valiosa para, en una segunda fase, llevar adelante la optimización racional de inhibidores con mayor afinidad y selectividad por la proteasa viral.
10 horas semanales
Coordinador o Responsable
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:1
Equipo:
COMINI MA (Responsable) , MEDEIROS, A. (Responsable) , FLÓ, M. , Ruatta, Santiago Matías , LARRIEUX, N , BUSCHIAZZO, A.
-
Diseño y preparación de selenosemicarbazonas y sus complejos metálicos como inhibidores de proteasas de SARS-CoV2 (03/2023 - 09/2025 )
Código: 22520220100086UD Partiendo de resultados preliminares
obtenidos por el grupo, en este proyecto se propone diseñar nuevas selenosemicarbazonas con el
fin de comprender la relación entre la estructura de estas y la actividad inhibitoria frente a las
enzimas 3CLPro y PLpro, y en particular, estudiar el efecto de la naturaleza de diferentes
sustituyentes. Se propone, además, utilizar estos compuestos como ligandos para la generación
de complejos de paladio, platino y rutenio. Los complejos metálicos se diseñarán también en
forma racional, incluyendo en la esfera de coordinación de metal, distintos co-ligandos que
permitan modular las propiedades fisicoquímicas y biológicas de las nuevas especies complejas.
El objetivo es obtener compuestos que además de inhibir las enzimas seleccionadas, presenten
una buena actividad antiviral y baja citotoxicidad inespecífica. Para los mejores compuestos se
estudiará el mecanismo de inhibición y realizarán estudios in silico, propiedades fisicoquímicas
y ADME.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA , G. MAHLER , S. Rostán Talasimov , NICOLÁS VEIGA , L. OTERO
-
Tripanosomiasis olvidadas: Expandiendo el espacio químico de potenciales agentes tripanosomicidas con estrategias de inteligencia artificial, in silico, síntesis, ensayos bioquímicos y parasitológicos (03/2023 - 09/2025 )
Código: 22520220100046UD : La propuesta está organizada en tres etapas. En la primera, estrategias de inteligencia artificial (deep learning-DL/reinforcement learning-RL) serán aplicadas para lograr una lista de moléculas diseñadas "de novo". Se realizará el entrenamiento de una red usando la base de datos PDBBind y se utilizará un filtro de ligandos según su IC50 medido en diversos organismos. Luego, se realizará el entrenamiento de una red neuronal generacional y se realizará un RL para obtener su sintetizabilidad (servicios de la base Reaxys-Elsevier y propiedades ADMET (software Schrödinger). En base a investigaciones en marcha, y a que comparten al ligando tripanotiona en el sitio enzimático (la primera como producto y la segunda como reactivo), se seleccionaron a tripanotiona sintetasa(TS) y a tripanotiona reductasa(TR) como blancos de interés. Con sus estructuras, se realizará una "prueba de concepto", generando hasta 3000 diseños "de novo", (hits.denovo) y se construirán sus estructuras 3D a partir de sus códigos SMILES. Se organizará una base de hasta 3000 hits.denovo mediante observación y clasificación de su espacio químico. Con las estructuras 3D de TS /TR, y el campo de fuerzas Amber14-EHT(MOE), se realizará docking molecular para evaluar la posible unión y ordenamiento según sus energías libres de interacción. Se registrarán sus patrones de contacto. Se seleccionarán los 100 mejores anclados, se revisará su factibilidad sintética y se propondrá un conjunto de 30 moléculas para su síntesis y se realizarán ensayos de inhibición en TS/TR, y de sonda redox. Se profundizará en el estudio del modo de acción, a través de estudios DFT (evaluación de una posible reactividad redox).Se comprobará el éxito obtenido mediante ensayos de bioactividad en tripomastigotes y amastigotes de tripanosomátidosy de su selectividad respecto al huésped para los 30 hits.denovo sintetizados. Finalmente, se entregará una lista de posibles candidatos con marcada actividad y selectividad para su desarrollo como fármacos tripanosomicidas.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA , M. PAULINO (Responsable) , Ballesteros-Casallas Andres , Cantero, J , Salas C
-
Síntesis de una nueva serie de oligamidas análogas a distamicina como potenciales antitripanosomátidos (03/2023 - 09/2025 )
Código: 22520220100105UD El objetivo de este proyecto se enmarca en el interés generado durante estos años de colaboración entre los investigadores del FQ y el IPMont. en encontrar nuevas entidades que den solución a enfermedades desatendidas y por comprender el mecanismo molecular por el cual estos compuestos actúan, por lo que planteamos preparar una nueva serie de compuestos que mejoren las propiedades fisicoquímicas y nos permitan evaluar las actividades biológicas in vivo.
Para ello planteamos una serie de derivados que consideramos no seran tan susceptibles a sistemas de degradación enzimática, proponemos el uso de metodología de síntesis de oligoamidas ya empleadas en el grupo y desarrollar otras nuevas metodologías en fase sólida. Esto nos permitirá estudiar cómo afectan las pequeñas modificaciones estructurales a las propiedades fisicoquímicas y la actividad biológica. Estos estudios nos permitirán a futuro abordar la identificación de blancos moleculares de estos compuestos y aspectos (ultra)estructurales de las interacciones.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Equipo:
COMINI MA , SERRA, G. , L.SCARONE (Responsable) , MEDEIROS, A.
-
Metagenómica aplicada al descubrimiento de nuevas enzimas redox (04/2022 - 08/2025 )
Código: FCE_1_2021_1_166635 Identificación de nuevas enzimas redox en proteobacterias
1 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Doctorado:1
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
COMINI MA , Gregorio IRAOLA , Ari Fernando ZEIDA CAMACHO , Daniela COSTA DUARTE , Bruno MANTA PORTEIRO (Responsable)
Areas de conocimiento:
Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas /
Bioquímica y Biología Molecular /
Biologia Redox
-
Diseño racional de potenciales inhibidores de proteasas de SARS-CoV-2 basados en tio y selenosemicarbazonas derivadas de cumarinas y sus complejos metálicos (05/2021 - 10/2024 )
Código: FCE_3_2020_1_162617 Diseño y optimización de inhibidores de las proteasas de SARS-CoV-2 basados en compuestos orgánicos
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Doctorado:1
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
COMINI MA , Ana Lucía OTERO ZUBIAURRE , Graciela MAHLER TARRÍO , Jorge Nicolás VEIGA RODRÍGUEZ , Martín FLÓ DÍAZ , Micaela Marco , María Mercedes Fernández Campos , Santiago ROSTÁN TALASIMOV (Responsable)
Areas de conocimiento:
Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas /
Química Inorgánica y Nuclear /
Química Medicinal
-
Nuevo mecanismo de percepción del oxígeno en el cerebro en desarrollo. (04/2020 - 03/2024 )
Código: FCE_1_2019_1_156160 Aplicación de biosensores FRET para el estudio de fenómenos de señalización
1 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:1
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
COMINI MA , Ana Clara Gonzalez , Daniel PRIETO MENA , Martín BACCINO CALACE , Boris Egger , Cecilia ABREU OLANO , Mariel Rosas Aida , Rafael CANTERA CARLOMAGNO (Responsable) , Javiera Quiroz
Areas de conocimiento:
Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas /
Biología del Desarrollo /
Proliferación y diferenciación de células mad
-
Estrategias catalíticas en la síntesis de glicomiméticos. Evaluación de su actividad anti-tripanosomátido y antitumoral, en la etapa temprana del descubrimiento de fármacos. (03/2020 - 02/2024 )
Código: FCE_1_2019_1_156376 Síntesis y estudio biológico de compuestos glicomiméticos.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:1
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
COMINI MA , Estefanía DIBELLO RUDOLF (Responsable) , Gustavo SEOANE MUNIZ , Mariela Raquel BOLLATI FOGOLÍN , Juan Manuel MESA BRUNO , Pierina Nahir Schiappapietra Soba , Daniela GAMENARA LANGONA (Responsable)
Areas de conocimiento:
Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Químicas /
Química Orgánica /
Síntesis orgánica.
-
Mini-intestinos: una potente herramienta in vitro para el reemplazo de animales de experimentación (06/2020 - 08/2023 )
Código: FMV_1_2019_1_156213 Generación de organoides murinos para el estudio de la interacción huesped-patógeno
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Doctorado:1
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
COMINI MA , Martina CRISPO BENEDETTO (Responsable) , Romina María del Luján Pagotto , Hellen DAGHERO VILLANUEVA , Andrea MEDEIROS PEREYRA , Cristina Alexandra Quiroga Lozano , Mariela Raquel BOLLATI FOGOLÍN (Responsable)
Areas de conocimiento:
Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud /
Tecnologías que involucran la manipulación de células, tejidos, órganos o todo el org /
Tecnología celular
-
Focused drug discovery against SARS-CoV-2: Targeting cell invasion and replication (10/2020 - 03/2023 )
Código: CRP-ICGEB-2020_URY20_03 RNA viruses are etiologic agents of zoonotic, acute and mortal diseases, including COVID-19, in humans. Compared to DNA viruses, RNA viruses generally have very high mutation rates, which hampers the development of long-term effective vaccines. Antivirals are useful for prevention and treatment of these illnesses, alone or in combination with immunization. The current SARS-CoV-2 pandemic has evidenced the urgent need for antivirals to limit the course of the infection. The genome of SARS-CoV-2 codes for structural and non-structural proteins that play key roles during infection. The structural spike glycoprotein is critical for virus recognition and internalization by the host cells. The non-structural viral proteases are essential for pathogen replication and for antagonizing the host immune response. This project aims to contribute to the development of potential antiviral agents against SARS-related infections by addressing the identification and characterization of drug-like compounds targeting these two major and essential viral components.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Especialización:1
Maestría/Magister:1
Equipo:
COMINI MA , GLORIA V. LÓPEZ (Responsable) , Ruatta, Santiago Matías , FLÓ, M. , david shum , PRITSCH, O. , SERRA, G. , CERECETTO, H. , Alan Talevi
-
Desarrollo de compuestos organometálicos multifuncionales como potenciales agentes antiparasitarios. (03/2021 - 03/2023 )
Código: CSIC I+D 2020_425 Síntesis y evaluación de compuestos organometálicos contra la forma infectiva de Trypanosoma brucei brucei, citoxicidad y modo de acción.
1 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA , GAMBINO, D. , MEDEIROS, A. , F. Rivas
-
Generación de extractos ricos en polifenoles a partir de orujos de uva. (03/2019 - 10/2022 )
Código: ALI_2_2018_1_149574 En este proyecto nos proponemos generar extractos de orujo de la cepa Tannat en forma sólida. A partir de éstos se generará un microencapsulado el cual será tomado como materia prima para el desarrollo de una bebida funcionalizada. En simultáneo, se analizará el extracto fenólico y sus fracciones para conocer y documentar su complejo perfil molecular y funcionalidades como antioxidante, anti-inflamatoria y neuroprotectoras.
1 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Especialización:1
Maestría/Magister:1
Equipo:
COMINI MA , M. PAULINO (Responsable) , BOLLATI-FOGOLIN M , BOIDO, E. , CARRAU, F. , JUAN ANDRES ABIN-CARRIQUIRY , ABREU C. , PARDO, H. , GAMBARO, A. , Pablo RODRÍGUEZ GARCÍA
-
: Investigating the role of organic peroxides and mercaptopyruvate/hydrogen sulphide in cell signalling, oxidative stress and drug-resistance addressed with novel genetically-encoded biosensors (08/2020 - 08/2022 )
Código: FIOCRUZ ? PASTEUR ? USP Call 2020 Design and application of fluorescent protein-based biosensors for lipoperoxides and hydrogen sulphide.
5 horas semanales
Coordinador o Responsable
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Especialización:1
Equipo:
COMINI MA (Responsable) , Silvane Maria Fonseca Murta , Flavia Carla Meotti , BONILLA, M. , ODDONE N. , Márcia Aparecida da Silva , Paula Alves da Silva
-
Nuevas herramientas moleculares para la reducción de los costos de producción de moléculas bioactivas (05/2019 - 06/2022 )
Código: FMV_3_2018_1_148443 Desarrollo de sistemas de purificación de proteínas recombinantes basados en elastina e inteína.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:1
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
COMINI MA , Karin GRUNBERG ESKENAZI , Mariela Raquel BOLLATI FOGOLÍN , Sergio Fabian PANTANO GUTIERREZ , LUCIA BASSETTI BACCINO , Cecilia ABREU OLANO (Responsable)
Areas de conocimiento:
Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas /
Bioquímica y Biología Molecular /
Proteínas Recombinantes
-
Desarrollo de biosensores redox fluorescentes para compuestos azufrados y evaluación de su funcionalidad en modelos celulares (03/2021 - 03/2022 )
Código: CSIC I+D 2020_365 Este proyecto se enfoca en el desarrollo de nuevos sensores fluorescentes genéticamente codificados que permitan monitorear en diferentes compartimentos de células eucariotas, de forma dinámica y en tiempo real, los niveles de dos metabolitos azufrados de relevancia biológica: el glutatión persulfuro y el 3-mercaptopiruvato. Estas moléculas están involucradas en el metabolismo de la cisteína y del sulfuro de hidrógeno, y están siendo estudiados por su relevancia en señalización, defensa frente a oxidantes y tráfico de azufre. Como módulo sensor de estos biosensores se emplearán diferentes azufretransferasas y como módulo reportero una variante de la proteína fluorescente verde sensible al estado redox (roGFP2). Las enzimas azufretransferasas llevan azufre desde distintos metabolitos hacia blancos aceptores, pasando por un intermediario persulfuro (RSSH) formado a nivel de una cisteína del sitio activo durante su ciclo catalítico. La roGFP2 posee un par de cisteínas que pueden estar en el estado tiol o disulfuro. El estado de estas cisteínas repercute en las propiedades de la emisión de fluorescencia. Es nuestra hipótesis, apoyada por resultados preliminares, que la oxidación de la roGFP2 por el persulfuro formado en las azufretransferasas cuando son expuestas a los metabolitos azufrados de interés, producirá cambios en la fluorescencia, es decir, una señal cuantificable. Se caracterizarán distintas azufretransferasas respecto a su especificidad por los sustratos y a su interacción con sistemas reductores endógenos, se evaluará su capacidad de oxidar a la roGFP2 en presencia de los sustratos de interés y se generarán los biosensores fusionando ambas proteínas. Los biosensores que resulten más eficientes y específicos in vitro serán expresados en sistemas biológicos de interés biomédico: tripanosomátidos y células de mamífero.
1 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA , BONILLA, M. (Responsable) , CUEVASANTA, E. (Responsable) , ALVAREZ, B. , BENCHOAM, D , Rouhier N
-
EVALUACION DE LA ACCION ANTIPARASITARIA DE NUEVOS TERPENOIDES NATURALES Y SEMISINTETICOS. LA MAQUINARIA ANTIOXIDANTE DE TRYPANOSOMA CRUZI COMO POSIBLE BLANCO TERAPEUTICO PARA LA ACCION DE ESTAS MOLECULAS (03/2020 - 03/2022 )
Código: PICT-2019-2019-03912 El presente plan de trabajo propone estudiar las bases moleculares de la acción de compuestos naturales
sobre T.cruzi. Se estudiará el mecanismo de acción de una lactona sesquiterpénica, dehidroleucodina (DhL),
sobre la maquinaria redox de T.cruzi, mediante: mediciones de especies reactivas de oxígeno (ROS) debido
al tratamiento con el compuesto y se propone evaluar la mayor o menor sensibilidad de parásitos
modificados genéticamente para una mayor (sobreexpresión) o menor (knock out) expresión de enzimas de
las vías de detoxificación de T.cruzi. También se estudiará si esos cambios en la expresión de enzimas Redox
inciden en la capacidad infectiva y en la sensibilidad de los parásitos intracelulares a DhL. Por otra parte se
tratará de identificar los grupos activos sobre la molécula de DhL mediante el uso de derivados de esta
lactona obtenidos por sustitución química. Se utilizarán técnicas de biología molecular, bioquímicas, y
microscopía óptica o electrónica. La molécula de DhL ha sido elegida entre tantas evaluadas en nuestro
laboratorio ya que es muy activa contra T.cruzi y con muy baja citotoxicidad sobre células de mamíferos, por
lo que sería un buen candidato para futuras estrategias terapéuticas.
1 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA , PATRICIA ANDREA BARRERA (Responsable) , WALTER BERÓN (Responsable) , Jessica Daniela Gomez , ROBELLO, C. , Veronica Jimenez
-
Caracterización funcional de una nueva proteína de Trypanosoma cruzi con alto potencial diagnóstico de la enfermedad de Chagas. (03/2020 - 03/2022 )
Código: PICT-2019-2019-03796 Este proyecto propone la validación de la proteína de Trypanosoma cruzi Tc323, como antígeno para la detección precisa de la enfermedad de Chagas crónica a partir de muestras de sangre, así como también como posible marcador de evolución de la infección y de curación luego del tratamiento con drogas anti-parasitarias. Se proyecta incluir Tc323 (como proteína completa o fragmentos de esta) en un sensor en tira de papel simple y de bajo costo que ya estamos desarrollando (similar al utilizado en los test de embarazo), cuyo principal fin es su uso en los centros sanitarios de zonas rurales de bajos recursos socioeconómicos. Además, este proyecto propone la caracterización bioquímica y funcional de Tc323, mediante experimentos que permitan establecer el rol de esta proteína en procesos tales como la proliferación, la homeostasis intracelular, la diferenciación a las formas infectivas y la invasión a células de mamífero.
1 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA , Mariana Potenza , Karina Gomez (Responsable) , MARIANA PATRICIA TASSO , Fred Luciano Neves Santos , Silvia Longhi , Maria Paola Zago
-
Síntesis y estudio de nuevos derivados de benzoisotiazolonas como agentes tripanosomátidos multi blanco (03/2019 - 08/2021 )
Código: CSIC I+D 2018_388 Los tripanosomátidos incluyen parásitos de los géneros Trypanosoma y Leishmania relevantes para la salud humana y animal. Las infecciones por tripanosomátidos afectan cerca de 150 millones de personas en el mundo. Actualmente no existen vacunas para prevenir estas enfermedades y la quimioterapia, aunque de eficacia relativa y tóxica, continúa siendo la única opción disponible para combatirlas. El metabolismo redox de los tripanosomátidos ofrece candidatos farmacológicos atractivos ya que es indispensable y tiene componentes totalmente ausentes en mamíferos o bien presentan características marcadamente diferentes. Entre ellos se destaca la tripanotión sintetasa (TryS) y la tripanotión reductasa (TR) dos enzimas parásito-específicas que produce y mantienen reducido, respectivamente, al principal cofactor o sustrato redox de bajo peso molecular, tripanotión. Si bien ambas enzimas son estructuralmente diferentes, ambas comparten a nivel de sitio activo la capacidad de unir al tripanotión o su molécula precursora, la mono-glutationil espermidina. A la fecha no se ha explorado la posibilidad de diseñar compuestos capaces de interferir con la actividad de ambas enzimas, lo cual potenciaría su actividad anti-proliferativa. Este proyecto tiene por objetivo diseñar racionalmente y caracterizar bioquímica y biológicamente compuestos multi-diana dirigidos contra TryS y TR, y particularmente activos contra las especies que desarrollan infecciones intracelulares. La hipótesis de trabajo está sustentada en que derivados del ebselen probaron ser curativos en un modelo murino de tripanosomiasis Africana y fueron capaces de inhibir TR y TryS. También nos motiva trabajar con este scaffold estructural que el ebselen está siendo estudiado en fase clínica III para el tratamiento de otras enfermedades. Esto abre las puertas a un rápido reposicionamiento de los derivados más potentes y selectivos que emerjan de nuestro proyecto hacia estas enfermedades parasitarias. Sobre la base de los antecedentes previos, la primera fase de este proyecto investigará en detalle el mecanismo de inhibición contra TryS y TR de nuevos derivados pertenecientes a la familia de las benzoisotiazolonas, a la cual pertenece ebselen. El análisis de la relación estructura-actividad guiará el diseño de nuevos análogos para obtener perfiles superiores de inhibición y afinidad por estas enzimas. Complementariamente se evaluará la actividad biológica de los compuestos sobre las formas amastigotas intracelulares de T. cruzi y L. infantum, y la forma sanguínea de T. brucei que expresan un gen reportero bioluminiscente. El efecto on-target de los compuestos más activos y selectivos será estudiado empleando líneas transgénicas de estos parásitos que expresan un biosensor redox fluorescente. Con estos estudios se esperan obtener nuevos derivados de benzoisotiazolonas que posean: i) un mecanismo de inhibición contra blancos moleculares validado desde el punto de vista enzimático y biológico, ii) una destacada actividad y potencia contra las formas clínicamente relevantes de diferentes especies de tripanosomátidos
10 horas semanales
Coordinador o Responsable
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA (Responsable) , MEDEIROS, A. (Responsable) , INCERTI M , D. BENÍTEZ , cquiroga
-
Drug Discovery Against the Major Protease of SARS-CoV-2 (09/2020 - 07/2021 )
Código: SARS-CoV-2 CALL IPIN 2020 So far, the nucleoside analogue Remdesivir is the only drug approved for the treatment of SARS-CoV-2. For a virus class with a high mutation rate, chemotherapy remains as a long-term, safe and complementary alternative to immunoprofilaxis. This multicentric and multidisciplinary drug discovery proposal aims at the identification and full characterization of inhibitors of the SARS-CoV-2 cysteine-dependent viral proteases.
10 horas semanales
Coordinador o Responsable
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Especialización:1
Maestría/Magister:1
Equipo:
COMINI MA (Responsable) , david shum , BOLLATI-FOGOLIN M , PRITSCH, O. , Alan Talevi , ALVAREZ, B. , SERRA, G. , GLORIA V. LÓPEZ , Jiu Yaming , Salinas Gustavo , Indiani de Oliveira Camila
-
Inferencia y Comparación de Modelos Cinéticos y Evolutivos de Cores Catalíticos de Proteasomas (03/2019 - 03/2021 )
Código: CSIC I+D 2018 Las principales preguntas que buscamos responder son las siguientes:
(a) ¿Cómo son los mecanismos cinéticos (actividad e inhibición) de los distintos proteasomas? ¿Son significativamente diferentes? ¿Cuáles son los pasos controlan en cada uno de ellos la catálisis y la inhibición? Suponemos que la compartimentalización en los CCPHslV es menos importante que en los CCP20S, ¿será así? ¿Se confirman los mecanismos ya propuestos de los distintos inhibidores? ¿Es posible establecer una nueva racionalidad en la mejora de inhibidores específicos de cada proteasoma? ¿Cuáles son los inhibidores más específicos de los distintos proteasomas y por qué mecanismo cinético se explica la especificidad?
b) ¿Qué podemos aprender de la evolución de los proteasomas considerando especialmente las arqueas relacionadas con el origen de los eucariotas? ¿Cómo son las secuencias de las proteínas proteasomales de arqueas del superfilum Asgard? ¿Podremos determinar los eventos de
duplicación, pérdida y transferencia horizontal en los diferentes linajes? ¿Surge alguna proteína viral como candidata muy probable a ser un homólogo proteasomal? ¿Qué rol (si corresponde alguno) pueden haber tenido los virus en la evolución de los proteasomas? ¿Encontraremos algún homólogo proteasomal activo en los virus actuales? ¿Qué rol podría este cumplir en el ciclo del virus? ¿Se confirma que secuencias homólogas están solo en bacteriófagos caudados (myoviridae y siphoviridae) y si fuera así, por qué? ¿Qué eventos de selección positiva en diferentes linajes podremos inferir y qué explicaciones ecológicas o fisiológicas podremos eventualmente esgrimir?
2 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Pregrado:1
Equipo:
COMINI MA , H. BOTTI (Responsable) , LEBRATO, L. , Curbelo D , ROMERO H , GRAÑA, M. , CHIRIBAO, M.L , TRUJILLO, M. , I. RAMÍREZ
-
Quinonas multi-diana para el desarrollo de fármacos tripanosomicidas (03/2019 - 03/2021 )
Código: CSIC I+D 2018 En esta propuesta se estudiará una serie amplificada de 4-ariloxy-quinonas variando sustituyentes
halógenos, hidrocarbonados y nitrados. Se medirá su inhibición en TR y G6PDH y su reactividad frente a
sondas redox. Para aquellas con IC50<10?M, se estudiará su capacidad de inhibir el crecimiento in vitro en
amastigotes T.cruzi Dm28c y L.infantum. Se comparará la reactividad en tripomastigotes de cepas Dm28c,
INC-5 y NINOA. Las más activas se someterán a ensayos in vivo (Tácruzi). En simultáneo se realizarán
estudios in silico (farmacóforos, descriptores como HOMO-LUMO e índices de Fukui entre otros, QSAR2D
y 3D; anclaje reverso y directo; dinámica molecular).
Se seleccionará el mejor candidato para el desarrollo de un compuesto tripanocida, validando su
mecanismo de acción a través de la formación de radicales libres y/o a través de la inhibición de dianas
involucradas, quedando a verificar una acción simultánea de inhibición enzimática y consumo de equivalentes
de reducción (acción subversiva). Se conocerán las bases moleculares de su acción y su intervención en
diferentes rutas metabólicas, con lo que, además de racionalizar su efecto como antitripanosomatídeos se
propondrá su reposicionamiento como candidatos a fármacos para enfermedades diversas como otras
tripanosomiasis o cáncer.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:1
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA , M. PAULINO (Responsable) , Brenda Vera Melendez , Cantero, J , Pablo RODRÍGUEZ GARCÍA , Mayán Carolina Navarro Ibarra
-
Plasticidad estructural de la unidad de plegamiento tiorredoxina en platelmintos parásitos (04/2018 - 01/2021 )
Código: FCE_1_2017_1_136340 Estudio de proteínas con plegamiento tiorredoxina, caracterización bioquímica.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Doctorado:1
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
COMINI MA , Massimo Bellanda , Hugo BISIO SABARIS , Jorge Luis PÓRFIDO , Néstor Carrillo , Adriana Krapp , Marcos Gustavo SALINAS GRECCO (Responsable)
Areas de conocimiento:
Ciencias Naturales y Exactas / Ciencias Biológicas /
Bioquímica y Biología Molecular /
Biología Estructural
-
Diseño de biosensores para monitoreo simultáneo de señalización redox y cAMP: Desde la computadora a la célula y vuelta a la computadora (10/2015 - 02/2019 )
Código: FMV_1_2014_1_104000 Desarrollo de biosensores fluorescentes duales para detectar vías de señalización por AMPc y redox.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Especialización:1
Doctorado:1
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
COMINI MA , María Florencia SARDI PIANO , Mariela Raquel BOLLATI FOGOLÍN , Karen PERELMUTER SCHEIN , Federico LECUMBERRY RUVERTONI , Matías Rodrigo MACHADO GONZALEZ , Sergio Fabian PANTANO GUTIERREZ (Responsable)
Areas de conocimiento:
Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud /
Tecnologías que involucran la manipulación de células, tejidos, órganos o todo el org /
Biofísica computacional, Tecnología celular
-
DISEÑO Y PRODUCCIÓN DE NUEVAS VARIANTES DE LA HORMONA FOLICULO ESTIMULANTE (FSH) PARA SU EMPLEO EN ESPECIES DE INTERÉS PRODUCTIVO (01/2016 - 12/2018 )
Código: ALI_1_2015_1_5084 La producción industrial de ganado para consumo de carne y otros productos (leche,
lana, etc.) está hoy en día estrechamente ligada a la eficacia de biotecnologías
reproductivas (inseminación artificial y superovulación). En estas técnicas,
hormonas de la reproducción son empleadas para estimular la función ovárica de la
hembras con el fin de incrementar las chances de fecundación. Actualmente, las
hormonas reproductivas disponibles en el mercado se obtienen de fuentes naturales
lo cual trae asociados problemas de estabilidad, baja y variable potencia biológica,
riesgo de contaminación con agentes adventicios y alto costo de producción, entre
otros. Estudios previos de análisis de secuencias y simulación molecular conducidos
por miembros de esta Alianza indican que es altamente factible la generación de
nuevas variantes de hormonas recombinantes con propiedades biológicas y
comerciales mejoradas. Mediante una aproximación multidisciplinaria que involucra
estudios de modelado molecular, con la tecnología del ADN recombinante, la
ingeniería de proteínas y la optimización de los procesos de producción de proteínas
a pequeña escala este proyecto tiene por objetivo el diseño y producción de
hormonas recombinantes de alto valor agregado y con aplicaciones en el mercado
de la reproducción ganadera y veterinaria.
Se prevé que el producto generado en este proyecto ofrezca ventajas económicas y
biológicas respecto a las opciones disponibles en el mercado que, al corto plazo
puedan impactar directamente en la economía nacional y regional.
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Especialización:1
Maestría/Magister:1
Equipo:
COMINI MA , BOLLATI-FOGOLIN M (Responsable) , PANTANO S , M. CRISPO , ABREU C. , Karin Grunberg
-
Target-based drug discovery of compounds interfering with trypanothione biosynthesis in trypanosomatids (09/2015 - 04/2018 )
Código: Actions Concertées InterPasteuriennes - ACIP 2015 The main objective of this project is to identify and contribute to the development of novel compounds targeting the redox metabolism of trypanosomatids, which can be developed to clinically useful drugs.
The secondary objectives are: ? to screen a chemical library of FDA-approved drugs and a kinase-focussed library for suitable lead compounds against a unique and essential enzyme for trypanosomatids, trypanothione synthetase, ? to deepen the biochemical and biological characterization of hits identified in previous studies (paullones) in respect to inhibitory activity (nM IC50), safety and efficacy (EC50 in vitro <1?M; ED50 in infection models <10mg/Kg; therapeutic range > 50), ? to create an interdisciplinary team able to deliver drug candidates in the field, ? to lower the barrier for final development of drug candidates by interested companies or organizations.
The screening of a library containing molecules already suitable for clinical use offers the advantage to speed-up the implementation of therapies against trypanosomiasis and leishmaniasis. From an economical point of view, this strategy significantly avoids and/or shortens the long and expensive toxicological studies, which may be restricted to test only the new effective dose.
20 horas semanales
Coordinador o Responsable
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA (Responsable) , Camila Indiani de Olivera , Jo Hwan No , David Shum , Conrad Kunick
-
The thioredoxin fold diversity in trypanosomatids and tapeworms (03/2015 - 03/2017 )
Código: CRP/URU14-01 Protozoan and flatworm infections are highly prevalent in developing countries causing devastating neglected diseases. Parasites of the genus Trypanosoma and Leishmania, and cestode and trematode flatworms (e.g. Echicnococcus granulosus and Fasciola hepatica) are among the major etiologic agents of zoonotic diseases affecting humans and livestock in South America. The identification of novel drugs that target parasite-specific molecules and/or mechanisms is an important goal in public health of the poorest regions and countries.
Our groups have greatly contributed to demonstrate that the thiol-dependent redox and iron-sulphur cluster trafficking pathways of trypanosomatids and flatworms differ substantially from their vertebrate hosts, are essential for parasite survival, and constitute promising pharmacological targets. This project will focus on understanding the thiol-dependent pathways of these parasitic lineages. This will reveal new checkpoints of parasite redox metabolism; at the same time it will provide key insights into the functional diversity of the thioredoxin (Trx)-fold proteins.
To address this aim we will use comparative genomics, structural biology and biochemical approaches in a complementary manner. By genome wide searches we will build a Trx-fold proteins atlas for these lineages. Special emphasis will be placed on comparing: i) the ?atlas? of parasitic and free-living species, since these differences may represent adaptations to the parasitic lifestyle, ii) the ?atlas? of parasites and their hosts, since the variants absent in the mammalian hosts may represent potential pharmacological targets.
Further insights into the functional divergence of Trx-fold proteins in these lineages will be provided by structural biology and biochemical approaches. Using NMR spectroscopy we will complete the structure of mono- and dithiol glutaredoxins, a functionally divergent Trx-fold subfamily of trypanosomatids. This will, most likely, unveil how this protein class coevolved with the unique redox cofactor of these organisms, trypanothione. We will also determine the structure of two Trx-fold proteins of tapeworms, which coordinate iron-sulfur clusters. The interactome of redox members of the Trx-fold proteins of trypanosomatids and tapeworms will be addressed using a pull-down strategy based on cysteine mutants of redoxin proteins as molecular baits to trap interactors. This will contribute to unravel the diverse metabolic and cellular processes that are controlled by different Trx-fold proteins in lineages where specific gene family expansions and adaptations have occurred, but their functional relevance is not understood.
Finally, an important goal that will be accomplished in this project is the training of local scientists in NMR spectroscopy of macromolecules. Despite being an extremely useful discipline for biological and biomedical research, NMR spectroscopy of proteins remains completely undeveloped in our country.
20 horas semanales
Coordinador o Responsable
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA (Responsable) , SALINAS G (Responsable) , MANTA B , Massimo Bellanda
-
Síntesis de nuevos quimioterápicos análogos a Aeruciclamidas (06/2013 - 03/2015 )
Código: FCE_3_2011_1_6916 Síntesis y evaluación de ciclopéptidos con antividad anti-tripanosoma
5 horas semanales
Integrante del Equipo
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Doctorado:1
Equipo:
COMINI MA , SERRA, G. , L.SCARONE , MANTA, E. , S. PEÑA (Responsable) , MEDEIROS, A.
-
Generación y caracterización de líneas celulares de importancia biotecnológica y biomédica para el monitoreo de cambios redox intracelulares en tiempo real e in situ (02/2011 - 06/2013 )
Código: PR_FMV_2009_1_2617 Desarrollo y caracterización de líneas celulares reporteras redox
30 horas semanales
Coordinador o Responsable
Concluido
RRHH formados en el proyecto:
Maestría/Magister:1
Financiación:
Agencia Nacional de Investigación e Innovación, Uruguay, Apoyo financiero
Equipo:
COMINI MA (Responsable)
Areas de conocimiento:
Ciencias Médicas y de la Salud / Biotecnología de la Salud /
Tecnologías que involucran la manipulación de células, tejidos, órganos o todo el org /
Biología Redox y Tecnología Celular